seq1 = pF1KB8619.tfa, 948 bp
seq2 = pF1KB8619/gi568815579r_10823294.tfa (gi568815579r:10823294_11027960), 204667 bp

>pF1KB8619 948
>gi568815579r:10823294_11027960 (Chr19)

(complement)

1-31  (99551-99581)   100% ->
32-192  (100002-100162)   100% ->
193-279  (100245-100331)   100% ->
280-367  (102188-102275)   100% ->
368-484  (103769-103885)   100% ->
485-651  (103962-104128)   100% ->
652-834  (104284-104466)   100% ->
835-948  (104554-104667)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCATCGGCCGACGAGCTGACCTTCCATG         AATTCGAGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
  99551 ATGGCATCGGCCGACGAGCTGACCTTCCATGGTG...CAGAATTCGAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GGCCACTAATCTTCTGGCTGACACCCCAGATGCAGCCACCACCAGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100012 GGCCACTAATCTTCTGGCTGACACCCCAGATGCAGCCACCACCAGCAGAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCGATCAGCTGACCCCACAAGGGCACGTGGCTGTGGCCGTGGGCTCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100062 GCGATCAGCTGACCCCACAAGGGCACGTGGCTGTGGCCGTGGGCTCAGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCAGCTATGGAGCCGAGGATGAGGTGGAGGAGGAGAGTGACAAGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100112 GGCAGCTATGGAGCCGAGGATGAGGTGGAGGAGGAGAGTGACAAGGCCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 G         CTCCTGCAGGAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGGGATTCT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100162 GGTG...CAGCTCCTGCAGGAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGGGATTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGACCTTCAGCTACTATCAGAGCTTCTTTGACGTGGACACCTCACAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100285 GGACCTTCAGCTACTATCAGAGCTTCTTTGACGTGGACACCTCACAGGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    280       GTCCTGGACCGGATCAAAGGCTCACTGCTGCCCCGGCCTGGCCA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100335 ...CAGGTCCTGGACCGGATCAAAGGCTCACTGCTGCCCCGGCCTGGCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAACTTTGTGCGGCACCATCTGCGGAATCGGCCGGATCTGTATG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 102232 CAACTTTGTGCGGCACCATCTGCGGAATCGGCCGGATCTGTATGGTG...

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    368    GCCCCTTCTGGATCTGTGCCACGTTGGCCTTTGTCCTGGCCGTCACT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103766 CAGGCCCCTTCTGGATCTGTGCCACGTTGGCCTTTGTCCTGGCCGTCACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GGCAACCTGACGCTGGTGCTGGCCCAGAGGAGGGACCCCTCCATCCACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103816 GGCAACCTGACGCTGGTGCTGGCCCAGAGGAGGGACCCCTCCATCCACTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CAGCCCCCAGTTCCACAAGG         TGACCGTGGCAGGCATCAGCA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 103866 CAGCCCCCAGTTCCACAAGGGTA...CAGTGACCGTGGCAGGCATCAGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TCTACTGCTATGCGTGGCTGGTGCCCCTGGCCCTGTGGGGCTTCCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103983 TCTACTGCTATGCGTGGCTGGTGCCCCTGGCCCTGTGGGGCTTCCTGCGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TGGCGCAAGGGTGTCCAGGAGCGCATGGGGCCCTACACCTTCCTGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104033 TGGCGCAAGGGTGTCCAGGAGCGCATGGGGCCCTACACCTTCCTGGAGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGTGTGCATCTACGGCTACTCCCTCTTTGTCTTCATCCCCATGGTG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 104083 TGTGTGCATCTACGGCTACTCCCTCTTTGTCTTCATCCCCATGGTGGTG.

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    652      GTCCTGTGGCTCATCCCTGTGCCTTGGCTGCAGTGGCTCTTTGGG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104133 ..CAGGTCCTGTGGCTCATCCCTGTGCCTTGGCTGCAGTGGCTCTTTGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GCGCTGGCCCTGGGCCTGTCAGCCGCCGGGCTGGTATTCACCCTCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104329 GCGCTGGCCCTGGGCCTGTCAGCCGCCGGGCTGGTATTCACCCTCTGGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CGTGGTCCGTGAGGACACCAGGCTGGTGGCCACAGTGCTGCTGTCCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104379 CGTGGTCCGTGAGGACACCAGGCTGGTGGCCACAGTGCTGCTGTCCGTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TCGTGCTGCTCCACGCCCTCCTGGCCATGGGCTGTAAG         TTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 104429 TCGTGCTGCTCCACGCCCTCCTGGCCATGGGCTGTAAGGTA...CAGTTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TACTTCTTCCAGTCGCTGCCTCCGGAGAACGTGGCTCCTCCTCCCCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 104557 TACTTCTTCCAGTCGCTGCCTCCGGAGAACGTGGCTCCTCCACCCCAAAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CACATCTCTGCCCTCAAACATCGCGCTGTCCCCTACCTTGCCGCAGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104607 CACATCTCTGCCCTCAAACATCGCGCTGTCCCCTACCTTGCCGCAGTCCC

   1000     .    :
    938 TGGCCCCCTCC
        |||||||||||
 104657 TGGCCCCCTCC