Result of FASTA (omim) for pF1KB8422
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8422, 744 aa
  1>>>pF1KB8422 744 - 744 aa - 744 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4766+/-0.000444; mu= 7.5188+/- 0.028
 mean_var=345.0692+/-70.573, 0's: 0 Z-trim(120.2): 1811  B-trim: 173 in 1/55
 Lambda= 0.069043
 statistics sampled from 33090 (35253) to 33090 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.738), E-opt: 0.2 (0.413), width:  16
 Scan time: 13.450

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_689838 (OMIM: 610159) zinc finger protein 366 [ ( 744) 5306 543.4 1.3e-153
NP_001073878 (OMIM: 603981) zinc finger protein 99 ( 864)  889 103.5 3.8e-21
XP_016881641 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 502)  884 102.7 3.9e-21
XP_016881642 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 502)  884 102.7 3.9e-21
XP_016881640 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 669)  884 102.8 4.7e-21
XP_016881639 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 688)  884 102.9 4.7e-21
XP_016881638 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 700)  884 102.9 4.8e-21
NP_001138296 (OMIM: 604750) zinc finger protein 23 ( 700)  884 102.9 4.8e-21
XP_006723037 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 700)  884 102.9 4.8e-21
NP_006621 (OMIM: 604750) zinc finger protein 234 [ ( 700)  884 102.9 4.8e-21
XP_016882571 (OMIM: 194551) PREDICTED: zinc finger ( 365)  878 101.9   5e-21
XP_016882570 (OMIM: 194551) PREDICTED: zinc finger ( 365)  878 101.9   5e-21
XP_011526007 (OMIM: 603980) PREDICTED: zinc finger ( 531)  881 102.4   5e-21
NP_037512 (OMIM: 603994) zinc finger protein 112 i ( 907)  885 103.1 5.2e-21
NP_001076804 (OMIM: 603994) zinc finger protein 11 ( 913)  885 103.1 5.2e-21
NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 ( 572)  881 102.5 5.2e-21
XP_011513163 (OMIM: 602277) PREDICTED: zinc finger ( 675)  880 102.5 6.2e-21
NP_001305822 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 675)  880 102.5 6.2e-21
NP_067040 (OMIM: 194551) zinc finger protein 77 [H ( 545)  878 102.1 6.3e-21
NP_001305821 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751)  880 102.5 6.6e-21
NP_001305820 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751)  880 102.5 6.6e-21
NP_009080 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 i ( 751)  880 102.5 6.6e-21
XP_016882569 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 489)  873 101.6 8.3e-21
NP_067039 (OMIM: 194545) endothelial zinc finger p ( 489)  873 101.6 8.3e-21
XP_016882567 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 549)  873 101.6 8.9e-21
XP_011525495 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 549)  873 101.6 8.9e-21
XP_016882568 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 549)  873 101.6 8.9e-21
NP_001165697 (OMIM: 613903) zinc finger protein 54 ( 628)  873 101.7 9.6e-21
NP_001165696 (OMIM: 613903) zinc finger protein 54 ( 660)  873 101.7 9.9e-21
NP_689819 (OMIM: 613903) zinc finger protein 540 i ( 660)  873 101.7 9.9e-21
NP_998763 (OMIM: 616847) zinc finger protein 543 [ ( 600)  871 101.5 1.1e-20
XP_016882723 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 518)  867 101.0 1.3e-20
NP_001243102 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 531)  867 101.0 1.3e-20
XP_011526566 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 536)  867 101.0 1.3e-20
NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 is ( 595)  867 101.1 1.4e-20
NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 625)  867 101.1 1.4e-20
XP_011526565 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 640)  867 101.1 1.5e-20
NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782)  864 100.9   2e-20
NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782)  864 100.9   2e-20
NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782)  864 100.9   2e-20
NP_001309065 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818)  864 101.0 2.1e-20
NP_150630 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818)  864 101.0 2.1e-20
NP_001309061 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818)  864 101.0 2.1e-20
NP_001309060 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818)  864 101.0 2.1e-20
NP_001309059 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818)  864 101.0 2.1e-20
NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818)  864 101.0 2.1e-20
NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818)  864 101.0 2.1e-20
NP_001309057 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818)  864 101.0 2.1e-20
NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818)  864 101.0 2.1e-20
NP_001309062 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818)  864 101.0 2.1e-20


>>NP_689838 (OMIM: 610159) zinc finger protein 366 [Homo  (744 aa)
 initn: 5306 init1: 5306 opt: 5306  Z-score: 2879.0  bits: 543.4 E(85289): 1.3e-153
Smith-Waterman score: 5306; 100.0% identity (100.0% similar) in 744 aa overlap (1-744:1-744)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MQKEMKMIKDEDVHFDLAVKKTPSFPHCLQPVASRGKAPQRHPFPEALRGPFSQFRYEPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 MQKEMKMIKDEDVHFDLAVKKTPSFPHCLQPVASRGKAPQRHPFPEALRGPFSQFRYEPP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 PGDLDGFPGVFEGAGSRKRKSMPTKMPYNHPAEEVTLALHSEENKNHGLPNLPLLFPQPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 PGDLDGFPGVFEGAGSRKRKSMPTKMPYNHPAEEVTLALHSEENKNHGLPNLPLLFPQPP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 RPKYDSQMIDLCNVGFQFYRSLEHFGGKPVKQEPIKPSAVWPQPTPTPFLPTPYPYYPKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 RPKYDSQMIDLCNVGFQFYRSLEHFGGKPVKQEPIKPSAVWPQPTPTPFLPTPYPYYPKV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 HPGLMFPFFVPSSSPFPFSRHTFLPKQPPEPLLPRKAEPQESEETKQKVERVDVNVQIDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 HPGLMFPFFVPSSSPFPFSRHTFLPKQPPEPLLPRKAEPQESEETKQKVERVDVNVQIDD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 SYYVDVGGSQKRWQCPTCEKSYTSKYNLVTHILGHSGIKPHACTHCGKLFKQLSHLHTHM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 SYYVDVGGSQKRWQCPTCEKSYTSKYNLVTHILGHSGIKPHACTHCGKLFKQLSHLHTHM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 LTHQGTRPHKCQVCHKAFTQTSHLKRHMMQHSEVKPHNCRVCGRGFAYPSELKAHEAKHA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 LTHQGTRPHKCQVCHKAFTQTSHLKRHMMQHSEVKPHNCRVCGRGFAYPSELKAHEAKHA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 SGRENICVECGLDFPTLAQLKRHLTTHRGPIQYNCSECDKTFQYPSQLQNHMMKHKDIRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 SGRENICVECGLDFPTLAQLKRHLTTHRGPIQYNCSECDKTFQYPSQLQNHMMKHKDIRP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 YICSECGMEFVQPHHLKQHSLTHKGVKEHKCGICGREFTLLANMKRHVLIHTNIRAYQCH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 YICSECGMEFVQPHHLKQHSLTHKGVKEHKCGICGREFTLLANMKRHVLIHTNIRAYQCH
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB8 LCYKSFVQKQTLKAHMIVHSDVKPFKCKLCGKEFNRMHNLMGHMHLHSDSKPFKCLYCPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 LCYKSFVQKQTLKAHMIVHSDVKPFKCKLCGKEFNRMHNLMGHMHLHSDSKPFKCLYCPS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB8 KFTLKGNLTRHMKVKHGVMERGLHSQGLGRGRIALAQTAGVLRSLEQEEPFDLSQKRRAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 KFTLKGNLTRHMKVKHGVMERGLHSQGLGRGRIALAQTAGVLRSLEQEEPFDLSQKRRAK
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB8 VPVFQSDGESAQGSHCHEEEEEDNCYEVEPYSPGLAPQSQQLCTPEDLSTKSEHAPEVLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 VPVFQSDGESAQGSHCHEEEEEDNCYEVEPYSPGLAPQSQQLCTPEDLSTKSEHAPEVLE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB8 EACKEEKEDASKGEWEKRSKGDLGAEGGQERDCAGRDECLSLRAFQSTRRGPSFSDYLYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 EACKEEKEDASKGEWEKRSKGDLGAEGGQERDCAGRDECLSLRAFQSTRRGPSFSDYLYF
              670       680       690       700       710       720

              730       740    
pF1KB8 KHRDESLKELLERKMEKQAVLLGI
       ::::::::::::::::::::::::
NP_689 KHRDESLKELLERKMEKQAVLLGI
              730       740    

>>NP_001073878 (OMIM: 603981) zinc finger protein 99 [Ho  (864 aa)
 initn: 1564 init1: 834 opt: 889  Z-score: 500.6  bits: 103.5 E(85289): 3.8e-21
Smith-Waterman score: 889; 32.7% identity (59.9% similar) in 416 aa overlap (215-618:357-765)

          190       200       210       220       230          240 
pF1KB8 MFPFFVPSSSPFPFSRHTFLPKQPPEPLLPRKAEPQESEETKQKVERVD---VNVQIDDS
                                     :: :  ..::   : :.      :..   .
NP_001 ALRKHQIIHTGKKPYKCEECGKAFSQSSTLRKHEIIHTEEKPYKYEECGKAFSNLSALRK
        330       340       350       360       370       380      

             250       260       270       280       290       300 
pF1KB8 YYVDVGGSQKRWQCPTCEKSYTSKYNLVTHILGHSGIKPHACTHCGKLFKQLSHLHTHML
       . . .  .:: ..:  : :..  . .:..: . :.. ::  : .::: ::..: :. : .
NP_001 HEI-IHTGQKPYKCEECGKAFKWSSKLTVHKVIHTAEKPCKCEECGKAFKRFSALRKHKI
         390       400       410       420       430       440     

             310       320       330       340       350       360 
pF1KB8 THQGTRPHKCQVCHKAFTQTSHLKRHMMQHSEVKPHNCRVCGRGFAYPSELKAHEAKHAS
        : : .:.::. : :::.. : :..: . :.  ::..:. ::..: . :.: .:.. :  
NP_001 IHTGKQPYKCEECSKAFSNFSALRKHEIIHTGEKPYKCEECGKAFKWSSKLTVHKVIHME
         450       460       470       480       490       500     

             370       380       390       400       410       420 
pF1KB8 GRENICVECGLDFPTLAQLKRHLTTHRGPIQYNCSECDKTFQYPSQLQNHMMKHKDIRPY
        .   : :::  :  .. :..:   : :   :.: :: :.:.  : :..: . :   .::
NP_001 EKPCKCEECGKAFKHFSALRKHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNNSSTLMKHKIIHTGKKPY
         510       520       530       540       550       560     

             430       440       450       460       470       480 
pF1KB8 ICSECGMEFVQPHHLKQHSLTHKGVKEHKCGICGREFTLLANMKRHVLIHTNIRAYQCHL
        : :::  : :  :: .:.  : : : .::  ::. :. .. ...: .:::. . :.:. 
NP_001 KCEECGKAFKQSSHLTRHKAIHTGEKPYKCEECGKAFNHFSALRKHQIIHTGKKPYKCEE
         570       580       590       600       610       620     

             490       500       510       520       530       540 
pF1KB8 CYKSFVQKQTLKAHMIVHSDVKPFKCKLCGKEFNRMHNLMGHMHLHSDSKPFKCLYCPSK
       : :.: :..::. : :.:.  ::.::. ::: :.   .:  :  .:.. ::.::  : . 
NP_001 CGKAFSQSSTLRKHEIIHTGEKPYKCEECGKAFKWSSHLTRHKVIHTEEKPYKCEECGKA
         630       640       650       660       670       680     

             550       560       570       580           590       
pF1KB8 FTLKGNLTRHMKVKHGVMERGLHSQGLGRGRIALAQTAGVLRSLE----QEEPFDLSQ--
       :.  . : .:  .. :  ..  . .  :.   :..:.. .::. :     :.:.   .  
NP_001 FNHFSALRKHKIIHTG--KKPYKCEECGK---AFSQSS-TLRKHEIIHTGEKPYKCEECG
         690       700         710           720       730         

            600       610       620       630       640       650  
pF1KB8 ---KRRAKVPVFQSDGESAQGSHCHEEEEEDNCYEVEPYSPGLAPQSQQLCTPEDLSTKS
          :  .:. : .    . .  .:.:                                  
NP_001 KAFKWSSKLTVHKVIHTAEKPCKCEECGKAFKHFSALRKHKIIHTGKKPYKCEECGKAFN
     740       750       760       770       780       790         

>--
 initn: 460 init1: 460 opt: 475  Z-score: 277.7  bits: 62.3 E(85289): 9.9e-09
Smith-Waterman score: 475; 30.0% identity (56.4% similar) in 243 aa overlap (252-492:114-356)

             230       240       250         260       270         
pF1KB8 SEETKQKVERVDVNVQIDDSYYVDVGGSQKRWQCPTCE--KSYTSKYNLVTHILGHSGIK
                                     : .: . .  : .   :: ...    .  :
NP_001 DFWPDQSIKDSFQEIILRTYARCGHKNLRLRKDCESVNEGKMHEEAYNKLNQCWTTTQGK
            90       100       110       120       130       140   

     280       290       300       310       320       330         
pF1KB8 PHACTHCGKLFKQLSHLHTHMLTHQGTRPHKCQVCHKAFTQTSHLKRHMMQHSEVKPHNC
          :..  :.:.. :. . . . :   .  ::. : :.: . ::: .:   :.. . ..:
NP_001 IFQCNKYVKVFHKYSNSNRYKIRHTKKKTFKCMKCSKSFFMLSHLIQHKRIHTRENIYKC
           150       160       170       180       190       200   

     340       350       360       370       380       390         
pF1KB8 RVCGRGFAYPSELKAHEAKHASGRENICVECGLDFPTLAQLKRHLTTHRGPIQYNCSECD
       .  :..: . : :  :.  :.  .     .::  :   ... .    : :    .: :: 
NP_001 EERGKAFKWFSTLIKHKIIHTEDKPYKYKKCGKAFNISSMFTKCKIIHTGKKPCKCEECG
           210       220       230       240       250       260   

     400       410       420       430       440       450         
pF1KB8 KTFQYPSQLQNHMMKHKDIRPYICSECGMEFVQPHHLKQHSLTHKGVKEHKCGICGREFT
       :.:.  : :..: . :   .:: : :::  : :  :: .:.  : : : .::  ::. :.
NP_001 KVFNNSSTLMKHKIIHTGKKPYKCEECGKAFKQSSHLTRHKAIHTGEKPYKCEECGKAFN
           270       280       290       300       310       320   

     460       470       480       490       500       510         
pF1KB8 LLANMKRHVLIHTNIRAYQCHLCYKSFVQKQTLKAHMIVHSDVKPFKCKLCGKEFNRMHN
        .. ...: .:::. . :.:. : :.: :..::                           
NP_001 HFSALRKHQIIHTGKKPYKCEECGKAFSQSSTLRKHEIIHTEEKPYKYEECGKAFSNLSA
           330       340       350       360       370       380   

     520       530       540       550       560       570         
pF1KB8 LMGHMHLHSDSKPFKCLYCPSKFTLKGNLTRHMKVKHGVMERGLHSQGLGRGRIALAQTA
                                                                   
NP_001 LRKHEIIHTGQKPYKCEECGKAFKWSSKLTVHKVIHTAEKPCKCEECGKAFKRFSALRKH
           390       400       410       420       430       440   

>>XP_016881641 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger pro  (502 aa)
 initn: 2493 init1: 864 opt: 884  Z-score: 500.3  bits: 102.7 E(85289): 3.9e-21
Smith-Waterman score: 906; 39.3% identity (63.9% similar) in 305 aa overlap (250-554:171-475)

     220       230       240       250       260       270         
pF1KB8 QESEETKQKVERVDVNVQIDDSYYVDVGGSQKRWQCPTCEKSYTSKYNLVTHILGHSGIK
                                     .: . : .: :..  . .. .:   :.: :
XP_016 TGEKPYKCEECGKCFIQPSQFQAHRRIHTGEKPYVCKVCGKGFIYSSSFQAHQGVHTGEK
              150       160       170       180       190       200

     280       290       300       310       320       330         
pF1KB8 PHACTHCGKLFKQLSHLHTHMLTHQGTRPHKCQVCHKAFTQTSHLKRHMMQHSEVKPHNC
       :. :..::: :..  : ..:...: : .:.::.:: ::: :.:.:: :.  ::  :: .:
XP_016 PYKCNECGKSFRMKIHYQVHLVVHTGEKPYKCEVCGKAFRQSSYLKIHLKAHSVQKPFKC
              210       220       230       240       250       260

     340       350       360       370       380       390         
pF1KB8 RVCGRGFAYPSELKAHEAKHASGRENICVECGLDFPTLAQLKRHLTTHRGPIQYNCSECD
       . ::.::   :.:. :.  :.. .   : :::  :   :.:: :   : :   ::: :: 
XP_016 EECGQGFNQSSRLQIHQLIHTGEKPYKCEECGKGFSRRADLKIHCRIHTGEKPYNCEECG
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     400       410       420       430       440       450         
pF1KB8 KTFQYPSQLQNHMMKHKDIRPYICSECGMEFVQPHHLKQHSLTHKGVKEHKCGICGREFT
       :.:.  :.: .:.  :.  .:. : :::  : .  ::. :. .: : : .::: ::. : 
XP_016 KVFSQASHLLTHQRVHSGEKPFKCEECGKSFSRSAHLQAHQKVHTGEKPYKCGECGKGFK
              330       340       350       360       370       380

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pF1KB8 LLANMKRHVLIHTNIRAYQCHLCYKSFVQKQTLKAHMIVHSDVKPFKCKLCGKEFNRMHN
          :.  :  .::. . : :  : : : : ..:. :. ::.  ::.:: .::: :.:  .
XP_016 WSLNLDMHQRVHTGEKPYTCGECGKHFSQASSLQLHQSVHTGEKPYKCDVCGKVFSRSSQ
              390       400       410       420       430       440

     520       530       540       550       560       570         
pF1KB8 LMGHMHLHSDSKPFKCLYCPSKFTLKGNLTRHMKVKHGVMERGLHSQGLGRGRIALAQTA
       :. : ..:.  ::.::  : ..:. ..::. : :.                         
XP_016 LQYHRRVHTGEKPYKCEICGKRFSWRSNLVSHHKIHAAGTFYENDENSKNIRELSEGGSS
              450       460       470       480       490       500

     580       590       600       610       620       630         
pF1KB8 GVLRSLEQEEPFDLSQKRRAKVPVFQSDGESAQGSHCHEEEEEDNCYEVEPYSPGLAPQS
                                                                   
XP_016 TR                                                          
                                                                   

>--
 initn: 449 init1: 449 opt: 449  Z-score: 266.2  bits: 59.3 E(85289): 4.4e-08
Smith-Waterman score: 464; 39.1% identity (58.6% similar) in 169 aa overlap (277-445:2-170)

        250       260       270       280       290       300      
pF1KB8 GGSQKRWQCPTCEKSYTSKYNLVTHILGHSGIKPHACTHCGKLFKQLSHLHTHMLTHQGT
                                     : : . :  ::: :.: :::.::. .:   
XP_016                              MGEKCYKCDVCGKEFSQSSHLQTHQRVHTVE
                                            10        20        30 

        310       320       330       340       350       360      
pF1KB8 RPHKCQVCHKAFTQTSHLKRHMMQHSEVKPHNCRVCGRGFAYPSELKAHEAKHASGRENI
       .: ::  : :.:.. : :  :   ::  ::.::. :::.: . :.:. :.  :.. .   
XP_016 KPFKCVECGKGFSRRSTLTVHCKLHSGEKPYNCEECGRAFIHASHLQEHQRIHTGEKPFK
              40        50        60        70        80        90 

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pF1KB8 CVECGLDFPTLAQLKRHLTTHRGPIQYNCSECDKTFQYPSQLQNHMMKHKDIRPYICSEC
       :  :: .:   . :. :  .: :   :.: .: : :   :.:. :.  :   .:: : ::
XP_016 CDTCGKNFRRRSALNNHCMVHTGEKPYKCEDCGKCFTCSSNLRIHQRVHTGEKPYKCEEC
             100       110       120       130       140       150 

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pF1KB8 GMEFVQPHHLKQHSLTHKGVKEHKCGICGREFTLLANMKRHVLIHTNIRAYQCHLCYKSF
       :  :.:: ... :   : :                                         
XP_016 GKCFIQPSQFQAHRRIHTGEKPYVCKVCGKGFIYSSSFQAHQGVHTGEKPYKCNECGKSF
             160       170       180       190       200       210 

>>XP_016881642 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger pro  (502 aa)
 initn: 2493 init1: 864 opt: 884  Z-score: 500.3  bits: 102.7 E(85289): 3.9e-21
Smith-Waterman score: 906; 39.3% identity (63.9% similar) in 305 aa overlap (250-554:171-475)

     220       230       240       250       260       270         
pF1KB8 QESEETKQKVERVDVNVQIDDSYYVDVGGSQKRWQCPTCEKSYTSKYNLVTHILGHSGIK
                                     .: . : .: :..  . .. .:   :.: :
XP_016 TGEKPYKCEECGKCFIQPSQFQAHRRIHTGEKPYVCKVCGKGFIYSSSFQAHQGVHTGEK
              150       160       170       180       190       200

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pF1KB8 PHACTHCGKLFKQLSHLHTHMLTHQGTRPHKCQVCHKAFTQTSHLKRHMMQHSEVKPHNC
       :. :..::: :..  : ..:...: : .:.::.:: ::: :.:.:: :.  ::  :: .:
XP_016 PYKCNECGKSFRMKIHYQVHLVVHTGEKPYKCEVCGKAFRQSSYLKIHLKAHSVQKPFKC
              210       220       230       240       250       260

     340       350       360       370       380       390         
pF1KB8 RVCGRGFAYPSELKAHEAKHASGRENICVECGLDFPTLAQLKRHLTTHRGPIQYNCSECD
       . ::.::   :.:. :.  :.. .   : :::  :   :.:: :   : :   ::: :: 
XP_016 EECGQGFNQSSRLQIHQLIHTGEKPYKCEECGKGFSRRADLKIHCRIHTGEKPYNCEECG
              270       280       290       300       310       320

     400       410       420       430       440       450         
pF1KB8 KTFQYPSQLQNHMMKHKDIRPYICSECGMEFVQPHHLKQHSLTHKGVKEHKCGICGREFT
       :.:.  :.: .:.  :.  .:. : :::  : .  ::. :. .: : : .::: ::. : 
XP_016 KVFSQASHLLTHQRVHSGEKPFKCEECGKSFSRSAHLQAHQKVHTGEKPYKCGECGKGFK
              330       340       350       360       370       380

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pF1KB8 LLANMKRHVLIHTNIRAYQCHLCYKSFVQKQTLKAHMIVHSDVKPFKCKLCGKEFNRMHN
          :.  :  .::. . : :  : : : : ..:. :. ::.  ::.:: .::: :.:  .
XP_016 WSLNLDMHQRVHTGEKPYTCGECGKHFSQASSLQLHQSVHTGEKPYKCDVCGKVFSRSSQ
              390       400       410       420       430       440

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pF1KB8 LMGHMHLHSDSKPFKCLYCPSKFTLKGNLTRHMKVKHGVMERGLHSQGLGRGRIALAQTA
       :. : ..:.  ::.::  : ..:. ..::. : :.                         
XP_016 LQYHRRVHTGEKPYKCEICGKRFSWRSNLVSHHKIHAAGTFYENDENSKNIRELSEGGSS
              450       460       470       480       490       500

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pF1KB8 GVLRSLEQEEPFDLSQKRRAKVPVFQSDGESAQGSHCHEEEEEDNCYEVEPYSPGLAPQS
                                                                   
XP_016 TR                                                          
                                                                   

>--
 initn: 449 init1: 449 opt: 449  Z-score: 266.2  bits: 59.3 E(85289): 4.4e-08
Smith-Waterman score: 464; 39.1% identity (58.6% similar) in 169 aa overlap (277-445:2-170)

        250       260       270       280       290       300      
pF1KB8 GGSQKRWQCPTCEKSYTSKYNLVTHILGHSGIKPHACTHCGKLFKQLSHLHTHMLTHQGT
                                     : : . :  ::: :.: :::.::. .:   
XP_016                              MGEKCYKCDVCGKEFSQSSHLQTHQRVHTVE
                                            10        20        30 

        310       320       330       340       350       360      
pF1KB8 RPHKCQVCHKAFTQTSHLKRHMMQHSEVKPHNCRVCGRGFAYPSELKAHEAKHASGRENI
       .: ::  : :.:.. : :  :   ::  ::.::. :::.: . :.:. :.  :.. .   
XP_016 KPFKCVECGKGFSRRSTLTVHCKLHSGEKPYNCEECGRAFIHASHLQEHQRIHTGEKPFK
              40        50        60        70        80        90 

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pF1KB8 CVECGLDFPTLAQLKRHLTTHRGPIQYNCSECDKTFQYPSQLQNHMMKHKDIRPYICSEC
       :  :: .:   . :. :  .: :   :.: .: : :   :.:. :.  :   .:: : ::
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       :  :.:: ... :   : :                                         
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       :. :..::: :..  : ..:...: : .:.::.:: ::: :.:.:: :.  ::  :: .:
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       . ::.::   :.:. :.  :.. .   : :::  :   :.:: :   : :   ::: :: 
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       :.:.  :.: .:.  :.  .:. : :::  : .  ::. :. .: : : .::: ::. : 
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          :.  :  .::. . : :  : : : : ..:. :. ::.  ::.:: .::: :.:  .
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XP_016 TR                                                          
                                                                   

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       :. .:.  :   ::: : :.: .::: :  .: :: :. .:.: . .::.:: : :.:.:
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       ::. :.  :.  :: .:  ::.::.  : : .:   :.. .   : :::  :   ..:..
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       :   : :   ..:. : :.:.  : :.:: : :   .:: : .::  :.   .:. :. .
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>>XP_016881639 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger pro  (688 aa)
 initn: 2526 init1: 864 opt: 884  Z-score: 498.9  bits: 102.9 E(85289): 4.7e-21
Smith-Waterman score: 906; 39.3% identity (63.9% similar) in 305 aa overlap (250-554:357-661)

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       :. :..::: :..  : ..:...: : .:.::.:: ::: :.:.:: :.  ::  :: .:
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       . ::.::   :.:. :.  :.. .   : :::  :   :.:: :   : :   ::: :: 
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       :.:.  :.: .:.  :.  .:. : :::  : .  ::. :. .: : : .::: ::. : 
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       :. : ..:.  ::.::  : ..:. ..::. : :.                         
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XP_016 TR                                                          
                                                                   

>--
 initn: 612 init1: 612 opt: 624  Z-score: 358.9  bits: 77.0 E(85289): 3e-13
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>>XP_016881638 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger pro  (700 aa)
 initn: 2526 init1: 864 opt: 884  Z-score: 498.8  bits: 102.9 E(85289): 4.8e-21
Smith-Waterman score: 906; 39.3% identity (63.9% similar) in 305 aa overlap (250-554:369-673)

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pF1KB8 QESEETKQKVERVDVNVQIDDSYYVDVGGSQKRWQCPTCEKSYTSKYNLVTHILGHSGIK
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pF1KB8 PHACTHCGKLFKQLSHLHTHMLTHQGTRPHKCQVCHKAFTQTSHLKRHMMQHSEVKPHNC
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XP_016 PYKCNECGKSFRMKIHYQVHLVVHTGEKPYKCEVCGKAFRQSSYLKIHLKAHSVQKPFKC
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       . ::.::   :.:. :.  :.. .   : :::  :   :.:: :   : :   ::: :: 
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pF1KB8 KTFQYPSQLQNHMMKHKDIRPYICSECGMEFVQPHHLKQHSLTHKGVKEHKCGICGREFT
       :.:.  :.: .:.  :.  .:. : :::  : .  ::. :. .: : : .::: ::. : 
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          :.  :  .::. . : :  : : : : ..:. :. ::.  ::.:: .::: :.:  .
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       :. : ..:.  ::.::  : ..:. ..::. : :.                         
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XP_016 TR                                                          
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>--
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       :. .:.  :   ::: : :.: .::: :  .: :: :. .:.: . .::.:: : :.:.:
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       ::. :.  :.  :: .:  ::.::.  : : .:   :.. .   : :::  :   ..:..
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       :   : :   ..:. : :.:.  : :.:: : :   .:: : .::  :.   .:. :. .
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>>NP_001138296 (OMIM: 604750) zinc finger protein 234 [H  (700 aa)
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       . ::.::   :.:. :.  :.. .   : :::  :   :.:: :   : :   ::: :: 
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pF1KB8 LMGHMHLHSDSKPFKCLYCPSKFTLKGNLTRHMKVKHGVMERGLHSQGLGRGRIALAQTA
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NP_001 LQYHRRVHTGEKPYKCEICGKRFSWRSNLVSHHKIHAAGTFYENDENSKNIRELSEGGSS
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pF1KB8 GVLRSLEQEEPFDLSQKRRAKVPVFQSDGESAQGSHCHEEEEEDNCYEVEPYSPGLAPQS
                                                                   
NP_001 TR                                                          
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>--
 initn: 612 init1: 612 opt: 624  Z-score: 358.9  bits: 77.0 E(85289): 3e-13
Smith-Waterman score: 624; 37.9% identity (60.8% similar) in 240 aa overlap (233-472:129-367)

            210       220       230       240       250       260  
pF1KB8 FLPKQPPEPLLPRKAEPQESEETKQKVERVDVNVQIDDSYYVDVGGSQKRWQCPTCEKSY
                                     :.. :.  . :.   : :: .::   .::.
NP_001 YWGQIWKQIASDLIKYEDSMISISRFPRQGDLSCQVRAGLYTTHTG-QKFYQCDEYKKSF
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pF1KB8 TSKYNLVTHILGHSGIKPHACTHCGKLFKQLSHLHTHMLTHQGTRPHKCQVCHKAFTQTS
       :. .:.  :   ::: : :.: .::: :  .: :: :. .:.: . .::.:: : :.:.:
NP_001 TDVFNFDLHQQLHSGEKSHTCDECGKSFCYISALHIHQRVHMGEKCYKCDVCGKEFSQSS
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pF1KB8 HLKRHMMQHSEVKPHNCRVCGRGFAYPSELKAHEAKHASGRENICVECGLDFPTLAQLKR
       ::. :.  :.  :: .:  ::.::.  : : .:   :.. .   : :::  :   ..:..
NP_001 HLQTHQRVHTVEKPFKCVECGKGFSRRSTLTVHCKLHSGEKPYNCEECGRAFIHASHLQE
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pF1KB8 HLTTHRGPIQYNCSECDKTFQYPSQLQNHMMKHKDIRPYICSECGMEFVQPHHLKQHSLT
       :   : :   ..:. : :.:.  : :.:: : :   .:: : .::  :.   .:. :. .
NP_001 HQRIHTGEKPFKCDTCGKNFRRRSALNNHCMVHTGEKPYKCEDCGKCFTCSSNLRIHQRV
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>>XP_006723037 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger pro  (700 aa)
 initn: 2526 init1: 864 opt: 884  Z-score: 498.8  bits: 102.9 E(85289): 4.8e-21
Smith-Waterman score: 906; 39.3% identity (63.9% similar) in 305 aa overlap (250-554:369-673)

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pF1KB8 QESEETKQKVERVDVNVQIDDSYYVDVGGSQKRWQCPTCEKSYTSKYNLVTHILGHSGIK
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pF1KB8 PHACTHCGKLFKQLSHLHTHMLTHQGTRPHKCQVCHKAFTQTSHLKRHMMQHSEVKPHNC
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pF1KB8 RVCGRGFAYPSELKAHEAKHASGRENICVECGLDFPTLAQLKRHLTTHRGPIQYNCSECD
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       :.:.  :.: .:.  :.  .:. : :::  : .  ::. :. .: : : .::: ::. : 
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       :. : ..:.  ::.::  : ..:. ..::. : :.                         
XP_006 LQYHRRVHTGEKPYKCEICGKRFSWRSNLVSHHKIHAAGTFYENDENSKNIRELSEGGSS
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pF1KB8 GVLRSLEQEEPFDLSQKRRAKVPVFQSDGESAQGSHCHEEEEEDNCYEVEPYSPGLAPQS
                                                                   
XP_006 TR                                                          
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       :. .:.  :   ::: : :.: .::: :  .: :: :. .:.: . .::.:: : :.:.:
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       ::. :.  :.  :: .:  ::.::.  : : .:   :.. .   : :::  :   ..:..
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       :   : :   ..:. : :.:.  : :.:: : :   .:: : .::  :.   .:. :. .
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       :. :..::: :..  : ..:...: : .:.::.:: ::: :.:.:: :.  ::  :: .:
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       . ::.::   :.:. :.  :.. .   : :::  :   :.:: :   : :   ::: :: 
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       :.:.  :.: .:.  :.  .:. : :::  : .  ::. :. .: : : .::: ::. : 
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NP_006 YWGQIWKQIASDLIKYEDSMISISRFPRQGDLSCQVRAGLYTTHTG-QKFYQCDEYKKSF
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744 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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 start: Fri Nov  4 12:46:16 2016 done: Fri Nov  4 12:46:18 2016
 Total Scan time: 13.450 Total Display time:  0.160

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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