Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8413
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8413, 720 aa
1>>>pF1KB8413 720 - 720 aa - 720 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2869+/-0.000993; mu= 14.8612+/- 0.060
mean_var=76.3689+/-15.147, 0's: 0 Z-trim(104.6): 24 B-trim: 2 in 1/52
Lambda= 0.146763
statistics sampled from 7974 (7983) to 7974 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.617), E-opt: 0.2 (0.245), width: 16
Scan time: 3.780
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13398.1 ELMO2 gene_id:63916|Hs108|chr20 ( 720) 4714 1008.1 0
CCDS82623.1 ELMO2 gene_id:63916|Hs108|chr20 ( 632) 4123 882.9 0
CCDS5449.1 ELMO1 gene_id:9844|Hs108|chr7 ( 727) 3705 794.4 0
CCDS10833.2 ELMO3 gene_id:79767|Hs108|chr16 ( 773) 2454 529.5 7.1e-150
CCDS5450.1 ELMO1 gene_id:9844|Hs108|chr7 ( 247) 1336 292.7 4.5e-79
>>CCDS13398.1 ELMO2 gene_id:63916|Hs108|chr20 (720 aa)
initn: 4714 init1: 4714 opt: 4714 Z-score: 5390.9 bits: 1008.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4714; 100.0% identity (100.0% similar) in 720 aa overlap (1-720:1-720)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MPPPSDIVKVAIEWPGANAQLLEIDQKRPLASIIKEVCDGWSLPNPEYYTLRYADGPQLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MPPPSDIVKVAIEWPGANAQLLEIDQKRPLASIIKEVCDGWSLPNPEYYTLRYADGPQLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 ITEQTRSDIKNGTILQLAISPSRAARQLMERTQSSNMETRLDAMKELAKLSADVTFATEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ITEQTRSDIKNGTILQLAISPSRAARQLMERTQSSNMETRLDAMKELAKLSADVTFATEF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 INMDGIIVLTRLVESGTKLLSHYSEMLAFTLTAFLELMDHGIVSWDMVSITFIKQIAGYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 INMDGIIVLTRLVESGTKLLSHYSEMLAFTLTAFLELMDHGIVSWDMVSITFIKQIAGYV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 SQPMVDVSILQRSLAILESMVLNSQSLYQKIAEEITVGQLISHLQVSNQEIQTYAIALIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SQPMVDVSILQRSLAILESMVLNSQSLYQKIAEEITVGQLISHLQVSNQEIQTYAIALIN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ALFLKAPEDKRQDMANAFAQKHLRSIILNHVIRGNRPIKTEMAHQLYVLQVLTFNLLEER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ALFLKAPEDKRQDMANAFAQKHLRSIILNHVIRGNRPIKTEMAHQLYVLQVLTFNLLEER
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 MMTKMDPNDQAQRDIIFELRRIAFDAESDPSNAPGSGTEKRKAMYTKDYKMLGFTNHINP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MMTKMDPNDQAQRDIIFELRRIAFDAESDPSNAPGSGTEKRKAMYTKDYKMLGFTNHINP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 AMDFTQTPPGMLALDNMLYLAKVHQDTYIRIVLENSSREDKHECPFGRSAIELTKMLCEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AMDFTQTPPGMLALDNMLYLAKVHQDTYIRIVLENSSREDKHECPFGRSAIELTKMLCEI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 LQVGELPNEGRNDYHPMFFTHDRAFEELFGICIQLLNKTWKEMRATAEDFNKVMQVVREQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LQVGELPNEGRNDYHPMFFTHDRAFEELFGICIQLLNKTWKEMRATAEDFNKVMQVVREQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 ITRALPSKPNSLDQFKSKLRSLSYSEILRLRQSERMSQDDFQSPPIVELREKIQPEILEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ITRALPSKPNSLDQFKSKLRSLSYSEILRLRQSERMSQDDFQSPPIVELREKIQPEILEL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 IKQQRLNRLCEGSSFRKIGNRRRQERFWYCRLALNHKVLHYGDLDDNPQGEVTFESLQEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IKQQRLNRLCEGSSFRKIGNRRRQERFWYCRLALNHKVLHYGDLDDNPQGEVTFESLQEK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 IPVADIKAIVTGKDCPHMKEKSALKQNKEVLELAFSILYDPDETLNFIAPNKYEYCIWID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IPVADIKAIVTGKDCPHMKEKSALKQNKEVLELAFSILYDPDETLNFIAPNKYEYCIWID
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 GLSALLGKDMSSELTKSDLDTLLSMEMKLRLLDLENIQIPEAPPPIPKEPSSYDFVYHYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GLSALLGKDMSSELTKSDLDTLLSMEMKLRLLDLENIQIPEAPPPIPKEPSSYDFVYHYG
670 680 690 700 710 720
>>CCDS82623.1 ELMO2 gene_id:63916|Hs108|chr20 (632 aa)
initn: 4123 init1: 4123 opt: 4123 Z-score: 4715.5 bits: 882.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4123; 100.0% identity (100.0% similar) in 632 aa overlap (89-720:1-632)
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 LYITEQTRSDIKNGTILQLAISPSRAARQLMERTQSSNMETRLDAMKELAKLSADVTFAT
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MERTQSSNMETRLDAMKELAKLSADVTFAT
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 EFINMDGIIVLTRLVESGTKLLSHYSEMLAFTLTAFLELMDHGIVSWDMVSITFIKQIAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EFINMDGIIVLTRLVESGTKLLSHYSEMLAFTLTAFLELMDHGIVSWDMVSITFIKQIAG
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 YVSQPMVDVSILQRSLAILESMVLNSQSLYQKIAEEITVGQLISHLQVSNQEIQTYAIAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 YVSQPMVDVSILQRSLAILESMVLNSQSLYQKIAEEITVGQLISHLQVSNQEIQTYAIAL
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 INALFLKAPEDKRQDMANAFAQKHLRSIILNHVIRGNRPIKTEMAHQLYVLQVLTFNLLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 INALFLKAPEDKRQDMANAFAQKHLRSIILNHVIRGNRPIKTEMAHQLYVLQVLTFNLLE
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 ERMMTKMDPNDQAQRDIIFELRRIAFDAESDPSNAPGSGTEKRKAMYTKDYKMLGFTNHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ERMMTKMDPNDQAQRDIIFELRRIAFDAESDPSNAPGSGTEKRKAMYTKDYKMLGFTNHI
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 NPAMDFTQTPPGMLALDNMLYLAKVHQDTYIRIVLENSSREDKHECPFGRSAIELTKMLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 NPAMDFTQTPPGMLALDNMLYLAKVHQDTYIRIVLENSSREDKHECPFGRSAIELTKMLC
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 EILQVGELPNEGRNDYHPMFFTHDRAFEELFGICIQLLNKTWKEMRATAEDFNKVMQVVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EILQVGELPNEGRNDYHPMFFTHDRAFEELFGICIQLLNKTWKEMRATAEDFNKVMQVVR
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 EQITRALPSKPNSLDQFKSKLRSLSYSEILRLRQSERMSQDDFQSPPIVELREKIQPEIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EQITRALPSKPNSLDQFKSKLRSLSYSEILRLRQSERMSQDDFQSPPIVELREKIQPEIL
400 410 420 430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 ELIKQQRLNRLCEGSSFRKIGNRRRQERFWYCRLALNHKVLHYGDLDDNPQGEVTFESLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ELIKQQRLNRLCEGSSFRKIGNRRRQERFWYCRLALNHKVLHYGDLDDNPQGEVTFESLQ
460 470 480 490 500 510
600 610 620 630 640 650
pF1KB8 EKIPVADIKAIVTGKDCPHMKEKSALKQNKEVLELAFSILYDPDETLNFIAPNKYEYCIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EKIPVADIKAIVTGKDCPHMKEKSALKQNKEVLELAFSILYDPDETLNFIAPNKYEYCIW
520 530 540 550 560 570
660 670 680 690 700 710
pF1KB8 IDGLSALLGKDMSSELTKSDLDTLLSMEMKLRLLDLENIQIPEAPPPIPKEPSSYDFVYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IDGLSALLGKDMSSELTKSDLDTLLSMEMKLRLLDLENIQIPEAPPPIPKEPSSYDFVYH
580 590 600 610 620 630
720
pF1KB8 YG
::
CCDS82 YG
>>CCDS5449.1 ELMO1 gene_id:9844|Hs108|chr7 (727 aa)
initn: 2768 init1: 2157 opt: 3705 Z-score: 4236.2 bits: 794.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3705; 75.7% identity (92.8% similar) in 725 aa overlap (1-717:1-724)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MPPPSDIVKVAIEWPGANAQLLEIDQKRPLASIIKEVCDGWSLPNPEYYTLRYADGPQLY
::::.:::::::::::: .:.:::::.::..::::::::::: : ::..:..::. ..:
CCDS54 MPPPADIVKVAIEWPGAYPKLMEIDQKKPLSAIIKEVCDGWSLANHEYFALQHADSSNFY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 ITEQTRSDIKNGTILQLAISPSRAARQLMERTQSSNMETRLDAMKELAKLSADVTFATEF
:::..:..:::::::.:. ::.. :.:: :: :::.:...:.:.:.::.:: ::::: ::
CCDS54 ITEKNRNEIKNGTILRLTTSPAQNAQQLHERIQSSSMDAKLEALKDLASLSRDVTFAQEF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB8 INMDGIIVLTRLVESGT-------KLLSH-YSEMLAFTLTAFLELMDHGIVSWDMVSITF
::.::: .::..::::: :... ...::.::::::.::::::::::: :..:
CCDS54 INLDGISLLTQMVESGTERYQKLQKIMKPCFGDMLSFTLTAFVELMDHGIVSWDTFSVAF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 IKQIAGYVSQPMVDVSILQRSLAILESMVLNSQSLYQKIAEEITVGQLISHLQVSNQEIQ
::.::..:.. .:.:::::::::::::::::..::::.:.:::.:::: ::: :.::::
CCDS54 IKKIASFVNKSAIDISILQRSLAILESMVLNSHDLYQKVAQEITIGQLIPHLQGSDQEIQ
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 TYAIALINALFLKAPEDKRQDMANAFAQKHLRSIILNHVIRGNRPIKTEMAHQLYVLQVL
::.::.:::::::::...::.::: .:::.::::::.::::..: :..::::::::::::
CCDS54 TYTIAVINALFLKAPDERRQEMANILAQKQLRSIILTHVIRAQRAINNEMAHQLYVLQVL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 TFNLLEERMMTKMDPNDQAQRDIIFELRRIAFDAESDPSNAPGSGTEKRKAMYTKDYKML
::::::.::::::::.::::::::::::::::::::.:.:. :: ::::.:::.::: :
CCDS54 TFNLLEDRMMTKMDPQDQAQRDIIFELRRIAFDAESEPNNSSGS-MEKRKSMYTRDYKKL
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 GFTNHINPAMDFTQTPPGMLALDNMLYLAKVHQDTYIRIVLENSSREDKHECPFGRSAIE
:: ::.:::::::::::::::::::::.:: :::.::::::::::::::::::::::.::
CCDS54 GFINHVNPAMDFTQTPPGMLALDNMLYFAKHHQDAYIRIVLENSSREDKHECPFGRSSIE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 LTKMLCEILQVGELPNEGRNDYHPMFFTHDRAFEELFGICIQLLNKTWKEMRATAEDFNK
:::::::::.:::::.: ::.:::::::::.:::.: ::::::::::::::::.:::::
CCDS54 LTKMLCEILKVGELPSETCNDFHPMFFTHDRSFEEFFCICIQLLNKTWKEMRATSEDFNK
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 VMQVVREQITRALPSKPNSLDQFKSKLRSLSYSEILRLRQSERMSQDDFQSPPIVELREK
:::::.::. ::: .::.:::::::::..:::.:::..::::::.:.:::: ::.::.::
CCDS54 VMQVVKEQVMRALTTKPSSLDQFKSKLQNLSYTEILKIRQSERMNQEDFQSRPILELKEK
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 IQPEILELIKQQRLNRLCEGSSFRKIGNRRRQERFWYCRLALNHKVLHYGDLDDNPQGEV
::::::::::::::::: ::. :::.. ::::..::::::. ::::::::::...:::::
CCDS54 IQPEILELIKQQRLNRLVEGTCFRKLNARRRQDKFWYCRLSPNHKVLHYGDLEESPQGEV
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB8 TFESLQEKIPVADIKAIVTGKDCPHMKEKSALKQNKEVLELAFSILYDPDETLNFIAPNK
.:::.:.:::::::.::::::::::::.:::::::::::::::::: . ::::::.:
CCDS54 PHDSLQDKLPVADIKAVVTGKDCPHMKEKGALKQNKEVLELAFSILYDSNCQLNFIAPDK
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB8 YEYCIWIDGLSALLGKDMSSELTKSDLDTLLSMEMKLRLLDLENIQIPEAPPPIPKEPSS
.::::: :::.::::::: :.::..:::::::::.:::::::::::::.::::::::::.
CCDS54 HEYCIWTDGLNALLGKDMMSDLTRNDLDTLLSMEIKLRLLDLENIQIPDAPPPIPKEPSN
660 670 680 690 700 710
720
pF1KB8 YDFVYHYG
:::::
CCDS54 YDFVYDCN
720
>>CCDS10833.2 ELMO3 gene_id:79767|Hs108|chr16 (773 aa)
initn: 2135 init1: 985 opt: 2454 Z-score: 2804.2 bits: 529.5 E(32554): 7.1e-150
Smith-Waterman score: 2454; 50.6% identity (80.3% similar) in 720 aa overlap (1-717:54-766)
10 20 30
pF1KB8 MPPPSDIVKVAIEWPGANAQLLEIDQKRPL
: :: ..::.::. : ::...:: .::
CCDS10 PRPQGPQARCTLGRRCTVSGKCRRPRPSWTMAPPRNVVKIAIKMRDAIPQLIQLDQAKPL
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 ASIIKEVCDGWSLPNPEYYTLRYADGPQLYITEQTRSDIKNGTILQLAISPSRAARQLME
:...:::::.::: . : :.:..::: . ::::..:..::::.:: :. .:. :.::.
CCDS10 AAVLKEVCDAWSLTHSERYALQFADGHRRYITENNRAEIKNGSILCLSTAPDLEAEQLLG
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 RTQSSNMETRLDAMKELAKLSADVTFATEFINMDGIIVLTRLVESGTKLLSHYSEMLAFT
::.. : : .:...:. :..:. :: : :. .:. .: ..:.: : .:.::..
CCDS10 GLQSNSPEGRREALRRLVPLASDMIFAREVISRNGLQILGTIIEDGDDL----GEVLALS
150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 LTAFLELMDHGIVSWDMVSITFIKQIAGYVSQPMVDVSILQRSLAILESMVLNSQSLYQK
: :: :::.::.:::. .:: :..... ::.. ..:.:. .:..:::..:.: .: :
CCDS10 LRAFSELMEHGVVSWETLSIPFVRKVVCYVNMNLMDASVPPLALGLLESVTLSSPALGQL
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 IAEEITVGQLISHLQVSNQEIQTYAIALINALFLKAPEDKRQDMANAFAQKHLRSIILNH
. :. . .:. :::: ::..:: :.::..::. : .:. : . . :..::..: ..
CCDS10 VKSEVPLDRLLVHLQVMNQQLQTKAMALLTALLQGASPVERKHMLDYLWQRNLRQFIYKN
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 VIRGNRPIKTEMAHQLYVLQVLTFNLLEERMMTKMDPNDQAQRDIIFELRRIAFDAESDP
.:.. :. ::::.:::::.: ..::: :: : .:: .: ::. . ::. ::..:..
CCDS10 IIHSAAPMGDEMAHHLYVLQALMLGLLEPRMRTPLDPYSQEQREQLQVLRQAAFEVEGES
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 SNAPGSGTEKRKAMYTKDYKMLGFTNHINPAMDFTQTPPGMLALDNMLYLAKVHQDTYIR
:.: : ....:... ..... :::.: :::.:. ..:::.::::::::... ..: :
CCDS10 SGA-GLSADRRRSLCAREFRKLGFSNS-NPAQDLERVPPGLLALDNMLYFSRNAPSAYSR
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 IVLENSSREDKHECPFGRSAIELTKMLCEILQVGELPNEGRNDYHPMFFTHDRAFEELFG
.:::::::::::::::.:..:.:: .:::.:.::: .: .:. :::: .:..:.:::
CCDS10 FVLENSSREDKHECPFARGSIQLTVLLCELLRVGEPCSETAQDFSPMFFGQDQSFHELFC
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 ICIQLLNKTWKEMRATAEDFNKVMQVVREQITRALPSKPNSLDQFKSKLRSLSYSEILRL
. :::::::::::::: :::.:::::::::..:.: ::.::. :..:. .:.:.:.:::
CCDS10 VGIQLLNKTWKEMRATQEDFDKVMQVVREQLARTLALKPTSLELFRTKVNALTYGEVLRL
500 510 520 530 540 550
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 RQSERMSQDDFQSPPIVELREKIQPEILELIKQQRLNRLCEGSSFRKIGNRRRQERFWYC
::.::. :. .:::.:::::..::.. ::.:::: :::::. ::::..::::...:.:
CCDS10 RQTERLHQEGTLAPPILELREKLKPELMGLIRQQRLLRLCEGTLFRKISSRRRQDKLWFC
560 570 580 590 600 610
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 RLALNHKVLHYGDLDDNPQGEVTFESLQEKIPVADIKAIVTGKDCPHMKEKSALKQNKEV
:. :::.:.:::.... . :.::: :..::::..:..:::::::..::.. ::::..
CCDS10 CLSPNHKLLQYGDMEEGASPP-TLESLPEQLPVADMRALLTGKDCPHVREKGSGKQNKDL
620 630 640 650 660 670
640 650 660 670 680
pF1KB8 LELAFSILYDPDET---LNFIAPNKYEYCIWIDGLSALLGKDMSSELTKSDLDTLLSMEM
:::::: :: : ::::::.: :. .: ::::::::. :.:: :. ::. ::.::
CCDS10 YELAFSISYDRGEEEAYLNFIAPSKREFYLWTDGLSALLGSPMGSEQTRLDLEQLLTMET
680 690 700 710 720 730
690 700 710 720
pF1KB8 KLRLLDLENIQIPEAPPPIPKEPSSYDFVYHYG
:::::.:::. ::: :::.: :....: :
CCDS10 KLRLLELENVPIPERPPPVPPPPTNFNFCYDCSIAEP
740 750 760 770
>>CCDS5450.1 ELMO1 gene_id:9844|Hs108|chr7 (247 aa)
initn: 1336 init1: 1336 opt: 1336 Z-score: 1533.1 bits: 292.7 E(32554): 4.5e-79
Smith-Waterman score: 1336; 79.1% identity (94.3% similar) in 244 aa overlap (474-717:1-244)
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 AFEELFGICIQLLNKTWKEMRATAEDFNKVMQVVREQITRALPSKPNSLDQFKSKLRSLS
::::.::. ::: .::.:::::::::..::
CCDS54 MQVVKEQVMRALTTKPSSLDQFKSKLQNLS
10 20 30
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 YSEILRLRQSERMSQDDFQSPPIVELREKIQPEILELIKQQRLNRLCEGSSFRKIGNRRR
:.:::..::::::.:.:::: ::.::.::::::::::::::::::: ::. :::.. :::
CCDS54 YTEILKIRQSERMNQEDFQSRPILELKEKIQPEILELIKQQRLNRLVEGTCFRKLNARRR
40 50 60 70 80 90
570 580 590 600 610 620
pF1KB8 QERFWYCRLALNHKVLHYGDLDDNPQGEVTFESLQEKIPVADIKAIVTGKDCPHMKEKSA
:..::::::. ::::::::::...::::: .:::.:.:::::::.::::::::::::.:
CCDS54 QDKFWYCRLSPNHKVLHYGDLEESPQGEVPHDSLQDKLPVADIKAVVTGKDCPHMKEKGA
100 110 120 130 140 150
630 640 650 660 670 680
pF1KB8 LKQNKEVLELAFSILYDPDETLNFIAPNKYEYCIWIDGLSALLGKDMSSELTKSDLDTLL
::::::::::::::::: . ::::::.:.::::: :::.::::::: :.::..::::::
CCDS54 LKQNKEVLELAFSILYDSNCQLNFIAPDKHEYCIWTDGLNALLGKDMMSDLTRNDLDTLL
160 170 180 190 200 210
690 700 710 720
pF1KB8 SMEMKLRLLDLENIQIPEAPPPIPKEPSSYDFVYHYG
:::.:::::::::::::.::::::::::.:::::
CCDS54 SMEIKLRLLDLENIQIPDAPPPIPKEPSNYDFVYDCN
220 230 240
720 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 12:44:04 2016 done: Fri Nov 4 12:44:05 2016
Total Scan time: 3.780 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]