Result of FASTA (ccds) for pF1KB8363
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8363, 503 aa
  1>>>pF1KB8363 503 - 503 aa - 503 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5243+/-0.00103; mu= 16.6555+/- 0.061
 mean_var=67.1336+/-13.740, 0's: 0 Z-trim(103.4): 69  B-trim: 0 in 0/49
 Lambda= 0.156532
 statistics sampled from 7336 (7408) to 7336 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.59), E-opt: 0.2 (0.228), width:  16
 Scan time:  2.970

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS10139.1 CYP19A1 gene_id:1588|Hs108|chr15       ( 503) 3319 758.9       0
CCDS33491.1 CYP24A1 gene_id:1591|Hs108|chr20       ( 514)  348 88.0 2.7e-17
CCDS34119.1 CYP4V2 gene_id:285440|Hs108|chr4       ( 525)  335 85.1 2.1e-16
CCDS33285.1 CYP27C1 gene_id:339761|Hs108|chr2      ( 372)  320 81.6 1.7e-15
CCDS9954.1 CYP46A1 gene_id:10858|Hs108|chr14       ( 500)  307 78.7 1.6e-14
CCDS64723.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7       ( 393)  303 77.8 2.5e-14
CCDS5676.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7        ( 503)  303 77.8 3.1e-14
CCDS5675.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7        ( 504)  293 75.6 1.5e-13
CCDS55123.1 CYP51A1 gene_id:1595|Hs108|chr7        ( 404)  289 74.6 2.3e-13
CCDS5673.1 CYP3A7 gene_id:1551|Hs108|chr7          ( 503)  286 74.0 4.4e-13
CCDS75639.1 CYP3A51P gene_id:100861540|Hs108|chr7  ( 535)  286 74.0 4.7e-13
CCDS7686.1 CYP2E1 gene_id:1571|Hs108|chr10         ( 493)  285 73.8 5.1e-13
CCDS55721.1 CYP2C8 gene_id:1558|Hs108|chr10        ( 388)  282 73.0 6.6e-13
CCDS12569.1 CYP2A7 gene_id:1549|Hs108|chr19        ( 494)  283 73.3 6.9e-13
CCDS73166.1 CYP2C8 gene_id:1558|Hs108|chr10        ( 420)  282 73.0 7.1e-13
CCDS7438.1 CYP2C8 gene_id:1558|Hs108|chr10         ( 490)  282 73.1 8.1e-13
CCDS34047.1 CYP2U1 gene_id:113612|Hs108|chr4       ( 544)  281 72.9   1e-12
CCDS5674.1 CYP3A4 gene_id:1576|Hs108|chr7          ( 503)  280 72.6 1.1e-12
CCDS7818.1 CYP2R1 gene_id:120227|Hs108|chr11       ( 501)  279 72.4 1.3e-12
CCDS5672.1 CYP3A5 gene_id:1577|Hs108|chr7          ( 502)  278 72.2 1.5e-12
CCDS7426.1 CYP26A1 gene_id:1592|Hs108|chr10        ( 497)  273 71.0 3.3e-12
CCDS12568.1 CYP2A6 gene_id:1548|Hs108|chr19        ( 494)  272 70.8 3.9e-12
CCDS7437.1 CYP2C9 gene_id:1559|Hs108|chr10         ( 490)  269 70.1 6.2e-12
CCDS7427.1 CYP26A1 gene_id:1592|Hs108|chr10        ( 428)  268 69.9 6.4e-12
CCDS7436.1 CYP2C19 gene_id:1557|Hs108|chr10        ( 490)  260 68.1 2.5e-11
CCDS7435.1 CYP2C18 gene_id:1562|Hs108|chr10        ( 490)  257 67.4   4e-11
CCDS12570.1 CYP2B6 gene_id:1555|Hs108|chr19        ( 491)  255 67.0 5.5e-11
CCDS33657.1 CYP2D6 gene_id:1565|Hs108|chr22        ( 446)  254 66.7   6e-11
CCDS46721.1 CYP2D6 gene_id:1565|Hs108|chr22        ( 497)  254 66.8 6.5e-11
CCDS44460.1 CYP2C18 gene_id:1562|Hs108|chr10       ( 431)  253 66.5 6.8e-11
CCDS12571.1 CYP2A13 gene_id:1553|Hs108|chr19       ( 494)  253 66.5 7.6e-11
CCDS81318.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1         ( 497)  253 66.5 7.6e-11
CCDS542.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1           ( 511)  253 66.5 7.8e-11
CCDS41328.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1         ( 512)  253 66.5 7.8e-11


>>CCDS10139.1 CYP19A1 gene_id:1588|Hs108|chr15            (503 aa)
 initn: 3319 init1: 3319 opt: 3319  Z-score: 4050.0  bits: 758.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3319; 99.4% identity (99.4% similar) in 503 aa overlap (1-503:1-503)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MVLEMLNPIHYNITSIVPEAMPAATMPVLLLTGLFLLVWNYEGTSSIPGPGYCMGIGPLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MVLEMLNPIHYNITSIVPEAMPAATMPVLLLTGLFLLVWNYEGTSSIPGPGYCMGIGPLI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 SHGRFLWMGIGSACNYYNRVYGEFMRVWISGEGTLIISKSSSMFHIMKHNHYSSRFGSKL
       :::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SHGRFLWMGIGSACNYYNRVYGEFMRVWISGEETLIISKSSSMFHIMKHNHYSSRFGSKL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 GLQCIGMHEKGIIFNNNPELWKTTRPFFMKALSGPGLVRMVTVCAESLKTHLDRLEEVTN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GLQCIGMHEKGIIFNNNPELWKTTRPFFMKALSGPGLVRMVTVCAESLKTHLDRLEEVTN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 ESGYVDVLTLLRRVMLDTSNTLFLRISLDESAIVVKIQGYFDAWQALLIKPDIFFKISWL
       :::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ESGYVDVLTLLRRVMLDTSNTLFLRIPLDESAIVVKIQGYFDAWQALLIKPDIFFKISWL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 YKKYEKSVKDLKDAIEVLIAEKRRRISTEEKLEECMDFATELILAEKRGDLTRENVNQCI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YKKYEKSVKDLKDAIEVLIAEKRRRISTEEKLEECMDFATELILAEKRGDLTRENVNQCI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 LEMLIAAPDTMSVSLFFMLFLIAKHPNVEEAIIKEIQTVIGERDIKIDDIQKLKVMENFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LEMLIAAPDTMSVSLFFMLFLIAKHPNVEEAIIKEIQTVIGERDIKIDDIQKLKVMENFI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 YESMRYQPVVDLVMRKALEDDVIDGYPVKKGTNIILNIGRMHRLEFFPKPNEFTLENFAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YESMRYQPVVDLVMRKALEDDVIDGYPVKKGTNIILNIGRMHRLEFFPKPNEFTLENFAK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 NVPYRYFQPFGFGPRGCAGKYIAMVMMKAILVTLLRRFHVKTLQGQCVESIQKIHDSSLH
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS10 NVPYRYFQPFGFGPRGCAGKYIAMVMMKAILVTLLRRFHVKTLQGQCVESIQKIHDLSLH
              430       440       450       460       470       480

              490       500   
pF1KB8 PDETKNMLEMIFTPRNSDRCLEH
       :::::::::::::::::::::::
CCDS10 PDETKNMLEMIFTPRNSDRCLEH
              490       500   

>>CCDS33491.1 CYP24A1 gene_id:1591|Hs108|chr20            (514 aa)
 initn: 258 init1:  98 opt: 348  Z-score: 423.9  bits: 88.0 E(32554): 2.7e-17
Smith-Waterman score: 364; 21.2% identity (56.9% similar) in 480 aa overlap (42-495:53-514)

              20        30        40        50        60        70 
pF1KB8 NITSIVPEAMPAATMPVLLLTGLFLLVWNYEGTSSIPGPGYCMGIGPLISHGRFLWMGIG
                                     ......:::     .: :.   ..:: : :
CCDS33 QPPRLVTSTAYTSPQPREVPVCPLTAGGETQNAAALPGPTSWPLLGSLL---QILWKG-G
             30        40        50        60        70            

                   80        90       100        110       120     
pF1KB8 SACNY-----YNRVYGEFMRVWISGEGTLIISKSSSMFHIMK-HNHYSSRFGSKLGLQCI
          ..     :.. ::...:. ...  .. ...   .  ... .. : .:.  :      
CCDS33 LKKQHDTLVEYHKKYGKIFRMKLGSFESVHLGSPCLLEALYRTESAYPQRLEIKPWKAYR
       80        90       100       110       120       130        

         130        140       150        160       170       180   
pF1KB8 GMHEKGI-IFNNNPELWKTTRPFFMKALSGPGLV-RMVTVCAESLKTHLDRLEEVTNESG
        ....:  ..  . : :. .:  :.: :  :: : .. .   : :   . :..:. .: :
CCDS33 DYRKEGYGLLILEGEDWQRVRSAFQKKLMKPGEVMKLDNKINEVLADFMGRIDELCDERG
      140       150       160       170       180       190        

            190               200       210        220       230   
pF1KB8 YV-DVLTLLRR--------VMLDTSNTLFLRISLDESA-IVVKIQGYFDAWQALLIKPDI
       .: :. . : .        :. .    :. . . ::.. ... :. .....  ... :  
CCDS33 HVEDLYSELNKWSFESICLVLYEKRFGLLQKNAGDEAVNFIMAIKTMMSTFGRMMVTPVE
      200       210       220       230       240       250        

             240       250       260       270       280       290 
pF1KB8 FFKI--SWLYKKYEKSVKDLKDAIEVLIAEKRRRISTEEKLEECMDFATELILAEKRGDL
       . :   . ... .  .   .  .... : .. .. : . .     ::  . :  ..:  :
CCDS33 LHKSLNTKVWQDHTLAWDTIFKSVKACIDNRLEKYSQQPS----ADFLCD-IYHQNR--L
      260       270       280       290           300        310   

             300       310       320       330       340        350
pF1KB8 TRENVNQCILEMLIAAPDTMSVSLFFMLFLIAKHPNVEEAIIKEIQTVIGERDI-KIDDI
       .....   . :. .:: .: . ::...:. ....:.:.. ..::::.:. : .. . .:.
CCDS33 SKKELYAAVTELQLAAVETTANSLMWILYNLSRNPQVQQKLLKEIQSVLPENQVPRAEDL
             320       330       340       350       360       370 

              360       370       380       390       400          
pF1KB8 QKLKVMENFIYESMRYQPVVDLVMRKALEDDVIDGYPVKKGTNIILNIGRMHRLE-FFPK
       ...  ..  . ::::  : : .. :   .  :.  : . ::: ..::   .   :  :  
CCDS33 RNMPYLKACLKESMRLTPSVPFTTRTLDKATVLGEYALPKGTVLMLNTQVLGSSEDNFED
             380       390       400       410       420       430 

     410           420       430       440       450       460     
pF1KB8 PNEFT----LENFAKNVPYRYFQPFGFGPRGCAGKYIAMVMMKAILVTLLRRFHVKTLQG
        ..:     :..  :  :. .. ::: : : : :. .: ....  :  ..:.. ... ..
CCDS33 SSQFRPERWLQEKEKINPFAHL-PFGVGKRMCIGRRLAELQLHLALCWIVRKYDIQATDN
             440       450        460       470       480       490

         470       480       490       500   
pF1KB8 QCVESIQKIHDSSLHPDETKNMLEMIFTPRNSDRCLEH
          : .. .:...: :..    : . :  :        
CCDS33 ---EPVEMLHSGTLVPSRE---LPIAFCQR        
                 500          510            

>>CCDS34119.1 CYP4V2 gene_id:285440|Hs108|chr4            (525 aa)
 initn: 227 init1: 105 opt: 335  Z-score: 407.8  bits: 85.1 E(32554): 2.1e-16
Smith-Waterman score: 343; 29.0% identity (62.4% similar) in 255 aa overlap (233-464:246-494)

            210       220       230       240       250       260  
pF1KB8 FLRISLDESAIVVKIQGYFDAWQALLIKPDIFFKISWLYKKYEKSVKDLKDAIEVLIAEK
                                     ..:: .: .::   :.. :.   . .:::.
CCDS34 DSEYVRAVYRMSEMIFRRIKMPWLWLDLWYLMFKEGWEHKK---SLQILHTFTNSVIAER
         220       230       240       250          260       270  

            270                     280       290        300       
pF1KB8 RRRISTEE--------------KLEECMDFATELILAEKRGD-LTRENVNQCILEMLIAA
         .....:              : .  .:.   : ... .:. :..:.. . .  ... .
CCDS34 ANEMNANEDCRGDGRGSAPSKNKRRAFLDLL--LSVTDDEGNRLSHEDIREEVDTFMFEG
            280       290       300         310       320       330

       310       320       330       340         350       360     
pF1KB8 PDTMSVSLFFMLFLIAKHPNVEEAIIKEIQTVIGERD--IKIDDIQKLKVMENFIYESMR
        :: .... . :.:....:.:.. . .:.. :.:. :    ..:..::. .:  : :..:
CCDS34 HDTTAAAINWSLYLLGSNPEVQKKVDHELDDVFGKSDRPATVEDLKKLRYLECVIKETLR
              340       350       360       370       380       390

         370       380       390       400        410        420   
pF1KB8 YQPVVDLVMRKALEDDVIDGYPVKKGTNIILNIGRMHRL-EFFPKPNEFTLENF-AKNV-
         : : :  :.. ::  . :: : :::. ..    .::  ..::.:.::  : :  .:. 
CCDS34 LFPSVPLFARSVSEDCEVAGYRVLKGTEAVIIPYALHRDPRYFPNPEEFQPERFFPENAQ
              400       410       420       430       440       450

               430       440       450       460       470         
pF1KB8 ---PYRYFQPFGFGPRGCAGKYIAMVMMKAILVTLLRRFHVKTLQGQCVESIQKIHDSSL
          :: :  ::. :::.: :. .:..  :.::  .::.: ... :               
CCDS34 GRHPYAYV-PFSAGPRNCIGQKFAVMEEKTILSCILRHFWIESNQKREELGLEGQLILRP
               460       470       480       490       500         

     480       490       500   
pF1KB8 HPDETKNMLEMIFTPRNSDRCLEH
                               
CCDS34 SNGIWIKLKRRNADER        
     510       520             

>>CCDS33285.1 CYP27C1 gene_id:339761|Hs108|chr2           (372 aa)
 initn: 284 init1: 138 opt: 320  Z-score: 391.9  bits: 81.6 E(32554): 1.7e-15
Smith-Waterman score: 330; 29.8% identity (58.4% similar) in 255 aa overlap (219-462:102-343)

      190       200       210       220        230         240     
pF1KB8 TLLRRVMLDTSNTLFLRISLDESAIVVKIQGYFDAW-QALLIKPDIFFKISW--LYKKYE
                                     : .  : . .. ::   :  ::  :.:  .
CCDS33 CLENSIPQLTVEYIEALELMFSMFKTSMYAGAIPRWLRPFIPKPWREFCRSWDGLFKFSQ
              80        90       100       110       120       130 

         250        260       270       280       290       300    
pF1KB8 KSVKD-LKDAIEVLIAEKRRRISTEEKLEECMDFATELILAEKRGDLTRENVNQCILEML
         : . :.: :.  . .. ::.:          . : :.:..    :: ...   . :::
CCDS33 IHVDNKLRD-IQYQM-DRGRRVSG--------GLLTYLFLSQA---LTLQEIYANVTEML
             140         150               160          170        

          310       320       330       340        350       360   
pF1KB8 IAAPDTMSVSLFFMLFLIAKHPNVEEAIIKEIQTVIGERDIKID-DIQKLKVMENFIYES
       .:. :: : .: . ..:.:.::.:.... .::   .::: .    :. :. ... .. :.
CCDS33 LAGVDTTSFTLSWTVYLLARHPEVQQTVYREIVKNLGERHVPTAADVPKVPLVRALLKET
      180       190       200       210       220       230        

           370       380       390        400       410       420  
pF1KB8 MRYQPVVDLVMRKALEDDVIDGYPVKKGTNIIL-NIGRMHRLEFFPKPNEFTLENFAKNV
       .:  ::.    : . :: :: :: . :::.. : . .  .. : ::. .::  : . .. 
CCDS33 LRLFPVLPGNGRVTQEDLVIGGYLIPKGTQLALCHYATSYQDENFPRAKEFRPERWLRKG
      240       250       260       270       280       290        

                 430       440       450       460       470       
pF1KB8 PYRYFQ-----PFGFGPRGCAGKYIAMVMMKAILVTLLRRFHVKTLQGQCVESIQKIHDS
            .     ::: : :.: :. :: . .. ... ::..:..::               
CCDS33 DLDRVDNFGSIPFGHGVRSCIGRRIAELEIHLVVIQLLQHFEIKTSSQTNAVHAKTHGLL
      300       310       320       330       340       350        

       480       490       500   
pF1KB8 SLHPDETKNMLEMIFTPRNSDRCLEH
                                 
CCDS33 TPGGPIHVRFVNRK            
      360       370              

>>CCDS9954.1 CYP46A1 gene_id:10858|Hs108|chr14            (500 aa)
 initn: 168 init1: 109 opt: 307  Z-score: 374.0  bits: 78.7 E(32554): 1.6e-14
Smith-Waterman score: 341; 21.5% identity (57.5% similar) in 447 aa overlap (41-466:30-466)

               20        30        40        50        60          
pF1KB8 YNITSIVPEAMPAATMPVLLLTGLFLLVWNYEGTSSIPGPGYCMGIGPLISH-----GRF
                                     ::   . : :.. .:  : . .     :: 
CCDS99  MSPGLLLLGSAVLLAFGLCCTFVHRARSRYEHIPGPPRPSFLLGHLPCFWKKDEVGGRV
                10        20        30        40        50         

          70        80        90       100       110       120     
pF1KB8 LWMGIGSACNYYNRVYGEFMRVWISGEGTLIISKSSSMFHIMKHNHYSSRFGSKLGLQCI
       :     ..   . . ::  .:: .  . ..:...  :. ...  ..:..      .:: .
CCDS99 LQ----DVFLDWAKKYGPVVRVNVFHKTSVIVTSPESVKKFLMSTKYNKDSKMYRALQTV
      60            70        80        90       100       110     

            130       140       150       160       170       180  
pF1KB8 -G--MHEKGIIFNNNPELWKTTRPFFMKALSGPGLVRMVTVCAESLKTHLDRLEEVTNES
        :  .  .:.. . : : :.  :  .  :.:  .:: .. .  :. .  .. ::  .. .
CCDS99 FGERLFGQGLVSECNYERWHKQRRVIDLAFSRSSLVSLMETFNEKAEQLVEILEAKADGQ
         120       130       140       150       160       170     

            190       200        210       220       230           
pF1KB8 GYVDVLTLLRRVMLDTSNTLFLRISLD-ESAIVVKIQGYFDAWQALLIKPDIFFK--ISW
         :..  .:  . .:    .. . ..  :.....  :  ..    :...     .  .. 
CCDS99 TPVSMQDMLTYTAMD----ILAKAAFGMETSMLLGAQKPLSQAVKLMLEGITASRNTLAK
         180       190           200       210       220       230 

     240       250         260          270       280       290    
pF1KB8 LYKKYEKSVKDLKDAIEVL--IAE---KRRRISTEEKLEECMDFATELILAEKRGDLTRE
       .    .:........:. :  ...   .::: . ..  :   :. :... ::. :    :
CCDS99 FLPGKRKQLREVRESIRFLRQVGRDWVQRRREALKRGEEVPADILTQILKAEE-GAQDDE
             240       250       260       270       280        290

          300       310       320       330       340        350   
pF1KB8 NVNQCILEMLIAAPDTMSVSLFFMLFLIAKHPNVEEAIIKEIQTVIG-ERDIKIDDIQKL
       .. . .. ..::. .: .  : : .. ....:..   .  :.. ::: .: . ..:. .:
CCDS99 GLLDNFVTFFIAGHETSANHLAFTVMELSRQPEIVARLQAEVDEVIGSKRYLDFEDLGRL
              300       310       320       330       340       350

           360       370       380       390       400        410  
pF1KB8 KVMENFIYESMRYQPVVDLVMRKALEDDVIDGYPVKKGTNIILNIGRMHRLE-FFPKPNE
       . . . . ::.:  : .  ..:   :. .:::  :  .: ....   : :.. .:  :  
CCDS99 QYLSQVLKESLRLYPPAWGTFRLLEEETLIDGVRVPGNTPLLFSTYVMGRMDTYFEDPLT
              360       370       380       390       400       410

            420          430       440       450       460         
pF1KB8 FTLENFAKNVP---YRYFQPFGFGPRGCAGKYIAMVMMKAILVTLLRRFHVKTLQGQCVE
       :. . :. ..:   . :: ::..: :.: :. .:.. .:.... ::.:.. . . ::   
CCDS99 FNPDRFGPGAPKPRFTYF-PFSLGHRSCIGQQFAQMEVKVVMAKLLQRLEFRLVPGQRFG
              420        430       440       450       460         

     470       480       490       500   
pF1KB8 SIQKIHDSSLHPDETKNMLEMIFTPRNSDRCLEH
                                         
CCDS99 LQEQATLKPLDPVLCTLRPRGWQPAPPPPPC   
     470       480       490       500   

>>CCDS64723.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7            (393 aa)
 initn: 177 init1:  96 opt: 303  Z-score: 370.7  bits: 77.8 E(32554): 2.5e-14
Smith-Waterman score: 303; 28.4% identity (60.4% similar) in 225 aa overlap (251-461:139-356)

              230       240       250       260       270       280
pF1KB8 FDAWQALLIKPDIFFKISWLYKKYEKSVKDLKDAIEVLIAEKRRRISTEEKLEECMDFAT
                                     ::..:: .   :. :.. ..: .  .::  
CCDS64 TEKCGALFPFLTPVFEALNIGLFPKDVTHFLKNSIERM---KESRLKDKQKHR--VDFFQ
      110       120       130       140          150         160   

              290              300       310       320       330   
pF1KB8 ELILAEKRGDLTR-------ENVNQCILEMLIAAPDTMSVSLFFMLFLIAKHPNVEEAII
       ..: ...  .          : : : :. ...:: :: :..: :... .: ::.:.. . 
CCDS64 QMIDSQNSKETKSHKALSDLELVAQSII-IIFAAYDTTSTTLPFIMYELATHPDVQQKLQ
           170       180       190        200       210       220  

           340        350       360       370       380       390  
pF1KB8 KEIQTVIGER-DIKIDDIQKLKVMENFIYESMRYQPVVDLVMRKALEDDVIDGYPVKKGT
       .::..:. ..  .  : . ... ..  . :..:  :::. : :   .:  :.:  . :: 
CCDS64 EEIDAVLPNKAPVTYDALVQMEYLDMVVNETLRLFPVVSRVTRVCKKDIEINGVFIPKGL
            230       240       250       260       270       280  

            400        410       420            430       440      
pF1KB8 NIILNIGRMHRL-EFFPKPNEFTLENFAKNVP-----YRYFQPFGFGPRGCAGKYIAMVM
        ... :  .:.  ... .:..:  : :.:.       :::. ::: :::.: :  .:.. 
CCDS64 AVMVPIYALHHDPKYWTEPEKFCPERFSKKNKDSIDLYRYI-PFGAGPRNCIGMRFALTN
            290       300       310       320        330       340 

        450       460       470       480       490       500   
pF1KB8 MKAILVTLLRRFHVKTLQGQCVESIQKIHDSSLHPDETKNMLEMIFTPRNSDRCLEH
       .:  ..  :. :  :                                          
CCDS64 IKLAVIRALQNFSFKPCKETQIPLKLDNLPILQPEKPIVLKVHLRDGITSGP     
             350       360       370       380       390        

>>CCDS5676.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7             (503 aa)
 initn: 213 init1:  96 opt: 303  Z-score: 369.1  bits: 77.8 E(32554): 3.1e-14
Smith-Waterman score: 392; 22.9% identity (56.1% similar) in 476 aa overlap (21-461:4-466)

               10        20        30        40                50  
pF1KB8 MVLEMLNPIHYNITSIVPEAMPAATMPVLLLTGLFLLVWNYEGTSS--------IPGPGY
                           .:  .: . .:..  :..    :: :        ::::  
CCDS56                  MDLIPNFAMETWVLVATSLVLLYIYGTHSHKLFKKLGIPGPTP
                                10        20        30        40   

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB8 CMGIGPLISHGRFLWMGIGSACNYYNRVYGEFMRVWISGEGTLIISKSSSMFHIMKHNHY
          .: .. . : :: ..   ::   . :::.  .. . .  :.:   . .  .. .. :
CCDS56 LPFLGTILFYLRGLW-NFDRECN---EKYGEMWGLYEGQQPMLVIMDPDMIKTVLVKECY
            50         60           70        80        90         

            120       130       140       150       160       170  
pF1KB8 SSRFGSKLGLQCIGMHEKGIIFNNNPELWKTTRPFFMKALSGPGLVRMVTVCAESLKTHL
       :  : ... :  .:. .... : .. : ::  : ..  :...  . .:: . ..     .
CCDS56 SV-FTNQMPLGPMGFLKSALSFAEDEE-WKRIRTLLSPAFTSVKFKEMVPIISQCGDMLV
     100        110       120        130       140       150       

            180       190       200            210       220       
pF1KB8 DRLEEVTNESGYVDVLTLLRRVMLDTSNTLFLRISLD-----ESAIVVKIQGYF--DAWQ
         :.. ...:  ...  ..    .:. .  .. ..::     .. .. ...  .  :  .
CCDS56 RSLRQEAENSKSINLKDFFGAYTMDVITGTLFGVNLDSLNNPQDPFLKNMKKLLKLDFLD
       160       170       180       190       200       210       

         230       240            250        260       270         
pF1KB8 ALLIKPDIFFKISWLYKK-----YEKSVKD-LKDAIEVLIAEKRRRISTEEKLEECMDFA
        .:.  ..:  .. ...      . :.:   ::..:: .   :. :.. ..: .  .:: 
CCDS56 PFLLLISLFPFLTPVFEALNIGLFPKDVTHFLKNSIERM---KESRLKDKQKHR--VDFF
       220       230       240       250          260         270  

     280       290              300       310       320       330  
pF1KB8 TELILAEKRGDLTR-------ENVNQCILEMLIAAPDTMSVSLFFMLFLIAKHPNVEEAI
        ..: ...  .          : : : :. ...:: :: :..: :... .: ::.:.. .
CCDS56 QQMIDSQNSKETKSHKALSDLELVAQSII-IIFAAYDTTSTTLPFIMYELATHPDVQQKL
            280       290       300        310       320       330 

            340        350       360       370       380       390 
pF1KB8 IKEIQTVIGER-DIKIDDIQKLKVMENFIYESMRYQPVVDLVMRKALEDDVIDGYPVKKG
        .::..:. ..  .  : . ... ..  . :..:  :::. : :   .:  :.:  . ::
CCDS56 QEEIDAVLPNKAPVTYDALVQMEYLDMVVNETLRLFPVVSRVTRVCKKDIEINGVFIPKG
             340       350       360       370       380       390 

             400        410       420            430       440     
pF1KB8 TNIILNIGRMHRL-EFFPKPNEFTLENFAKNVP-----YRYFQPFGFGPRGCAGKYIAMV
         ... :  .:.  ... .:..:  : :.:.       :::. ::: :::.: :  .:..
CCDS56 LAVMVPIYALHHDPKYWTEPEKFCPERFSKKNKDSIDLYRYI-PFGAGPRNCIGMRFALT
             400       410       420       430        440       450

         450       460       470       480       490       500   
pF1KB8 MMKAILVTLLRRFHVKTLQGQCVESIQKIHDSSLHPDETKNMLEMIFTPRNSDRCLEH
        .:  ..  :. :  :                                          
CCDS56 NIKLAVIRALQNFSFKPCKETQIPLKLDNLPILQPEKPIVLKVHLRDGITSGP     
              460       470       480       490       500        

>>CCDS5675.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7             (504 aa)
 initn: 213 init1:  96 opt: 293  Z-score: 356.9  bits: 75.6 E(32554): 1.5e-13
Smith-Waterman score: 382; 22.9% identity (56.2% similar) in 477 aa overlap (21-461:4-467)

               10        20        30        40                50  
pF1KB8 MVLEMLNPIHYNITSIVPEAMPAATMPVLLLTGLFLLVWNYEGTSS--------IPGPGY
                           .:  .: . .:..  :..    :: :        ::::  
CCDS56                  MDLIPNFAMETWVLVATSLVLLYIYGTHSHKLFKKLGIPGPTP
                                10        20        30        40   

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB8 CMGIGPLISHGRFLWMGIGSACNYYNRVYGEFMRVWISGEGTLIISKSSSMFHIMKHNHY
          .: .. . : :: ..   ::   . :::.  .. . .  :.:   . .  .. .. :
CCDS56 LPFLGTILFYLRGLW-NFDRECN---EKYGEMWGLYEGQQPMLVIMDPDMIKTVLVKECY
            50         60           70        80        90         

            120       130       140       150       160       170  
pF1KB8 SSRFGSKLGLQCIGMHEKGIIFNNNPELWKTTRPFFMKALSGPGLVRMVTVCAESLKTHL
       :  : ... :  .:. .... : .. : ::  : ..  :...  . .:: . ..     .
CCDS56 SV-FTNQMPLGPMGFLKSALSFAEDEE-WKRIRTLLSPAFTSVKFKEMVPIISQCGDMLV
     100        110       120        130       140       150       

            180       190       200            210       220       
pF1KB8 DRLEEVTNESGYVDVLTLLRRVMLDTSNTLFLRISLD-----ESAIVVKIQGYF--DAWQ
         :.. ...:  ...  ..    .:. .  .. ..::     .. .. ...  .  :  .
CCDS56 RSLRQEAENSKSINLKDFFGAYTMDVITGTLFGVNLDSLNNPQDPFLKNMKKLLKLDFLD
       160       170       180       190       200       210       

         230       240            250        260       270         
pF1KB8 ALLIKPDIFFKISWLYKK-----YEKSVKD-LKDAIEVLIAEKRRRISTEEKLEECMDFA
        .:.  ..:  .. ...      . :.:   ::..:: .   :. :.. ..: .  .:: 
CCDS56 PFLLLISLFPFLTPVFEALNIGLFPKDVTHFLKNSIERM---KESRLKDKQKHR--VDFF
       220       230       240       250          260         270  

     280       290              300       310       320       330  
pF1KB8 TELILAEKRGDLTR-------ENVNQCILEMLIAAPDTMSVSLFFMLFLIAKHPNVEEAI
        ..: ...  .          : : : :. ...:: :: :..: :... .: ::.:.. .
CCDS56 QQMIDSQNSKETKSHKALSDLELVAQSII-IIFAAYDTTSTTLPFIMYELATHPDVQQKL
            280       290       300        310       320       330 

            340        350       360       370       380       390 
pF1KB8 IKEIQTVIGER-DIKIDDIQKLKVMENFIYESMRYQPVVDLVMRKALEDDVIDGYPVKKG
        .::..:. ..  .  : . ... ..  . :..:  :::. : :   .:  :.:  . ::
CCDS56 QEEIDAVLPNKAPVTYDALVQMEYLDMVVNETLRLFPVVSRVTRVCKKDIEINGVFIPKG
             340       350       360       370       380       390 

             400        410        420            430       440    
pF1KB8 TNIILNIGRMHRL-EFFPKPNEFTLEN-FAKNVP-----YRYFQPFGFGPRGCAGKYIAM
         ... :  .:.  ... .:..:  :. :.:.       :::. ::: :::.: :  .:.
CCDS56 LAVMVPIYALHHDPKYWTEPEKFCPESRFSKKNKDSIDLYRYI-PFGAGPRNCIGMRFAL
             400       410       420       430        440       450

          450       460       470       480       490       500   
pF1KB8 VMMKAILVTLLRRFHVKTLQGQCVESIQKIHDSSLHPDETKNMLEMIFTPRNSDRCLEH
       . .:  ..  :. :  :                                          
CCDS56 TNIKLAVIRALQNFSFKPCKETQIPLKLDNLPILQPEKPIVLKVHLRDGITSGP     
              460       470       480       490       500         

>>CCDS55123.1 CYP51A1 gene_id:1595|Hs108|chr7             (404 aa)
 initn: 122 init1:  91 opt: 289  Z-score: 353.5  bits: 74.6 E(32554): 2.3e-13
Smith-Waterman score: 289; 23.5% identity (57.3% similar) in 358 aa overlap (130-465:42-378)

     100       110       120       130       140       150         
pF1KB8 SSSMFHIMKHNHYSSRFGSKLGLQCIGMHEKGIIFNNNPELWKTTRPFFMKALSGPGLVR
                                     ::. ..    ..   . .. ..:.   . .
CCDS55 SDAAALLFNSKNEDLNAEDVYSRLTTPVFGKGVAYDVPNPVFLEQKKMLKSGLNIAHFKQ
              20        30        40        50        60        70 

     160       170       180       190        200          210     
pF1KB8 MVTVCAESLKTHLDRLEEVTNESGYVDVLTLLRR-VMLDTSNTLF---LRISLDESA--I
        :..  .  : ..    :  .:::  .:.  : . ..: .:. :    .: .:.:..  .
CCDS55 HVSIIEKETKEYF----ESWGESGEKNVFEALSELIILTASHCLHGKEIRSQLNEKVAQL
              80            90       100       110       120       

           220         230       240           250       260       
pF1KB8 VVKIQGYFD--AWQALLIKPDIFFKISWL----YKKYEKSVKDLKDAIEVLIAEKRRRIS
        . ..: :.  ::  ::  :      .::    ... ... ...:: .   : .:::.  
CCDS55 YADLDGGFSHAAW--LL--P------GWLPLPSFRRRDRAHREIKDIFYKAI-QKRRQ--
       130       140                 150       160        170      

       270       280       290       300       310       320       
pF1KB8 TEEKLEECMDFATELILAEKRGDLTRENVNQCILEMLIAAPDTMSVSLFFMLFLIAKHPN
       ..::... ..   .    . :  :: ..:   .. .:.:.  : :..  .: :..:.  .
CCDS55 SQEKIDDILQTLLDATYKDGR-PLTDDEVAGMLIGLLLAGQHTSSTTSAWMGFFLARDKT
          180       190        200       210       220       230   

       330       340         350       360       370       380     
pF1KB8 VEEAIIKEIQTVIGER--DIKIDDIQKLKVMENFIYESMRYQPVVDLVMRKALEDDVIDG
       ...    : .:: ::    .  :... :....  : :..: .: . ..:: :   ... :
CCDS55 LQKKCYLEQKTVCGENLPPLTYDQLKDLNLLDRCIKETLRLRPPIMIMMRMARTPQTVAG
           240       250       260       270       280       290   

         390               400       410       420       430       
pF1KB8 YPVKKGTNII--------LNIGRMHRLEFFPKPNEFTLENFAKNVPYRYFQPFGFGPRGC
       : .  : ..         :. . ..::.:  .:...  .: :..  . :  ::: : . :
CCDS55 YTIPPGHQVCVSPTVNQRLKDSWVERLDF--NPDRYLQDNPASGEKFAYV-PFGAGRHRC
           300       310       320         330       340        350

       440       450       460       470       480       490       
pF1KB8 AGKYIAMVMMKAILVTLLRRFHVKTLQGQCVESIQKIHDSSLHPDETKNMLEMIFTPRNS
        :. .:.:..:.:  :.:: ..   ..:                                
CCDS55 IGENFAYVQIKTIWSTMLRLYEFDLIDGYFPTVNYTTMIHTPENPVIRYKRRSK      
              360       370       380       390       400          

>>CCDS5673.1 CYP3A7 gene_id:1551|Hs108|chr7               (503 aa)
 initn: 192 init1: 113 opt: 286  Z-score: 348.3  bits: 74.0 E(32554): 4.4e-13
Smith-Waterman score: 326; 24.4% identity (53.6% similar) in 483 aa overlap (21-461:4-466)

               10        20        30        40                50  
pF1KB8 MVLEMLNPIHYNITSIVPEAMPAATMPVLLLTGLFLLVWNYEGTSS--------IPGPGY
                           .:  .. . :: .. :..    :: .        ::::  
CCDS56                  MDLIPNLAVETWLLLAVSLILLYLYGTRTHGLFKKLGIPGPTP
                                10        20        30        40   

             60        70         80        90       100       110 
pF1KB8 CMGIGPLISHGRFLWMGIGSAC-NYYNRVYGEFMRVWISGEGTLIISKSSSMFHIMKHNH
          .:  .:  .  :  .   : . : .:.:    ..   .  : :.  . .  .. .. 
CCDS56 LPFLGNALSFRKGYWT-FDMECYKKYRKVWG----IYDCQQPMLAITDPDMIKTVLVKEC
            50         60        70            80        90        

             120       130       140       150       160           
pF1KB8 YSSRFGSKLGLQCIGMHEKGIIFNNNPELWKTTRPFFMKALSGPGLVRMVTVCAE-----
       ::  : ..  .  .:. ...: . .. : ::  : ..  ....  : .:: . :.     
CCDS56 YSV-FTNRRPFGPVGFMKNAISIAEDEE-WKRIRSLLSPTFTSGKLKEMVPIIAQYGDVL
      100        110       120        130       140       150      

          170       180           190        200                   
pF1KB8 --SLKTHLDRLEEVTNESGY----VDVLTLLRR-VMLDTSNT----------LFLRIS-L
         .:. . .  . :: .  .    .::.:     : .:. :.           .::.. :
CCDS56 VRNLRREAETGKPVTLKHVFGAYSMDVITSTSFGVSIDSLNNPQDPFVENTKKLLRFNPL
        160       170       180       190       200       210      

      210       220        230         240       250       260     
pF1KB8 DESAIVVKIQGYFDA-WQALLIKPDIFFK--ISWLYKKYEKSVKDLKDAIEVLIAEKRRR
       :  .. .:.  ..    .:: :   .: .  ::.:     ::::..:..   :   ...:
CCDS56 DPFVLSIKVFPFLTPILEALNI--TVFPRKVISFL----TKSVKQIKEG--RLKETQKHR
        220       230         240           250         260        

         270       280       290       300       310       320     
pF1KB8 ISTEEKLEECMDFATELILAEKRGDLTRENVNQCILEMLIAAPDTMSVSLFFMLFLIAKH
       ..  . . . .. . .    .  .::  : . : :. ...:. .: :  : :... .: :
CCDS56 VDFLQLMIDSQN-SKDSETHKALSDL--ELMAQSII-FIFAGYETTSSVLSFIIYELATH
      270       280        290         300        310       320    

         330       340        350       360       370       380    
pF1KB8 PNVEEAIIKEIQTVIGER-DIKIDDIQKLKVMENFIYESMRYQPVVDLVMRKALEDDVID
       :.:.. . :::.::. ..     : . .:. ..  . :..:  ::.  . :   .:  :.
CCDS56 PDVQQKVQKEIDTVLPNKAPPTYDTVLQLEYLDMVVNETLRLFPVAMRLERVCKKDVEIN
          330       340       350       360       370       380    

          390       400        410       420            430        
pF1KB8 GYPVKKGTNIILNIGRMHRL-EFFPKPNEFTLENFAK----NV-PYRYFQPFGFGPRGCA
       :. . ::. ...    .:.  ... .:..:  : :.:    :. :: :  ::: :::.: 
CCDS56 GMFIPKGVVVMIPSYVLHHDPKYWTEPEKFLPERFSKKNKDNIDPYIY-TPFGSGPRNCI
          390       400       410       420       430        440   

      440       450       460       470       480       490        
pF1KB8 GKYIAMVMMKAILVTLLRRFHVKTLQGQCVESIQKIHDSSLHPDETKNMLEMIFTPRNSD
       :  .:.: ::  :: .:. :  :                                     
CCDS56 GMRFALVNMKLALVRVLQNFSFKPCKETQIPLKLRFGGLLLTEKPIVLKAESRDETVSGA
           450       460       470       480       490       500   




503 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 12:15:17 2016 done: Fri Nov  4 12:15:17 2016
 Total Scan time:  2.970 Total Display time:  0.080

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com