Result of FASTA (ccds) for pF1KB8292
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8292, 449 aa
  1>>>pF1KB8292 449 - 449 aa - 449 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5466+/-0.00135; mu= 2.4183+/- 0.078
 mean_var=248.6309+/-55.016, 0's: 0 Z-trim(108.2): 939  B-trim: 409 in 1/51
 Lambda= 0.081339
 statistics sampled from 9022 (10077) to 9022 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.66), E-opt: 0.2 (0.31), width:  16
 Scan time:  2.240

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11837.1 ZBTB14 gene_id:7541|Hs108|chr18        ( 449) 3025 368.7 6.7e-102
CCDS34639.2 ZNF713 gene_id:349075|Hs108|chr7       ( 443)  532 76.2 7.7e-14
CCDS54213.1 ZNF317 gene_id:57693|Hs108|chr19       ( 563)  530 76.0 1.1e-13
CCDS12210.1 ZNF317 gene_id:57693|Hs108|chr19       ( 595)  530 76.1 1.1e-13
CCDS5951.2 ZNF596 gene_id:169270|Hs108|chr8        ( 504)  528 75.7 1.2e-13
CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19        ( 738)  531 76.3 1.2e-13
CCDS12634.1 ZNF155 gene_id:7711|Hs108|chr19        ( 538)  519 74.7 2.5e-13
CCDS12944.1 ZNF667 gene_id:63934|Hs108|chr19       ( 610)  520 74.9 2.5e-13
CCDS58668.1 ZNF155 gene_id:7711|Hs108|chr19        ( 549)  519 74.7 2.6e-13
CCDS35106.1 ZNF483 gene_id:158399|Hs108|chr9       ( 744)  521 75.1 2.7e-13
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19      ( 674)  512 74.0 5.2e-13
CCDS54258.1 ZNF540 gene_id:163255|Hs108|chr19      ( 628)  511 73.8 5.4e-13
CCDS73997.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17      ( 511)  509 73.5 5.5e-13
CCDS11172.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17      ( 521)  509 73.5 5.6e-13
CCDS12506.1 ZNF540 gene_id:163255|Hs108|chr19      ( 660)  511 73.9 5.6e-13
CCDS32981.1 ZNF675 gene_id:171392|Hs108|chr19      ( 568)  509 73.6 5.9e-13
CCDS4441.1 ZNF454 gene_id:285676|Hs108|chr5        ( 522)  508 73.4 6.1e-13
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16       ( 869)  512 74.1 6.2e-13
CCDS42557.1 ZNF829 gene_id:374899|Hs108|chr19      ( 432)  505 73.0 6.8e-13
CCDS59380.1 ZNF829 gene_id:374899|Hs108|chr19      ( 513)  505 73.1 7.6e-13
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19      ( 591)  506 73.2 7.8e-13
CCDS12269.2 ZNF625 gene_id:90589|Hs108|chr19       ( 372)  502 72.6 7.8e-13
CCDS12975.1 ZSCAN22 gene_id:342945|Hs108|chr19     ( 491)  504 72.9   8e-13
CCDS46203.1 ZSCAN5B gene_id:342933|Hs108|chr19     ( 495)  504 72.9 8.1e-13
CCDS12409.1 ZNF14 gene_id:7561|Hs108|chr19         ( 642)  506 73.3 8.2e-13
CCDS64999.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8           ( 590)  505 73.1 8.4e-13
CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19      ( 676)  506 73.3 8.5e-13
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19      ( 697)  506 73.3 8.7e-13
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19      ( 580)  504 73.0   9e-13
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6          ( 751)  506 73.3 9.2e-13
CCDS6435.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8            ( 686)  505 73.2 9.3e-13
CCDS64996.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8           ( 697)  505 73.2 9.5e-13
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19      ( 644)  504 73.0 9.7e-13
CCDS58523.1 ZNF286B gene_id:729288|Hs108|chr17     ( 522)  502 72.7 9.9e-13
CCDS47944.1 ZNF251 gene_id:90987|Hs108|chr8        ( 671)  504 73.1   1e-12
CCDS46160.1 ZNF577 gene_id:84765|Hs108|chr19       ( 426)  500 72.4   1e-12
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9       ( 699)  504 73.1   1e-12
CCDS12842.2 ZNF577 gene_id:84765|Hs108|chr19       ( 485)  500 72.4 1.1e-12
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX          ( 779)  504 73.1 1.1e-12
CCDS46101.1 ZNF234 gene_id:10780|Hs108|chr19       ( 700)  503 73.0 1.1e-12
CCDS31089.1 ZNF124 gene_id:7678|Hs108|chr1         ( 289)  495 71.6 1.2e-12
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 616)  501 72.7 1.2e-12
CCDS33121.1 ZNF582 gene_id:147948|Hs108|chr19      ( 517)  499 72.4 1.3e-12
CCDS47592.1 ZNF679 gene_id:168417|Hs108|chr7       ( 411)  497 72.0 1.3e-12
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 658)  501 72.7 1.3e-12
CCDS33094.1 ZNF468 gene_id:90333|Hs108|chr19       ( 522)  499 72.4 1.3e-12
CCDS32915.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19       ( 742)  502 72.9 1.3e-12
CCDS74289.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19       ( 745)  502 72.9 1.3e-12
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 670)  501 72.7 1.3e-12
CCDS56105.1 ZNF835 gene_id:90485|Hs108|chr19       ( 537)  499 72.4 1.3e-12


>>CCDS11837.1 ZBTB14 gene_id:7541|Hs108|chr18             (449 aa)
 initn: 3025 init1: 3025 opt: 3025  Z-score: 1942.9  bits: 368.7 E(32554): 6.7e-102
Smith-Waterman score: 3025; 100.0% identity (100.0% similar) in 449 aa overlap (1-449:1-449)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MEFFISMSETIKYNDDDHKTLFLKTLNEQRLEGEFCDIAIVVEDVKFRAHRCVLAACSTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MEFFISMSETIKYNDDDHKTLFLKTLNEQRLEGEFCDIAIVVEDVKFRAHRCVLAACSTY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 FKKLFKKLEVDSSSVIEIDFLRSDIFEEVLNYMYTAKISVKKEDVNLMMSSGQILGIRFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FKKLFKKLEVDSSSVIEIDFLRSDIFEEVLNYMYTAKISVKKEDVNLMMSSGQILGIRFL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 DKLCSQKRDVSSPDENNGQSKSKYCLKINRPIGDAADTQDDDVEEIGDQDDSPSDDTVEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DKLCSQKRDVSSPDENNGQSKSKYCLKINRPIGDAADTQDDDVEEIGDQDDSPSDDTVEG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 TPPSQEDGKSPTTTLRVQEAILKELGSEEVRKVNCYGQEVESMETPESKDLGSQTPQALT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TPPSQEDGKSPTTTLRVQEAILKELGSEEVRKVNCYGQEVESMETPESKDLGSQTPQALT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 FNDGMSEVKDEQTPGWTTAASDMKFEYLLYGHHREQIACQACGKTFSDEGRLRKHEKLHT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FNDGMSEVKDEQTPGWTTAASDMKFEYLLYGHHREQIACQACGKTFSDEGRLRKHEKLHT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 ADRPFVCEMCTKGFTTQAHLKEHLKIHTGYKPYSCEVCGKSFIRAPDLKKHERVHSNERP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ADRPFVCEMCTKGFTTQAHLKEHLKIHTGYKPYSCEVCGKSFIRAPDLKKHERVHSNERP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 FACHMCDKAFKHKSHLKDHERRHRGEKPFVCGSCTKAFAKASDLKRHENNMHSERKQVTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FACHMCDKAFKHKSHLKDHERRHRGEKPFVCGSCTKAFAKASDLKRHENNMHSERKQVTP
              370       380       390       400       410       420

              430       440         
pF1KB8 SAIQSETEQLQAAAMAAEAEQQLETIACS
       :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SAIQSETEQLQAAAMAAEAEQQLETIACS
              430       440         

>>CCDS34639.2 ZNF713 gene_id:349075|Hs108|chr7            (443 aa)
 initn: 1104 init1: 493 opt: 532  Z-score: 362.0  bits: 76.2 E(32554): 7.7e-14
Smith-Waterman score: 532; 37.8% identity (73.5% similar) in 196 aa overlap (224-416:232-424)

           200       210       220        230       240         250
pF1KB8 TLRVQEAILKELGSEEVRKVNCYGQEVESMETP-ESKDLGSQTPQALTFNDGM--SEVKD
                                     ::: : .. :.   : . ..: .  .:  .
CCDS34 SIKIPLNSDTQGNSIKHNSDLIYYQGNYVRETPYEYSECGKIFNQHILLTDHIHTAEKPS
             210       220       230       240       250       260 

              260       270       280       290       300       310
pF1KB8 EQTPGWTTAASDMKFEYLLYGHHREQIACQACGKTFSDEGRLRKHEKLHTADRPFVCEMC
       :   ... ..:  . ..:: :.  .   :. ::: ::.. .: .:...::...::.:. :
CCDS34 ECGKAFSHTSSLSQPQMLLTGE--KPYKCDECGKRFSQRIHLIQHQRIHTGEKPFICNGC
             270       280         290       300       310         

              320       330       340       350       360       370
pF1KB8 TKGFTTQAHLKEHLKIHTGYKPYSCEVCGKSFIRAPDLKKHERVHSNERPFACHMCDKAF
        :.:  .. . .::.:::: :::.:. :::.: :  .: .:.:.:..:.:. : .: :::
CCDS34 GKAFRQHSSFTQHLRIHTGEKPYKCNQCGKAFSRITSLTEHHRLHTGEKPYECGFCGKAF
     320       330       340       350       360       370         

              380       390       400       410       420       430
pF1KB8 KHKSHLKDHERRHRGEKPFVCGSCTKAFAKASDLKRHENNMHSERKQVTPSAIQSETEQL
       ....::..::: : ::::. :. : :::.... :..:.. .:...:              
CCDS34 SQRTHLNQHERTHTGEKPYKCNECGKAFSQSAHLNQHRK-IHTREKLCEYKCEQTVRHSP
     380       390       400       410        420       430        

              440         
pF1KB8 QAAAMAAEAEQQLETIACS
                          
CCDS34 SFSST              
      440                 

>>CCDS54213.1 ZNF317 gene_id:57693|Hs108|chr19            (563 aa)
 initn: 1941 init1: 489 opt: 530  Z-score: 359.4  bits: 76.0 E(32554): 1.1e-13
Smith-Waterman score: 530; 40.9% identity (68.5% similar) in 181 aa overlap (237-415:179-356)

        210       220       230       240         250       260    
pF1KB8 SEEVRKVNCYGQEVESMETPESKDLGSQTPQALTFNDG--MSEVKDEQTPGWTTAASDMK
                                     : ... ::  : : .. :  ..::.::  .
CCDS54 LTQPMGRHAGKRPYHRRDYGVAFKGRPHLTQHMSMYDGRKMHECHQCQK-AFTTSASLTR
      150       160       170       180       190        200       

          270       280       290       300       310       320    
pF1KB8 FEYLLYGHHREQIACQACGKTFSDEGRLRKHEKLHTADRPFVCEMCTKGFTTQAHLKEHL
        . .  :.  .   :. :::.:.: . ::.: . :  ..:: : .: ..: : . :: :.
CCDS54 HRRIHTGE--KPYECSDCGKAFNDPSALRSHARTHLKEKPFDCSQCGNAFRTLSALKIHM
       210         220       230       240       250       260     

          330       340       350       360       370       380    
pF1KB8 KIHTGYKPYSCEVCGKSFIRAPDLKKHERVHSNERPFACHMCDKAFKHKSHLKDHERRHR
       ..::: .::.:. :::.. :.  :  :.:.:..:::. :: : :::.: ::::.: : : 
CCDS54 RVHTGERPYKCDQCGKAYGRSCHLIAHKRTHTGERPYECHDCGKAFQHPSHLKEHVRNHT
         270       280       290       300       310       320     

          390       400       410       420       430       440    
pF1KB8 GEKPFVCGSCTKAFAKASDLKRHENNMHSERKQVTPSAIQSETEQLQAAAMAAEAEQQLE
       ::::..: .: :::   :... :..:   :.                             
CCDS54 GEKPYACTQCGKAFRWKSNFNLHKKNHMVEKTYECKECGKSFGDLVSRRKHMRIHIVKKP
         330       340       350       360       370       380     

                                                                   
pF1KB8 TIACS                                                       
                                                                   
CCDS54 VECRQCGKTFRNQSILKTHMNSHTGEKPYGCDLCGKAFSASSNLTAHRKIHTQERRYECA
         390       400       410       420       430       440     

>>CCDS12210.1 ZNF317 gene_id:57693|Hs108|chr19            (595 aa)
 initn: 1941 init1: 489 opt: 530  Z-score: 359.1  bits: 76.1 E(32554): 1.1e-13
Smith-Waterman score: 537; 31.4% identity (61.0% similar) in 315 aa overlap (125-415:77-388)

          100       110       120       130       140       150    
pF1KB8 TAKISVKKEDVNLMMSSGQILGIRFLDKLCSQKRDVSSPDENNGQSKSKYCLKINRP--I
                                     ::..  ..   .: .. ..   ....:  :
CCDS12 HTPSVGSQESVTFQDVAVDFTEKEWPLLDSSQRKLYKDVMLENYSNLTSLGYQVGKPSLI
         50        60        70        80        90       100      

            160       170        180           190       200       
pF1KB8 GDAADTQDDDVEEIGDQDDSPSD-DTVEGTPPS--QED--GKSPTTTLRVQEAILKELGS
       .   . ..  .:: : .. . .: .:   :  :  .::  ::   . . ...: : : ..
CCDS12 SHLEQEEEPRTEERGAHQGACADWETPSKTKWSLLMEDIFGKETPSGVTMERAGLGEKST
        110       120       130       140       150       160      

       210          220             230             240         250
pF1KB8 EEVRKVNCYGQE---VESM-----ETP-ESKDLG------SQTPQALTFNDG--MSEVKD
       : ..  . .:..   .. :     . : . .: :       .  : ... ::  : : ..
CCDS12 EYAHLFEVFGMDPHLTQPMGRHAGKRPYHRRDYGVAFKGRPHLTQHMSMYDGRKMHECHQ
        170       180       190       200       210       220      

              260       270       280       290       300       310
pF1KB8 EQTPGWTTAASDMKFEYLLYGHHREQIACQACGKTFSDEGRLRKHEKLHTADRPFVCEMC
        :  ..::.::  . . .  :  ..   :. :::.:.: . ::.: . :  ..:: : .:
CCDS12 CQK-AFTTSASLTRHRRIHTG--EKPYECSDCGKAFNDPSALRSHARTHLKEKPFDCSQC
         230       240         250       260       270       280   

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pF1KB8 TKGFTTQAHLKEHLKIHTGYKPYSCEVCGKSFIRAPDLKKHERVHSNERPFACHMCDKAF
        ..: : . :: :...::: .::.:. :::.. :.  :  :.:.:..:::. :: : :::
CCDS12 GNAFRTLSALKIHMRVHTGERPYKCDQCGKAYGRSCHLIAHKRTHTGERPYECHDCGKAF
           290       300       310       320       330       340   

              380       390       400       410       420       430
pF1KB8 KHKSHLKDHERRHRGEKPFVCGSCTKAFAKASDLKRHENNMHSERKQVTPSAIQSETEQL
       .: ::::.: : : ::::..: .: :::   :... :..:   :.               
CCDS12 QHPSHLKEHVRNHTGEKPYACTQCGKAFRWKSNFNLHKKNHMVEKTYECKECGKSFGDLV
           350       360       370       380       390       400   

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pF1KB8 QAAAMAAEAEQQLETIACS                                         
                                                                   
CCDS12 SRRKHMRIHIVKKPVECRQCGKTFRNQSILKTHMNSHTGEKPYGCDLCGKAFSASSNLTA
           410       420       430       440       450       460   

>>CCDS5951.2 ZNF596 gene_id:169270|Hs108|chr8             (504 aa)
 initn: 1910 init1: 522 opt: 528  Z-score: 358.7  bits: 75.7 E(32554): 1.2e-13
Smith-Waterman score: 542; 43.0% identity (74.7% similar) in 158 aa overlap (258-415:261-417)

       230       240       250       260       270       280       
pF1KB8 SKDLGSQTPQALTFNDGMSEVKDEQTPGWTTAASDMKFEYLLYGHHREQIACQACGKTFS
                                     . .:... . ... ... :: :. :::.:.
CCDS59 AFTHCSDLRKHERTHTGEKPYGCHLCGKAFSKSSNLRRHEMIHTREKAQI-CHLCGKAFT
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       290       300       310       320       330       340       
pF1KB8 DEGRLRKHEKLHTADRPFVCEMCTKGFTTQAHLKEHLKIHTGYKPYSCEVCGKSFIRAPD
         . :::::. : .:.:. : .: :.:.  ..:..: . :.: ::: :..:::.: .   
CCDS59 HCSDLRKHERTHLGDKPYGCLLCGKAFSKCSYLRQHERTHNGEKPYECHLCGKAFSHCSH
     290       300       310       320       330       340         

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pF1KB8 LKKHERVHSNERPFACHMCDKAFKHKSHLKDHERRHRGEKPFVCGSCTKAFAKASDLKRH
       :..::: :..:.: .::.: ::: ..: :: ::: : ::::. :  : :::...:::.::
CCDS59 LRQHERSHNGEKPHGCHLCGKAFTESSVLKRHERIHTGEKPYECHVCGKAFTESSDLRRH
     350       360       370       380       390       400         

       410       420       430       440                           
pF1KB8 ENNMHSERKQVTPSAIQSETEQLQAAAMAAEAEQQLETIACS                  
       : .  .:.                                                    
CCDS59 ERTHTGEKPYECHLCGKAFNHSSVLRRHERTHTGEKPYECNICGKAFNRSYNFRLHRRVH
     410       420       430       440       450       460         

>>CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19             (738 aa)
 initn: 3624 init1: 505 opt: 531  Z-score: 358.6  bits: 76.3 E(32554): 1.2e-13
Smith-Waterman score: 548; 34.6% identity (60.5% similar) in 286 aa overlap (139-416:202-457)

      110       120       130       140       150           160    
pF1KB8 MSSGQILGIRFLDKLCSQKRDVSSPDENNGQSKSKYCLKINRPIGDA----ADTQDDDVE
                                     : :.: :  :  :  :     .  .::.. 
CCDS33 QEFPTGKVPNSWSKIYLNETQNYQRSCKQTQMKNKLC--IFAPYVDIFSCISHHHDDNIV
             180       190       200         210       220         

          170          180       190       200       210       220 
pF1KB8 EIGDQDDSPSD---DTVEGTPPSQEDGKSPTTTLRVQEAILKELGSEEVRKVNCYGQEVE
       .  :.  : ::   ::.. .: .:.. ..   : .         :.:  .  :    .  
CCDS33 HKRDKVHSNSDCGKDTLKVSPLTQRSIHTGQKTYQ---------GNECEEAFN----DSS
     230       240       250       260                270          

             230       240       250       260       270        280
pF1KB8 SMETPESKDLGSQTPQALTFNDGMSEVKDEQTPGWTTAASDMKFEYLLY-GHHREQIACQ
       :.:  ..  ::...:   : .      ::      :. .: .  .  .  :..:    :.
CCDS33 SLELHKQVHLGKKSPACSTHE------KD------TSYSSGIPVQQSVRTGKKRYW--CH
        280       290                   300       310       320    

              290       300       310       320       330       340
pF1KB8 ACGKTFSDEGRLRKHEKLHTADRPFVCEMCTKGFTTQAHLKEHLKIHTGYKPYSCEVCGK
        ::: ::. . :. :...::...:..:. : :.:. ..::  :: :::: ::: :. :::
CCDS33 ECGKGFSQSSNLQTHQRVHTGEKPYTCHECGKSFNQSSHLYAHLPIHTGEKPYRCDSCGK
            330       340       350       360       370       380  

              350       360       370       380       390       400
pF1KB8 SFIRAPDLKKHERVHSNERPFACHMCDKAFKHKSHLKDHERRHRGEKPFVCGSCTKAFAK
       .: :. ::. : :::..:.:. :..: :.: ..:::. ::: : ::::. ::.: : :. 
CCDS33 GFSRSTDLNIHCRVHTGEKPYKCEVCGKGFTQRSHLQAHERIHTGEKPYKCGDCGKRFSC
            390       400       410       420       430       440  

              410       420       430       440                    
pF1KB8 ASDLKRHENNMHSERKQVTPSAIQSETEQLQAAAMAAEAEQQLETIACS           
       .:.:. :.  .:.:.:                                            
CCDS33 SSNLHTHQR-VHTEEKPYKCDECGKCFSLSFNLHSHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSSASS
            450        460       470       480       490       500 

>--
 initn: 2543 init1: 482 opt: 506  Z-score: 342.7  bits: 73.3 E(32554): 9.1e-13
Smith-Waterman score: 509; 36.9% identity (68.4% similar) in 187 aa overlap (269-448:474-660)

      240       250       260       270            280       290   
pF1KB8 LTFNDGMSEVKDEQTPGWTTAASDMKFEYLLYGHHR-----EQIACQACGKTFSDEGRLR
                                     :..:.:     .   :. ::: ::. . ..
CCDS33 SNLHTHQRVHTEEKPYKCDECGKCFSLSFNLHSHQRVHTGEKPYKCEECGKGFSSASSFQ
           450       460       470       480       490       500   

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pF1KB8 KHEKLHTADRPFVCEMCTKGFTTQAHLKEHLKIHTGYKPYSCEVCGKSFIRAPDLKKHER
       .:...::...:: :..: :::. ..... : ..::: :::.:::::: :  . .:..:.:
CCDS33 SHQRVHTGEKPFRCNVCGKGFSQSSYFQAHQRVHTGEKPYKCEVCGKRFNWSLNLHNHQR
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pF1KB8 VHSNERPFACHMCDKAFKHKSHLKDHERRHRGEKPFVCGSCTKAFAKASDLKRHENNMHS
       ::..:.:. :. : :.:.. :.:. :.  : ::::: : .: : :..:: :. :.    .
CCDS33 VHTGEKPYKCEECGKGFSQASNLQAHQSVHTGEKPFKCDACQKRFSQASHLQAHQRVHTG
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             420       430       440                               
pF1KB8 ER--KQVTPSAIQSETEQLQAAAMAAEAEQQLETIACS                      
       :.  :  : .   :.  .::.  .   .:. ..   :                       
CCDS33 EKPYKCDTCGKAFSQRSNLQVHQIIHTGEKPFKCEECGKEFSWSAGLSAHQRVHTGEKPY
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CCDS33 TCQQCGKGFSQASHFHTHQRVHTGERPYICDVCCKGFSQRSHLIYHQRVHTGGNL
           690       700       710       720       730        

>>CCDS12634.1 ZNF155 gene_id:7711|Hs108|chr19             (538 aa)
 initn: 1326 init1: 516 opt: 519  Z-score: 352.7  bits: 74.7 E(32554): 2.5e-13
Smith-Waterman score: 525; 32.5% identity (62.6% similar) in 286 aa overlap (130-407:68-334)

     100       110       120       130       140       150         
pF1KB8 VKKEDVNLMMSSGQILGIRFLDKLCSQKRDVSSPDENNGQSKSKYCLKINRPIGDAADTQ
                                     ...  . .:.: .:   ...  . .:.  .
CCDS12 LENFRNLLSVGHQPFHQDTCHFLREEKFWMMGTATQREGNSGGKIQTELES-VPEAGAHE
        40        50        60        70        80         90      

     160          170       180       190       200       210      
pF1KB8 DDDVEEIGDQ---DDSPSDDTVEGTPPSQEDGKSPTTTLRVQEAILKELGSEEVRKVNCY
       . . ..: .:   : . :.:.. ..    :.:  :. .    :: :  . . .  : .  
CCDS12 EWSCQQIWEQIAKDLTRSQDSIINNSQFFENGDVPSQV----EAGLPTIHTGQ--KPSQG
        100       110       120       130           140         150

        220       230       240       250       260       270      
pF1KB8 GQEVESMETPESKDLGSQTPQALTFNDGMSEVKDEQTPGWTTAASDMKFEYLLYGHHREQ
       :.  .:.      ::    :: : ...  : . ::        .... .   :. :.: .
CCDS12 GKCKQSISDVPIFDL----PQQL-YSEEKSYTCDE-------CGKSICYISALHVHQRVH
              160            170       180              190        

             280       290       300       310       320       330 
pF1KB8 IA-----CQACGKTFSDEGRLRKHEKLHTADRPFVCEMCTKGFTTQAHLKEHLKIHTGYK
       ..     :..::: ::. ..:. :...::...:: ::.: :::. .. :. : :.::: :
CCDS12 VGEKLFMCDVCGKEFSQSSHLQTHQRVHTGEKPFKCEQCGKGFSRRSALNVHRKLHTGEK
      200       210       220       230       240       250        

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pF1KB8 PYSCEVCGKSFIRAPDLKKHERVHSNERPFACHMCDKAFKHKSHLKDHERRHRGEKPFVC
       :: ::.:::.::.  .::.:.:.:..:.:: : .: :.:  .:.::.:   : ::::: :
CCDS12 PYICEACGKAFIHDSQLKEHKRIHTGEKPFKCDICGKTFYFRSRLKSHSMVHTGEKPFRC
      260       270       280       290       300       310        

             400       410       420       430       440           
pF1KB8 GSCTKAFAKASDLKRHENNMHSERKQVTPSAIQSETEQLQAAAMAAEAEQQLETIACS  
        .: :.: . : :.::                                            
CCDS12 DTCDKSFHQRSALNRHCMVHTGEKPYRCEQCGKGFIGRLDFYKHQVVHTGEKPYNCKECG
      320       330       340       350       360       370        

>>CCDS12944.1 ZNF667 gene_id:63934|Hs108|chr19            (610 aa)
 initn: 1862 init1: 497 opt: 520  Z-score: 352.6  bits: 74.9 E(32554): 2.5e-13
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      250       260       270       280       290       300        
pF1KB8 KDEQTPGWTTAASDMKFEYLLYGHHREQIACQACGKTFSDEGRLRKHEKLHTADRPFVCE
                                     :. :::.:: .  : .:...:: :::. :.
CCDS12 FKCNKCSKVFGRQSFLIEHQRIHTGEKPYQCEECGKAFSHRISLTRHKRIHTEDRPYECD
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pF1KB8 MCTKGFTTQAHLKEHLKIHTGYKPYSCEVCGKSFIRAPDLKKHERVHSNERPFACHMCDK
       .: :.:. .::: .: .:::: :::.:..:::.: .  .:  ::: :..:.:. :. : :
CCDS12 QCGKAFSQSAHLAQHERIHTGEKPYTCKTCGKAFSQRTSLILHERSHTGEKPYECNECGK
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pF1KB8 AFKHKSHLKDHERRHRGEKPFVCGSCTKAFAKASDLKRHENNMHSERKQVTPSAIQSETE
       ::.  : :  :.: : .:::. :..: ::....:.: ::.:. :::.:            
CCDS12 AFSSGSDLIRHQRSHSSEKPYECSKCGKAYSRSSSLIRHQNT-HSEEKA           
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      430       440         
pF1KB8 QLQAAAMAAEAEQQLETIACS

>>CCDS58668.1 ZNF155 gene_id:7711|Hs108|chr19             (549 aa)
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Smith-Waterman score: 525; 32.5% identity (62.6% similar) in 286 aa overlap (130-407:79-345)

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pF1KB8 VKKEDVNLMMSSGQILGIRFLDKLCSQKRDVSSPDENNGQSKSKYCLKINRPIGDAADTQ
                                     ...  . .:.: .:   ...  . .:.  .
CCDS58 LENFRNLLSVGHQPFHQDTCHFLREEKFWMMGTATQREGNSGGKIQTELES-VPEAGAHE
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pF1KB8 DDDVEEIGDQ---DDSPSDDTVEGTPPSQEDGKSPTTTLRVQEAILKELGSEEVRKVNCY
       . . ..: .:   : . :.:.. ..    :.:  :. .    :: :  . . .  : .  
CCDS58 EWSCQQIWEQIAKDLTRSQDSIINNSQFFENGDVPSQV----EAGLPTIHTGQ--KPSQG
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pF1KB8 GQEVESMETPESKDLGSQTPQALTFNDGMSEVKDEQTPGWTTAASDMKFEYLLYGHHREQ
       :.  .:.      ::    :: : ...  : . ::        .... .   :. :.: .
CCDS58 GKCKQSISDVPIFDL----PQQL-YSEEKSYTCDE-------CGKSICYISALHVHQRVH
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pF1KB8 IA-----CQACGKTFSDEGRLRKHEKLHTADRPFVCEMCTKGFTTQAHLKEHLKIHTGYK
       ..     :..::: ::. ..:. :...::...:: ::.: :::. .. :. : :.::: :
CCDS58 VGEKLFMCDVCGKEFSQSSHLQTHQRVHTGEKPFKCEQCGKGFSRRSALNVHRKLHTGEK
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pF1KB8 PYSCEVCGKSFIRAPDLKKHERVHSNERPFACHMCDKAFKHKSHLKDHERRHRGEKPFVC
       :: ::.:::.::.  .::.:.:.:..:.:: : .: :.:  .:.::.:   : ::::: :
CCDS58 PYICEACGKAFIHDSQLKEHKRIHTGEKPFKCDICGKTFYFRSRLKSHSMVHTGEKPFRC
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pF1KB8 GSCTKAFAKASDLKRHENNMHSERKQVTPSAIQSETEQLQAAAMAAEAEQQLETIACS  
        .: :.: . : :.::                                            
CCDS58 DTCDKSFHQRSALNRHCMVHTGEKPYRCEQCGKGFIGRLDFYKHQVVHTGEKPYNCKECG
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>>CCDS35106.1 ZNF483 gene_id:158399|Hs108|chr9            (744 aa)
 initn: 2376 init1: 501 opt: 521  Z-score: 352.2  bits: 75.1 E(32554): 2.7e-13
Smith-Waterman score: 521; 37.4% identity (65.2% similar) in 198 aa overlap (224-416:409-605)

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pF1KB8 TLRVQEAILKELGSEEVRKVNCYGQEVESMETPESKDLGSQTPQALTFNDGMSEVKDEQT
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CCDS35 KRQKIHLGDRSQKCSKCGIIFIRRSTLSRRKTPMCEKCRKDSCQEAALNKDEGNESGEKT
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CCDS35 HKCSKCGKAFGYSASLTKHRRIHTGEKPYMCNECGKAFSDSSSLTPHHRTHSGEKPFKCD
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pF1KB8 MCTKGFTTQAHLKEHLKIHTGYKPYSCEVCGKSFIRAPDLKKHERVHSNERPFACHMCDK
        : :::: .::: .: .:::: :::.:. ::. :  . .: .:.:.:..:.:..:  : :
CCDS35 DCGKGFTLSAHLIKHQRIHTGEKPYKCKDCGRPFSDSSSLIQHQRIHTGEKPYTCSNCGK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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