Result of FASTA (ccds) for pF1KB8262
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8262, 191 aa
  1>>>pF1KB8262 191 - 191 aa - 191 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7617+/-0.000909; mu= 11.1566+/- 0.055
 mean_var=84.1915+/-16.740, 0's: 0 Z-trim(107.6): 70  B-trim: 35 in 1/50
 Lambda= 0.139778
 statistics sampled from 9607 (9677) to 9607 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.695), E-opt: 0.2 (0.297), width:  16
 Scan time:  1.860

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS10360.1 CIB1 gene_id:10519|Hs108|chr15         ( 191) 1230 257.4 3.8e-69
CCDS73781.1 CIB1 gene_id:10519|Hs108|chr15         ( 231) 1063 223.8 6.1e-59
CCDS33160.1 CIB4 gene_id:130106|Hs108|chr2         ( 185)  489 108.0 3.6e-24
CCDS12340.1 CIB3 gene_id:117286|Hs108|chr19        ( 187)  458 101.7 2.7e-22
CCDS10296.1 CIB2 gene_id:10518|Hs108|chr15         ( 187)  447 99.5 1.3e-21
CCDS61722.1 CIB2 gene_id:10518|Hs108|chr15         ( 144)  357 81.3   3e-16
CCDS74305.1 CIB3 gene_id:117286|Hs108|chr19        ( 138)  323 74.4 3.4e-14
CCDS61723.1 CIB2 gene_id:10518|Hs108|chr15         ( 138)  315 72.8   1e-13


>>CCDS10360.1 CIB1 gene_id:10519|Hs108|chr15              (191 aa)
 initn: 1230 init1: 1230 opt: 1230  Z-score: 1354.8  bits: 257.4 E(32554): 3.8e-69
Smith-Waterman score: 1230; 100.0% identity (100.0% similar) in 191 aa overlap (1-191:1-191)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MGGSGSRLSKELLAEYQDLTFLTKQEILLAHRRFCELLPQEQRSVESSLRAQVPFEQILS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MGGSGSRLSKELLAEYQDLTFLTKQEILLAHRRFCELLPQEQRSVESSLRAQVPFEQILS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 LPELKANPFKERICRVFSTSPAKDSLSFEDFLDLLSVFSDTATPDIKSHYAFRIFDFDDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LPELKANPFKERICRVFSTSPAKDSLSFEDFLDLLSVFSDTATPDIKSHYAFRIFDFDDD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 GTLNREDLSRLVNCLTGEGEDTRLSASEMKQLIDNILEESDIDRDGTINLSEFQHVISRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GTLNREDLSRLVNCLTGEGEDTRLSASEMKQLIDNILEESDIDRDGTINLSEFQHVISRS
              130       140       150       160       170       180

              190 
pF1KB8 PDFASSFKIVL
       :::::::::::
CCDS10 PDFASSFKIVL
              190 

>>CCDS73781.1 CIB1 gene_id:10519|Hs108|chr15              (231 aa)
 initn: 1217 init1: 1054 opt: 1063  Z-score: 1171.6  bits: 223.8 E(32554): 6.1e-59
Smith-Waterman score: 1087; 82.1% identity (82.1% similar) in 223 aa overlap (9-191:9-231)

               10        20                                        
pF1KB8 MGGSGSRLSKELLAEYQDLTFLTKQEILL-------------------------------
               :::::::::::::::::::::                               
CCDS73 MGGSGSRLSKELLAEYQDLTFLTKQEILLSVYVVLAPHLVDNEQQARSGNEHTGRPIAEN
               10        20        30        40        50        60

               30        40        50        60        70        80
pF1KB8 ---------AHRRFCELLPQEQRSVESSLRAQVPFEQILSLPELKANPFKERICRVFSTS
                :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TDSSPLSTRAHRRFCELLPQEQRSVESSLRAQVPFEQILSLPELKANPFKERICRVFSTS
               70        80        90       100       110       120

               90       100       110       120       130       140
pF1KB8 PAKDSLSFEDFLDLLSVFSDTATPDIKSHYAFRIFDFDDDGTLNREDLSRLVNCLTGEGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PAKDSLSFEDFLDLLSVFSDTATPDIKSHYAFRIFDFDDDGTLNREDLSRLVNCLTGEGE
              130       140       150       160       170       180

              150       160       170       180       190 
pF1KB8 DTRLSASEMKQLIDNILEESDIDRDGTINLSEFQHVISRSPDFASSFKIVL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DTRLSASEMKQLIDNILEESDIDRDGTINLSEFQHVISRSPDFASSFKIVL
              190       200       210       220       230 

>>CCDS33160.1 CIB4 gene_id:130106|Hs108|chr2              (185 aa)
 initn: 489 init1: 175 opt: 489  Z-score: 547.5  bits: 108.0 E(32554): 3.6e-24
Smith-Waterman score: 489; 44.7% identity (73.2% similar) in 179 aa overlap (11-189:12-180)

                10        20        30        40        50         
pF1KB8  MGGSGSRLSKELLAEYQDLTFLTKQEILLAHRRFCELLPQEQRSVESSLRAQVPFEQIL
                  : : ::: :::::..:::  :  : .: :  .   :..:     ..:. 
CCDS33 MGQCLRYQMHWEDLEEYQALTFLTRNEILCIHDTFLKLCPPGKYYKEATLT----MDQVS
               10        20        30        40        50          

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB8 SLPELKANPFKERICRVFSTSPAKDSLSFEDFLDLLSVFSDTATPDIKSHYAFRIFDFDD
       ::: :..:::..:::::::    :  .:::: : . ::::. : :..: .:::::.::..
CCDS33 SLPALRVNPFRDRICRVFS---HKGMFSFEDVLGMASVFSEQACPSLKIEYAFRIYDFNE
         60        70           80        90       100       110   

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB8 DGTLNREDLSRLVNCLTGEGEDTRLSASEMKQLIDNILEESDIDRDGTINLSEFQHVISR
       .: ...:::.:..  : . ..:  .: . . .: ...: :::.: :. ...:::.:....
CCDS33 NGFIDEEDLQRIILRLLN-SDD--MSEDLLMDLTNHVLSESDLDNDNMLSFSEFEHAMAK
           120       130          140       150       160       170

     180       190    
pF1KB8 SPDFASSFKIVL   
       :::: .::.:     
CCDS33 SPDFMNSFRIHFWGC
              180     

>>CCDS12340.1 CIB3 gene_id:117286|Hs108|chr19             (187 aa)
 initn: 314 init1: 183 opt: 458  Z-score: 513.6  bits: 101.7 E(32554): 2.7e-22
Smith-Waterman score: 458; 40.0% identity (71.1% similar) in 190 aa overlap (1-189:1-185)

               10        20        30        40         50         
pF1KB8 MGGSGSRLSKELLAEYQDLTFLTKQEILLAHRRFCELLPQE-QRSVESSLRAQVPFEQIL
       ::.. . ...: :  ::: ::.:..::.    :. .: ::    .  .   ..::.: : 
CCDS12 MGNKQTVFTHEQLEAYQDCTFFTRKEIMRLFYRYQDLAPQLVPLDYTTCPDVKVPYELIG
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB8 SLPELKANPFKERICRVFSTSPAKDSLSFEDFLDLLSVFSDTATPDIKSHYAFRIFDFDD
       :.:::: :::..:: .::: . .   .....:::..::.:. :  :.:..:::.:.::..
CCDS12 SMPELKDNPFRQRIAQVFSED-GDGHMTLDNFLDMFSVMSEMAPRDLKAYYAFKIYDFNN
               70        80         90       100       110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB8 DGTLNREDLSRLVNCLTGEGEDTRLSASEMKQLIDNILEESDIDRDGTINLSEFQHVISR
       :  .   :: . :. ::  :    ::: :.. . ...:.:.: :.:: ..: .::..: :
CCDS12 DDYICAWDLEQTVTKLTRGG----LSAEEVSLVCEKVLDEADGDHDGRLSLEDFQNMILR
     120       130           140       150       160       170     

     180       190 
pF1KB8 SPDFASSFKIVL
       .::: :.:.:  
CCDS12 APDFLSTFHIRI
         180       

>>CCDS10296.1 CIB2 gene_id:10518|Hs108|chr15              (187 aa)
 initn: 284 init1: 185 opt: 447  Z-score: 501.6  bits: 99.5 E(32554): 1.3e-21
Smith-Waterman score: 447; 37.9% identity (73.7% similar) in 190 aa overlap (1-189:1-185)

               10        20        30        40         50         
pF1KB8 MGGSGSRLSKELLAEYQDLTFLTKQEILLAHRRFCELLPQE-QRSVESSLRAQVPFEQIL
       ::.. . ...: : .::: ::..:..::  : :: :: :.    . ..:  ..::.  :.
CCDS10 MGNKQTIFTEEQLDNYQDCTFFNKKDILKLHSRFYELAPNLVPMDYRKSPIVHVPMSLII
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB8 SLPELKANPFKERICRVFSTSPAKDSLSFEDFLDLLSVFSDTATPDIKSHYAFRIFDFDD
       ..:::. :::::::  .:: . .. .:.:.::.:..::. ..:  ..:..:::.:.::. 
CCDS10 QMPELRENPFKERIVAAFSED-GEGNLTFNDFVDMFSVLCESAPRELKANYAFKIYDFNT
               70        80         90       100       110         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB8 DGTLNREDLSRLVNCLTGEGEDTRLSASEMKQLIDNILEESDIDRDGTINLSEFQHVISR
       :. . .:::   .  ::     ..:.  :.  . :...::.:.: :: .....:. .:..
CCDS10 DNFICKEDLELTLARLT----KSELDEEEVVLVCDKVIEEADLDGDGKLGFADFEDMIAK
     120       130           140       150       160       170     

     180       190 
pF1KB8 SPDFASSFKIVL
       .::: :.:.:  
CCDS10 APDFLSTFHIRI
         180       

>>CCDS61722.1 CIB2 gene_id:10518|Hs108|chr15              (144 aa)
 initn: 341 init1: 151 opt: 357  Z-score: 405.2  bits: 81.3 E(32554): 3e-16
Smith-Waterman score: 357; 38.4% identity (76.1% similar) in 138 aa overlap (52-189:10-142)

              30        40        50        60        70        80 
pF1KB8 LTKQEILLAHRRFCELLPQEQRSVESSLRAQVPFEQILSLPELKANPFKERICRVFSTSP
                                     .::.  :...:::. :::::::  .:: . 
CCDS61                      MDYRKSPIVHVPMSLIIQMPELRENPFKERIVAAFSED-
                                    10        20        30         

              90       100       110       120       130       140 
pF1KB8 AKDSLSFEDFLDLLSVFSDTATPDIKSHYAFRIFDFDDDGTLNREDLSRLVNCLTGEGED
       .. .:.:.::.:..::. ..:  ..:..:::.:.::. :. . .:::   .  ::     
CCDS61 GEGNLTFNDFVDMFSVLCESAPRELKANYAFKIYDFNTDNFICKEDLELTLARLT----K
       40        50        60        70        80        90        

             150       160       170       180       190 
pF1KB8 TRLSASEMKQLIDNILEESDIDRDGTINLSEFQHVISRSPDFASSFKIVL
       ..:.  :.  . :...::.:.: :: .....:. .:...::: :.:.:  
CCDS61 SELDEEEVVLVCDKVIEEADLDGDGKLGFADFEDMIAKAPDFLSTFHIRI
          100       110       120       130       140    

>>CCDS74305.1 CIB3 gene_id:117286|Hs108|chr19             (138 aa)
 initn: 327 init1: 148 opt: 323  Z-score: 368.4  bits: 74.4 E(32554): 3.4e-14
Smith-Waterman score: 323; 40.3% identity (72.9% similar) in 129 aa overlap (61-189:13-136)

               40        50        60        70        80        90
pF1KB8 HRRFCELLPQEQRSVESSLRAQVPFEQILSLPELKANPFKERICRVFSTSPAKDSLSFED
                                     :   . :::..:: .::: . .   .....
CCDS74                   MGNKQTVFTHEQLEAYQDNPFRQRIAQVFSED-GDGHMTLDN
                                 10        20        30         40 

              100       110       120       130       140       150
pF1KB8 FLDLLSVFSDTATPDIKSHYAFRIFDFDDDGTLNREDLSRLVNCLTGEGEDTRLSASEMK
       :::..::.:. :  :.:..:::.:.::..:  .   :: . :. ::  :    ::: :..
CCDS74 FLDMFSVMSEMAPRDLKAYYAFKIYDFNNDDYICAWDLEQTVTKLTRGG----LSAEEVS
              50        60        70        80        90           

              160       170       180       190 
pF1KB8 QLIDNILEESDIDRDGTINLSEFQHVISRSPDFASSFKIVL
        . ...:.:.: :.:: ..: .::..: :.::: :.:.:  
CCDS74 LVCEKVLDEADGDHDGRLSLEDFQNMILRAPDFLSTFHIRI
       100       110       120       130        

>>CCDS61723.1 CIB2 gene_id:10518|Hs108|chr15              (138 aa)
 initn: 299 init1: 151 opt: 315  Z-score: 359.7  bits: 72.8 E(32554): 1e-13
Smith-Waterman score: 315; 37.2% identity (74.4% similar) in 129 aa overlap (61-189:13-136)

               40        50        60        70        80        90
pF1KB8 HRRFCELLPQEQRSVESSLRAQVPFEQILSLPELKANPFKERICRVFSTSPAKDSLSFED
                                     : . . :::::::  .:: . .. .:.:.:
CCDS61                   MGNKQTIFTEEQLDNYQENPFKERIVAAFSED-GEGNLTFND
                                 10        20        30         40 

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