Result of FASTA (ccds) for pF1KB8207
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8207, 292 aa
  1>>>pF1KB8207 292 - 292 aa - 292 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1553+/-0.00116; mu= 5.9667+/- 0.066
 mean_var=202.0187+/-45.474, 0's: 0 Z-trim(108.4): 699  B-trim: 278 in 1/50
 Lambda= 0.090236
 statistics sampled from 9358 (10163) to 9358 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.688), E-opt: 0.2 (0.312), width:  16
 Scan time:  2.520

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7           ( 292) 1994 272.4 2.8e-73
CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17          ( 305) 1216 171.2 8.7e-43
CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12           ( 298) 1183 166.8 1.7e-41
CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12         ( 523) 1134 160.8   2e-39
CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12          ( 523) 1134 160.8   2e-39
CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX          ( 496) 1133 160.6 2.1e-39
CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX          ( 502) 1133 160.6 2.2e-39
CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX          ( 570) 1133 160.7 2.3e-39
CCDS55184.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7           ( 260) 1108 157.0 1.3e-38
CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10           ( 297) 1097 155.6 3.9e-38
CCDS44300.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1          ( 474) 1099 156.1 4.5e-38
CCDS1454.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1           ( 504) 1099 156.2 4.6e-38
CCDS75627.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7          ( 423) 1037 148.0 1.1e-35
CCDS5619.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7           ( 451) 1037 148.0 1.2e-35
CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7          ( 469) 1037 148.1 1.2e-35
CCDS2350.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2          ( 384)  974 139.8 3.1e-33
CCDS58746.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2         ( 400)  974 139.8 3.2e-33
CCDS58747.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2         ( 429)  974 139.8 3.3e-33
CCDS75628.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7          ( 340)  946 136.1 3.6e-32
CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5            ( 346)  880 127.5 1.4e-29
CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16         ( 360)  818 119.4 3.8e-27
CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9         ( 346)  813 118.8 5.9e-27
CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1          ( 748)  809 118.6 1.4e-26
CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1          ( 782)  809 118.6 1.4e-26
CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1          ( 795)  809 118.7 1.4e-26
CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1       ( 770)  808 118.5 1.5e-26
CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1       ( 779)  808 118.5 1.6e-26
CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1       ( 780)  808 118.5 1.6e-26
CCDS81253.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1       ( 783)  808 118.5 1.6e-26
CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14          ( 358)  761 112.0 6.6e-25
CCDS3570.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4           ( 493)  731 108.3 1.2e-23
CCDS82933.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4          ( 570)  731 108.3 1.3e-23
CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX          ( 960)  734 109.0 1.4e-23
CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX          (1030)  734 109.0 1.5e-23
CCDS8899.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12           ( 264)  713 105.6 4.1e-23
CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2        ( 315)  713 105.7 4.6e-23
CCDS73637.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14         ( 276)  690 102.6 3.4e-22
CCDS32514.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16         ( 272)  667 99.6 2.6e-21
CCDS5628.1 CDK6 gene_id:1021|Hs108|chr7            ( 326)  665 99.5 3.6e-21
CCDS8953.1 CDK4 gene_id:1019|Hs108|chr12           ( 303)  651 97.6 1.2e-20
CCDS47265.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5         ( 455)  648 97.4 2.1e-20
CCDS83002.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5           ( 253)  642 96.3 2.4e-20
CCDS47264.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5         ( 592)  648 97.5 2.4e-20
CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16         ( 357)  641 96.4 3.3e-20
CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16         ( 379)  641 96.4 3.4e-20
CCDS6409.2 MAPK15 gene_id:225689|Hs108|chr8        ( 544)  635 95.8 7.4e-20
CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6            ( 583)  634 95.7 8.5e-20
CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6             ( 623)  634 95.8 8.9e-20
CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6            ( 648)  634 95.8 9.1e-20
CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6            ( 632)  614 93.2 5.5e-19


>>CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7                (292 aa)
 initn: 1994 init1: 1994 opt: 1994  Z-score: 1429.2  bits: 272.4 E(32554): 2.8e-73
Smith-Waterman score: 1994; 100.0% identity (100.0% similar) in 292 aa overlap (1-292:1-292)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MQKYEKLEKIGEGTYGTVFKAKNRETHEIVALKRVRLDDDDEGVPSSALREICLLKELKH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MQKYEKLEKIGEGTYGTVFKAKNRETHEIVALKRVRLDDDDEGVPSSALREICLLKELKH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 KNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKYFDSCNGDLDPEIVKSFLFQLLKGLGFCHSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKYFDSCNGDLDPEIVKSFLFQLLKGLGFCHSR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 NVLHRDLKPQNLLINRNGELKLADFGLARAFGIPVRCYSAEVVTLWYRPPDVLFGAKLYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NVLHRDLKPQNLLINRNGELKLADFGLARAFGIPVRCYSAEVVTLWYRPPDVLFGAKLYS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 TSIDMWSAGCIFAELANAGRPLFPGNDVDDQLKRIFRLLGTPTEEQWPSMTKLPDYKPYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TSIDMWSAGCIFAELANAGRPLFPGNDVDDQLKRIFRLLGTPTEEQWPSMTKLPDYKPYP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290  
pF1KB8 MYPATTSLVNVVPKLNATGRDLLQNLLKCNPVQRISAEEALQHPYFSDFCPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MYPATTSLVNVVPKLNATGRDLLQNLLKCNPVQRISAEEALQHPYFSDFCPP
              250       260       270       280       290  

>>CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17               (305 aa)
 initn: 585 init1: 585 opt: 1216  Z-score: 881.6  bits: 171.2 E(32554): 8.7e-43
Smith-Waterman score: 1216; 61.4% identity (85.3% similar) in 293 aa overlap (1-291:1-291)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MQKYEKLEKIGEGTYGTVFKAKNRETHEIVALKRVRLDDDDEGVPSSALREICLLKELKH
       :. ..:.:::::::::.:.::::::: ..::::..::: . :::::.:.::: :::::::
CCDS11 MDMFQKVEKIGEGTYGVVYKAKNRETGQLVALKKIRLDLEMEGVPSTAIREISLLKELKH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100        110         
pF1KB8 KNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKYFDSCNGDLDP-EIVKSFLFQLLKGLGFCHS
        ::::: ::.:...:: ::::: .::::::.::  :.  : ...::.:::::.:..::::
CCDS11 PNIVRLLDVVHNERKLYLVFEFLSQDLKKYMDSTPGSELPLHLIKSYLFQLLQGVSFCHS
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB8 RNVLHRDLKPQNLLINRNGELKLADFGLARAFGIPVRCYSAEVVTLWYRPPDVLFGAKLY
       . :.::::::::::::. : .::::::::::::.:.: :. :::::::: :..:.:.:.:
CCDS11 HRVIHRDLKPQNLLINELGAIKLADFGLARAFGVPLRTYTHEVVTLWYRAPEILLGSKFY
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB8 STSIDMWSAGCIFAELANAGRPLFPGNDVDDQLKRIFRLLGTPTEEQWPSMTKLPDYK-P
       .:..:.:: ::::::...  . ::::..  ::: ::::.::::.:. ::..:.:::::  
CCDS11 TTAVDIWSIGCIFAEMVTR-KALFPGDSEIDQLFRIFRMLGTPSEDTWPGVTQLPDYKGS
              190        200       210       220       230         

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB8 YPMYPATTSLVNVVPKLNATGRDLLQNLLKCNPVQRISAEEALQHPYFSDFCPP      
       .: . .  .: ..::.:.  :::::..::. .: :::.:. :: :::::.  :       
CCDS11 FPKW-TRKGLEEIVPNLEPEGRDLLMQLLQYDPSQRITAKTALAHPYFSSPEPSPAARQY
     240        250       260       270       280       290        

CCDS11 VLQRFRH
      300     

>>CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12                (298 aa)
 initn: 1004 init1: 524 opt: 1183  Z-score: 858.5  bits: 166.8 E(32554): 1.7e-41
Smith-Waterman score: 1183; 59.9% identity (82.0% similar) in 294 aa overlap (1-292:1-292)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MQKYEKLEKIGEGTYGTVFKAKNRETHEIVALKRVRLDDDDEGVPSSALREICLLKELKH
       :....:.:::::::::.:.::.:. : :.::::..::: . :::::.:.::: :::::.:
CCDS88 MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100        110         
pF1KB8 KNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKYFDSCNGDLDP-EIVKSFLFQLLKGLGFCHS
        :::.: ::.:...:: :::::  :::::..:.      :  ..::.:::::.::.::::
CCDS88 PNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHS
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB8 RNVLHRDLKPQNLLINRNGELKLADFGLARAFGIPVRCYSAEVVTLWYRPPDVLFGAKLY
       . :::::::::::::: .: .::::::::::::.::: :. :::::::: :..:.: : :
CCDS88 HRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYY
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB8 STSIDMWSAGCIFAELANAGRPLFPGNDVDDQLKRIFRLLGTPTEEQWPSMTKLPDYKP-
       ::..:.:: ::::::...  : ::::..  ::: :::: :::: :  ::..:..::::: 
CCDS88 STAVDIWSLGCIFAEMVTR-RALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPS
              190        200       210       220       230         

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB8 YPMYPATTSLVNVVPKLNATGRDLLQNLLKCNPVQRISAEEALQHPYFSDFCPP      
       .: . :  .. .::: :.  ::.::...:. .: .::::. :: ::.:.:   :      
CCDS88 FPKW-ARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
     240        250       260       270       280       290        

>>CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12              (523 aa)
 initn: 1050 init1: 779 opt: 1134  Z-score: 821.2  bits: 160.8 E(32554): 2e-39
Smith-Waterman score: 1134; 56.3% identity (84.6% similar) in 293 aa overlap (1-291:189-478)

                                             10        20        30
pF1KB8                               MQKYEKLEKIGEGTYGTVFKAKNRETHEIV
                                     :. : ::::.:::::.::.:.... :...:
CCDS53 EKLQINSPPFDQPMSRRSRRASLSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLV
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pF1KB8 ALKRVRLDDDDEGVPSSALREICLLKELKHKNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKY
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CCDS53 ALKEIRLEHE-EGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQY
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pF1KB8 FDSCNGDLDPEIVKSFLFQLLKGLGFCHSRNVLHRDLKPQNLLINRNGELKLADFGLARA
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CCDS53 MDDCGNIMSMHNVKLFLYQILRGLAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARA
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>>CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12               (523 aa)
 initn: 1050 init1: 779 opt: 1134  Z-score: 821.2  bits: 160.8 E(32554): 2e-39
Smith-Waterman score: 1134; 56.3% identity (84.6% similar) in 293 aa overlap (1-291:189-478)

                                             10        20        30
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CCDS90 EKLQINSPPFDQPMSRRSRRASLSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLV
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pF1KB8 ALKRVRLDDDDEGVPSSALREICLLKELKHKNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKY
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CCDS90 ALKEIRLEHE-EGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQY
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CCDS90 MDDCGNIMSMHNVKLFLYQILRGLAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARA
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CCDS90 YESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPRIHALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGHGK
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>>CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX               (496 aa)
 initn: 1044 init1: 774 opt: 1133  Z-score: 820.8  bits: 160.6 E(32554): 2.1e-39
Smith-Waterman score: 1133; 58.0% identity (84.7% similar) in 288 aa overlap (1-286:162-446)

                                             10        20        30
pF1KB8                               MQKYEKLEKIGEGTYGTVFKAKNRETHEIV
                                     .. : ::.:.:::::.::.:.:.. : ..:
CCDS14 EKLTLNSPIFDKPLSRRLRRVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTDNLV
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pF1KB8 ALKRVRLDDDDEGVPSSALREICLLKELKHKNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKY
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CCDS14 ALKEIRLEHE-EGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLKQY
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pF1KB8 FDSCNGDLDPEIVKSFLFQLLKGLGFCHSRNVLHRDLKPQNLLINRNGELKLADFGLARA
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CCDS14 LDDCGNIINMHNVKLFLFQLLRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARA
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CCDS14 KSIPTKTYSNEVVTLWYRPPDILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMAT-GRPLFPGSTVEE
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CCDS14 QLHFIFRILGTPTEETWPGILSNEEFKTYNYPKYRAE-ALLSHAPRLDSDGADLLTKLLQ
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CCDS14 FEGRNRISAEDAMKHPFFLSLGERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSSMPDSGRPA
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>>CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX               (502 aa)
 initn: 1044 init1: 774 opt: 1133  Z-score: 820.7  bits: 160.6 E(32554): 2.2e-39
Smith-Waterman score: 1133; 58.0% identity (84.7% similar) in 288 aa overlap (1-286:168-452)

                                             10        20        30
pF1KB8                               MQKYEKLEKIGEGTYGTVFKAKNRETHEIV
                                     .. : ::.:.:::::.::.:.:.. : ..:
CCDS48 EKLTLNSPIFDKPLSRRLRRVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTDNLV
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pF1KB8 ALKRVRLDDDDEGVPSSALREICLLKELKHKNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKY
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CCDS48 ALKEIRLEHE-EGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLKQY
       200        210       220       230       240       250      

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pF1KB8 FDSCNGDLDPEIVKSFLFQLLKGLGFCHSRNVLHRDLKPQNLLINRNGELKLADFGLARA
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CCDS48 LDDCGNIINMHNVKLFLFQLLRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARA
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pF1KB8 FGIPVRCYSAEVVTLWYRPPDVLFGAKLYSTSIDMWSAGCIFAELANAGRPLFPGNDVDD
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CCDS48 KSIPTKTYSNEVVTLWYRPPDILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMAT-GRPLFPGSTVEE
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pF1KB8 QLKRIFRLLGTPTEEQWPSMTKLPDYKPY--PMYPATTSLVNVVPKLNATGRDLLQNLLK
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CCDS48 QLHFIFRILGTPTEETWPGILSNEEFKTYNYPKYRAE-ALLSHAPRLDSDGADLLTKLLQ
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pF1KB8 CNPVQRISAEEALQHPYFSDFCPP                                    
        .  .:::::.:..::.:                                          
CCDS48 FEGRNRISAEDAMKHPFFLSLGERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSSMPDSGRPA
          440       450       460       470       480       490    

>>CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX               (570 aa)
 initn: 1044 init1: 774 opt: 1133  Z-score: 820.1  bits: 160.7 E(32554): 2.3e-39
Smith-Waterman score: 1133; 58.0% identity (84.7% similar) in 288 aa overlap (1-286:236-520)

                                             10        20        30
pF1KB8                               MQKYEKLEKIGEGTYGTVFKAKNRETHEIV
                                     .. : ::.:.:::::.::.:.:.. : ..:
CCDS55 EKLTLNSPIFDKPLSRRLRRVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTDNLV
         210       220       230       240       250       260     

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pF1KB8 ALKRVRLDDDDEGVPSSALREICLLKELKHKNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKY
       :::..::. . ::.: .:.::. :::.::: ::: :::..:..:.::::::. :.:::.:
CCDS55 ALKEIRLEHE-EGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLKQY
         270        280       290       300       310       320    

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pF1KB8 FDSCNGDLDPEIVKSFLFQLLKGLGFCHSRNVLHRDLKPQNLLINRNGELKLADFGLARA
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CCDS55 LDDCGNIINMHNVKLFLFQLLRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARA
          330       340       350       360       370       380    

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pF1KB8 FGIPVRCYSAEVVTLWYRPPDVLFGAKLYSTSIDMWSAGCIFAELANAGRPLFPGNDVDD
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CCDS55 KSIPTKTYSNEVVTLWYRPPDILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMAT-GRPLFPGSTVEE
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pF1KB8 QLKRIFRLLGTPTEEQWPSMTKLPDYKPY--PMYPATTSLVNVVPKLNATGRDLLQNLLK
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CCDS55 QLHFIFRILGTPTEETWPGILSNEEFKTYNYPKYRAE-ALLSHAPRLDSDGADLLTKLLQ
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pF1KB8 CNPVQRISAEEALQHPYFSDFCPP                                    
        .  .:::::.:..::.:                                          
CCDS55 FEGRNRISAEDAMKHPFFLSLGERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSSMPDSGRPA
            510       520       530       540       550       560  

>>CCDS55184.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7                (260 aa)
 initn: 1091 init1: 1091 opt: 1108  Z-score: 806.4  bits: 157.0 E(32554): 1.3e-38
Smith-Waterman score: 1701; 89.0% identity (89.0% similar) in 292 aa overlap (1-292:1-260)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MQKYEKLEKIGEGTYGTVFKAKNRETHEIVALKRVRLDDDDEGVPSSALREICLLKELKH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MQKYEKLEKIGEGTYGTVFKAKNRETHEIVALKRVRLDDDDEGVPSSALREICLLKELKH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 KNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKYFDSCNGDLDPEIVKSFLFQLLKGLGFCHSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                
CCDS55 KNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKYFDSCNGDLDPEIVK----------------
               70        80        90       100                    

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 NVLHRDLKPQNLLINRNGELKLADFGLARAFGIPVRCYSAEVVTLWYRPPDVLFGAKLYS
                       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ----------------NGELKLADFGLARAFGIPVRCYSAEVVTLWYRPPDVLFGAKLYS
                          110       120       130       140        

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 TSIDMWSAGCIFAELANAGRPLFPGNDVDDQLKRIFRLLGTPTEEQWPSMTKLPDYKPYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TSIDMWSAGCIFAELANAGRPLFPGNDVDDQLKRIFRLLGTPTEEQWPSMTKLPDYKPYP
      150       160       170       180       190       200        

              250       260       270       280       290  
pF1KB8 MYPATTSLVNVVPKLNATGRDLLQNLLKCNPVQRISAEEALQHPYFSDFCPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MYPATTSLVNVVPKLNATGRDLLQNLLKCNPVQRISAEEALQHPYFSDFCPP
      210       220       230       240       250       260

>>CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10                (297 aa)
 initn: 1093 init1: 483 opt: 1097  Z-score: 798.0  bits: 155.6 E(32554): 3.9e-38
Smith-Waterman score: 1097; 57.2% identity (81.8% similar) in 292 aa overlap (1-289:1-290)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MQKYEKLEKIGEGTYGTVFKAKNRETHEIVALKRVRLDDDDEGVPSSALREICLLKELKH
       :. : :.:::::::::.:.:.... : ..::.:..::....:::::.:.::: :::::.:
CCDS44 MEDYTKIEKIGEGTYGVVYKGRHKTTGQVVAMKKIRLESEEEGVPSTAIREISLLKELRH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90         100       110        
pF1KB8 KNIVRLHDVLHSDKKLTLVFEFCDQDLKKYFDSCN-GD-LDPEIVKSFLFQLLKGLGFCH
        ::: :.::: .:..: :.::: ..:::::.::   :. .:  .:::.:.:.:.:. :::
CCDS44 PNIVSLQDVLMQDSRLYLIFEFLSMDLKKYLDSIPPGQYMDSSLVKSYLYQILQGIVFCH
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB8 SRNVLHRDLKPQNLLINRNGELKLADFGLARAFGIPVRCYSAEVVTLWYRPPDVLFGAKL
       :: :::::::::::::. .: .::::::::::::::.: :. :::::::: :.::.:.  
CCDS44 SRRVLHRDLKPQNLLIDDKGTIKLADFGLARAFGIPIRVYTHEVVTLWYRSPEVLLGSAR
              130       140       150       160       170       180

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB8 YSTSIDMWSAGCIFAELANAGRPLFPGNDVDDQLKRIFRLLGTPTEEQWPSMTKLPDYK-
       ::: .:.:: : ::::::.  .::: :..  ::: :::: ::::..: :: . .: ::: 
CCDS44 YSTPVDIWSIGTIFAELATK-KPLFHGDSEIDQLFRIFRALGTPNNEVWPEVESLQDYKN
              190       200        210       220       230         

       240       250       260       270       280       290      
pF1KB8 PYPMYPATTSLVNVVPKLNATGRDLLQNLLKCNPVQRISAEEALQHPYFSDFCPP    
        .: .    ::.. : .:. .: :::...:  .:..:::.. ::.::::.:.       
CCDS44 TFPKWKPG-SLASHVKNLDENGLDLLSKMLIYDPAKRISGKMALNHPYFNDLDNQIKKM
     240        250       260       270       280       290       




292 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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