Result of FASTA (ccds) for pF1KB8173
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8173, 358 aa
  1>>>pF1KB8173 358 - 358 aa - 358 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8166+/-0.000698; mu= 12.5630+/- 0.043
 mean_var=158.6667+/-32.493, 0's: 0 Z-trim(115.6): 49  B-trim: 875 in 1/54
 Lambda= 0.101820
 statistics sampled from 16075 (16125) to 16075 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.807), E-opt: 0.2 (0.495), width:  16
 Scan time:  2.400

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS46132.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19        ( 358) 2502 378.6 4.4e-105
CCDS74406.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19        ( 375) 1467 226.6 2.7e-59
CCDS33064.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19        ( 421) 1043 164.4 1.6e-40
CCDS45220.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15         ( 306) 1007 158.9 5.1e-39
CCDS42014.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15         ( 381) 1007 159.0 5.9e-39
CCDS45218.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15         ( 394) 1007 159.0 6.1e-39
CCDS46309.1 MEIS1 gene_id:4211|Hs108|chr2          ( 390)  994 157.1 2.3e-38
CCDS10045.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15         ( 470)  953 151.2 1.7e-36
CCDS45219.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15         ( 388)  913 145.2 8.6e-35
CCDS45217.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15         ( 401)  913 145.2 8.8e-35
CCDS10044.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15         ( 477)  913 145.3   1e-34
CCDS41730.1 PKNOX2 gene_id:63876|Hs108|chr11       ( 472)  373 66.0 7.5e-11
CCDS68211.1 PKNOX1 gene_id:5316|Hs108|chr21        ( 319)  368 65.1 9.5e-11


>>CCDS46132.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19             (358 aa)
 initn: 2502 init1: 2502 opt: 2502  Z-score: 2000.0  bits: 378.6 E(32554): 4.4e-105
Smith-Waterman score: 2502; 100.0% identity (100.0% similar) in 358 aa overlap (1-358:1-358)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MARRYDELPHYPGIVDGPAALASFPETVPAVPGPYGPHRPPQPLPPGLDSDGLKREKDEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MARRYDELPHYPGIVDGPAALASFPETVPAVPGPYGPHRPPQPLPPGLDSDGLKREKDEI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 YGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDVCSSDSFNEDIAAFAKQVRSER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDVCSSDSFNEDIAAFAKQVRSER
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 PLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKGKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCPSLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKGKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCPSLP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 DQNNMWIRDHEDSGSVHLGTPGPSSGGLASQSGDNSSDQGDGLDTSVASPSSGGEDEDLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DQNNMWIRDHEDSGSVHLGTPGPSSGGLASQSGDNSSDQGDGLDTSVASPSSGGEDEDLD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 QERRRNKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLSHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QERRRNKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLSHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINAR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350        
pF1KB8 RRIVQPMIDQSNRTGQGAAFSPEGQPIGGYTETQPHVAVRPPGSVGMSLNLEGEWHYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RRIVQPMIDQSNRTGQGAAFSPEGQPIGGYTETQPHVAVRPPGSVGMSLNLEGEWHYL
              310       320       330       340       350        

>>CCDS74406.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19             (375 aa)
 initn: 1467 init1: 1467 opt: 1467  Z-score: 1178.1  bits: 226.6 E(32554): 2.7e-59
Smith-Waterman score: 2458; 95.5% identity (95.5% similar) in 375 aa overlap (1-358:1-375)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MARRYDELPHYPGIVDGPAALASFPETVPAVPGPYGPHRPPQPLPPGLDSDGLKREKDEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MARRYDELPHYPGIVDGPAALASFPETVPAVPGPYGPHRPPQPLPPGLDSDGLKREKDEI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 YGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDVCSSDSFNEDIAAFAKQVRSER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 YGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDVCSSDSFNEDIAAFAKQVRSER
               70        80        90       100       110       120

              130       140                        150       160   
pF1KB8 PLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK-----------------GKMPIDLVIEDRDG
       :::::::::::::::::::::::::::::                 ::::::::::::::
CCDS74 PLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHDLCDNFCHRYITCLKGKMPIDLVIEDRDG
              130       140       150       160       170       180

           170       180       190       200       210       220   
pF1KB8 GCREDFEDYPASCPSLPDQNNMWIRDHEDSGSVHLGTPGPSSGGLASQSGDNSSDQGDGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GCREDFEDYPASCPSLPDQNNMWIRDHEDSGSVHLGTPGPSSGGLASQSGDNSSDQGDGL
              190       200       210       220       230       240

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB8 DTSVASPSSGGEDEDLDQERRRNKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLSHPYPSEEQKKQLAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 DTSVASPSSGGEDEDLDQERRRNKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLSHPYPSEEQKKQLAQ
              250       260       270       280       290       300

           290       300       310       320       330       340   
pF1KB8 DTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRTGQGAAFSPEGQPIGGYTETQPHVAVRPPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 DTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRTGQGAAFSPEGQPIGGYTETQPHVAVRPPG
              310       320       330       340       350       360

           350        
pF1KB8 SVGMSLNLEGEWHYL
       :::::::::::::::
CCDS74 SVGMSLNLEGEWHYL
              370     

>>CCDS33064.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19             (421 aa)
 initn: 1672 init1: 1041 opt: 1043  Z-score: 840.8  bits: 164.4 E(32554): 1.6e-40
Smith-Waterman score: 2134; 83.8% identity (83.8% similar) in 390 aa overlap (1-327:1-390)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MARRYDELPHYPGIVDGPAALASFPETVPAVPGPYGPHRPPQPLPPGLDSDGLKREKDEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MARRYDELPHYPGIVDGPAALASFPETVPAVPGPYGPHRPPQPLPPGLDSDGLKREKDEI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 YGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDVCSSDSFNEDIAAFAKQVRSER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDVCSSDSFNEDIAAFAKQVRSER
               70        80        90       100       110       120

              130       140                        150       160   
pF1KB8 PLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK-----------------GKMPIDLVIEDRDG
       :::::::::::::::::::::::::::::                 ::::::::::::::
CCDS33 PLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHDLCDNFCHRYITCLKGKMPIDLVIEDRDG
              130       140       150       160       170       180

           170       180       190       200       210       220   
pF1KB8 GCREDFEDYPASCPSLPDQNNMWIRDHEDSGSVHLGTPGPSSGGLASQSGDNSSDQGDGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GCREDFEDYPASCPSLPDQNNMWIRDHEDSGSVHLGTPGPSSGGLASQSGDNSSDQGDGL
              190       200       210       220       230       240

           230       240       250       260                       
pF1KB8 DTSVASPSSGGEDEDLDQERRRNKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLS--------------
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::              
CCDS33 DTSVASPSSGGEDEDLDQERRRNKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLSRRSEAPVLPDVCLG
              250       260       270       280       290       300

                                     270       280       290       
pF1KB8 --------------------------------HPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFI
                                       ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LGSPSPGPRWARPWGSDCGRPGRQSDSCWWLQHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFI
              310       320       330       340       350       360

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB8 NARRRIVQPMIDQSNRTGQGAAFSPEGQPIGGYTETQPHVAVRPPGSVGMSLNLEGEWHY
       ::::::::::::::::::::::::::::::                              
CCDS33 NARRRIVQPMIDQSNRTGQGAAFSPEGQPIGGYTETQPHVAVRPPGSVGMSLNLEGEWHY
              370       380       390       400       410       420

>>CCDS45220.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15              (306 aa)
 initn: 1077 init1: 659 opt: 1007  Z-score: 814.0  bits: 158.9 E(32554): 5.1e-39
Smith-Waterman score: 1377; 67.8% identity (84.1% similar) in 314 aa overlap (69-358:1-306)

       40        50        60        70        80        90        
pF1KB8 RPPQPLPPGLDSDGLKREKDEIYGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGD
                                     .::::::::::::.::. . :      :::
CCDS45                               MALVFEKCELATCTPREPGVA------GGD
                                             10        20          

      100       110       120       130       140                  
pF1KB8 VCSSDSFNEDIAAFAKQVRSERPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK---------
       ::::::::::::.::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::         
CCDS45 VCSSDSFNEDIAVFAKQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFC
           30        40        50        60        70        80    

             150       160       170       180        190          
pF1KB8 --------GKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCPSLPDQN-NMWIRDHEDSGSVH-LG
               :::::::::..:::. . : :.  .:  .: :.: . : :::.:. :.:  :
CCDS45 HRYISCLKGKMPIDLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSW-RDHDDATSTHSAG
           90       100       110       120       130        140   

     200       210       220       230       240       250         
pF1KB8 TPGPSSGGLASQSGDNSSDQGDGLDTSVASPSSGGEDEDLDQERRRNKKRGIFPKVATNI
       :::::::: :::::::::.::::::.:::::..: .:.: :....:.:::::::::::::
CCDS45 TPGPSSGGHASQSGDNSSEQGDGLDNSVASPGTG-DDDDPDKDKKRQKKRGIFPKVATNI
           150       160       170        180       190       200  

     260       270       280       290       300       310         
pF1KB8 MRAWLFQHLSHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRT-GQGA
       :::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. .:::
CCDS45 MRAWLFQHLTHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGA
            210       220       230       240       250       260  

      320       330        340          350        
pF1KB8 AFSPEGQPIGGYT-ETQPHVAVRPPG---SVGMSLNLEGEWHYL
       :.::::::.:... . : :...:: :   ..::.....:.:::.
CCDS45 AYSPEGQPMGSFVLDGQQHMGIRPAGPMSGMGMNMGMDGQWHYM
            270       280       290       300      

>>CCDS42014.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15              (381 aa)
 initn: 1231 init1: 659 opt: 1007  Z-score: 812.8  bits: 159.0 E(32554): 5.9e-39
Smith-Waterman score: 1522; 63.8% identity (79.1% similar) in 378 aa overlap (9-358:14-381)

                    10        20        30        40         50    
pF1KB8      MARRYDELPHYPGIVDGPAALASFPETVPAVPGPYGPHRP-PQPLPPGLDS---D
                    :: :  .     :   :     .   :: : : :. .: .. :   :
CCDS42 MDGVGVPASMYGDPHAPRPIPPVHHLNHGPPL--HATQHYGAHAPHPNVMPASMGSAVND
               10        20        30          40        50        

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB8 GLKREKDEIYGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDVCSSDSFNEDIAA
       .:::.:: ::::::::::::::::::::::.::. . :      :::::::::::::::.
CCDS42 ALKRDKDAIYGHPLFPLLALVFEKCELATCTPREPGVA------GGDVCSSDSFNEDIAV
       60        70        80        90             100       110  

             120       130       140                        150    
pF1KB8 FAKQVRSERPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK-----------------GKMPI
       ::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::                 :::::
CCDS42 FAKQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRYISCLKGKMPI
            120       130       140       150       160       170  

          160       170       180        190        200       210  
pF1KB8 DLVIEDRDGGCREDFEDYPASCPSLPDQN-NMWIRDHEDSGSVH-LGTPGPSSGGLASQS
       ::::..:::. . : :.  .:  .: :.: . : :::.:. :.:  ::::::::: ::::
CCDS42 DLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSW-RDHDDATSTHSAGTPGPSSGGHASQS
            180       190       200        210       220       230 

            220       230       240       250       260       270  
pF1KB8 GDNSSDQGDGLDTSVASPSSGGEDEDLDQERRRNKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLSHPY
       :::::.::::::.:::::..: .:.: :....:.::::::::::::::::::::::.:::
CCDS42 GDNSSEQGDGLDNSVASPGTG-DDDDPDKDKKRQKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLTHPY
             240       250        260       270       280       290

            280       290       300       310        320       330 
pF1KB8 PSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRT-GQGAAFSPEGQPIGGYT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. .::::.::::::.:...
CCDS42 PSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGAAYSPEGQPMGSFV
              300       310       320       330       340       350

              340          350        
pF1KB8 -ETQPHVAVRPPG---SVGMSLNLEGEWHYL
        . : :...:: :   ..::.....:.:::.
CCDS42 LDGQQHMGIRPAGPMSGMGMNMGMDGQWHYM
              360       370       380 

>>CCDS45218.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15              (394 aa)
 initn: 1300 init1: 659 opt: 1007  Z-score: 812.6  bits: 159.0 E(32554): 6.1e-39
Smith-Waterman score: 1590; 63.3% identity (79.2% similar) in 403 aa overlap (1-358:1-394)

               10           20        30                      40   
pF1KB8 MARRYDELPHYPGIVDG---PAALASFPETVPAVP-------GP-------YGPHRP-PQ
       ::.:::::::: :. ::   ::.. . :..   .:       ::       :: : : :.
CCDS45 MAQRYDELPHYGGM-DGVGVPASMYGDPHAPRPIPPVHHLNHGPPLHATQHYGAHAPHPN
               10         20        30        40        50         

             50           60        70        80        90         
pF1KB8 PLPPGLDS---DGLKREKDEIYGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDV
        .: .. :   :.:::.:: ::::::::::::::::::::::.::. . ::      :::
CCDS45 VMPASMGSAVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALVFEKCELATCTPREPGVAG------GDV
      60        70        80        90       100       110         

     100       110       120       130       140                   
pF1KB8 CSSDSFNEDIAAFAKQVRSERPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK----------
       :::::::::::.::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::          
CCDS45 CSSDSFNEDIAVFAKQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCH
           120       130       140       150       160       170   

            150       160       170       180        190        200
pF1KB8 -------GKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCPSLPDQN-NMWIRDHEDSGSVH-LGT
              :::::::::..:::. . : :.  .:  .: :.: . : :::.:. :.:  ::
CCDS45 RYISCLKGKMPIDLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSW-RDHDDATSTHSAGT
           180       190       200       210        220       230  

              210       220       230       240       250       260
pF1KB8 PGPSSGGLASQSGDNSSDQGDGLDTSVASPSSGGEDEDLDQERRRNKKRGIFPKVATNIM
       ::::::: :::::::::.::::::.:::::..: .:.: :....:.::::::::::::::
CCDS45 PGPSSGGHASQSGDNSSEQGDGLDNSVASPGTG-DDDDPDKDKKRQKKRGIFPKVATNIM
            240       250       260        270       280       290 

              270       280       290       300       310          
pF1KB8 RAWLFQHLSHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRT-GQGAA
       ::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. .::::
CCDS45 RAWLFQHLTHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGAA
             300       310       320       330       340       350 

     320       330        340          350        
pF1KB8 FSPEGQPIGGYT-ETQPHVAVRPPG---SVGMSLNLEGEWHYL
       .::::::.:... . : :...:: :   ..::.....:.:::.
CCDS45 YSPEGQPMGSFVLDGQQHMGIRPAGPMSGMGMNMGMDGQWHYM
             360       370       380       390    

>>CCDS46309.1 MEIS1 gene_id:4211|Hs108|chr2               (390 aa)
 initn: 1192 init1: 506 opt: 994  Z-score: 802.3  bits: 157.1 E(32554): 2.3e-38
Smith-Waterman score: 1535; 61.2% identity (79.2% similar) in 400 aa overlap (1-358:1-390)

               10           20            30            40         
pF1KB8 MARRYDELPHYPGIVDG---PAALASFPETV----PAVPGPYGP----HRPPQP-----L
       ::.:::.:::: :. ::   :... . :...    :.    .::    :. :.      .
CCDS46 MAQRYDDLPHYGGM-DGVGIPSTMYGDPHAARSMQPVHHLNHGPPLHSHQYPHTAHTNAM
               10         20        30        40        50         

           50           60        70        80        90       100 
pF1KB8 PPGLDS---DGLKREKDEIYGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDVCS
        :.. :   :.:::.:: ::::::::::::.:::::::::.::. . ::      :::::
CCDS46 APSMGSSVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALIFEKCELATCTPREPGVAG------GDVCS
      60        70        80        90       100             110   

             110       120       130       140                     
pF1KB8 SDSFNEDIAAFAKQVRSERPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK------------
       :.:::::::.::::.:.:.:::::::::::::::::::::::::::::            
CCDS46 SESFNEDIAVFAKQIRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRY
           120       130       140       150       160       170   

          150       160       170       180       190        200   
pF1KB8 -----GKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCPSLPDQNNMWIRDHEDSGSVHLG-TPGP
            :::::::::.::.:: . : ::   :  .: :: . : :::.:..:.. : ::::
CCDS46 ISCLKGKMPIDLVIDDREGGSKSDSEDITRSA-NLTDQPS-WNRDHDDTASTRSGGTPGP
           180       190       200        210        220       230 

           210       220       230       240       250       260   
pF1KB8 SSGGLASQSGDNSSDQGDGLDTSVASPSSGGEDEDLDQERRRNKKRGIFPKVATNIMRAW
       :::: .:.::::::.::::::.::::::.: .:.: :....:.:::::::::::::::::
CCDS46 SSGGHTSHSGDNSSEQGDGLDNSVASPSTG-DDDDPDKDKKRHKKRGIFPKVATNIMRAW
             240       250       260        270       280       290

           270       280       290       300       310        320  
pF1KB8 LFQHLSHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRT-GQGAAFSP
       :::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. .::. ..:
CCDS46 LFQHLTHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGTPYNP
              300       310       320       330       340       350

            330        340          350        
pF1KB8 EGQPIGGYT-ETQPHVAVRPPG---SVGMSLNLEGEWHYL
       .:::.::.. . : :...: ::   ..::....::.:::.
CCDS46 DGQPMGGFVMDGQQHMGIRAPGPMSGMGMNMGMEGQWHYM
              360       370       380       390

>>CCDS10045.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15              (470 aa)
 initn: 1203 init1: 659 opt: 953  Z-score: 768.8  bits: 151.2 E(32554): 1.7e-36
Smith-Waterman score: 1536; 64.3% identity (78.7% similar) in 389 aa overlap (1-347:1-380)

               10           20        30                      40   
pF1KB8 MARRYDELPHYPGIVDG---PAALASFPETVPAVP-------GP-------YGPHRP-PQ
       ::.:::::::: :. ::   ::.. . :..   .:       ::       :: : : :.
CCDS10 MAQRYDELPHYGGM-DGVGVPASMYGDPHAPRPIPPVHHLNHGPPLHATQHYGAHAPHPN
               10         20        30        40        50         

             50           60        70        80        90         
pF1KB8 PLPPGLDS---DGLKREKDEIYGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDV
        .: .. :   :.:::.:: ::::::::::::::::::::::.::. . ::      :::
CCDS10 VMPASMGSAVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALVFEKCELATCTPREPGVAG------GDV
      60        70        80        90       100       110         

     100       110       120       130       140                   
pF1KB8 CSSDSFNEDIAAFAKQVRSERPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK----------
       :::::::::::.::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::          
CCDS10 CSSDSFNEDIAVFAKQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCH
           120       130       140       150       160       170   

            150       160       170       180        190        200
pF1KB8 -------GKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCPSLPDQN-NMWIRDHEDSGSVH-LGT
              :::::::::..:::. . : :.  .:  .: :.: . : :::.:. :.:  ::
CCDS10 RYISCLKGKMPIDLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSW-RDHDDATSTHSAGT
           180       190       200       210        220       230  

              210       220       230       240       250       260
pF1KB8 PGPSSGGLASQSGDNSSDQGDGLDTSVASPSSGGEDEDLDQERRRNKKRGIFPKVATNIM
       ::::::: :::::::::.::::::.:::::..: .:.: :....:.::::::::::::::
CCDS10 PGPSSGGHASQSGDNSSEQGDGLDNSVASPGTG-DDDDPDKDKKRQKKRGIFPKVATNIM
            240       250       260        270       280       290 

              270       280       290       300       310          
pF1KB8 RAWLFQHLSHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRT-GQGAA
       ::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. .::::
CCDS10 RAWLFQHLTHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGAA
             300       310       320       330       340       350 

     320       330        340       350                            
pF1KB8 FSPEGQPIGGYT-ETQPHVAVRPPGSVGMSLNLEGEWHYL                    
       .::::::.:... . : :...:: :  .:                               
CCDS10 YSPEGQPMGSFVLDGQQHMGIRPAGLQSMPGDYVSQGGPMGMSMAQPSYTPPQMTPHPTQ
             360       370       380       390       400       410 

>>CCDS45219.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15              (388 aa)
 initn: 1379 init1: 667 opt: 913  Z-score: 738.1  bits: 145.2 E(32554): 8.6e-35
Smith-Waterman score: 1516; 62.9% identity (77.7% similar) in 385 aa overlap (9-358:14-388)

                    10        20        30        40         50    
pF1KB8      MARRYDELPHYPGIVDGPAALASFPETVPAVPGPYGPHRP-PQPLPPGLDS---D
                    :: :  .     :   :     .   :: : : :. .: .. :   :
CCDS45 MDGVGVPASMYGDPHAPRPIPPVHHLNHGPPL--HATQHYGAHAPHPNVMPASMGSAVND
               10        20        30          40        50        

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB8 GLKREKDEIYGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDVCSSDSFNEDIAA
       .:::.:: ::::::::::::::::::::::.::. . :      :::::::::::::::.
CCDS45 ALKRDKDAIYGHPLFPLLALVFEKCELATCTPREPGVA------GGDVCSSDSFNEDIAV
       60        70        80        90             100       110  

             120       130       140                        150    
pF1KB8 FAKQVRSERPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK-----------------GKMPI
       ::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::                 :::::
CCDS45 FAKQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRYISCLKGKMPI
            120       130       140       150       160       170  

          160       170       180        190        200       210  
pF1KB8 DLVIEDRDGGCREDFEDYPASCPSLPDQN-NMWIRDHEDSGSVH-LGTPGPSSGGLASQS
       ::::..:::. . : :.  .:  .: :.: . : :::.:. :.:  ::::::::: ::::
CCDS45 DLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSW-RDHDDATSTHSAGTPGPSSGGHASQS
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