Result of SIM4 for pF1KB8143

seq1 = pF1KB8143.tfa, 1218 bp
seq2 = pF1KB8143/gi568815581f_36838198.tfa (gi568815581f:36838198_37043128), 204931 bp

>pF1KB8143 1218
>gi568815581f:36838198_37043128 (Chr17)

1-170  (100001-100170)   100% ->
171-397  (102093-102319)   100% ->
398-675  (102413-102690)   100% ->
676-841  (104003-104168)   100% ->
842-1218  (104555-104931)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTTCACTGTGCCGGCTGCAAAAGGCCCATCCTGGACCGCTTTCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTTCACTGTGCCGGCTGCAAAAGGCCCATCCTGGACCGCTTTCTCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAACGTGCTGGACAGGGCCTGGCACGTCAAGTGCGTCCAGTGCTGTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAACGTGCTGGACAGGGCCTGGCACGTCAAGTGCGTCCAGTGCTGTGAAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTAAATGCAACCTGACCGAGAAGTGCTTCTCCAGGGAAGGCAAACTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTAAATGCAACCTGACCGAGAAGTGCTTCTCCAGGGAAGGCAAACTCTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGCAAGAACGACTTCTTCCG         GTGTTTCGGTACCAAATGCGC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100151 TGCAAGAACGACTTCTTCCGGTG...CAGGTGTTTCGGTACCAAATGCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGGCTGCGCTCAGGGCATCTCCCCTAGCGACCTGGTGCGGAGAGCGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102114 AGGCTGCGCTCAGGGCATCTCCCCTAGCGACCTGGTGCGGAGAGCGCGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCAAAGTGTTTCACCTGAACTGCTTCACCTGCATGATGTGTAACAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102164 GCAAAGTGTTTCACCTGAACTGCTTCACCTGCATGATGTGTAACAAGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTCTCCACTGGCGAGGAACTCTACATCATCGACGAGAATAAGTTCGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102214 CTCTCCACTGGCGAGGAACTCTACATCATCGACGAGAATAAGTTCGTCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAAAGAGGATTACCTAAGTAACAGCAGTGTTGCCAAAGAGAACAGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102264 CAAAGAGGATTACCTAAGTAACAGCAGTGTTGCCAAAGAGAACAGCCTTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACTCGG         CCACCACGGGCAGTGACCCCAGTTTGTCTCCGGAT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102314 ACTCGGGTG...TAGCCACCACGGGCAGTGACCCCAGTTTGTCTCCGGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TCCCAAGACCCGTCGCAGGACGACGCCAAGGACTCGGAGAGCGCCAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102448 TCCCAAGACCCGTCGCAGGACGACGCCAAGGACTCGGAGAGCGCCAACGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GTCGGACAAGGAAGCGGGTAGCAACGAGAATGACGACCAGAACCTGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102498 GTCGGACAAGGAAGCGGGTAGCAACGAGAATGACGACCAGAACCTGGGCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCAAGCGGCGGGGACCGCGCACCACCATCAAAGCCAAGCAGCTGGAGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102548 CCAAGCGGCGGGGACCGCGCACCACCATCAAAGCCAAGCAGCTGGAGACG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTGAAGGCCGCCTTCGCTGCTACACCCAAGCCCACCCGCCACATCCGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102598 CTGAAGGCCGCCTTCGCTGCTACACCCAAGCCCACCCGCCACATCCGCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GCAGCTGGCGCAGGAGACCGGCCTCAACATGCGCGTCATTCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 102648 GCAGCTGGCGCAGGAGACCGGCCTCAACATGCGCGTCATTCAGGTC...C

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    676   GTCTGGTTCCAGAACCGGCGCTCCAAGGAGCGGAGGATGAAGCAGCTG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104001 AGGTCTGGTTCCAGAACCGGCGCTCCAAGGAGCGGAGGATGAAGCAGCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AGCGCCCTGGGCGCCCGGCGCCACGCCTTCTTCCGCAGTCCGCGCCGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104051 AGCGCCCTGGGCGCCCGGCGCCACGCCTTCTTCCGCAGTCCGCGCCGGAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GCGGCCGCTGGTGGACCGCCTGGAGCCGGGCGAGCTCATCCCCAATGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104101 GCGGCCGCTGGTGGACCGCCTGGAGCCGGGCGAGCTCATCCCCAATGGTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CCTTCTCCTTCTACGGAG         ATTACCAGAGCGAGTACTACGGG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 104151 CCTTCTCCTTCTACGGAGGTG...CAGATTACCAGAGCGAGTACTACGGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CCCGGGGGCAACTACGACTTCTTCCCGCAAGGCCCCCCGTCCTCGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104578 CCCGGGGGCAACTACGACTTCTTCCCGCAAGGCCCCCCGTCCTCGCAGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CCAGACACCAGTGGACCTACCCTTCGTGCCGTCATCTGGGCCGTCCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104628 CCAGACACCAGTGGACCTACCCTTCGTGCCGTCATCTGGGCCGTCCGGGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CGCCCCTGGGTGGCCTGGAGCACCCGCTGCCGGGCCACCACCCGTCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104678 CGCCCCTGGGTGGCCTGGAGCACCCGCTGCCGGGCCACCACCCGTCGAGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GAGGCGCAGCGGTTTACCGACATCCTGGCGCACCCACCCGGGGACTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104728 GAGGCGCAGCGGTTTACCGACATCCTGGCGCACCCACCCGGGGACTCGCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 CAGCCCCGAGCCCAGCCTGCCCGGGCCTCTGCACTCCATGTCGGCCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104778 CAGCCCCGAGCCCAGCCTGCCCGGGCCTCTGCACTCCATGTCGGCCGAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 TCTTCGGACCCAGCCCGCCCTTCTCGTCGCTGTCGGTCAACGGTGGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104828 TCTTCGGACCCAGCCCGCCCTTCTCGTCGCTGTCGGTCAACGGTGGGGCG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 AGCTACGGAAACCACCTGTCCCACCCCCCCGAAATGAACGAGGCGGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104878 AGCTACGGAAACCACCTGTCCCACCCCCCCGAAATGAACGAGGCGGCCGT

   1250 
   1215 GTGG
        ||||
 104928 GTGG

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