Result of FASTA (ccds) for pF1KB7711
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7711, 421 aa
  1>>>pF1KB7711 421 - 421 aa - 421 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7069+/-0.000795; mu= 9.0790+/- 0.048
 mean_var=205.1063+/-40.651, 0's: 0 Z-trim(115.7): 67  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.089554
 statistics sampled from 16168 (16235) to 16168 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.807), E-opt: 0.2 (0.499), width:  16
 Scan time:  3.680

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS32739.1 FOXJ1 gene_id:2302|Hs108|chr17         ( 421) 2954 393.7 1.7e-109
CCDS30708.1 FOXD2 gene_id:2306|Hs108|chr1          ( 495)  452 70.6 3.9e-12
CCDS34975.1 FOXD4 gene_id:2298|Hs108|chr9          ( 439)  435 68.3 1.7e-11
CCDS12677.1 FOXA3 gene_id:3171|Hs108|chr19         ( 350)  431 67.7   2e-11
CCDS13192.1 FOXS1 gene_id:2307|Hs108|chr20         ( 330)  430 67.5 2.1e-11
CCDS550.1 FOXE3 gene_id:2301|Hs108|chr1            ( 319)  422 66.5 4.2e-11
CCDS4372.1 FOXI1 gene_id:2299|Hs108|chr5           ( 378)  421 66.4 5.2e-11
CCDS2117.1 FOXD4L1 gene_id:200350|Hs108|chr2       ( 408)  416 65.8 8.6e-11


>>CCDS32739.1 FOXJ1 gene_id:2302|Hs108|chr17              (421 aa)
 initn: 2954 init1: 2954 opt: 2954  Z-score: 2079.2  bits: 393.7 E(32554): 1.7e-109
Smith-Waterman score: 2954; 100.0% identity (100.0% similar) in 421 aa overlap (1-421:1-421)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MAESWLRLSGAGPAEEAGPEGGLEEPDALDDSLTSLQWLQEFSILNAKAPALPPGGTDPH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MAESWLRLSGAGPAEEAGPEGGLEEPDALDDSLTSLQWLQEFSILNAKAPALPPGGTDPH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 GYHQVPGSAAPGSPLAADPACLGQPHTPGKPTSSCTSRSAPPGLQAPPPDDVDYATNPHV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GYHQVPGSAAPGSPLAADPACLGQPHTPGKPTSSCTSRSAPPGLQAPPPDDVDYATNPHV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 KPPYSYATLICMAMQASKATKITLSAIYKWITDNFCYFRHADPTWQNSIRHNLSLNKCFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KPPYSYATLICMAMQASKATKITLSAIYKWITDNFCYFRHADPTWQNSIRHNLSLNKCFI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 KVPREKDEPGKGGFWRIDPQYAERLLSGAFKKRRLPPVHIHPAFARQAAQEPSAVPRAGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KVPREKDEPGKGGFWRIDPQYAERLLSGAFKKRRLPPVHIHPAFARQAAQEPSAVPRAGP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 LTVNTEAQQLLREFEEATGEAGWGAGEGRLGHKRKQPLPKRVAKVPRPPSTLLPTPEEQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LTVNTEAQQLLREFEEATGEAGWGAGEGRLGHKRKQPLPKRVAKVPRPPSTLLPTPEEQG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 ELEPLKGNFDWEAIFDAGTLGGELGALEALELSPPLSPASHVDVDLTIHGRHIDCPATWG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ELEPLKGNFDWEAIFDAGTLGGELGALEALELSPPLSPASHVDVDLTIHGRHIDCPATWG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 PSVEQAADSLDFDETFLATSFLQHPWDESGSGCLPPEPLFEAGDATLASDLQDWASVGAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PSVEQAADSLDFDETFLATSFLQHPWDESGSGCLPPEPLFEAGDATLASDLQDWASVGAF
              370       380       390       400       410       420

        
pF1KB7 L
       :
CCDS32 L
        

>>CCDS30708.1 FOXD2 gene_id:2306|Hs108|chr1               (495 aa)
 initn: 390 init1: 390 opt: 452  Z-score: 331.3  bits: 70.6 E(32554): 3.9e-12
Smith-Waterman score: 462; 30.8% identity (49.8% similar) in 442 aa overlap (16-396:14-428)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MAESWLRLSGAGPAEEAGPEGGLEEPDALDDSLTSLQWLQEFSILNAKAPALPPGGTDPH
                      :..: ..: : ::  : . . .   :   : :..    :  . ::
CCDS30   MTLGSCCCEIMSSESSP-AALSEADADIDVVGGGSGGGE---LPARSGPRAPRDVLPH
                 10         20        30           40        50    

               70            80         90       100               
pF1KB7 GYHQVPGSAAPGSPLAADP----ACL-GQPHTPGKPTSSCTSRSAPPGLQA--------P
       : :. :.  :  . :: :     .:  :.:.. ..  .. .. :  ::  :        :
CCDS30 G-HEPPAEEAE-ADLAEDEEESGGCSDGEPRALASRGAAAAAGSPGPGAAAARGAAGPGP
            60         70        80        90       100       110  

       110        120       130       140       150       160      
pF1KB7 PPDDVDYAT-NPHVKPPYSYATLICMAMQASKATKITLSAIYKWITDNFCYFRHADPTWQ
        : .   :: .: ::::::: .:: ::.  :   ..::: : ..:.  : :.:.  :.::
CCDS30 GPPSGGAATRSPLVKPPYSYIALITMAILQSPKKRLTLSEICEFISGRFPYYREKFPAWQ
            120       130       140       150       160       170  

        170       180       190       200       210                
pF1KB7 NSIRHNLSLNKCFIKVPREKDEPGKGGFWRIDPQYAERLLSGAFKKRR-------LPPVH
       :::::::::: ::.:.:::  .::::..: .::. :. . .:.: .::       ::: :
CCDS30 NSIRHNLSLNDCFVKIPREPGNPGKGNYWTLDPESADMFDNGSFLRRRKRFKRQPLPPPH
            180       190       200       210       220       230  

     220       230       240       250       260                   
pF1KB7 IHPAFARQAAQEPSAVPRAGPLTVNTEAQQLLREFEEATGEAGWGAG----------EGR
        ::        .:  . :.:  ... .   .:  :  : :  :.: :           : 
CCDS30 PHP------HPHPELLLRGGAAAAG-DPGAFLPGFA-AYGAYGYGYGLALPAYGAPPPGP
                  240       250        260        270       280    

     270                         280        290              300   
pF1KB7 LGHKRKQPL------------------PKRVAKVPR-PPSTLL-------PTPEEQGELE
         : . .:                   : :.:  :  ::.. .       :.:   .   
CCDS30 APHPHPHPHAFAFAAAAAAAPCQLSVPPGRAAAPPPGPPTASVFAGAGSAPAPAPASGSG
          290       300       310       320       330       340    

           310       320          330        340       350         
pF1KB7 PLKGNFDWEAIFDAGTLGGELG---ALEALELSPPLS-PASHVDVDLTIHGRHIDCPATW
       :  :     :.     ::.:::   :. :  :::: .  :. . . :  .: . :  .  
CCDS30 PGPGPAGLPAF-----LGAELGCAKAFYAASLSPPAAGTAAGLPTALLRQGLKTDAGGGA
          350            360       370       380       390         

     360       370       380       390       400       410         
pF1KB7 GPSVEQAADSLDFDETFLATSFLQHPWDESGSGCLPPEPLFEAGDATLASDLQDWASVGA
       : .   :..  .:.        ..:   ..:.:  ::                       
CCDS30 GGGGAGAGQRPSFS--------IDHIMGHGGGGAAPPGAGEGSPGPPFAAAAGPGGQAQV
     400       410               420       430       440       450 

     420                                           
pF1KB7 FL                                          
                                                   
CCDS30 LAMLTAPALAPVAGHIRLSHPGDALLSSGSRFASKVAGLSGCHF
             460       470       480       490     

>>CCDS34975.1 FOXD4 gene_id:2298|Hs108|chr9               (439 aa)
 initn: 381 init1: 355 opt: 435  Z-score: 320.1  bits: 68.3 E(32554): 1.7e-11
Smith-Waterman score: 436; 30.7% identity (50.9% similar) in 342 aa overlap (88-417:76-401)

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB7 DPHGYHQVPGSAAPGSPLAADPACLGQPHTPGKPTSSCTSRSAPPGLQAPPPDDVDYATN
                                     :. :.   :   :::   :   :    : .
CCDS34 FLEQSLQPGLQVARWGGVALPREHIEGGGGPSDPSEFGTEFRAPPRSAAASED----ARQ
          50        60        70        80        90           100 

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB7 PHVKPPYSYATLICMAMQASKATKITLSAIYKWITDNFCYFRHADPTWQNSIRHNLSLNK
       : .::: :: .:: ::.  :   ..:::.:  .:.: : :.:.  :.:::::::::::: 
CCDS34 P-AKPPSSYIALITMAILQSPHKRLTLSGICAFISDRFPYYRRKFPAWQNSIRHNLSLND
              110       120       130       140       150       160

       180       190       200       210               220         
pF1KB7 CFIKVPREKDEPGKGGFWRIDPQYAERLLSGAFKKRR--------LPPVHI-HPAFARQA
       ::.:.:::  .::::..: .::   . . .:.: .::         : .:. :: :   :
CCDS34 CFVKIPREPGRPGKGNYWSLDPASQDMFDNGSFLRRRKRFQRHQPTPGAHLPHP-FPLPA
              170       180       190       200       210          

      230       240       250       260       270       280        
pF1KB7 AQEPSAVPRAGPLTVNTEAQQLLREFEEATGEAGWGAGEGRLGHKRKQPLPKRVAKVPRP
       :.     :: :::       :       . : :  ..: ::  .   .: : :   .  :
CCDS34 AHAALHNPRPGPLLGAPAPPQ------PVPG-AYPNTGPGRRPYALLHPHPPRYLLLSAP
     220       230       240              250       260       270  

      290       300       310       320       330       340        
pF1KB7 PSTLLPTPEEQGELEPLKGNFDWEAIFDAGTLGGELGALEALELSPPLSPASHVDVDLT-
         .  :   : ..:    . :   .   . .:: .  . .  . .     : .:.   . 
CCDS34 AYAGAPKKAEGADLAT-PAPFPCCSPHLVLSLGRRARVWRRHREADASLSALRVSCKGSG
            280        290       300       310       320       330 

         350       360       370       380       390       400     
pF1KB7 --IHGRHIDCPATWGPSVEQAADSLDFDETFLATSFLQHPWDESGSGCLPPEPLFEAGDA
         ..: .  ::   : ..  ..:     .:.:  .  .:  .. ..:: : .    .:  
CCDS34 ERVQGLRRVCPRPRGATAPCSSDRQAC-RTILQQQ-QRHQEEDCANGCAPTKGAVLGGHL
             340       350        360        370       380         

         410       420                                   
pF1KB7 TLASDLQDWASVGAFL                                  
       . :: :  . .:                                      
CCDS34 SAASALLRYQAVAEGSGLTSLAAPLGGEGTSPVFLVSPTPSSLAESAGPS
     390       400       410       420       430         

>>CCDS12677.1 FOXA3 gene_id:3171|Hs108|chr19              (350 aa)
 initn: 395 init1: 341 opt: 431  Z-score: 318.5  bits: 67.7 E(32554): 2e-11
Smith-Waterman score: 431; 38.8% identity (58.3% similar) in 206 aa overlap (19-214:19-210)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MAESWLRLSGAGPAEEAGPEGGLEEPDALDDSLTSLQWLQEFSILNAKAPALPPGGTDPH
                         ::.:  :  .    . ..  :. .  ::  .   ::::    
CCDS12 MLGSVKMEAHDLAEWSYYPEAG--EVYSPVTPVPTMAPLNSYMTLNPLSSPYPPGG----
               10        20          30        40        50        

               70          80        90       100       110        
pF1KB7 GYHQVPGSAAPGSPLA--ADPACLGQPHTPGKPTSSCTSRSAPPGLQAPPPDDVDYATNP
           .:.:  :..:::  :  : :: :  ::  .:. .: :   :  :: :  :     :
CCDS12 ----LPASPLPSGPLAPPAPAAPLG-PTFPGLGVSGGSSSS---GYGAPGPGLVHGKEMP
               60        70         80        90          100      

              120       130       140       150       160       170
pF1KB7 --------HVKPPYSYATLICMAMQASKATKITLSAIYKWITDNFCYFRHADPTWQNSIR
               :.:::::: .:: ::.: . .  .::: ::.:: : : :.:. .  ::::::
CCDS12 KGYRRPLAHAKPPYSYISLITMAIQQAPGKMLTLSEIYQWIMDLFPYYRENQQRWQNSIR
        110       120       130       140       150       160      

              180       190       200       210       220       230
pF1KB7 HNLSLNKCFIKVPREKDEPGKGGFWRIDPQYAERLLSGAFKKRRLPPVHIHPAFARQAAQ
       :.::.: ::.:: :  :.::::..: . :. .. . .: . .:.                
CCDS12 HSLSFNDCFVKVARSPDKPGKGSYWALHPSSGNMFENGCYLRRQKRFKLEEKVKKGGSGA
        170       180       190       200       210       220      

              240       250       260       270       280       290
pF1KB7 EPSAVPRAGPLTVNTEAQQLLREFEEATGEAGWGAGEGRLGHKRKQPLPKRVAKVPRPPS
                                                                   
CCDS12 ATTTRNGTGSAASTTTPAATVTSPPQPPPPAPEPEAQGGEDVGALDCGSPASSTPYFTGL
        230       240       250       260       270       280      

>>CCDS13192.1 FOXS1 gene_id:2307|Hs108|chr20              (330 aa)
 initn: 411 init1: 388 opt: 430  Z-score: 318.1  bits: 67.5 E(32554): 2.1e-11
Smith-Waterman score: 430; 35.9% identity (55.5% similar) in 256 aa overlap (105-342:3-244)

           80        90       100       110       120       130    
pF1KB7 LAADPACLGQPHTPGKPTSSCTSRSAPPGLQAPPPDDVDYATNPHVKPPYSYATLICMAM
                                     : : :     .:.: .:::::: .:: ::.
CCDS13                             MQQQPLPGPGAPTTEP-TKPPYSYIALIAMAI
                                           10         20        30 

          140       150       160       170       180       190    
pF1KB7 QASKATKITLSAIYKWITDNFCYFRHADPTWQNSIRHNLSLNKCFIKVPREKDEPGKGGF
       :.: . . :::.::..:   : ..::  : ::::::::::::.::.::::.  .::::..
CCDS13 QSSPGQRATLSGIYRYIMGRFAFYRHNRPGWQNSIRHNLSLNECFVKVPRDDRKPGKGSY
              40        50        60        70        80        90 

          200       210       220       230          240       250 
pF1KB7 WRIDPQYAERLLSGAFKKRRLPPVHIHPAFARQAAQEPSAVP---RAGPLTVNTEAQQLL
       : .::.  . .  :.: .::         :.::.. : .  :   : ::: ....   . 
CCDS13 WTLDPDCHDMFEHGSFLRRRR-------RFTRQTGAEGTRGPAKARRGPLRATSQDPGVP
             100       110              120       130       140    

                     260       270       280           290         
pF1KB7 -----REFE---EATGEAGWGAGEGRLGHKRKQPLPKRVAKVPRPP----STLLPTPEEQ
            :.     :     : . : : .:    .  :  .   ::::        : :   
CCDS13 NATTGRQCSFPPELPDPKGLSFG-GLVGAMPASMCPATTDGRPRPPMEPKEISTPKPACP
          150       160        170       180       190       200   

     300       310        320       330         340       350      
pF1KB7 GELEPLKGNFDWEAI-FDAGTLGGELGALEALELSP-P-LSPASHVDVDLTIHGRHIDCP
       :::    .. .  :. : ::     ..  :... .: : ::: : .              
CCDS13 GELPVATSSSSCPAFGFPAG-----FSEAESFNKAPTPVLSPESGIGSSYQCRLQALNFC
           210       220            230       240       250        

        360       370       380       390       400       410      
pF1KB7 ATWGPSVEQAADSLDFDETFLATSFLQHPWDESGSGCLPPEPLFEAGDATLASDLQDWAS
                                                                   
CCDS13 MGADPGLEHLLASAAPSPAPPTPPGSLRAPLPLPTDHKEPWVAGGFPVQGGSGYPLGLTP
      260       270       280       290       300       310        

>>CCDS550.1 FOXE3 gene_id:2301|Hs108|chr1                 (319 aa)
 initn: 373 init1: 373 opt: 422  Z-score: 312.7  bits: 66.5 E(32554): 4.2e-11
Smith-Waterman score: 422; 37.6% identity (61.4% similar) in 189 aa overlap (53-238:9-189)

             30        40        50        60        70        80  
pF1KB7 LEEPDALDDSLTSLQWLQEFSILNAKAPALPPGGTDPHGYHQVPGSAAPGSPLAADPACL
                                     ::.. .  :.  .:. :  : :    :. :
CCDS55                       MAGRSDMDPPAAFS--GFPALPAVAPSGPP----PSPL
                                     10          20            30  

             90        100       110       120       130       140 
pF1KB7 GQPHTPGK-PTSSCTSRSAPPGLQAPPPDDVDYATNPHVKPPYSYATLICMAMQASKATK
       .  . ::. :  . ..:.      :: :         . :::::: .:: ::.  . . .
CCDS55 AGAE-PGREPEEAAAGRGEAAPTPAPGPGRRRRRPLQRGKPPYSYIALIAMALAHAPGRR
              40        50        60        70        80        90 

             150       160       170       180       190       200 
pF1KB7 ITLSAIYKWITDNFCYFRHADPTWQNSIRHNLSLNKCFIKVPREKDEPGKGGFWRIDPQY
       .::.:::..::. : ..: .   :::::::::.:: ::.:::::  .::::..: .::  
CCDS55 LTLAAIYRFITERFAFYRDSPRKWQNSIRHNLTLNDCFVKVPREPGNPGKGNYWTLDPAA
             100       110       120       130       140       150 

             210         220       230       240       250         
pF1KB7 AERLLSGAF--KKRRLPPVHIHPAFARQAAQEPSAVPRAGPLTVNTEAQQLLREFEEATG
       :. . .:.:  ...:.  ... :: :  :   :   : :                     
CCDS55 ADMFDNGSFLRRRKRFKRAEL-PAHAAAAPGPPLPFPYAPYAPAPGPALLVPPPSAGPGP
             160       170        180       190       200       210

     260       270       280       290       300       310         
pF1KB7 EAGWGAGEGRLGHKRKQPLPKRVAKVPRPPSTLLPTPEEQGELEPLKGNFDWEAIFDAGT
                                                                   
CCDS55 SPPARLFSVDSLVNLQPELAGLGAPEPPCCAAPDAAAAAFPPCAAAASPPLYSQVPDRLV
              220       230       240       250       260       270

>>CCDS4372.1 FOXI1 gene_id:2299|Hs108|chr5                (378 aa)
 initn: 369 init1: 347 opt: 421  Z-score: 311.1  bits: 66.4 E(32554): 5.2e-11
Smith-Waterman score: 421; 31.5% identity (58.5% similar) in 241 aa overlap (19-251:19-252)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MAESWLRLSGAGPAEEAGPEGGLEEPDALDDSLTSLQWLQEFSILNAKAPALPPGGTDPH
                         :  : : :.    .:   ....  .. . . :..  ::   .
CCDS43 MSSFDLPAPSPPRCSPQFPSIGQEPPEM---NLYYENFFHPQGVPSPQRPSFEGGGE--Y
               10        20           30        40        50       

               70        80        90       100       110          
pF1KB7 GYHQVPGSAAPGSPLAADPACLGQPHTPGKPTSSCTSRSAPPGLQAPPPDDVDYATNPH-
       :    :     :  ..  :   :   .:  : .  ..:   :....   .:. .   :  
CCDS43 GATPNPYLWFNGPTMTPPPYLPGPNASPFLPQAYGVQRPLLPSVSGLGGSDLGWLPIPSQ
          60        70        80        90       100       110     

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB7 ------VKPPYSYATLICMAMQASKATKITLSAIYKWITDNFCYFRHADPTWQNSIRHNL
             :.:::::..:: ::....   ..::: ::....::: .. ..   :::::::::
CCDS43 EELMKLVRPPYSYSALIAMAIHGAPDKRLTLSQIYQYVADNFPFYNKSKAGWQNSIRHNL
         120       130       140       150       160       170     

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB7 SLNKCFIKVPREKDEPGKGGFWRIDPQYAERLLSGAFKKRRLPPVHIHPAFARQAAQEP-
       ::: :: ::::..:.::::..: .::.  . . .: :...:     .  . :  : ..  
CCDS43 SLNDCFKKVPRDEDDPGKGNYWTLDPNCEKMFDNGNFRRKRKRKSDVSSSTASLALEKTE
         180       190       200       210       220       230     

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB7 SAVPRAGPLTVNTEAQQLLREFEEATGEAGWGAGEGRLGHKRKQPLPKRVAKVPRPPSTL
       :..:  .: :  :: :..:                                         
CCDS43 SSLPVDSPKT--TEPQDILDGASPGGTTSSPEKRPSPPPSGAPCLNSFLSSMTAYVSGGS
         240         250       260       270       280       290   

>>CCDS2117.1 FOXD4L1 gene_id:200350|Hs108|chr2            (408 aa)
 initn: 433 init1: 354 opt: 416  Z-score: 307.2  bits: 65.8 E(32554): 8.6e-11
Smith-Waterman score: 418; 36.2% identity (51.0% similar) in 243 aa overlap (88-312:79-308)

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB7 DPHGYHQVPGSAAPGSPLAADPACLGQPHTPGKPTSSCTSRSAPPGLQAPPPDDVDYATN
                                     :. :.   :   :::   :   :    : .
CCDS21 KFLEQSLQPGLQVARWGGVALPREHIEGGGPSDPSEFGTEFRAPPRSAAASED----ARQ
       50        60        70        80        90       100        

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB7 PHVKPPYSYATLICMAMQASKATKITLSAIYKWITDNFCYFRHADPTWQNSIRHNLSLNK
       : .:::::: .:: ::.  :   ..:::.:  .:.  : :.:.  :.:::::::::::: 
CCDS21 P-AKPPYSYIALITMAILQSPHKRLTLSGICAFISGRFPYYRRKFPAWQNSIRHNLSLND
           110       120       130       140       150       160   

       180       190       200       210               220         
pF1KB7 CFIKVPREKDEPGKGGFWRIDPQYAERLLSGAFKKRR--------LPPVHI-HPAFARQA
       ::.:.:::  .:::: .: .::   . . .:.: .::         : .:. :: :   :
CCDS21 CFVKIPREPGHPGKGTYWSLDPASQDMFDNGSFLRRRKRFKRHQLTPGAHLPHP-FPLPA
           170       180       190       200       210        220  

      230       240       250       260       270       280        
pF1KB7 AQEPSAVPRAGPLTVNTEAQQLLREFEEATGEAGWGAGEGRLGHKRKQPLPKRVAKVPRP
       :.     :: :::       :       . : :  ... ::  .   .: : :   .  :
CCDS21 AHAALHNPRPGPLLGAPALPQ------PVPG-AYPNTAPGRRPYALLHPHPPRYLLLSAP
            230       240              250       260       270     

      290                300       310       320       330         
pF1KB7 PSTLLP---------TPEEQGELEPLKGNFDWEAIFDAGTLGGELGALEALELSPPLSPA
         .  :         ::     :.:  :   ::                           
CCDS21 AYAGAPKKAEGADLATPGTLPVLQPSLGPQPWEEGKGLASPPGGGCISFSIESIMQGVRG
         280       290       300       310       320       330     

     340       350       360       370       380       390         
pF1KB7 SHVDVDLTIHGRHIDCPATWGPSVEQAADSLDFDETFLATSFLQHPWDESGSGCLPPEPL
                                                                   
CCDS21 AGTGAAQSLSPTAWSYCPLLQRPSSLSDNFAATAAASGGGLRQRLRSHQGRGAGRAPVGR
         340       350       360       370       380       390     




421 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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