seq1 = pF1KB7542.tfa, 774 bp
seq2 = pF1KB7542/gi568815581r_48830478.tfa (gi568815581r:48830478_49044734), 214257 bp

>pF1KB7542 774
>gi568815581r:48830478_49044734 (Chr17)

(complement)

1-54  (100001-100054)   100% ->
55-105  (100760-100810)   100% ->
106-244  (103673-103811)   100% ->
245-349  (107611-107715)   100% ->
350-422  (108493-108565)   100% ->
423-564  (111389-111530)   100% ->
565-639  (113018-113092)   100% ->
640-774  (114123-114257)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCACCGCCGCGGGGTGGGAGCTGGCGCCATCGCCAAGAAGAAACTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCACCGCCGCGGGGTGGGAGCTGGCGCCATCGCCAAGAAGAAACTTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAG         GCCAAGTATAAGGAGCGAGGGACGGTCTTGGCTGAGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGAGGTG...CAGGCCAAGTATAAGGAGCGAGGGACGGTCTTGGCTGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACCAGCTAGCCCAG         ATGTCAAAGCAGTTGGACATGTTCAAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100797 ACCAGCTAGCCCAGGTA...CAGATGTCAAAGCAGTTGGACATGTTCAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 ACCAACCTGGAGGAATTTGCCAGCAAACACAAGCAGGAGATCCGGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103700 ACCAACCTGGAGGAATTTGCCAGCAAACACAAGCAGGAGATCCGGAAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TCCTGAGTTCCGTGTGCAGTTCCAGGACATGTGTGCAACCATTGGCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103750 TCCTGAGTTCCGTGTGCAGTTCCAGGACATGTGTGCAACCATTGGCGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATCCGCTGGCCT         CTGGAAAAGGATTTTGGTCTGAGATGCTG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 103800 ATCCGCTGGCCTGTA...TAGCTGGAAAAGGATTTTGGTCTGAGATGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GGCGTGGGGGACTTCTATTACGAACTAGGTGTCCAAATTATCGAAGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107640 GGCGTGGGGGACTTCTATTACGAACTAGGTGTCCAAATTATCGAAGTGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCTGGCGCTGAAGCATCGGAATGGAG         GTCTGATAACTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 107690 CCTGGCGCTGAAGCATCGGAATGGAGGTG...CAGGTCTGATAACTTTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AGGAACTACATCAACAGGTGTTGAAGGGAAGGGGCAAGTTCGCCCAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108508 AGGAACTACATCAACAGGTGTTGAAGGGAAGGGGCAAGTTCGCCCAGGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GTCAGTCA         AGATGACCTGATCAGAGCCATCAAGAAACTAAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 108558 GTCAGTCAGTA...CAGAGATGACCTGATCAGAGCCATCAAGAAACTAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GGCACTTGGCACTGGCTTCGGCATCATCCCTGTGGGCGGCACTTACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111422 GGCACTTGGCACTGGCTTCGGCATCATCCCTGTGGGCGGCACTTACCTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TTCAGTCTGTTCCAGCTGAGCTCAATATGGATCACACCGTGGTGCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111472 TTCAGTCTGTTCCAGCTGAGCTCAATATGGATCACACCGTGGTGCTGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CTGGCAGAG         AAGAATGGCTACGTGACTGTCAGTGAGATCAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 111522 CTGGCAGAGGTA...CAGAAGAATGGCTACGTGACTGTCAGTGAGATCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 AGCCAGTCTTAAATGGGAGACCGAGCGAGCGCGGCAAGTGCTG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 113050 AGCCAGTCTTAAATGGGAGACCGAGCGAGCGCGGCAAGTGCTGGTA...C

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    640   GAACACCTGCTGAAGGAAGGGTTGGCGTGGCTGGACTTACAGGCCCCA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114121 AGGAACACCTGCTGAAGGAAGGGTTGGCGTGGCTGGACTTACAGGCCCCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GGGGAGGCCCACTACTGGCTGCCAGCTCTCTTCACTGACCTCTACTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114171 GGGGAGGCCCACTACTGGCTGCCAGCTCTCTTCACTGACCTCTACTCCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .
    738 GGAGATTACAGCTGAGGAGGCCAGAGAAGCCCTCCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114221 GGAGATTACAGCTGAGGAGGCCAGAGAAGCCCTCCCC