Result of FASTA (ccds) for pF1KB7293
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7293, 1030 aa
  1>>>pF1KB7293 1030 - 1030 aa - 1030 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0323+/-0.00106; mu= 16.9702+/- 0.063
 mean_var=67.0533+/-13.355, 0's: 0 Z-trim(103.0): 34  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.156626
 statistics sampled from 7185 (7212) to 7185 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.581), E-opt: 0.2 (0.222), width:  16
 Scan time:  3.930

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS10770.1 SLC12A3 gene_id:6559|Hs108|chr16       (1030) 6894 1567.5       0
CCDS45491.1 SLC12A3 gene_id:6559|Hs108|chr16       (1029) 6875 1563.2       0
CCDS58464.1 SLC12A3 gene_id:6559|Hs108|chr16       (1021) 5393 1228.4       0
CCDS10129.2 SLC12A1 gene_id:6557|Hs108|chr15       (1099) 2854 654.6 3.2e-187
CCDS53940.1 SLC12A1 gene_id:6557|Hs108|chr15       (1099) 2847 653.1 9.5e-187
CCDS4144.1 SLC12A2 gene_id:6558|Hs108|chr5         (1212) 2755 632.3 1.9e-180
CCDS58965.1 SLC12A2 gene_id:6558|Hs108|chr5        (1196) 2748 630.7 5.6e-180
CCDS42012.1 SLC12A6 gene_id:9990|Hs108|chr15       (1091)  587 142.4   5e-33
CCDS10036.1 SLC12A6 gene_id:9990|Hs108|chr15       (1099)  587 142.4 5.1e-33
CCDS42010.1 SLC12A6 gene_id:9990|Hs108|chr15       (1135)  587 142.4 5.2e-33
CCDS42011.1 SLC12A6 gene_id:9990|Hs108|chr15       (1141)  587 142.4 5.3e-33
CCDS58352.1 SLC12A6 gene_id:9990|Hs108|chr15       (1150)  587 142.4 5.3e-33
CCDS54031.1 SLC12A4 gene_id:6560|Hs108|chr16       (1054)  577 140.1 2.3e-32
CCDS54030.1 SLC12A4 gene_id:6560|Hs108|chr16       (1079)  577 140.1 2.4e-32
CCDS10855.1 SLC12A4 gene_id:6560|Hs108|chr16       (1085)  577 140.1 2.4e-32
CCDS54032.1 SLC12A4 gene_id:6560|Hs108|chr16       (1087)  577 140.1 2.4e-32
CCDS13391.1 SLC12A5 gene_id:57468|Hs108|chr20      (1116)  565 137.4 1.6e-31
CCDS46610.1 SLC12A5 gene_id:57468|Hs108|chr20      (1139)  565 137.4 1.6e-31
CCDS5707.1 SLC12A9 gene_id:56996|Hs108|chr7        ( 914)  496 121.8 6.6e-27
CCDS59068.1 SLC12A9 gene_id:56996|Hs108|chr7       ( 631)  438 108.7 4.1e-23
CCDS59069.1 SLC12A9 gene_id:56996|Hs108|chr7       ( 538)  435 108.0 5.7e-23
CCDS43143.1 SLC12A8 gene_id:84561|Hs108|chr3       ( 714)  401 100.3 1.5e-20
CCDS34129.1 SLC12A7 gene_id:10723|Hs108|chr5       (1083)  364 92.0 7.4e-18


>>CCDS10770.1 SLC12A3 gene_id:6559|Hs108|chr16            (1030 aa)
 initn: 6894 init1: 6894 opt: 6894  Z-score: 8408.9  bits: 1567.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6894; 100.0% identity (100.0% similar) in 1030 aa overlap (1-1030:1-1030)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MAELPTTETPGDATLCSGRFTISTLLSSDEPSPPAAYDSSHPSHLTHSSTFCMRTFGYNT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MAELPTTETPGDATLCSGRFTISTLLSSDEPSPPAAYDSSHPSHLTHSSTFCMRTFGYNT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 IDVVPTYEHYANSTQPGEPRKVRPTLADLHSFLKQEGRHLHALAFDSRPSHEMTDGLVEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IDVVPTYEHYANSTQPGEPRKVRPTLADLHSFLKQEGRHLHALAFDSRPSHEMTDGLVEG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 EAGTSSEKNPEEPVRFGWVKGVMIRCMLNIWGVILYLRLPWITAQAGIVLTWIIILLSVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EAGTSSEKNPEEPVRFGWVKGVMIRCMLNIWGVILYLRLPWITAQAGIVLTWIIILLSVT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 VTSITGLSISAISTNGKVKSGGTYFLISRSLGPELGGSIGLIFAFANAVGVAMHTVGFAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VTSITGLSISAISTNGKVKSGGTYFLISRSLGPELGGSIGLIFAFANAVGVAMHTVGFAE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 TVRDLLQEYGAPIVDPINDIRIIAVVSVTVLLAISLAGMEWESKAQVLFFLVIMVSFANY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TVRDLLQEYGAPIVDPINDIRIIAVVSVTVLLAISLAGMEWESKAQVLFFLVIMVSFANY
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 LVGTLIPPSEDKASKGFFSYRADIFVQNLVPDWRGPDGTFFGMFSIFFPSATGILAGANI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LVGTLIPPSEDKASKGFFSYRADIFVQNLVPDWRGPDGTFFGMFSIFFPSATGILAGANI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 SGDLKDPAIAIPKGTLMAIFWTTISYLAISATIGSCVVRDASGVLNDTVTPGWGACEGLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SGDLKDPAIAIPKGTLMAIFWTTISYLAISATIGSCVVRDASGVLNDTVTPGWGACEGLA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 CSYGWNFTECTQQHSCHYGLINYYQTMSMVSGFAPLITAGIFGATLSSALACLVSAAKVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CSYGWNFTECTQQHSCHYGLINYYQTMSMVSGFAPLITAGIFGATLSSALACLVSAAKVF
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 QCLCEDQLYPLIGFFGKGYGKNKEPVRGYLLAYAIAVAFIIIAELNTIAPIISNFFLCSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QCLCEDQLYPLIGFFGKGYGKNKEPVRGYLLAYAIAVAFIIIAELNTIAPIISNFFLCSY
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB7 ALINFSCFHASITNSPGWRPSFQYYNKWAALFGAIISVVIMFLLTWWAALIAIGVVLFLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ALINFSCFHASITNSPGWRPSFQYYNKWAALFGAIISVVIMFLLTWWAALIAIGVVLFLL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB7 LYVIYKKPEVNWGSSVQAGSYNLALSYSVGLNEVEDHIKNYRPQCLVLTGPPNFRPALVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LYVIYKKPEVNWGSSVQAGSYNLALSYSVGLNEVEDHIKNYRPQCLVLTGPPNFRPALVD
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB7 FVGTFTRNLSLMICGHVLIGPHKQRMPELQLIANGHTKWLNKRKIKAFYSDVIAEDLRRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FVGTFTRNLSLMICGHVLIGPHKQRMPELQLIANGHTKWLNKRKIKAFYSDVIAEDLRRG
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB7 VQILMQAAGLGRMKPNILVVGFKKNWQSAHPATVEDYIGILHDAFDFNYGVCVMRMREGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VQILMQAAGLGRMKPNILVVGFKKNWQSAHPATVEDYIGILHDAFDFNYGVCVMRMREGL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB7 NVSKMMQAHINPVFDPAEDGKEASARGARPSVSGALDPKALVKEEQATTIFQSEQGKKTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NVSKMMQAHINPVFDPAEDGKEASARGARPSVSGALDPKALVKEEQATTIFQSEQGKKTI
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB7 DIYWLFDDGGLTLLIPYLLGRKRRWSKCKIRVFVGGQINRMDQERKAIISLLSKFRLGFH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DIYWLFDDGGLTLLIPYLLGRKRRWSKCKIRVFVGGQINRMDQERKAIISLLSKFRLGFH
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB7 EVHILPDINQNPRAEHTKRFEDMIAPFRLNDGFKDEATVNEMRRDCPWKISDEEITKNRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EVHILPDINQNPRAEHTKRFEDMIAPFRLNDGFKDEATVNEMRRDCPWKISDEEITKNRV
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB7 KSLRQVRLNEIVLDYSRDAALIVITLPIGRKGKCPSSLYMAWLETLSQDLRPPVILIRGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KSLRQVRLNEIVLDYSRDAALIVITLPIGRKGKCPSSLYMAWLETLSQDLRPPVILIRGN
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030
pF1KB7 QENVLTFYCQ
       ::::::::::
CCDS10 QENVLTFYCQ
             1030

>>CCDS45491.1 SLC12A3 gene_id:6559|Hs108|chr16            (1029 aa)
 initn: 6252 init1: 6252 opt: 6875  Z-score: 8385.7  bits: 1563.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6875; 99.9% identity (99.9% similar) in 1030 aa overlap (1-1030:1-1029)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MAELPTTETPGDATLCSGRFTISTLLSSDEPSPPAAYDSSHPSHLTHSSTFCMRTFGYNT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MAELPTTETPGDATLCSGRFTISTLLSSDEPSPPAAYDSSHPSHLTHSSTFCMRTFGYNT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 IDVVPTYEHYANSTQPGEPRKVRPTLADLHSFLKQEGRHLHALAFDSRPSHEMTDGLVEG
       :::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IDVVPTYEHYANSTQPGEPRKVRPTLADLHSFLK-EGRHLHALAFDSRPSHEMTDGLVEG
               70        80        90        100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 EAGTSSEKNPEEPVRFGWVKGVMIRCMLNIWGVILYLRLPWITAQAGIVLTWIIILLSVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EAGTSSEKNPEEPVRFGWVKGVMIRCMLNIWGVILYLRLPWITAQAGIVLTWIIILLSVT
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 VTSITGLSISAISTNGKVKSGGTYFLISRSLGPELGGSIGLIFAFANAVGVAMHTVGFAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VTSITGLSISAISTNGKVKSGGTYFLISRSLGPELGGSIGLIFAFANAVGVAMHTVGFAE
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 TVRDLLQEYGAPIVDPINDIRIIAVVSVTVLLAISLAGMEWESKAQVLFFLVIMVSFANY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TVRDLLQEYGAPIVDPINDIRIIAVVSVTVLLAISLAGMEWESKAQVLFFLVIMVSFANY
     240       250       260       270       280       290         

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 LVGTLIPPSEDKASKGFFSYRADIFVQNLVPDWRGPDGTFFGMFSIFFPSATGILAGANI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LVGTLIPPSEDKASKGFFSYRADIFVQNLVPDWRGPDGTFFGMFSIFFPSATGILAGANI
     300       310       320       330       340       350         

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 SGDLKDPAIAIPKGTLMAIFWTTISYLAISATIGSCVVRDASGVLNDTVTPGWGACEGLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SGDLKDPAIAIPKGTLMAIFWTTISYLAISATIGSCVVRDASGVLNDTVTPGWGACEGLA
     360       370       380       390       400       410         

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 CSYGWNFTECTQQHSCHYGLINYYQTMSMVSGFAPLITAGIFGATLSSALACLVSAAKVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CSYGWNFTECTQQHSCHYGLINYYQTMSMVSGFAPLITAGIFGATLSSALACLVSAAKVF
     420       430       440       450       460       470         

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 QCLCEDQLYPLIGFFGKGYGKNKEPVRGYLLAYAIAVAFIIIAELNTIAPIISNFFLCSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QCLCEDQLYPLIGFFGKGYGKNKEPVRGYLLAYAIAVAFIIIAELNTIAPIISNFFLCSY
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       ::::::::::
CCDS45 QENVLTFYCQ
    1020         

>>CCDS58464.1 SLC12A3 gene_id:6559|Hs108|chr16            (1021 aa)
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Smith-Waterman score: 6804; 99.0% identity (99.1% similar) in 1030 aa overlap (1-1030:1-1021)

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CSYGWNFTECTQQHSCHYGLINYYQTMSMVSGFAPLITAGIFGATLSSALACLVSAAKVF
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CCDS58 FVGTFTRNLSLMICGHVLIGPHKQRMPELQLIANGHTKWLNKRKIKAFYSDVIAEDLRRG
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CCDS58 VQILMQAAGLGRMKPNILVVGFKKNWQSAHPATVEDYIGILHDAFDFNYGVCVMRMREGL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DIYWLFDDGGLTLLIPYLLGRKRRWSKCKIRVFVGGQINRMDQERKAIISLLSKFRLGFH
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pF1KB7 EVHILPDINQNPRAEHTKRFEDMIAPFRLNDGFKDEATVNEMRRDCPWKISDEEITKNRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EVHILPDINQNPRAEHTKRFEDMIAPFRLNDGFKDEATVNEMRRDCPWKISDEEITKNRV
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pF1KB7 KSLRQVRLNEIVLDYSRDAALIVITLPIGRKGKCPSSLYMAWLETLSQDLRPPVILIRGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KSLRQVRLNEIVLDYSRDAALIVITLPIGRKGKCPSSLYMAWLETLSQDLRPPVILIRGN
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pF1KB7 QENVLTFYCQ
       ::::::::::
CCDS58 QENVLTFYCQ
            1020 

>>CCDS10129.2 SLC12A1 gene_id:6557|Hs108|chr15            (1099 aa)
 initn: 3116 init1: 1465 opt: 2854  Z-score: 3474.8  bits: 654.6 E(32554): 3.2e-187
Smith-Waterman score: 3567; 51.5% identity (78.2% similar) in 1052 aa overlap (10-1028:64-1098)

                                    10        20        30         
pF1KB7                      MAELPTTETPGDATLCSGRFTISTLLSSDEPSPPAAYDS
                                     ::.   :   :     :.: :    :  :.
CCDS10 AAADDNTDPPHYEETSFGDEAQKRLRISFRPGNQE-CYDNF-----LQSGET---AKTDA
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      40        50        60        70        80        90         
pF1KB7 SHPSHLTHSSTFCMRTFGYNTIDVVPTYEHYANSTQPGEPRKVRPTLADLHSFLKQEGRH
       :  .. .:..:. ..:::.::.:.::  :.: :. . . :.  ::.: ..:   .: ...
CCDS10 SFHAYDSHTNTYYLQTFGHNTMDAVPKIEYYRNTGSISGPKVNRPSLLEIH---EQLAKN
           90       100       110       120       130          140 

     100       110       120       130       140       150         
pF1KB7 LHALAFDSRPSHEMTDGLVEGEAGTSSEKNPEEPVRFGWVKGVMIRCMLNIWGVILYLRL
       . :.. .:       ::.   : . ..: .    :.:::::::..:::::::::.:..::
CCDS10 V-AVTPSSADRVANGDGIPGDEQAENKEDDQAGVVKFGWVKGVLVRCMLNIWGVMLFIRL
              150       160       170       180       190       200

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pF1KB7 PWITAQAGIVLTWIIILLSVTVTSITGLSISAISTNGKVKSGGTYFLISRSLGPELGGSI
        ::...::: :  .:::::. :::::::: :::.::: :..::.:.:::::::::.::::
CCDS10 SWIVGEAGIGLGVLIILLSTMVTSITGLSTSAIATNGFVRGGGAYYLISRSLGPEFGGSI
              210       220       230       240       250       260

     220       230       240       250       260       270         
pF1KB7 GLIFAFANAVGVAMHTVGFAETVRDLLQEYGAPIVDPINDIRIIAVVSVTVLLAISLAGM
       ::::::::::.:::..::::::: :::.:  . .::: ::::::. ..:..::.::.:::
CCDS10 GLIFAFANAVAVAMYVVGFAETVVDLLKESDSMMVDPTNDIRIIGSITVVILLGISVAGM
              270       280       290       300       310       320

     280       290       300       310       320       330         
pF1KB7 EWESKAQVLFFLVIMVSFANYLVGTLIPPSEDKASKGFFSYRADIFVQNLVPDWRGPDGT
       :::.::::..........::...::.:: ...: :.:::.:.:.::..:. : .   .: 
CCDS10 EWEAKAQVILLVILLIAIANFFIGTVIPSNNEKKSRGFFNYQASIFAENFGPRFTKGEG-
              330       340       350       360       370          

     340       350       360       370       380       390         
pF1KB7 FFGMFSIFFPSATGILAGANISGDLKDPAIAIPKGTLMAIFWTTISYLAISATIGSCVVR
       ::..:.::::.::::::::::::::.::  :::.::..::: ::..::...  .:.::::
CCDS10 FFSVFAIFFPAATGILAGANISGDLEDPQDAIPRGTMLAIFITTVAYLGVAICVGACVVR
     380       390       400       410       420       430         

     400       410        420       430       440       450        
pF1KB7 DASGVLNDTVTPGWGACEG-LACSYGWNFTECTQQHSCHYGLINYYQTMSMVSGFAPLIT
       ::.: .:::.  : . :.:  ::. :..:..: ... :.:::.: .:.:::::::.::::
CCDS10 DATGNMNDTIISGMN-CNGSAACGLGYDFSRC-RHEPCQYGLMNNFQVMSMVSGFGPLIT
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pF1KB7 AGIFGATLSSALACLVSAAKVFQCLCEDQLYPLIGFFGKGYGKNKEPVRGYLLAYAIAVA
       ::::.:::::::: :::: :::: ::.:..:  . ::.::::::.::.:::.:.. ::.:
CCDS10 AGIFSATLSSALASLVSAPKVFQALCKDNIYKALQFFAKGYGKNNEPLRGYILTFLIAMA
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pF1KB7 FIIIAELNTIAPIISNFFLCSYALINFSCFHASITNSPGWRPSFQYYNKWAALFGAIISV
       ::.:::::::::::::::: ::::::::::::: ..::::::..  :: :..::::..  
CCDS10 FILIAELNTIAPIISNFFLASYALINFSCFHASYAKSPGWRPAYGIYNMWVSLFGAVLCC
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pF1KB7 VIMFLLTWWAALIAIGVVLFLLLYVIYKKPEVNWGSSVQAGSYNLALSYSVGLNEVEDHI
       ..::...::::.:.  . .:: .::  :::.::::::.:: ::  ::. .. :. ::::.
CCDS10 AVMFVINWWAAVITYVIEFFLYVYVTCKKPDVNWGSSTQALSYVSALDNALELTTVEDHV
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pF1KB7 KNYRPQCLVLTGPPNFRPALVDFVGTFTRNLSLMICGHVLIGPHKQRMPELQLIANGHTK
       ::.::::.:::: :  ::::.:.. .::.: .: :: .:..::.:  . :..     .  
CCDS10 KNFRPQCIVLTGGPMTRPALLDITHAFTKNSGLCICCEVFVGPRKLCVKEMNSGMAKKQA
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pF1KB7 WLNKRKIKAFYSDVIAEDLRRGVQILMQAAGLGRMKPNILVVGFKKNWQSAHPATVEDYI
       :: : ::::::. : :. .: ::. :.::.:::::::: ::.:.::::..:  . .:.:.
CCDS10 WLIKNKIKAFYAAVAADCFRDGVRSLLQASGLGRMKPNTLVIGYKKNWRKAPLTEIENYV
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pF1KB7 GILHDAFDFNYGVCVMRMREGLNVSKMMQAH------------INPVFDPAEDGKEASA-
       ::.::::::. :: ..:. .:...:...:..            .. ..   :  .:... 
CCDS10 GIIHDAFDFEIGVVIVRISQGFDISQVLQVQEELERLEQERLALEATIKDNECEEESGGI
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pF1KB7 RG------------ARPSVSGALDPKALV-------KEEQATTIFQSEQGKKTIDIYWLF
       ::            . :. .:... .  .       :  .:.: :...: : :::..:::
CCDS10 RGLFKKAGKLNITKTTPKKDGSINTSQSMHVGEFNQKLVEASTQFKKKQEKGTIDVWWLF
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pF1KB7 DDGGLTLLIPYLLGRKRRWSKCKIRVFVGGQINRMDQERKAIISLLSKFRLGFHEVHILP
       :::::::::::.:  ...:. ::.:..:::.:::...:. .. :::::::. : ..::. 
CCDS10 DDGGLTLLIPYILTLRKKWKDCKLRIYVGGKINRIEEEKIVMASLLSKFRIKFADIHIIG
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pF1KB7 DINQNPRAEHTKRFEDMIAPFRLNDGFKDEATVNEMRRDCPWKISDEEITKNRVKSLRQV
       :::  :  :  : ::.:: :.::... :: .:.....:. ::::.: :.   . :: :::
CCDS10 DINIRPNKESWKVFEEMIEPYRLHESCKDLTTAEKLKRETPWKITDAELEAVKEKSYRQV
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pF1KB7 RLNEIVLDYSRDAALIVITLPIGRKGKCPSSLYMAWLETLSQDLRPPVILIRGNQENVLT
       ::::.. ..:: : :::..::..:::.  . ::::::: :...: :::.:.:::..::::
CCDS10 RLNELLQEHSRAANLIVLSLPVARKGSISDLLYMAWLEILTKNL-PPVLLVRGNHKNVLT
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       1030
pF1KB7 FYCQ
       ::  
CCDS10 FYS 
           

>>CCDS53940.1 SLC12A1 gene_id:6557|Hs108|chr15            (1099 aa)
 initn: 3109 init1: 1465 opt: 2847  Z-score: 3466.2  bits: 653.1 E(32554): 9.5e-187
Smith-Waterman score: 3560; 51.3% identity (78.2% similar) in 1052 aa overlap (10-1028:64-1098)

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pF1KB7                      MAELPTTETPGDATLCSGRFTISTLLSSDEPSPPAAYDS
                                     ::.   :   :     :.: :    :  :.
CCDS53 AAADDNTDPPHYEETSFGDEAQKRLRISFRPGNQE-CYDNF-----LQSGET---AKTDA
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pF1KB7 SHPSHLTHSSTFCMRTFGYNTIDVVPTYEHYANSTQPGEPRKVRPTLADLHSFLKQEGRH
       :  .. .:..:. ..:::.::.:.::  :.: :. . . :.  ::.: ..:   .: ...
CCDS53 SFHAYDSHTNTYYLQTFGHNTMDAVPKIEYYRNTGSISGPKVNRPSLLEIH---EQLAKN
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pF1KB7 LHALAFDSRPSHEMTDGLVEGEAGTSSEKNPEEPVRFGWVKGVMIRCMLNIWGVILYLRL
       . :.. .:       ::.   : . ..: .    :.:::::::..:::::::::.:..::
CCDS53 V-AVTPSSADRVANGDGIPGDEQAENKEDDQAGVVKFGWVKGVLVRCMLNIWGVMLFIRL
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pF1KB7 PWITAQAGIVLTWIIILLSVTVTSITGLSISAISTNGKVKSGGTYFLISRSLGPELGGSI
        ::...::: :  ::: :::.::..::.:.::: ::: :..::.:.:::::::::.::::
CCDS53 SWIVGEAGIGLGVIIIGLSVVVTTLTGISMSAICTNGVVRGGGAYYLISRSLGPEFGGSI
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     220       230       240       250       260       270         
pF1KB7 GLIFAFANAVGVAMHTVGFAETVRDLLQEYGAPIVDPINDIRIIAVVSVTVLLAISLAGM
       ::::::::::.:::..::::::: :::.:  . .::: ::::::. ..:..::.::.:::
CCDS53 GLIFAFANAVAVAMYVVGFAETVVDLLKESDSMMVDPTNDIRIIGSITVVILLGISVAGM
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pF1KB7 EWESKAQVLFFLVIMVSFANYLVGTLIPPSEDKASKGFFSYRADIFVQNLVPDWRGPDGT
       :::.::::..........::...::.:: ...: :.:::.:.:.::..:. : .   .: 
CCDS53 EWEAKAQVILLVILLIAIANFFIGTVIPSNNEKKSRGFFNYQASIFAENFGPRFTKGEG-
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pF1KB7 FFGMFSIFFPSATGILAGANISGDLKDPAIAIPKGTLMAIFWTTISYLAISATIGSCVVR
       ::..:.::::.::::::::::::::.::  :::.::..::: ::..::...  .:.::::
CCDS53 FFSVFAIFFPAATGILAGANISGDLEDPQDAIPRGTMLAIFITTVAYLGVAICVGACVVR
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pF1KB7 DASGVLNDTVTPGWGACEG-LACSYGWNFTECTQQHSCHYGLINYYQTMSMVSGFAPLIT
       ::.: .:::.  : . :.:  ::. :..:..: ... :.:::.: .:.:::::::.::::
CCDS53 DATGNMNDTIISGMN-CNGSAACGLGYDFSRC-RHEPCQYGLMNNFQVMSMVSGFGPLIT
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pF1KB7 AGIFGATLSSALACLVSAAKVFQCLCEDQLYPLIGFFGKGYGKNKEPVRGYLLAYAIAVA
       ::::.:::::::: :::: :::: ::.:..:  . ::.::::::.::.:::.:.. ::.:
CCDS53 AGIFSATLSSALASLVSAPKVFQALCKDNIYKALQFFAKGYGKNNEPLRGYILTFLIAMA
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pF1KB7 FIIIAELNTIAPIISNFFLCSYALINFSCFHASITNSPGWRPSFQYYNKWAALFGAIISV
       ::.:::::::::::::::: ::::::::::::: ..::::::..  :: :..::::..  
CCDS53 FILIAELNTIAPIISNFFLASYALINFSCFHASYAKSPGWRPAYGIYNMWVSLFGAVLCC
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pF1KB7 VIMFLLTWWAALIAIGVVLFLLLYVIYKKPEVNWGSSVQAGSYNLALSYSVGLNEVEDHI
       ..::...::::.:.  . .:: .::  :::.::::::.:: ::  ::. .. :. ::::.
CCDS53 AVMFVINWWAAVITYVIEFFLYVYVTCKKPDVNWGSSTQALSYVSALDNALELTTVEDHV
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pF1KB7 KNYRPQCLVLTGPPNFRPALVDFVGTFTRNLSLMICGHVLIGPHKQRMPELQLIANGHTK
       ::.::::.:::: :  ::::.:.. .::.: .: :: .:..::.:  . :..     .  
CCDS53 KNFRPQCIVLTGGPMTRPALLDITHAFTKNSGLCICCEVFVGPRKLCVKEMNSGMAKKQA
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pF1KB7 WLNKRKIKAFYSDVIAEDLRRGVQILMQAAGLGRMKPNILVVGFKKNWQSAHPATVEDYI
       :: : ::::::. : :. .: ::. :.::.:::::::: ::.:.::::..:  . .:.:.
CCDS53 WLIKNKIKAFYAAVAADCFRDGVRSLLQASGLGRMKPNTLVIGYKKNWRKAPLTEIENYV
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pF1KB7 GILHDAFDFNYGVCVMRMREGLNVSKMMQAH------------INPVFDPAEDGKEASA-
       ::.::::::. :: ..:. .:...:...:..            .. ..   :  .:... 
CCDS53 GIIHDAFDFEIGVVIVRISQGFDISQVLQVQEELERLEQERLALEATIKDNECEEESGGI
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pF1KB7 RG------------ARPSVSGALDPKALV-------KEEQATTIFQSEQGKKTIDIYWLF
       ::            . :. .:... .  .       :  .:.: :...: : :::..:::
CCDS53 RGLFKKAGKLNITKTTPKKDGSINTSQSMHVGEFNQKLVEASTQFKKKQEKGTIDVWWLF
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pF1KB7 DDGGLTLLIPYLLGRKRRWSKCKIRVFVGGQINRMDQERKAIISLLSKFRLGFHEVHILP
       :::::::::::.:  ...:. ::.:..:::.:::...:. .. :::::::. : ..::. 
CCDS53 DDGGLTLLIPYILTLRKKWKDCKLRIYVGGKINRIEEEKIVMASLLSKFRIKFADIHIIG
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pF1KB7 DINQNPRAEHTKRFEDMIAPFRLNDGFKDEATVNEMRRDCPWKISDEEITKNRVKSLRQV
       :::  :  :  : ::.:: :.::... :: .:.....:. ::::.: :.   . :: :::
CCDS53 DINIRPNKESWKVFEEMIEPYRLHESCKDLTTAEKLKRETPWKITDAELEAVKEKSYRQV
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pF1KB7 RLNEIVLDYSRDAALIVITLPIGRKGKCPSSLYMAWLETLSQDLRPPVILIRGNQENVLT
       ::::.. ..:: : :::..::..:::.  . ::::::: :...: :::.:.:::..::::
CCDS53 RLNELLQEHSRAANLIVLSLPVARKGSISDLLYMAWLEILTKNL-PPVLLVRGNHKNVLT
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       1030
pF1KB7 FYCQ
       ::  
CCDS53 FYS 
           

>>CCDS4144.1 SLC12A2 gene_id:6558|Hs108|chr5              (1212 aa)
 initn: 3509 init1: 1538 opt: 2755  Z-score: 3353.2  bits: 632.3 E(32554): 1.9e-180
Smith-Waterman score: 3591; 52.1% identity (79.7% similar) in 1030 aa overlap (39-1025:193-1208)

       10        20        30        40           50        60     
pF1KB7 TPGDATLCSGRFTISTLLSSDEPSPPAAYDSSHPSHL---THSSTFCMRTFGYNTIDVVP
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CCDS41 GVDGPNVSFQNGGDTVLSEGSSLHSGGGGGSGHHQHYYYDTHTNTYYLRTFGHNTMDAVP
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pF1KB7 TYEHYANST-QPGEPRKVRPTLADLHSFLKQEG-RHLHALAFDSRPSHEMTDGLVEGEAG
         .:: ... : :: . .::.::.::. :..:  .   : . .: :..   :..:   : 
CCDS41 RIDHYRHTAAQLGE-KLLRPSLAELHDELEKEPFEDGFANGEESTPTR---DAVVTYTAE
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pF1KB7 TSSEKNPEEPVRFGWVKGVMIRCMLNIWGVILYLRLPWITAQAGIVLTWIIILLSVTVTS
       ...       :.:::.:::..:::::::::.:..:: ::..:::: :. ..:.....::.
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       ::::: :::.::: :..::.:.:::::::::.::.:::::::::::.:::..::::::: 
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       .::.:..  ..: :::::::....:..::.::.::::::.:::................:
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       :.::  :.:  ::::.:...:: .:. ::.:  . :::..:.::::.:::::::::::::
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       ...:. : ..  : :::.: .:.:::::::.:::.::::.:::::::: :::: :.:: :
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CCDS41 HLQGQEELLSSQEKSPGTKDVVVSVEYSKKSDLDTSKPLSEKPITHKVEEEDGKTATQPL
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       :.::..  :..  ...:..: ::.:.:.:.   ..:. ::.::::.. ..:  : .::..
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pF1KB7 LPIGRKGKCPSSLYMAWLETLSQDLRPPVILIRGNQENVLTFYCQ
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CCDS41 LPVARKGAVSSALYMAWLEALSKDL-PPILLVRGNHQSVLTFYS 
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CCDS58 SKGV------VKFGWIKGVLVRCMLNIWGVMLFIRLSWIVGQAGIGLSVLVIMMATVVTT
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pF1KB7 KMM-QAHI------NP----VFDPAEDGKEASARGARP---------SVSGALDPKALVK
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CCDS58 HLQGQEELLSSQEKSPGTKDVVVSVEYSKKSDLDTSKPLSEKPITHKESKGPIVPLNVAD
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CCDS58 QKLLEASTQFQKKQGKNTIDVWWLFDDGGLTLLIPYLLTTKKKWKDCKIRVFIGGKINRI
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pF1KB7 DQERKAIISLLSKFRLGFHEVHILPDINQNPRAEHTKRFEDMIAPFRLNDGFKDEATVNE
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CCDS58 DHDRRAMATLLSKFRIDFSDIMVLGDINTKPKKENIIAFEEIIEPYRLHEDDKEQDIADK
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CCDS42 LLKLDEDLHVKHPRLLTFASQLKAGKGLTIVGSVIVGNFLENYGE-ALAAEQTIKHLMEA
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pF1KB7 HDAFDFNYGVCVMRMREGLNVSKMMQAHINPVFDPAEDGKEASARGARPSVSGALDPKAL
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CCDS42 -----------TVRVTTAAHLALLVAKNIS--FFP-------------------------
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CCDS42 DREAQLVKDRNSMLRLTSIGSDEDEETETYQEKVHMTWTKDKYMASRGQKAKSMEGFQDL
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CCDS42 LER-VLLVRGGGSEVITIYS 
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pF1KB7 RSLGPELGGSIGLIFAFANAVGVAMHTVGFAETV-------------RDLLQEYGAPIVD
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pF1KB7 VTPGWGACEGLACSYGWNFTECTQQHSCHYGLINYYQTMSMVSGFAPLITAGIFGATLSS
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CCDS10 ----------LRDKFG---------DAVKGNLV--VGTLSWPSPW--VIVIGSFFSTCGA
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pF1KB7 ALACLVSAAKVFQCLCEDQLYPLIGFFGKGYGKNKEPVRGYLLAYAIAVAFIIIAELNTI
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CCDS10 APILSMFFLMCYLFVNLACALQTLLRTPNWRPRFRYYH-WALSFMGMSICLALMFISSWY
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pF1KB7 AALIAIGVVLFLLLYVIYKKPEVNWGSSVQAGSYNLALSYSVGLNEVEDHIKNYRPQCLV
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CCDS10 YAIVAMVIAGMIYKYIEYQGAEKEWGDGIRGLSLSAARFALLRLEEGPPHTKNWRPQLLV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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