Result of FASTA (omim) for pF1KB7240
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7240, 311 aa
  1>>>pF1KB7240 311 - 311 aa - 311 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.4536+/-0.000484; mu= 20.8263+/- 0.030
 mean_var=87.7663+/-22.368, 0's: 0 Z-trim(106.8): 275  B-trim: 887 in 1/48
 Lambda= 0.136902
 statistics sampled from 14486 (14875) to 14486 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.5), E-opt: 0.2 (0.174), width:  16
 Scan time:  6.900

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 1026 213.4 4.8e-55
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 1018 211.8 1.4e-54
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312)  953 199.0   1e-50
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312)  953 199.0   1e-50
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322)  953 199.0 1.1e-50
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311)  922 192.9 7.3e-49
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311)  914 191.3 2.2e-48
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308)  907 189.9 5.6e-48
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312)  879 184.4 2.6e-46
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317)  863 181.2 2.4e-45
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317)  863 181.2 2.4e-45
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317)  863 181.2 2.4e-45
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317)  857 180.0 5.4e-45
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312)  855 179.6   7e-45
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307)  845 177.6 2.7e-44
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327)  826 173.9 3.8e-43
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312)  819 172.5 9.7e-43
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314)  806 169.9 5.8e-42
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300)  802 169.1 9.7e-42
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309)  773 163.4 5.2e-40
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318)  518 113.1 7.7e-25
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320)  457 101.0 3.3e-21
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351)  218 53.9 5.6e-07
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306)  216 53.4 6.8e-07
XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389)  200 50.4   7e-06
XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425)  200 50.4 7.4e-06
XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425)  200 50.4 7.4e-06
NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425)  200 50.4 7.4e-06
NP_003599 (OMIM: 604620) psychosine receptor [Homo ( 337)  192 48.7 1.9e-05
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313)  188 47.9 3.2e-05
XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333)  188 47.9 3.3e-05
XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370)  188 48.0 3.5e-05
XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376)  188 48.0 3.6e-05
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382)  188 48.0 3.6e-05
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382)  188 48.0 3.6e-05
XP_011508789 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 403)  188 48.0 3.7e-05
NP_006047 (OMIM: 604153) neuromedin-U receptor 1 [ ( 426)  188 48.1 3.9e-05
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323)  184 47.1 5.6e-05
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318)  182 46.7 7.3e-05
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444)  183 47.1 7.8e-05
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461)  183 47.1   8e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339)  181 46.5 8.7e-05
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423)  175 45.5 0.00023
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor  ( 428)  173 45.1  0.0003
NP_001050 (OMIM: 162332,614840) neuromedin-K recep ( 465)  173 45.1 0.00032
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337)  170 44.4 0.00039
NP_001048 (OMIM: 162321) substance-K receptor [Hom ( 398)  168 44.1 0.00057
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471)  165 43.6 0.00095
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic  ( 408)  164 43.3   0.001
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332)  162 42.8  0.0012


>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo   (314 aa)
 initn: 1015 init1: 1015 opt: 1026  Z-score: 1109.2  bits: 213.4 E(85289): 4.8e-55
Smith-Waterman score: 1026; 49.5% identity (77.2% similar) in 307 aa overlap (2-308:4-310)

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pF1KB7   MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIWLSSHLHTP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
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pF1KB7 MYYFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAM
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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pF1KB7 AYDRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYIIGLVCASVHTGCMFRVQFCKFDLINHYF
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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pF1KB7 CDLLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIASILHIRSTEGRSKAF
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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pF1KB7 STCSSHMLAVVIFFGSAAFMYLQPSSISSMDQGKVSSVFYTIIVPMLNPLIYSLRNKDVH
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
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      300       310  
pF1KB7 VSLKKMLQRRTLL 
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NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
              310    

>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo   (314 aa)
 initn: 1042 init1: 998 opt: 1018  Z-score: 1100.7  bits: 211.8 E(85289): 1.4e-54
Smith-Waterman score: 1018; 48.1% identity (79.5% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIWLSSHLHTPMY
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
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pF1KB7 YFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAMAY
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
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pF1KB7 DRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYIIGLVCASVHTGCMFRVQFCKFDLINHYFCD
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NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
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pF1KB7 LLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIASILHIRSTEGRSKAFST
         ::.:::::.  ... .   ... ::.   :.:: :: ... ::. ..: ::: .::::
NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
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pF1KB7 CSSHMLAVVIFFGSAAFMYLQPSSISSMDQGKVSSVFYTIIVPMLNPLIYSLRNKDVHVS
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
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pF1KB7 LKKMLQRRTLL   
       : ....:.      
NP_003 LANVISRKRTSSFL
              310    

>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep  (312 aa)
 initn: 1007 init1: 953 opt: 953  Z-score: 1031.3  bits: 199.0 E(85289): 1e-50
Smith-Waterman score: 953; 44.6% identity (77.9% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)

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pF1KB7 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIWLSSHLHTPMY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KB7 YFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAMAY
       .:::.:::.:.: : . .::::.: . : . ::.  :.::.:: ..:.  .  .::.:::
XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KB7 DRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYIIGLVCASVHTGCMFRVQFCKFDLINHYFCD
       :...:.: :: :.. .... :  :. :..... . . .::  :  ..::  . :.:.:::
XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KB7 LLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIASILHIRSTEGRSKAFST
       . ::::::::. ..:...::  ::. ...: : :: ::. :  ..:.. ::.:: :::::
XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KB7 CSSHMLAVVIFFGSAAFMYLQPSSISSMDQGKVSSVFYTIIVPMLNPLIYSLRNKDVHVS
       :.::. .:..:...   .:..: :  : ..  ...:.::...:::::.::::::. .. .
XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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pF1KB7 LKKMLQRRTLL 
       :::.. :     
XP_011 LKKVVGRVVFSV
              310  

>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo   (312 aa)
 initn: 1007 init1: 953 opt: 953  Z-score: 1031.3  bits: 199.0 E(85289): 1e-50
Smith-Waterman score: 953; 44.6% identity (77.9% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIWLSSHLHTPMY
       ::: :.:::.::.: :::.::. :  ::..::..:..::.::: .   . ..: ::::::
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 YFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAMAY
       .:::.:::.:.: : . .::::.: . : . ::.  :.::.:: ..:.  .  .::.:::
NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 DRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYIIGLVCASVHTGCMFRVQFCKFDLINHYFCD
       :...:.: :: :.. .... :  :. :..... . . .::  :  ..::  . :.:.:::
NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 LLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIASILHIRSTEGRSKAFST
       . ::::::::. ..:...::  ::. ...: : :: ::. :  ..:.. ::.:: :::::
NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 CSSHMLAVVIFFGSAAFMYLQPSSISSMDQGKVSSVFYTIIVPMLNPLIYSLRNKDVHVS
       :.::. .:..:...   .:..: :  : ..  ...:.::...:::::.::::::. .. .
NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
              250       260       270       280       290       300

              310  
pF1KB7 LKKMLQRRTLL 
       :::.. :     
NP_036 LKKVVGRVVFSV
              310  

>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep  (322 aa)
 initn: 1007 init1: 953 opt: 953  Z-score: 1031.2  bits: 199.0 E(85289): 1.1e-50
Smith-Waterman score: 953; 44.6% identity (77.9% similar) in 307 aa overlap (1-307:11-317)

                         10        20        30        40        50
pF1KB7           MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIW
                 ::: :.:::.::.: :::.::. :  ::..::..:..::.::: .   . 
XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS
               10        20        30        40        50        60

               60        70        80        90       100       110
pF1KB7 LSSHLHTPMYYFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLVFAIA
       ..: ::::::.:::.:::.:.: : . .::::.: . : . ::.  :.::.:: ..:.  
XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM
               70        80        90       100       110       120

              120       130       140       150       160       170
pF1KB7 ECHMLAAMAYDRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYIIGLVCASVHTGCMFRVQFCK
       .  .::.::::...:.: :: :.. .... :  :. :..... . . .::  :  ..:: 
XP_011 DNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCA
              130       140       150       160       170       180

              180       190       200       210       220       230
pF1KB7 FDLINHYFCDLLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIASILHIRS
        . :.:.:::. ::::::::. ..:...::  ::. ...: : :: ::. :  ..:.. :
XP_011 DNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPS
              190       200       210       220       230       240

              240       250       260       270       280       290
pF1KB7 TEGRSKAFSTCSSHMLAVVIFFGSAAFMYLQPSSISSMDQGKVSSVFYTIIVPMLNPLIY
       :.:: ::::::.::. .:..:...   .:..: :  : ..  ...:.::...:::::.::
XP_011 TKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIY
              250       260       270       280       290       300

              300       310  
pF1KB7 SLRNKDVHVSLKKMLQRRTLL 
       ::::. .. .:::.. :     
XP_011 SLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
              310       320  

>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H  (311 aa)
 initn: 950 init1: 905 opt: 922  Z-score: 998.3  bits: 192.9 E(85289): 7.3e-49
Smith-Waterman score: 922; 43.8% identity (75.5% similar) in 306 aa overlap (3-308:4-309)

                10        20        30        40        50         
pF1KB7  MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIWLSSHLHTPM
          : : . .: ::: :.:. :..   :: .:: ::..... ::.. .:: ..:::::::
NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB7 YYFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAMA
       :.:::.::::: :. .  .:::: :.. :.. :..  :. : ..: .....:  ...:::
NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB7 YDRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYIIGLVCASVHTGCMFRVQFCKFDLINHYFC
       :::: :::.::::: :.:   :  ..::.:. ::. .  . : .....::  ..: :.::
NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB7 DLLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIASILHIRSTEGRSKAFS
       :.  :: :::.. .  ...   .  :  .. .:.:. :: .:  ::..: :..::::::.
NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB7 TCSSHMLAVVIFFGSAAFMYLQPSSISSMDQGKVSSVFYTIIVPMLNPLIYSLRNKDVHV
       ::.::. :: .:. :. :.::. :: .: .  . .:::::...:::::::::::::... 
NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
              250       260       270       280       290       300

     300       310 
pF1KB7 SLKKMLQRRTLL
       .::.. .:.   
NP_001 ALKRLQKRKCC 
              310  

>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor   (311 aa)
 initn: 996 init1: 908 opt: 914  Z-score: 989.7  bits: 191.3 E(85289): 2.2e-48
Smith-Waterman score: 914; 43.5% identity (76.1% similar) in 301 aa overlap (5-305:8-308)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB7    MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIWLSSHLHT
              : ::   :::.:.:. :.:.. .:.. : .:..:..::: .  : .:.:::::
NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
               10        20        30        40        50        60

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB7 PMYYFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAA
       :::.:::.:::.:.:..:   :..:::.   .. :::  :: :::: :... .:: .:..
NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
               70        80        90       100       110       120

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB7 MAYDRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYIIGLVCASVHTGCMFRVQFCKFDLINHY
       :.:::: :.: :: :.:..  . :  : .. .. :.. ...:..  : : .:    ..:.
NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
              130       140       150       160       170       180

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB7 FCDLLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIASILHIRSTEGRSKA
       ::..  ::.::: . .::.: .. .... .:.: . :: ::  :. .::...:: : .:.
NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
              190       200       210       220       230       240

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB7 FSTCSSHMLAVVIFFGSAAFMYLQPSSISSMDQGKVSSVFYTIIVPMLNPLIYSLRNKDV
       :.::..:..:: .::  :  ::::: : .:.::::  ..:::...: ::::::.:::: :
NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
              250       260       270       280       290       300

       300       310 
pF1KB7 HVSLKKMLQRRTLL
       . ..:...      
NP_001 RGAVKRLMGWE   
              310    

>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo   (308 aa)
 initn: 992 init1: 749 opt: 907  Z-score: 982.3  bits: 189.9 E(85289): 5.6e-48
Smith-Waterman score: 907; 44.2% identity (77.2% similar) in 303 aa overlap (5-307:5-305)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIWLSSHLHTPMY
           :...::::.: :::. :. .  ::...::.:.:::.::: . .:. ..:.::::::
NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 YFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAMAY
       .:: .::. :.: :: :.:. ::.....:..:..  : ..: :::.:. ..: .::.:.:
NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 DRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYIIGLVCASVHTGCMFRVQFCKFDLINHYFCD
       :::.:::.:: :  :.. :.: .:  : .  :.. . : :  ..:. .   . : :.::.
NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 LLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIASILHIRSTEGRSKAFST
          :: :. .. ..... :. .:.  .:.: . :: ::  ::.......:: :  :::::
NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 CSSHMLAVVIFFGSAAFMYLQPSSISSMDQGKVSSVFYTIIVPMLNPLIYSLRNKDVHVS
       :.::...:..:.::: . :. :.:  : .: :  ::::.:..:::::::::::::::...
NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKS--SKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
              250       260         270       280       290        

              310 
pF1KB7 LKKMLQRRTLL
       :.:.  :    
NP_003 LRKVATRNFP 
      300         

>>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo   (312 aa)
 initn: 847 init1: 727 opt: 879  Z-score: 952.3  bits: 184.4 E(85289): 2.6e-46
Smith-Waterman score: 879; 43.3% identity (74.6% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-306)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MSGENNSSVTEFILAGLSEQPELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMTTLIWLSSHLHTPMY
       :.: :.:  .::.: :.::.:: :  :: .::..:.::::::. .   :  .:.::::.:
NP_002 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIILAISSDSRLHTPVY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 YFLSSLSFIDFCHSTVITPKMLVNFVTEKNIISYPECMTQLYFFLVFAIAECHMLAAMAY
       .::..::: :.   :   ::::::. .... :::  :.:::::.. ..  .  .::.:::
NP_002 FFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSLVALDNLILAVMAY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 DRYMAICSPLLYSVIISNKACFSLILGVYIIGLVCASVHTGCMFRVQFCKFDLINHYFCD
       :::.::: :: :.. .: : :. :.   ...... . .::  : :: ::    :.. ::.
NP_002 DRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLMTRVTFCGSRKIHYIFCE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 LLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIASILHIRSTEGRSKAFST
       .  ::...::.: .:. ... .: : .:.:   .. ::..:: .::.: :.  . :::::
NP_002 MYVLLRMACSNIQINHTVLIATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIRAILRIPSVSKKYKAFST
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