Result of FASTA (omim) for pF1KB7206
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7206, 575 aa
  1>>>pF1KB7206 575 - 575 aa - 575 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6037+/-0.000443; mu= 14.2266+/- 0.027
 mean_var=163.8193+/-33.229, 0's: 0 Z-trim(115.4): 65  B-trim: 11 in 1/52
 Lambda= 0.100206
 statistics sampled from 25838 (25893) to 25838 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.304), width:  16
 Scan time:  8.980

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_872325 (OMIM: 615718) BPI fold-containing famil ( 614) 3733 552.5 1.5e-156
NP_872599 (OMIM: 615717) BPI fold-containing famil ( 476)  843 134.5 7.4e-31
XP_016883152 (OMIM: 614110) PREDICTED: BPI fold-co ( 469)  781 125.6 3.6e-28
NP_777557 (OMIM: 614110) BPI fold-containing famil ( 453)  742 119.9 1.8e-26
NP_079503 (OMIM: 614108) BPI fold-containing famil ( 458)  477 81.6 6.1e-15
XP_011528391 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-co ( 507)  367 65.8   4e-10
NP_777592 (OMIM: 614109) BPI fold-containing famil ( 507)  367 65.8   4e-10
XP_011528390 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-co ( 507)  367 65.8   4e-10
XP_011528392 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-co ( 507)  367 65.8   4e-10
NP_001716 (OMIM: 109195) bactericidal permeability ( 487)  343 62.3 4.3e-09
XP_011528393 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-co ( 455)  307 57.0 1.5e-07
NP_570913 (OMIM: 607412) BPI fold-containing famil ( 256)  208 42.4  0.0021
NP_057667 (OMIM: 607412) BPI fold-containing famil ( 256)  208 42.4  0.0021
NP_001230122 (OMIM: 607412) BPI fold-containing fa ( 256)  208 42.4  0.0021


>>NP_872325 (OMIM: 615718) BPI fold-containing family B   (614 aa)
 initn: 3733 init1: 3733 opt: 3733  Z-score: 2931.6  bits: 552.5 E(85289): 1.5e-156
Smith-Waterman score: 3733; 100.0% identity (100.0% similar) in 575 aa overlap (1-575:40-614)

                                             10        20        30
pF1KB7                               MLQQSDALHSALREVPLGVGDIPYNDFHVR
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 LSVVAVCGTSHETNTVLRVTKDVLSNAISGMLQQSDALHSALREVPLGVGDIPYNDFHVR
      10        20        30        40        50        60         

               40        50        60        70        80        90
pF1KB7 GPPPVYTNGKKLDGIYQYGHIETNDNTAQLGGKYRYGEILESEGSIRDLRNSGYRSAENA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 GPPPVYTNGKKLDGIYQYGHIETNDNTAQLGGKYRYGEILESEGSIRDLRNSGYRSAENA
      70        80        90       100       110       120         

              100       110       120       130       140       150
pF1KB7 YGGHRGLGRYRAAPVGRLHRRELQPGEIPPGVATGAVGPGGLLGTGGMLAADGILAGQGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 YGGHRGLGRYRAAPVGRLHRRELQPGEIPPGVATGAVGPGGLLGTGGMLAADGILAGQGG
     130       140       150       160       170       180         

              160       170       180       190       200       210
pF1KB7 LLGGGGLLGDGGLLGGGGVLGVLGEGGILSTVQGITGLRIVELTLPRVSVRLLPGVGVYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 LLGGGGLLGDGGLLGGGGVLGVLGEGGILSTVQGITGLRIVELTLPRVSVRLLPGVGVYL
     190       200       210       220       230       240         

              220       230       240       250       260       270
pF1KB7 SLYTRVAINGKSLIGFLDIAVEVNITAKVRLTMDRTGYPRLVIERCDTLLGGIKVKLLRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 SLYTRVAINGKSLIGFLDIAVEVNITAKVRLTMDRTGYPRLVIERCDTLLGGIKVKLLRG
     250       260       270       280       290       300         

              280       290       300       310       320       330
pF1KB7 LLPNLVDNLVNRVLADVLPDLLCPIVDVVLGLVNDQLGLVDSLIPLGILGSVQYTFSSLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 LLPNLVDNLVNRVLADVLPDLLCPIVDVVLGLVNDQLGLVDSLIPLGILGSVQYTFSSLP
     310       320       330       340       350       360         

              340       350       360       370       380       390
pF1KB7 LVTGEFLELDLNTLVGEAGGGLIDYPLGWPAVSPKPMPELPPMGDNTKSQLAMSANFLGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 LVTGEFLELDLNTLVGEAGGGLIDYPLGWPAVSPKPMPELPPMGDNTKSQLAMSANFLGS
     370       380       390       400       410       420         

              400       410       420       430       440       450
pF1KB7 VLTLLQKQHALDLDITNGMFEELPPLTTATLGALIPKVFQQYPESCPLIIRIQVLNPPSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 VLTLLQKQHALDLDITNGMFEELPPLTTATLGALIPKVFQQYPESCPLIIRIQVLNPPSV
     430       440       450       460       470       480         

              460       470       480       490       500       510
pF1KB7 MLQKDKALVKVLATAEVMVSQPKDLETTICLIDVDTEFLASFSTEGDKLMIDAKLEKTSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 MLQKDKALVKVLATAEVMVSQPKDLETTICLIDVDTEFLASFSTEGDKLMIDAKLEKTSL
     490       500       510       520       530       540         

              520       530       540       550       560       570
pF1KB7 NLRTSNVGNFDIGLMEVLVEKIFDLAFMPAMNAVLGSGVPLPKILNIDFSNADIDVLEDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 NLRTSNVGNFDIGLMEVLVEKIFDLAFMPAMNAVLGSGVPLPKILNIDFSNADIDVLEDL
     550       560       570       580       590       600         

            
pF1KB7 LVLSA
       :::::
NP_872 LVLSA
     610    

>>NP_872599 (OMIM: 615717) BPI fold-containing family B   (476 aa)
 initn: 937 init1: 347 opt: 843  Z-score: 675.0  bits: 134.5 E(85289): 7.4e-31
Smith-Waterman score: 988; 37.8% identity (69.4% similar) in 471 aa overlap (105-574:28-473)

           80        90       100       110       120       130    
pF1KB7 SIRDLRNSGYRSAENAYGGHRGLGRYRAAPVGRLHRRELQPGEIPPGVATGAVGPGGLLG
                                     :: : :  ..  :.  .. .. ::   : .
NP_872    MQPVMLALWSLLLLWGLATPCQELLETVGTLAR--IDKDELGKAIQNSLVGEPILQN
                  10        20        30          40        50     

          140       150       160       170       180       190    
pF1KB7 TGGMLAADGILAGQGGLLGGGGLLGDGGLLGGGGVLGVLGEGGILSTVQGITGLRIVELT
       . :     .. : . ::::.::::: ::::: :::.::. :         ..::.: :::
NP_872 VLG-----SVTAVNRGLLGSGGLLGGGGLLGHGGVFGVVEE---------LSGLKIEELT
               60        70        80        90                100 

          200       210       220        230       240       250   
pF1KB7 LPRVSVRLLPGVGVYLSLYTRVAINGKS-LIGFLDIAVEVNITAKVRLTMDRTGYPRLVI
       ::.: ..:::: :: :::.:.:... .. : :.:..:.:::.:..: :...  : : :..
NP_872 LPKVLLKLLPGFGVQLSLHTKVGMHCSGPLGGLLQLAAEVNVTSRVALAVSSRGTPILIL
             110       120       130       140       150       160 

           260       270       280       290       300       310   
pF1KB7 ERCDTLLGGIKVKLLRGLLPNLVDNLVNRVLADVLPDLLCPIVDVVLGLVNDQLGLVDSL
       .::.::::  ...:. ::::. . ..:...:  ::: ::::.:: :::.::. :: : .:
NP_872 KRCSTLLG--HISLFSGLLPTPLFGVVEQMLFKVLPGLLCPVVDSVLGVVNELLGAVLGL
               170       180       190       200       210         

           320       330       340       350       360       370   
pF1KB7 IPLGILGSVQYTFSSLPLVTGEFLELDLNTLVGEAGGGLIDYPLGWPAVSPKPMPELPPM
       . :: ::::......:::......:::.: .:  ..: .::.:    . .:    ..:: 
NP_872 VSLGALGSVEFSLATLPLISNQYIELDINPIVKSVAGDIIDFP---KSRAPA---KVPPK
     220       230       240       250       260             270   

           380       390       400       410       420       430   
pF1KB7 GDNTKSQLAMSANFLGSVLTLLQKQHALDLDITNGMFEELPPLTTATLGALIPKVFQQYP
        :.: ::. .   ...... ::: . :::.:::  .     ::::. :.::.:... . :
NP_872 KDHT-SQVMVPLYLFNTTFGLLQTNGALDMDITPELVPSDVPLTTTDLAALLPEALGKLP
            280       290       300       310       320       330  

           440       450       460       470       480       490   
pF1KB7 ESCPLIIRIQVLNPPSVMLQKDKALVKVLATAEVMVSQPKDLETTICLIDVDTEFLASFS
           :.. ..: . :.: :.. ::::.. :. .:.   ::    ..  ..      :...
NP_872 LHQQLLLFLRVREAPTVTLHNKKALVSLPANIHVLFYVPKGTPESLFELNSVMTVRAQLA
            340       350       360       370       380       390  

           500       510       520       530       540       550   
pF1KB7 TEGDKLMIDAKLEKTSLNLRTSNVGNFDIGLMEVLVEKIFDLAFMPAMNAVLGSGVPLPK
         . :: :. .::. :... .: .  :: . .:  . ..   .. : .:..:  :.::::
NP_872 PSATKLHISLSLERLSVKVASSFTHAFDGSRLEEWLSHVVGAVYAPKLNVALDVGIPLPK
            400       410       420       430       440       450  

           560       570       
pF1KB7 ILNIDFSNADIDVLEDLLVLSA  
       .:::.:::. ....:. .::.   
NP_872 VLNINFSNSVLEIVENAVVLTVAS
            460       470      

>>XP_016883152 (OMIM: 614110) PREDICTED: BPI fold-contai  (469 aa)
 initn: 710 init1: 240 opt: 781  Z-score: 626.6  bits: 125.6 E(85289): 3.6e-28
Smith-Waterman score: 781; 31.3% identity (68.2% similar) in 453 aa overlap (129-573:20-464)

      100       110       120       130       140       150        
pF1KB7 RYRAAPVGRLHRRELQPGEIPPGVATGAVGPGGLLGTGGMLAADGILAGQGGLLGGGGLL
                                     ::.::  :  .   : :.: :  ::::.  
XP_016            MLRILCLALCSLLTGTRADPGALLRLGMDIMNRGELVGPGVQLGGGAWE
                          10        20        30        40         

      160       170           180       190       200       210    
pF1KB7 GDGGLLGGGGVLGVLGEGGI----LSTVQGITGLRIVELTLPRVSVRLLPGVGVYLSLYT
        ....  .  .  . .:.:     .. ..:::.:.. .. :: ... ..::::..  . :
XP_016 VQSAMDESHILEKMAAEAGKKQPGMKPIKGITNLKVKDVQLPVITLNFVPGVGIFQCVST
      50        60        70        80        90       100         

          220        230       240        250       260       270  
pF1KB7 RVAINGKSLIGF-LDIAVEVNITAKVRLTMDR-TGYPRLVIERCDTLLGGIKVKLLRGLL
        ....:::..:  ..: : .::::  ::  :. :: : .  : :...: ..:..:  ..:
XP_016 GMTVTGKSFMGGNMEIIVALNITATNRLLRDEETGLPVFKSEGCEVILVNVKTNLPSNML
     110       120       130       140       150       160         

            280       290       300       310       320       330  
pF1KB7 PNLVDNLVNRVLADVLPDLLCPIVDVVLGLVNDQLGLVDSLIPLGILGSVQYTFSSLPLV
       :..:..... .:  ::: :.:: .:.::  :: .   ... .:.: .:.:.:.. : : .
XP_016 PKMVNKFLDSTLHKVLPGLMCPAIDAVLVYVNRKWTNLSDPMPVGQMGTVKYVLMSAPAT
     170       180       190       200       210       220         

            340       350       360       370       380       390  
pF1KB7 TGEFLELDLNTLVGEAGGGLIDYPLGWPAVSPKPMPELPPMGDNTKSQLAMSANFLGSVL
       :. ...::.. .: .  :  :    .  :..   .::    :   .::: . :.::.. :
XP_016 TASYIQLDFSPVVQQQKGKTIKLADAGEALT---FPEGYAKG---SSQLLLPATFLSAEL
     230       240       250       260             270       280   

            400       410       420       430       440       450  
pF1KB7 TLLQKQHALDLDITNGMFEELPPLTTATLGALIPKVFQQYPESCPLIIRIQVLNPPSVML
       .::::  .. ..: . :. :::: :: ::. .::.:   ::.: ::  .:.. .::.: .
XP_016 ALLQK--SFHVNIQDTMIGELPPQTTKTLARFIPEVAVAYPKSKPLTTQIKIKKPPKVTM
             290       300       310       320       330       340 

            460       470        480       490       500        510
pF1KB7 QKDKALVKVLATAEVMVSQPKD-LETTICLIDVDTEFLASFSTEGDKLMIDAKLEKT-SL
       .  :.:... .: :..... ..    .. :..:  .. ...:.. ..:.. ..:..  ::
XP_016 KTGKSLLHLHSTLEMFAARWRSKAPMSLFLLEVHFNLKVQYSVHENQLQMATSLDRLLSL
             350       360       370       380       390       400 

              520       530       540       550       560       570
pF1KB7 NLRTSNVGNFDIGLMEVLVEKIFDLAFMPAMNAVLGSGVPLPKILNIDFSNADIDVLEDL
       . ..:..:::.   .  .. . .. :..:..: ::  :.::: .: .... :..:..:. 
XP_016 SRKSSSIGNFNERELTGFITSYLEEAYIPVVNDVLQVGLPLPDFLAMNYNLAELDIVENA
             410       420       430       440       450       460 

               
pF1KB7 LVLSA   
       :.:     
XP_016 LMLDLKLG
               

>>NP_777557 (OMIM: 614110) BPI fold-containing family B   (453 aa)
 initn: 654 init1: 240 opt: 742  Z-score: 596.3  bits: 119.9 E(85289): 1.8e-26
Smith-Waterman score: 742; 31.8% identity (70.4% similar) in 399 aa overlap (179-573:58-448)

      150       160       170       180       190       200        
pF1KB7 GGLLGGGGLLGDGGLLGGGGVLGVLGEGGILSTVQGITGLRIVELTLPRVSVRLLPGVGV
                                     .. ..:::.:.. .. :: ... ..::::.
NP_777 MDIMNQVQSAMDESHILEKMAAEAGKKQPGMKPIKGITNLKVKDVQLPVITLNFVPGVGI
        30        40        50        60        70        80       

      210       220        230       240        250       260      
pF1KB7 YLSLYTRVAINGKSLIGF-LDIAVEVNITAKVRLTMDR-TGYPRLVIERCDTLLGGIKVK
       .  . : ....:::..:  ..: : .::::  ::  :. :: : .  : :...: ..:..
NP_777 FQCVSTGMTVTGKSFMGGNMEIIVALNITATNRLLRDEETGLPVFKSEGCEVILVNVKTN
        90       100       110       120       130       140       

        270       280       290       300       310       320      
pF1KB7 LLRGLLPNLVDNLVNRVLADVLPDLLCPIVDVVLGLVNDQLGLVDSLIPLGILGSVQYTF
       :  ..::..:..... .:  ::: :.:: .:.::  :: .   ... .:.: .:.:.:..
NP_777 LPSNMLPKMVNKFLDSTLHKVLPGLMCPAIDAVLVYVNRKWTNLSDPMPVGQMGTVKYVL
       150       160       170       180       190       200       

        330       340       350       360       370       380      
pF1KB7 SSLPLVTGEFLELDLNTLVGEAGGGLIDYPLGWPAVSPKPMPELPPMGDNTKSQLAMSAN
        : : .:. ...::.. .: .  :  :    .  :..   .::    :.   ::: . :.
NP_777 MSAPATTASYIQLDFSPVVQQQKGKTIKLADAGEALT---FPEGYAKGS---SQLLLPAT
       210       220       230       240          250          260 

        390       400       410       420       430       440      
pF1KB7 FLGSVLTLLQKQHALDLDITNGMFEELPPLTTATLGALIPKVFQQYPESCPLIIRIQVLN
       ::.. :.::::  .. ..: . :. :::: :: ::. .::.:   ::.: ::  .:.. .
NP_777 FLSAELALLQK--SFHVNIQDTMIGELPPQTTKTLARFIPEVAVAYPKSKPLTTQIKIKK
             270         280       290       300       310         

        450       460       470        480       490       500     
pF1KB7 PPSVMLQKDKALVKVLATAEVMVSQPKD-LETTICLIDVDTEFLASFSTEGDKLMIDAKL
       ::.: ..  :.:... .: :..... ..    .. :..:  .. ...:.. ..:.. ..:
NP_777 PPKVTMKTGKSLLHLHSTLEMFAARWRSKAPMSLFLLEVHFNLKVQYSVHENQLQMATSL
     320       330       340       350       360       370         

          510       520       530       540       550       560    
pF1KB7 EKT-SLNLRTSNVGNFDIGLMEVLVEKIFDLAFMPAMNAVLGSGVPLPKILNIDFSNADI
       ..  ::. ..:..:::.   .  .. . .. :..:..: ::  :.::: .: .... :..
NP_777 DRLLSLSRKSSSIGNFNERELTGFITSYLEEAYIPVVNDVLQVGLPLPDFLAMNYNLAEL
     380       390       400       410       420       430         

          570        
pF1KB7 DVLEDLLVLSA   
       :..:. :.:     
NP_777 DIVENALMLDLKLG
     440       450   

>>NP_079503 (OMIM: 614108) BPI fold-containing family B   (458 aa)
 initn: 460 init1: 204 opt: 477  Z-score: 389.2  bits: 81.6 E(85289): 6.1e-15
Smith-Waterman score: 477; 26.8% identity (61.4% similar) in 396 aa overlap (186-575:67-452)

         160       170       180       190       200       210     
pF1KB7 GLLGDGGLLGGGGVLGVLGEGGILSTVQGITGLRIVELTLPRVSVRLLPGVGVYLSLYTR
                                     : .::... .::. .... : :: :   . 
NP_079 VSEIGKAPLQRALQVTVPHFLDWSGEALQPTRIRILNVHVPRLHLKFIAGFGVRLLAAAN
         40        50        60        70        80        90      

         220       230       240       250       260       270     
pF1KB7 VAINGKSLIGFLDIAVEVNITAKVRLTMDRTGYPRLVIERCDTLLGGIKVKLLRGLLPNL
        ...       :.... :.. : .:.:..    : . :  :. . :  .     .   . 
NP_079 FTFKVFRAPEPLELTLPVELLADTRVTQSSIRTPVVSISACSLFSGHANEFDGSNSTSHA
        100       110       120       130       140       150      

         280       290        300       310       320       330    
pF1KB7 VDNLVNRVLADVLPDLLC-PIVDVVLGLVNDQLGLVDSLIPLGILGSVQYTFSSLPLVTG
       .  ::.. .  :: . ::  : ..: : :: .:: . .: :.:  ....:.. :.: ::.
NP_079 LLVLVQKHIKAVLSNKLCLSISNLVQG-VNVHLGTLIGLNPVGPESQIRYSMVSVPTVTS
        160       170       180        190       200       210     

          340       350       360        370       380          390
pF1KB7 EFLELDLNTLVGEAGGGLIDYPLGWPAVSPKPM-PELPPMGDNTKSQLA---MSANFLGS
       ... :..:...         . :: : . :    : . :   .:....:   .: ... :
NP_079 DYISLEVNAVL---------FLLGKPIILPTDATPFVLPRHVGTEGSMATVGLSQQLFDS
         220                230       240       250       260      

              400       410       420       430       440       450
pF1KB7 VLTLLQKQHALDLDITNGMFEELPPLTTATLGALIPKVFQQYPESCPLIIRIQVLNPPSV
       .: ::::  ::.::::. .  .   :.:..:: :::.: .:.::  :.......   : .
NP_079 ALLLLQKAGALNLDITGQLRSDDNLLNTSALGRLIPEVARQFPEPMPVVLKVRLGATPVA
        270       280       290       300       310       320      

              460       470       480       490       500          
pF1KB7 MLQKDKALVKVLATAEVMVSQPKDLETTICLIDVDTEFLASFSTEGDKLM-IDAKLEKTS
       ::. ..: ...   .::...  ..   ..  .:: ...  ..:.   ::.   . :  ..
NP_079 MLHTNNATLRLQPFVEVLATASNSAFQSLFSLDVVVNLRLQLSVSKVKLQGTTSVLGDVQ
        330       340       350       360       370       380      

     510       520       530       540       550       560         
pF1KB7 LNLRTSNVGNFDIGLMEVLVEKIFDLAFMPAMNAVLGSGVPLPKILNIDFSNADIDVLED
       :.. .:::: .:   ...:.  .:.  ..  .::.:. :. :: ..:. .   .: : : 
NP_079 LTVASSNVGFIDTDQVRTLMGTVFEKPLLDHLNALLAMGIALPGVVNLHYVAPEIFVYEG
        390       400       410       420       430       440      

     570           
pF1KB7 LLVLSA      
        .:.:.      
NP_079 YVVISSGLFYQS
        450        

>>XP_011528391 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-contai  (507 aa)
 initn: 263 init1: 214 opt: 367  Z-score: 302.8  bits: 65.8 E(85289): 4e-10
Smith-Waterman score: 367; 24.8% identity (58.3% similar) in 408 aa overlap (186-574:81-473)

         160       170       180       190       200       210     
pF1KB7 GLLGDGGLLGGGGVLGVLGEGGILSTVQGITGLRIVELTLPRVSVRLLPGVGVYLSLYTR
                                     ....:  ...: .:. ..::::.  .: ..
XP_011 EQMLKEKKLPDLSGSESLEFLKVDYVNYNFSNIKISAFSFPNTSLAFVPGVGIK-ALTNH
               60        70        80        90       100          

         220                 230        240       250       260    
pF1KB7 VAINGKSLIGF----------LDIAVE-VNITAKVRLTMDRTGYPRLVIERCDTLLGGIK
        . : ..  ::           :. .  : .:. . :: .  :.: : .. : . :.  .
XP_011 GTANISTDWGFESPLFQDTGGADLFLSGVYFTGIIILTRNDFGHPTLKLQDCYAQLSHAH
     110       120       130       140       150       160         

          270       280       290          300       310       320 
pF1KB7 VKLLRGLLPNLVDNLVNRVLADVLPDL---LCPIVDVVLGLVNDQLGLVDSLIPLGILGS
       :..  : :  : ..... .   .: .:   ::::.   .  .: .:. .. :  .     
XP_011 VSF-SGELSVLYNSFAEPMEKPILKNLNEMLCPIIASEVKALNANLSTLEVLTKIDNYTL
     170        180       190       200       210       220        

             330       340       350       360        370       380
pF1KB7 VQYTFSSLPLVTGEFLELDLNTLVGEAGGGLIDYPLGWPAVSP-KPMPELPPMGDNTKSQ
       ..:.. : : .: ..:.:.:.        :.. :::   .  : .:.: . :  .:.   
XP_011 LDYSLISSPEITENYLDLNLK--------GVF-YPLENLTDPPFSPVPFVLPERSNSMLY
      230       240               250        260       270         

              390       400       410       420       430       440
pF1KB7 LAMSANFLGSVLTLLQKQHALDLDITNGMFEELPPLTTATLGALIPKVFQQYPESCPLII
       ....  :. :.        .... ...  . .    ..  :: .. .. . :  : :...
XP_011 IGIAEYFFKSASFAHFTAGVFNVTLSTEEISNHFVQNSQGLGNVLSRIAEIYILSQPFMV
     280       290       300       310       320       330         

              450       460       470       480       490          
pF1KB7 RIQVLNPPSVMLQKDKALVKVLATAEVMVSQPKDLETTICLIDVDTEFLASFSTE----G
       ::.. .:: . ::  .  . . :.  .:..:::.  .:.  : :. .:.:: :.     :
XP_011 RIMATEPPIINLQPGNFTLDIPASI-MMLTQPKN--STVETI-VSMDFVASTSVGLVILG
     340       350       360        370          380       390     

        500       510       520       530       540       550      
pF1KB7 DKLMIDAKLEKTSLNLRTSNVGNFDIGLMEVLVEKIFDLAFMPAMNAVLGSGVPLPKILN
       ..:. . .:..  : :  :: .:...  .: .. .:. .. .:  :: : .: :: .  .
XP_011 QRLVCSLSLNRFRLALPESNRSNIEVLRFENILSSILHFGVLPLANAKLQQGFPLSNPHK
         400       410       420       430       440       450     

        560       570                                      
pF1KB7 IDFSNADIDVLEDLLVLSA                                 
       . : :.::.::: .:..:                                  
XP_011 FLFVNSDIEVLEGFLLISTDLKYETSSKQQPSFHVWEGLNLISRQWRGKSAP
         460       470       480       490       500       

>>NP_777592 (OMIM: 614109) BPI fold-containing family C   (507 aa)
 initn: 263 init1: 214 opt: 367  Z-score: 302.8  bits: 65.8 E(85289): 4e-10
Smith-Waterman score: 367; 24.8% identity (58.3% similar) in 408 aa overlap (186-574:81-473)

         160       170       180       190       200       210     
pF1KB7 GLLGDGGLLGGGGVLGVLGEGGILSTVQGITGLRIVELTLPRVSVRLLPGVGVYLSLYTR
                                     ....:  ...: .:. ..::::.  .: ..
NP_777 EQMLKEKKLPDLSGSESLEFLKVDYVNYNFSNIKISAFSFPNTSLAFVPGVGIK-ALTNH
               60        70        80        90       100          

         220                 230        240       250       260    
pF1KB7 VAINGKSLIGF----------LDIAVE-VNITAKVRLTMDRTGYPRLVIERCDTLLGGIK
        . : ..  ::           :. .  : .:. . :: .  :.: : .. : . :.  .
NP_777 GTANISTDWGFESPLFQDTGGADLFLSGVYFTGIIILTRNDFGHPTLKLQDCYAQLSHAH
     110       120       130       140       150       160         

          270       280       290          300       310       320 
pF1KB7 VKLLRGLLPNLVDNLVNRVLADVLPDL---LCPIVDVVLGLVNDQLGLVDSLIPLGILGS
       :..  : :  : ..... .   .: .:   ::::.   .  .: .:. .. :  .     
NP_777 VSF-SGELSVLYNSFAEPMEKPILKNLNEMLCPIIASEVKALNANLSTLEVLTKIDNYTL
     170        180       190       200       210       220        

             330       340       350       360        370       380
pF1KB7 VQYTFSSLPLVTGEFLELDLNTLVGEAGGGLIDYPLGWPAVSP-KPMPELPPMGDNTKSQ
       ..:.. : : .: ..:.:.:.        :.. :::   .  : .:.: . :  .:.   
NP_777 LDYSLISSPEITENYLDLNLK--------GVF-YPLENLTDPPFSPVPFVLPERSNSMLY
      230       240               250        260       270         

              390       400       410       420       430       440
pF1KB7 LAMSANFLGSVLTLLQKQHALDLDITNGMFEELPPLTTATLGALIPKVFQQYPESCPLII
       ....  :. :.        .... ...  . .    ..  :: .. .. . :  : :...
NP_777 IGIAEYFFKSASFAHFTAGVFNVTLSTEEISNHFVQNSQGLGNVLSRIAEIYILSQPFMV
     280       290       300       310       320       330         

              450       460       470       480       490          
pF1KB7 RIQVLNPPSVMLQKDKALVKVLATAEVMVSQPKDLETTICLIDVDTEFLASFSTE----G
       ::.. .:: . ::  .  . . :.  .:..:::.  .:.  : :. .:.:: :.     :
NP_777 RIMATEPPIINLQPGNFTLDIPASI-MMLTQPKN--STVETI-VSMDFVASTSVGLVILG
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       . : :.::.::: .:..:                                  
NP_777 FLFVNSDIEVLEGFLLISTDLKYETSSKQQPSFHVWEGLNLISRQWRGKSAP
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        . : ..  ::           :. .  : .:. . :: .  :.: : .. : . :.  .
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       ....  :. :.        .... ...  . .    ..  :: .. .. . :  : :...
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       ::.. .:: . ::  .  . . :.  .:..:::.  .:.  : :. .:.:: :.     :
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       . : :.::.::: .:..:                                  
XP_011 FLFVNSDIEVLEGFLLISTDLKYETSSKQQPSFHVWEGLNLISRQWRGKSAP
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>>XP_011528392 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-contai  (507 aa)
 initn: 263 init1: 214 opt: 367  Z-score: 302.8  bits: 65.8 E(85289): 4e-10
Smith-Waterman score: 367; 24.8% identity (58.3% similar) in 408 aa overlap (186-574:81-473)

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pF1KB7 VAINGKSLIGF----------LDIAVE-VNITAKVRLTMDRTGYPRLVIERCDTLLGGIK
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       ....  :. :.        .... ...  . .    ..  :: .. .. . :  : :...
XP_011 IGIAEYFFKSASFAHFTAGVFNVTLSTEEISNHFVQNSQGLGNVLSRIAEIYILSQPFMV
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       ::.. .:: . ::  .  . . :.  .:..:::.  .:.  : :. .:.:: :.     :
XP_011 RIMATEPPIINLQPGNFTLDIPASI-MMLTQPKN--STVETI-VSMDFVASTSVGLVILG
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pF1KB7 DKLMIDAKLEKTSLNLRTSNVGNFDIGLMEVLVEKIFDLAFMPAMNAVLGSGVPLPKILN
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XP_011 QRLVCSLSLNRFRLALPESNRSNIEVLRFENILSSILHFGVLPLANAKLQQGFPLSNPHK
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pF1KB7 IDFSNADIDVLEDLLVLSA                                 
       . : :.::.::: .:..:                                  
XP_011 FLFVNSDIEVLEGFLLISTDLKYETSSKQQPSFHVWEGLNLISRQWRGKSAP
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pF1KB7 AINGK--------SLIGFLDIAVE-VNITAKVRLTMDRT-GYPRLVIERCDTLLGGIKVK
        :.::        .. : .:...: ..:.: ..:  . : : : ..   :.. .....:.
NP_001 KISGKWKAQKRFLKMSGNFDLSIEGMSISADLKLGSNPTSGKPTITCSSCSSHINSVHVH
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pF1KB7 LLR---GLLPNLVDNLVNRVLADVLPDLLCP-IVDVVLGLVNDQLGLVDSLIPLGILGSV
       . .   : : .:  . .. .: . . . .:  ... : . ..  .  .  .  .  ....
NP_001 ISKSKVGWLIQLFHKKIESALRNKMNSQVCEKVTNSVSSELQPYFQTLPVMTKIDSVAGI
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pF1KB7 QYTFSSLPLVTGEFLELDLNTLVGEAGGGLIDYPLGWPAVSPKPMPELPPMGDNTKSQLA
       .: . . : .:.: :.....   ::  .     :   :  .: :. :.:   :     :.
NP_001 NYGLVAPPATTAETLDVQMK---GEFYSENHHNP---PPFAP-PVMEFPAAHDRM-VYLG
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pF1KB7 MSANFLGSVLTLLQKQHALDLDITNGMFEELPP--LTTATLGALIPKVFQQYPESCPLII
       .:  :....  . :.  .: . . . :. .     :::  .:...:.: ...: .  . :
NP_001 LSDYFFNTAGLVYQEAGVLKMTLRDDMIPKESKFRLTTKFFGTFLPEVAKKFP-NMKIQI
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pF1KB7 RIQVLNPPSVMLQKDKALVKVLATAEVMVSQPKDLETTICLIDVDTEFLASFSTEGDKLM
       .... .:: . .:         . .....  :..  ... :: . :      :.:...:.
NP_001 HVSASTPPHLSVQPTGLTFYPAVDVQAFAVLPNSSLASLFLIGMHTTGSMEVSAESNRLV
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pF1KB7 IDAKLEKTSLNLRTSNVGNFDIGLMEVLVEKIFDLAFMPAMNAVLGSGVPLPKILNIDFS
        . ::..  :.:. ::.: : . :.. ... :  .  .: .:  : .: :::    ... 
NP_001 GELKLDRLLLELKHSNIGPFPVELLQDIMNYIVPILVLPRVNEKLQKGFPLPTPARVQLY
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pF1KB7 NADIDVLEDLLVLSA     
       :. ..  ...:...:     
NP_001 NVVLQPHQNFLLFGADVVYK
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575 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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