Result of FASTA (ccds) for pF1KB7194
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7194, 676 aa
  1>>>pF1KB7194 676 - 676 aa - 676 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7518+/-0.000991; mu= 7.2297+/- 0.060
 mean_var=239.9754+/-48.560, 0's: 0 Z-trim(114.0): 50  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.082792
 statistics sampled from 14555 (14605) to 14555 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.752), E-opt: 0.2 (0.449), width:  16
 Scan time:  4.310

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS7736.1 KCNQ1 gene_id:3784|Hs108|chr11          ( 676) 4541 555.5 8.8e-158
CCDS55037.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6         ( 923) 1440 185.2 3.5e-46
CCDS4976.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6          ( 932) 1411 181.8 3.9e-45
CCDS34943.1 KCNQ3 gene_id:3786|Hs108|chr8          ( 872) 1254 163.0 1.6e-39
CCDS55035.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6         ( 822) 1195 155.9 2.1e-37
CCDS56554.1 KCNQ3 gene_id:3786|Hs108|chr8          ( 752) 1188 155.1 3.5e-37
CCDS55034.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6         ( 951) 1185 154.8 5.3e-37
CCDS13518.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20         ( 844) 1182 154.4 6.2e-37
CCDS13521.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20         ( 393) 1172 152.9 8.2e-37
CCDS456.1 KCNQ4 gene_id:9132|Hs108|chr1            ( 695) 1176 153.6 8.9e-37
CCDS46629.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20         ( 841) 1171 153.1 1.5e-36
CCDS13519.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20         ( 854) 1171 153.1 1.6e-36
CCDS13520.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20         ( 872) 1171 153.1 1.6e-36


>>CCDS7736.1 KCNQ1 gene_id:3784|Hs108|chr11               (676 aa)
 initn: 4541 init1: 4541 opt: 4541  Z-score: 2946.1  bits: 555.5 E(32554): 8.8e-158
Smith-Waterman score: 4541; 100.0% identity (100.0% similar) in 676 aa overlap (1-676:1-676)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MAAASSPPRAERKRWGWGRLPGARRGSAGLAKKCPFSLELAEGGPAGGALYAPIAPGAPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MAAASSPPRAERKRWGWGRLPGARRGSAGLAKKCPFSLELAEGGPAGGALYAPIAPGAPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 PAPPASPAAPAAPPVASDLGPRPPVSLDPRVSIYSTRRPVLARTHVQGRVYNFLERPTGW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PAPPASPAAPAAPPVASDLGPRPPVSLDPRVSIYSTRRPVLARTHVQGRVYNFLERPTGW
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 KCFVYHFAVFLIVLVCLIFSVLSTIEQYAALATGTLFWMEIVLVVFFGTEYVVRLWSAGC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KCFVYHFAVFLIVLVCLIFSVLSTIEQYAALATGTLFWMEIVLVVFFGTEYVVRLWSAGC
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 RSKYVGLWGRLRFARKPISIIDLIVVVASMVVLCVGSKGQVFATSAIRGIRFLQILRMLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RSKYVGLWGRLRFARKPISIIDLIVVVASMVVLCVGSKGQVFATSAIRGIRFLQILRMLH
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 VDRQGGTWRLLGSVVFIHRQELITTLYIGFLGLIFSSYFVYLAEKDAVNESGRVEFGSYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VDRQGGTWRLLGSVVFIHRQELITTLYIGFLGLIFSSYFVYLAEKDAVNESGRVEFGSYA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 DALWWGVVTVTTIGYGDKVPQTWVGKTIASCFSVFAISFFALPAGILGSGFALKVQQKQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DALWWGVVTVTTIGYGDKVPQTWVGKTIASCFSVFAISFFALPAGILGSGFALKVQQKQR
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 QKHFNRQIPAAASLIQTAWRCYAAENPDSSTWKIYIRKAPRSHTLLSPSPKPKKSVVVKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 QKHFNRQIPAAASLIQTAWRCYAAENPDSSTWKIYIRKAPRSHTLLSPSPKPKKSVVVKK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 KKFKLDKDNGVTPGEKMLTVPHITCDPPEERRLDHFSVDGYDSSVRKSPTLLEVSMPHFM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KKFKLDKDNGVTPGEKMLTVPHITCDPPEERRLDHFSVDGYDSSVRKSPTLLEVSMPHFM
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 RTNSFAEDLDLEGETLLTPITHISQLREHHRATIKVIRRMQYFVAKKKFQQARKPYDVRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RTNSFAEDLDLEGETLLTPITHISQLREHHRATIKVIRRMQYFVAKKKFQQARKPYDVRD
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB7 VIEQYSQGHLNLMVRIKELQRRLDQSIGKPSLFISVSEKSKDRGSNTIGARLNRVEDKVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VIEQYSQGHLNLMVRIKELQRRLDQSIGKPSLFISVSEKSKDRGSNTIGARLNRVEDKVT
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB7 QLDQRLALITDMLHQLLSLHGGSTPGSGGPPREGGAHITQPCGSGGSVDPELFLPSNTLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 QLDQRLALITDMLHQLLSLHGGSTPGSGGPPREGGAHITQPCGSGGSVDPELFLPSNTLP
              610       620       630       640       650       660

              670      
pF1KB7 TYEQLTVPRRGPDEGS
       ::::::::::::::::
CCDS77 TYEQLTVPRRGPDEGS
              670      

>>CCDS55037.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6              (923 aa)
 initn: 707 init1: 679 opt: 1440  Z-score: 942.6  bits: 185.2 E(32554): 3.5e-46
Smith-Waterman score: 1440; 44.5% identity (72.5% similar) in 541 aa overlap (92-617:98-622)

              70        80        90       100       110       120 
pF1KB7 APPASPAAPAAPPVASDLGPRPPVSLDPRVSIYSTRRPVLARTHVQGRVYNFLERPTGWK
                                     :  : :: :  : .::. .:: :::: :: 
CCDS55 LGGGGGGLRESRRGKQGARMSLLGKPLSYTSSQSCRRNVKYR-RVQNYLYNVLERPRGWA
        70        80        90       100        110       120      

             130       140       150       160       170       180 
pF1KB7 CFVYHFAVFLIVLVCLIFSVLSTIEQYAALATGTLFWMEIVLVVFFGTEYVVRLWSAGCR
        :.::  :::.:. :::.::.::: ... ::.. :. .:.:..: :: :...:.::::: 
CCDS55 -FIYHAFVFLLVFGCLILSVFSTIPEHTKLASSCLLILEFVMIVVFGLEFIIRIWSAGCC
         130       140       150       160       170       180     

             190       200       210       220       230       240 
pF1KB7 SKYVGLWGRLRFARKPISIIDLIVVVASMVVLCVGSKGQVFATSAIRGIRFLQILRMLHV
        .: :  :::::::::. .:: ::..::..:. . ..:..:::::.:..::::::::...
CCDS55 CRYRGWQGRLRFARKPFCVIDTIVLIASIAVVSAKTQGNIFATSALRSLRFLQILRMVRM
         190       200       210       220       230       240     

             250       260       270       280       290       300 
pF1KB7 DRQGGTWRLLGSVVFIHRQELITTLYIGFLGLIFSSYFVYLAEKDAVNESGRVEFGSYAD
       ::.::::.::::::. : .::::. ::::: :::::..:::.:::: :.    ::..:::
CCDS55 DRRGGTWKLLGSVVYAHSKELITAWYIGFLVLIFSSFLVYLVEKDA-NK----EFSTYAD
         250       260       270       280       290            300

             310       320       330       340       350       360 
pF1KB7 ALWWGVVTVTTIGYGDKVPQTWVGKTIASCFSVFAISFFALPAGILGSGFALKVQQKQRQ
       :::::..:.::::::::.: ::.:. ... :....::::::::::::::::::::...::
CCDS55 ALWWGTITLTTIGYGDKTPLTWLGRLLSAGFALLGISFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQ
              310       320       330       340       350       360

             370       380       390         400       410         
pF1KB7 KHFNRQIPAAASLIQTAWRCYAAENPDSS--TWKIYIRKAPRSHTLLSPSPKP---KKSV
       :::...   ::.::: .:: :::.. . :  ::: ...     ::  ::. .    :. :
CCDS55 KHFEKRRNPAANLIQCVWRSYAADEKSVSIATWKPHLKAL---HTC-SPTNQKLSFKERV
              370       380       390       400           410      

        420       430       440       450       460       470      
pF1KB7 VVKKKKFKLDKDNGVTPGEKMLTVPHITCDPPEERRLDHFSVDGYDSSVRKSPTL-LEVS
        . . . .  :.  .. :..      :: .    .    .:   ... .:  :.: :. :
CCDS55 RMASPRGQSIKSRQASVGDRRSPSTDITAEGSPTKVQKSWS---FNDRTRFRPSLRLKSS
        420       430       440       450          460       470   

          480       490       500       510       520       530    
pF1KB7 MPH-FMRTNSFAEDLDLEGETLLTPITHISQLREHHRATIKVIRRMQYFVAKKKFQQARK
       .:.  . ...     :.  :      . . .:    ...:..:: :.. :::.::... .
CCDS55 QPKPVIDADTALGTDDVYDEKGCQCDVSVEDLTPPLKTVIRAIRIMKFHVAKRKFKETLR
           480       490       500       510       520       530   

          540       550       560       570       580              
pF1KB7 PYDVRDVIEQYSQGHLNLMVRIKELQRRLDQSIGKPSLFISVSEKSKDRGSN--------
       ::::.::::::: :::... ::: :: :.:: .:: .  :. ..::... .         
CCDS55 PYDVKDVIEQYSAGHLDMLCRIKSLQTRVDQILGKGQ--ITSDKKSREKITAEHETTDDL
           540       550       560       570         580       590 

        590       600       610       620       630       640      
pF1KB7 TIGARLNRVEDKVTQLDQRLALITDMLHQLLSLHGGSTPGSGGPPREGGAHITQPCGSGG
       .. .:. .:: .: .....:  . :. .:.:                             
CCDS55 SMLGRVVKVEKQVQSIESKLDCLLDIYQQVLRKGSASALALASFQIPPFECEQTSDYQSP
             600       610       620       630       640       650 

        650       660       670                                    
pF1KB7 SVDPELFLPSNTLPTYEQLTVPRRGPDEGS                              
                                                                   
CCDS55 VDSKDLSGSAQNSGCLSRSTSANISRGLQFILTPNEFSAQTFYALSPTMHSQATQVPISQ
             660       670       680       690       700       710 

>>CCDS4976.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6               (932 aa)
 initn: 1353 init1: 679 opt: 1411  Z-score: 923.8  bits: 181.8 E(32554): 3.9e-45
Smith-Waterman score: 1432; 44.3% identity (72.3% similar) in 549 aa overlap (92-617:98-631)

              70        80        90       100       110       120 
pF1KB7 APPASPAAPAAPPVASDLGPRPPVSLDPRVSIYSTRRPVLARTHVQGRVYNFLERPTGWK
                                     :  : :: :  : .::. .:: :::: :: 
CCDS49 LGGGGGGLRESRRGKQGARMSLLGKPLSYTSSQSCRRNVKYR-RVQNYLYNVLERPRGWA
        70        80        90       100        110       120      

             130       140       150       160       170       180 
pF1KB7 CFVYHFAVFLIVLVCLIFSVLSTIEQYAALATGTLFWMEIVLVVFFGTEYVVRLWSAGCR
        :.::  :::.:. :::.::.::: ... ::.. :. .:.:..: :: :...:.::::: 
CCDS49 -FIYHAFVFLLVFGCLILSVFSTIPEHTKLASSCLLILEFVMIVVFGLEFIIRIWSAGCC
         130       140       150       160       170       180     

             190       200       210       220       230       240 
pF1KB7 SKYVGLWGRLRFARKPISIIDLIVVVASMVVLCVGSKGQVFATSAIRGIRFLQILRMLHV
        .: :  :::::::::. .:: ::..::..:. . ..:..:::::.:..::::::::...
CCDS49 CRYRGWQGRLRFARKPFCVIDTIVLIASIAVVSAKTQGNIFATSALRSLRFLQILRMVRM
         190       200       210       220       230       240     

             250       260       270       280       290       300 
pF1KB7 DRQGGTWRLLGSVVFIHRQELITTLYIGFLGLIFSSYFVYLAEKDAVNESGRVEFGSYAD
       ::.::::.::::::. : .::::. ::::: :::::..:::.:::: :.    ::..:::
CCDS49 DRRGGTWKLLGSVVYAHSKELITAWYIGFLVLIFSSFLVYLVEKDA-NK----EFSTYAD
         250       260       270       280       290            300

             310       320       330       340       350       360 
pF1KB7 ALWWGVVTVTTIGYGDKVPQTWVGKTIASCFSVFAISFFALPAGILGSGFALKVQQKQRQ
       :::::..:.::::::::.: ::.:. ... :....::::::::::::::::::::...::
CCDS49 ALWWGTITLTTIGYGDKTPLTWLGRLLSAGFALLGISFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQ
              310       320       330       340       350       360

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pF1KB7 KHFNRQIPAAASLIQTAWRCYAAENPDSS--TWKIYIRKAPRSHTLLSPSPKPKKSVVVK
       :::...   ::.::: .:: :::.. . :  ::: ...     ::  ::. : .  .  .
CCDS49 KHFEKRRNPAANLIQCVWRSYAADEKSVSIATWKPHLKAL---HTC-SPTKKEQGEASSS
              370       380       390       400           410      

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pF1KB7 KK-KFKLDKDNGVTPGEKMLTVPHITCDPPEERRLDHFSVDGYDSSVRKS----------
       .: .:: ..   ..:  . .   . .    .    : ....:  ..:.::          
CCDS49 QKLSFK-ERVRMASPRGQSIKSRQASVGDRRSPSTD-ITAEGSPTKVQKSWSFNDRTRFR
        420        430       440       450        460       470    

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pF1KB7 PTL-LEVSMPH-FMRTNSFAEDLDLEGETLLTPITHISQLREHHRATIKVIRRMQYFVAK
       :.: :. :.:.  . ...     :.  :      . . .:    ...:..:: :.. :::
CCDS49 PSLRLKSSQPKPVIDADTALGTDDVYDEKGCQCDVSVEDLTPPLKTVIRAIRIMKFHVAK
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pF1KB7 KKFQQARKPYDVRDVIEQYSQGHLNLMVRIKELQRRLDQSIGKPSLFISVSEKSKDRGSN
       .::... .::::.::::::: :::... ::: :: :.:: .:: .  :. ..::... . 
CCDS49 RKFKETLRPYDVKDVIEQYSAGHLDMLCRIKSLQTRVDQILGKGQ--ITSDKKSREKITA
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pF1KB7 --------TIGARLNRVEDKVTQLDQRLALITDMLHQLLSLHGGSTPGSGGPPREGGAHI
               .. .:. .:: .: .....:  . :. .:.:                     
CCDS49 EHETTDDLSMLGRVVKVEKQVQSIESKLDCLLDIYQQVLRKGSASALALASFQIPPFECE
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pF1KB7 TQPCGSGGSVDPELFLPSNTLPTYEQLTVPRRGPDEGS                      
                                                                   
CCDS49 QTSDYQSPVDSKDLSGSAQNSGCLSRSTSANISRGLQFILTPNEFSAQTFYALSPTMHSQ
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>>CCDS34943.1 KCNQ3 gene_id:3786|Hs108|chr8               (872 aa)
 initn: 985 init1: 441 opt: 1254  Z-score: 822.8  bits: 163.0 E(32554): 1.6e-39
Smith-Waterman score: 1254; 43.5% identity (71.7% similar) in 499 aa overlap (106-585:107-589)

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pF1KB7 ASDLGPRPPVSLDPRVSIYSTRRPVLARTHVQGRVYNFLERPTGWKCFVYHFAVFLIVLV
                                     .:  .:. :::: ::  ..::  :::::: 
CCDS34 GQRRTPQGIGLLAKTPLSRPVKRNNAKYRRIQTLIYDALERPRGWA-LLYHALVFLIVLG
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pF1KB7 CLIFSVLSTIEQYAALATGTLFWMEIVLVVFFGTEYVVRLWSAGCRSKYVGLWGRLRFAR
       :::..::.:...: ...   :. .:   . .::.:...:.:.:::  .: :  :::.:::
CCDS34 CLILAVLTTFKEYETVSGDWLLLLETFAIFIFGAEFALRIWAAGCCCRYKGWRGRLKFAR
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pF1KB7 KPISIIDLIVVVASMVVLCVGSKGQVFATSAIRGIRFLQILRMLHVDRQGGTWRLLGSVV
       ::. ..:..:..::. :. ::..:.:.::: .:..:::::::::..::.::::.::::..
CCDS34 KPLCMLDIFVLIASVPVVAVGNQGNVLATS-LRSLRFLQILRMLRMDRRGGTWKLLGSAI
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pF1KB7 FIHRQELITTLYIGFLGLIFSSYFVYLAEKDA--VNESG---RVEFGSYADALWWGVVTV
         : .::::. ::::: ::.::..:::.:::.  :. .:   . :: .::::::::..:.
CCDS34 CAHSKELITAWYIGFLTLILSSFLVYLVEKDVPEVDAQGEEMKEEFETYADALWWGLITL
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pF1KB7 TTIGYGDKVPQTWVGKTIASCFSVFAISFFALPAGILGSGFALKVQQKQRQKHFNRQIPA
       .:::::::.:.:: :. ::. ::....:::::::::::::.:::::...:::::...   
CCDS34 ATIGYGDKTPKTWEGRLIAATFSLIGVSFFALPAGILGSGLALKVQEQHRQKHFEKRRKP
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pF1KB7 AASLIQTAWRCYAAENPDS----STWKIY--IRKAP--RSHTLLSPSPKPKKSVVVKKKK
       :: :::.::: : : ::.     .::..:  . . :  :.. : . : . : ...    .
CCDS34 AAELIQAAWR-YYATNPNRIDLVATWRFYESVVSFPFFRKEQLEAASSQ-KLGLL---DR
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pF1KB7 FKLDKDNGVTPGEKMLT---VPHITCDPPEERR-LDHFSVDGYDSSVRKSPTLLEVSMPH
        .:..  : .   :..:   :  :  .: .: . .   . . . .. : .   .  :   
CCDS34 VRLSNPRGSNTKGKLFTPLNVDAIEESPSKEPKPVGLNNKERFRTAFRMKAYAFWQSSED
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pF1KB7 FMRTNSFAEDLDLEGETLLTPITHISQLREHHRATIKVIRRMQYFVAKKKFQQARKPYDV
           . .:::   .:     :   : ..    .:.:...: .:. . ::::... .::::
CCDS34 AGTGDPMAED---RGYGNDFP---IEDMIPTLKAAIRAVRILQFRLYKKKFKETLRPYDV
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pF1KB7 RDVIEQYSQGHLNLMVRIKELQRRLDQ--SIGKPSLFISVSEKSKDRGSNTIGARLNRVE
       .::::::: :::... ::: :: :.:.  . : ::   . ..:....::           
CCDS34 KDVIEQYSAGHLDMLSRIKYLQTRIDMIFTPGPPS---TPKHKKSQKGSAFTFPSQQSPR
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pF1KB7 DKVTQLDQRLALITDMLHQLLSLHGGSTPGSGGPPREGGAHITQPCGSGGSVDPELFLPS
                                                                   
CCDS34 NEPYVARPSTSEIEDQSMMGKFVKVERQVQDMGKKLDFLVDMHMQHMERLQVQVTEYYPT
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>>CCDS55035.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6              (822 aa)
 initn: 916 init1: 679 opt: 1195  Z-score: 785.1  bits: 155.9 E(32554): 2.1e-37
Smith-Waterman score: 1248; 42.9% identity (64.8% similar) in 534 aa overlap (92-617:98-521)

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pF1KB7 APPASPAAPAAPPVASDLGPRPPVSLDPRVSIYSTRRPVLARTHVQGRVYNFLERPTGWK
                                     :  : :: :  : .::. .:: :::: :: 
CCDS55 LGGGGGGLRESRRGKQGARMSLLGKPLSYTSSQSCRRNVKYR-RVQNYLYNVLERPRGWA
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pF1KB7 CFVYHFAVFLIVLVCLIFSVLSTIEQYAALATGTLFWMEIVLVVFFGTEYVVRLWSAGCR
        :.::  :::.:. :::.::.::: ... ::.. :. .:.:..: :: :...:.::::: 
CCDS55 -FIYHAFVFLLVFGCLILSVFSTIPEHTKLASSCLLILEFVMIVVFGLEFIIRIWSAGCC
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pF1KB7 SKYVGLWGRLRFARKPISIIDLIVVVASMVVLCVGSKGQVFATSAIRGIRFLQILRMLHV
        .: :  :::::::::. .:: ::..::..:. . ..:..:::::.:..::::::::...
CCDS55 CRYRGWQGRLRFARKPFCVIDTIVLIASIAVVSAKTQGNIFATSALRSLRFLQILRMVRM
         190       200       210       220       230       240     

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pF1KB7 DRQGGTWRLLGSVVFIHRQELITTLYIGFLGLIFSSYFVYLAEKDAVNESGRVEFGSYAD
       ::.::::.::::::. : .::::. ::::: :::::..:::.:::: :.    ::..:::
CCDS55 DRRGGTWKLLGSVVYAHSKELITAWYIGFLVLIFSSFLVYLVEKDA-NK----EFSTYAD
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pF1KB7 ALWWGVVTVTTIGYGDKVPQTWVGKTIASCFSVFAISFFALPAGILGSGFALKVQQKQRQ
       :::::..:.::::::::.: ::.:. ... :....::::::::::::::::::::...::
CCDS55 ALWWGTITLTTIGYGDKTPLTWLGRLLSAGFALLGISFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQ
              310       320       330       340       350       360

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pF1KB7 KHFNRQIPAAASLIQTAWRCYAAENPDSSTWKIYIRKAPRSHTLLSPSPKPKKSVVVKKK
       :::...   ::.::: .:: :::.                           .::: .   
CCDS55 KHFEKRRNPAANLIQCVWRSYAAD---------------------------EKSVSIATW
              370       380                                  390   

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pF1KB7 KFKLDKDNGVTPGEKMLTVPHITCDPPEERRLDHFSVDGYDSSVRKSPTLLEVSMPHFMR
       :          :  : :   : ::.: ....       :  ::                 
CCDS55 K----------PHLKAL---H-TCSPTKKEQ-------GEASS-----------------
                     400           410                             

             490       500       510       520       530       540 
pF1KB7 TNSFAEDLDLEGETLLTPITHISQLREHHRATIKVIRRMQYFVAKKKFQQARKPYDVRDV
                                           : :.. :::.::... .::::.::
CCDS55 ------------------------------------RIMKFHVAKRKFKETLRPYDVKDV
                                             420       430         

             550       560       570       580               590   
pF1KB7 IEQYSQGHLNLMVRIKELQRRLDQSIGKPSLFISVSEKSKDRGSN--------TIGARLN
       ::::: :::... ::: :: :.:: .:: .  :. ..::... .         .. .:. 
CCDS55 IEQYSAGHLDMLCRIKSLQTRVDQILGKGQ--ITSDKKSREKITAEHETTDDLSMLGRVV
     440       450       460         470       480       490       

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pF1KB7 RVEDKVTQLDQRLALITDMLHQLLSLHGGSTPGSGGPPREGGAHITQPCGSGGSVDPELF
       .:: .: .....:  . :. .:.:                                    
CCDS55 KVEKQVQSIESKLDCLLDIYQQVLRKGSASALALASFQIPPFECEQTSDYQSPVDSKDLS
       500       510       520       530       540       550       

>>CCDS56554.1 KCNQ3 gene_id:3786|Hs108|chr8               (752 aa)
 initn: 944 init1: 441 opt: 1188  Z-score: 781.1  bits: 155.1 E(32554): 3.5e-37
Smith-Waterman score: 1188; 43.2% identity (72.0% similar) in 479 aa overlap (126-585:6-469)

         100       110       120       130       140       150     
pF1KB7 TRRPVLARTHVQGRVYNFLERPTGWKCFVYHFAVFLIVLVCLIFSVLSTIEQYAALATGT
                                     : ..::::: :::..::.:...: ...   
CCDS56                          MKPAEHATMFLIVLGCLILAVLTTFKEYETVSGDW
                                        10        20        30     

         160       170       180       190       200       210     
pF1KB7 LFWMEIVLVVFFGTEYVVRLWSAGCRSKYVGLWGRLRFARKPISIIDLIVVVASMVVLCV
       :. .:   . .::.:...:.:.:::  .: :  :::.:::::. ..:..:..::. :. :
CCDS56 LLLLETFAIFIFGAEFALRIWAAGCCCRYKGWRGRLKFARKPLCMLDIFVLIASVPVVAV
          40        50        60        70        80        90     

         220       230       240       250       260       270     
pF1KB7 GSKGQVFATSAIRGIRFLQILRMLHVDRQGGTWRLLGSVVFIHRQELITTLYIGFLGLIF
       :..:.:.::: .:..:::::::::..::.::::.::::..  : .::::. ::::: ::.
CCDS56 GNQGNVLATS-LRSLRFLQILRMLRMDRRGGTWKLLGSAICAHSKELITAWYIGFLTLIL
         100        110       120       130       140       150    

         280         290          300       310       320       330
pF1KB7 SSYFVYLAEKDA--VNESG---RVEFGSYADALWWGVVTVTTIGYGDKVPQTWVGKTIAS
       ::..:::.:::.  :. .:   . :: .::::::::..:..:::::::.:.:: :. ::.
CCDS56 SSFLVYLVEKDVPEVDAQGEEMKEEFETYADALWWGLITLATIGYGDKTPKTWEGRLIAA
          160       170       180       190       200       210    

              340       350       360       370       380          
pF1KB7 CFSVFAISFFALPAGILGSGFALKVQQKQRQKHFNRQIPAAASLIQTAWRCYAAENPDS-
        ::....:::::::::::::.:::::...:::::...   :: :::.::: : : ::.  
CCDS56 TFSLIGVSFFALPAGILGSGLALKVQEQHRQKHFEKRRKPAAELIQAAWR-YYATNPNRI
          220       230       240       250       260        270   

        390         400         410       420       430            
pF1KB7 ---STWKIY--IRKAP--RSHTLLSPSPKPKKSVVVKKKKFKLDKDNGVTPGEKMLT---
          .::..:  . . :  :.. : . : . : ...    . .:..  : .   :..:   
CCDS56 DLVATWRFYESVVSFPFFRKEQLEAASSQ-KLGLL---DRVRLSNPRGSNTKGKLFTPLN
           280       290       300           310       320         

     440       450        460       470       480       490        
pF1KB7 VPHITCDPPEERR-LDHFSVDGYDSSVRKSPTLLEVSMPHFMRTNSFAEDLDLEGETLLT
       :  :  .: .: . .   . . . .. : .   .  :       . .:::   .:     
CCDS56 VDAIEESPSKEPKPVGLNNKERFRTAFRMKAYAFWQSSEDAGTGDPMAED---RGYGNDF
     330       340       350       360       370          380      

      500       510       520       530       540       550        
pF1KB7 PITHISQLREHHRATIKVIRRMQYFVAKKKFQQARKPYDVRDVIEQYSQGHLNLMVRIKE
       ::    ..    .:.:...: .:. . ::::... .::::.::::::: :::... ::: 
CCDS56 PIE---DMIPTLKAAIRAVRILQFRLYKKKFKETLRPYDVKDVIEQYSAGHLDMLSRIKY
           390       400       410       420       430       440   

      560         570       580       590       600       610      
pF1KB7 LQRRLDQ--SIGKPSLFISVSEKSKDRGSNTIGARLNRVEDKVTQLDQRLALITDMLHQL
       :: :.:.  . : ::   . ..:....::                               
CCDS56 LQTRIDMIFTPGPPS---TPKHKKSQKGSAFTFPSQQSPRNEPYVARPSTSEIEDQSMMG
           450          460       470       480       490       500

>>CCDS55034.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6              (951 aa)
 initn: 932 init1: 679 opt: 1185  Z-score: 777.8  bits: 154.8 E(32554): 5.3e-37
Smith-Waterman score: 1408; 43.3% identity (69.9% similar) in 568 aa overlap (92-617:98-650)

              70        80        90       100       110       120 
pF1KB7 APPASPAAPAAPPVASDLGPRPPVSLDPRVSIYSTRRPVLARTHVQGRVYNFLERPTGWK
                                     :  : :: :  : .::. .:: :::: :: 
CCDS55 LGGGGGGLRESRRGKQGARMSLLGKPLSYTSSQSCRRNVKYR-RVQNYLYNVLERPRGWA
        70        80        90       100        110       120      

             130       140       150       160       170       180 
pF1KB7 CFVYHFAVFLIVLVCLIFSVLSTIEQYAALATGTLFWMEIVLVVFFGTEYVVRLWSAGCR
        :.::  :::.:. :::.::.::: ... ::.. :. .:.:..: :: :...:.::::: 
CCDS55 -FIYHAFVFLLVFGCLILSVFSTIPEHTKLASSCLLILEFVMIVVFGLEFIIRIWSAGCC
         130       140       150       160       170       180     

             190       200       210       220       230       240 
pF1KB7 SKYVGLWGRLRFARKPISIIDLIVVVASMVVLCVGSKGQVFATSAIRGIRFLQILRMLHV
        .: :  :::::::::. .:: ::..::..:. . ..:..:::::.:..::::::::...
CCDS55 CRYRGWQGRLRFARKPFCVIDTIVLIASIAVVSAKTQGNIFATSALRSLRFLQILRMVRM
         190       200       210       220       230       240     

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pF1KB7 DRQGGTWRLLGSVVFIHRQELITTLYIGFLGLIFSSYFVYLAEKDAVNESGRVEFGSYAD
       ::.::::.::::::. : .::::. ::::: :::::..:::.:::: :.    ::..:::
CCDS55 DRRGGTWKLLGSVVYAHSKELITAWYIGFLVLIFSSFLVYLVEKDA-NK----EFSTYAD
         250       260       270       280       290            300

             310       320       330       340       350       360 
pF1KB7 ALWWGVVTVTTIGYGDKVPQTWVGKTIASCFSVFAISFFALPAGILGSGFALKVQQKQRQ
       :::::..:.::::::::.: ::.:. ... :....::::::::::::::::::::...::
CCDS55 ALWWGTITLTTIGYGDKTPLTWLGRLLSAGFALLGISFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQ
              310       320       330       340       350       360

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pF1KB7 KHFNRQIPAAASLIQTAWRCYAAENPDSS--TWKIYIRKAPRSHTLLSPSPKPK------
       :::...   ::.::: .:: :::.. . :  ::: ...     ::  ::. : .      
CCDS55 KHFEKRRNPAANLIQCVWRSYAADEKSVSIATWKPHLKAL---HTC-SPTKKEQGEASSS
              370       380       390       400           410      

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pF1KB7 KSVVVKKKKFKLDKDNGVTPGEKMLTVPHITCDPPE------------ERRLDHFSV--D
       :    :.: :..  .     ..:.    ..    :.            .::    ..  .
CCDS55 KFCSNKQKLFRMYTSR--KQSQKLSFKERVRMASPRGQSIKSRQASVGDRRSPSTDITAE
        420       430         440       450       460       470    

     460                 470         480       490       500       
pF1KB7 GYDSSVRKS----------PTL-LEVSMPH-FMRTNSFAEDLDLEGETLLTPITHISQLR
       :  ..:.::          :.: :. :.:.  . ...     :.  :      . . .: 
CCDS55 GSPTKVQKSWSFNDRTRFRPSLRLKSSQPKPVIDADTALGTDDVYDEKGCQCDVSVEDLT
          480       490       500       510       520       530    

       510       520       530       540       550       560       
pF1KB7 EHHRATIKVIRRMQYFVAKKKFQQARKPYDVRDVIEQYSQGHLNLMVRIKELQRRLDQSI
          ...:..:: :.. :::.::... .::::.::::::: :::... ::: :: :.:: .
CCDS55 PPLKTVIRAIRIMKFHVAKRKFKETLRPYDVKDVIEQYSAGHLDMLCRIKSLQTRVDQIL
          540       550       560       570       580       590    

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pF1KB7 GKPSLFISVSEKSKDRGSN--------TIGARLNRVEDKVTQLDQRLALITDMLHQLLSL
       :: .  :. ..::... .         .. .:. .:: .: .....:  . :. .:.:  
CCDS55 GKGQ--ITSDKKSREKITAEHETTDDLSMLGRVVKVEKQVQSIESKLDCLLDIYQQVLRK
            600       610       620       630       640       650  

     620       630       640       650       660       670         
pF1KB7 HGGSTPGSGGPPREGGAHITQPCGSGGSVDPELFLPSNTLPTYEQLTVPRRGPDEGS   
                                                                   
CCDS55 GSASALALASFQIPPFECEQTSDYQSPVDSKDLSGSAQNSGCLSRSTSANISRGLQFILT
            660       670       680       690       700       710  

>>CCDS13518.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20              (844 aa)
 initn: 1264 init1: 674 opt: 1182  Z-score: 776.5  bits: 154.4 E(32554): 6.2e-37
Smith-Waterman score: 1406; 38.4% identity (64.4% similar) in 677 aa overlap (44-671:13-656)

            20        30        40        50        60          70 
pF1KB7 RWGWGRLPGARRGSAGLAKKCPFSLELAEGGPAGGALYAPIAPGAPG--PAPPASPAAPA
                                     ::.:      .  :  :  :. : :    :
CCDS13                   MVQKSRNGGVYPGPSG---EKKLKVGFVGLDPGAPDSTRDGA
                                 10           20        30         

              80        90           100       110       120       
pF1KB7 APPVASDLGPRPPVSLDPRVSIYSTRRP----VLARTHVQGRVYNFLERPTGWKCFVYHF
          ..:.   :  .   ::..  .. .:    .. : ..:. .:: :::: ::  :.:: 
CCDS13 LLIAGSEAPKRGSILSKPRAGGAGAGKPPKRNAFYR-KLQNFLYNVLERPRGWA-FIYHA
      40        50        60        70         80        90        

       130       140       150       160       170       180       
pF1KB7 AVFLIVLVCLIFSVLSTIEQYAALATGTLFWMEIVLVVFFGTEYVVRLWSAGCRSKYVGL
        :::.:. ::..::.:::..:   . :.:. .::: .: ::.:: ::.:.:::  .: : 
CCDS13 YVFLLVFSCLVLSVFSTIKEYEKSSEGALYILEIVTIVVFGVEYFVRIWAAGCCCRYRGW
       100       110       120       130       140       150       

       190       200       210       220       230       240       
pF1KB7 WGRLRFARKPISIIDLIVVVASMVVLCVGSKGQVFATSAIRGIRFLQILRMLHVDRQGGT
        :::.:::::. .::..:..::..:: .::.:.::::::.:..::::::::...::.:::
CCDS13 RGRLKFARKPFCVIDIMVLIASIAVLAAGSQGNVFATSALRSLRFLQILRMIRMDRRGGT
       160       170       180       190       200       210       

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pF1KB7 WRLLGSVVFIHRQELITTLYIGFLGLIFSSYFVYLAEKDAVNESGRVEFGSYADALWWGV
       :.::::::. : .::.:. ::::: ::..:..::::::   ..     : .::::::::.
CCDS13 WKLLGSVVYAHSKELVTAWYIGFLCLILASFLVYLAEKGENDH-----FDTYADALWWGL
       220       230       240       250       260            270  

       310       320       330       340       350       360       
pF1KB7 VTVTTIGYGDKVPQTWVGKTIASCFSVFAISFFALPAGILGSGFALKVQQKQRQKHFNRQ
       .:.:::::::: :::: :. .:. :.....:::::::::::::::::::...:::::...
CCDS13 ITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAATFTLIGVSFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKR
            280       290       300       310       320       330  

       370       380          390       400        410       420   
pF1KB7 IPAAASLIQTAWRCYAAENPDS---STWKIYIRKAPRS-HTLLSPSPKPKKSVVVKKKK-
          ::.:::.::: ::..   .   :::. : : .    . :. :  . .    .:.:. 
CCDS13 RNPAAGLIQSAWRFYATNLSRTDLHSTWQYYERTVTVPMYRLIPPLNQLELLRNLKSKSG
            340       350       360       370       380       390  

              430       440       450       460       470          
pF1KB7 --FKLDKDNGVTPGEKMLTVPHITCDPPEERRLDHFSVDGYDSSVRKSPTL---LEVSMP
         :. :     .:..:.    ..  .:       . : ..  ..::.::.    :: :  
CCDS13 LAFRKDPPPEPSPSQKVSLKDRVFSSPRGVAAKGKGSPQA--QTVRRSPSADQSLEDSPS
            400       410       420       430         440       450

       480                           490           500        510  
pF1KB7 HFMRTNSF--------------------AEDLDLEGETLLT----PITHISQ-LREHHRA
       .  .. ::                    .:. .: :: ..     :   ... :    ..
CCDS13 KVPKSWSFGDRSRARQAFRIKGAASRQNSEEASLPGEDIVDDKSCPCEFVTEDLTPGLKV
              460       470       480       490       500       510

            520       530       540       550       560       570  
pF1KB7 TIKVIRRMQYFVAKKKFQQARKPYDVRDVIEQYSQGHLNLMVRIKELQRRLDQSIGKPSL
       .:...  :...:.:.::... .:::: ::::::: :::... ::: :: :.:: .:.   
CCDS13 SIRAVCVMRFLVSKRKFKESLRPYDVMDVIEQYSAGHLDMLSRIKSLQSRVDQIVGRGP-
              520       530       540       550       560          

            580               590       600       610       620    
pF1KB7 FISVSEKSKDRGSN--------TIGARLNRVEDKVTQLDQRLALITDMLHQLLSLHGGST
         ....:.. .:          .. .::..:: .: .....: .....  : .       
CCDS13 --AITDKDRTKGPAEAELPEDPSMMGRLGKVEKQVLSMEKKLDFLVNIYMQRM-------
       570       580       590       600       610       620       

          630       640       650       660       670              
pF1KB7 PGSGGPPREGGAHITQPCGSGGSVDPELFLPSNTLPTYEQLTVPRRGPDEGS        
          : :: :  :..       :. .::   : .. :   .  : :.:             
CCDS13 ---GIPPTETEAYF-------GAKEPEPAPPYHS-PEDSREHVDRHGCIVKIVRSSSSTG
                 630              640        650       660         

CCDS13 QKNFSAPPAAPPVQCPPSTSWQPQSHPRQGHGTSPVGDHGSLVRIPPPPAHERSLSAYGG
     670       680       690       700       710       720         

>>CCDS13521.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20              (393 aa)
 initn: 1095 init1: 674 opt: 1172  Z-score: 774.4  bits: 152.9 E(32554): 8.2e-37
Smith-Waterman score: 1172; 48.2% identity (73.7% similar) in 392 aa overlap (44-425:13-387)

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                                     ::.:     . .. . ::::  .  ..   
CCDS13                   MVQKSRNGGVYPGPSGEKKLKVGFVGLDPGAPDSTRDGALLI
                                 10        20        30        40  

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       :.  ::  .: :. ::   .   .      .: .. : ..:. .:: :::: ::  :.::
CCDS13 AGSEAPKRGSILSKPRAGGAGAGK----PPKRNAFYR-KLQNFLYNVLERPRGWA-FIYH
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pF1KB7 FAVFLIVLVCLIFSVLSTIEQYAALATGTLFWMEIVLVVFFGTEYVVRLWSAGCRSKYVG
         :::.:. ::..::.:::..:   . :.:. .::: .: ::.:: ::.:.:::  .: :
CCDS13 AYVFLLVFSCLVLSVFSTIKEYEKSSEGALYILEIVTIVVFGVEYFVRIWAAGCCCRYRG
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         :::.:::::. .::..:..::..:: .::.:.::::::.:..::::::::...::.::
CCDS13 WRGRLKFARKPFCVIDIMVLIASIAVLAAGSQGNVFATSALRSLRFLQILRMIRMDRRGG
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       ::.::::::. : .::.:. ::::: ::..:..::::::   ..     : .::::::::
CCDS13 TWKLLGSVVYAHSKELVTAWYIGFLCLILASFLVYLAEKGENDH-----FDTYADALWWG
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pF1KB7 VVTVTTIGYGDKVPQTWVGKTIASCFSVFAISFFALPAGILGSGFALKVQQKQRQKHFNR
       ..:.:::::::: :::: :. .:. :.....:::::::::::::::::::...:::::..
CCDS13 LITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAATFTLIGVSFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEK
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pF1KB7 QIPAAASLIQTAWRCYAAENPDS---STWKIYIRKAPRSHTLLSPSPKPKKSVVVKKKKF
       .   ::.:::.::: ::..   .   :::. : :      :.  :  . .. . . :. :
CCDS13 RRNPAAGLIQSAWRFYATNLSRTDLHSTWQYYER------TVTVPMYRYRRRAPATKQLF
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       ..                                                          
CCDS13 HFLFSICS                                                    
         390                                                       

>>CCDS456.1 KCNQ4 gene_id:9132|Hs108|chr1                 (695 aa)
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pF1KB7 MAAASSPPRAERKRWGWGRLPG-ARRGSAGLAKKCPFSLELAEGGPAG-----GALYAPI
          : .:::    : : :  :: : :  : :.     . : .:.: .:     : : .:.
CCDS45   MAEAPPR----RLGLGPPPGDAPR--AELVALTAVQSEQGEAGGGGSPRRLGLLGSPL
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        :::: :.: .. .        :  : :  ..   :      ::       .:. ::: :
CCDS45 PPGAPLPGPGSGSG--------SACGQRSSAA-HKRY-----RR-------LQNWVYNVL
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       ::: ::  ::::  .::.:. ::..::::::...  ::.  :. .:.:..: :: ::.::
CCDS45 ERPRGWA-FVYHVFIFLLVFSCLVLSVLSTIQEHQELANECLLILEFVMIVVFGLEYIVR
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       .:::::  .: :  ::.::::::. .::.:: :::..:. .:..:..:::::.:..::::
CCDS45 VWSAGCCCRYRGWQGRFRFARKPFCVIDFIVFVASVAVIAAGTQGNIFATSALRSMRFLQ
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CCDS45 ILRMVRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELITAWYIGFLVLIFASFLVYLAEKDANSD----
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        :.::::.::::..:.::::::::.:.::.:...:. :....::::::::::::::::::
CCDS45 -FSSYADSLWWGTITLTTIGYGDKTPHTWLGRVLAAGFALLGISFFALPAGILGSGFALK
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       ::...:::::...   ::.:::.::: :...      ..::  :                
CCDS45 VQEQHRQKHFEKRRMPAANLIQAAWRLYSTDMSRAYLTATWYYYDSILPSFRELALLFEH
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pF1KB7 -------------IRKAP-------------RSHTLLSPSPKPKKSVVVK-KKKFKLDKD
                    .:.::               :   : :  : .:  .  : .... ..
CCDS45 VQRARNGGLRPLEVRRAPVPDGAPSRYPPVATCHRPGSTSFCPGESSRMGIKDRIRMGSS
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pF1KB7 NGVT-PGEKMLTVPHITCDPPEERRLDHFSVDGYDSSVR-KSPTLLEVSM---PHFMRTN
       .  : :... :. : .  .:  :.  .  :    ..:   .. : ...:.   :.    .
CCDS45 QRRTGPSKQHLAPPTMPTSPSSEQVGEATSPTKVQKSWSFNDRTRFRASLRLKPRTSAED
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pF1KB7 SFAEDLDLEGETLLTPITHISQLREHHRATIKVIRRMQYFVAKKKFQQARKPYDVRDVIE
       . .:..  : ..    .: ....    ...:. :: ....:::.::... .::::.::::
CCDS45 APSEEVAEE-KSYQCELT-VDDIMPAVKTVIRSIRILKFLVAKRKFKETLRPYDVKDVIE
         510        520        530       540       550       560   

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       ::: :::... ::: :: :.:: .:.     .. ::. :.: .        .. .:. .:
CCDS45 QYSAGHLDMLGRIKSLQTRVDQIVGRGPGDRKAREKG-DKGPSDAEVVDEISMMGRVVKV
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676 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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