Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7161
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7161, 373 aa
1>>>pF1KB7161 373 - 373 aa - 373 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0942+/-0.000758; mu= 4.6073+/- 0.046
mean_var=136.5668+/-27.092, 0's: 0 Z-trim(113.9): 47 B-trim: 175 in 1/51
Lambda= 0.109749
statistics sampled from 14440 (14487) to 14440 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.774), E-opt: 0.2 (0.445), width: 16
Scan time: 3.010
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14678.1 MAGEC2 gene_id:51438|Hs108|chrX ( 373) 2469 401.7 5.4e-112
CCDS35417.1 MAGEC1 gene_id:9947|Hs108|chrX (1142) 1157 194.1 5e-49
CCDS14677.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX ( 346) 1013 171.1 1.3e-42
CCDS14705.1 MAGEA10 gene_id:4109|Hs108|chrX ( 369) 982 166.3 4e-41
CCDS14221.1 MAGEB4 gene_id:4115|Hs108|chrX ( 346) 822 140.9 1.6e-33
CCDS35221.1 MAGEB10 gene_id:139422|Hs108|chrX ( 347) 805 138.2 1e-32
CCDS59524.1 MAGEB17 gene_id:645864|Hs108|chrX ( 336) 798 137.1 2.2e-32
CCDS14691.1 MAGEA9 gene_id:4108|Hs108|chrX ( 315) 795 136.6 2.9e-32
CCDS35423.1 MAGEA9B gene_id:728269|Hs108|chrX ( 315) 795 136.6 2.9e-32
CCDS48180.1 MAGEA11 gene_id:4110|Hs108|chrX ( 429) 790 135.9 6.5e-32
CCDS14216.1 MAGEB18 gene_id:286514|Hs108|chrX ( 343) 786 135.2 8.3e-32
CCDS14222.1 MAGEB1 gene_id:4112|Hs108|chrX ( 347) 773 133.1 3.5e-31
CCDS43927.1 MAGEB16 gene_id:139604|Hs108|chrX ( 324) 767 132.2 6.3e-31
CCDS14702.1 MAGEA4 gene_id:4103|Hs108|chrX ( 317) 746 128.9 6.2e-30
CCDS14219.1 MAGEB2 gene_id:4113|Hs108|chrX ( 319) 738 127.6 1.5e-29
CCDS14692.1 MAGEA8 gene_id:4107|Hs108|chrX ( 318) 732 126.6 2.9e-29
CCDS14676.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX ( 643) 731 126.6 6.1e-29
CCDS14220.1 MAGEB3 gene_id:4114|Hs108|chrX ( 346) 717 124.3 1.6e-28
CCDS76050.1 MAGEA6 gene_id:4105|Hs108|chrX ( 314) 714 123.8 2.1e-28
CCDS76045.1 MAGEA3 gene_id:4102|Hs108|chrX ( 314) 710 123.2 3.2e-28
CCDS76046.1 MAGEA2B gene_id:266740|Hs108|chrX ( 314) 690 120.0 2.9e-27
CCDS76049.1 MAGEA2 gene_id:4101|Hs108|chrX ( 314) 690 120.0 2.9e-27
CCDS76048.1 MAGEA12 gene_id:4111|Hs108|chrX ( 314) 677 117.9 1.2e-26
CCDS76051.1 MAGEA1 gene_id:4100|Hs108|chrX ( 309) 668 116.5 3.2e-26
CCDS65233.1 MAGEB5 gene_id:347541|Hs108|chrX ( 275) 589 104.0 1.7e-22
CCDS10023.1 NSMCE3 gene_id:56160|Hs108|chr15 ( 304) 575 101.8 8.5e-22
CCDS14217.1 MAGEB6 gene_id:158809|Hs108|chrX ( 407) 563 99.9 4.1e-21
CCDS3269.1 MAGEF1 gene_id:64110|Hs108|chr3 ( 307) 520 93.1 3.6e-19
CCDS14433.1 MAGEE1 gene_id:57692|Hs108|chrX ( 957) 509 91.5 3.3e-18
CCDS14362.1 MAGED2 gene_id:10916|Hs108|chrX ( 606) 493 88.9 1.3e-17
CCDS14337.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 778) 492 88.8 1.8e-17
CCDS35279.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 834) 492 88.8 1.9e-17
CCDS73700.1 MAGEL2 gene_id:54551|Hs108|chr15 (1249) 494 89.2 2.2e-17
CCDS59527.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 309) 480 86.7 2.9e-17
CCDS43958.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 706) 480 86.9 6.1e-17
CCDS59528.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1034) 480 86.9 8.5e-17
CCDS43959.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1431) 480 87.0 1.1e-16
CCDS10014.1 NDN gene_id:4692|Hs108|chr15 ( 321) 467 84.7 1.3e-16
CCDS48116.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX ( 739) 465 84.5 3.3e-16
CCDS35281.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 739) 465 84.5 3.3e-16
CCDS14338.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 741) 465 84.5 3.3e-16
CCDS59529.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 962) 422 77.7 4.6e-14
CCDS14431.1 MAGEE2 gene_id:139599|Hs108|chrX ( 523) 410 75.7 1e-13
CCDS14369.1 MAGEH1 gene_id:28986|Hs108|chrX ( 219) 365 68.5 6.5e-12
>>CCDS14678.1 MAGEC2 gene_id:51438|Hs108|chrX (373 aa)
initn: 2469 init1: 2469 opt: 2469 Z-score: 2124.1 bits: 401.7 E(32554): 5.4e-112
Smith-Waterman score: 2469; 100.0% identity (100.0% similar) in 373 aa overlap (1-373:1-373)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPPVPGVPFRNVDNDSPTSVELEDWVDAQHPTDEEEEEASSASSTLYLVFSPSSFSTSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MPPVPGVPFRNVDNDSPTSVELEDWVDAQHPTDEEEEEASSASSTLYLVFSPSSFSTSSS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LILGGPEEEEVPSGVIPNLTESIPSSPPQGPPQGPSQSPLSSCCSSFSWSSFSEESSSQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LILGGPEEEEVPSGVIPNLTESIPSSPPQGPPQGPSQSPLSSCCSSFSWSSFSEESSSQK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GEDTGTCQGLPDSESSFTYTLDEKVAELVEFLLLKYEAEEPVTEAEMLMIVIKYKDYFPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GEDTGTCQGLPDSESSFTYTLDEKVAELVEFLLLKYEAEEPVTEAEMLMIVIKYKDYFPV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 ILKRAREFMELLFGLALIEVGPDHFCVFANTVGLTDEGSDDEGMPENSLLIIILSVIFIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ILKRAREFMELLFGLALIEVGPDHFCVFANTVGLTDEGSDDEGMPENSLLIIILSVIFIK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 GNCASEEVIWEVLNAVGVYAGREHFVYGEPRELLTKVWVQGHYLEYREVPHSSPPYYEFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GNCASEEVIWEVLNAVGVYAGREHFVYGEPRELLTKVWVQGHYLEYREVPHSSPPYYEFL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 WGPRAHSESIKKKVLEFLAKLNNTVPSSFPSWYKDALKDVEERVQATIDTADDATVMASE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 WGPRAHSESIKKKVLEFLAKLNNTVPSSFPSWYKDALKDVEERVQATIDTADDATVMASE
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB7 SLSVMSSNVSFSE
:::::::::::::
CCDS14 SLSVMSSNVSFSE
370
>>CCDS35417.1 MAGEC1 gene_id:9947|Hs108|chrX (1142 aa)
initn: 1131 init1: 750 opt: 1157 Z-score: 993.7 bits: 194.1 E(32554): 5e-49
Smith-Waterman score: 1176; 57.0% identity (74.3% similar) in 370 aa overlap (19-370:784-1140)
10 20 30 40
pF1KB7 MPPVPGVPFRNVDNDSPTSVELEDWVDAQHPTDEEEEEASSASSTLYL
: : . ....: . . :. :.: :
CCDS35 SLPQSFPESPQSPPEGPAQSPLQRPVSSFFSYTLASLLQSSHESPQSPPEGP-AQSPLQ-
760 770 780 790 800 810
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 VFSP-SSF--STSSSLILGGPEEEEVPSGVIPNLTESIPSSPPQGPPQGPSQSPLSSCCS
:: ::: :::::: ..: . .. : :: .. :..: :::. : :
CCDS35 --SPVSSFPSSTSSSLSQSSP---------VSSFPSSTSSSLSKSSPESPLQSPVISFSS
820 830 840 850 860
110 120 130 140 150
pF1KB7 SFSWSSFSEESSSQKGEDTGTCQ------GLPDSESS------FTYTLDEKVAELVEFLL
: : : ::::::: : :.. . .: :::: ::::::::: ::..:::
CCDS35 STSLSPFSEESSSPVDEYTSSSDTLLESDSLTDSESLIESEPLFTYTLDEKVDELARFLL
870 880 890 900 910 920
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 LKYEAEEPVTEAEMLMIVI-KYKDYFPVILKRAREFMELLFGLALIEVGPDHFCVFANTV
:::....:.:.:::: :: .: :::::...::::.:.:::..: :: :: ::.::.
CCDS35 LKYQVKQPITKAEMLTNVISRYTGYFPVIFRKAREFIEILFGISLREVDPDDSYVFVNTL
930 940 950 960 970 980
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 GLTDEG--SDDEGMPENSLLIIILSVIFIKGNCASEEVIWEVLNAVGVYAGREHFVYGEP
::.:: ::..:: .: :::.:::.:::::. :::::::.::...:: ::::::..:::
CCDS35 DLTSEGCLSDEQGMSQNRLLILILSIIFIKGTYASEEVIWDVLSGIGVRAGREHFAFGEP
990 1000 1010 1020 1030 1040
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 RELLTKVWVQGHYLEYREVPHSSPPYYEFLWGPRAHSESIKKKVLEFLAKLNNTVPSSFP
:::::::::: :::::::::.:::: :::::::::::: ::.::.:::: :.:::: .::
CCDS35 RELLTKVWVQEHYLEYREVPNSSPPRYEFLWGPRAHSEVIKRKVVEFLAMLKNTVPITFP
1050 1060 1070 1080 1090 1100
340 350 360 370
pF1KB7 SWYKDALKDVEERVQATIDTADDATVMASESLSVMSSNVSFSE
: :::::::::::.:: :::.::.:. : : :::: . :
CCDS35 SSYKDALKDVEERAQAIIDTTDDSTATESASSSVMSPSFSSE
1110 1120 1130 1140
>>CCDS14677.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX (346 aa)
initn: 1252 init1: 499 opt: 1013 Z-score: 878.7 bits: 171.1 E(32554): 1.3e-42
Smith-Waterman score: 1180; 56.8% identity (76.2% similar) in 340 aa overlap (1-318:1-339)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPPVPGVPFRNVDNDSPTSVELEDWVDAQHPTDEEEEEASSASSTLYLVFSPSSFSTSSS
:: :..: . ..: . :: :::: :::::.:::.::. . . ::: : :::
CCDS14 MPLFPNLPRLSFEEDFQNPSVTEDLVDAQDSIDEEEEDASSTSSSSFHFLFPSSSSLSSS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KB7 ----------LILGGPEEEEVPSGVIPNLTESIPSSPPQGPP--------QGPSQSPLSS
:::: ::.:..:.. .: : .: : :::::: :.: ::::.:
CCDS14 SPLSSPLPSTLILGVPEDEDMPAAGMPPLPQSPPEIPPQGPPKISPQGPPQSPPQSPLDS
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 CCSSFSWSSFSEESSSQKGEDTGTCQGLPDSESSFTYTLDEKVAELVEFLLLKYEAEEPV
: : . :. ..:::::.. :::.: ..::.::: :.:::::::::.::::::...:::
CCDS14 CSSPLLWTRLDEESSSEE-EDTATWHALPESESLPRYALDEKVAELVQFLLLKYQTKEPV
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KB7 TEAEMLMIVIK-YKDYFPVILKRAREFMELLFGLALIEVGPD-HFCVFANTVGLTDEGS-
:.:::: ::: ::::::.:. .:.::.::.::.:: .. :: : : .:. :: :::
CCDS14 TKAEMLTTVIKKYKDYFPMIFGKAHEFIELIFGIALTDMDPDNHSYFFEDTLDLTYEGSL
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 -DDEGMPENSLLIIILSVIFIKGNCASEEVIWEVLNAVGVYAGREHFVYGEPRELLTKVW
::.:::.: :::.:::.:::::.:. ::::::::.:.:: ::::::.::.::.::: :
CCDS14 IDDQGMPKNCLLILILSMIFIKGSCVPEEVIWEVLSAIGVCAGREHFIYGDPRKLLTIHW
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 VQGHYLEYREVPHSSPPYYEFLWGPRAHSESIKKKVLEFLAKLNNTVPSSFPSWYKDALK
:: .::::::::.:.:: ::::::::::::. :... :.
CCDS14 VQRKYLEYREVPNSAPPRYEFLWGPRAHSEASKRSLRVFIQAIQYHP
300 310 320 330 340
340 350 360 370
pF1KB7 DVEERVQATIDTADDATVMASESLSVMSSNVSFSE
>>CCDS14705.1 MAGEA10 gene_id:4109|Hs108|chrX (369 aa)
initn: 853 init1: 613 opt: 982 Z-score: 851.7 bits: 166.3 E(32554): 4e-41
Smith-Waterman score: 982; 47.1% identity (70.7% similar) in 382 aa overlap (1-373:1-369)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPPVPGVPFRNVDNDSPTSVELEDWVDAQHPTDEEEEEASSASSTLYLVFS-PSSFSTSS
:: .: ..: .. : . :: : ::. .::.:.. . : ::: :.::
CCDS14 MPRAPKRQRCMPEEDLQSQSETQGLEGAQAPLAVEEDASSSTSTSSSFPSSFPSSSSSSS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 S----LILGGPEEEEVPSGVIPNLTESIPSSPPQGPPQGPSQSPLSSCCSSFSWSSFSEE
: :: . ::: . . . :: :::. : .:: : .:. .. .:
CCDS14 SSCYPLIPSTPEEVSADDET-PN--------PPQSA-QIACSSP--SVVASLPLDQSDEG
70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 SSSQKGEDTGTCQGLPDSESSFTYTLDEKVAELVEFLLLKYEAEEPVTEAEMLMIVIK-Y
::::: :. .: : :::::: .::::..::.:::.::. .::.:.::.: ::. :
CCDS14 SSSQKEESPSTLQVLPDSESLPRSEIDEKVTDLVQFLLFKYQMKEPITKAEILESVIRNY
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 KDYFPVILKRAREFMELLFGLALIEVGPD-HFCVFANTVGLTDEG--SDDEGMPENSLLI
.:.::.....: : : :.::. . :: : : :.....::: .: :: ..::....::
CCDS14 EDHFPLLFSEASECMLLVFGIDVKEVDPTGHSFVLVTSLGLTYDGMLSDVQSMPKTGILI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 IILSVIFIKGNCASEEVIWEVLNAVGVYAGREHFVYGEPRELLTKVWVQGHYLEYREVPH
.:::..::.: :. ::::::.:: .:.: : ::..:::::.:::. ::: .:::::.::
CCDS14 LILSIVFIEGYCTPEEVIWEALNMMGLYDGMEHLIYGEPRKLLTQDWVQENYLEYRQVPG
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 SSPPYYEFLWGPRAHSESIKKKVLEFLAKLNNTVPSSFPSWYKDALKDVEERVQATIDTA
:.: ::::::::::.: : ..:.::::.:.. : ::: ::..:::: :::.: : :.
CCDS14 SDPARYEFLWGPRAHAEIRKMSLLKFLAKVNGSDPRSFPLWYEEALKDEEERAQDRIATT
290 300 310 320 330 340
360 370
pF1KB7 DDATVMASESLSVMSSNVSFSE
::.:.::: : :. .: :. :
CCDS14 DDTTAMASASSSATGS-FSYPE
350 360
>>CCDS14221.1 MAGEB4 gene_id:4115|Hs108|chrX (346 aa)
initn: 758 init1: 511 opt: 822 Z-score: 715.3 bits: 140.9 E(32554): 1.6e-33
Smith-Waterman score: 822; 43.8% identity (72.7% similar) in 322 aa overlap (58-370:22-343)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 AQHPTDEEEEEASSASSTLYLVFSPSSFSTSSSLILGGP---EEEEVPSGVIPNLTESIP
...: .: : :.:: ::. : ..
CCDS14 MPRGQKSKLRAREKRQRTRGQTQDLKVGQPTAAEKEESPSSSSSVLRDTAS
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 SSPPQGPPQGPS-QSPLSSCCSSFSWSSFSEESSSQKGEDTGTCQGLPDSESSFTYTLDE
:: : :: :. . : .: ...: .. .. . :: :.... :. ..: :. .: .
CCDS14 SSLAFGIPQEPQREPPTTSAAAAMSCTGSDKGDESQDEENASSSQASTSTERSLKDSLTR
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 KVAELVEFLLLKYEAEEPVTEAEMLMIVIK-YKDYFPVILKRAREFMELLFGLALIEVGP
:. ::.::: ::. .::.:.:::: :. : ::..:: :.... . ::.::::: ::.:
CCDS14 KTKMLVQFLLYKYKMKEPTTKAEMLKIISKKYKEHFPEIFRKVSQRTELVFGLALKEVNP
120 130 140 150 160 170
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 D-HFCVFANTVGLTD-EGSDDEGMPENSLLIIILSVIFIKGNCASEEVIWEVLNAVGVYA
: .... .: .: . :. .:.:.::. .:::::..:::: :: ::: :: .:.:
CCDS14 TTHSYILVSMLGPNDGNQSSAWTLPRNGLLMPLLSVIFLNGNCAREEEIWEFLNMLGIYD
180 190 200 210 220 230
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 GREHFVYGEPRELLTKVWVQGHYLEYREVPHSSPPYYEFLWGPRAHSESIKKKVLEFLAK
:..:...::::.:.:. :: .::::..::.:.:: :.::::::::.:. : ::::::::
CCDS14 GKRHLIFGEPRKLITQDLVQEKYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAK
240 250 260 270 280 290
330 340 350 360 370
pF1KB7 LNNTVPSSFPSWYKDALKDVEERVQATIDTAD--DATVMASESLSVMSSNVSFSE
.:.:.:..:: :..::.: :::. : .: .:.:.: . ::. :
CCDS14 VNDTTPNNFPLLYEEALRDEEERAGARPRVAARRGTTAMTSAYSRATSSSSSQPM
300 310 320 330 340
>>CCDS35221.1 MAGEB10 gene_id:139422|Hs108|chrX (347 aa)
initn: 817 init1: 562 opt: 805 Z-score: 700.7 bits: 138.2 E(32554): 1e-32
Smith-Waterman score: 805; 43.4% identity (71.7% similar) in 311 aa overlap (67-370:34-344)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 EEASSASSTLYLVFSPSSFSTSSSLILGGPEEEEVPSGVIPNLTESIPSS--PPQGPPQG
:::: : .. : . . :: .. :.:
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