Result of FASTA (omim) for pF1KB7149
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7149, 347 aa
  1>>>pF1KB7149 347 - 347 aa - 347 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8286+/-0.00033; mu= 10.6746+/- 0.021
 mean_var=117.3956+/-23.333, 0's: 0 Z-trim(119.0): 128  B-trim: 325 in 1/54
 Lambda= 0.118372
 statistics sampled from 32478 (32606) to 32478 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.729), E-opt: 0.2 (0.382), width:  16
 Scan time:  9.120

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_002354 (OMIM: 300097) melanoma-associated antig ( 347) 2303 403.7  3e-112
NP_796379 (OMIM: 300097) melanoma-associated antig ( 347) 2303 403.7  3e-112
NP_803134 (OMIM: 300097) melanoma-associated antig ( 347) 2303 403.7  3e-112
NP_002358 (OMIM: 300153) melanoma-associated antig ( 346) 1500 266.6 5.6e-71
XP_011543814 (OMIM: 300098) PREDICTED: melanoma-as ( 319) 1368 244.0 3.2e-64
NP_002355 (OMIM: 300098) melanoma-associated antig ( 319) 1368 244.0 3.2e-64
XP_011543869 (OMIM: 300763) PREDICTED: melanoma-as ( 336) 1145 206.0 9.8e-53
NP_001264236 (OMIM: 300763) melanoma-associated an ( 336) 1145 206.0 9.8e-53
NP_872312 (OMIM: 300761) melanoma-associated antig ( 347) 1109 199.8 7.1e-51
NP_002356 (OMIM: 300152) melanoma-associated antig ( 346) 1078 194.5 2.8e-49
XP_011543815 (OMIM: 300152) PREDICTED: melanoma-as ( 346) 1078 194.5 2.8e-49
XP_011543816 (OMIM: 300152) PREDICTED: melanoma-as ( 346) 1078 194.5 2.8e-49
XP_011543756 (OMIM: 300762) PREDICTED: melanoma-as ( 324)  949 172.5 1.1e-42
XP_011543755 (OMIM: 300762) PREDICTED: melanoma-as ( 324)  949 172.5 1.1e-42
NP_001093391 (OMIM: 300762) melanoma-associated an ( 324)  949 172.5 1.1e-42
NP_066386 (OMIM: 300343) melanoma-associated antig ( 369)  897 163.7 5.9e-40
NP_001238757 (OMIM: 300343) melanoma-associated an ( 369)  897 163.7 5.9e-40
NP_001011543 (OMIM: 300343) melanoma-associated an ( 369)  897 163.7 5.9e-40
NP_775794 (OMIM: 300467) melanoma-associated antig ( 407)  871 159.2 1.4e-38
XP_016885011 (OMIM: 300344) PREDICTED: melanoma-as ( 394)  861 157.5 4.4e-38
NP_001011544 (OMIM: 300344) melanoma-associated an ( 400)  861 157.5 4.5e-38
XP_011529466 (OMIM: 300344) PREDICTED: melanoma-as ( 421)  861 157.5 4.7e-38
NP_005357 (OMIM: 300344) melanoma-associated antig ( 429)  861 157.5 4.8e-38
XP_016885010 (OMIM: 300344) PREDICTED: melanoma-as ( 429)  861 157.5 4.8e-38
NP_002353 (OMIM: 300175) melanoma-associated antig ( 317)  855 156.4 7.6e-38
NP_001011548 (OMIM: 300175) melanoma-associated an ( 317)  855 156.4 7.6e-38
NP_001011549 (OMIM: 300175) melanoma-associated an ( 317)  855 156.4 7.6e-38
XP_005274736 (OMIM: 300175) PREDICTED: melanoma-as ( 317)  855 156.4 7.6e-38
NP_001011550 (OMIM: 300175) melanoma-associated an ( 317)  855 156.4 7.6e-38
XP_005274735 (OMIM: 300175) PREDICTED: melanoma-as ( 317)  855 156.4 7.6e-38
XP_005274734 (OMIM: 300175) PREDICTED: melanoma-as ( 397)  855 156.5 9.1e-38
NP_001258681 (OMIM: 300466) melanoma-associated an ( 275)  847 155.0 1.7e-37
XP_016885009 (OMIM: 300341) PREDICTED: melanoma-as ( 318)  830 152.2 1.5e-36
NP_001159872 (OMIM: 300341) melanoma-associated an ( 318)  830 152.2 1.5e-36
NP_005355 (OMIM: 300341) melanoma-associated antig ( 318)  830 152.2 1.5e-36
NP_001159873 (OMIM: 300341) melanoma-associated an ( 318)  830 152.2 1.5e-36
NP_004979 (OMIM: 300016) melanoma-associated antig ( 309)  800 147.0   5e-35
XP_005278250 (OMIM: 300764) PREDICTED: melanoma-as ( 315)  790 145.3 1.7e-34
XP_005262392 (OMIM: 300342) PREDICTED: melanoma-as ( 315)  790 145.3 1.7e-34
NP_001074259 (OMIM: 300764) melanoma-associated an ( 315)  790 145.3 1.7e-34
NP_005356 (OMIM: 300342) melanoma-associated antig ( 315)  790 145.3 1.7e-34
XP_005278249 (OMIM: 300764) PREDICTED: melanoma-as ( 315)  790 145.3 1.7e-34
XP_005262391 (OMIM: 300342) PREDICTED: melanoma-as ( 315)  790 145.3 1.7e-34
NP_057333 (OMIM: 300468) melanoma-associated antig ( 373)  773 142.5 1.4e-33
NP_001269433 (OMIM: 300173) melanoma-associated an ( 314)  729 134.9 2.3e-31
NP_001269430 (OMIM: 300173) melanoma-associated an ( 314)  729 134.9 2.3e-31
NP_005352 (OMIM: 300173) melanoma-associated antig ( 314)  729 134.9 2.3e-31
NP_786885 (OMIM: 300173) melanoma-associated antig ( 314)  729 134.9 2.3e-31
NP_001308333 (OMIM: 300549) melanoma-associated an ( 314)  729 134.9 2.3e-31
NP_001308331 (OMIM: 300549) melanoma-associated an ( 314)  729 134.9 2.3e-31


>>NP_002354 (OMIM: 300097) melanoma-associated antigen B  (347 aa)
 initn: 2303 init1: 2303 opt: 2303  Z-score: 2136.3  bits: 403.7 E(85289): 3e-112
Smith-Waterman score: 2303; 100.0% identity (100.0% similar) in 347 aa overlap (1-347:1-347)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPSSSPVLGDTPTSSPAAGIPQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPSSSPVLGDTPTSSPAAGIPQK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 PQGAPPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMHFIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PQGAPPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMHFIL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 RKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTLVSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 RKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTLVSK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 LNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLIYGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLIYGE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 PRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATPRDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATPRDF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       
pF1KB7 PSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
              310       320       330       340       

>>NP_796379 (OMIM: 300097) melanoma-associated antigen B  (347 aa)
 initn: 2303 init1: 2303 opt: 2303  Z-score: 2136.3  bits: 403.7 E(85289): 3e-112
Smith-Waterman score: 2303; 100.0% identity (100.0% similar) in 347 aa overlap (1-347:1-347)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPSSSPVLGDTPTSSPAAGIPQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_796 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPSSSPVLGDTPTSSPAAGIPQK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 PQGAPPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMHFIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_796 PQGAPPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMHFIL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 RKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTLVSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_796 RKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTLVSK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 LNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLIYGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_796 LNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLIYGE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 PRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATPRDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_796 PRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATPRDF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       
pF1KB7 PSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_796 PSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
              310       320       330       340       

>>NP_803134 (OMIM: 300097) melanoma-associated antigen B  (347 aa)
 initn: 2303 init1: 2303 opt: 2303  Z-score: 2136.3  bits: 403.7 E(85289): 3e-112
Smith-Waterman score: 2303; 100.0% identity (100.0% similar) in 347 aa overlap (1-347:1-347)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPSSSPVLGDTPTSSPAAGIPQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_803 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPSSSPVLGDTPTSSPAAGIPQK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 PQGAPPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMHFIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_803 PQGAPPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMHFIL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 RKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTLVSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_803 RKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTLVSK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 LNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLIYGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_803 LNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLIYGE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 PRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATPRDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_803 PRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATPRDF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       
pF1KB7 PSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_803 PSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
              310       320       330       340       

>>NP_002358 (OMIM: 300153) melanoma-associated antigen B  (346 aa)
 initn: 1436 init1: 884 opt: 1500  Z-score: 1395.2  bits: 266.6 E(85289): 5.6e-71
Smith-Waterman score: 1500; 68.1% identity (83.6% similar) in 348 aa overlap (1-347:1-346)

               10        20        30        40         50         
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPSSSP-VLGDTPTSSPAAGIPQ
       :::::::::::::::...: .:: :::.. ::::::: ::::  :: :: .:: : ::::
NP_002 MPRGQKSKLRAREKRQRTRGQTQDLKVGQPTAAEKEESPSSSSSVLRDTASSSLAFGIPQ
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB7 KPQGAPPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMHFI
       .::  ::::.::::.::: ::.: . : ::::: :::.:::: :.:: .. .. ::..:.
NP_002 EPQREPPTTSAAAAMSCTGSDKGDESQDEENASSSQASTSTERSLKDSLTRKTKMLVQFL
               70        80        90       100       110       120

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pF1KB7 LRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTLVS
       : ::::.::  ::.:::....:::.:: ::.  .:.: :::::: ::: ::. :.: :::
NP_002 LYKYKMKEPTTKAEMLKIISKKYKEHFPEIFRKVSQRTELVFGLALKEVNPTTHSYILVS
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pF1KB7 KLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLIYG
        :.  :::: :. : .::::::::::.::::.:: : :::::.:.:.:: :::..:::.:
NP_002 MLG-PNDGNQSSAWTLPRNGLLMPLLSVIFLNGNCAREEEIWEFLNMLGIYDGKRHLIFG
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pF1KB7 EPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATPRD
       ::::.:::::::::::.:.::::::::::::::::::.:::.::::::::::.: .:: .
NP_002 EPRKLITQDLVQEKYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDTTPNN
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pF1KB7 FPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
       ::  :::::::::::: .:  : ::: ::: :  : :::  : ::.::
NP_002 FPLLYEEALRDEEERAGARPRVAARRGTTAMT-SAYSRATSSSSSQPM
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>>XP_011543814 (OMIM: 300098) PREDICTED: melanoma-associ  (319 aa)
 initn: 1264 init1: 1043 opt: 1368  Z-score: 1273.9  bits: 244.0 E(85289): 3.2e-64
Smith-Waterman score: 1368; 65.2% identity (88.0% similar) in 316 aa overlap (1-313:1-316)

               10        20        30        40         50         
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPS-SSPVLGDTPTSSPAAGIPQ
       :::::::::::::::::::.::.::.: ..: ::.:: :  :: : : . .:::::::::
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pF1KB7 KPQGAPPTTTAAAA-VSCTESDEGAKC-QGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMH
       .:: :: :..:::: :: :.: .:::  :::.::: :::.:::.:  .::.. ..: :..
XP_011 EPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSGSLVQ
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pF1KB7 FILRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTL
       :.: :::... . :..:::.: .....:: :::. ::. : .::::.:.. ::.:::::.
XP_011 FLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGHTYTF
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pF1KB7 VSKLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLI
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pF1KB7 YGEPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATP
       .::: :.::.::::::::.:.:::.:::::.::::::::::::.::::::::::.::.::
XP_011 FGEPWKLITKDLVQEKYLEYKQVPSSDPPRFQFLWGPRAYAETSKMKVLEFLAKVNGTTP
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pF1KB7 RDFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
         ::.::::::.:::.                                  
XP_011 CAFPTHYEEALKDEEKAGV                               
              310                                        

>>NP_002355 (OMIM: 300098) melanoma-associated antigen B  (319 aa)
 initn: 1264 init1: 1043 opt: 1368  Z-score: 1273.9  bits: 244.0 E(85289): 3.2e-64
Smith-Waterman score: 1368; 65.2% identity (88.0% similar) in 316 aa overlap (1-313:1-316)

               10        20        30        40         50         
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPS-SSPVLGDTPTSSPAAGIPQ
       :::::::::::::::::::.::.::.: ..: ::.:: :  :: : : . .:::::::::
NP_002 MPRGQKSKLRAREKRRKARDETRGLNVPQVTEAEEEEAPCCSSSVSGGAASSSPAAGIPQ
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pF1KB7 KPQGAPPTTTAAAA-VSCTESDEGAKC-QGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMH
       .:: :: :..:::: :: :.: .:::  :::.::: :::.:::.:  .::.. ..: :..
NP_002 EPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSGSLVQ
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pF1KB7 FILRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTL
       :.: :::... . :..:::.: .....:: :::. ::. : .::::.:.. ::.:::::.
NP_002 FLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGHTYTF
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pF1KB7 VSKLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLI
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NP_002 IDKVDLTDEESLLSSWDFPRRKLLMPLLGVIFLNGNSATEEEIWEFLNMLGVYDGEEHSV
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pF1KB7 YGEPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATP
       .::: :.::.::::::::.:.:::.:::::.::::::::::::.::::::::::.::.::
NP_002 FGEPWKLITKDLVQEKYLEYKQVPSSDPPRFQFLWGPRAYAETSKMKVLEFLAKVNGTTP
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pF1KB7 RDFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
         ::.::::::.:::.                                  
NP_002 CAFPTHYEEALKDEEKAGV                               
              310                                        

>>XP_011543869 (OMIM: 300763) PREDICTED: melanoma-associ  (336 aa)
 initn: 1174 init1: 983 opt: 1145  Z-score: 1067.8  bits: 206.0 E(85289): 9.8e-53
Smith-Waterman score: 1145; 55.1% identity (78.9% similar) in 332 aa overlap (1-330:1-331)

               10        20        30        40         50         
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPSSS-PVLGDTPTSSPAAGIPQ
       ::::: :: :::::::.:: : : :  :.:::::::. :::: :.  . : : : :::::
XP_011 MPRGQASKRRAREKRRQARGEDQCLGGAQATAAEKEKLPSSSSPACQSPPQSFPNAGIPQ
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pF1KB7 KPQGAPPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQ-GEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMHF
       . : :   .. :.::: : :::::: : ::   :: .. .:.::. .: .  ..: :..:
XP_011 ESQRASYPSSPASAVSLTSSDEGAKGQKGESPNSF-HGPSSSESTGRDLLNTKTGELVQF
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pF1KB7 ILRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTLV
       .: ::  .::: .  ::::...:::.:: :::  ... .:.:::: ::: .:: ..:.::
XP_011 LLNKYIRKEPITREAMLKVINRKYKQHFPEILRRSTENVEVVFGLYLKEMDPSRQSYVLV
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pF1KB7 SKLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLIY
       .::.. :.:.::.   :: .:::: ::..::..:: :::::.:. .:.:: : :..:.::
XP_011 GKLDFPNQGSLSDGGGFPLSGLLMVLLSTIFMHGNRATEEEMWECLNALGMYKGRKHFIY
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pF1KB7 GEPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATPR
       :::....:.:::.: ::.:.:::.::::::.::::::: :::.:::::::.::.: ..  
XP_011 GEPQELVTKDLVREGYLEYQQVPSSDPPRYEFLWGPRARAETSKMKVLEFVAKLNDTVAS
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pF1KB7 DFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
        . :.::::::.:::.:..:. .:   :. :.                 
XP_011 TYKSRYEEALREEEEQARARAVARDSARARASRSFQP            
     300       310       320       330                  

>>NP_001264236 (OMIM: 300763) melanoma-associated antige  (336 aa)
 initn: 1174 init1: 983 opt: 1145  Z-score: 1067.8  bits: 206.0 E(85289): 9.8e-53
Smith-Waterman score: 1145; 55.1% identity (78.9% similar) in 332 aa overlap (1-330:1-331)

               10        20        30        40         50         
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPSSS-PVLGDTPTSSPAAGIPQ
       ::::: :: :::::::.:: : : :  :.:::::::. :::: :.  . : : : :::::
NP_001 MPRGQASKRRAREKRRQARGEDQCLGGAQATAAEKEKLPSSSSPACQSPPQSFPNAGIPQ
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80         90       100       110        
pF1KB7 KPQGAPPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQ-GEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMHF
       . : :   .. :.::: : :::::: : ::   :: .. .:.::. .: .  ..: :..:
NP_001 ESQRASYPSSPASAVSLTSSDEGAKGQKGESPNSF-HGPSSSESTGRDLLNTKTGELVQF
               70        80        90        100       110         

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB7 ILRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTLV
       .: ::  .::: .  ::::...:::.:: :::  ... .:.:::: ::: .:: ..:.::
NP_001 LLNKYIRKEPITREAMLKVINRKYKQHFPEILRRSTENVEVVFGLYLKEMDPSRQSYVLV
     120       130       140       150       160       170         

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pF1KB7 SKLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLIY
       .::.. :.:.::.   :: .:::: ::..::..:: :::::.:. .:.:: : :..:.::
NP_001 GKLDFPNQGSLSDGGGFPLSGLLMVLLSTIFMHGNRATEEEMWECLNALGMYKGRKHFIY
     180       190       200       210       220       230         

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pF1KB7 GEPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATPR
       :::....:.:::.: ::.:.:::.::::::.::::::: :::.:::::::.::.: ..  
NP_001 GEPQELVTKDLVREGYLEYQQVPSSDPPRYEFLWGPRARAETSKMKVLEFVAKLNDTVAS
     240       250       260       270       280       290         

      300       310       320       330       340       
pF1KB7 DFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
        . :.::::::.:::.:..:. .:   :. :.                 
NP_001 TYKSRYEEALREEEEQARARAVARDSARARASRSFQP            
     300       310       320       330                  

>>NP_872312 (OMIM: 300761) melanoma-associated antigen B  (347 aa)
 initn: 1088 init1: 950 opt: 1109  Z-score: 1034.3  bits: 199.8 E(85289): 7.1e-51
Smith-Waterman score: 1109; 52.4% identity (76.2% similar) in 349 aa overlap (1-345:1-345)

               10        20        30         40        50         
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECP-SSSPVLGDTPTSSPAAGIPQ
       ::::::::::::::::.::   . :  :     :.:: : :.:  : :.  ::   :  .
NP_872 MPRGQKSKLRAREKRRQARGGLEDLIDALDILEEEEESPPSASACLKDVFQSS-LDGASN
               10        20        30        40        50          

      60           70        80        90       100       110      
pF1KB7 KPQG---APPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLM
       .:.:   :  :.:.:.:.: :.  ::.. : ::    .:   .:.:  . ::  .. .:.
NP_872 NPHGLREAQSTSTSATAASHTRHPEGVNDQMEERPICTQDLEATDSFPRGPVDEKVIILV
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NP_872 PSEFSNWYTEALQDEEERARARVAAKARVSATAG---ARSKVKSSKSSQLQ
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>>NP_002356 (OMIM: 300152) melanoma-associated antigen B  (346 aa)
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NP_002 MPRGQKSTLHAREKRQQTRGQTQDHQGAQITATNKKKVSFSSPLILGATIQKKSAGRSRS
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         .::: :  :::..  ::  .: .::. . :.. ::::. .:: .:  ::.  ...::.
NP_002 ALKKPQRALSTTTSVD-VSYKKSYKGANSKIEKKQSFSQGLSSTVQSRTDPLIMKTNMLV
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NP_002 QFLMEMYKMKKPIMKADMLKIVQKSHKNCFPEILKKASFNMEVVFGVDLKKVDSTKDSYV
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347 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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