Result of FASTA (ccds) for pF1KB7114
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7114, 273 aa
  1>>>pF1KB7114 273 - 273 aa - 273 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7547+/-0.000696; mu= 17.8954+/- 0.042
 mean_var=59.7173+/-11.885, 0's: 0 Z-trim(109.4): 26  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.165968
 statistics sampled from 10840 (10864) to 10840 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.716), E-opt: 0.2 (0.334), width:  16
 Scan time:  2.500

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS382.1 GJB5 gene_id:2709|Hs108|chr1             ( 273) 1914 466.2 1.1e-131
CCDS383.1 GJB4 gene_id:127534|Hs108|chr1           ( 266) 1113 274.4 5.8e-74
CCDS384.1 GJB3 gene_id:2707|Hs108|chr1             ( 270) 1051 259.6 1.7e-69
CCDS5008.1 GJB7 gene_id:375519|Hs108|chr6          ( 223)  903 224.1 6.9e-59
CCDS9291.1 GJB6 gene_id:10804|Hs108|chr13          ( 261)  863 214.6   6e-56
CCDS14408.1 GJB1 gene_id:2705|Hs108|chrX           ( 283)  855 212.7 2.4e-55
CCDS9290.1 GJB2 gene_id:2706|Hs108|chr13           ( 226)  828 206.1 1.8e-53
CCDS58547.1 GJD3 gene_id:125111|Hs108|chr17        ( 294)  445 114.5 8.9e-26
CCDS30834.1 GJA8 gene_id:2703|Hs108|chr1           ( 433)  442 113.9   2e-25
CCDS30669.1 GJA4 gene_id:2701|Hs108|chr1           ( 333)  425 109.8 2.7e-24
CCDS9289.1 GJA3 gene_id:2700|Hs108|chr13           ( 435)  406 105.3 7.8e-23
CCDS34697.1 GJC3 gene_id:349149|Hs108|chr7         ( 279)  395 102.5 3.4e-22
CCDS5025.1 GJA10 gene_id:84694|Hs108|chr6          ( 543)  398 103.4 3.5e-22
CCDS929.1 GJA5 gene_id:2702|Hs108|chr1             ( 358)  392 101.9 6.8e-22
CCDS5123.1 GJA1 gene_id:2697|Hs108|chr6            ( 382)  392 101.9 7.2e-22
CCDS432.1 GJA9 gene_id:81025|Hs108|chr1            ( 515)  376 98.2 1.3e-20
CCDS1569.1 GJC2 gene_id:57165|Hs108|chr1           ( 439)  358 93.8 2.3e-19
CCDS11487.1 GJC1 gene_id:10052|Hs108|chr17         ( 396)  343 90.2 2.5e-18
CCDS10040.1 GJD2 gene_id:57369|Hs108|chr15         ( 321)  331 87.2 1.6e-17
CCDS7191.1 GJD4 gene_id:219770|Hs108|chr10         ( 370)  272 73.2 3.1e-13


>>CCDS382.1 GJB5 gene_id:2709|Hs108|chr1                  (273 aa)
 initn: 1914 init1: 1914 opt: 1914  Z-score: 2477.7  bits: 466.2 E(32554): 1.1e-131
Smith-Waterman score: 1914; 100.0% identity (100.0% similar) in 273 aa overlap (1-273:1-273)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MNWSIFEGLLSGVNKYSTAFGRIWLSLVFIFRVLVYLVTAERVWSDDHKDFDCNTRQPGC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 MNWSIFEGLLSGVNKYSTAFGRIWLSLVFIFRVLVYLVTAERVWSDDHKDFDCNTRQPGC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 SNVCFDEFFPVSHVRLWALQLILVTCPSLLVVMHVAYREVQEKRHREAHGENSGRLYLNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 SNVCFDEFFPVSHVRLWALQLILVTCPSLLVVMHVAYREVQEKRHREAHGENSGRLYLNP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 GKKRGGLWWTYVCSLVFKASVDIAFLYVFHSFYPKYILPPVVKCHADPCPNIVDCFISKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 GKKRGGLWWTYVCSLVFKASVDIAFLYVFHSFYPKYILPPVVKCHADPCPNIVDCFISKP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 SEKNIFTLFMVATAAICILLNLVELIYLVSKRCHECLAARKAQAMCTGHHPHGTTSSCKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 SEKNIFTLFMVATAAICILLNLVELIYLVSKRCHECLAARKAQAMCTGHHPHGTTSSCKQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270   
pF1KB7 DDLLSGDLIFLGSDSHPPLLPDRPRDHVKKTIL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 DDLLSGDLIFLGSDSHPPLLPDRPRDHVKKTIL
              250       260       270   

>>CCDS383.1 GJB4 gene_id:127534|Hs108|chr1                (266 aa)
 initn: 1133 init1: 1113 opt: 1113  Z-score: 1441.3  bits: 274.4 E(32554): 5.8e-74
Smith-Waterman score: 1113; 67.7% identity (87.6% similar) in 226 aa overlap (1-226:1-226)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MNWSIFEGLLSGVNKYSTAFGRIWLSLVFIFRVLVYLVTAERVWSDDHKDFDCNTRQPGC
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CCDS38 MNWAFLQGLLSGVNKYSTVLSRIWLSVVFIFRVLVYVVAAEEVWDDEQKDFVCNTKQPGC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 SNVCFDEFFPVSHVRLWALQLILVTCPSLLVVMHVAYREVQEKRHREAHGENSGRLYLNP
        :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::: .:..:.  :: :.  :: : 
CCDS38 PNVCYDEFFPVSHVRLWALQLILVTCPSLLVVMHVAYREERERKHHLKHGPNAPSLYDNL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 GKKRGGLWWTYVCSLVFKASVDIAFLYVFHSFYPKYILPPVVKCHADPCPNIVDCFISKP
       .::::::::::. ::.:::.:: .:::.:: .:  : .: :: : ..:::. :::.::.:
CCDS38 SKKRGGLWWTYLLSLIFKAAVDAGFLYIFHRLYKDYDMPRVVACSVEPCPHTVDCYISRP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 SEKNIFTLFMVATAAICILLNLVELIYLVSKRCHECLAARKAQAMCTGHHPHGTTSSCKQ
       .::..:: :::.:::::::::: :..:::.::: : .. :. .  :              
CCDS38 TEKKVFTYFMVTTAAICILLNLSEVFYLVGKRCMEIFGPRHRRPRCRECLPDTCPPYVLS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270   
pF1KB7 DDLLSGDLIFLGSDSHPPLLPDRPRDHVKKTIL
                                        
CCDS38 QGGHPEDGNSVLMKAGSAPVDAGGYP       
              250       260             

>>CCDS384.1 GJB3 gene_id:2707|Hs108|chr1                  (270 aa)
 initn: 1016 init1: 800 opt: 1051  Z-score: 1361.0  bits: 259.6 E(32554): 1.7e-69
Smith-Waterman score: 1051; 57.1% identity (85.8% similar) in 240 aa overlap (1-239:1-240)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MNWSIFEGLLSGVNKYSTAFGRIWLSLVFIFRVLVYLVTAERVWSDDHKDFDCNTRQPGC
       :.:. ...::::::::::::::::::.::.::::::.:.:::::.:..:::::::.::::
CCDS38 MDWKTLQALLSGVNKYSTAFGRIWLSVVFVFRVLVYVVAAERVWGDEQKDFDCNTKQPGC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 SNVCFDEFFPVSHVRLWALQLILVTCPSLLVVMHVAYREVQEKRHREAHGENSGRLYLNP
       .:::.:..::.:..::::::::.::::::::..:::::: .:.:::. ::.. ..:: : 
CCDS38 TNVCYDNYFPISNIRLWALQLIFVTCPSLLVILHVAYREERERRHRQKHGDQCAKLYDNA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160        170         
pF1KB7 GKKRGGLWWTYVCSLVFKASVDIAFLYVFHSFYPKYILPPVVKC-HADPCPNIVDCFISK
       :::.:::::::. ::.::  ... :::..:...  . .: .:.: .. ::::::::.:..
CCDS38 GKKHGGLWWTYLFSLIFKLIIEFLFLYLLHTLWHGFNMPRLVQCANVAPCPNIVDCYIAR
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB7 PSEKNIFTLFMVATAAICILLNLVELIYLVSKRCHECLAARKAQAMCTGHHPHGTTSSCK
       :.::.::: :::...:.::.:.. :: ::. .:  . :   : .. :.     . .:.:.
CCDS38 PTEKKIFTYFMVGASAVCIVLTICELCYLICHRVLRGLHKDKPRGGCSPSSSASRASTCR
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270   
pF1KB7 QDDLLSGDLIFLGSDSHPPLLPDRPRDHVKKTIL
                                         
CCDS38 CHHKLVEAGEVDPDPGNNKLQASAPNLTPI    
              250       260       270    

>>CCDS5008.1 GJB7 gene_id:375519|Hs108|chr6               (223 aa)
 initn: 883 init1: 528 opt: 903  Z-score: 1170.7  bits: 224.1 E(32554): 6.9e-59
Smith-Waterman score: 903; 55.2% identity (81.3% similar) in 230 aa overlap (1-225:1-221)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MNWSIFEGLLSGVNKYSTAFGRIWLSLVFIFRVLVYLVTAERVWSDDHKDFDCNTRQPGC
       :.: ... ::::::::::. : :::..::.::.:::.:.::.::.:..:.:.::.:::::
CCDS50 MSWMFLRDLLSGVNKYSTGTGWIWLAVVFVFRLLVYMVAAEHVWKDEQKEFECNSRQPGC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 SNVCFDEFFPVSHVRLWALQLILVTCPSLLVVMHVAYREVQEKRHREAHGENSGRLYLNP
       .:::::.:::.:.:::::::::.:. ::::::.::::.: .:::::.       .::..:
CCDS50 KNVCFDDFFPISQVRLWALQLIMVSTPSLLVVLHVAYHEGREKRHRK-------KLYVSP
               70        80        90       100              110   

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 GKKRGGLWWTYVCSLVFKASVDIAFLYVFHSFYPKYILPPVVKCHADPCPNIVDCFISKP
       :   ::::..:. ::. :.. .:.:: .:...:  . .: ..::   :::: ::::::::
CCDS50 GTMDGGLWYAYLISLIVKTGFEIGFLVLFYKLYDGFSVPYLIKCDLKPCPNTVDCFISKP
           120       130       140       150       160       170   

              190       200       210            220       230     
pF1KB7 SEKNIFTLFMVATAAICILLNLVELIYLVSK---RCHECLAA--RKAQAMCTGHHPHGTT
       .::.:: ::.: :. .::.::..:: .:: :   .:  ::    .: :..          
CCDS50 TEKTIFILFLVITSCLCIVLNFIELSFLVLKCFIKC--CLQKYLKKPQVLSV        
           180       190       200         210       220           

         240       250       260       270   
pF1KB7 SSCKQDDLLSGDLIFLGSDSHPPLLPDRPRDHVKKTIL

>>CCDS9291.1 GJB6 gene_id:10804|Hs108|chr13               (261 aa)
 initn: 851 init1: 470 opt: 863  Z-score: 1117.9  bits: 214.6 E(32554): 6e-56
Smith-Waterman score: 863; 46.8% identity (79.4% similar) in 248 aa overlap (1-243:1-244)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MNWSIFEGLLSGVNKYSTAFGRIWLSLVFIFRVLVYLVTAERVWSDDHKDFDCNTRQPGC
       :.:. .. ...::::.::..:..:....:::::.. .:.:..::.:...:: ::: ::::
CCDS92 MDWGTLHTFIGGVNKHSTSIGKVWITVIFIFRVMILVVAAQEVWGDEQEDFVCNTLQPGC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90        100       110         
pF1KB7 SNVCFDEFFPVSHVRLWALQLILVTCPSLLVVMHVAY-REVQEKRHREAHGENSGRLYLN
       .:::.:.::::::.::::::::.:. :.:::.::::: :.   .. :... .:. .   .
CCDS92 KNVCYDHFFPVSHIRLWALQLIFVSTPALLVAMHVAYYRHETTRKFRRGEKRNDFKDIED
               70        80        90       100       110       120

     120           130       140       150       160       170     
pF1KB7 PGKKR----GGLWWTYVCSLVFKASVDIAFLYVFHSFYPKYILPPVVKCHADPCPNIVDC
         :..    :.:::::. :. :.   . ::.:::. .:  : :: :.::  :::::.:::
CCDS92 IKKQKVRIEGSLWWTYTSSIFFRIIFEAAFMYVFYFLYNGYHLPWVLKCGIDPCPNLVDC
              130       140       150       160       170       180

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB7 FISKPSEKNIFTLFMVATAAICILLNLVELIYLVSKRCHECLAARKAQAMCTGHHPHGTT
       :::.:.::..::.::.....::.:::..:: ::. : : .    :. .:.   .::. . 
CCDS92 FISRPTEKTVFTIFMISASVICMLLNVAELCYLLLKVCFR----RSKRAQTQKNHPNHAL
              190       200       210       220           230      

         240       250       260       270   
pF1KB7 SSCKQDDLLSGDLIFLGSDSHPPLLPDRPRDHVKKTIL
       .  ::...                              
CCDS92 KESKQNEMNELISDSGQNAITGFPS             
        240       250       260              

>>CCDS14408.1 GJB1 gene_id:2705|Hs108|chrX                (283 aa)
 initn: 843 init1: 490 opt: 855  Z-score: 1107.1  bits: 212.7 E(32554): 2.4e-55
Smith-Waterman score: 855; 52.2% identity (80.4% similar) in 230 aa overlap (1-223:1-222)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MNWSIFEGLLSGVNKYSTAFGRIWLSLVFIFRVLVYLVTAERVWSDDHKDFDCNTRQPGC
       :::. .  ::::::..:::.::.:::..::::..: .:.:: ::.:....: ::: ::::
CCDS14 MNWTGLYTLLSGVNRHSTAIGRVWLSVIFIFRIMVLVVAAESVWGDEKSSFICNTLQPGC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100         110        
pF1KB7 SNVCFDEFFPVSHVRLWALQLILVTCPSLLVVMHVAYREVQEKR--HREAHGENSGRLYL
       ..::.:.:::.::::::.::::::. :.:::.::::...  ::.  . :.::.    :.:
CCDS14 NSVCYDQFFPISHVRLWSLQLILVSTPALLVAMHVAHQQHIEKKMLRLEGHGDP---LHL
               70        80        90       100       110          

      120            130       140       150       160       170   
pF1KB7 NPGKKR-----GGLWWTYVCSLVFKASVDIAFLYVFHSFYPKYILPPVVKCHADPCPNIV
       .  :..     : :::::: :.::.   . .:.:::. .:: : .  .::: . :::: :
CCDS14 EEVKRHKVHISGTLWWTYVISVVFRLLFEAVFMYVFYLLYPGYAMVRLVKCDVYPCPNTV
       120       130       140       150       160       170       

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB7 DCFISKPSEKNIFTLFMVATAAICILLNLVELIYLVSKRCHECLAARKAQAMCTGHHPHG
       :::.:.:.::..::.::.:...:::.::..:..::. . :     ::.::          
CCDS14 DCFVSRPTEKTVFTVFMLAASGICIILNVAEVVYLIIRAC-----ARRAQRRSNPPSRKG
       180       190       200       210            220       230  

           240       250       260       270              
pF1KB7 TTSSCKQDDLLSGDLIFLGSDSHPPLLPDRPRDHVKKTIL           
                                                          
CCDS14 SGFGHRLSPEYKQNEINKLLSEQDGSLKDILRRSPGTGAGLAEKSDRCSAC
            240       250       260       270       280   

>>CCDS9290.1 GJB2 gene_id:2706|Hs108|chr13                (226 aa)
 initn: 828 init1: 485 opt: 828  Z-score: 1073.5  bits: 206.1 E(32554): 1.8e-53
Smith-Waterman score: 828; 50.2% identity (83.1% similar) in 219 aa overlap (1-213:1-218)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MNWSIFEGLLSGVNKYSTAFGRIWLSLVFIFRVLVYLVTAERVWSDDHKDFDCNTRQPGC
       :.:. .. .:.::::.::..:.:::...::::... .:.:..::.:.. :: ::: ::::
CCDS92 MDWGTLQTILGGVNKHSTSIGKIWLTVLFIFRIMILVVAAKEVWGDEQADFVCNTLQPGC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110          
pF1KB7 SNVCFDEFFPVSHVRLWALQLILVTCPSLLVVMHVAYREVQEKRHREAHGENSGRLY---
       .:::.:..::.::.::::::::.:. :.:::.::::::. .::...  .:: ....    
CCDS92 KNVCYDHYFPISHIRLWALQLIFVSTPALLVAMHVAYRR-HEKKRKFIKGEIKSEFKDIE
               70        80        90        100       110         

        120         130       140       150       160       170    
pF1KB7 -LNPGKKR--GGLWWTYVCSLVFKASVDIAFLYVFHSFYPKYILPPVVKCHADPCPNIVD
        ..  : :  :.:::::. :. :..  . ::.:::. .:  . .  .:::.: :::: ::
CCDS92 EIKTQKVRIEGSLWWTYTSSIFFRVIFEAAFMYVFYVMYDGFSMQRLVKCNAWPCPNTVD
     120       130       140       150       160       170         

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB7 CFISKPSEKNIFTLFMVATAAICILLNLVELIYLVSKRCHECLAARKAQAMCTGHHPHGT
       ::.:.:.::..::.::.:...::::::..:: ::. . :                     
CCDS92 CFVSRPTEKTVFTVFMIAVSGICILLNVTELCYLLIRYCSGKSKKPV             
     180       190       200       210       220                   

          240       250       260       270   
pF1KB7 TSSCKQDDLLSGDLIFLGSDSHPPLLPDRPRDHVKKTIL

>>CCDS58547.1 GJD3 gene_id:125111|Hs108|chr17             (294 aa)
 initn: 470 init1: 299 opt: 445  Z-score: 576.3  bits: 114.5 E(32554): 8.9e-26
Smith-Waterman score: 445; 33.8% identity (66.2% similar) in 213 aa overlap (3-211:4-215)

                10        20        30        40        50         
pF1KB7  MNWSIFEGLLSGVNKYSTAFGRIWLSLVFIFRVLVYLVTAERVWSDDHKDFDCNTRQPG
          :... .::..:.  :   ::.:: ...:::.::  ...  :. :....: ::: :::
CCDS58 MGEWAFLGSLLDAVQLQSPLVGRLWLVVMLIFRILVLATVGGAVFEDEQEEFVCNTLQPG
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB7 CSNVCFDEFFPVSHVRLWALQLILVTCPSLLVVMHVAYREVQEKRHREAHGENSGRL---
       : ..:.:. ::::: :.: ....:.. : .: :..  .:  .:    :: .. .  :   
CCDS58 CRQTCYDRAFPVSHYRFWLFHILLLSAPPVLFVVYSMHRAGKEAGGAEAAAQCAPGLPEA
               70        80        90       100       110       120

        120        130       140       150       160       170     
pF1KB7 YLNPGKKRGG-LWWTYVCSLVFKASVDIAFLYVFHSFYPKYILPPVVKCHADPCPNIVDC
          :   :.      :. :....  ....::     .:  . . :   : . :::. :::
CCDS58 QCAPCALRARRARRCYLLSVALRLLAELTFLGGQALLYG-FRVAPHFACAGPPCPHTVDC
              130       140       150        160       170         

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB7 FISKPSEKNIFTLFMVATAAICILLNLVELIYLVSKRCHECLAARKAQAMCTGHHPHGTT
       :.:.:.::..:.::. :.. .  ::...:: .:. :                        
CCDS58 FVSRPTEKTVFVLFYFAVGLLSALLSVAELGHLLWKGRPRAGERDNRCNRAHEEAQKLLP
     180       190       200       210       220       230         

         240       250       260       270                    
pF1KB7 SSCKQDDLLSGDLIFLGSDSHPPLLPDRPRDHVKKTIL                 
                                                              
CCDS58 PPPPPPPPPALPSRRPGPEPCAPPAYAHPAPASLRECGSGRGKASPATGRRDLAI
     240       250       260       270       280       290    

>>CCDS30834.1 GJA8 gene_id:2703|Hs108|chr1                (433 aa)
 initn: 653 init1: 409 opt: 442  Z-score: 570.0  bits: 113.9 E(32554): 2e-25
Smith-Waterman score: 675; 43.8% identity (73.9% similar) in 226 aa overlap (2-208:3-227)

                10        20        30        40        50         
pF1KB7  MNWSIFEGLLSGVNKYSTAFGRIWLSLVFIFRVLVYLVTAERVWSDDHKDFDCNTRQPG
         .::.. ..:  ::..::..::.::...::::.:.  ..:: ::.:...:: :::.:::
CCDS30 MGDWSFLGNILEEVNEHSTVIGRVWLTVLFIFRILILGTAAEFVWGDEQSDFVCNTQQPG
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90        100                  
pF1KB7 CSNVCFDEFFPVSHVRLWALQLILVTCPSLLVVMH-VAYREVQEKRH-REAH--------
       : :::.:: ::.::.:::.::.:.:. :::. : : : : ...:::. :::.        
CCDS30 CENVCYDEAFPISHIRLWVLQIIFVSTPSLMYVGHAVHYVRMEEKRKSREAEELGQQAGT
               70        80        90       100       110       120

       110       120              130       140       150       160
pF1KB7 --GENSGRLYLNPGKK-------RGGLWWTYVCSLVFKASVDIAFLYVFHSFYPKYILPP
         : ..: .  . :.:       .: :  ::.: ..::.  ...:. : : :   . . :
CCDS30 NGGPDQGSVKKSSGSKGTKKFRLEGTLLRTYICHIIFKTLFEVGFI-VGHYFLYGFRILP
              130       140       150       160        170         

              170       180       190       200       210       220
pF1KB7 VVKCHADPCPNIVDCFISKPSEKNIFTLFMVATAAICILLNLVELIYLVSKRCHECLAAR
       . .:   ::::.::::.:.:.::.:: :::...:.. ..::..:: .:            
CCDS30 LYRCSRWPCPNVVDCFVSRPTEKTIFILFMLSVASVSLFLNVMELGHLGLKGIRSALKRP
     180       190       200       210       220       230         

              230       240       250       260       270          
pF1KB7 KAQAMCTGHHPHGTTSSCKQDDLLSGDLIFLGSDSHPPLLPDRPRDHVKKTIL       
                                                                   
CCDS30 VEQPLGEIPEKSLHSIAVSSIQKAKGYQLLEEEKIVSHYFPLTEVGMVETSPLPAKPFNQ
     240       250       260       270       280       290         

>>CCDS30669.1 GJA4 gene_id:2701|Hs108|chr1                (333 aa)
 initn: 701 init1: 425 opt: 425  Z-score: 549.6  bits: 109.8 E(32554): 2.7e-24
Smith-Waterman score: 634; 35.8% identity (65.9% similar) in 279 aa overlap (2-257:3-277)

                10        20        30        40        50         
pF1KB7  MNWSIFEGLLSGVNKYSTAFGRIWLSLVFIFRVLVYLVTAERVWSDDHKDFDCNTRQPG
         .:...: ::. :...::. :.:::...::::.:.  ...: ::.:...::.::: :::
CCDS30 MGDWGFLEKLLDQVQEHSTVVGKIWLTVLFIFRILILGLAGESVWGDEQSDFECNTAQPG
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB7 CSNVCFDEFFPVSHVRLWALQLILVTCPSLLVVMHVAYREVQEKRHREAHGENSGRLYLN
       :.:::.:. ::.::.: :.::...:. :.:. . :: :   .:.: :. .::  .    .
CCDS30 CTNVCYDQAFPISHIRYWVLQFLFVSTPTLVYLGHVIYLSRREERLRQKEGELRALPAKD
               70        80        90       100       110       120

     120                              130       140       150      
pF1KB7 PG-----------------------KKRGGLWWTYVCSLVFKASVDIAFLYVFHSFYPKY
       :                        . ::.:  ::: :.. :. .. .:::    .:  .
CCDS30 PQVERALAAVERQMAKISVAEDGRLRIRGALMGTYVASVLCKSVLEAGFLYGQWRLYG-W
              130       140       150       160       170          

        160       170       180       190       200       210      
pF1KB7 ILPPVVKCHADPCPNIVDCFISKPSEKNIFTLFMVATAAICILLNLVELIYLVSKRCHEC
        . ::  :.  ::: .::::.:.:.::.:: .::.... : ..:::.::..:. .   . 
CCDS30 TMEPVFVCQRAPCPYLVDCFVSRPTEKTIFIIFMLVVGLISLVLNLLELVHLLCRCLSRG
     180       190       200       210       220       230         

        220       230       240       250       260       270      
pF1KB7 LAARKAQAMCTGHHPHGTTSSCKQDDLLSGDLIFLGSDSHPPLLPDRPRDHVKKTIL   
       . ::..:    .   .::.:.   :...    .  : .: :                   
CCDS30 MRARQGQ---DAPPTQGTSSDPYTDQVFFYLPVGQGPSSPPCPTYNGLSSSEQNWANLTT
     240          250       260       270       280       290      

CCDS30 EERLASSRPPLFLDPPPQNGQKPPSRPSSSASKKQYV
        300       310       320       330   




273 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 04:52:00 2016 done: Fri Nov  4 04:52:00 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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