Result of FASTA (ccds) for pF1KB3881
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3881, 369 aa
  1>>>pF1KB3881 369 - 369 aa - 369 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0971+/-0.000892; mu= 13.1231+/- 0.054
 mean_var=80.8365+/-15.931, 0's: 0 Z-trim(107.5): 43  B-trim: 338 in 1/51
 Lambda= 0.142650
 statistics sampled from 9555 (9598) to 9555 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.669), E-opt: 0.2 (0.295), width:  16
 Scan time:  2.750

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS13764.1 SEPT5 gene_id:5413|Hs108|chr22         ( 369) 2482 520.3  1e-147
CCDS11609.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17         ( 459) 1869 394.2 1.2e-109
CCDS56041.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17         ( 470) 1869 394.2 1.2e-109
CCDS11610.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17         ( 478) 1869 394.2 1.2e-109
CCDS58582.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17         ( 493) 1869 394.2 1.3e-109
CCDS56224.1 SEPT5 gene_id:5413|Hs108|chr22         ( 346) 1699 359.2 3.1e-99
CCDS58581.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17         ( 331) 1679 355.0 5.2e-98
CCDS10678.3 SEPT1 gene_id:1731|Hs108|chr16         ( 414) 1569 332.5 4.1e-91
CCDS74682.1 SEPT2 gene_id:4735|Hs108|chr2          ( 396) 1361 289.6 3.1e-78
CCDS2548.1 SEPT2 gene_id:4735|Hs108|chr2           ( 361) 1359 289.2 3.8e-78
CCDS75582.1 SEPT7 gene_id:989|Hs108|chr7           ( 401) 1127 241.5 9.7e-64
CCDS63195.1 SEPT2 gene_id:4735|Hs108|chr2          ( 371) 1076 231.0 1.3e-60
CCDS14026.2 SEPT3 gene_id:55964|Hs108|chr22        ( 358) 1036 222.7 3.8e-58
CCDS14027.2 SEPT3 gene_id:55964|Hs108|chr22        ( 350) 1018 219.0 4.9e-57
CCDS45795.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17        ( 335) 1014 218.2 8.3e-57
CCDS74166.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17        ( 362) 1014 218.2 8.9e-57
CCDS45793.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17        ( 422) 1014 218.2   1e-56
CCDS45794.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17        ( 474) 1014 218.3 1.1e-56
CCDS77122.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17        ( 567) 1014 218.3 1.3e-56
CCDS45791.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17        ( 568) 1014 218.3 1.3e-56
CCDS45792.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17        ( 579) 1014 218.3 1.3e-56
CCDS45790.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17        ( 586) 1014 218.3 1.4e-56
CCDS45743.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17         ( 274)  940 202.9 2.7e-52
CCDS43360.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5         ( 429)  889 192.5 5.7e-49
CCDS43359.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5         ( 442)  889 192.5 5.9e-49
CCDS43358.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5         ( 483)  889 192.5 6.4e-49
CCDS10522.1 SEPT12 gene_id:124404|Hs108|chr16      ( 358)  881 190.8 1.5e-48
CCDS75298.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5         ( 440)  874 189.4   5e-48
CCDS14585.1 SEPT6 gene_id:23157|Hs108|chrX         ( 427)  870 188.6 8.6e-48
CCDS14583.1 SEPT6 gene_id:23157|Hs108|chrX         ( 429)  870 188.6 8.6e-48
CCDS14584.1 SEPT6 gene_id:23157|Hs108|chrX         ( 434)  870 188.6 8.7e-48
CCDS34018.1 SEPT11 gene_id:55752|Hs108|chr4        ( 429)  858 186.1 4.8e-47
CCDS77931.1 SEPT11 gene_id:55752|Hs108|chr4        ( 439)  858 186.1 4.9e-47
CCDS42726.1 SEPT10 gene_id:151011|Hs108|chr2       ( 431)  855 185.5 7.4e-47
CCDS82496.1 SEPT10 gene_id:151011|Hs108|chr2       ( 450)  855 185.5 7.6e-47
CCDS46383.1 SEPT10 gene_id:151011|Hs108|chr2       ( 454)  855 185.5 7.7e-47
CCDS82497.1 SEPT10 gene_id:151011|Hs108|chr2       ( 544)  855 185.6   9e-47
CCDS5519.2 SEPT14 gene_id:346288|Hs108|chr7        ( 432)  852 184.9 1.1e-46
CCDS47262.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5         ( 369)  746 163.1 3.6e-40
CCDS53987.1 SEPT12 gene_id:124404|Hs108|chr16      ( 312)  420 95.9 4.9e-20


>>CCDS13764.1 SEPT5 gene_id:5413|Hs108|chr22              (369 aa)
 initn: 2482 init1: 2482 opt: 2482  Z-score: 2765.4  bits: 520.3 E(32554): 1e-147
Smith-Waterman score: 2482; 100.0% identity (100.0% similar) in 369 aa overlap (1-369:1-369)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MSTGLRYKSKLATPEDKQDIDKQYVGFATLPNQVHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MSTGLRYKSKLATPEDKQDIDKQYVGFATLPNQVHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 VHSLFLTDLYKDRKLLSAEERISQTVEILKHTVDIEEKGVKLKLTIVDTPGFGDAVNNTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VHSLFLTDLYKDRKLLSAEERISQTVEILKHTVDIEEKGVKLKLTIVDTPGFGDAVNNTE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 CWKPITDYVDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPFGHGLRPVDVGFMKALHE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CWKPITDYVDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPFGHGLRPVDVGFMKALHE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 KVNIVPLIAKADCLVPSEIRKLKERIREEIDKFGIHVYQFPECDSDEDEDFKQQDRELKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KVNIVPLIAKADCLVPSEIRKLKERIREEIDKFGIHVYQFPECDSDEDEDFKQQDRELKE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 SAPFAVIGSNTVVEAKGQRVRGRLYPWGIVEVENQAHCDFVKLRNMLIRTHMHDLKDVTC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SAPFAVIGSNTVVEAKGQRVRGRLYPWGIVEVENQAHCDFVKLRNMLIRTHMHDLKDVTC
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 DVHYENYRAHCIQQMTSKLTQDSRMESPIPILPLPTPDAETEKLIRMKDEELRRMQEMLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DVHYENYRAHCIQQMTSKLTQDSRMESPIPILPLPTPDAETEKLIRMKDEELRRMQEMLQ
              310       320       330       340       350       360

                
pF1KB3 RMKQQMQDQ
       :::::::::
CCDS13 RMKQQMQDQ
                

>>CCDS11609.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17              (459 aa)
 initn: 1900 init1: 1724 opt: 1869  Z-score: 2082.1  bits: 394.2 E(32554): 1.2e-109
Smith-Waterman score: 1909; 76.9% identity (91.2% similar) in 364 aa overlap (14-368:95-457)

                                10        20        30        40   
pF1KB3                  MSTGLRYKSKLATPEDKQDIDKQYVGFATLPNQVHRKSVKKGF
                                     : :... ::.::::::::::::::::::::
CCDS11 PQSSDNQQYFCAPAPLSPSARPRSPWGKLDPYDSSEDDKEYVGFATLPNQVHRKSVKKGF
           70        80        90       100       110       120    

            50        60        70        80        90       100   
pF1KB3 DFTLMVAGESGLGKSTLVHSLFLTDLYKDRKLLSAEERISQTVEILKHTVDIEEKGVKLK
       ::::::::::::::::::.::::::::.:::::.::::: ::::: ::.::::::::.:.
CCDS11 DFTLMVAGESGLGKSTLVNSLFLTDLYRDRKLLGAEERIMQTVEITKHAVDIEEKGVRLR
          130       140       150       160       170       180    

           110       120       130       140       150       160   
pF1KB3 LTIVDTPGFGDAVNNTECWKPITDYVDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPF
       :::::::::::::::::::::...:.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LTIVDTPGFGDAVNNTECWKPVAEYIDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPF
          190       200       210       220       230       240    

           170       180       190       200       210       220   
pF1KB3 GHGLRPVDVGFMKALHEKVNIVPLIAKADCLVPSEIRKLKERIREEIDKFGIHVYQFPEC
       ::::::.:: ::::::..:::::..:::: :.: :. . :..:::::..:::..::::.:
CCDS11 GHGLRPLDVEFMKALHQRVNIVPILAKADTLTPPEVDHKKRKIREEIEHFGIKIYQFPDC
          250       260       270       280       290       300    

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB3 DSDEDEDFKQQDRELKESAPFAVIGSNTVVEAKGQRVRGRLYPWGIVEVENQAHCDFVKL
       ::::::::: ::. :::: :::::::::::::.:.:::::::::::::::: .:::::::
CCDS11 DSDEDEDFKLQDQALKESIPFAVIGSNTVVEARGRRVRGRLYPWGIVEVENPGHCDFVKL
          310       320       330       340       350       360    

           290       300       310                320       330    
pF1KB3 RNMLIRTHMHDLKDVTCDVHYENYRAHCIQQMT---------SKLTQDSRMESPIPILPL
       :.::.::::.:::::: ..:::::::.:::.::         .:::..:  . ::: .: 
CCDS11 RTMLVRTHMQDLKDVTRETHYENYRAQCIQSMTRLVVKERNRNKLTRESGTDFPIPAVP-
          370       380       390       400       410       420    

          340       350       360          
pF1KB3 PTPDAETEKLIRMKDEELRRMQEMLQRMKQQMQDQ 
       :  : ::::::: ::::::::::::.....::..  
CCDS11 PGTDPETEKLIREKDEELRRMQEMLHKIQKQMKENY
           430       440       450         

>>CCDS56041.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17              (470 aa)
 initn: 1900 init1: 1724 opt: 1869  Z-score: 2082.0  bits: 394.2 E(32554): 1.2e-109
Smith-Waterman score: 1909; 76.9% identity (91.2% similar) in 364 aa overlap (14-368:106-468)

                                10        20        30        40   
pF1KB3                  MSTGLRYKSKLATPEDKQDIDKQYVGFATLPNQVHRKSVKKGF
                                     : :... ::.::::::::::::::::::::
CCDS56 PQSSDNQQYFCAPAPLSPSARPRSPWGKLDPYDSSEDDKEYVGFATLPNQVHRKSVKKGF
          80        90       100       110       120       130     

            50        60        70        80        90       100   
pF1KB3 DFTLMVAGESGLGKSTLVHSLFLTDLYKDRKLLSAEERISQTVEILKHTVDIEEKGVKLK
       ::::::::::::::::::.::::::::.:::::.::::: ::::: ::.::::::::.:.
CCDS56 DFTLMVAGESGLGKSTLVNSLFLTDLYRDRKLLGAEERIMQTVEITKHAVDIEEKGVRLR
         140       150       160       170       180       190     

           110       120       130       140       150       160   
pF1KB3 LTIVDTPGFGDAVNNTECWKPITDYVDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPF
       :::::::::::::::::::::...:.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LTIVDTPGFGDAVNNTECWKPVAEYIDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPF
         200       210       220       230       240       250     

           170       180       190       200       210       220   
pF1KB3 GHGLRPVDVGFMKALHEKVNIVPLIAKADCLVPSEIRKLKERIREEIDKFGIHVYQFPEC
       ::::::.:: ::::::..:::::..:::: :.: :. . :..:::::..:::..::::.:
CCDS56 GHGLRPLDVEFMKALHQRVNIVPILAKADTLTPPEVDHKKRKIREEIEHFGIKIYQFPDC
         260       270       280       290       300       310     

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB3 DSDEDEDFKQQDRELKESAPFAVIGSNTVVEAKGQRVRGRLYPWGIVEVENQAHCDFVKL
       ::::::::: ::. :::: :::::::::::::.:.:::::::::::::::: .:::::::
CCDS56 DSDEDEDFKLQDQALKESIPFAVIGSNTVVEARGRRVRGRLYPWGIVEVENPGHCDFVKL
         320       330       340       350       360       370     

           290       300       310                320       330    
pF1KB3 RNMLIRTHMHDLKDVTCDVHYENYRAHCIQQMT---------SKLTQDSRMESPIPILPL
       :.::.::::.:::::: ..:::::::.:::.::         .:::..:  . ::: .: 
CCDS56 RTMLVRTHMQDLKDVTRETHYENYRAQCIQSMTRLVVKERNRNKLTRESGTDFPIPAVP-
         380       390       400       410       420       430     

          340       350       360          
pF1KB3 PTPDAETEKLIRMKDEELRRMQEMLQRMKQQMQDQ 
       :  : ::::::: ::::::::::::.....::..  
CCDS56 PGTDPETEKLIREKDEELRRMQEMLHKIQKQMKENY
          440       450       460       470

>>CCDS11610.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17              (478 aa)
 initn: 1900 init1: 1724 opt: 1869  Z-score: 2081.9  bits: 394.2 E(32554): 1.2e-109
Smith-Waterman score: 1909; 76.9% identity (91.2% similar) in 364 aa overlap (14-368:114-476)

                                10        20        30        40   
pF1KB3                  MSTGLRYKSKLATPEDKQDIDKQYVGFATLPNQVHRKSVKKGF
                                     : :... ::.::::::::::::::::::::
CCDS11 PQSSDNQQYFCAPAPLSPSARPRSPWGKLDPYDSSEDDKEYVGFATLPNQVHRKSVKKGF
            90       100       110       120       130       140   

            50        60        70        80        90       100   
pF1KB3 DFTLMVAGESGLGKSTLVHSLFLTDLYKDRKLLSAEERISQTVEILKHTVDIEEKGVKLK
       ::::::::::::::::::.::::::::.:::::.::::: ::::: ::.::::::::.:.
CCDS11 DFTLMVAGESGLGKSTLVNSLFLTDLYRDRKLLGAEERIMQTVEITKHAVDIEEKGVRLR
           150       160       170       180       190       200   

           110       120       130       140       150       160   
pF1KB3 LTIVDTPGFGDAVNNTECWKPITDYVDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPF
       :::::::::::::::::::::...:.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LTIVDTPGFGDAVNNTECWKPVAEYIDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPF
           210       220       230       240       250       260   

           170       180       190       200       210       220   
pF1KB3 GHGLRPVDVGFMKALHEKVNIVPLIAKADCLVPSEIRKLKERIREEIDKFGIHVYQFPEC
       ::::::.:: ::::::..:::::..:::: :.: :. . :..:::::..:::..::::.:
CCDS11 GHGLRPLDVEFMKALHQRVNIVPILAKADTLTPPEVDHKKRKIREEIEHFGIKIYQFPDC
           270       280       290       300       310       320   

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB3 DSDEDEDFKQQDRELKESAPFAVIGSNTVVEAKGQRVRGRLYPWGIVEVENQAHCDFVKL
       ::::::::: ::. :::: :::::::::::::.:.:::::::::::::::: .:::::::
CCDS11 DSDEDEDFKLQDQALKESIPFAVIGSNTVVEARGRRVRGRLYPWGIVEVENPGHCDFVKL
           330       340       350       360       370       380   

           290       300       310                320       330    
pF1KB3 RNMLIRTHMHDLKDVTCDVHYENYRAHCIQQMT---------SKLTQDSRMESPIPILPL
       :.::.::::.:::::: ..:::::::.:::.::         .:::..:  . ::: .: 
CCDS11 RTMLVRTHMQDLKDVTRETHYENYRAQCIQSMTRLVVKERNRNKLTRESGTDFPIPAVP-
           390       400       410       420       430       440   

          340       350       360          
pF1KB3 PTPDAETEKLIRMKDEELRRMQEMLQRMKQQMQDQ 
       :  : ::::::: ::::::::::::.....::..  
CCDS11 PGTDPETEKLIREKDEELRRMQEMLHKIQKQMKENY
            450       460       470        

>>CCDS58582.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17              (493 aa)
 initn: 1900 init1: 1724 opt: 1869  Z-score: 2081.6  bits: 394.2 E(32554): 1.3e-109
Smith-Waterman score: 1909; 76.9% identity (91.2% similar) in 364 aa overlap (14-368:129-491)

                                10        20        30        40   
pF1KB3                  MSTGLRYKSKLATPEDKQDIDKQYVGFATLPNQVHRKSVKKGF
                                     : :... ::.::::::::::::::::::::
CCDS58 PQSSDNQQYFCAPAPLSPSARPRSPWGKLDPYDSSEDDKEYVGFATLPNQVHRKSVKKGF
      100       110       120       130       140       150        

            50        60        70        80        90       100   
pF1KB3 DFTLMVAGESGLGKSTLVHSLFLTDLYKDRKLLSAEERISQTVEILKHTVDIEEKGVKLK
       ::::::::::::::::::.::::::::.:::::.::::: ::::: ::.::::::::.:.
CCDS58 DFTLMVAGESGLGKSTLVNSLFLTDLYRDRKLLGAEERIMQTVEITKHAVDIEEKGVRLR
      160       170       180       190       200       210        

           110       120       130       140       150       160   
pF1KB3 LTIVDTPGFGDAVNNTECWKPITDYVDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPF
       :::::::::::::::::::::...:.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LTIVDTPGFGDAVNNTECWKPVAEYIDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPF
      220       230       240       250       260       270        

           170       180       190       200       210       220   
pF1KB3 GHGLRPVDVGFMKALHEKVNIVPLIAKADCLVPSEIRKLKERIREEIDKFGIHVYQFPEC
       ::::::.:: ::::::..:::::..:::: :.: :. . :..:::::..:::..::::.:
CCDS58 GHGLRPLDVEFMKALHQRVNIVPILAKADTLTPPEVDHKKRKIREEIEHFGIKIYQFPDC
      280       290       300       310       320       330        

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB3 DSDEDEDFKQQDRELKESAPFAVIGSNTVVEAKGQRVRGRLYPWGIVEVENQAHCDFVKL
       ::::::::: ::. :::: :::::::::::::.:.:::::::::::::::: .:::::::
CCDS58 DSDEDEDFKLQDQALKESIPFAVIGSNTVVEARGRRVRGRLYPWGIVEVENPGHCDFVKL
      340       350       360       370       380       390        

           290       300       310                320       330    
pF1KB3 RNMLIRTHMHDLKDVTCDVHYENYRAHCIQQMT---------SKLTQDSRMESPIPILPL
       :.::.::::.:::::: ..:::::::.:::.::         .:::..:  . ::: .: 
CCDS58 RTMLVRTHMQDLKDVTRETHYENYRAQCIQSMTRLVVKERNRNKLTRESGTDFPIPAVP-
      400       410       420       430       440       450        

          340       350       360          
pF1KB3 PTPDAETEKLIRMKDEELRRMQEMLQRMKQQMQDQ 
       :  : ::::::: ::::::::::::.....::..  
CCDS58 PGTDPETEKLIREKDEELRRMQEMLHKIQKQMKENY
       460       470       480       490   

>>CCDS56224.1 SEPT5 gene_id:5413|Hs108|chr22              (346 aa)
 initn: 1699 init1: 1699 opt: 1699  Z-score: 1895.0  bits: 359.2 E(32554): 3.1e-99
Smith-Waterman score: 1699; 99.6% identity (100.0% similar) in 254 aa overlap (18-271:27-280)

                        10        20        30        40        50 
pF1KB3          MSTGLRYKSKLATPEDKQDIDKQYVGFATLPNQVHRKSVKKGFDFTLMVAG
                                 .:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MDSLAAPQDRLVEQLLSPRTQAQRRLKDIDKQYVGFATLPNQVHRKSVKKGFDFTLMVAG
               10        20        30        40        50        60

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB3 ESGLGKSTLVHSLFLTDLYKDRKLLSAEERISQTVEILKHTVDIEEKGVKLKLTIVDTPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ESGLGKSTLVHSLFLTDLYKDRKLLSAEERISQTVEILKHTVDIEEKGVKLKLTIVDTPG
               70        80        90       100       110       120

             120       130       140       150       160       170 
pF1KB3 FGDAVNNTECWKPITDYVDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPFGHGLRPVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 FGDAVNNTECWKPITDYVDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPFGHGLRPVD
              130       140       150       160       170       180

             180       190       200       210       220       230 
pF1KB3 VGFMKALHEKVNIVPLIAKADCLVPSEIRKLKERIREEIDKFGIHVYQFPECDSDEDEDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VGFMKALHEKVNIVPLIAKADCLVPSEIRKLKERIREEIDKFGIHVYQFPECDSDEDEDF
              190       200       210       220       230       240

             240       250       260       270       280       290 
pF1KB3 KQQDRELKESAPFAVIGSNTVVEAKGQRVRGRLYPWGIVEVENQAHCDFVKLRNMLIRTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                    
CCDS56 KQQDRELKESAPFAVIGSNTVVEAKGQRVRGRLYPWGIVEGALRLREAAQHAHPHAYARP
              250       260       270       280       290       300

             300       310       320       330       340       350 
pF1KB3 MHDLKDVTCDVHYENYRAHCIQQMTSKLTQDSRMESPIPILPLPTPDAETEKLIRMKDEE
                                                                   
CCDS56 QGRDVRRALRELPRALHPADDQQTDPGQPHGEPHPDPAAAHPGRRD              
              310       320       330       340                    

>>CCDS58581.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17              (331 aa)
 initn: 1724 init1: 1548 opt: 1679  Z-score: 1873.0  bits: 355.0 E(32554): 5.2e-98
Smith-Waterman score: 1719; 76.4% identity (90.9% similar) in 330 aa overlap (48-368:1-329)

        20        30        40        50        60        70       
pF1KB3 QDIDKQYVGFATLPNQVHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTLVHSLFLTDLYKDRKLLS
                                     ::::::::::::::.::::::::.:::::.
CCDS58                               MVAGESGLGKSTLVNSLFLTDLYRDRKLLG
                                             10        20        30

        80        90       100       110       120       130       
pF1KB3 AEERISQTVEILKHTVDIEEKGVKLKLTIVDTPGFGDAVNNTECWKPITDYVDQQFEQYF
       ::::: ::::: ::.::::::::.:.:::::::::::::::::::::...:.::::::::
CCDS58 AEERIMQTVEITKHAVDIEEKGVRLRLTIVDTPGFGDAVNNTECWKPVAEYIDQQFEQYF
               40        50        60        70        80        90

       140       150       160       170       180       190       
pF1KB3 RDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPFGHGLRPVDVGFMKALHEKVNIVPLIAKADCLVPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::.:: ::::::..:::::..:::: :.: 
CCDS58 RDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPFGHGLRPLDVEFMKALHQRVNIVPILAKADTLTPP
              100       110       120       130       140       150

       200       210       220       230       240       250       
pF1KB3 EIRKLKERIREEIDKFGIHVYQFPECDSDEDEDFKQQDRELKESAPFAVIGSNTVVEAKG
       :. . :..:::::..:::..::::.:::::::::: ::. :::: :::::::::::::.:
CCDS58 EVDHKKRKIREEIEHFGIKIYQFPDCDSDEDEDFKLQDQALKESIPFAVIGSNTVVEARG
              160       170       180       190       200       210

       260       270       280       290       300       310       
pF1KB3 QRVRGRLYPWGIVEVENQAHCDFVKLRNMLIRTHMHDLKDVTCDVHYENYRAHCIQQMT-
       .:::::::::::::::: .::::::::.::.::::.:::::: ..:::::::.:::.:: 
CCDS58 RRVRGRLYPWGIVEVENPGHCDFVKLRTMLVRTHMQDLKDVTRETHYENYRAQCIQSMTR
              220       230       240       250       260       270

                320       330       340       350       360        
pF1KB3 --------SKLTQDSRMESPIPILPLPTPDAETEKLIRMKDEELRRMQEMLQRMKQQMQD
               .:::..:  . ::: .: :  : ::::::: ::::::::::::.....::..
CCDS58 LVVKERNRNKLTRESGTDFPIPAVP-PGTDPETEKLIREKDEELRRMQEMLHKIQKQMKE
              280       290        300       310       320         

         
pF1KB3 Q 
         
CCDS58 NY
     330 

>>CCDS10678.3 SEPT1 gene_id:1731|Hs108|chr16              (414 aa)
 initn: 1560 init1: 1173 opt: 1569  Z-score: 1749.2  bits: 332.5 E(32554): 4.1e-91
Smith-Waterman score: 1590; 64.3% identity (85.8% similar) in 359 aa overlap (20-367:48-402)

                          10        20        30        40         
pF1KB3            MSTGLRYKSKLATPEDKQDIDKQYVGFATLPNQVHRKSVKKGFDFTLMV
                                     .::.:::::.::::.:::::::::::::::
CCDS10 EGWRVEAALSFLPHQRKWGETAGAVMAGGVMDKEYVGFAALPNQLHRKSVKKGFDFTLMV
        20        30        40        50        60        70       

      50        60        70        80        90       100         
pF1KB3 AGESGLGKSTLVHSLFLTDLYKDRKLLSAEERISQTVEILKHTVDIEEKGVKLKLTIVDT
       :::::::::::..:::::.::.::..  :  :..::. : .. :.::: :::.:::.:::
CCDS10 AGESGLGKSTLINSLFLTNLYEDRQVPEASARLTQTLAIERRGVEIEEGGVKVKLTLVDT
        80        90       100       110       120       130       

     110       120       130       140       150       160         
pF1KB3 PGFGDAVNNTECWKPITDYVDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPFGHGLRP
       :::::.:. ..:: :.. ....:::::.:::::::::::::.:::::::::::::.::::
CCDS10 PGFGDSVDCSDCWLPVVKFIEEQFEQYLRDESGLNRKNIQDSRVHCCLYFISPFGRGLRP
       140       150       160       170       180       190       

     170       180       190       200       210       220         
pF1KB3 VDVGFMKALHEKVNIVPLIAKADCLVPSEIRKLKERIREEIDKFGIHVYQFPECDSDEDE
       .::.:..:.::::::.:.:.::: :.:.: . ::..::... .  ::.::::::::::::
CCDS10 LDVAFLRAVHEKVNIIPVIGKADALMPQETQALKQKIRDQLKEEEIHIYQFPECDSDEDE
       200       210       220       230       240       250       

     230       240       250        260       270       280        
pF1KB3 DFKQQDRELKESAPFAVIGSNTVVEAKGQR-VRGRLYPWGIVEVENQAHCDFVKLRNMLI
       :::.:: :.::: ::::.::  ::.  :.: :::: : :: :::::  ::::..:: ::.
CCDS10 DFKRQDAEMKESIPFAVVGSCEVVRDGGNRPVRGRRYSWGTVEVENPHHCDFLNLRRMLV
       260       270       280       290       300       310       

      290       300       310                 320       330        
pF1KB3 RTHMHDLKDVTCDVHYENYRAHCIQQMT----------SKLTQDSRMESPIPILPLPTPD
       .::..:::.:: :. ::.:::.:.:...          :::...:  : :.:.:::    
CCDS10 QTHLQDLKEVTHDLLYEGYRARCLQSLARPGARDRASRSKLSRQSATEIPLPMLPL----
       320       330       340       350       360       370       

      340       350       360                   
pF1KB3 AETEKLIRMKDEELRRMQEMLQRMKQQMQDQ          
       :.:::::: ::::::::::::..:. :::            
CCDS10 ADTEKLIREKDEELRRMQEMLEKMQAQMQQSQAQGEQSDAL
           380       390       400       410    

>>CCDS74682.1 SEPT2 gene_id:4735|Hs108|chr2               (396 aa)
 initn: 1331 init1: 1253 opt: 1361  Z-score: 1518.1  bits: 289.6 E(32554): 3.1e-78
Smith-Waterman score: 1413; 58.4% identity (81.8% similar) in 363 aa overlap (10-369:35-381)

                                    10        20           30      
pF1KB3                      MSTGLRYKSKLATPEDKQDIDKQ---YVGFATLPNQVHR
                                     :..  .  : :. .   :::::.:::::::
CCDS74 SEGRATRPCLRVPSARRGDEGLHQRDEASQKMSKQQPTQFINPETPGYVGFANLPNQVHR
           10        20        30        40        50        60    

         40        50        60        70        80        90      
pF1KB3 KSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTLVHSLFLTDLYKDRKLLSAEERISQTVEILKHTVDIE
       :::::::.:::::.::::::::::..:::::::: .: . .: :.: .::.:   ::.::
CCDS74 KSVKKGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYPERVIPGAAEKIERTVQIEASTVEIE
           70        80        90       100       110       120    

        100       110       120       130       140       150      
pF1KB3 EKGVKLKLTIVDTPGFGDAVNNTECWKPITDYVDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCC
       :.::::.::.:::::.:::.:  .:.: : .:.:.:::.:..:::::::..: :::::::
CCDS74 ERGVKLRLTVVDTPGYGDAINCRDCFKTIISYIDEQFERYLHDESGLNRRHIIDNRVHCC
          130       140       150       160       170       180    

        160       170       180       190       200       210      
pF1KB3 LYFISPFGHGLRPVDVGFMKALHEKVNIVPLIAKADCLVPSEIRKLKERIREEIDKFGIH
       .::::::::::.:.::.::::.:.::::::.::::: :. .: ..::.:: .::.. .:.
CCDS74 FYFISPFGHGLKPLDVAFMKAIHNKVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHNIK
          190       200       210       220       230       240    

        220       230       240       250       260       270      
pF1KB3 VYQFPECDSDEDEDFKQQDRELKESAPFAVIGSNTVVEAKGQRVRGRLYPWGIVEVENQA
       .:..:. .::::::::.: : :: : ::.:.::: ..::::..:::::::::.:::::  
CCDS74 IYHLPDAESDEDEDFKEQTRLLKASIPFSVVGSNQLIEAKGKKVRGRLYPWGVVEVENPE
          250       260       270       280       290       300    

        280       290       300       310       320       330      
pF1KB3 HCDFVKLRNMLIRTHMHDLKDVTCDVHYENYRAHCIQQMTSKLTQDSRMESPIPILPLPT
       : ::.:::.::: :::.::..:: :.::::.:.. ...   :. ..              
CCDS74 HNDFLKLRTMLI-THMQDLQEVTQDLHYENFRSERLKRGGRKVENE--------------
          310        320       330       340                       

        340       350       360                        
pF1KB3 PDAETEKLIRMKDEELRRMQEMLQRMKQQMQDQ               
        : . ....  :. ::::::::. ::. ::: :               
CCDS74 -DMNKDQILLEKEAELRRMQEMIARMQAQMQMQMQGGDGDGGALGHHV
      350       360       370       380       390      

>>CCDS2548.1 SEPT2 gene_id:4735|Hs108|chr2                (361 aa)
 initn: 1331 init1: 1253 opt: 1359  Z-score: 1516.5  bits: 289.2 E(32554): 3.8e-78
Smith-Waterman score: 1411; 60.4% identity (83.5% similar) in 346 aa overlap (24-369:17-346)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MSTGLRYKSKLATPEDKQDIDKQYVGFATLPNQVHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTL
                              :::::.::::::::::::::.:::::.::::::::::
CCDS25        MSKQQPTQFINPETPGYVGFANLPNQVHRKSVKKGFEFTLMVVGESGLGKSTL
                      10        20        30        40        50   

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 VHSLFLTDLYKDRKLLSAEERISQTVEILKHTVDIEEKGVKLKLTIVDTPGFGDAVNNTE
       ..:::::::: .: . .: :.: .::.:   ::.:::.::::.::.:::::.:::.:  .
CCDS25 INSLFLTDLYPERVIPGAAEKIERTVQIEASTVEIEERGVKLRLTVVDTPGYGDAINCRD
            60        70        80        90       100       110   

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 CWKPITDYVDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPFGHGLRPVDVGFMKALHE
       :.: : .:.:.:::.:..:::::::..: :::::::.::::::::::.:.::.::::.:.
CCDS25 CFKTIISYIDEQFERYLHDESGLNRRHIIDNRVHCCFYFISPFGHGLKPLDVAFMKAIHN
           120       130       140       150       160       170   

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 KVNIVPLIAKADCLVPSEIRKLKERIREEIDKFGIHVYQFPECDSDEDEDFKQQDRELKE
       ::::::.::::: :. .: ..::.:: .::.. .:..:..:. .::::::::.: : :: 
CCDS25 KVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHNIKIYHLPDAESDEDEDFKEQTRLLKA
           180       190       200       210       220       230   

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 SAPFAVIGSNTVVEAKGQRVRGRLYPWGIVEVENQAHCDFVKLRNMLIRTHMHDLKDVTC
       : ::.:.::: ..::::..:::::::::.:::::  : ::.:::.::: :::.::..:: 
CCDS25 SIPFSVVGSNQLIEAKGKKVRGRLYPWGVVEVENPEHNDFLKLRTMLI-THMQDLQEVTQ
           240       250       260       270       280        290  

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 DVHYENYRAHCIQQMTSKLTQDSRMESPIPILPLPTPDAETEKLIRMKDEELRRMQEMLQ
       :.::::.:.. ...   :. ..               : . ....  :. ::::::::. 
CCDS25 DLHYENFRSERLKRGGRKVENE---------------DMNKDQILLEKEAELRRMQEMIA
            300       310                      320       330       

                               
pF1KB3 RMKQQMQDQ               
       ::. ::: :               
CCDS25 RMQAQMQMQMQGGDGDGGALGHHV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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