seq1 = pF1KA1343.tfa, 1485 bp seq2 = pF1KA1343/gi568815597f_211160116.tfa (gi568815597f:211160116_211413765), 253650 bp >pF1KA1343 1485 >gi568815597f:211160116_211413765 (Chr1) 1-49 (100001-100049) 100% -> 50-127 (111117-111194) 100% -> 128-180 (114095-114147) 100% -> 181-342 (116142-116303) 100% -> 343-467 (118002-118126) 100% -> 468-546 (119123-119201) 100% -> 547-765 (129063-129281) 100% -> 766-843 (135561-135638) 100% -> 844-901 (143968-144025) 100% -> 902-1143 (152605-152846) 100% -> 1144-1485 (153309-153650) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGAGAGTCGGAGCCGAATACCAAGCTCGGATCCCTGAATTTGATCCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||> 100001 ATGAGAGTCGGAGCCGAATACCAAGCTCGGATCCCTGAATTTGATCCAGG 50 . : . : . : . : . : 50 GTGCTACAAAGTACACAGATAAAGACAATGGAGGGATGCTTG >>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 TA...CAGGTGCTACAAAGTACACAGATAAAGACAATGGAGGGATGCTTG 100 . : . : . : . : . : 92 TATGGTCTCCATATCACAGTATCCCAGATGCCAAAT TGGAT ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||| 111159 TATGGTCTCCATATCACAGTATCCCAGATGCCAAATGTA...CAGTGGAT 150 . : . : . : . : . : 133 GAATACATTGCAATTGCAAAGGAAAAGCATGGCTACAATGTGGAACAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>> 114100 GAATACATTGCAATTGCAAAGGAAAAGCATGGCTACAATGTGGAACAGGT 200 . : . : . : . : . : 181 GCACTTGGCATGTTGTTCTGGCATAAACATAACATTGAGAAGT >...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114150 A...AAGGCACTTGGCATGTTGTTCTGGCATAAACATAACATTGAGAAGT 250 . : . : . : . : . : 224 CCCTTGCTGATCTCCCTAATTTCACTCCCTTTCCGGATGAGTGGACAGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116185 CCCTTGCTGATCTCCCTAATTTCACTCCCTTTCCGGATGAGTGGACAGTG 300 . : . : . : . : . : 274 GAAGATAAAGTCCTATTTGAACAAGCCTTTAGTTTTCATGGAAAGAGCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116235 GAAGATAAAGTCCTATTTGAACAAGCCTTTAGTTTTCATGGAAAGAGCTT 350 . : . : . : . : . : 324 TCACAGGATTCAGCAAATG CTTCCAGATAAGACAATTGCAA |||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||| 116285 TCACAGGATTCAGCAAATGGTA...AAGCTTCCAGATAAGACAATTGCAA 400 . : . : . : . : . : 365 GCCTTGTAAAATATTACTATTCTTGGAAAAAAACTCGCTCTAGGACAAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 118024 GCCTTGTAAAATATTACTATTCTTGGAAAAAAACTCGCTCTAGGACAAGT 450 . : . : . : . : . : 415 TTGATGGATCGCCAGGCTCGTAAACTAGCTAATAGACATAATCAGGGTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 118074 TTGATGGATCGCCAGGCTCGTAAACTAGCTAATAGACATAATCAGGGTGA 500 . : . : . : . : . : 465 CAG TGATGATGATGTAGAAGAAACACATCCAATGGATGGGA |||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 118124 CAGGTA...CAGTGATGATGATGTAGAAGAAACACATCCAATGGATGGGA 550 . : . : . : . : . : 506 ATGATAGTGATTATGATCCCAAAAAAGAAGCCAAAAAAGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>> 119161 ATGATAGTGATTATGATCCCAAAAAAGAAGCCAAAAAAGAGGTA...TAG 600 . : . : . : . : . : 547 GGTAATACTGAACAACCTGTCCAAACTAGCAAGATTGGACTTGGAAGAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 129063 GGTAATACTGAACAACCTGTCCAAACTAGCAAGATTGGACTTGGAAGAAG 650 . : . : . : . : . : 597 AGAGTATCAGAGTTTACAACATCGCCATCATTCTCAGCGTTCTAAGTGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 129113 AGAGTATCAGAGTTTACAACATCGCCATCATTCTCAGCGTTCTAAGTGCC 700 . : . : . : . : . : 647 GTCCACCTAAGGGCATGTATTTAACCCAGGAAGATGTGGTAGCAGTTTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 129163 GTCCACCTAAGGGCATGTATTTAACCCAGGAAGATGTGGTAGCAGTTTCC 750 . : . : . : . : . : 697 TGTAGTCCCAATGCAGCCAACACCATCCTGAGGCAACTGGACATGGAGTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 129213 TGTAGTCCCAATGCAGCCAACACCATCCTGAGGCAACTGGACATGGAGTT 800 . : . : . : . : . : 747 GATCTCTCTAAAACGTCAG GTTCAGAATGCTAAGCAAGTAA |||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||| 129263 GATCTCTCTAAAACGTCAGGTA...AAGGTTCAGAATGCTAAGCAAGTAA 850 . : . : . : . : . : 788 ACAGTGCACTTAAACAGAAAATGGAAGGTGGAATTGAAGAATTCAAACCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 135583 ACAGTGCACTTAAACAGAAAATGGAAGGTGGAATTGAAGAATTCAAACCT 900 . : . : . : . : . : 838 CCTGAG TCAAATCAGAAAATTAATGCCCGTTGGACCACAGA ||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||| 135633 CCTGAGGTA...TAGTCAAATCAGAAAATTAATGCCCGTTGGACCACAGA 950 . : . : . : . : . : 879 GGAGCAGCTTCTAGCAGTGCAAG GTGTCCGCAAATATGGTA |||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||| 144003 GGAGCAGCTTCTAGCAGTGCAAGGTA...CAGGTGTCCGCAAATATGGTA 1000 . : . : . : . : . : 920 AAGATTTTCAAGCTATTGCAGATGTAATTGGCAACAAGACTGTTGGCCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 152623 AAGATTTTCAAGCTATTGCAGATGTAATTGGCAACAAGACTGTTGGCCAA 1050 . : . : . : . : . : 970 GTGAAGAACTTCTTTGTAAACTACAGGCGTCGGTTTAACTTAGAGGAGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 152673 GTGAAGAACTTCTTTGTAAACTACAGGCGTCGGTTTAACTTAGAGGAGGT 1100 . : . : . : . : . : 1020 ATTGCAGGAGTGGGAAGCAGAACAAGGAACCCAGGCTTCTAATGGTGATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 152723 ATTGCAGGAGTGGGAAGCAGAACAAGGAACCCAGGCTTCTAATGGTGATG 1150 . : . : . : . : . : 1070 CTTCTACTTTAGGGGAGGAGACAAAAAGTGCTTCTAATGTGCCATCAGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 152773 CTTCTACTTTAGGGGAGGAGACAAAAAGTGCTTCTAATGTGCCATCAGGG 1200 . : . : . : . : . : 1120 AAGAGCACTGATGAAGAAGAGGAG GCACAGACCCCACAGGC ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||| 152823 AAGAGCACTGATGAAGAAGAGGAGGTG...TAGGCACAGACCCCACAGGC 1250 . : . : . : . : . : 1161 TCCTCGGACACTGGGTCCATCACCTCCTGCCCCATCATCCACTCCAACAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 153326 TCCTCGGACACTGGGTCCATCACCTCCTGCCCCATCATCCACTCCAACAC 1300 . : . : . : . : . : 1211 CAACAGCCCCTATTGCCACTCTGAACCAGCCTCCACCACTTCTTCGTCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 153376 CAACAGCCCCTATTGCCACTCTGAACCAGCCTCCACCACTTCTTCGTCCA 1350 . : . : . : . : . : 1261 ACACTGCCTGCTGCCCCGGCTCTTCACCGGCAGCCTCCTCCACTCCAGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 153426 ACACTGCCTGCTGCCCCGGCTCTTCACCGGCAGCCTCCTCCACTCCAGCA 1400 . : . : . : . : . : 1311 GCAGGCTCGGTTCATCCAGCCCCGGCCAACTTTAAATCAGCCTCCACCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 153476 GCAGGCTCGGTTCATCCAGCCCCGGCCAACTTTAAATCAGCCTCCACCAC 1450 . : . : . : . : . : 1361 CTCTTATTCGCCCTGCTAATTCCATGCCACCCCGTCTAAACCCAAGACCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 153526 CTCTTATTCGCCCTGCTAATTCCATGCCACCCCGTCTAAACCCAAGACCG 1500 . : . : . : . : . : 1411 GTGTTGTCCACGGTTGGTGGTCAACAGCCACCATCACTTATTGGAATTCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 153576 GTGTTGTCCACGGTTGGTGGTCAACAGCCACCATCACTTATTGGAATTCA 1550 . : . : . 1461 GACAGATTCACAGTCCTCACTGCAC ||||||||||||||||||||||||| 153626 GACAGATTCACAGTCCTCACTGCAC