Result of SIM4 for pF1KA1181

seq1 = pF1KA1181.tfa, 870 bp
seq2 = pF1KA1181/gi568815593f_172788697.tfa (gi568815593f:172788697_173050813), 262117 bp

>pF1KA1181 870
>gi568815593f:172788697_173050813 (Chr5)

1-20  (45718-45737)   100% ->
21-82  (100003-100064)   100% ->
83-155  (108306-108378)   100% ->
156-250  (120971-121065)   100% ->
251-375  (126018-126142)   100% ->
376-480  (135309-135413)   100% ->
481-541  (137813-137873)   100% ->
542-642  (143740-143840)   100% ->
643-765  (146492-146614)   100% ->
766-870  (162013-162117)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCTTTGACTTCAGGAG         GTTTGACATCTACAGGAAGGT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
  45718 ATGCCCTTTGACTTCAGGAGGTG...CAGGTTTGACATCTACAGGAAGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GCCCAAGGACCTTACGCAGCCAACGTACACCGGGGCCATTA         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100024 GCCCAAGGACCTTACGCAGCCAACGTACACCGGGGCCATTAGTG...CAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     83 TCTCCATCTGCTGCTGCCTCTTCATCCTCTTCCTCTTCCTCTCGGAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108306 TCTCCATCTGCTGCTGCCTCTTCATCCTCTTCCTCTTCCTCTCGGAGCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 ACCGGATTTATAACGACAGAAGT         TGTGAACGAGCTCTATGT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 108356 ACCGGATTTATAACGACAGAAGTGTA...TAGTGTGAACGAGCTCTATGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    174 CGATGACCCAGACAAGGACAGCGGTGGCAAGATCGACGTCAGTCTGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120989 CGATGACCCAGACAAGGACAGCGGTGGCAAGATCGACGTCAGTCTGAACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TCAGTTTACCCAATCTGCACTGCGAGT         TGGTTGGGCTTGAC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 121039 TCAGTTTACCCAATCTGCACTGCGAGTGTG...CAGTGGTTGGGCTTGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 ATTCAGGATGAGATGGGCAGGCACGAAGTGGGCCACATCGACAACTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126032 ATTCAGGATGAGATGGGCAGGCACGAAGTGGGCCACATCGACAACTCCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GAAGATCCCGCTGAACAATGGGGCAGGCTGCCGCTTCGAGGGGCAGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126082 GAAGATCCCGCTGAACAATGGGGCAGGCTGCCGCTTCGAGGGGCAGTTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 GCATCAACAAG         GTCCCCGGCAACTTCCACGTGTCCACACAC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 126132 GCATCAACAAGGTA...CAGGTCCCCGGCAACTTCCACGTGTCCACACAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 AGTGCCACAGCCCAGCCACAGAACCCAGACATGACGCATGTCATCCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135339 AGTGCCACAGCCCAGCCACAGAACCCAGACATGACGCATGTCATCCACAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GCTCTCCTTTGGGGACACGCTACAG         GTCCAGAACATCCACG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 135389 GCTCTCCTTTGGGGACACGCTACAGGTG...CAGGTCCAGAACATCCACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 GAGCTTTCAATGCTCTCGGGGGAGCAGACAGACTCACCTCCAACC     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 137829 GAGCTTTCAATGCTCTCGGGGGAGCAGACAGACTCACCTCCAACCGTA..

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542     CCCTGGCCTCCCACGACTACATCCTGAAGATTGTGCCCACGGTTTA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137879 .CAGCCCTGGCCTCCCACGACTACATCCTGAAGATTGTGCCCACGGTTTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 TGAGGACAAGAGTGGCAAGCAGCGGTACTCCTACCAGTACACGGTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143786 TGAGGACAAGAGTGGCAAGCAGCGGTACTCCTACCAGTACACGGTGGCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 ACAAG         GAATACGTCGCCTACAGCCACACGGGCCGCATCATC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143836 ACAAGGTG...CAGGAATACGTCGCCTACAGCCACACGGGCCGCATCATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 CCTGCAATCTGGTTCCGCTACGACCTCAGCCCCATCACGGTCAAGTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146528 CCTGCAATCTGGTTCCGCTACGACCTCAGCCCCATCACGGTCAAGTACAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 AGAGAGACGGCAGCCGCTGTACAGATTCATCACCACG         ATCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 146578 AGAGAGACGGCAGCCGCTGTACAGATTCATCACCACGGTG...CAGATCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 GTGCCATCATTGGCGGGACCTTCACCGTCGCCGGCATCCTGGACTCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162017 GTGCCATCATTGGCGGGACCTTCACCGTCGCCGGCATCCTGGACTCATGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 ATCTTCACAGCCTCTGAGGCCTGGAAGAAGATCCAGCTGGGCAAGATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162067 ATCTTCACAGCCTCTGAGGCCTGGAAGAAGATCCAGCTGGGCAAGATGCA

    950 
    870 T
        |
 162117 T

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