seq1 = pF1KA0840.tfa, 1473 bp seq2 = pF1KA0840/gi568815593f_15400677.tfa (gi568815593f:15400677_16037183), 636507 bp >pF1KA0840 1473 >gi568815593f:15400677_16037183 (Chr5) 37-127 (215306-215396) 100% -> 128-739 (527214-527825) 100% -> 740-1473 (535774-536507) 100% 0 . : . : . : . : . : 37 GGCAAAGGCAGCTCGAGCATCTCATCTGACGTGAGTTCAAGTACAGATCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 215306 GGCAAAGGCAGCTCGAGCATCTCATCTGACGTGAGTTCAAGTACAGATCA 50 . : . : . : . : . : 87 CACGCCCACTAAAGCCCAGAAGAATGTGGCTACCAGCGAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>> 215356 CACGCCCACTAAAGCCCAGAAGAATGTGGCTACCAGCGAAGGTA...CAG 100 . : . : . : . : . : 128 ACTCCGACCTGAGCATGCGCACACTGAGCACGCCCAGCCCAGCCCTGATA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 527214 ACTCCGACCTGAGCATGCGCACACTGAGCACGCCCAGCCCAGCCCTGATA 150 . : . : . : . : . : 178 TGTCCACCGAATCTCCCAGGATTTCAGAATGGAAGGGGCTCGTCCACCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 527264 TGTCCACCGAATCTCCCAGGATTTCAGAATGGAAGGGGCTCGTCCACCTC 200 . : . : . : . : . : 228 CTCGTCCTCCATCACCGGGGAGACGGTGGCCATGGTGCACTCCCCGCCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 527314 CTCGTCCTCCATCACCGGGGAGACGGTGGCCATGGTGCACTCCCCGCCCC 250 . : . : . : . : . : 278 CGACCCGCCTCACACACCCGCTCATCCGGCTCGCCTCCAGACCCCAGAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 527364 CGACCCGCCTCACACACCCGCTCATCCGGCTCGCCTCCAGACCCCAGAAG 300 . : . : . : . : . : 328 GAGCAGGCCAGCATAGACCGGCTCCCGGACCACTCCATGGTGCAGATCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 527414 GAGCAGGCCAGCATAGACCGGCTCCCGGACCACTCCATGGTGCAGATCTT 350 . : . : . : . : . : 378 CTCCTTCCTGCCCACCAACCAGCTGTGCCGCTGCGCGCGAGTGTGCCGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 527464 CTCCTTCCTGCCCACCAACCAGCTGTGCCGCTGCGCGCGAGTGTGCCGCC 400 . : . : . : . : . : 428 GCTGGTACAACCTGGCCTGGGACCCGCGGCTCTGGAGGACTATCCGCCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 527514 GCTGGTACAACCTGGCCTGGGACCCGCGGCTCTGGAGGACTATCCGCCTG 450 . : . : . : . : . : 478 ACGGGCGAGACCATCAACGTGGACCGCGCCCTCAAGGTGCTGACCCGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 527564 ACGGGCGAGACCATCAACGTGGACCGCGCCCTCAAGGTGCTGACCCGCAG 500 . : . : . : . : . : 528 ACTCTGCCAGGACACCCCCAACGTGTGTCTCATGCTGGAAACCGTAACTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 527614 ACTCTGCCAGGACACCCCCAACGTGTGTCTCATGCTGGAAACCGTAACTG 550 . : . : . : . : . : 578 TCAGTGGCTGCAGGCGGCTCACAGACCGAGGGCTGTACACCATCGCCCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 527664 TCAGTGGCTGCAGGCGGCTCACAGACCGAGGGCTGTACACCATCGCCCAG 600 . : . : . : . : . : 628 TGCTGCCCCGAACTGAGGCGACTGGAAGTCTCAGGCTGTTACAATATCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 527714 TGCTGCCCCGAACTGAGGCGACTGGAAGTCTCAGGCTGTTACAATATCTC 650 . : . : . : . : . : 678 CAACGAGGCCGTCTTTGATGTGGTGTCCCTCTGCCCTAATCTGGAGCACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 527764 CAACGAGGCCGTCTTTGATGTGGTGTCCCTCTGCCCTAATCTGGAGCACC 700 . : . : . : . : . : 728 TGGATGTGTCAG GATGCTCCAAAGTGACCTGCATCAGCTTG ||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||| 527814 TGGATGTGTCAGGTA...CAGGATGCTCCAAAGTGACCTGCATCAGCTTG 750 . : . : . : . : . : 769 ACCCGGGAGGCCTCCATTAAACTGTCACCCTTGCATGGCAAACAGATTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 535803 ACCCGGGAGGCCTCCATTAAACTGTCACCCTTGCATGGCAAACAGATTTC 800 . : . : . : . : . : 819 CATCCGCTACCTGGACATGACGGACTGCTTCGTGCTGGAGGACGAAGGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 535853 CATCCGCTACCTGGACATGACGGACTGCTTCGTGCTGGAGGACGAAGGCC 850 . : . : . : . : . : 869 TGCACACCATCGCGGCGCACTGCACGCAGCTCACCCACCTCTACCTGCGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 535903 TGCACACCATCGCGGCGCACTGCACGCAGCTCACCCACCTCTACCTGCGC 900 . : . : . : . : . : 919 CGCTGCGTCCGCCTGACCGACGAAGGCCTGCGCTACCTGGTGATCTACTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 535953 CGCTGCGTCCGCCTGACCGACGAAGGCCTGCGCTACCTGGTGATCTACTG 950 . : . : . : . : . : 969 CGCCTCCATCAAGGAGCTGAGCGTCAGCGACTGCCGCTTCGTCAGCGACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 536003 CGCCTCCATCAAGGAGCTGAGCGTCAGCGACTGCCGCTTCGTCAGCGACT 1000 . : . : . : . : . : 1019 TCGGCCTGCGGGAGATCGCCAAGCTGGAGTCCCGCCTGCGGTACCTGAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 536053 TCGGCCTGCGGGAGATCGCCAAGCTGGAGTCCCGCCTGCGGTACCTGAGC 1050 . : . : . : . : . : 1069 ATCGCGCACTGCGGCCGGGTCACCGACGTGGGCATCCGCTACGTGGCCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 536103 ATCGCGCACTGCGGCCGGGTCACCGACGTGGGCATCCGCTACGTGGCCAA 1100 . : . : . : . : . : 1119 GTACTGCAGCAAGCTGCGCTACCTCAACGCGAGGGGCTGCGAGGGCATCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 536153 GTACTGCAGCAAGCTGCGCTACCTCAACGCGAGGGGCTGCGAGGGCATCA 1150 . : . : . : . : . : 1169 CGGACCACGGTGTGGAGTACCTCGCCAAGAACTGCACCAAACTCAAATCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 536203 CGGACCACGGTGTGGAGTACCTCGCCAAGAACTGCACCAAACTCAAATCC 1200 . : . : . : . : . : 1219 CTGGATATCGGCAAATGCCCTTTGGTATCCGACACGGGCCTGGAGTGCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 536253 CTGGATATCGGCAAATGCCCTTTGGTATCCGACACGGGCCTGGAGTGCCT 1250 . : . : . : . : . : 1269 GGCCCTGAACTGCTTCAACCTCAAGCGGCTCAGCCTCAAGTCCTGCGAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 536303 GGCCCTGAACTGCTTCAACCTCAAGCGGCTCAGCCTCAAGTCCTGCGAGA 1300 . : . : . : . : . : 1319 GCATCACCGGCCAGGGCTTGCAGATCGTGGCCGCCAACTGCTTTGACCTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 536353 GCATCACCGGCCAGGGCTTGCAGATCGTGGCCGCCAACTGCTTTGACCTC 1350 . : . : . : . : . : 1369 CAGACGCTGAATGTCCAGGACTGCGAGGTCTCCGTGGAGGCCCTGCGCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 536403 CAGACGCTGAATGTCCAGGACTGCGAGGTCTCCGTGGAGGCCCTGCGCTT 1400 . : . : . : . : . : 1419 TGTCAAACGCCACTGCAAGCGCTGCGTCATCGAGCACACCAACCCGGCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 536453 TGTCAAACGCCACTGCAAGCGCTGCGTCATCGAGCACACCAACCCGGCTT 1450 . 1469 TCTTC ||||| 536503 TCTTC