Result of FASTA (omim) for pF1KA0700
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0700, 1130 aa
  1>>>pF1KA0700 1130 - 1130 aa - 1130 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8359+/-0.000389; mu= 7.5135+/- 0.025
 mean_var=191.8444+/-38.906, 0's: 0 Z-trim(119.3): 10  B-trim: 921 in 1/56
 Lambda= 0.092598
 statistics sampled from 33062 (33072) to 33062 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.7), E-opt: 0.2 (0.388), width:  16
 Scan time: 16.380

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001284524 (OMIM: 607777) paired amphipathic hel (1130) 7586 1026.6       0
NP_001284526 (OMIM: 607777) paired amphipathic hel ( 720) 4759 648.8 3.4e-185
NP_056075 (OMIM: 607777) paired amphipathic helix  (1162) 4757 648.7  6e-185
XP_006722767 (OMIM: 607777) PREDICTED: paired amph ( 645) 4347 593.8 1.1e-168
NP_001138830 (OMIM: 607776,613406) paired amphipat (1273) 1885 265.0   2e-69
NP_001138829 (OMIM: 607776,613406) paired amphipat (1273) 1885 265.0   2e-69
XP_006720529 (OMIM: 607776,613406) PREDICTED: pair (1273) 1885 265.0   2e-69
XP_006720528 (OMIM: 607776,613406) PREDICTED: pair (1273) 1885 265.0   2e-69
XP_006720530 (OMIM: 607776,613406) PREDICTED: pair (1273) 1885 265.0   2e-69
NP_056292 (OMIM: 607776,613406) paired amphipathic (1273) 1885 265.0   2e-69


>>NP_001284524 (OMIM: 607777) paired amphipathic helix p  (1130 aa)
 initn: 7586 init1: 7586 opt: 7586  Z-score: 5484.1  bits: 1026.6 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 7586; 100.0% identity (100.0% similar) in 1130 aa overlap (1-1130:1-1130)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MAHAGGGSGGSGAGGPAGRGLSGARWGRSGSAGHEKLPVHVEDALTYLDQVKIRFGSDPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAHAGGGSGGSGAGGPAGRGLSGARWGRSGSAGHEKLPVHVEDALTYLDQVKIRFGSDPA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 TYNGFLEIMKEFKSQSIDTPGVIRRVSQLFHEHPDLIVGFNAFLPLGYRIDIPKNGKLNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TYNGFLEIMKEFKSQSIDTPGVIRRVSQLFHEHPDLIVGFNAFLPLGYRIDIPKNGKLNI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 QSPLTSQENSHNHGDGAEDFKQQVPYKEDKPQVPLESDSVEFNNAISYVNKIKTRFLDHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSPLTSQENSHNHGDGAEDFKQQVPYKEDKPQVPLESDSVEFNNAISYVNKIKTRFLDHP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 EIYRSFLEILHTYQKEQLNTRGRPFRGMSEEEVFTEVANLFRGQEDLLSEFGQFLPEAKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EIYRSFLEILHTYQKEQLNTRGRPFRGMSEEEVFTEVANLFRGQEDLLSEFGQFLPEAKR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 SLFTGNGPCEMHSVQKNEHDKTPEHSRKRSRPSLLRPVSAPAKKKMKLRGTKDLSIAAVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLFTGNGPCEMHSVQKNEHDKTPEHSRKRSRPSLLRPVSAPAKKKMKLRGTKDLSIAAVG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 KYGTLQEFSFFDKVRRVLKSQEVYENFLRCIALFNQELVSGSELLQLVSPFLGKFPELFA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KYGTLQEFSFFDKVRRVLKSQEVYENFLRCIALFNQELVSGSELLQLVSPFLGKFPELFA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 QFKSFLGVKELSFAPPMSDRSGDGISREIDYASCKRIGSSYRALPKTYQQPKCSGRTAIC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QFKSFLGVKELSFAPPMSDRSGDGISREIDYASCKRIGSSYRALPKTYQQPKCSGRTAIC
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 KEVLNDTWVSFPSWSEDSTFVSSKKTPYEEQLHRCEDERFELDVVLETNLATIRVLESVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KEVLNDTWVSFPSWSEDSTFVSSKKTPYEEQLHRCEDERFELDVVLETNLATIRVLESVQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 KKLSRMAPEDQEKFRLDDSLGGTSEVIQRRAIYRIYGDKAPEIIESLKKNPVTAVPVVLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KKLSRMAPEDQEKFRLDDSLGGTSEVIQRRAIYRIYGDKAPEIIESLKKNPVTAVPVVLK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 RLKAKEEEWREAQQGFNKIWREQYEKAYLKSLDHQAVNFKQNDTKALRSKSLLNEIESVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLKAKEEEWREAQQGFNKIWREQYEKAYLKSLDHQAVNFKQNDTKALRSKSLLNEIESVY
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 DEHQEQHSEGRSAPSSEPHLIFVYEDRQILEDAAALISYYVKRQPAIQKEDQGTIHQLLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DEHQEQHSEGRSAPSSEPHLIFVYEDRQILEDAAALISYYVKRQPAIQKEDQGTIHQLLH
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 QFVPSLFFSQQLDLGASEESADEDRDSPQGQTTDPSERKKPAPGPHSSPPEEKGAFGDAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QFVPSLFFSQQLDLGASEESADEDRDSPQGQTTDPSERKKPAPGPHSSPPEEKGAFGDAP
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 ATEQPPLPPPAPHKPLDDVYSLFFANNNWYFFLRLHQTLCSRLLKIYRQAQKQLLEYRTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATEQPPLPPPAPHKPLDDVYSLFFANNNWYFFLRLHQTLCSRLLKIYRQAQKQLLEYRTE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 KEREKLLCEGRREKGSDPAMELRLKQPSEVELEEYYPAFLDMVRSLLEGSIDPTQYEDTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KEREKLLCEGRREKGSDPAMELRLKQPSEVELEEYYPAFLDMVRSLLEGSIDPTQYEDTL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 REMFTIHAYVGFTMDKLVQNIARQLHHLVSDDVCLKVVELYLNEKKRGAAGGNLSSRCVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REMFTIHAYVGFTMDKLVQNIARQLHHLVSDDVCLKVVELYLNEKKRGAAGGNLSSRCVR
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 AARETSYQWKAERCMADENCFKVMFLQRKGQVIMTIELLDTEEAQTEDPVEVQHLARYVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AARETSYQWKAERCMADENCFKVMFLQRKGQVIMTIELLDTEEAQTEDPVEVQHLARYVE
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 QYVGTEGASSSPTEGFLLKPVFLQRNLKKFRRRWQSEQARALRGEARSSWKRLVGVESAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QYVGTEGASSSPTEGFLLKPVFLQRNLKKFRRRWQSEQARALRGEARSSWKRLVGVESAC
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA0 DVDCRFKLSTHKMVFIVNSEDYMYRRGTLCRAKQVQPLVLLRHHQHFEEWHSRWLEDNVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DVDCRFKLSTHKMVFIVNSEDYMYRRGTLCRAKQVQPLVLLRHHQHFEEWHSRWLEDNVT
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130
pF1KA0 VEAASLVQDWLMGEEDEDMVPCKTLCETVHVHGLPVTRYRVQYSRRPASP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VEAASLVQDWLMGEEDEDMVPCKTLCETVHVHGLPVTRYRVQYSRRPASP
             1090      1100      1110      1120      1130

>>NP_001284526 (OMIM: 607777) paired amphipathic helix p  (720 aa)
 initn: 4759 init1: 4759 opt: 4759  Z-score: 3445.9  bits: 648.8 E(85289): 3.4e-185
Smith-Waterman score: 4759; 99.9% identity (100.0% similar) in 709 aa overlap (422-1130:12-720)

             400       410       420       430       440       450 
pF1KA0 ASCKRIGSSYRALPKTYQQPKCSGRTAICKEVLNDTWVSFPSWSEDSTFVSSKKTPYEEQ
                                     .:::::::::::::::::::::::::::::
NP_001                    MQRHSRHFLLVQVLNDTWVSFPSWSEDSTFVSSKKTPYEEQ
                                  10        20        30        40 

             460       470       480       490       500       510 
pF1KA0 LHRCEDERFELDVVLETNLATIRVLESVQKKLSRMAPEDQEKFRLDDSLGGTSEVIQRRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LHRCEDERFELDVVLETNLATIRVLESVQKKLSRMAPEDQEKFRLDDSLGGTSEVIQRRA
              50        60        70        80        90       100 

             520       530       540       550       560       570 
pF1KA0 IYRIYGDKAPEIIESLKKNPVTAVPVVLKRLKAKEEEWREAQQGFNKIWREQYEKAYLKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IYRIYGDKAPEIIESLKKNPVTAVPVVLKRLKAKEEEWREAQQGFNKIWREQYEKAYLKS
             110       120       130       140       150       160 

             580       590       600       610       620       630 
pF1KA0 LDHQAVNFKQNDTKALRSKSLLNEIESVYDEHQEQHSEGRSAPSSEPHLIFVYEDRQILE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LDHQAVNFKQNDTKALRSKSLLNEIESVYDEHQEQHSEGRSAPSSEPHLIFVYEDRQILE
             170       180       190       200       210       220 

             640       650       660       670       680       690 
pF1KA0 DAAALISYYVKRQPAIQKEDQGTIHQLLHQFVPSLFFSQQLDLGASEESADEDRDSPQGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DAAALISYYVKRQPAIQKEDQGTIHQLLHQFVPSLFFSQQLDLGASEESADEDRDSPQGQ
             230       240       250       260       270       280 

             700       710       720       730       740       750 
pF1KA0 TTDPSERKKPAPGPHSSPPEEKGAFGDAPATEQPPLPPPAPHKPLDDVYSLFFANNNWYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTDPSERKKPAPGPHSSPPEEKGAFGDAPATEQPPLPPPAPHKPLDDVYSLFFANNNWYF
             290       300       310       320       330       340 

             760       770       780       790       800       810 
pF1KA0 FLRLHQTLCSRLLKIYRQAQKQLLEYRTEKEREKLLCEGRREKGSDPAMELRLKQPSEVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FLRLHQTLCSRLLKIYRQAQKQLLEYRTEKEREKLLCEGRREKGSDPAMELRLKQPSEVE
             350       360       370       380       390       400 

             820       830       840       850       860       870 
pF1KA0 LEEYYPAFLDMVRSLLEGSIDPTQYEDTLREMFTIHAYVGFTMDKLVQNIARQLHHLVSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LEEYYPAFLDMVRSLLEGSIDPTQYEDTLREMFTIHAYVGFTMDKLVQNIARQLHHLVSD
             410       420       430       440       450       460 

             880       890       900       910       920       930 
pF1KA0 DVCLKVVELYLNEKKRGAAGGNLSSRCVRAARETSYQWKAERCMADENCFKVMFLQRKGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DVCLKVVELYLNEKKRGAAGGNLSSRCVRAARETSYQWKAERCMADENCFKVMFLQRKGQ
             470       480       490       500       510       520 

             940       950       960       970       980       990 
pF1KA0 VIMTIELLDTEEAQTEDPVEVQHLARYVEQYVGTEGASSSPTEGFLLKPVFLQRNLKKFR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VIMTIELLDTEEAQTEDPVEVQHLARYVEQYVGTEGASSSPTEGFLLKPVFLQRNLKKFR
             530       540       550       560       570       580 

            1000      1010      1020      1030      1040      1050 
pF1KA0 RRWQSEQARALRGEARSSWKRLVGVESACDVDCRFKLSTHKMVFIVNSEDYMYRRGTLCR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RRWQSEQARALRGEARSSWKRLVGVESACDVDCRFKLSTHKMVFIVNSEDYMYRRGTLCR
             590       600       610       620       630       640 

            1060      1070      1080      1090      1100      1110 
pF1KA0 AKQVQPLVLLRHHQHFEEWHSRWLEDNVTVEAASLVQDWLMGEEDEDMVPCKTLCETVHV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AKQVQPLVLLRHHQHFEEWHSRWLEDNVTVEAASLVQDWLMGEEDEDMVPCKTLCETVHV
             650       660       670       680       690       700 

            1120      1130
pF1KA0 HGLPVTRYRVQYSRRPASP
       :::::::::::::::::::
NP_001 HGLPVTRYRVQYSRRPASP
             710       720

>>NP_056075 (OMIM: 607777) paired amphipathic helix prot  (1162 aa)
 initn: 4757 init1: 4757 opt: 4757  Z-score: 3441.4  bits: 648.7 E(85289): 6e-185
Smith-Waterman score: 7512; 97.2% identity (97.2% similar) in 1162 aa overlap (1-1130:1-1162)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MAHAGGGSGGSGAGGPAGRGLSGARWGRSGSAGHEKLPVHVEDALTYLDQVKIRFGSDPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 MAHAGGGSGGSGAGGPAGRGLSGARWGRSGSAGHEKLPVHVEDALTYLDQVKIRFGSDPA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 TYNGFLEIMKEFKSQSIDTPGVIRRVSQLFHEHPDLIVGFNAFLPLGYRIDIPKNGKLNI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 TYNGFLEIMKEFKSQSIDTPGVIRRVSQLFHEHPDLIVGFNAFLPLGYRIDIPKNGKLNI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 QSPLTSQENSHNHGDGAEDFKQQVPYKEDKPQVPLESDSVEFNNAISYVNKIKTRFLDHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 QSPLTSQENSHNHGDGAEDFKQQVPYKEDKPQVPLESDSVEFNNAISYVNKIKTRFLDHP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 EIYRSFLEILHTYQKEQLNTRGRPFRGMSEEEVFTEVANLFRGQEDLLSEFGQFLPEAKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 EIYRSFLEILHTYQKEQLNTRGRPFRGMSEEEVFTEVANLFRGQEDLLSEFGQFLPEAKR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 SLFTGNGPCEMHSVQKNEHDKTPEHSRKRSRPSLLRPVSAPAKKKMKLRGTKDLSIAAVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 SLFTGNGPCEMHSVQKNEHDKTPEHSRKRSRPSLLRPVSAPAKKKMKLRGTKDLSIAAVG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 KYGTLQEFSFFDKVRRVLKSQEVYENFLRCIALFNQELVSGSELLQLVSPFLGKFPELFA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 KYGTLQEFSFFDKVRRVLKSQEVYENFLRCIALFNQELVSGSELLQLVSPFLGKFPELFA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 QFKSFLGVKELSFAPPMSDRSGDGISREIDYASCKRIGSSYRALPKTYQQPKCSGRTAIC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 QFKSFLGVKELSFAPPMSDRSGDGISREIDYASCKRIGSSYRALPKTYQQPKCSGRTAIC
              370       380       390       400       410       420

                                              430       440        
pF1KA0 KE--------------------------------VLNDTWVSFPSWSEDSTFVSSKKTPY
       ::                                ::::::::::::::::::::::::::
NP_056 KELDHWTLLQGSWTDDYCMSKFKNTCWIPGYSAGVLNDTWVSFPSWSEDSTFVSSKKTPY
              430       440       450       460       470       480

      450       460       470       480       490       500        
pF1KA0 EEQLHRCEDERFELDVVLETNLATIRVLESVQKKLSRMAPEDQEKFRLDDSLGGTSEVIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 EEQLHRCEDERFELDVVLETNLATIRVLESVQKKLSRMAPEDQEKFRLDDSLGGTSEVIQ
              490       500       510       520       530       540

      510       520       530       540       550       560        
pF1KA0 RRAIYRIYGDKAPEIIESLKKNPVTAVPVVLKRLKAKEEEWREAQQGFNKIWREQYEKAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 RRAIYRIYGDKAPEIIESLKKNPVTAVPVVLKRLKAKEEEWREAQQGFNKIWREQYEKAY
              550       560       570       580       590       600

      570       580       590       600       610       620        
pF1KA0 LKSLDHQAVNFKQNDTKALRSKSLLNEIESVYDEHQEQHSEGRSAPSSEPHLIFVYEDRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LKSLDHQAVNFKQNDTKALRSKSLLNEIESVYDEHQEQHSEGRSAPSSEPHLIFVYEDRQ
              610       620       630       640       650       660

      630       640       650       660       670       680        
pF1KA0 ILEDAAALISYYVKRQPAIQKEDQGTIHQLLHQFVPSLFFSQQLDLGASEESADEDRDSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 ILEDAAALISYYVKRQPAIQKEDQGTIHQLLHQFVPSLFFSQQLDLGASEESADEDRDSP
              670       680       690       700       710       720

      690       700       710       720       730       740        
pF1KA0 QGQTTDPSERKKPAPGPHSSPPEEKGAFGDAPATEQPPLPPPAPHKPLDDVYSLFFANNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 QGQTTDPSERKKPAPGPHSSPPEEKGAFGDAPATEQPPLPPPAPHKPLDDVYSLFFANNN
              730       740       750       760       770       780

      750       760       770       780       790       800        
pF1KA0 WYFFLRLHQTLCSRLLKIYRQAQKQLLEYRTEKEREKLLCEGRREKGSDPAMELRLKQPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 WYFFLRLHQTLCSRLLKIYRQAQKQLLEYRTEKEREKLLCEGRREKGSDPAMELRLKQPS
              790       800       810       820       830       840

      810       820       830       840       850       860        
pF1KA0 EVELEEYYPAFLDMVRSLLEGSIDPTQYEDTLREMFTIHAYVGFTMDKLVQNIARQLHHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 EVELEEYYPAFLDMVRSLLEGSIDPTQYEDTLREMFTIHAYVGFTMDKLVQNIARQLHHL
              850       860       870       880       890       900

      870       880       890       900       910       920        
pF1KA0 VSDDVCLKVVELYLNEKKRGAAGGNLSSRCVRAARETSYQWKAERCMADENCFKVMFLQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 VSDDVCLKVVELYLNEKKRGAAGGNLSSRCVRAARETSYQWKAERCMADENCFKVMFLQR
              910       920       930       940       950       960

      930       940       950       960       970       980        
pF1KA0 KGQVIMTIELLDTEEAQTEDPVEVQHLARYVEQYVGTEGASSSPTEGFLLKPVFLQRNLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 KGQVIMTIELLDTEEAQTEDPVEVQHLARYVEQYVGTEGASSSPTEGFLLKPVFLQRNLK
              970       980       990      1000      1010      1020

      990      1000      1010      1020      1030      1040        
pF1KA0 KFRRRWQSEQARALRGEARSSWKRLVGVESACDVDCRFKLSTHKMVFIVNSEDYMYRRGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 KFRRRWQSEQARALRGEARSSWKRLVGVESACDVDCRFKLSTHKMVFIVNSEDYMYRRGT
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

     1050      1060      1070      1080      1090      1100        
pF1KA0 LCRAKQVQPLVLLRHHQHFEEWHSRWLEDNVTVEAASLVQDWLMGEEDEDMVPCKTLCET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LCRAKQVQPLVLLRHHQHFEEWHSRWLEDNVTVEAASLVQDWLMGEEDEDMVPCKTLCET
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

     1110      1120      1130
pF1KA0 VHVHGLPVTRYRVQYSRRPASP
       ::::::::::::::::::::::
NP_056 VHVHGLPVTRYRVQYSRRPASP
             1150      1160  

>>XP_006722767 (OMIM: 607777) PREDICTED: paired amphipat  (645 aa)
 initn: 4347 init1: 4347 opt: 4347  Z-score: 3149.1  bits: 593.8 E(85289): 1.1e-168
Smith-Waterman score: 4347; 100.0% identity (100.0% similar) in 645 aa overlap (486-1130:1-645)

         460       470       480       490       500       510     
pF1KA0 EDERFELDVVLETNLATIRVLESVQKKLSRMAPEDQEKFRLDDSLGGTSEVIQRRAIYRI
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006                               MAPEDQEKFRLDDSLGGTSEVIQRRAIYRI
                                             10        20        30

         520       530       540       550       560       570     
pF1KA0 YGDKAPEIIESLKKNPVTAVPVVLKRLKAKEEEWREAQQGFNKIWREQYEKAYLKSLDHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 YGDKAPEIIESLKKNPVTAVPVVLKRLKAKEEEWREAQQGFNKIWREQYEKAYLKSLDHQ
               40        50        60        70        80        90

         580       590       600       610       620       630     
pF1KA0 AVNFKQNDTKALRSKSLLNEIESVYDEHQEQHSEGRSAPSSEPHLIFVYEDRQILEDAAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AVNFKQNDTKALRSKSLLNEIESVYDEHQEQHSEGRSAPSSEPHLIFVYEDRQILEDAAA
              100       110       120       130       140       150

         640       650       660       670       680       690     
pF1KA0 LISYYVKRQPAIQKEDQGTIHQLLHQFVPSLFFSQQLDLGASEESADEDRDSPQGQTTDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LISYYVKRQPAIQKEDQGTIHQLLHQFVPSLFFSQQLDLGASEESADEDRDSPQGQTTDP
              160       170       180       190       200       210

         700       710       720       730       740       750     
pF1KA0 SERKKPAPGPHSSPPEEKGAFGDAPATEQPPLPPPAPHKPLDDVYSLFFANNNWYFFLRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SERKKPAPGPHSSPPEEKGAFGDAPATEQPPLPPPAPHKPLDDVYSLFFANNNWYFFLRL
              220       230       240       250       260       270

         760       770       780       790       800       810     
pF1KA0 HQTLCSRLLKIYRQAQKQLLEYRTEKEREKLLCEGRREKGSDPAMELRLKQPSEVELEEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 HQTLCSRLLKIYRQAQKQLLEYRTEKEREKLLCEGRREKGSDPAMELRLKQPSEVELEEY
              280       290       300       310       320       330

         820       830       840       850       860       870     
pF1KA0 YPAFLDMVRSLLEGSIDPTQYEDTLREMFTIHAYVGFTMDKLVQNIARQLHHLVSDDVCL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 YPAFLDMVRSLLEGSIDPTQYEDTLREMFTIHAYVGFTMDKLVQNIARQLHHLVSDDVCL
              340       350       360       370       380       390

         880       890       900       910       920       930     
pF1KA0 KVVELYLNEKKRGAAGGNLSSRCVRAARETSYQWKAERCMADENCFKVMFLQRKGQVIMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KVVELYLNEKKRGAAGGNLSSRCVRAARETSYQWKAERCMADENCFKVMFLQRKGQVIMT
              400       410       420       430       440       450

         940       950       960       970       980       990     
pF1KA0 IELLDTEEAQTEDPVEVQHLARYVEQYVGTEGASSSPTEGFLLKPVFLQRNLKKFRRRWQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 IELLDTEEAQTEDPVEVQHLARYVEQYVGTEGASSSPTEGFLLKPVFLQRNLKKFRRRWQ
              460       470       480       490       500       510

        1000      1010      1020      1030      1040      1050     
pF1KA0 SEQARALRGEARSSWKRLVGVESACDVDCRFKLSTHKMVFIVNSEDYMYRRGTLCRAKQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SEQARALRGEARSSWKRLVGVESACDVDCRFKLSTHKMVFIVNSEDYMYRRGTLCRAKQV
              520       530       540       550       560       570

        1060      1070      1080      1090      1100      1110     
pF1KA0 QPLVLLRHHQHFEEWHSRWLEDNVTVEAASLVQDWLMGEEDEDMVPCKTLCETVHVHGLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 QPLVLLRHHQHFEEWHSRWLEDNVTVEAASLVQDWLMGEEDEDMVPCKTLCETVHVHGLP
              580       590       600       610       620       630

        1120      1130
pF1KA0 VTRYRVQYSRRPASP
       :::::::::::::::
XP_006 VTRYRVQYSRRPASP
              640     

>>NP_001138830 (OMIM: 607776,613406) paired amphipathic   (1273 aa)
 initn: 3914 init1: 1503 opt: 1885  Z-score: 1367.3  bits: 265.0 E(85289): 2e-69
Smith-Waterman score: 3851; 52.7% identity (75.8% similar) in 1162 aa overlap (44-1130:126-1273)

            20        30        40        50        60        70   
pF1KA0 GGPAGRGLSGARWGRSGSAGHEKLPVHVEDALTYLDQVKIRFGSDPATYNGFLEIMKEFK
                                     ::.::::::..:::.: .:: ::.::::::
NP_001 GQVVQSHAHPAPPVAPVQGQQQFQRLKVEDALSYLDQVKLQFGSQPQVYNDFLDIMKEFK
         100       110       120       130       140       150     

            80        90       100       110       120             
pF1KA0 SQSIDTPGVIRRVSQLFHEHPDLIVGFNAFLPLGYRIDIPKNGKLNIQSP----------
       :::::::::: ::::::. :::::.:::.::: ::.:..  :  .:. .:          
NP_001 SQSIDTPGVISRVSQLFKGHPDLIMGFNTFLPPGYKIEVQTNDMVNVTTPGQVHQIPTHG
         160       170       180       190       200       210     

                     130       140       150                       
pF1KA0 ----------LTSQENSHNHGDGAEDFKQQVPYKEDKP-----------QVP--------
                   :: ....    :.   :  : : .::           :.:        
NP_001 IQPQPQPPPQHPSQPSAQSAPAPAQPAPQPPPAKVSKPSQLQAHTPASQQTPPLPPYASP
         220       230       240       250       260       270     

                               160       170       180       190   
pF1KA0 --------------------LESDS-VEFNNAISYVNKIKTRFLDHPEIYRSFLEILHTY
                           :.... ::::.::.::::::.::  .:.::..::::::::
NP_001 RSPPVQPHTPVTISLGTAPSLQNNQPVEFNHAINYVNKIKNRFQGQPDIYKAFLEILHTY
         280       290       300       310       320       330     

           200          210       220       230       240       250
pF1KA0 QKEQLNTR---GRPFRGMSEEEVFTEVANLFRGQEDLLSEFGQFLPEAKRSLFTGNGPCE
       :::: :..   :    ...:.::...:: ::..:::::::::::::.:. :.. ..   :
NP_001 QKEQRNAKEAGGNYTPALTEQEVYAQVARLFKNQEDLLSEFGQFLPDANSSVLLSKTTAE
         340       350       360       370       380       390     

              260          270               280       290         
pF1KA0 MHSVQKNEHD---KTPEHSRKRSRPSL----LR--PV--SAPAKKKMKLRGTKDLSIAAV
         .  .:.:    : :. . : .:::     .:  :.  . :.::: :: . :: :.: .
NP_001 KVDSVRNDHGGTVKKPQLNNKPQRPSQNGCQIRRHPTGTTPPVKKKPKLLNLKDSSMADA
         400       410       420       430       440       450     

     300       310       320       330       340       350         
pF1KA0 GKYGTLQEFSFFDKVRRVLKSQEVYENFLRCIALFNQELVSGSELLQLVSPFLGKFPELF
       .:.:   :  ::::::..:.: :.:::::::...::::..: .::.::::::::::::::
NP_001 SKHGGGTESLFFDKVRKALRSAEAYENFLRCLVIFNQEVISRAELVQLVSPFLGKFPELF
         460       470       480       490       500       510     

     360       370        380       390       400       410        
pF1KA0 AQFKSFLGVKE-LSFAPPMSDRSGDGISREIDYASCKRIGSSYRALPKTYQQPKCSGRTA
         ::.::: :: . .    ..:. .::. :::::::::.:::::::::.::::::.::: 
NP_001 NWFKNFLGYKESVHLETYPKERATEGIAMEIDYASCKRLGSSYRALPKSYQQPKCTGRTP
         520       530       540       550       560       570     

      420       430       440       450       460       470        
pF1KA0 ICKEVLNDTWVSFPSWSEDSTFVSSKKTPYEEQLHRCEDERFELDVVLETNLATIRVLES
       .::::::::::::::::::::::::::: :::...::::::::::::::::::::::::.
NP_001 LCKEVLNDTWVSFPSWSEDSTFVSSKKTQYEEHIYRCEDERFELDVVLETNLATIRVLEA
         580       590       600       610       620       630     

      480       490       500       510       520       530        
pF1KA0 VQKKLSRMAPEDQEKFRLDDSLGGTSEVIQRRAIYRIYGDKAPEIIESLKKNPVTAVPVV
       .::::::.. :.: :::::..::::::::.:.:. :::.::: .::..:.:::  :::.:
NP_001 IQKKLSRLSAEEQAKFRLDNTLGGTSEVIHRKALQRIYADKAADIIDGLRKNPSIAVPIV
         640       650       660       670       680       690     

      540       550       560       570       580       590        
pF1KA0 LKRLKAKEEEWREAQQGFNKIWREQYEKAYLKSLDHQAVNFKQNDTKALRSKSLLNEIES
       ::::: :::::::::.::::.:::: :: ::::::::..::::::::.::::::::::::
NP_001 LKRLKMKEEEWREAQRGFNKVWREQNEKYYLKSLDHQGINFKQNDTKVLRSKSLLNEIES
         700       710       720       730       740       750     

      600       610       620       630       640       650        
pF1KA0 VYDEHQEQHSEGRSAPSSEPHLIFVYEDRQILEDAAALISYYVKRQPAIQKEDQGTIHQL
       .:::.::: .:  ..    ::: ..:::.:::::::::: ..:::: .:::::.  :.:.
NP_001 IYDERQEQATEENAGVPVGPHLSLAYEDKQILEDAAALIIHHVKRQTGIQKEDKYKIKQI
         760       770       780       790       800       810     

      660       670       680       690       700       710        
pF1KA0 LHQFVPSLFFSQQLDLGASEESADEDRDSPQGQTTDPSERKKPAPGPHSSPPEEKGAFGD
       .:.:.:.:.:.:. ::.  ::  .:. :  ..  :   .... . :   :::. :  :..
NP_001 MHHFIPDLLFAQRGDLSDVEEEEEEEMDVDEA--TGAVKKHNGVGG---SPPKSKLLFSN
         820       830       840         850          860       870

      720       730       740       750       760       770        
pF1KA0 APATEQPPLPPPAPHKPLDDVYSLFFANNNWYFFLRLHQTLCSRLLKIYRQAQKQLLEYR
       . : .          . .:.::.::..:::::.:.:::: :: :::.:  ::..:. :  
NP_001 TAAQKL---------RGMDEVYNLFYVNNNWYIFMRLHQILCLRLLRICSQAERQIEEEN
                       880       890       900       910       920 

      780       790       800       810       820       830        
pF1KA0 TEKEREKLLCEGRREKGSDPAMELRLKQPSEVELEEYYPAFLDMVRSLLEGSIDPTQYED
        :.: :. .   .:.:...::..::::.: .:..:.:::::::::::::.:.:: .::::
NP_001 REREWEREVLGIKRDKSDSPAIQLRLKEPMDVDVEDYYPAFLDMVRSLLDGNIDSSQYED
             930       940       950       960       970       980 

      840       850       860       870       880       890        
pF1KA0 TLREMFTIHAYVGFTMDKLVQNIARQLHHLVSDDVCLKVVELYLNEKKRGAAGGNLSSRC
       .::::::::::..::::::.:.:.:::.:.:::..:..:..::: :.. ::.::.:... 
NP_001 SLREMFTIHAYIAFTMDKLIQSIVRQLQHIVSDEICVQVTDLYLAENNNGATGGQLNTQN
             990      1000      1010      1020      1030      1040 

      900       910       920       930       940       950        
pF1KA0 VRAARETSYQWKAERCMADENCFKVMFLQRKGQVIMTIELLDTEEAQTEDPVEVQHLARY
        :.  :..:: :::. :.::::::.::.: .::: .::::::::: ...::::... . :
NP_001 SRSLLESTYQRKAEQLMSDENCFKLMFIQSQGQVQLTIELLDTEEENSDDPVEAERWSDY
            1050      1060      1070      1080      1090      1100 

      960       970       980       990      1000      1010        
pF1KA0 VEQYVGTEGASSSPTEGFLLKPVFLQRNLKKFRRRWQSEQARALRGEARSSWKRLVGVES
       ::.:.... .:    : .  ::::: :::...:.  .... .  .:.  .: : . .:.:
NP_001 VERYMNSDTTSPELREHLAQKPVFLPRNLRRIRKCQRGREQQEKEGKEGNSKKTMENVDS
            1110      1120      1130      1140      1150      1160 

     1020      1030      1040      1050      1060      1070        
pF1KA0 ACDVDCRFKLSTHKMVFIVNSEDYMYRRGTLCRAKQVQPLVLLRHHQHFEEWHSRWLEDN
          ..:::::...:::....:::::::: .: ::.: .  :  : ::.:. : ..: ...
NP_001 LDKLECRFKLNSYKMVYVIKSEDYMYRRTALLRAHQSHERVSKRLHQRFQAWVDKWTKEH
            1170      1180      1190      1200      1210      1220 

     1080      1090      1100      1110      1120      1130
pF1KA0 VTVEAASLVQDWLMGEEDEDMVPCKTLCETVHVHGLPVTRYRVQYSRRPASP
       :  : :. .. :::::  : .::: : :.:  .: . ...:::.:.    .:
NP_001 VPREMAAETSKWLMGEGLEGLVPCTTTCDTETLHFVSINKYRVKYGTVFKAP
            1230      1240      1250      1260      1270   

>>NP_001138829 (OMIM: 607776,613406) paired amphipathic   (1273 aa)
 initn: 3914 init1: 1503 opt: 1885  Z-score: 1367.3  bits: 265.0 E(85289): 2e-69
Smith-Waterman score: 3851; 52.7% identity (75.8% similar) in 1162 aa overlap (44-1130:126-1273)

            20        30        40        50        60        70   
pF1KA0 GGPAGRGLSGARWGRSGSAGHEKLPVHVEDALTYLDQVKIRFGSDPATYNGFLEIMKEFK
                                     ::.::::::..:::.: .:: ::.::::::
NP_001 GQVVQSHAHPAPPVAPVQGQQQFQRLKVEDALSYLDQVKLQFGSQPQVYNDFLDIMKEFK
         100       110       120       130       140       150     

            80        90       100       110       120             
pF1KA0 SQSIDTPGVIRRVSQLFHEHPDLIVGFNAFLPLGYRIDIPKNGKLNIQSP----------
       :::::::::: ::::::. :::::.:::.::: ::.:..  :  .:. .:          
NP_001 SQSIDTPGVISRVSQLFKGHPDLIMGFNTFLPPGYKIEVQTNDMVNVTTPGQVHQIPTHG
         160       170       180       190       200       210     

                     130       140       150                       
pF1KA0 ----------LTSQENSHNHGDGAEDFKQQVPYKEDKP-----------QVP--------
                   :: ....    :.   :  : : .::           :.:        
NP_001 IQPQPQPPPQHPSQPSAQSAPAPAQPAPQPPPAKVSKPSQLQAHTPASQQTPPLPPYASP
         220       230       240       250       260       270     

                               160       170       180       190   
pF1KA0 --------------------LESDS-VEFNNAISYVNKIKTRFLDHPEIYRSFLEILHTY
                           :.... ::::.::.::::::.::  .:.::..::::::::
NP_001 RSPPVQPHTPVTISLGTAPSLQNNQPVEFNHAINYVNKIKNRFQGQPDIYKAFLEILHTY
         280       290       300       310       320       330     

           200          210       220       230       240       250
pF1KA0 QKEQLNTR---GRPFRGMSEEEVFTEVANLFRGQEDLLSEFGQFLPEAKRSLFTGNGPCE
       :::: :..   :    ...:.::...:: ::..:::::::::::::.:. :.. ..   :
NP_001 QKEQRNAKEAGGNYTPALTEQEVYAQVARLFKNQEDLLSEFGQFLPDANSSVLLSKTTAE
         340       350       360       370       380       390     

              260          270               280       290         
pF1KA0 MHSVQKNEHD---KTPEHSRKRSRPSL----LR--PV--SAPAKKKMKLRGTKDLSIAAV
         .  .:.:    : :. . : .:::     .:  :.  . :.::: :: . :: :.: .
NP_001 KVDSVRNDHGGTVKKPQLNNKPQRPSQNGCQIRRHPTGTTPPVKKKPKLLNLKDSSMADA
         400       410       420       430       440       450     

     300       310       320       330       340       350         
pF1KA0 GKYGTLQEFSFFDKVRRVLKSQEVYENFLRCIALFNQELVSGSELLQLVSPFLGKFPELF
       .:.:   :  ::::::..:.: :.:::::::...::::..: .::.::::::::::::::
NP_001 SKHGGGTESLFFDKVRKALRSAEAYENFLRCLVIFNQEVISRAELVQLVSPFLGKFPELF
         460       470       480       490       500       510     

     360       370        380       390       400       410        
pF1KA0 AQFKSFLGVKE-LSFAPPMSDRSGDGISREIDYASCKRIGSSYRALPKTYQQPKCSGRTA
         ::.::: :: . .    ..:. .::. :::::::::.:::::::::.::::::.::: 
NP_001 NWFKNFLGYKESVHLETYPKERATEGIAMEIDYASCKRLGSSYRALPKSYQQPKCTGRTP
         520       530       540       550       560       570     

      420       430       440       450       460       470        
pF1KA0 ICKEVLNDTWVSFPSWSEDSTFVSSKKTPYEEQLHRCEDERFELDVVLETNLATIRVLES
       .::::::::::::::::::::::::::: :::...::::::::::::::::::::::::.
NP_001 LCKEVLNDTWVSFPSWSEDSTFVSSKKTQYEEHIYRCEDERFELDVVLETNLATIRVLEA
         580       590       600       610       620       630     

      480       490       500       510       520       530        
pF1KA0 VQKKLSRMAPEDQEKFRLDDSLGGTSEVIQRRAIYRIYGDKAPEIIESLKKNPVTAVPVV
       .::::::.. :.: :::::..::::::::.:.:. :::.::: .::..:.:::  :::.:
NP_001 IQKKLSRLSAEEQAKFRLDNTLGGTSEVIHRKALQRIYADKAADIIDGLRKNPSIAVPIV
         640       650       660       670       680       690     

      540       550       560       570       580       590        
pF1KA0 LKRLKAKEEEWREAQQGFNKIWREQYEKAYLKSLDHQAVNFKQNDTKALRSKSLLNEIES
       ::::: :::::::::.::::.:::: :: ::::::::..::::::::.::::::::::::
NP_001 LKRLKMKEEEWREAQRGFNKVWREQNEKYYLKSLDHQGINFKQNDTKVLRSKSLLNEIES
         700       710       720       730       740       750     

      600       610       620       630       640       650        
pF1KA0 VYDEHQEQHSEGRSAPSSEPHLIFVYEDRQILEDAAALISYYVKRQPAIQKEDQGTIHQL
       .:::.::: .:  ..    ::: ..:::.:::::::::: ..:::: .:::::.  :.:.
NP_001 IYDERQEQATEENAGVPVGPHLSLAYEDKQILEDAAALIIHHVKRQTGIQKEDKYKIKQI
         760       770       780       790       800       810     

      660       670       680       690       700       710        
pF1KA0 LHQFVPSLFFSQQLDLGASEESADEDRDSPQGQTTDPSERKKPAPGPHSSPPEEKGAFGD
       .:.:.:.:.:.:. ::.  ::  .:. :  ..  :   .... . :   :::. :  :..
NP_001 MHHFIPDLLFAQRGDLSDVEEEEEEEMDVDEA--TGAVKKHNGVGG---SPPKSKLLFSN
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pF1KA0 APATEQPPLPPPAPHKPLDDVYSLFFANNNWYFFLRLHQTLCSRLLKIYRQAQKQLLEYR
       . : .          . .:.::.::..:::::.:.:::: :: :::.:  ::..:. :  
NP_001 TAAQKL---------RGMDEVYNLFYVNNNWYIFMRLHQILCLRLLRICSQAERQIEEEN
                       880       890       900       910       920 

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pF1KA0 TEKEREKLLCEGRREKGSDPAMELRLKQPSEVELEEYYPAFLDMVRSLLEGSIDPTQYED
        :.: :. .   .:.:...::..::::.: .:..:.:::::::::::::.:.:: .::::
NP_001 REREWEREVLGIKRDKSDSPAIQLRLKEPMDVDVEDYYPAFLDMVRSLLDGNIDSSQYED
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pF1KA0 TLREMFTIHAYVGFTMDKLVQNIARQLHHLVSDDVCLKVVELYLNEKKRGAAGGNLSSRC
       .::::::::::..::::::.:.:.:::.:.:::..:..:..::: :.. ::.::.:... 
NP_001 SLREMFTIHAYIAFTMDKLIQSIVRQLQHIVSDEICVQVTDLYLAENNNGATGGQLNTQN
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pF1KA0 VRAARETSYQWKAERCMADENCFKVMFLQRKGQVIMTIELLDTEEAQTEDPVEVQHLARY
        :.  :..:: :::. :.::::::.::.: .::: .::::::::: ...::::... . :
NP_001 SRSLLESTYQRKAEQLMSDENCFKLMFIQSQGQVQLTIELLDTEEENSDDPVEAERWSDY
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pF1KA0 VEQYVGTEGASSSPTEGFLLKPVFLQRNLKKFRRRWQSEQARALRGEARSSWKRLVGVES
       ::.:.... .:    : .  ::::: :::...:.  .... .  .:.  .: : . .:.:
NP_001 VERYMNSDTTSPELREHLAQKPVFLPRNLRRIRKCQRGREQQEKEGKEGNSKKTMENVDS
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pF1KA0 ACDVDCRFKLSTHKMVFIVNSEDYMYRRGTLCRAKQVQPLVLLRHHQHFEEWHSRWLEDN
          ..:::::...:::....:::::::: .: ::.: .  :  : ::.:. : ..: ...
NP_001 LDKLECRFKLNSYKMVYVIKSEDYMYRRTALLRAHQSHERVSKRLHQRFQAWVDKWTKEH
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pF1KA0 VTVEAASLVQDWLMGEEDEDMVPCKTLCETVHVHGLPVTRYRVQYSRRPASP
       :  : :. .. :::::  : .::: : :.:  .: . ...:::.:.    .:
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       :::::::::: ::::::. :::::.:::.::: ::.:..  :  .:. .:          
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pF1KA0 QKEQLNTR---GRPFRGMSEEEVFTEVANLFRGQEDLLSEFGQFLPEAKRSLFTGNGPCE
       :::: :..   :    ...:.::...:: ::..:::::::::::::.:. :.. ..   :
XP_006 QKEQRNAKEAGGNYTPALTEQEVYAQVARLFKNQEDLLSEFGQFLPDANSSVLLSKTTAE
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         .  .:.:    : :. . : .:::     .:  :.  . :.::: :: . :: :.: .
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pF1KA0 GKYGTLQEFSFFDKVRRVLKSQEVYENFLRCIALFNQELVSGSELLQLVSPFLGKFPELF
       .:.:   :  ::::::..:.: :.:::::::...::::..: .::.::::::::::::::
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pF1KA0 AQFKSFLGVKE-LSFAPPMSDRSGDGISREIDYASCKRIGSSYRALPKTYQQPKCSGRTA
         ::.::: :: . .    ..:. .::. :::::::::.:::::::::.::::::.::: 
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       .::::::::::::::::::::::::::: :::...::::::::::::::::::::::::.
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       .::::::.. :.: :::::..::::::::.:.:. :::.::: .::..:.:::  :::.:
XP_006 IQKKLSRLSAEEQAKFRLDNTLGGTSEVIHRKALQRIYADKAADIIDGLRKNPSIAVPIV
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pF1KA0 LKRLKAKEEEWREAQQGFNKIWREQYEKAYLKSLDHQAVNFKQNDTKALRSKSLLNEIES
       ::::: :::::::::.::::.:::: :: ::::::::..::::::::.::::::::::::
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       .:::.::: .:  ..    ::: ..:::.:::::::::: ..:::: .:::::.  :.:.
XP_006 IYDERQEQATEENAGVPVGPHLSLAYEDKQILEDAAALIIHHVKRQTGIQKEDKYKIKQI
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pF1KA0 LHQFVPSLFFSQQLDLGASEESADEDRDSPQGQTTDPSERKKPAPGPHSSPPEEKGAFGD
       .:.:.:.:.:.:. ::.  ::  .:. :  ..  :   .... . :   :::. :  :..
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XP_006 REREWEREVLGIKRDKSDSPAIQLRLKEPMDVDVEDYYPAFLDMVRSLLDGNIDSSQYED
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>>XP_006720528 (OMIM: 607776,613406) PREDICTED: paired a  (1273 aa)
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           200          210       220       230       240       250
pF1KA0 QKEQLNTR---GRPFRGMSEEEVFTEVANLFRGQEDLLSEFGQFLPEAKRSLFTGNGPCE
       :::: :..   :    ...:.::...:: ::..:::::::::::::.:. :.. ..   :
XP_006 QKEQRNAKEAGGNYTPALTEQEVYAQVARLFKNQEDLLSEFGQFLPDANSSVLLSKTTAE
         340       350       360       370       380       390     

              260          270               280       290         
pF1KA0 MHSVQKNEHD---KTPEHSRKRSRPSL----LR--PV--SAPAKKKMKLRGTKDLSIAAV
         .  .:.:    : :. . : .:::     .:  :.  . :.::: :: . :: :.: .
XP_006 KVDSVRNDHGGTVKKPQLNNKPQRPSQNGCQIRRHPTGTTPPVKKKPKLLNLKDSSMADA
         400       410       420       430       440       450     

     300       310       320       330       340       350         
pF1KA0 GKYGTLQEFSFFDKVRRVLKSQEVYENFLRCIALFNQELVSGSELLQLVSPFLGKFPELF
       .:.:   :  ::::::..:.: :.:::::::...::::..: .::.::::::::::::::
XP_006 SKHGGGTESLFFDKVRKALRSAEAYENFLRCLVIFNQEVISRAELVQLVSPFLGKFPELF
         460       470       480       490       500       510     

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pF1KA0 AQFKSFLGVKE-LSFAPPMSDRSGDGISREIDYASCKRIGSSYRALPKTYQQPKCSGRTA
         ::.::: :: . .    ..:. .::. :::::::::.:::::::::.::::::.::: 
XP_006 NWFKNFLGYKESVHLETYPKERATEGIAMEIDYASCKRLGSSYRALPKSYQQPKCTGRTP
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pF1KA0 ICKEVLNDTWVSFPSWSEDSTFVSSKKTPYEEQLHRCEDERFELDVVLETNLATIRVLES
       .::::::::::::::::::::::::::: :::...::::::::::::::::::::::::.
XP_006 LCKEVLNDTWVSFPSWSEDSTFVSSKKTQYEEHIYRCEDERFELDVVLETNLATIRVLEA
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pF1KA0 VQKKLSRMAPEDQEKFRLDDSLGGTSEVIQRRAIYRIYGDKAPEIIESLKKNPVTAVPVV
       .::::::.. :.: :::::..::::::::.:.:. :::.::: .::..:.:::  :::.:
XP_006 IQKKLSRLSAEEQAKFRLDNTLGGTSEVIHRKALQRIYADKAADIIDGLRKNPSIAVPIV
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pF1KA0 LKRLKAKEEEWREAQQGFNKIWREQYEKAYLKSLDHQAVNFKQNDTKALRSKSLLNEIES
       ::::: :::::::::.::::.:::: :: ::::::::..::::::::.::::::::::::
XP_006 LKRLKMKEEEWREAQRGFNKVWREQNEKYYLKSLDHQGINFKQNDTKVLRSKSLLNEIES
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pF1KA0 VYDEHQEQHSEGRSAPSSEPHLIFVYEDRQILEDAAALISYYVKRQPAIQKEDQGTIHQL
       .:::.::: .:  ..    ::: ..:::.:::::::::: ..:::: .:::::.  :.:.
XP_006 IYDERQEQATEENAGVPVGPHLSLAYEDKQILEDAAALIIHHVKRQTGIQKEDKYKIKQI
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pF1KA0 LHQFVPSLFFSQQLDLGASEESADEDRDSPQGQTTDPSERKKPAPGPHSSPPEEKGAFGD
       .:.:.:.:.:.:. ::.  ::  .:. :  ..  :   .... . :   :::. :  :..
XP_006 MHHFIPDLLFAQRGDLSDVEEEEEEEMDVDEA--TGAVKKHNGVGG---SPPKSKLLFSN
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pF1KA0 APATEQPPLPPPAPHKPLDDVYSLFFANNNWYFFLRLHQTLCSRLLKIYRQAQKQLLEYR
       . : .          . .:.::.::..:::::.:.:::: :: :::.:  ::..:. :  
XP_006 TAAQKL---------RGMDEVYNLFYVNNNWYIFMRLHQILCLRLLRICSQAERQIEEEN
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pF1KA0 TEKEREKLLCEGRREKGSDPAMELRLKQPSEVELEEYYPAFLDMVRSLLEGSIDPTQYED
        :.: :. .   .:.:...::..::::.: .:..:.:::::::::::::.:.:: .::::
XP_006 REREWEREVLGIKRDKSDSPAIQLRLKEPMDVDVEDYYPAFLDMVRSLLDGNIDSSQYED
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pF1KA0 TLREMFTIHAYVGFTMDKLVQNIARQLHHLVSDDVCLKVVELYLNEKKRGAAGGNLSSRC
       .::::::::::..::::::.:.:.:::.:.:::..:..:..::: :.. ::.::.:... 
XP_006 SLREMFTIHAYIAFTMDKLIQSIVRQLQHIVSDEICVQVTDLYLAENNNGATGGQLNTQN
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pF1KA0 VRAARETSYQWKAERCMADENCFKVMFLQRKGQVIMTIELLDTEEAQTEDPVEVQHLARY
        :.  :..:: :::. :.::::::.::.: .::: .::::::::: ...::::... . :
XP_006 SRSLLESTYQRKAEQLMSDENCFKLMFIQSQGQVQLTIELLDTEEENSDDPVEAERWSDY
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pF1KA0 VEQYVGTEGASSSPTEGFLLKPVFLQRNLKKFRRRWQSEQARALRGEARSSWKRLVGVES
       ::.:.... .:    : .  ::::: :::...:.  .... .  .:.  .: : . .:.:
XP_006 VERYMNSDTTSPELREHLAQKPVFLPRNLRRIRKCQRGREQQEKEGKEGNSKKTMENVDS
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pF1KA0 ACDVDCRFKLSTHKMVFIVNSEDYMYRRGTLCRAKQVQPLVLLRHHQHFEEWHSRWLEDN
          ..:::::...:::....:::::::: .: ::.: .  :  : ::.:. : ..: ...
XP_006 LDKLECRFKLNSYKMVYVIKSEDYMYRRTALLRAHQSHERVSKRLHQRFQAWVDKWTKEH
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pF1KA0 VTVEAASLVQDWLMGEEDEDMVPCKTLCETVHVHGLPVTRYRVQYSRRPASP
       :  : :. .. :::::  : .::: : :.:  .: . ...:::.:.    .:
XP_006 VPREMAAETSKWLMGEGLEGLVPCTTTCDTETLHFVSINKYRVKYGTVFKAP
            1230      1240      1250      1260      1270   

>>XP_006720530 (OMIM: 607776,613406) PREDICTED: paired a  (1273 aa)
 initn: 3914 init1: 1503 opt: 1885  Z-score: 1367.3  bits: 265.0 E(85289): 2e-69
Smith-Waterman score: 3851; 52.7% identity (75.8% similar) in 1162 aa overlap (44-1130:126-1273)

            20        30        40        50        60        70   
pF1KA0 GGPAGRGLSGARWGRSGSAGHEKLPVHVEDALTYLDQVKIRFGSDPATYNGFLEIMKEFK
                                     ::.::::::..:::.: .:: ::.::::::
XP_006 GQVVQSHAHPAPPVAPVQGQQQFQRLKVEDALSYLDQVKLQFGSQPQVYNDFLDIMKEFK
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pF1KA0 SQSIDTPGVIRRVSQLFHEHPDLIVGFNAFLPLGYRIDIPKNGKLNIQSP----------
       :::::::::: ::::::. :::::.:::.::: ::.:..  :  .:. .:          
XP_006 SQSIDTPGVISRVSQLFKGHPDLIMGFNTFLPPGYKIEVQTNDMVNVTTPGQVHQIPTHG
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pF1KA0 ----------LTSQENSHNHGDGAEDFKQQVPYKEDKP-----------QVP--------
                   :: ....    :.   :  : : .::           :.:        
XP_006 IQPQPQPPPQHPSQPSAQSAPAPAQPAPQPPPAKVSKPSQLQAHTPASQQTPPLPPYASP
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pF1KA0 --------------------LESDS-VEFNNAISYVNKIKTRFLDHPEIYRSFLEILHTY
                           :.... ::::.::.::::::.::  .:.::..::::::::
XP_006 RSPPVQPHTPVTISLGTAPSLQNNQPVEFNHAINYVNKIKNRFQGQPDIYKAFLEILHTY
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pF1KA0 QKEQLNTR---GRPFRGMSEEEVFTEVANLFRGQEDLLSEFGQFLPEAKRSLFTGNGPCE
       :::: :..   :    ...:.::...:: ::..:::::::::::::.:. :.. ..   :
XP_006 QKEQRNAKEAGGNYTPALTEQEVYAQVARLFKNQEDLLSEFGQFLPDANSSVLLSKTTAE
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pF1KA0 MHSVQKNEHD---KTPEHSRKRSRPSL----LR--PV--SAPAKKKMKLRGTKDLSIAAV
         .  .:.:    : :. . : .:::     .:  :.  . :.::: :: . :: :.: .
XP_006 KVDSVRNDHGGTVKKPQLNNKPQRPSQNGCQIRRHPTGTTPPVKKKPKLLNLKDSSMADA
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pF1KA0 GKYGTLQEFSFFDKVRRVLKSQEVYENFLRCIALFNQELVSGSELLQLVSPFLGKFPELF
       .:.:   :  ::::::..:.: :.:::::::...::::..: .::.::::::::::::::
XP_006 SKHGGGTESLFFDKVRKALRSAEAYENFLRCLVIFNQEVISRAELVQLVSPFLGKFPELF
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pF1KA0 AQFKSFLGVKE-LSFAPPMSDRSGDGISREIDYASCKRIGSSYRALPKTYQQPKCSGRTA
         ::.::: :: . .    ..:. .::. :::::::::.:::::::::.::::::.::: 
XP_006 NWFKNFLGYKESVHLETYPKERATEGIAMEIDYASCKRLGSSYRALPKSYQQPKCTGRTP
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pF1KA0 ICKEVLNDTWVSFPSWSEDSTFVSSKKTPYEEQLHRCEDERFELDVVLETNLATIRVLES
       .::::::::::::::::::::::::::: :::...::::::::::::::::::::::::.
XP_006 LCKEVLNDTWVSFPSWSEDSTFVSSKKTQYEEHIYRCEDERFELDVVLETNLATIRVLEA
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pF1KA0 VQKKLSRMAPEDQEKFRLDDSLGGTSEVIQRRAIYRIYGDKAPEIIESLKKNPVTAVPVV
       .::::::.. :.: :::::..::::::::.:.:. :::.::: .::..:.:::  :::.:
XP_006 IQKKLSRLSAEEQAKFRLDNTLGGTSEVIHRKALQRIYADKAADIIDGLRKNPSIAVPIV
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pF1KA0 LKRLKAKEEEWREAQQGFNKIWREQYEKAYLKSLDHQAVNFKQNDTKALRSKSLLNEIES
       ::::: :::::::::.::::.:::: :: ::::::::..::::::::.::::::::::::
XP_006 LKRLKMKEEEWREAQRGFNKVWREQNEKYYLKSLDHQGINFKQNDTKVLRSKSLLNEIES
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pF1KA0 VYDEHQEQHSEGRSAPSSEPHLIFVYEDRQILEDAAALISYYVKRQPAIQKEDQGTIHQL
       .:::.::: .:  ..    ::: ..:::.:::::::::: ..:::: .:::::.  :.:.
XP_006 IYDERQEQATEENAGVPVGPHLSLAYEDKQILEDAAALIIHHVKRQTGIQKEDKYKIKQI
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pF1KA0 LHQFVPSLFFSQQLDLGASEESADEDRDSPQGQTTDPSERKKPAPGPHSSPPEEKGAFGD
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XP_006 MHHFIPDLLFAQRGDLSDVEEEEEEEMDVDEA--TGAVKKHNGVGG---SPPKSKLLFSN
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pF1KA0 APATEQPPLPPPAPHKPLDDVYSLFFANNNWYFFLRLHQTLCSRLLKIYRQAQKQLLEYR
       . : .          . .:.::.::..:::::.:.:::: :: :::.:  ::..:. :  
XP_006 TAAQKL---------RGMDEVYNLFYVNNNWYIFMRLHQILCLRLLRICSQAERQIEEEN
                       880       890       900       910       920 

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        :.: :. .   .:.:...::..::::.: .:..:.:::::::::::::.:.:: .::::
XP_006 REREWEREVLGIKRDKSDSPAIQLRLKEPMDVDVEDYYPAFLDMVRSLLDGNIDSSQYED
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pF1KA0 TLREMFTIHAYVGFTMDKLVQNIARQLHHLVSDDVCLKVVELYLNEKKRGAAGGNLSSRC
       .::::::::::..::::::.:.:.:::.:.:::..:..:..::: :.. ::.::.:... 
XP_006 SLREMFTIHAYIAFTMDKLIQSIVRQLQHIVSDEICVQVTDLYLAENNNGATGGQLNTQN
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pF1KA0 VRAARETSYQWKAERCMADENCFKVMFLQRKGQVIMTIELLDTEEAQTEDPVEVQHLARY
        :.  :..:: :::. :.::::::.::.: .::: .::::::::: ...::::... . :
XP_006 SRSLLESTYQRKAEQLMSDENCFKLMFIQSQGQVQLTIELLDTEEENSDDPVEAERWSDY
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pF1KA0 VEQYVGTEGASSSPTEGFLLKPVFLQRNLKKFRRRWQSEQARALRGEARSSWKRLVGVES
       ::.:.... .:    : .  ::::: :::...:.  .... .  .:.  .: : . .:.:
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          ..:::::...:::....:::::::: .: ::.: .  :  : ::.:. : ..: ...
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       :  : :. .. :::::  : .::: : :.:  .: . ...:::.:.    .:
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       :::: :..   :    ...:.::...:: ::..:::::::::::::.:. :.. ..   :
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         .  .:.:    : :. . : .:::     .:  :.  . :.::: :: . :: :.: .
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       .:.:   :  ::::::..:.: :.:::::::...::::..: .::.::::::::::::::
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         ::.::: :: . .    ..:. .::. :::::::::.:::::::::.::::::.::: 
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       .::::::::::::::::::::::::::: :::...::::::::::::::::::::::::.
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       .::::::.. :.: :::::..::::::::.:.:. :::.::: .::..:.:::  :::.:
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       ::::: :::::::::.::::.:::: :: ::::::::..::::::::.::::::::::::
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       .:::.::: .:  ..    ::: ..:::.:::::::::: ..:::: .:::::.  :.:.
NP_056 IYDERQEQATEENAGVPVGPHLSLAYEDKQILEDAAALIIHHVKRQTGIQKEDKYKIKQI
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       .:.:.:.:.:.:. ::.  ::  .:. :  ..  :   .... . :   :::. :  :..
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       . : .          . .:.::.::..:::::.:.:::: :: :::.:  ::..:. :  
NP_056 TAAQKL---------RGMDEVYNLFYVNNNWYIFMRLHQILCLRLLRICSQAERQIEEEN
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NP_056 VERYMNSDTTSPELREHLAQKPVFLPRNLRRIRKCQRGREQQEKEGKEGNSKKTMENVDS
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1130 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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 start: Fri Nov  4 00:57:09 2016 done: Fri Nov  4 00:57:12 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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