Result of FASTA (omim) for pF1KB7875
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7875, 570 aa
  1>>>pF1KB7875 570 - 570 aa - 570 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5194+/-0.000936; mu= 15.0179+/- 0.058
 mean_var=307.9235+/-61.329, 0's: 0 Z-trim(109.2): 2138  B-trim: 123 in 2/49
 Lambda= 0.073089
 statistics sampled from 14966 (17316) to 14966 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.506), E-opt: 0.2 (0.203), width:  16
 Scan time:  9.200

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_775802 (OMIM: 603982) zinc finger protein 100 [ ( 542) 3120 344.4 5.4e-94
NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 ( 572) 2844 315.4 3.2e-85
NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 is ( 595) 2757 306.2 1.9e-82
NP_689839 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 is ( 586) 2738 304.2 7.5e-82
XP_005259754 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 2663 296.3 1.7e-79
XP_011525900 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 2663 296.3 1.7e-79
NP_258429 (OMIM: 606957) zinc finger protein 257 i ( 563) 2662 296.2 1.9e-79
NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 73 ( 536) 2660 295.9 2.1e-79
XP_011525901 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 2660 296.0 2.2e-79
XP_006722660 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 2660 296.0 2.2e-79
NP_975011 (OMIM: 604768) zinc finger protein 254 i ( 659) 2659 296.0 2.5e-79
XP_011526007 (OMIM: 603980) PREDICTED: zinc finger ( 531) 2655 295.4 3.1e-79
NP_001269288 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 852) 2649 295.1   6e-79
NP_066971 (OMIM: 604756) zinc finger protein 273 [ ( 569) 2621 291.9 3.8e-78
XP_016867177 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 569) 2621 291.9 3.8e-78
NP_112495 (OMIM: 603975) zinc finger protein 93 [H ( 620) 2612 291.0 7.7e-78
NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 2608 291.1 1.4e-77
NP_001073878 (OMIM: 603981) zinc finger protein 99 ( 864) 2525 282.1 5.2e-75
XP_016882746 (OMIM: 603977) PREDICTED: zinc finger (1168) 2523 282.1 6.9e-75
NP_009084 (OMIM: 603977) zinc finger protein 208 i (1280) 2523 282.1 7.2e-75
NP_001243582 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 818) 2513 280.8 1.2e-74
NP_003414 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 is ( 809) 2507 280.1 1.9e-74
NP_001265606 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2483 277.4 9.5e-74
NP_001265591 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2483 277.4 9.5e-74
XP_016883005 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2483 277.4 9.5e-74
XP_011526746 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2483 277.4 9.5e-74
NP_001265590 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2483 277.4 9.5e-74
XP_011526745 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2483 277.4 9.5e-74
XP_016883003 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2483 277.4 9.5e-74
XP_016883004 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2483 277.4 9.5e-74
NP_001303925 (OMIM: 606957) zinc finger protein 25 ( 531) 2482 277.2 9.5e-74
XP_016881605 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2477 276.6 1.3e-73
NP_001243578 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
NP_001243579 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
XP_011526561 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
XP_016882702 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
XP_011526559 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
NP_001243577 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
XP_016882703 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
XP_016882701 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
XP_016882704 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
XP_016882697 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
XP_016882705 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
XP_016882698 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
XP_016882700 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
XP_016882699 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
XP_016882696 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2473 276.5 2.2e-73
XP_016882724 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 2426 271.8 8.2e-72
XP_011526567 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 2426 271.8 8.2e-72
XP_016867187 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2416 270.2 1.2e-71


>>NP_775802 (OMIM: 603982) zinc finger protein 100 [Homo  (542 aa)
 initn: 4628 init1: 3106 opt: 3120  Z-score: 1808.5  bits: 344.4 E(85289): 5.4e-94
Smith-Waterman score: 3148; 78.4% identity (88.1% similar) in 570 aa overlap (1-570:1-542)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MENLKSGVYPLKEASGCPGADRNLLVYSFYEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQDLY
       :.. . :. ::: :::::::.:.::: :..:::::::::::::::::::::::.::: ::
NP_775 MDDPRYGMCPLKGASGCPGAERSLLVQSYFEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDSAQQGLY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 RKVMLENYRNLVFLAGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHAMVDQPPVTYSHFAQDLWPE
       ::::::::::::::::::..::::::::::::::::.::: :: .:::  ::: :::: :
NP_775 RKVMLENYRNLVFLAGIALTKPDLITCLEQGKEPWNIKRHEMVAKPPVICSHFPQDLWAE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 QGIKDSFQEVILRRYGKCGHEDLQLRTGCKSVDECNLHKECYDELNQCLTTTQSEIFQYD
       : :::::::.::..::: ::..:::. ::::::::..:::  ..::::: ::::.::: :
NP_775 QDIKDSFQEAILKKYGKYGHDNLQLQKGCKSVDECKVHKEHDNKLNQCLITTQSNIFQCD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 KYVNVFYKFSNPNIQKIRHTGKKPFKCKKCDKSFCMLLHLTQHKRIHIRENSYQCEECGK
         ..::. ::: : .::::: :::::::::.::::::::::::::.:: ::::::..:::
NP_775 PSAKVFHTFSNSNRHKIRHTRKKPFKCKKCEKSFCMLLHLTQHKRFHITENSYQCKDCGK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 VFNWFSTLTRHRRIHTGEKPYKCEQCGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKTFNR
       .:::::::: ::::::::::::::.:::::..:: :::::::::::::::::::::.:::
NP_775 AFNWFSTLTTHRRIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKAFNR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 SSHLTTHKRIHTGEKPYRCEECGRAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTL
       ::::::::::::: :::.: :::.:::::::::::.::::::::::::::::::::::::
NP_775 SSHLTTHKRIHTGVKPYKCTECGKAFNRSSHLTTHRIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 TTHKIIHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKIIHTGEKFYKCEECGKGFNWSSTLTKHK
       ::::: ::::::::::::::::::::::::::  ::::::::::::::::::::.:::::
NP_775 TTHKITHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKTSHTGEKFYKCEECGKGFNWSSALTKHK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 RIHTGEKPYKCEQCGKAFNESSNLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPKLTAHKVIHS
       ::::::::::::.::::::::::::.::.::::::::::.::::::::: .:::::.::.
NP_775 RIHTGEKPYKCEECGKAFNESSNLTTHKMIHTGEKPYKCDECGKAFNRSSQLTAHKMIHT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 GEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKITHIGDTSYKYLECDKAFSQSSTLTKHKVIHTGEKP
       :::::::::::::::. :.:::::::: :. :::. ::                      
NP_775 GEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKITHTGEKSYKWEEC----------------------
              490       500       510                              

              550       560       570
pF1KB7 YNCEEYGKAFNQSSNLIEQSNSYWRETLQM
             :: :::: .::.:.::::::::::
NP_775 ------GKDFNQSLSLIKQNNSYWRETLQM
            520       530       540  

>>NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 [Ho  (572 aa)
 initn: 4340 init1: 2601 opt: 2844  Z-score: 1651.0  bits: 315.4 E(85289): 3.2e-85
Smith-Waterman score: 2844; 76.2% identity (90.3% similar) in 526 aa overlap (31-556:9-533)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MENLKSGVYPLKEASGCPGADRNLLVYSFYEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQDLY
                                     : : :::::::.:::::::::::::::.::
NP_001                       MPGPLGSLEMGVLTFRDVALEFSLEEWQCLDTAQQNLY
                                     10        20        30        

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 RKVMLENYRNLVFLAGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHAMVDQPPVTYSHFAQDLWPE
       :.:::::::::::. :::.:::::::::::::::::.::: :: .:::.::.:::::::.
NP_001 RNVMLENYRNLVFV-GIAASKPDLITCLEQGKEPWNVKRHEMVTEPPVVYSYFAQDLWPK
       40        50         60        70        80        90       

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 QGIKDSFQEVILRRYGKCGHEDLQLRTGCKSVDECNLHKECYDELNQCLTTTQSEIFQYD
       :: :. ::.:::: : :::.:.::::  :::.:::..:::::. :::::::::..:::::
NP_001 QGKKNYFQKVILRTYKKCGRENLQLRKYCKSMDECKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQYD
       100       110       120       130       140       150       

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 KYVNVFYKFSNPNIQKIRHTGKKPFKCKKCDKSFCMLLHLTQHKRIHIRENSYQCEECGK
       :::.::.:::: : .:: ::::: ::::.:.:::::: ::.::::::  :. :.:.::::
NP_001 KYVKVFHKFSNSNRHKIGHTGKKSFKCKECEKSFCMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGK
       160       170       180       190       200       210       

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 VFNWFSTLTRHRRIHTGEKPYKCEQCGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKTFNR
       ..:  :.:. :.:::::.::::::.:::::.. : ::::::::::.:::.::::::.::.
NP_001 AYNEASNLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLSHLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQ
       220       230       240       250       260       270       

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 SSHLTTHKRIHTGEKPYRCEECGRAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTL
       :..::::::::::::::.::::::::..:: ::.:::::.::::::::::::::.:::::
NP_001 SANLTTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTAHKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTL
       280       290       300       310       320       330       

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 TTHKIIHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKIIHTGEKFYKCEECGKGFNWSSTLTKHK
       :::::::.::: :::::::::: :.:.:: :: ::.::: ::::::::.:. ::::: ::
NP_001 TTHKIIHTGEKFYKCEECGKAFSRLSHLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHK
       340       350       360       370       380       390       

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 RIHTGEKPYKCEQCGKAFNESSNLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPKLTAHKVIHS
       :::.::: :::: :.:::.. :.::.:: :::::::::::::::::: : .::.::.::.
NP_001 RIHAGEKFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHT
       400       410       420       430       440       450       

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 GEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKITHIGDTSYKYLECDKAFSQSSTLTKHKVIHTGEKP
       :::::::::::::::: :.:.:::. : :.  ::  :: :::.::: :: ::.:::::::
NP_001 GEKPYKCEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKP
       460       470       480       490       500       510       

              550       560       570                         
pF1KB7 YNCEEYGKAFNQSSNLIEQSNSYWRETLQM                         
       :.::: :::::.:: :                                       
NP_001 YKCEECGKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK
       520       530       540       550       560       570  

>>NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 isofor  (595 aa)
 initn: 6296 init1: 2594 opt: 2757  Z-score: 1601.3  bits: 306.2 E(85289): 1.9e-82
Smith-Waterman score: 2757; 74.4% identity (87.5% similar) in 528 aa overlap (33-559:2-528)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KB7 NLKSGVYPLKEASGCPGADRNLLVYSFYEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQDLYRK
                                     ::::::::::::::.:::::::::..:::.
NP_003                              MGPLTFRDVAIEFSLKEWQCLDTAQRNLYRN
                                            10        20        30 

             70        80        90       100        110       120 
pF1KB7 VMLENYRNLVFLAGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHA-MVDQPPVTYSHFAQDLWPEQ
       :::::::::::: ::.::::::::::::::: :.::::  :: .: :  :::::::::::
NP_003 VMLENYRNLVFL-GITVSKPDLITCLEQGKEAWSMKRHEIMVAKPTVMCSHFAQDLWPEQ
              40         50        60        70        80        90

             130       140       150       160       170       180 
pF1KB7 GIKDSFQEVILRRYGKCGHEDLQLRTGCKSVDECNLHKECYDELNQCLTTTQSEIFQYDK
       .::::::.: :.::::: ::.: :: ::.:.:::..::   . ::::::.:::.::: ::
NP_003 NIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDK
              100       110       120       130       140       150

             190       200       210       220       230       240 
pF1KB7 YVNVFYKFSNPNIQKIRHTGKKPFKCKKCDKSFCMLLHLTQHKRIHIRENSYQCEECGKV
       ::.: .:::: : ..:::: :::::: :: ::: :.  ::.:.::: : : :.::::::.
NP_003 YVKVAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKA
              160       170       180       190       200       210

             250       260       270       280       290       300 
pF1KB7 FNWFSTLTRHRRIHTGEKPYKCEQCGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKTFNRS
       ::: ::::.:.::::::::::::.:::::.:::.:  :: ::::::::.:::::::::: 
NP_003 FNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRF
              220       230       240       250       260       270

             310       320       330       340       350       360 
pF1KB7 SHLTTHKRIHTGEKPYRCEECGRAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLT
       : ::::: ::::::::.:.:::.:::::: ::::. :::::::::::::::::.:::.::
NP_003 STLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLT
              280       290       300       310       320       330

             370       380       390       400       410       420 
pF1KB7 THKIIHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKIIHTGEKFYKCEECGKGFNWSSTLTKHKR
       ::::::.:::::::..::::: . ..:: :..:::::: ::::.:::.::  : :: :: 
NP_003 THKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKI
              340       350       360       370       380       390

             430       440       450       460       470       480 
pF1KB7 IHTGEKPYKCEQCGKAFNESSNLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPKLTAHKVIHSG
       ::::::::::..:::::..::.:: :::::::::::::.:: ::::.: ::: :: ::.:
NP_003 IHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTG
              400       410       420       430       440       450

             490       500       510       520       530       540 
pF1KB7 EKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKITHIGDTSYKYLECDKAFSQSSTLTKHKVIHTGEKPY
       ::::.::.::::::: ::::.:: .:  .  ::  :: :.:.  :::: ::.::::::::
NP_003 EKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPY
              460       470       480       490       500       510

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pF1KB7 NCEEYGKAFNQSSNLIEQSNSYWRETLQM                               
       .::: ::::::::.: ..                                          
NP_003 KCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEE
              520       530       540       550       560       570

>--
 initn: 704 init1: 362 opt: 362  Z-score: 236.4  bits: 53.7 E(85289): 2e-06
Smith-Waterman score: 362; 79.7% identity (90.6% similar) in 64 aa overlap (308-371:529-592)

       280       290       300       310       320       330       
pF1KB7 THKIIHTGEKPYRCEECGKTFNRSSHLTTHKRIHTGEKPYRCEECGRAFNRSSHLTTHKI
                                     :.:::::::: :::::.:::.::.:: :: 
NP_003 IHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKR
      500       510       520       530       540       550        

       340       350       360       370       380       390       
pF1KB7 IHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHKIIHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKIIHTG
       ::::::::::::: :::. ::.:: :::::.:::                          
NP_003 IHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI                       
      560       570       580       590                            

       400       410       420       430       440       450       
pF1KB7 EKFYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEQCGKAFNESSNLTAHKIIHTGEKPY

>>NP_689839 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 isofor  (586 aa)
 initn: 2491 init1: 2491 opt: 2738  Z-score: 1590.5  bits: 304.2 E(85289): 7.5e-82
Smith-Waterman score: 2738; 74.8% identity (85.9% similar) in 531 aa overlap (33-563:2-531)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KB7 NLKSGVYPLKEASGCPGADRNLLVYSFYEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQDLYRK
                                     :::::::: :::::::::::::::..::: 
NP_689                              MGPLTFRDVKIEFSLEEWQCLDTAQRNLYRD
                                            10        20        30 

             70        80        90       100       110       120  
pF1KB7 VMLENYRNLVFLAGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHAMVDQPPVTYSHFAQDLWPEQG
       :::::::::::: ::::::::::: :::::::::.::: :::. ::  ::::::.:::..
NP_689 VMLENYRNLVFL-GIAVSKPDLITWLEQGKEPWNLKRHEMVDKTPVMCSHFAQDVWPEHS
              40         50        60        70        80        90

            130       140       150       160       170       180  
pF1KB7 IKDSFQEVILRRYGKCGHEDLQLRTGCKSVDECNLHKECYDELNQCLTTTQSEIFQYDKY
       ::::::.:::: ::: :::.::::   :::: :...:  :. ::::::::.:.::: :::
NP_689 IKDSFQKVILRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKY
              100       110       120       130       140       150

            190       200       210       220       230       240  
pF1KB7 VNVFYKFSNPNIQKIRHTGKKPFKCKKCDKSFCMLLHLTQHKRIHIRENSYQCEECGKVF
       :.::.:: : : .:::::::::::::.  :::::: .:::::.:: :: ::.::::::.:
NP_689 VKVFHKFPNVNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAF
              160       170       180       190       200       210

            250       260       270       280       290       300  
pF1KB7 NWFSTLTRHRRIHTGEKPYKCEQCGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKTFNRSS
       :: ::::.:. :::::::::::.:::::..::.:: :::::::::::.::::::.:::::
NP_689 NWSSTLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSS
              220       230       240       250       260       270

            310       320       330       340       350       360  
pF1KB7 HLTTHKRIHTGEKPYRCEECGRAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTT
        :: :::::: ::::.:::::.:::. : :. :: ::  .::::::::::::   : :  
NP_689 TLTKHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKK
              280       290       300       310       320       330

            370       380       390       400       410       420  
pF1KB7 HKIIHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKIIHTGEKFYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRI
       :::::.:::::::::::::: .:: :::::::::::: :::.::::.:: ::::::::::
NP_689 HKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRI
              340       350       360       370       380       390

            430       440       450       460       470       480  
pF1KB7 HTGEKPYKCEQCGKAFNESSNLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPKLTAHKVIHSGE
       ::::::::::.:::::..::.:: ::::::::::::::.:::::. :  .: ::  :  .
NP_689 HTGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFSWSSAFTKHKRNHMED
              400       410       420       430       440       450

            490       500       510       520       530       540  
pF1KB7 KPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKITHIGDTSYKYLECDKAFSQSSTLTKHKVIHTGEKPYN
       ::::::::::::. ::.:::::: :  .  ::  :: :::.::: .::::.:::  : :.
NP_689 KPYKCEECGKAFSVFSTLTKHKIIHTREKPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYK
              460       470       480       490       500       510

            550       560       570                                
pF1KB7 CEEYGKAFNQSSNLIEQSNSYWRETLQM                                
       ::. :.::::::::  ..  :                                       
NP_689 CEKCGNAFNQSSNLTARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKFSTLITHQIIYTGEKPCKHECG
              520       530       540       550       560       570

>>XP_005259754 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger pro  (551 aa)
 initn: 5502 init1: 2422 opt: 2663  Z-score: 1548.0  bits: 296.3 E(85289): 1.7e-79
Smith-Waterman score: 2663; 71.7% identity (87.0% similar) in 530 aa overlap (33-562:2-530)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KB7 NLKSGVYPLKEASGCPGADRNLLVYSFYEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQDLYRK
                                     ::: :::::::::::::.::::::..:::.
XP_005                              MGPLQFRDVAIEFSLEEWHCLDTAQRNLYRN
                                            10        20        30 

             70        80        90       100       110       120  
pF1KB7 VMLENYRNLVFLAGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHAMVDQPPVTYSHFAQDLWPEQG
       :::::::::::: ::.::::::::::::::.: .::.: :: .: :: ::::.::::::.
XP_005 VMLENYRNLVFL-GIVVSKPDLITCLEQGKKPLTMKKHEMVANPSVTCSHFARDLWPEQS
              40         50        60        70        80        90

            130       140       150       160       170       180  
pF1KB7 IKDSFQEVILRRYGKCGHEDLQLRTGCKSVDECNLHKECYDELNQCLTTTQSEIFQYDKY
       ::::::.: :::: . ::..::.. ::.:::::..::. :. ::: ::::::.::: :::
XP_005 IKDSFQKVTLRRYENYGHDNLQFKKGCESVDECKVHKRGYNGLNQYLTTTQSKIFQCDKY
              100       110       120       130       140       150

            190       200       210       220       230       240  
pF1KB7 VNVFYKFSNPNIQKIRHTGKKPFKCKKCDKSFCMLLHLTQHKRIHIRENSYQCEECGKVF
       :.:..:::: : .:::::::::::: .: :.: .   :: ::.::  :. ..::::::.:
XP_005 VKVIHKFSNSNRHKIRHTGKKPFKCIECGKAFNQSSTLTTHKKIHTGEKPFKCEECGKAF
              160       170       180       190       200       210

            250       260       270       280       290       300  
pF1KB7 NWFSTLTRHRRIHTGEKPYKCEQCGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKTFNRSS
       :: : :: :.::::::: ::::.:::::.. : ::.:::::.:::::.::::::.:.:::
XP_005 NWSSHLTTHKRIHTGEKRYKCEDCGKAFSRFSYLTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKRSS
              220       230       240       250       260       270

            310       320       330       340       350       360  
pF1KB7 HLTTHKRIHTGEKPYRCEECGRAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTT
       .::::: ::::::::.:::::.::.::: ::.:::::.::::::::::::::.. :.:::
XP_005 NLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKRSSILTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKHPSVLTT
              280       290       300       310       320       330

            370       380       390       400       410       420  
pF1KB7 HKIIHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKIIHTGEKFYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRI
       :: ::.:::::::::::.::  :: :: :::::.::: ::::::::.::::: :: ::::
XP_005 HKRIHTGEKPYKCEECGRAFKYFSSLTTHKIIHSGEKPYKCEECGKAFNWSSHLTTHKRI
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pF1KB7 HTGEKPYKCEQCGKAFNESSNLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPKLTAHKVIHSGE
       ::::::::::.::.::. ::.::.:::::::..:.:::::::::.    ::.:: ::.::
XP_005 HTGEKPYKCEECGEAFKYSSSLTTHKIIHTGQQPFKCEECGKAFKCFSILTTHKRIHTGE
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pF1KB7 KPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKITHIGDTSYKYLECDKAFSQSSTLTKHKVIHTGEKPYN
       :::::::::::::. :.:: ::  : :.  ::  .: :::..:  ::.:: ::::::::.
XP_005 KPYKCEECGKAFNSSSHLTAHKRIHTGEKPYKCERCGKAFKRSFILTRHKRIHTGEKPYK
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pF1KB7 CEEYGKAFNQSSNLIEQSNSYWRETLQM             
       ::: ::.:.  :.:  .. :                     
XP_005 CEECGKGFKCPSTLTTHKRSGCPTRKLLLSSVSTLNNSEWK
              520       530       540       550 

>>XP_011525900 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger pro  (551 aa)
 initn: 5502 init1: 2422 opt: 2663  Z-score: 1548.0  bits: 296.3 E(85289): 1.7e-79
Smith-Waterman score: 2663; 71.7% identity (87.0% similar) in 530 aa overlap (33-562:2-530)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KB7 NLKSGVYPLKEASGCPGADRNLLVYSFYEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQDLYRK
                                     ::: :::::::::::::.::::::..:::.
XP_011                              MGPLQFRDVAIEFSLEEWHCLDTAQRNLYRN
                                            10        20        30 

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pF1KB7 VMLENYRNLVFLAGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHAMVDQPPVTYSHFAQDLWPEQG
       :::::::::::: ::.::::::::::::::.: .::.: :: .: :: ::::.::::::.
XP_011 VMLENYRNLVFL-GIVVSKPDLITCLEQGKKPLTMKKHEMVANPSVTCSHFARDLWPEQS
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pF1KB7 IKDSFQEVILRRYGKCGHEDLQLRTGCKSVDECNLHKECYDELNQCLTTTQSEIFQYDKY
       ::::::.: :::: . ::..::.. ::.:::::..::. :. ::: ::::::.::: :::
XP_011 IKDSFQKVTLRRYENYGHDNLQFKKGCESVDECKVHKRGYNGLNQYLTTTQSKIFQCDKY
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pF1KB7 VNVFYKFSNPNIQKIRHTGKKPFKCKKCDKSFCMLLHLTQHKRIHIRENSYQCEECGKVF
       :.:..:::: : .:::::::::::: .: :.: .   :: ::.::  :. ..::::::.:
XP_011 VKVIHKFSNSNRHKIRHTGKKPFKCIECGKAFNQSSTLTTHKKIHTGEKPFKCEECGKAF
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pF1KB7 NWFSTLTRHRRIHTGEKPYKCEQCGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKTFNRSS
       :: : :: :.::::::: ::::.:::::.. : ::.:::::.:::::.::::::.:.:::
XP_011 NWSSHLTTHKRIHTGEKRYKCEDCGKAFSRFSYLTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKRSS
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pF1KB7 HLTTHKRIHTGEKPYRCEECGRAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTT
       .::::: ::::::::.:::::.::.::: ::.:::::.::::::::::::::.. :.:::
XP_011 NLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKRSSILTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKHPSVLTT
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pF1KB7 HKIIHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKIIHTGEKFYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRI
       :: ::.:::::::::::.::  :: :: :::::.::: ::::::::.::::: :: ::::
XP_011 HKRIHTGEKPYKCEECGRAFKYFSSLTTHKIIHSGEKPYKCEECGKAFNWSSHLTTHKRI
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pF1KB7 HTGEKPYKCEQCGKAFNESSNLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPKLTAHKVIHSGE
       ::::::::::.::.::. ::.::.:::::::..:.:::::::::.    ::.:: ::.::
XP_011 HTGEKPYKCEECGEAFKYSSSLTTHKIIHTGQQPFKCEECGKAFKCFSILTTHKRIHTGE
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pF1KB7 KPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKITHIGDTSYKYLECDKAFSQSSTLTKHKVIHTGEKPYN
       :::::::::::::. :.:: ::  : :.  ::  .: :::..:  ::.:: ::::::::.
XP_011 KPYKCEECGKAFNSSSHLTAHKRIHTGEKPYKCERCGKAFKRSFILTRHKRIHTGEKPYK
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pF1KB7 CEEYGKAFNQSSNLIEQSNSYWRETLQM             
       ::: ::.:.  :.:  .. :                     
XP_011 CEECGKGFKCPSTLTTHKRSGCPTRKLLLSSVSTLNNSEWK
              520       530       540       550 

>>NP_258429 (OMIM: 606957) zinc finger protein 257 isofo  (563 aa)
 initn: 2813 init1: 1282 opt: 2662  Z-score: 1547.3  bits: 296.2 E(85289): 1.9e-79
Smith-Waterman score: 2662; 73.4% identity (85.5% similar) in 530 aa overlap (33-556:2-530)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KB7 NLKSGVYPLKEASGCPGADRNLLVYSFYEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQDLYRK
                                     ::::.:::..:::::::.:::::::.::: 
NP_258                              MGPLTIRDVTVEFSLEEWHCLDTAQQNLYRD
                                            10        20        30 

             70        80        90       100       110       120  
pF1KB7 VMLENYRNLVFLAGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHAMVDQPPVTYSHFAQDLWPEQG
       :::::::::::: ::::::::::::::::::: ::::: :: .:::  ::.:.:: ::. 
NP_258 VMLENYRNLVFL-GIAVSKPDLITCLEQGKEPCNMKRHEMVAKPPVMCSHIAEDLCPERD
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pF1KB7 IKDSFQEVILRRYGKCGHEDLQLRTGCKSVDECNLHKECYDELNQCLTTTQSEIFQYDKY
       ::  ::.:::::: :: ::.:::: ::::::::.. :  :. ::::: ::::...: :::
NP_258 IKYFFQKVILRRYDKCEHENLQLRKGCKSVDECKVCKGGYNGLNQCLITTQSKMYQCDKY
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pF1KB7 VNVFYKFSNPNIQKIRHTGKKPFKCKKCDKSFCMLLHLTQHKRIHIRENSYQCEECGKVF
       :.::::::: . .::::: ::  :::.: :::::: .::.::::::::::..::::::.:
NP_258 VKVFYKFSNSDRHKIRHTEKKTCKCKECGKSFCMLSQLTRHKRIHIRENSHKCEECGKAF
              160       170       180       190       200       210

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pF1KB7 NWFSTLTRHRRIHTGEKPYKCEQCGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKTFNRSS
       :  :.::::.  ::::::::::.:::::..:: :: ::.::: ::::.::::::.:::::
NP_258 NQSSALTRHKMTHTGEKPYKCEECGKAFNRSSHLTQHKVIHTREKPYKCEECGKAFNRSS
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pF1KB7 HLTTHKRIHTGEKPYRCEECGRAFNRSSHLTT---HKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSST
       :.: :::::. :::.. .:: .::. :: :::   :: :::::::::::::::::::::.
NP_258 HITQHKRIHNREKPFKYDECCKAFKWSSALTTLTQHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSA
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pF1KB7 LTTHKIIHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKIIHTGEKFYKCEECGKGFNWSSTLTKH
       :: ::.::.::::..:::::::: : :.::.:::::: :: ::::::::.:: :: ::::
NP_258 LTRHKMIHTGEKPFQCEECGKAFNRSSHLTQHKIIHTKEKPYKCEECGKAFNRSSHLTKH
              340       350       360       370       380       390

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pF1KB7 KRIHTGEKPYKCEQCGKAFNESSNLTA---HKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPKLTAHK
       ::::: :: :::..  :::: :: ::.   :::::::::::::::::::::::  :  ::
NP_258 KRIHTREKAYKCDEYCKAFNWSSALTTLTQHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSYLIRHK
              400       410       420       430       440       450

        480       490       500       510       520       530      
pF1KB7 VIHSGEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKITHIGDTSYKYLECDKAFSQSSTLTKHKVIHT
       .::.:::::::::::::::: :.::.::: : :.  ::  :: :::..:: :..::.:::
NP_258 IIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSHLTQHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSHLSQHKIIHT
              460       470       480       490       500       510

        540       550       560       570                   
pF1KB7 GEKPYNCEEYGKAFNQSSNLIEQSNSYWRETLQM                   
       :::::.::: :: ::. : :                                 
NP_258 GEKPYKCEECGKPFNRFSYLTVHKRIHAGENPNKYEECGKACNHSSNLTKHNS
              520       530       540       550       560   

>>NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 737 [H  (536 aa)
 initn: 5499 init1: 2419 opt: 2660  Z-score: 1546.4  bits: 295.9 E(85289): 2.1e-79
Smith-Waterman score: 2660; 72.3% identity (87.4% similar) in 524 aa overlap (33-556:2-524)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KB7 NLKSGVYPLKEASGCPGADRNLLVYSFYEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQDLYRK
                                     ::: :::::::::::::.::::::..:::.
NP_001                              MGPLQFRDVAIEFSLEEWHCLDTAQRNLYRN
                                            10        20        30 

             70        80        90       100       110       120  
pF1KB7 VMLENYRNLVFLAGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHAMVDQPPVTYSHFAQDLWPEQG
       :::::::::::: ::.::::::::::::::.: .::.: :: .: :: ::::.::::::.
NP_001 VMLENYRNLVFL-GIVVSKPDLITCLEQGKKPLTMKKHEMVANPSVTCSHFARDLWPEQS
              40         50        60        70        80        90

            130       140       150       160       170       180  
pF1KB7 IKDSFQEVILRRYGKCGHEDLQLRTGCKSVDECNLHKECYDELNQCLTTTQSEIFQYDKY
       ::::::.: :::: . ::..::.. ::.:::::..::. :. ::: ::::::.::: :::
NP_001 IKDSFQKVTLRRYENYGHDNLQFKKGCESVDECKVHKRGYNGLNQYLTTTQSKIFQCDKY
              100       110       120       130       140       150

            190       200       210       220       230       240  
pF1KB7 VNVFYKFSNPNIQKIRHTGKKPFKCKKCDKSFCMLLHLTQHKRIHIRENSYQCEECGKVF
       :.:..:::: : .:::::::::::: .: :.: .   :: ::.::  :. ..::::::.:
NP_001 VKVIHKFSNSNRHKIRHTGKKPFKCIECGKAFNQSSTLTTHKKIHTGEKPFKCEECGKAF
              160       170       180       190       200       210

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pF1KB7 NWFSTLTRHRRIHTGEKPYKCEQCGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKTFNRSS
       :: : :: :.::::::: ::::.:::::.. : ::.:::::.:::::.::::::.:.:::
NP_001 NWSSHLTTHKRIHTGEKRYKCEDCGKAFSRFSYLTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKRSS
              220       230       240       250       260       270

            310       320       330       340       350       360  
pF1KB7 HLTTHKRIHTGEKPYRCEECGRAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTT
       .::::: ::::::::.:::::.::.::: ::.:::::.::::::::::::::.. :.:::
NP_001 NLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKRSSILTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKHPSVLTT
              280       290       300       310       320       330

            370       380       390       400       410       420  
pF1KB7 HKIIHAGEKPYKCEECGKAFYRFSYLTKHKIIHTGEKFYKCEECGKGFNWSSTLTKHKRI
       :: ::.:::::::::::.::  :: :: :::::.::: ::::::::.::::: :: ::::
NP_001 HKRIHTGEKPYKCEECGRAFKYFSSLTTHKIIHSGEKPYKCEECGKAFNWSSHLTTHKRI
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       ::::::::::.::.::. ::.::.:::::::..:.:::::::::.    ::.:: ::.::
NP_001 HTGEKPYKCEECGEAFKYSSSLTTHKIIHTGQQPFKCEECGKAFKCFSILTTHKRIHTGE
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pF1KB7 KPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKITHIGDTSYKYLECDKAFSQSSTLTKHKVIHTGEKPYN
       :::::::::::::. :.:: ::  : :.  ::  .: :::..:  ::.:: ::::::::.
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pF1KB7 CEEYGKAFNQSSNLIEQSNSYWRETLQM
       ::: ::.:.  :.:              
NP_001 CEECGKGFKCPSTLTTHKVIHTGEKL  
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XP_011 IKDSFQKVTLRRYENYGHDNLQFKKGCESVDECKVHKRGYNGLNQYLTTTQSKIFQCDKY
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pF1KB7 NWFSTLTRHRRIHTGEKPYKCEQCGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKTFNRSS
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       .::::: ::::::::.:::::.::.::: ::.:::::.::::::::::::::.. :.:::
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pF1KB7 HTGEKPYKCEQCGKAFNESSNLTAHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSPKLTAHKVIHSGE
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XP_011 KPYKCEECGKAFNSSSHLTAHKRIHTGEKPYKCERCGKAFKRSFILTRHKRIHTGEKPYK
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>>XP_006722660 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger pro  (550 aa)
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pF1KB7 NLKSGVYPLKEASGCPGADRNLLVYSFYEKGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQDLYRK
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pF1KB7 VMLENYRNLVFLAGIAVSKPDLITCLEQGKEPWNMKRHAMVDQPPVTYSHFAQDLWPEQG
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XP_006 VMLENYRNLVFL-GIVVSKPDLITCLEQGKKPLTMKKHEMVANPSVTCSHFARDLWPEQS
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pF1KB7 IKDSFQEVILRRYGKCGHEDLQLRTGCKSVDECNLHKECYDELNQCLTTTQSEIFQYDKY
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pF1KB7 VNVFYKFSNPNIQKIRHTGKKPFKCKKCDKSFCMLLHLTQHKRIHIRENSYQCEECGKVF
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pF1KB7 NWFSTLTRHRRIHTGEKPYKCEQCGKAFKQSSTLTTHKIIHTGEKPYRCEECGKTFNRSS
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pF1KB7 HLTTHKRIHTGEKPYRCEECGRAFNRSSHLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTT
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pF1KB7 KPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKITHIGDTSYKYLECDKAFSQSSTLTKHKVIHTGEKPYN
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pF1KB7 CEEYGKAFNQSSNLIEQSNSYWRETLQM            
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XP_006 CEECGKGFKCPSTLTTHKFFVYCREVAVLLENCYSHLYPH
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570 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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