seq1 = pF1KB9473.tfa, 2496 bp seq2 = pF1KB9473/gi568815595f_113433082.tfa (gi568815595f:113433082_113727705), 294624 bp >pF1KB9473 2496 >gi568815595f:113433082_113727705 (Chr3) 1-222 (99941-100162) 100% -> 223-344 (133339-133460) 100% -> 345-515 (134459-134629) 100% -> 516-561 (143841-143886) 100% -> 562-663 (147527-147628) 100% -> 664-747 (148280-148363) 100% -> 748-835 (150328-150415) 100% -> 836-907 (151617-151688) 100% -> 908-1001 (152096-152189) 100% -> 1002-1045 (159924-159967) 100% -> 1046-1117 (168507-168578) 100% -> 1118-1263 (169924-170069) 100% -> 1264-1337 (170879-170952) 100% -> 1338-1404 (171829-171895) 100% -> 1405-1478 (173960-174033) 100% -> 1479-1602 (175013-175136) 100% -> 1603-1720 (175338-175455) 100% -> 1721-1857 (177927-178063) 100% -> 1858-1978 (179005-179124) 95% -> 1979-2058 (183013-183095) 96% -> 2059-2105 (186599-186645) 100% -> 2106-2211 (190346-190451) 100% -> 2212-2322 (190542-190652) 100% -> 2323-2436 (193021-193134) 100% -> 2437-2496 (194565-194624) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGCGCGGCTGCCTGCGGCTCGCGCTGCTCTGCGCGCTGCCCTGGCTCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 99941 ATGCGCGGCTGCCTGCGGCTCGCGCTGCTCTGCGCGCTGCCCTGGCTCCT 50 . : . : . : . : . : 51 GCTGGCGGCGTCGCCCGGGCACCCGGCGAAATCCCCCAGGCAGCCCCCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 99991 GCTGGCGGCGTCGCCCGGGCACCCGGCGAAATCCCCCAGGCAGCCCCCGG 100 . : . : . : . : . : 101 CACCGCGCCGCGACCCCTTCGACGCTGCCAGGGGCGCCGATTTCGATCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100041 CACCGCGCCGCGACCCCTTCGACGCTGCCAGGGGCGCCGATTTCGATCAT 150 . : . : . : . : . : 151 GTCTACAGCGGGGTGGTGAACCTCAGCACCGAGAACATCTACTCTTTCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100091 GTCTACAGCGGGGTGGTGAACCTCAGCACCGAGAACATCTACTCTTTCAA 200 . : . : . : . : . : 201 CTACACCAGCCAGCCCGACCAG GTGACAGCCGTGAGGGTGT ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||| 100141 CTACACCAGCCAGCCCGACCAGGTA...CAGGTGACAGCCGTGAGGGTGT 250 . : . : . : . : . : 242 ATGTGAACAGTTCCTCTGAGAATCTCAACTACCCGGTCCTTGTTGTGGTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 133358 ATGTGAACAGTTCCTCTGAGAATCTCAACTACCCGGTCCTTGTTGTGGTT 300 . : . : . : . : . : 292 CGCCAGCAGAAAGAGGTGCTGTCCTGGCAGGTTCCTCTGCTCTTCCAAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 133408 CGCCAGCAGAAAGAGGTGCTGTCCTGGCAGGTTCCTCTGCTCTTCCAAGG 350 . : . : . : . : . : 342 ACT ATACCAGAGGAGCTACAACTATCAAGAAGTGAGCCGCA |||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 133458 ACTGTA...CAGATACCAGAGGAGCTACAACTATCAAGAAGTGAGCCGCA 400 . : . : . : . : . : 383 CCTTATGTCCCTCAGAAGCAACCAATGAGACGGGACCCTTGCAGCAACTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 134497 CCTTATGTCCCTCAGAAGCAACCAATGAGACGGGACCCTTGCAGCAACTG 450 . : . : . : . : . : 433 ATATTTGTAGATGTCGCATCCATGGCACCCCTGGGTGCTCAGTACAAACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 134547 ATATTTGTAGATGTCGCATCCATGGCACCCCTGGGTGCTCAGTACAAACT 500 . : . : . : . : . : 483 GCTAGTTACCAAGCTGAAGCACTTCCAGCTCCG GACAAATG |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||| 134597 GCTAGTTACCAAGCTGAAGCACTTCCAGCTCCGGTA...CAGGACAAATG 550 . : . : . : . : . : 524 TTGCCTTTCACTTTACTGCCAGCCCCTCTCAACCTCAG TAT ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||| 143849 TTGCCTTTCACTTTACTGCCAGCCCCTCTCAACCTCAGGTA...CAGTAT 600 . : . : . : . : . : 565 TTTCTATACAAGTTTCCCAAAGACGTGGACTCAGTTATCATTAAAGTGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 147530 TTTCTATACAAGTTTCCCAAAGACGTGGACTCAGTTATCATTAAAGTGGT 650 . : . : . : . : . : 615 GTCTGAAATGGCTTATCCATGTTCTGTTGTCTCAGTCCAGAATATCATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||> 147580 GTCTGAAATGGCTTATCCATGTTCTGTTGTCTCAGTCCAGAATATCATGG 700 . : . : . : . : . : 664 TGCCCGGTGTATGATCTCGACCACAATGTGGAATTTAATGGT >>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 147630 TG...CAGTGCCCGGTGTATGATCTCGACCACAATGTGGAATTTAATGGT 750 . : . : . : . : . : 706 GTCTATCAGTCCATGACCAAGAAAGCTGCCATCACGCTACAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>> 148322 GTCTATCAGTCCATGACCAAGAAAGCTGCCATCACGCTACAGGTG...CA 800 . : . : . : . : . : 748 AAGAAGGATTTTCCAGGCGAGCAGTTCTTCGTGGTATTTGTGATAAAGC >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 150327 GAAGAAGGATTTTCCAGGCGAGCAGTTCTTCGTGGTATTTGTGATAAAGC 850 . : . : . : . : . : 797 CTGAAGATTATGCCTGTGGAGGATCTTTCTTCATCCAGG AA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|| 150377 CTGAAGATTATGCCTGTGGAGGATCTTTCTTCATCCAGGGTA...CAGAA 900 . : . : . : . : . : 838 AAGGAAAACCAGACCTGGAATCTACAGCGAAAAAAGAACCTTGAAGTGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 151619 AAGGAAAACCAGACCTGGAATCTACAGCGAAAAAAGAACCTTGAAGTGAC 950 . : . : . : . : . : 888 CATTGTCCCTTCCATTAAAG AATCTGTTTATGTGAAATCCA ||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||| 151669 CATTGTCCCTTCCATTAAAGGTC...CAGAATCTGTTTATGTGAAATCCA 1000 . : . : . : . : . : 929 GTCTTTTCAGTGTCTTCATCTTCCTGTCCTTCTACTTGGGATGCCTTCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 152117 GTCTTTTCAGTGTCTTCATCTTCCTGTCCTTCTACTTGGGATGCCTTCTT 1050 . : . : . : . : . : 979 GTTGGGTTTGTTCATTATCTGAG GTTTCAGAGAAAATCCAT |||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||| 152167 GTTGGGTTTGTTCATTATCTGAGGTA...CAGGTTTCAGAGAAAATCCAT 1100 . : . : . : . : . : 1020 TGATGGAAGCTTTGGGTCCAATGATG GCTCTGGAAATATGG ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||| 159942 TGATGGAAGCTTTGGGTCCAATGATGGTA...CAGGCTCTGGAAATATGG 1150 . : . : . : . : . : 1061 TGGCATCTCATCCCATTGCTGCCAGCACACCCGAAGGGAGCAATTATGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 168522 TGGCATCTCATCCCATTGCTGCCAGCACACCCGAAGGGAGCAATTATGGG 1200 . : . : . : . : . : 1111 ACAATAG ATGAGTCAAGCTCCAGTCCTGGAAGGCAGATGTC |||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||| 168572 ACAATAGGTA...CAGATGAGTCAAGCTCCAGTCCTGGAAGGCAGATGTC 1250 . : . : . : . : . : 1152 CTCCTCCGATGGTGGGCCACCGGGCCAGTCAGACACAGACAGCTCCGTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 169958 CTCCTCCGATGGTGGGCCACCGGGCCAGTCAGACACAGACAGCTCCGTGG 1300 . : . : . : . : . : 1202 AGGAGAGCGACTTCGACACCATGCCAGACATTGAGAGTGATAAAAACATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 170008 AGGAGAGCGACTTCGACACCATGCCAGACATTGAGAGTGATAAAAACATC 1350 . : . : . : . : . : 1252 ATCCGGACCAAG ATGTTCCTTTACCTGTCAGATTTGTCCAG ||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||| 170058 ATCCGGACCAAGGTA...CAGATGTTCCTTTACCTGTCAGATTTGTCCAG 1400 . : . : . : . : . : 1293 GAAGGACCGGAGAATTGTCAGCAAAAAATATAAAATTTATTTTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.. 170908 GAAGGACCGGAGAATTGTCAGCAAAAAATATAAAATTTATTTTTGGTA.. 1450 . : . : . : . : . : 1338 GAACATCATCACCATTGCTGTGTTTTACGCGCTGCCCGTGATCCAG .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 170958 .TAGGAACATCATCACCATTGCTGTGTTTTACGCGCTGCCCGTGATCCAG 1500 . : . : . : . : . : 1384 CTGGTCATTACCTATCAGACA GTGGTAAATGTCACTGGCAA |||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||| 171875 CTGGTCATTACCTATCAGACAGTA...CAGGTGGTAAATGTCACTGGCAA 1550 . : . : . : . : . : 1425 CCAGGACATCTGTTACTACAACTTCCTCTGTGCTCACCCCTTGGGCGTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 173980 CCAGGACATCTGTTACTACAACTTCCTCTGTGCTCACCCCTTGGGCGTCC 1600 . : . : . : . : . : 1475 TGAG TGCCTTCAACAACATTCTCAGCAATCTGGGCCACGTG ||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 174030 TGAGGTA...TAGTGCCTTCAACAACATTCTCAGCAATCTGGGCCACGTG 1650 . : . : . : . : . : 1516 CTTCTGGGCTTCCTCTTCCTGCTGATAGTCTTGCGCCGCGACATCCTCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 175050 CTTCTGGGCTTCCTCTTCCTGCTGATAGTCTTGCGCCGCGACATCCTCCA 1700 . : . : . : . : . : 1566 TCGGAGAGCCCTGGAAGCCAAGGACATCTTTGCTGTG GAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||| 175100 TCGGAGAGCCCTGGAAGCCAAGGACATCTTTGCTGTGGTG...CAGGAGT 1750 . : . : . : . : . : 1607 ACGGGATTCCCAAACACTTTGGTCTCTTCTACGCTATGGGCATTGCATTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 175342 ACGGGATTCCCAAACACTTTGGTCTCTTCTACGCTATGGGCATTGCATTG 1800 . : . : . : . : . : 1657 ATGATGGAAGGGGTGCTCAGTGCTTGCTACCATGTCTGCCCTAATTATTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 175392 ATGATGGAAGGGGTGCTCAGTGCTTGCTACCATGTCTGCCCTAATTATTC 1850 . : . : . : . : . : 1707 CAACTTCCAATTCG ACACCTCCTTCATGTACATGATCGCTG ||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||| 175442 CAACTTCCAATTCGGTA...CAGACACCTCCTTCATGTACATGATCGCTG 1900 . : . : . : . : . : 1748 GCCTGTGCATGCTGAAGCTCTATCAGACCCGCCACCCAGACATCAATGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 177954 GCCTGTGCATGCTGAAGCTCTATCAGACCCGCCACCCAGACATCAATGCC 1950 . : . : . : . : . : 1798 AGCGCCTACTCTGCCTATGCCTCCTTTGCTGTGGTCATCATGGTCACCGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 178004 AGCGCCTACTCTGCCTATGCCTCCTTTGCTGTGGTCATCATGGTCACCGT 2000 . : . : . : . : . : 1848 CCTTGGAGTG GTGTTTGGAAAAAATGACGTATGGTTCTGGG ||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| 178054 CCTTGGAGTGGTG...TAGGTGTTTGGAAAAAATGACGTATGGTTCTGGG 2050 . : . : . : . : . : 1889 TCATCTTCTCTGCAATCCACGTTCTGGCCTCGCTAGCCCTCAGCACCCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 179036 TCATCTTCTCTGCAATCCACGTTCTGGCCTCGCTAGCCCTCAGCACCCAG 2100 . : . : . : . : . : 1939 ATATATTATATGGGTCGTTTCAAGATAGATGTGTCTGACA |||||||||||||||||||||||||||| || ||| -| >>>...>>>- 179086 ATATATTATATGGGTCGTTTCAAGATAGGTGAGTCAC CTGTT...TATC 2150 . : . : . : . : . : 1979 CAGATTTGGGAATTTTCCGGCGGGCTGCCATGGTGTTCTACACAGACT --|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 183014 AGCAGATTTGGGAATTTTCCGGCGGGCTGCCATGGTGTTCTACACAGACT 2200 . : . : . : . : . : 2027 GTATCCAGCAGTGTAGCCGACCTCTATATATG GATAGAATG ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||| 183064 GTATCCAGCAGTGTAGCCGACCTCTATATATGGTA...CAGGATAGAATG 2250 . : . : . : . : . : 2068 GTGTTGCTGGTTGTGGGGAATCTGGTTAACTGGTCCTT CGC ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||| 186608 GTGTTGCTGGTTGTGGGGAATCTGGTTAACTGGTCCTTGTA...CAGCGC 2300 . : . : . : . : . : 2109 CCTCTTTGGATTGATATACCGCCCCAGGGACTTTGCTTCCTACATGCTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 190349 CCTCTTTGGATTGATATACCGCCCCAGGGACTTTGCTTCCTACATGCTGG 2350 . : . : . : . : . : 2159 GCATCTTCATCTGTAACCTTTTGCTGTACCTGGCCTTTTACATCATCATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 190399 GCATCTTCATCTGTAACCTTTTGCTGTACCTGGCCTTTTACATCATCATG 2400 . : . : . : . : . : 2209 AAG CTCCGCAGCTCTGAAAAGGTCCTCCCAGTCCCGCTCTT |||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 190449 AAGGTA...CAGCTCCGCAGCTCTGAAAAGGTCCTCCCAGTCCCGCTCTT 2450 . : . : . : . : . : 2250 CTGCATCGTGGCCACCGCTGTGATGTGGGCTGCCGCCCTATATTTTTTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 190580 CTGCATCGTGGCCACCGCTGTGATGTGGGCTGCCGCCCTATATTTTTTCT 2500 . : . : . : . : . : 2300 TCCAGAATCTCAGCAGCTGGGAG GGAACTCCGGCCGAATCC |||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||| 190630 TCCAGAATCTCAGCAGCTGGGAGGTA...CAGGGAACTCCGGCCGAATCC 2550 . : . : . : . : . : 2341 CGGGAGAAGAACCGCGAGTGCATTCTGCTGGATTTCTTCGATGACCATGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 193039 CGGGAGAAGAACCGCGAGTGCATTCTGCTGGATTTCTTCGATGACCATGA 2600 . : . : . : . : . : 2391 CATCTGGCACTTCCTCTCTGCTACTGCTCTGTTTTTCTCATTCTTG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>. 193089 CATCTGGCACTTCCTCTCTGCTACTGCTCTGTTTTTCTCATTCTTGGTG. 2650 . : . : . : . : . : 2437 GTTTTGTTAACTTTGGATGATGACCTTGATGTGGTTCGGAGAGAC ..>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 193139 ..CAGGTTTTGTTAACTTTGGATGATGACCTTGATGTGGTTCGGAGAGAC 2700 . : . 2482 CAGATCCCTGTCTTC ||||||||||||||| 194610 CAGATCCCTGTCTTC