Result of FASTA (ccds) for pF1KB9470
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9470, 655 aa
  1>>>pF1KB9470 655 - 655 aa - 655 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8887+/-0.000908; mu= 4.0413+/- 0.054
 mean_var=225.0513+/-46.020, 0's: 0 Z-trim(113.7): 128  B-trim: 97 in 1/50
 Lambda= 0.085494
 statistics sampled from 14169 (14300) to 14169 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.765), E-opt: 0.2 (0.439), width:  16
 Scan time:  4.430

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS58080.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10     ( 714) 3637 461.7 1.5e-129
CCDS58079.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10     ( 608) 3625 460.2 3.8e-129
CCDS7227.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10      ( 698) 3625 460.3 4.2e-129
CCDS58081.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10     ( 704) 3625 460.3 4.2e-129
CCDS54363.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2       ( 606) 1283 171.3 3.4e-42
CCDS3611.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4       ( 655) 1111 150.2 8.8e-36
CCDS43246.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4      ( 653) 1102 149.0 1.9e-35
CCDS34025.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4      ( 748) 1102 149.1 2.1e-35
CCDS46312.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2       ( 638)  952 130.5 6.9e-30
CCDS54364.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2       ( 639)  942 129.3 1.6e-29
CCDS33214.2 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2       ( 646)  942 129.3 1.6e-29
CCDS2572.1 SRGAP3 gene_id:9901|Hs108|chr3          (1099)  442 67.8   9e-11


>>CCDS58080.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10          (714 aa)
 initn: 3637 init1: 3637 opt: 3637  Z-score: 2439.2  bits: 461.7 E(32554): 1.5e-129
Smith-Waterman score: 4083; 91.4% identity (91.4% similar) in 687 aa overlap (28-655:28-714)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MLSPKIRQARRARSKSLVMGEQSRSPGRMPCPHRLGPVLKAGWLKKQRSIMKNWQQRWFV
                                  :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MLSPKIRQARRARSKSLVMGEQSRSPGRMPCPHRLGPVLKAGWLKKQRSIMKNWQQRWFV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100                    
pF1KB9 LRGDQLFYYKDKDEIKPQGFISLQGTQVTELPPGPEDPGKHLFEISPG------------
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::            
CCDS58 LRGDQLFYYKDKDEIKPQGFISLQGTQVTELPPGPEDPGKHLFEISPGGAGEREKVPANP
               70        80        90       100       110       120

                                                     110       120 
pF1KB9 -----------------------------------------------IFGQRLEETVHHE
                                                      :::::::::::::
CCDS58 EALLLMASSQRDMEDWVQAIRRVIWAPLGGGTARRSHAHPLEPLPPGIFGQRLEETVHHE
              130       140       150       160       170       180

             130       140       150       160       170       180 
pF1KB9 RKYGPRLAPLLVEQCVDFIRERGLTEEGLFRMPGQANLVRDLQDSFDCGEKPLFDSTTDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RKYGPRLAPLLVEQCVDFIRERGLTEEGLFRMPGQANLVRDLQDSFDCGEKPLFDSTTDV
              190       200       210       220       230       240

             190       200       210       220       230       240 
pF1KB9 HTVASLLKLYLRELPEPVVPFARYEDFLSCAQLLTKDEGEGTLELAKQVSNLPQANYNLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HTVASLLKLYLRELPEPVVPFARYEDFLSCAQLLTKDEGEGTLELAKQVSNLPQANYNLL
              250       260       270       280       290       300

             250       260       270       280       290       300 
pF1KB9 RYICKFLDEVQAYSNVNKMSVQNLATVFGPNILRPQVEDPVTIMEGTSLVQHLMTVLIRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RYICKFLDEVQAYSNVNKMSVQNLATVFGPNILRPQVEDPVTIMEGTSLVQHLMTVLIRK
              310       320       330       340       350       360

             310       320       330       340       350       360 
pF1KB9 HSQLFTAPVPEGPTSPRGGLQCAVGWGSEEVTRDSQGEPGGPGLPAHRTSSLDGAAVAVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HSQLFTAPVPEGPTSPRGGLQCAVGWGSEEVTRDSQGEPGGPGLPAHRTSSLDGAAVAVL
              370       380       390       400       410       420

             370       380       390       400       410       420 
pF1KB9 SRTAPTGPGSRCSPGKKVQTLPSWKSSFRQPRSLSGSPKGGGSSLEVPIISSGGNWLMNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SRTAPTGPGSRCSPGKKVQTLPSWKSSFRQPRSLSGSPKGGGSSLEVPIISSGGNWLMNG
              430       440       450       460       470       480

             430       440       450       460       470       480 
pF1KB9 LSSLRGHRRASSGDRLKDSGSVQRLSTYDNVPAPGLVPGIPSVASMAWSGASSSESSVGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LSSLRGHRRASSGDRLKDSGSVQRLSTYDNVPAPGLVPGIPSVASMAWSGASSSESSVGG
              490       500       510       520       530       540

             490       500       510       520       530       540 
pF1KB9 SLSSCTACRASDSSARSSLHTDWALEPSPLPSSSEDPKSLDLDHSMDEAGAGASNSEPSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SLSSCTACRASDSSARSSLHTDWALEPSPLPSSSEDPKSLDLDHSMDEAGAGASNSEPSE
              550       560       570       580       590       600

             550       560       570       580       590       600 
pF1KB9 PDSPTREHARRSEALQGLVTELRAELCRQRTEYERSVKRIEEGSADLRKRMSRLEEELDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PDSPTREHARRSEALQGLVTELRAELCRQRTEYERSVKRIEEGSADLRKRMSRLEEELDQ
              610       620       630       640       650       660

             610       620       630       640       650     
pF1KB9 EKKKYIMLEIKLRNSERAREDAERRNQLLQREMEEFFSTLGSLTVGAKGARAPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EKKKYIMLEIKLRNSERAREDAERRNQLLQREMEEFFSTLGSLTVGAKGARAPK
              670       680       690       700       710    

>>CCDS58079.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10          (608 aa)
 initn: 3625 init1: 3625 opt: 3625  Z-score: 2432.1  bits: 460.2 E(32554): 3.8e-129
Smith-Waterman score: 3625; 100.0% identity (100.0% similar) in 548 aa overlap (108-655:61-608)

        80        90       100       110       120       130       
pF1KB9 QGFISLQGTQVTELPPGPEDPGKHLFEISPGIFGQRLEETVHHERKYGPRLAPLLVEQCV
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EALLLMASSQRDMEDWVQAIRRVIWAPLGGGIFGQRLEETVHHERKYGPRLAPLLVEQCV
               40        50        60        70        80        90

       140       150       160       170       180       190       
pF1KB9 DFIRERGLTEEGLFRMPGQANLVRDLQDSFDCGEKPLFDSTTDVHTVASLLKLYLRELPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DFIRERGLTEEGLFRMPGQANLVRDLQDSFDCGEKPLFDSTTDVHTVASLLKLYLRELPE
              100       110       120       130       140       150

       200       210       220       230       240       250       
pF1KB9 PVVPFARYEDFLSCAQLLTKDEGEGTLELAKQVSNLPQANYNLLRYICKFLDEVQAYSNV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PVVPFARYEDFLSCAQLLTKDEGEGTLELAKQVSNLPQANYNLLRYICKFLDEVQAYSNV
              160       170       180       190       200       210

       260       270       280       290       300       310       
pF1KB9 NKMSVQNLATVFGPNILRPQVEDPVTIMEGTSLVQHLMTVLIRKHSQLFTAPVPEGPTSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NKMSVQNLATVFGPNILRPQVEDPVTIMEGTSLVQHLMTVLIRKHSQLFTAPVPEGPTSP
              220       230       240       250       260       270

       320       330       340       350       360       370       
pF1KB9 RGGLQCAVGWGSEEVTRDSQGEPGGPGLPAHRTSSLDGAAVAVLSRTAPTGPGSRCSPGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RGGLQCAVGWGSEEVTRDSQGEPGGPGLPAHRTSSLDGAAVAVLSRTAPTGPGSRCSPGK
              280       290       300       310       320       330

       380       390       400       410       420       430       
pF1KB9 KVQTLPSWKSSFRQPRSLSGSPKGGGSSLEVPIISSGGNWLMNGLSSLRGHRRASSGDRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KVQTLPSWKSSFRQPRSLSGSPKGGGSSLEVPIISSGGNWLMNGLSSLRGHRRASSGDRL
              340       350       360       370       380       390

       440       450       460       470       480       490       
pF1KB9 KDSGSVQRLSTYDNVPAPGLVPGIPSVASMAWSGASSSESSVGGSLSSCTACRASDSSAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KDSGSVQRLSTYDNVPAPGLVPGIPSVASMAWSGASSSESSVGGSLSSCTACRASDSSAR
              400       410       420       430       440       450

       500       510       520       530       540       550       
pF1KB9 SSLHTDWALEPSPLPSSSEDPKSLDLDHSMDEAGAGASNSEPSEPDSPTREHARRSEALQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SSLHTDWALEPSPLPSSSEDPKSLDLDHSMDEAGAGASNSEPSEPDSPTREHARRSEALQ
              460       470       480       490       500       510

       560       570       580       590       600       610       
pF1KB9 GLVTELRAELCRQRTEYERSVKRIEEGSADLRKRMSRLEEELDQEKKKYIMLEIKLRNSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GLVTELRAELCRQRTEYERSVKRIEEGSADLRKRMSRLEEELDQEKKKYIMLEIKLRNSE
              520       530       540       550       560       570

       620       630       640       650     
pF1KB9 RAREDAERRNQLLQREMEEFFSTLGSLTVGAKGARAPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RAREDAERRNQLLQREMEEFFSTLGSLTVGAKGARAPK
              580       590       600        

>>CCDS7227.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10           (698 aa)
 initn: 3625 init1: 3625 opt: 3625  Z-score: 2431.3  bits: 460.3 E(32554): 4.2e-129
Smith-Waterman score: 4216; 93.7% identity (93.7% similar) in 687 aa overlap (12-655:12-698)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MLSPKIRQARRARSKSLVMGEQSRSPGRMPCPHRLGPVLKAGWLKKQRSIMKNWQQRWFV
                  :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MLSPKIRQARRARSKSLVMGEQSRSPGRMPCPHRLGPVLKAGWLKKQRSIMKNWQQRWFV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100                    
pF1KB9 LRGDQLFYYKDKDEIKPQGFISLQGTQVTELPPGPEDPGKHLFEISPG------------
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::            
CCDS72 LRGDQLFYYKDKDEIKPQGFISLQGTQVTELPPGPEDPGKHLFEISPGGAGEREKVPANP
               70        80        90       100       110       120

                                     110       120       130       
pF1KB9 -------------------------------IFGQRLEETVHHERKYGPRLAPLLVEQCV
                                      :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EALLLMASSQRDMEDWVQAIRRVIWAPLGGGIFGQRLEETVHHERKYGPRLAPLLVEQCV
              130       140       150       160       170       180

       140       150       160       170       180       190       
pF1KB9 DFIRERGLTEEGLFRMPGQANLVRDLQDSFDCGEKPLFDSTTDVHTVASLLKLYLRELPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 DFIRERGLTEEGLFRMPGQANLVRDLQDSFDCGEKPLFDSTTDVHTVASLLKLYLRELPE
              190       200       210       220       230       240

       200       210       220       230       240       250       
pF1KB9 PVVPFARYEDFLSCAQLLTKDEGEGTLELAKQVSNLPQANYNLLRYICKFLDEVQAYSNV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 PVVPFARYEDFLSCAQLLTKDEGEGTLELAKQVSNLPQANYNLLRYICKFLDEVQAYSNV
              250       260       270       280       290       300

       260       270       280       290       300       310       
pF1KB9 NKMSVQNLATVFGPNILRPQVEDPVTIMEGTSLVQHLMTVLIRKHSQLFTAPVPEGPTSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 NKMSVQNLATVFGPNILRPQVEDPVTIMEGTSLVQHLMTVLIRKHSQLFTAPVPEGPTSP
              310       320       330       340       350       360

       320       330       340       350       360       370       
pF1KB9 RGGLQCAVGWGSEEVTRDSQGEPGGPGLPAHRTSSLDGAAVAVLSRTAPTGPGSRCSPGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RGGLQCAVGWGSEEVTRDSQGEPGGPGLPAHRTSSLDGAAVAVLSRTAPTGPGSRCSPGK
              370       380       390       400       410       420

       380       390       400       410       420       430       
pF1KB9 KVQTLPSWKSSFRQPRSLSGSPKGGGSSLEVPIISSGGNWLMNGLSSLRGHRRASSGDRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 KVQTLPSWKSSFRQPRSLSGSPKGGGSSLEVPIISSGGNWLMNGLSSLRGHRRASSGDRL
              430       440       450       460       470       480

       440       450       460       470       480       490       
pF1KB9 KDSGSVQRLSTYDNVPAPGLVPGIPSVASMAWSGASSSESSVGGSLSSCTACRASDSSAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 KDSGSVQRLSTYDNVPAPGLVPGIPSVASMAWSGASSSESSVGGSLSSCTACRASDSSAR
              490       500       510       520       530       540

       500       510       520       530       540       550       
pF1KB9 SSLHTDWALEPSPLPSSSEDPKSLDLDHSMDEAGAGASNSEPSEPDSPTREHARRSEALQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SSLHTDWALEPSPLPSSSEDPKSLDLDHSMDEAGAGASNSEPSEPDSPTREHARRSEALQ
              550       560       570       580       590       600

       560       570       580       590       600       610       
pF1KB9 GLVTELRAELCRQRTEYERSVKRIEEGSADLRKRMSRLEEELDQEKKKYIMLEIKLRNSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 GLVTELRAELCRQRTEYERSVKRIEEGSADLRKRMSRLEEELDQEKKKYIMLEIKLRNSE
              610       620       630       640       650       660

       620       630       640       650     
pF1KB9 RAREDAERRNQLLQREMEEFFSTLGSLTVGAKGARAPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RAREDAERRNQLLQREMEEFFSTLGSLTVGAKGARAPK
              670       680       690        

>>CCDS58081.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10          (704 aa)
 initn: 3625 init1: 3625 opt: 3625  Z-score: 2431.3  bits: 460.3 E(32554): 4.2e-129
Smith-Waterman score: 4211; 93.7% identity (93.7% similar) in 686 aa overlap (13-655:19-704)

                     10        20        30        40        50    
pF1KB9       MLSPKIRQARRARSKSLVMGEQSRSPGRMPCPHRLGPVLKAGWLKKQRSIMKNW
                         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MLPTASSKRRTFAARYFTRSKSLVMGEQSRSPGRMPCPHRLGPVLKAGWLKKQRSIMKNW
               10        20        30        40        50        60

           60        70        80        90       100              
pF1KB9 QQRWFVLRGDQLFYYKDKDEIKPQGFISLQGTQVTELPPGPEDPGKHLFEISPG------
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::      
CCDS58 QQRWFVLRGDQLFYYKDKDEIKPQGFISLQGTQVTELPPGPEDPGKHLFEISPGGAGERE
               70        80        90       100       110       120

                                           110       120       130 
pF1KB9 -------------------------------------IFGQRLEETVHHERKYGPRLAPL
                                            :::::::::::::::::::::::
CCDS58 KVPANPEALLLMASSQRDMEDWVQAIRRVIWAPLGGGIFGQRLEETVHHERKYGPRLAPL
              130       140       150       160       170       180

             140       150       160       170       180       190 
pF1KB9 LVEQCVDFIRERGLTEEGLFRMPGQANLVRDLQDSFDCGEKPLFDSTTDVHTVASLLKLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LVEQCVDFIRERGLTEEGLFRMPGQANLVRDLQDSFDCGEKPLFDSTTDVHTVASLLKLY
              190       200       210       220       230       240

             200       210       220       230       240       250 
pF1KB9 LRELPEPVVPFARYEDFLSCAQLLTKDEGEGTLELAKQVSNLPQANYNLLRYICKFLDEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LRELPEPVVPFARYEDFLSCAQLLTKDEGEGTLELAKQVSNLPQANYNLLRYICKFLDEV
              250       260       270       280       290       300

             260       270       280       290       300       310 
pF1KB9 QAYSNVNKMSVQNLATVFGPNILRPQVEDPVTIMEGTSLVQHLMTVLIRKHSQLFTAPVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QAYSNVNKMSVQNLATVFGPNILRPQVEDPVTIMEGTSLVQHLMTVLIRKHSQLFTAPVP
              310       320       330       340       350       360

             320       330       340       350       360       370 
pF1KB9 EGPTSPRGGLQCAVGWGSEEVTRDSQGEPGGPGLPAHRTSSLDGAAVAVLSRTAPTGPGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EGPTSPRGGLQCAVGWGSEEVTRDSQGEPGGPGLPAHRTSSLDGAAVAVLSRTAPTGPGS
              370       380       390       400       410       420

             380       390       400       410       420       430 
pF1KB9 RCSPGKKVQTLPSWKSSFRQPRSLSGSPKGGGSSLEVPIISSGGNWLMNGLSSLRGHRRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RCSPGKKVQTLPSWKSSFRQPRSLSGSPKGGGSSLEVPIISSGGNWLMNGLSSLRGHRRA
              430       440       450       460       470       480

             440       450       460       470       480       490 
pF1KB9 SSGDRLKDSGSVQRLSTYDNVPAPGLVPGIPSVASMAWSGASSSESSVGGSLSSCTACRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SSGDRLKDSGSVQRLSTYDNVPAPGLVPGIPSVASMAWSGASSSESSVGGSLSSCTACRA
              490       500       510       520       530       540

             500       510       520       530       540       550 
pF1KB9 SDSSARSSLHTDWALEPSPLPSSSEDPKSLDLDHSMDEAGAGASNSEPSEPDSPTREHAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SDSSARSSLHTDWALEPSPLPSSSEDPKSLDLDHSMDEAGAGASNSEPSEPDSPTREHAR
              550       560       570       580       590       600

             560       570       580       590       600       610 
pF1KB9 RSEALQGLVTELRAELCRQRTEYERSVKRIEEGSADLRKRMSRLEEELDQEKKKYIMLEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RSEALQGLVTELRAELCRQRTEYERSVKRIEEGSADLRKRMSRLEEELDQEKKKYIMLEI
              610       620       630       640       650       660

             620       630       640       650     
pF1KB9 KLRNSERAREDAERRNQLLQREMEEFFSTLGSLTVGAKGARAPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KLRNSERAREDAERRNQLLQREMEEFFSTLGSLTVGAKGARAPK
              670       680       690       700    

>>CCDS54363.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2            (606 aa)
 initn: 1449 init1: 829 opt: 1283  Z-score: 871.0  bits: 171.3 E(32554): 3.4e-42
Smith-Waterman score: 1481; 42.9% identity (65.8% similar) in 655 aa overlap (5-641:14-599)

                        10        20          30        40         
pF1KB9          MLSPKIRQARRARSKSLVMGEQSRS--PGRMPCPHRLGPVLKAGWLKKQRS
                    :.. :. :::.:.. :::  .  :.  : : .  :. : ::::::::
CCDS54 MSLKLPRNWDFNLKVEAAKIARSRSVMTGEQMAAFHPSSTPNPLER-PI-KMGWLKKQRS
               10        20        30        40          50        

      50        60        70        80        90       100         
pF1KB9 IMKNWQQRWFVLRGDQLFYYKDKDEIKPQGFISLQGTQVTELPPGPEDPGKHLFEISPGI
       :.::::::.::::..::.::::... :::: . : :  . :.  .::. :: .::: : .
CCDS54 IVKNWQQRYFVLRAQQLYYYKDEEDTKPQGCMYLPGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIP-V
       60        70        80        90       100       110        

     110       120       130       140       150       160         
pF1KB9 FGQRLEETVHHERKYGPRLAPLLVEQCVDFIRERGLTEEGLFRMPGQANLVRDLQDSFDC
       :::::.::: .:.:.::.:.:.:::.:..:: :.: .:::.::.::: :::..:.:.:: 
CCDS54 FGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAEFILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDA
       120       130       140       150       160       170       

     170       180       190       200       210       220         
pF1KB9 GEKPLFDSTTDVHTVASLLKLYLRELPEPVVPFARYEDFLSCAQLLTKDEGEGTLELAKQ
       ::.: ::  :::::::::::::::.:::::::...:: :: :.:: . ::...  :: ::
CCDS54 GERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEPVVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQ
       180       190       200       210       220       230       

     230       240       250       260       270       280         
pF1KB9 VSNLPQANYNLLRYICKFLDEVQAYSNVNKMSVQNLATVFGPNILRPQVEDPVTIMEGTS
       .: ::. ::.:: :::.:: :.:    ::::::.:::::.: :..: .::::..::.:: 
CCDS54 LSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQLNCAVNKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTP
       240       250       260       270       280       290       

     290       300         310       320             330       340 
pF1KB9 LVQHLMTVLIRKHSQLF--TAPVPEGPTSPRGGLQCA------VGWGSEEVTRDSQGEPG
        .:..::..:: :  ::  .  .: .: . ..  . :      ::: . :  : :. .  
CCDS54 QIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDIPLSPPAQKNDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTDSF
       300       310       320       330       340       350       

             350           360        370        380       390     
pF1KB9 GPGLPAHRTSSLDGA----AVAVLSRTAPT-GPGS-RCSPGKKVQTLPSWKSSFRQPRSL
       .       :.:  :     :    :  .:   ::. . .  :..::::. .. :     :
CCDS54 SSMTSDSDTTSPTGQQPSDAFPEDSSKVPREKPGDWKMQSRKRTQTLPN-RKCF-----L
       360       370       380       390       400        410      

         400        410       420        430       440       450   
pF1KB9 SGSPKGGGSS-LEVPIISSGGNWLMNGLSSL-RGHRRASSGDRLKDSGSVQRLSTYDNVP
       ... .:..:: .:   : ..  :  .. ..  .::::. : : :.. .. :: :::::::
CCDS54 TSAFQGANSSKME---IFKNEFWSPSSEAKAGEGHRRTMSQD-LRQLSDSQRTSTYDNVP
             420          430       440       450        460       

           460       470       480       490       500       510   
pF1KB9 APGLVPGIPSVASMAWSGASSSESSVGGSLSSCTACRASDSSARSSLHTDWALEPSPLPS
       .   .:: :.  . : :  :.. .: : .:.:                          :.
CCDS54 S---LPGSPGEEASALS--SQACDSKGDTLAS--------------------------PN
          470       480         490                                

           520       530       540       550       560       570   
pF1KB9 SSEDPKSLDLDHSMDEAGAGASNSEPSEPDSPTREHARRSEALQGLVTELRAELCRQRTE
       :              :.: : .::   : ::           :: .: ::: :.  :.  
CCDS54 S--------------ETGPGKKNSGEEEIDS-----------LQRMVQELRKEIETQKQM
                      500       510                  520       530 

           580       590       600       610       620       630   
pF1KB9 YERSVKRIEEGSADLRKRMSRLEEELDQEKKKYIMLEIKLRNSERAREDAERRNQLLQRE
       ::...: .:. . :.  .. ::.:::..::::   :::.::: ::.:::.:.::. :..:
CCDS54 YEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLNEELEKEKKKSAALEISLRNMERSREDVEKRNKALEEE
             540       550       560       570       580       590 

           640       650     
pF1KB9 MEEFFSTLGSLTVGAKGARAPK
       ..:: ...              
CCDS54 VKEFVKSMKEPKTEA       
             600             

>>CCDS3611.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4            (655 aa)
 initn: 1490 init1: 1081 opt: 1111  Z-score: 755.9  bits: 150.2 E(32554): 8.8e-36
Smith-Waterman score: 1365; 44.3% identity (65.7% similar) in 598 aa overlap (100-622:30-617)

      70        80        90       100       110       120         
pF1KB9 KDKDEIKPQGFISLQGTQVTELPPGPEDPGKHLFEISPGIFGQRLEETVHHERKYGPRLA
                                     :. : .  :::::.::.::..:..:: :::
CCDS36  MPEDRNSGGCPAGALASTPFIPKTTYRRIKRCFSFRKGIFGQKLEDTVRYEKRYGNRLA
                10        20        30        40        50         

     130       140       150       160       170       180         
pF1KB9 PLLVEQCVDFIRERGLTEEGLFRMPGQANLVRDLQDSFDCGEKPLFDSTTDVHTVASLLK
       :.::::::::::.::: ::::::.:::::::..:::.::::::: :::.:::::::::::
CCDS36 PMLVEQCVDFIRQRGLKEEGLFRLPGQANLVKELQDAFDCGEKPSFDSNTDVHTVASLLK
      60        70        80        90       100       110         

     190       200       210       220       230       240         
pF1KB9 LYLRELPEPVVPFARYEDFLSCAQLLTKDEGEGTLELAKQVSNLPQANYNLLRYICKFLD
       ::::::::::.:.:.::::::::.::.:.:  :. ::::::..:: .:::::.:::.:::
CCDS36 LYLRELPEPVIPYAKYEDFLSCAKLLSKEEEAGVKELAKQVKSLPVVNYNLLKYICRFLD
     120       130       140       150       160       170         

     250       260       270       280       290       300         
pF1KB9 EVQAYSNVNKMSVQNLATVFGPNILRPQVEDPVTIMEGTSLVQHLMTVLIRKHSQLFTAP
       :::.::.::::::::::::::::::::.::::.:::::: .::.::.:.: ::. ::   
CCDS36 EVQSYSGVNKMSVQNLATVFGPNILRPKVEDPLTIMEGTVVVQQLMSVMISKHDCLFPKD
     180       190       200       210       220       230         

     310       320                                    330       340
pF1KB9 VPEGPTSPRGGL-----------------------------QCAVGWGSEEVTRDSQGEP
       . :  ..:. :.                             ::.  : . :  . :. . 
CCDS36 A-ELQSKPQDGVSNNNEIQKKATMGQLQNKENNNTKDSPSRQCS--WDKSESPQRSSMNN
     240        250       260       270       280         290      

               350       360                  370                  
pF1KB9 GGP-GLPAHRTSSLDGAAVAV-LSRTAPT----------GPG--------SRCSPG-KKV
       :.: .: . .:.:  ...  . .::. :           : :        :  . : .:.
CCDS36 GSPTALSGSKTNSPKNSVHKLDVSRSPPLMVKKNPAFNKGSGIVTNGSFSSSNAEGLEKT
        300       310       320       330       340       350      

     380       390         400           410                 420   
pF1KB9 QTLPSWKSSFRQPRSL--SGSPKGGGS----SLEVPIISSG--GN--------WLMNGLS
       :: :. . . :.  ::  ::.  :  :    .... :..:   ::        :: ::  
CCDS36 QTTPNGSLQARRSSSLKVSGTKMGTHSVQNGTVRMGILNSDTLGNPTNVRNMSWLPNGYV
        360       370       380       390       400       410      

           430       440       450       460          470       480
pF1KB9 SLRGHRRASSGDRLKDSGSVQRLSTYDNVPAPGLVPGIP---SVASMAWSGASSSESSVG
       .:: ...  .. .:   :. .::::::::     . ..    :. : .:: .:: : :. 
CCDS36 TLRDNKQKEQAGEL---GQHNRLSTYDNVHQQFSMMNLDDKQSIDSATWS-TSSCEISLP
        420       430          440       450       460        470  

                  490       500       510       520       530      
pF1KB9 GSLSSC----TACRASDSSARSSLHTDWALEPSPLPSSSEDPKSLDLDHSMDEAGAGASN
        . .::    :.:  .:  . .    : .:.  :  . :. :.. .   .   .:. .: 
CCDS36 ENSNSCRSSTTTCPEQDFFGGN--FEDPVLDGPPQDDLSH-PRDYESKSDHRSVGGRSSR
            480       490         500       510        520         

        540       550         560       570       580       590    
pF1KB9 SEPSEPDSPTREHARRSE--ALQGLVTELRAELCRQRTEYERSVKRIEEGSADLRKRMSR
       .  :  .: :      :.  ::..::. :. :. .:. :::  .: .:. .  :. .:  
CCDS36 ATSSSDNSETFVGNSSSNHSALHSLVSSLKQEMTKQKIEYESRIKSLEQRNLTLETEMMS
     530       540       550       560       570       580         

          600       610       620       630       640       650    
pF1KB9 LEEELDQEKKKYIMLEIKLRNSERAREDAERRNQLLQREMEEFFSTLGSLTVGAKGARAP
       :..:::::.::. :.:::.::.:::.::                                
CCDS36 LHDELDQERKKFTMIEIKMRNAERAKEDAEKRNDMLQKEMEQFFSTFGELTVEPRRTERG
     590       600       610       620       630       640         

>>CCDS43246.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4           (653 aa)
 initn: 1481 init1: 1072 opt: 1102  Z-score: 749.9  bits: 149.0 E(32554): 1.9e-35
Smith-Waterman score: 1356; 44.6% identity (65.9% similar) in 590 aa overlap (108-622:36-615)

        80        90       100       110       120       130       
pF1KB9 QGFISLQGTQVTELPPGPEDPGKHLFEISPGIFGQRLEETVHHERKYGPRLAPLLVEQCV
                                     :::::.::.::..:..:: ::::.::::::
CCDS43 ESYLLMASTQNDMEDWVKSIRRVIWGPFGGGIFGQKLEDTVRYEKRYGNRLAPMLVEQCV
          10        20        30        40        50        60     

       140       150       160       170       180       190       
pF1KB9 DFIRERGLTEEGLFRMPGQANLVRDLQDSFDCGEKPLFDSTTDVHTVASLLKLYLRELPE
       ::::.::: ::::::.:::::::..:::.::::::: :::.:::::::::::::::::::
CCDS43 DFIRQRGLKEEGLFRLPGQANLVKELQDAFDCGEKPSFDSNTDVHTVASLLKLYLRELPE
          70        80        90       100       110       120     

       200       210       220       230       240       250       
pF1KB9 PVVPFARYEDFLSCAQLLTKDEGEGTLELAKQVSNLPQANYNLLRYICKFLDEVQAYSNV
       ::.:.:.::::::::.::.:.:  :. ::::::..:: .:::::.:::.::::::.::.:
CCDS43 PVIPYAKYEDFLSCAKLLSKEEEAGVKELAKQVKSLPVVNYNLLKYICRFLDEVQSYSGV
         130       140       150       160       170       180     

       260       270       280       290       300       310       
pF1KB9 NKMSVQNLATVFGPNILRPQVEDPVTIMEGTSLVQHLMTVLIRKHSQLFTAPVPEGPTSP
       :::::::::::::::::::.::::.:::::: .::.::.:.: ::. ::   . :  ..:
CCDS43 NKMSVQNLATVFGPNILRPKVEDPLTIMEGTVVVQQLMSVMISKHDCLFPKDA-ELQSKP
         190       200       210       220       230        240    

       320                                    330       340        
pF1KB9 RGGL-----------------------------QCAVGWGSEEVTRDSQGEPGGP-GLPA
       . :.                             ::.  : . :  . :. . :.: .: .
CCDS43 QDGVSNNNEIQKKATMGQLQNKENNNTKDSPSRQCS--WDKSESPQRSSMNNGSPTALSG
          250       260       270       280         290       300  

       350       360                  370                380       
pF1KB9 HRTSSLDGAAVAV-LSRTAPT----------GPG--------SRCSPG-KKVQTLPSWKS
        .:.:  ...  . .::. :           : :        :  . : .:.:: :. . 
CCDS43 SKTNSPKNSVHKLDVSRSPPLMVKKNPAFNKGSGIVTNGSFSSSNAEGLEKTQTTPNGSL
            310       320       330       340       350       360  

       390         400           410                 420       430 
pF1KB9 SFRQPRSL--SGSPKGGGS----SLEVPIISSG--GN--------WLMNGLSSLRGHRRA
       . :.  ::  ::.  :  :    .... :..:   ::        :: ::  .:: ... 
CCDS43 QARRSSSLKVSGTKMGTHSVQNGTVRMGILNSDTLGNPTNVRNMSWLPNGYVTLRDNKQK
            370       380       390       400       410       420  

             440       450       460          470       480        
pF1KB9 SSGDRLKDSGSVQRLSTYDNVPAPGLVPGIP---SVASMAWSGASSSESSVGGSLSSC--
        .. .:   :. .::::::::     . ..    :. : .:: .:: : :.  . .::  
CCDS43 EQAGEL---GQHNRLSTYDNVHQQFSMMNLDDKQSIDSATWS-TSSCEISLPENSNSCRS
               430       440       450       460        470        

          490       500       510       520       530       540    
pF1KB9 --TACRASDSSARSSLHTDWALEPSPLPSSSEDPKSLDLDHSMDEAGAGASNSEPSEPDS
         :.:  .:  . .    : .:.  :  . :. :.. .   .   .:. .: .  :  .:
CCDS43 STTTCPEQDFFGGN--FEDPVLDGPPQDDLSH-PRDYESKSDHRSVGGRSSRATSSSDNS
      480       490         500        510       520       530     

          550         560       570       580       590       600  
pF1KB9 PTREHARRSE--ALQGLVTELRAELCRQRTEYERSVKRIEEGSADLRKRMSRLEEELDQE
        :      :.  ::..::. :. :. .:. :::  .: .:. .  :. .:  :..:::::
CCDS43 ETFVGNSSSNHSALHSLVSSLKQEMTKQKIEYESRIKSLEQRNLTLETEMMSLHDELDQE
         540       550       560       570       580       590     

            610       620       630       640       650          
pF1KB9 KKKYIMLEIKLRNSERAREDAERRNQLLQREMEEFFSTLGSLTVGAKGARAPK     
       .::. :.:::.::.:::.::                                      
CCDS43 RKKFTMIEIKMRNAERAKEDAEKRNDMLQKEMEQFFSTFGELTVEPRRTERGNTIWIQ
         600       610       620       630       640       650   

>>CCDS34025.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4           (748 aa)
 initn: 1481 init1: 1072 opt: 1102  Z-score: 749.1  bits: 149.1 E(32554): 2.1e-35
Smith-Waterman score: 1562; 43.1% identity (63.6% similar) in 700 aa overlap (39-622:21-710)

       10        20        30        40        50        60        
pF1KB9 ARRARSKSLVMGEQSRSPGRMPCPHRLGPVLKAGWLKKQRSIMKNWQQRWFVLRGDQLFY
                                     .: :::.:: ...:.:. :::::.::::.:
CCDS34           MEENNDSTENPQQGQGRQNAIKCGWLRKQGGFVKTWHTRWFVLKGDQLYY
                         10        20        30        40        50

       70        80        90       100                            
pF1KB9 YKDKDEIKPQGFISLQGTQVTELPPGPEDPGKHLFEISPG--------------------
       .::.:: :: : : : :..:.: : . :.::: :::. ::                    
CCDS34 FKDEDETKPLGTIFLPGNKVSEHPCNEENPGKFLFEVVPGGDRDRMTANHESYLLMASTQ
               60        70        80        90       100       110

                           110       120       130       140       
pF1KB9 ---------------------IFGQRLEETVHHERKYGPRLAPLLVEQCVDFIRERGLTE
                            ::::.::.::..:..:: ::::.::::::::::.::: :
CCDS34 NDMEDWVKSIRRVIWGPFGGGIFGQKLEDTVRYEKRYGNRLAPMLVEQCVDFIRQRGLKE
              120       130       140       150       160       170

       150       160       170       180       190       200       
pF1KB9 EGLFRMPGQANLVRDLQDSFDCGEKPLFDSTTDVHTVASLLKLYLRELPEPVVPFARYED
       :::::.:::::::..:::.::::::: :::.:::::::::::::::::::::.:.:.:::
CCDS34 EGLFRLPGQANLVKELQDAFDCGEKPSFDSNTDVHTVASLLKLYLRELPEPVIPYAKYED
              180       190       200       210       220       230

       210       220       230       240       250       260       
pF1KB9 FLSCAQLLTKDEGEGTLELAKQVSNLPQANYNLLRYICKFLDEVQAYSNVNKMSVQNLAT
       :::::.::.:.:  :. ::::::..:: .:::::.:::.::::::.::.:::::::::::
CCDS34 FLSCAKLLSKEEEAGVKELAKQVKSLPVVNYNLLKYICRFLDEVQSYSGVNKMSVQNLAT
              240       250       260       270       280       290

       270       280       290       300       310       320       
pF1KB9 VFGPNILRPQVEDPVTIMEGTSLVQHLMTVLIRKHSQLFTAPVPEGPTSPRGGL------
       :::::::::.::::.:::::: .::.::.:.: ::. ::   . :  ..:. :.      
CCDS34 VFGPNILRPKVEDPLTIMEGTVVVQQLMSVMISKHDCLFPKDA-ELQSKPQDGVSNNNEI
              300       310       320       330        340         

                                    330       340        350       
pF1KB9 -----------------------QCAVGWGSEEVTRDSQGEPGGP-GLPAHRTSSLDGAA
                              ::.  : . :  . :. . :.: .: . .:.:  ...
CCDS34 QKKATMGQLQNKENNNTKDSPSRQCS--WDKSESPQRSSMNNGSPTALSGSKTNSPKNSV
     350       360       370         380       390       400       

       360                  370                380       390       
pF1KB9 VAV-LSRTAPT----------GPG--------SRCSPG-KKVQTLPSWKSSFRQPRSL--
         . .::. :           : :        :  . : .:.:: :. . . :.  ::  
CCDS34 HKLDVSRSPPLMVKKNPAFNKGSGIVTNGSFSSSNAEGLEKTQTTPNGSLQARRSSSLKV
       410       420       430       440       450       460       

         400           410                 420       430       440 
pF1KB9 SGSPKGGGS----SLEVPIISSG--GN--------WLMNGLSSLRGHRRASSGDRLKDSG
       ::.  :  :    .... :..:   ::        :: ::  .:: ...  .. .:   :
CCDS34 SGTKMGTHSVQNGTVRMGILNSDTLGNPTNVRNMSWLPNGYVTLRDNKQKEQAGEL---G
       470       480       490       500       510       520       

             450       460          470       480           490    
pF1KB9 SVQRLSTYDNVPAPGLVPGIP---SVASMAWSGASSSESSVGGSLSSC----TACRASDS
       . .::::::::     . ..    :. : .:: .:: : :.  . .::    :.:  .: 
CCDS34 QHNRLSTYDNVHQQFSMMNLDDKQSIDSATWS-TSSCEISLPENSNSCRSSTTTCPEQDF
          530       540       550        560       570       580   

          500       510       520       530       540       550    
pF1KB9 SARSSLHTDWALEPSPLPSSSEDPKSLDLDHSMDEAGAGASNSEPSEPDSPTREHARRSE
        . .    : .:.  :  . :. :.. .   .   .:. .: .  :  .: :      :.
CCDS34 FGGN--FEDPVLDGPPQDDLSH-PRDYESKSDHRSVGGRSSRATSSSDNSETFVGNSSSN
             590       600        610       620       630       640

            560       570       580       590       600       610  
pF1KB9 --ALQGLVTELRAELCRQRTEYERSVKRIEEGSADLRKRMSRLEEELDQEKKKYIMLEIK
         ::..::. :. :. .:. :::  .: .:. .  :. .:  :..:::::.::. :.:::
CCDS34 HSALHSLVSSLKQEMTKQKIEYESRIKSLEQRNLTLETEMMSLHDELDQERKKFTMIEIK
              650       660       670       680       690       700

            620       630       640       650          
pF1KB9 LRNSERAREDAERRNQLLQREMEEFFSTLGSLTVGAKGARAPK     
       .::.:::.::                                      
CCDS34 MRNAERAKEDAEKRNDMLQKEMEQFFSTFGELTVEPRRTERGNTIWIQ
              710       720       730       740        

>>CCDS46312.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2            (638 aa)
 initn: 1133 init1: 837 opt: 952  Z-score: 650.0  bits: 130.5 E(32554): 6.9e-30
Smith-Waterman score: 1402; 40.9% identity (62.3% similar) in 685 aa overlap (12-641:14-631)

                 10        20          30        40        50      
pF1KB9   MLSPKIRQARRARSKSLVMGEQSRS--PGRMPCPHRLGPVLKAGWLKKQRSIMKNWQQ
                    :::.:.. :::  .  :.  : : .  :. : :::::::::.:::::
CCDS46 MSLGQSACLFLSIARSRSVMTGEQMAAFHPSSTPNPLER-PI-KMGWLKKQRSIVKNWQQ
               10        20        30         40         50        

         60        70        80        90       100                
pF1KB9 RWFVLRGDQLFYYKDKDEIKPQGFISLQGTQVTELPPGPEDPGKHLFEISP---------
       :.::::..::.::::... :::: . : :  . :.  .::. :: .::: :         
CCDS46 RYFVLRAQQLYYYKDEEDTKPQGCMYLPGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWDQNRMG
       60        70        80        90       100       110        

                                    110       120       130        
pF1KB9 -----------------------------GIFGQRLEETVHHERKYGPRLAPLLVEQCVD
                                    :.:::::.::: .:.:.::.:.:.:::.:..
CCDS46 QDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCGVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCAE
      120       130       140       150       160       170        

      140       150       160       170       180       190        
pF1KB9 FIRERGLTEEGLFRMPGQANLVRDLQDSFDCGEKPLFDSTTDVHTVASLLKLYLRELPEP
       :: :.: .:::.::.::: :::..:.:.:: ::.: ::  :::::::::::::::.::::
CCDS46 FILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPEP
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      200       210       220       230       240       250        
pF1KB9 VVPFARYEDFLSCAQLLTKDEGEGTLELAKQVSNLPQANYNLLRYICKFLDEVQAYSNVN
       :::...:: :: :.:: . ::...  :: ::.: ::. ::.:: :::.:: :.:    ::
CCDS46 VVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQLNCAVN
      240       250       260       270       280       290        

      260       270       280       290       300         310      
pF1KB9 KMSVQNLATVFGPNILRPQVEDPVTIMEGTSLVQHLMTVLIRKHSQLF--TAPVPEGPTS
       ::::.:::::.: :..: .::::..::.::  .:..::..:: :  ::  .  .: .: .
CCDS46 KMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDIPLSPPA
      300       310       320       330       340       350        

        320             330       340       350           360      
pF1KB9 PRGGLQCA------VGWGSEEVTRDSQGEPGGPGLPAHRTSSLDGA----AVAVLSRTAP
        ..  . :      ::: . :  : :. .  .       :.:  :     :    :  .:
CCDS46 QKNDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTDSFSSMTSDSDTTSPTGQQPSDAFPEDSSKVP
      360       370       380       390       400       410        

         370        380       390       400       410       420    
pF1KB9 T-GPGS-RCSPGKKVQTLPSWKSSFRQPRSLSGSPKGGGSSLEVPIISSGGNWLMNGLSS
          ::. . .  :..::::. :  :     :... .:..:: .. :...   :  .. ..
CCDS46 REKPGDWKMQSRKRTQTLPNRKC-F-----LTSAFQGANSS-KMEIFKNEF-WSPSSEAK
      420       430       440             450        460        470

           430       440       450       460       470       480   
pF1KB9 L-RGHRRASSGDRLKDSGSVQRLSTYDNVPAPGLVPGIPSVASMAWSGASSSESSVGGSL
         .::::. : : :.. .. :: :::::::.   .:: :.  . : :  :.. .: : .:
CCDS46 AGEGHRRTMSQD-LRQLSDSQRTSTYDNVPS---LPGSPGEEASALS--SQACDSKGDTL
              480        490       500          510         520    

           490       500       510       520       530       540   
pF1KB9 SSCTACRASDSSARSSLHTDWALEPSPLPSSSEDPKSLDLDHSMDEAGAGASNSEPSEPD
       .:                          :.:              :.: : .::   : :
CCDS46 AS--------------------------PNS--------------ETGPGKKNSGEEEID
                                                  530       540    

           550       560       570       580       590       600   
pF1KB9 SPTREHARRSEALQGLVTELRAELCRQRTEYERSVKRIEEGSADLRKRMSRLEEELDQEK
       :           :: .: ::: :.  :.  ::...: .:. . :.  .. ::.:::..::
CCDS46 S-----------LQRMVQELRKEIETQKQMYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLNEELEKEK
                     550       560       570       580       590   

           610       620       630       640       650     
pF1KB9 KKYIMLEIKLRNSERAREDAERRNQLLQREMEEFFSTLGSLTVGAKGARAPK
       ::   :::.::: ::.:::.:.::. :..:..:: ...              
CCDS46 KKSAALEISLRNMERSREDVEKRNKALEEEVKEFVKSMKEPKTEA       
           600       610       620       630               

>>CCDS54364.1 ARHGAP25 gene_id:9938|Hs108|chr2            (639 aa)
 initn: 1125 init1: 829 opt: 942  Z-score: 643.4  bits: 129.3 E(32554): 1.6e-29
Smith-Waterman score: 1392; 40.7% identity (62.2% similar) in 686 aa overlap (12-641:14-632)

                 10        20          30        40        50      
pF1KB9   MLSPKIRQARRARSKSLVMGEQSRS--PGRMPCPHRLGPVLKAGWLKKQRSIMKNWQQ
                    :::.:.. :::  .  :.  : : .  :. : :::::::::.:::::
CCDS54 MSLGQSACLFLSIARSRSVMTGEQMAAFHPSSTPNPLER-PI-KMGWLKKQRSIVKNWQQ
               10        20        30         40         50        

         60        70        80        90       100                
pF1KB9 RWFVLRGDQLFYYKDKDEIKPQGFISLQGTQVTELPPGPEDPGKHLFEISPG--------
       :.::::..::.::::... :::: . : :  . :.  .::. :: .::: :.        
CCDS54 RYFVLRAQQLYYYKDEEDTKPQGCMYLPGCTIKEIATNPEEAGKFVFEIIPASWDQNRMG
       60        70        80        90       100       110        

                                     110       120       130       
pF1KB9 -------------------------------IFGQRLEETVHHERKYGPRLAPLLVEQCV
                                      .:::::.::: .:.:.::.:.:.:::.:.
CCDS54 QDSYVLMASSQAEMEEWVKFLRRVAGTPCGAVFGQRLDETVAYEQKFGPHLVPILVEKCA
      120       130       140       150       160       170        

       140       150       160       170       180       190       
pF1KB9 DFIRERGLTEEGLFRMPGQANLVRDLQDSFDCGEKPLFDSTTDVHTVASLLKLYLRELPE
       .:: :.: .:::.::.::: :::..:.:.:: ::.: ::  :::::::::::::::.:::
CCDS54 EFILEHGRNEEGIFRLPGQDNLVKQLRDAFDAGERPSFDRDTDVHTVASLLKLYLRDLPE
      180       190       200       210       220       230        

       200       210       220       230       240       250       
pF1KB9 PVVPFARYEDFLSCAQLLTKDEGEGTLELAKQVSNLPQANYNLLRYICKFLDEVQAYSNV
       ::::...:: :: :.:: . ::...  :: ::.: ::. ::.:: :::.:: :.:    :
CCDS54 PVVPWSQYEGFLLCGQLTNADEAKAQQELMKQLSILPRDNYSLLSYICRFLHEIQLNCAV
      240       250       260       270       280       290        

       260       270       280       290       300         310     
pF1KB9 NKMSVQNLATVFGPNILRPQVEDPVTIMEGTSLVQHLMTVLIRKHSQLF--TAPVPEGPT
       :::::.:::::.: :..: .::::..::.::  .:..::..:: :  ::  .  .: .: 
CCDS54 NKMSVDNLATVIGVNLIRSKVEDPAVIMRGTPQIQRVMTMMIRDHEVLFPKSKDIPLSPP
      300       310       320       330       340       350        

         320             330       340       350           360     
pF1KB9 SPRGGLQCA------VGWGSEEVTRDSQGEPGGPGLPAHRTSSLDGA----AVAVLSRTA
       . ..  . :      ::: . :  : :. .  .       :.:  :     :    :  .
CCDS54 AQKNDPKKAPVARSSVGWDATEDLRISRTDSFSSMTSDSDTTSPTGQQPSDAFPEDSSKV
      360       370       380       390       400       410        

          370        380       390       400       410       420   
pF1KB9 PT-GPGS-RCSPGKKVQTLPSWKSSFRQPRSLSGSPKGGGSSLEVPIISSGGNWLMNGLS
       :   ::. . .  :..::::. :  :     :... .:..:: .. :...   :  .. .
CCDS54 PREKPGDWKMQSRKRTQTLPNRKC-F-----LTSAFQGANSS-KMEIFKNEF-WSPSSEA
      420       430       440             450        460        470

            430       440       450       460       470       480  
pF1KB9 SL-RGHRRASSGDRLKDSGSVQRLSTYDNVPAPGLVPGIPSVASMAWSGASSSESSVGGS
       .  .::::. : : :.. .. :: :::::::.   .:: :.  . : :  :.. .: : .
CCDS54 KAGEGHRRTMSQD-LRQLSDSQRTSTYDNVPS---LPGSPGEEASALS--SQACDSKGDT
              480        490       500          510         520    

            490       500       510       520       530       540  
pF1KB9 LSSCTACRASDSSARSSLHTDWALEPSPLPSSSEDPKSLDLDHSMDEAGAGASNSEPSEP
       :.:                          :.:              :.: : .::   : 
CCDS54 LAS--------------------------PNS--------------ETGPGKKNSGEEEI
                                    530                     540    

            550       560       570       580       590       600  
pF1KB9 DSPTREHARRSEALQGLVTELRAELCRQRTEYERSVKRIEEGSADLRKRMSRLEEELDQE
       ::           :: .: ::: :.  :.  ::...: .:. . :.  .. ::.:::..:
CCDS54 DS-----------LQRMVQELRKEIETQKQMYEEQIKNLEKENYDVWAKVVRLNEELEKE
                     550       560       570       580       590   

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pF1KB9 KKKYIMLEIKLRNSERAREDAERRNQLLQREMEEFFSTLGSLTVGAKGARAPK
       :::   :::.::: ::.:::.:.::. :..:..:: ...              
CCDS54 KKKSAALEISLRNMERSREDVEKRNKALEEEVKEFVKSMKEPKTEA       
           600       610       620       630                




655 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 23:41:12 2016 done: Thu Nov  3 23:41:13 2016
 Total Scan time:  4.430 Total Display time:  0.170

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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