Result of FASTA (ccds) for pF1KB9449
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9449, 465 aa
  1>>>pF1KB9449 465 - 465 aa - 465 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0782+/-0.0007; mu= 10.3519+/- 0.042
 mean_var=114.9815+/-22.720, 0's: 0 Z-trim(113.8): 27  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.119608
 statistics sampled from 14381 (14405) to 14381 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.776), E-opt: 0.2 (0.442), width:  16
 Scan time:  2.860

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS45996.1 NFIX gene_id:4784|Hs108|chr19          ( 441) 3003 528.6 4.9e-150
CCDS59359.1 NFIX gene_id:4784|Hs108|chr19          ( 433) 2935 516.9 1.7e-146
CCDS53322.1 NFIA gene_id:4774|Hs108|chr1           ( 554) 2083 369.9 3.7e-102
CCDS615.1 NFIA gene_id:4774|Hs108|chr1             ( 498) 2043 363.0  4e-100
CCDS44156.1 NFIA gene_id:4774|Hs108|chr1           ( 509) 2043 363.0 4.1e-100
CCDS53321.1 NFIA gene_id:4774|Hs108|chr1           ( 501) 1984 352.8 4.7e-97
CCDS59331.1 NFIC gene_id:4782|Hs108|chr19          ( 439) 1634 292.4 6.4e-79
CCDS12107.1 NFIC gene_id:4782|Hs108|chr19          ( 428) 1616 289.3 5.4e-78
CCDS59330.1 NFIC gene_id:4782|Hs108|chr19          ( 508) 1617 289.5 5.5e-78
CCDS55291.1 NFIB gene_id:4781|Hs108|chr9           ( 494) 1610 288.3 1.2e-77
CCDS6474.1 NFIB gene_id:4781|Hs108|chr9            ( 420) 1599 286.3   4e-77
CCDS58640.1 NFIC gene_id:4782|Hs108|chr19          ( 430) 1587 284.3 1.7e-76
CCDS45914.1 NFIC gene_id:4782|Hs108|chr19          ( 499) 1570 281.4 1.5e-75
CCDS55292.1 NFIB gene_id:4781|Hs108|chr9           ( 446) 1564 280.3 2.8e-75


>>CCDS45996.1 NFIX gene_id:4784|Hs108|chr19               (441 aa)
 initn: 2700 init1: 2700 opt: 3003  Z-score: 2807.0  bits: 528.6 E(32554): 4.9e-150
Smith-Waterman score: 3003; 99.8% identity (99.8% similar) in 441 aa overlap (26-465:1-441)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MLPACRLPGLPSPRPAAALPPGRPAMYSPYCLTQDEFHPFIEALLPHVRAFSYTWFNLQA
                                :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45                          MYSPYCLTQDEFHPFIEALLPHVRAFSYTWFNLQA
                                        10        20        30     

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 RKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLGEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRPEFREDFVLTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLGEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRPEFREDFVLTI
          40        50        60        70        80        90     

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 TGKKPPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLYKSPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TGKKPPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLYKSPQ
         100       110       120       130       140       150     

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 CSNPGLCVQPHHIGVTIKELDLYLAYFVHTPESGQSDSSNQQGDADIKPLPNGHLSFQDC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CSNPGLCVQPHHIGVTIKELDLYLAYFVHTPESGQSDSSNQQGDADIKPLPNGHLSFQDC
         160       170       180       190       200       210     

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 FVTSGVWNVTELVRVSQTPVATASGPNFSLADLESPSYYNINQVTLGRRSITSPPSTSTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FVTSGVWNVTELVRVSQTPVATASGPNFSLADLESPSYYNINQVTLGRRSITSPPSTSTT
         220       230       240       250       260       270     

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 KRPKSIDDSEMESPVDDVFYPGTGRSPAAGSSQSSGWPNDVDAGPASLKKSGKLDFCSAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KRPKSIDDSEMESPVDDVFYPGTGRSPAAGSSQSSGWPNDVDAGPASLKKSGKLDFCSAL
         280       290       300       310       320       330     

              370       380       390       400       410          
pF1KB9 SSQGSSPRMAFTHHPLPVLAGVRPGSPRATASALHFPSTSIIQQSSPYFTHPTIRYHHH-
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: 
CCDS45 SSQGSSPRMAFTHHPLPVLAGVRPGSPRATASALHFPSTSIIQQSSPYFTHPTIRYHHHH
         340       350       360       370       380       390     

     420       430       440       450       460     
pF1KB9 GQDSLKEFVQFVCSDGSGQATGQHSQRQAPPLPTGLSASDPGTATF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GQDSLKEFVQFVCSDGSGQATGQHSQRQAPPLPTGLSASDPGTATF
         400       410       420       430       440 

>>CCDS59359.1 NFIX gene_id:4784|Hs108|chr19               (433 aa)
 initn: 2632 init1: 2632 opt: 2935  Z-score: 2743.8  bits: 516.9 E(32554): 1.7e-146
Smith-Waterman score: 2935; 99.8% identity (99.8% similar) in 432 aa overlap (35-465:2-433)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KB9 CRLPGLPSPRPAAALPPGRPAMYSPYCLTQDEFHPFIEALLPHVRAFSYTWFNLQARKRK
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59                              MDEFHPFIEALLPHVRAFSYTWFNLQARKRK
                                            10        20        30 

           70        80        90       100       110       120    
pF1KB9 YFKKHEKRMSKDEERAVKDELLGEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRPEFREDFVLTITGKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 YFKKHEKRMSKDEERAVKDELLGEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRPEFREDFVLTITGKK
              40        50        60        70        80        90 

          130       140       150       160       170       180    
pF1KB9 PPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLYKSPQCSNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLYKSPQCSNP
             100       110       120       130       140       150 

          190       200       210       220       230       240    
pF1KB9 GLCVQPHHIGVTIKELDLYLAYFVHTPESGQSDSSNQQGDADIKPLPNGHLSFQDCFVTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GLCVQPHHIGVTIKELDLYLAYFVHTPESGQSDSSNQQGDADIKPLPNGHLSFQDCFVTS
             160       170       180       190       200       210 

          250       260       270       280       290       300    
pF1KB9 GVWNVTELVRVSQTPVATASGPNFSLADLESPSYYNINQVTLGRRSITSPPSTSTTKRPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GVWNVTELVRVSQTPVATASGPNFSLADLESPSYYNINQVTLGRRSITSPPSTSTTKRPK
             220       230       240       250       260       270 

          310       320       330       340       350       360    
pF1KB9 SIDDSEMESPVDDVFYPGTGRSPAAGSSQSSGWPNDVDAGPASLKKSGKLDFCSALSSQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SIDDSEMESPVDDVFYPGTGRSPAAGSSQSSGWPNDVDAGPASLKKSGKLDFCSALSSQG
             280       290       300       310       320       330 

          370       380       390       400       410        420   
pF1KB9 SSPRMAFTHHPLPVLAGVRPGSPRATASALHFPSTSIIQQSSPYFTHPTIRYHHH-GQDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS59 SSPRMAFTHHPLPVLAGVRPGSPRATASALHFPSTSIIQQSSPYFTHPTIRYHHHHGQDS
             340       350       360       370       380       390 

           430       440       450       460     
pF1KB9 LKEFVQFVCSDGSGQATGQHSQRQAPPLPTGLSASDPGTATF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LKEFVQFVCSDGSGQATGQHSQRQAPPLPTGLSASDPGTATF
             400       410       420       430   

>>CCDS53322.1 NFIA gene_id:4774|Hs108|chr1                (554 aa)
 initn: 1441 init1: 1361 opt: 2083  Z-score: 1947.6  bits: 369.9 E(32554): 3.7e-102
Smith-Waterman score: 2083; 70.1% identity (83.4% similar) in 465 aa overlap (11-460:30-486)

                                  10        20         30        40
pF1KB9                    MLPACRLPGLPSPRPAAALPPGRPA-MYSPYCLTQDEFHPF
                                    ::: :  .  : ::: :::: ::::::::::
CCDS53 MQMCRPASSSVLYVPTRWPGGCGATWQSCPSPPPRRTRIPQRPAVMYSPLCLTQDEFHPF
               10        20        30        40        50        60

               50        60        70        80        90       100
pF1KB9 IEALLPHVRAFSYTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLGEKPEIKQKWASRL
       :::::::::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::.::::.::::::::
CCDS53 IEALLPHVRAFAYTWFNLQARKRKYFKKHEKRMSKEEERAVKDELLSEKPEVKQKWASRL
               70        80        90       100       110       120

              110       120       130       140       150       160
pF1KB9 LAKLRKDIRPEFREDFVLTITGKKPPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVI
       :::::::::::.:::::::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS53 LAKLRKDIRPEYREDFVLTVTGKKPPCCVLSNPDQKGKMRRIDCLRQADKVWRLDLVMVI
              130       140       150       160       170       180

              170       180       190       200       210       220
pF1KB9 LFKGIPLESTDGERLYKSPQCSNPGLCVQPHHIGVTIKELDLYLAYFVHTPESGQSDSSN
       ::::::::::::::: :::::::::::::::::::..::::::::::::. .:.::.: .
CCDS53 LFKGIPLESTDGERLVKSPQCSNPGLCVQPHHIGVSVKELDLYLAYFVHAADSSQSESPS
              190       200       210       220       230       240

              230        240       250       260       270         
pF1KB9 QQGDADIKPLP-NGHLSFQDCFVTSGVWNVTELVRVSQTPVATASGPNFSLADLESPSYY
       : .:::::  : ::::.::: ::::::..:::::::::::.:...::::::.:::: :::
CCDS53 QPSDADIKDQPENGHLGFQDSFVTSGVFSVTELVRVSQTPIAAGTGPNFSLSDLESSSYY
              250       260       270       280       290       300

     280       290       300       310       320       330         
pF1KB9 NINQVTLGRRSITSPPSTSTTKRPKSIDDSEMESPVDDVFYPGTGRSPAAGSSQSSGWPN
       ...  .. :::. :  :::.::: ::..: ::.:: .. :: : ::::..:: ::::: .
CCDS53 SMSPGAM-RRSLPSTSSTSSTKRLKSVED-EMDSPGEEPFYTGQGRSPGSGS-QSSGW-H
               310       320        330       340       350        

     340          350       360       370       380       390      
pF1KB9 DVDAG---PASLKKSGKLDFCSALSSQGSSPRMAFTHHPLPVLAGVRPGSPRATASALHF
       .:. :   :..:::: :  : :   :: ::   :::.:  ::..: : .::.:: :.:::
CCDS53 EVEPGMPSPTTLKKSEKSGFSSPSPSQTSSLGTAFTQHHRPVITGPR-ASPHATPSTLHF
        360       370       380       390       400        410     

        400       410       420       430       440                
pF1KB9 PSTSIIQQSSPYFTHPTIRYHHHGQDSLKEFVQFVCSDGSGQATGQ--------HSQRQA
       :.. :::: .:::.::.::::   :..::::::.:: : .:: .::         :: ..
CCDS53 PTSPIIQQPGPYFSHPAIRYHP--QETLKEFVQLVCPD-AGQQAGQVGFLNPNGSSQGKV
         420       430         440       450        460       470  

        450       460                                              
pF1KB9 --PPLPTGLSASDPGTATF                                         
         : ::: .    :                                              
CCDS53 HNPFLPTPMLPPPPPPPMARPVPLPVPDTKPPTTSTEGGAASPTSPTYSTPSTSPANRFV
            480       490       500       510       520       530  

>>CCDS615.1 NFIA gene_id:4774|Hs108|chr1                  (498 aa)
 initn: 1441 init1: 1361 opt: 2043  Z-score: 1911.0  bits: 363.0 E(32554): 4e-100
Smith-Waterman score: 2043; 70.8% identity (84.4% similar) in 449 aa overlap (26-460:1-441)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MLPACRLPGLPSPRPAAALPPGRPAMYSPYCLTQDEFHPFIEALLPHVRAFSYTWFNLQA
                                :::: :::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS61                          MYSPLCLTQDEFHPFIEALLPHVRAFAYTWFNLQA
                                        10        20        30     

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 RKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLGEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRPEFREDFVLTI
       :::::::::::::::.::::::::::.::::.:::::::::::::::::::.:::::::.
CCDS61 RKRKYFKKHEKRMSKEEERAVKDELLSEKPEVKQKWASRLLAKLRKDIRPEYREDFVLTV
          40        50        60        70        80        90     

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 TGKKPPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLYKSPQ
       ::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS61 TGKKPPCCVLSNPDQKGKMRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLVKSPQ
         100       110       120       130       140       150     

              190       200       210       220       230          
pF1KB9 CSNPGLCVQPHHIGVTIKELDLYLAYFVHTPESGQSDSSNQQGDADIKPLP-NGHLSFQD
       :::::::::::::::..::::::::::::. .:.::.: .: .:::::  : ::::.:::
CCDS61 CSNPGLCVQPHHIGVSVKELDLYLAYFVHAADSSQSESPSQPSDADIKDQPENGHLGFQD
         160       170       180       190       200       210     

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB9 CFVTSGVWNVTELVRVSQTPVATASGPNFSLADLESPSYYNINQVTLGRRSITSPPSTST
        ::::::..:::::::::::.:...::::::.:::: :::...  .. :::. :  :::.
CCDS61 SFVTSGVFSVTELVRVSQTPIAAGTGPNFSLSDLESSSYYSMSPGAM-RRSLPSTSSTSS
         220       230       240       250       260        270    

     300       310       320       330       340          350      
pF1KB9 TKRPKSIDDSEMESPVDDVFYPGTGRSPAAGSSQSSGWPNDVDAG---PASLKKSGKLDF
       ::: ::..: ::.:: .. :: : ::::..:: ::::: ..:. :   :..:::: :  :
CCDS61 TKRLKSVED-EMDSPGEEPFYTGQGRSPGSGS-QSSGW-HEVEPGMPSPTTLKKSEKSGF
          280        290       300        310        320       330 

        360       370       380       390       400       410      
pF1KB9 CSALSSQGSSPRMAFTHHPLPVLAGVRPGSPRATASALHFPSTSIIQQSSPYFTHPTIRY
        :   :: ::   :::.:  ::..: : .::.:: :.::::.. :::: .:::.::.:::
CCDS61 SSPSPSQTSSLGTAFTQHHRPVITGPR-ASPHATPSTLHFPTSPIIQQPGPYFSHPAIRY
             340       350        360       370       380       390

        420       430       440                 450       460      
pF1KB9 HHHGQDSLKEFVQFVCSDGSGQATGQ--------HSQRQA--PPLPTGLSASDPGTATF 
       :   :..::::::.:: : .:: .::         :: ..  : ::: .    :      
CCDS61 HP--QETLKEFVQLVCPD-AGQQAGQVGFLNPNGSSQGKVHNPFLPTPMLPPPPPPPMAR
                400        410       420       430       440       

CCDS61 PVPLPVPDTKPPTTSTEGGAASPTSPILVPGIKVAASHHPPDRPPDPFSTL
       450       460       470       480       490        

>>CCDS44156.1 NFIA gene_id:4774|Hs108|chr1                (509 aa)
 initn: 1441 init1: 1361 opt: 2043  Z-score: 1910.8  bits: 363.0 E(32554): 4.1e-100
Smith-Waterman score: 2043; 70.8% identity (84.4% similar) in 449 aa overlap (26-460:1-441)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MLPACRLPGLPSPRPAAALPPGRPAMYSPYCLTQDEFHPFIEALLPHVRAFSYTWFNLQA
                                :::: :::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS44                          MYSPLCLTQDEFHPFIEALLPHVRAFAYTWFNLQA
                                        10        20        30     

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 RKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLGEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRPEFREDFVLTI
       :::::::::::::::.::::::::::.::::.:::::::::::::::::::.:::::::.
CCDS44 RKRKYFKKHEKRMSKEEERAVKDELLSEKPEVKQKWASRLLAKLRKDIRPEYREDFVLTV
          40        50        60        70        80        90     

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 TGKKPPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLYKSPQ
       ::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS44 TGKKPPCCVLSNPDQKGKMRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLVKSPQ
         100       110       120       130       140       150     

              190       200       210       220       230          
pF1KB9 CSNPGLCVQPHHIGVTIKELDLYLAYFVHTPESGQSDSSNQQGDADIKPLP-NGHLSFQD
       :::::::::::::::..::::::::::::. .:.::.: .: .:::::  : ::::.:::
CCDS44 CSNPGLCVQPHHIGVSVKELDLYLAYFVHAADSSQSESPSQPSDADIKDQPENGHLGFQD
         160       170       180       190       200       210     

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB9 CFVTSGVWNVTELVRVSQTPVATASGPNFSLADLESPSYYNINQVTLGRRSITSPPSTST
        ::::::..:::::::::::.:...::::::.:::: :::...  .. :::. :  :::.
CCDS44 SFVTSGVFSVTELVRVSQTPIAAGTGPNFSLSDLESSSYYSMSPGAM-RRSLPSTSSTSS
         220       230       240       250       260        270    

     300       310       320       330       340          350      
pF1KB9 TKRPKSIDDSEMESPVDDVFYPGTGRSPAAGSSQSSGWPNDVDAG---PASLKKSGKLDF
       ::: ::..: ::.:: .. :: : ::::..:: ::::: ..:. :   :..:::: :  :
CCDS44 TKRLKSVED-EMDSPGEEPFYTGQGRSPGSGS-QSSGW-HEVEPGMPSPTTLKKSEKSGF
          280        290       300        310        320       330 

        360       370       380       390       400       410      
pF1KB9 CSALSSQGSSPRMAFTHHPLPVLAGVRPGSPRATASALHFPSTSIIQQSSPYFTHPTIRY
        :   :: ::   :::.:  ::..: : .::.:: :.::::.. :::: .:::.::.:::
CCDS44 SSPSPSQTSSLGTAFTQHHRPVITGPR-ASPHATPSTLHFPTSPIIQQPGPYFSHPAIRY
             340       350        360       370       380       390

        420       430       440                 450       460      
pF1KB9 HHHGQDSLKEFVQFVCSDGSGQATGQ--------HSQRQA--PPLPTGLSASDPGTATF 
       :   :..::::::.:: : .:: .::         :: ..  : ::: .    :      
CCDS44 HP--QETLKEFVQLVCPD-AGQQAGQVGFLNPNGSSQGKVHNPFLPTPMLPPPPPPPMAR
                400        410       420       430       440       

CCDS44 PVPLPVPDTKPPTTSTEGGAASPTSPTYSTPSTSPANRFVSVGPRDPSFVNIPQQTQSWY
       450       460       470       480       490       500       

>>CCDS53321.1 NFIA gene_id:4774|Hs108|chr1                (501 aa)
 initn: 1382 init1: 1302 opt: 1984  Z-score: 1855.9  bits: 352.8 E(32554): 4.7e-97
Smith-Waterman score: 1984; 70.5% identity (84.3% similar) in 440 aa overlap (35-460:2-433)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KB9 CRLPGLPSPRPAAALPPGRPAMYSPYCLTQDEFHPFIEALLPHVRAFSYTWFNLQARKRK
                                     :::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS53                              MDEFHPFIEALLPHVRAFAYTWFNLQARKRK
                                            10        20        30 

           70        80        90       100       110       120    
pF1KB9 YFKKHEKRMSKDEERAVKDELLGEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRPEFREDFVLTITGKK
       :::::::::::.::::::::::.::::.:::::::::::::::::::.:::::::.::::
CCDS53 YFKKHEKRMSKEEERAVKDELLSEKPEVKQKWASRLLAKLRKDIRPEYREDFVLTVTGKK
              40        50        60        70        80        90 

          130       140       150       160       170       180    
pF1KB9 PPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLYKSPQCSNP
       ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS53 PPCCVLSNPDQKGKMRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLVKSPQCSNP
             100       110       120       130       140       150 

          190       200       210       220       230        240   
pF1KB9 GLCVQPHHIGVTIKELDLYLAYFVHTPESGQSDSSNQQGDADIKPLP-NGHLSFQDCFVT
       :::::::::::..::::::::::::. .:.::.: .: .:::::  : ::::.::: :::
CCDS53 GLCVQPHHIGVSVKELDLYLAYFVHAADSSQSESPSQPSDADIKDQPENGHLGFQDSFVT
             160       170       180       190       200       210 

           250       260       270       280       290       300   
pF1KB9 SGVWNVTELVRVSQTPVATASGPNFSLADLESPSYYNINQVTLGRRSITSPPSTSTTKRP
       :::..:::::::::::.:...::::::.:::: :::...  .. :::. :  :::.::: 
CCDS53 SGVFSVTELVRVSQTPIAAGTGPNFSLSDLESSSYYSMSPGAM-RRSLPSTSSTSSTKRL
             220       230       240       250        260       270

           310       320       330       340          350       360
pF1KB9 KSIDDSEMESPVDDVFYPGTGRSPAAGSSQSSGWPNDVDAG---PASLKKSGKLDFCSAL
       ::..: ::.:: .. :: : ::::..:: ::::: ..:. :   :..:::: :  : :  
CCDS53 KSVED-EMDSPGEEPFYTGQGRSPGSGS-QSSGW-HEVEPGMPSPTTLKKSEKSGFSSPS
               280       290        300        310       320       

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 SSQGSSPRMAFTHHPLPVLAGVRPGSPRATASALHFPSTSIIQQSSPYFTHPTIRYHHHG
        :: ::   :::.:  ::..: : .::.:: :.::::.. :::: .:::.::.::::   
CCDS53 PSQTSSLGTAFTQHHRPVITGPR-ASPHATPSTLHFPTSPIIQQPGPYFSHPAIRYH--P
       330       340       350        360       370       380      

              430       440                 450       460          
pF1KB9 QDSLKEFVQFVCSDGSGQATGQ--------HSQRQA--PPLPTGLSASDPGTATF     
       :..::::::.:: : .:: .::         :: ..  : ::: .    :          
CCDS53 QETLKEFVQLVCPD-AGQQAGQVGFLNPNGSSQGKVHNPFLPTPMLPPPPPPPMARPVPL
          390        400       410       420       430       440   

CCDS53 PVPDTKPPTTSTEGGAASPTSPTYSTPSTSPANRFVSVGPRDPSFVNIPQQTQSWYLG
           450       460       470       480       490       500 

>>CCDS59331.1 NFIC gene_id:4782|Hs108|chr19               (439 aa)
 initn: 1496 init1: 1173 opt: 1634  Z-score: 1530.4  bits: 292.4 E(32554): 6.4e-79
Smith-Waterman score: 1634; 61.2% identity (77.7% similar) in 443 aa overlap (26-453:1-434)

               10        20         30        40        50         
pF1KB9 MLPACRLPGLPSPRPAAALPPGRPAMYS-PYCLTQDEFHPFIEALLPHVRAFSYTWFNLQ
                                ::: : :::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS59                          MYSSPLCLTQDEFHPFIEALLPHVRAFAYTWFNLQ
                                        10        20        30     

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB9 ARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLGEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRPEFREDFVLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::: ::::::.
CCDS59 ARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLGEKPEVKQKWASRLLAKLRKDIRPECREDFVLS
          40        50        60        70        80        90     

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB9 ITGKKPPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLYKSP
       ::::: : :::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :. 
CCDS59 ITGKKAPGCVLSNPDQKGKMRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLVKAA
         100       110       120       130       140       150     

     180       190       200       210         220        230      
pF1KB9 QCSNPGLCVQPHHIGVTIKELDLYLAYFVHTPESGQSDS--SNQQGDA-DIKPLPNGHLS
       ::..: ::::::::::..:::::::::::.  .. :: :  ... .:  : ::.     .
CCDS59 QCGHPVLCVQPHHIGVAVKELDLYLAYFVRERDAEQSGSPRTGMGSDQEDSKPITLDTTD
         160       170       180       190       200       210     

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB9 FQDCFVTSGVWNVTELVRVSQTPVATASGPNFSLADLESPSYYNINQVTLGRRSITSPPS
       ::. ::::::..::::..::.:::.:..::::::..:..   :..: .. : :      :
CCDS59 FQESFVTSGVFSVTELIQVSRTPVVTGTGPNFSLGELQGHLAYDLNPASTGLRRTLPSTS
         220       230       240       250       260       270     

        300       310       320         330       340       350    
pF1KB9 TSTTKRPKSIDDSEMESPVDDVFYPGTGR--SPAAGSSQSSGWPNDVDAGPASLKKSGKL
       .: .:: ::   . ::  ::    ::     ::.. .:.: .: .:...: .:  :. ..
CCDS59 SSGSKRHKS---GSMEEDVDT--SPGGDYYTSPSSPTSSSRNWTEDMEGGISSPVKKTEM
         280          290         300       310       320       330

             360       370        380       390         400        
pF1KB9 D---FCSALSSQGSSPRMA-FTHHPLPVLAGVRPGSPRAT--ASALHFPSTSIIQQS-SP
       :   : :   :  .:::.. ::.:  ::.: :. :  :.   .::::::.:::. :. : 
CCDS59 DKSPFNSP--SPQDSPRLSSFTQHHRPVIA-VHSGIARSPHPSSALHFPTTSILPQTAST
                340       350        360       370       380       

       410         420       430       440       450       460     
pF1KB9 YFTHPTIRY--HHHGQDSLKEFVQFVCSDGSGQATGQHSQRQAPPLPTGLSASDPGTATF
       :: : .:::  : . :: ::..:...: : ..:  :  . : . :: :            
CCDS59 YFPHTAIRYPPHLNPQDPLKDLVSLAC-DPASQQPGPPTLRPTRPLQTVPLWD       
       390       400       410        420       430                

>>CCDS12107.1 NFIC gene_id:4782|Hs108|chr19               (428 aa)
 initn: 1477 init1: 1154 opt: 1616  Z-score: 1513.8  bits: 289.3 E(32554): 5.4e-78
Smith-Waterman score: 1616; 62.2% identity (78.9% similar) in 426 aa overlap (26-438:1-420)

               10        20         30        40        50         
pF1KB9 MLPACRLPGLPSPRPAAALPPGRPAMYS-PYCLTQDEFHPFIEALLPHVRAFSYTWFNLQ
                                ::: : :::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS12                          MYSSPLCLTQDEFHPFIEALLPHVRAFAYTWFNLQ
                                        10        20        30     

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB9 ARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLGEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRPEFREDFVLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::: ::::::.
CCDS12 ARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLGEKPEVKQKWASRLLAKLRKDIRPECREDFVLS
          40        50        60        70        80        90     

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB9 ITGKKPPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLYKSP
       ::::: : :::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :. 
CCDS12 ITGKKAPGCVLSNPDQKGKMRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLVKAA
         100       110       120       130       140       150     

     180       190       200       210         220        230      
pF1KB9 QCSNPGLCVQPHHIGVTIKELDLYLAYFVHTPESGQSDS--SNQQGDA-DIKPLPNGHLS
       ::..: ::::::::::..:::::::::::.  .. :: :  ... .:  : ::.     .
CCDS12 QCGHPVLCVQPHHIGVAVKELDLYLAYFVRERDAEQSGSPRTGMGSDQEDSKPITLDTTD
         160       170       180       190       200       210     

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB9 FQDCFVTSGVWNVTELVRVSQTPVATASGPNFSLADLESPSYYNINQVTLGRRSITSPPS
       ::. ::::::..::::..::.:::.:..::::::..:..   :..: .. : :      :
CCDS12 FQESFVTSGVFSVTELIQVSRTPVVTGTGPNFSLGELQGHLAYDLNPASTGLRRTLPSTS
         220       230       240       250       260       270     

        300       310       320         330       340       350    
pF1KB9 TSTTKRPKSIDDSEMESPVDDVFYPGTGR--SPAAGSSQSSGWPNDVDAGPASLKKSGKL
       .: .:: ::   . ::  ::    ::     ::.. .:.: .: .:...: .:  :. ..
CCDS12 SSGSKRHKS---GSMEEDVDT--SPGGDYYTSPSSPTSSSRNWTEDMEGGISSPVKKTEM
         280          290         300       310       320       330

          360        370        380       390         400          
pF1KB9 DFCSALS-SQGSSPRMA-FTHHPLPVLAGVRPGSPRAT--ASALHFPSTSIIQQS-SPYF
       :     : :  .:::.. ::.:  ::.: :. :  :.   .::::::.:::. :. : ::
CCDS12 DKSPFNSPSPQDSPRLSSFTQHHRPVIA-VHSGIARSPHPSSALHFPTTSILPQTASTYF
              340       350        360       370       380         

     410         420       430       440       450       460     
pF1KB9 THPTIRY--HHHGQDSLKEFVQFVCSDGSGQATGQHSQRQAPPLPTGLSASDPGTATF
        : .:::  : . :: ::..:...:. .: :                           
CCDS12 PHTAIRYPPHLNPQDPLKDLVSLACDPASQQPGPSWYLG                   
     390       400       410       420                           

>>CCDS59330.1 NFIC gene_id:4782|Hs108|chr19               (508 aa)
 initn: 1477 init1: 1154 opt: 1617  Z-score: 1513.6  bits: 289.5 E(32554): 5.5e-78
Smith-Waterman score: 1627; 59.7% identity (75.8% similar) in 467 aa overlap (26-462:1-458)

               10        20         30        40        50         
pF1KB9 MLPACRLPGLPSPRPAAALPPGRPAMYS-PYCLTQDEFHPFIEALLPHVRAFSYTWFNLQ
                                ::: : :::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS59                          MYSSPLCLTQDEFHPFIEALLPHVRAFAYTWFNLQ
                                        10        20        30     

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB9 ARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLGEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRPEFREDFVLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::: ::::::.
CCDS59 ARKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLGEKPEVKQKWASRLLAKLRKDIRPECREDFVLS
          40        50        60        70        80        90     

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB9 ITGKKPPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLYKSP
       ::::: : :::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :. 
CCDS59 ITGKKAPGCVLSNPDQKGKMRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLVKAA
         100       110       120       130       140       150     

     180       190       200       210         220        230      
pF1KB9 QCSNPGLCVQPHHIGVTIKELDLYLAYFVHTPESGQSDS--SNQQGDA-DIKPLPNGHLS
       ::..: ::::::::::..:::::::::::.  .. :: :  ... .:  : ::.     .
CCDS59 QCGHPVLCVQPHHIGVAVKELDLYLAYFVRERDAEQSGSPRTGMGSDQEDSKPITLDTTD
         160       170       180       190       200       210     

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB9 FQDCFVTSGVWNVTELVRVSQTPVATASGPNFSLADLESPSYYNINQVTLGRRSITSPPS
       ::. ::::::..::::..::.:::.:..::::::..:..   :..: .. : :      :
CCDS59 FQESFVTSGVFSVTELIQVSRTPVVTGTGPNFSLGELQGHLAYDLNPASTGLRRTLPSTS
         220       230       240       250       260       270     

        300       310       320         330       340       350    
pF1KB9 TSTTKRPKSIDDSEMESPVDDVFYPGTGR--SPAAGSSQSSGWPNDVDAGPASLKKSGKL
       .: .:: ::   . ::  ::    ::     ::.. .:.: .: .:...: .:  :. ..
CCDS59 SSGSKRHKS---GSMEEDVDTS--PGGDYYTSPSSPTSSSRNWTEDMEGGISSPVKKTEM
         280          290         300       310       320       330

             360       370        380       390         400        
pF1KB9 D---FCSALSSQGSSPRMA-FTHHPLPVLAGVRPGSPRAT--ASALHFPSTSIIQQS-SP
       :   : :   :  .:::.. ::.:  ::.: :. :  :.   .::::::.:::. :. : 
CCDS59 DKSPFNSP--SPQDSPRLSSFTQHHRPVIA-VHSGIARSPHPSSALHFPTTSILPQTAST
                340       350        360       370       380       

       410         420       430            440               450  
pF1KB9 YFTHPTIRY--HHHGQDSLKEFVQFVCSDGSGQ-----ATGQ-----H---SQRQAPPLP
       :: : .:::  : . :: ::..:...:. .: :     ..::     :   .:  ::: :
CCDS59 YFPHTAIRYPPHLNPQDPLKDLVSLACDPASQQPGPLNGSGQLKMPSHCLSAQMLAPP-P
       390       400       410       420       430       440       

              460                                                  
pF1KB9 TGLS--ASDPGTATF                                             
        ::   :  :.:                                                
CCDS59 PGLPRLALPPATKPATTSEGGATSPTSPSYSPPDTSPANRSFVGLGPRDPAGIYQAQSWY
        450       460       470       480       490       500      

>>CCDS55291.1 NFIB gene_id:4781|Hs108|chr9                (494 aa)
 initn: 1323 init1: 1202 opt: 1610  Z-score: 1507.2  bits: 288.3 E(32554): 1.2e-77
Smith-Waterman score: 1636; 61.5% identity (77.6% similar) in 447 aa overlap (26-451:2-434)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MLPACRLPGLPSPRPAAALPPGRPAMYSPYCLTQDEFHPFIEALLPHVRAFSYTWFNLQA
                                :::: ::::::::::::::::::::..::::::::
CCDS55                         MMYSPICLTQDEFHPFIEALLPHVRAIAYTWFNLQA
                                       10        20        30      

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 RKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLGEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRPEFREDFVLTI
       ::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::: :.:::::::.
CCDS55 RKRKYFKKHEKRMSKDEERAVKDELLSEKPEIKQKWASRLLAKLRKDIRQEYREDFVLTV
         40        50        60        70        80        90      

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 TGKKPPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLYKSPQ
       :::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.
CCDS55 TGKKHPCCVLSNPDQKGKIRRIDCLRQADKVWRLDLVMVILFKGIPLESTDGERLMKSPH
        100       110       120       130       140       150      

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 CSNPGLCVQPHHIGVTIKELDLYLAYFVHTPESGQSDSSNQQGDADIKPLPNGHLSFQDC
       :.::.:::::::: :..:::::.:::.:.  .:::: : ...  :   :   :.:  .: 
CCDS55 CTNPALCVQPHHITVSVKELDLFLAYYVQEQDSGQSGSPSHNDPAKNPP---GYL--EDS
        160       170       180       190       200            210 

              250       260       270        280       290         
pF1KB9 FVTSGVWNVTELVRVSQTPVATASGPNFSLADLES-PSYYNINQVTLGRRSITSPPSTST
       :: :::.::.::::::.::.. ..: :: .... : : :...:. .  .::..::::.  
CCDS55 FVKSGVFNVSELVRVSRTPITQGTGVNFPIGEIPSQPYYHDMNSGVNLQRSLSSPPSS--
             220       230       240       250       260           

     300        310        320       330        340        350     
pF1KB9 TKRPKSID-DSEME-SPVDDVFYPGTGRSPAAGSSQSSGWPN-DVD-AGPASLKKSGKLD
        ::::.:. : .:: ::. : ::: .  ::::::     : . : : ..:...::  :  
CCDS55 -KRPKTISIDENMEPSPTGD-FYP-SPSSPAAGSRT---WHERDQDMSSPTTMKKPEKPL
      270       280        290        300          310       320   

         360       370        380         390         400          
pF1KB9 FCSALSSQGSSPRMA-FTHHPLPVLAGVRPG--SPRATA--SALHFPSTSIIQQS-SPYF
       : :: : : ::::.. : .:  : . ::  .  : :.    : : ::. .:.  . : ::
CCDS55 FSSA-SPQDSSPRLSTFPQHHHPGIPGVAHSVISTRTPPPPSPLPFPTQAILPPAPSSYF
            330       340       350       360       370       380  

     410         420               430       440       450         
pF1KB9 THPTIRY--HHHGQDSLKEFV--------QFVCSDGSGQATGQHSQRQAPPLPTGLSASD
       .::::::  : . ::.::..:        :    .::::..:.   . .: :        
CCDS55 SHPTIRYPPHLNPQDTLKNYVPSYDPSSPQTSQPNGSGQVVGKVPGHFTPVLAPSPHPSA
            390       400       410       420       430       440  

     460                                                   
pF1KB9 PGTATF                                              
                                                           
CCDS55 VRPVTLSMTDTKPITTSTEAYTASGTSQANRYVGLSPRDPSFLHQQQSWYLG
            450       460       470       480       490    




465 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 23:26:52 2016 done: Thu Nov  3 23:26:52 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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