Result of FASTA (omim) for pF1KB7019
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7019, 751 aa
  1>>>pF1KB7019 751 - 751 aa - 751 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2981+/-0.000457; mu= 14.6420+/- 0.028
 mean_var=89.6150+/-17.379, 0's: 0 Z-trim(110.4): 203  B-trim: 458 in 2/54
 Lambda= 0.135483
 statistics sampled from 18473 (18706) to 18473 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.572), E-opt: 0.2 (0.219), width:  16
 Scan time: 10.960

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_006370 (OMIM: 602645) semaphorin-3C precursor [ ( 751) 5112 1010.3       0
XP_005250170 (OMIM: 602645) PREDICTED: semaphorin- ( 693) 4726 934.8       0
XP_005265439 (OMIM: 601124) PREDICTED: semaphorin- ( 754) 2862 570.5 8.7e-162
NP_001305729 (OMIM: 601124) semaphorin-3F isoform  ( 754) 2862 570.5 8.7e-162
NP_001305727 (OMIM: 601124) semaphorin-3F isoform  ( 686) 2734 545.5 2.7e-154
XP_005250168 (OMIM: 603961,614897) PREDICTED: sema ( 771) 2396 479.4 2.3e-134
XP_016867162 (OMIM: 603961,614897) PREDICTED: sema ( 771) 2396 479.4 2.3e-134
XP_006715902 (OMIM: 603961,614897) PREDICTED: sema ( 771) 2396 479.4 2.3e-134
XP_005250167 (OMIM: 603961,614897) PREDICTED: sema ( 771) 2396 479.4 2.3e-134
XP_011514036 (OMIM: 603961,614897) PREDICTED: sema ( 771) 2396 479.4 2.3e-134
NP_006071 (OMIM: 603961,614897) semaphorin-3A prec ( 771) 2396 479.4 2.3e-134
NP_004177 (OMIM: 601124) semaphorin-3F isoform 1 p ( 785) 2358 472.0 4.1e-132
XP_011532300 (OMIM: 601124) PREDICTED: semaphorin- ( 785) 2358 472.0 4.1e-132
XP_005265438 (OMIM: 601124) PREDICTED: semaphorin- ( 785) 2358 472.0 4.1e-132
NP_689967 (OMIM: 609907) semaphorin-3D precursor [ ( 777) 2348 470.1 1.6e-131
XP_016867362 (OMIM: 609907) PREDICTED: semaphorin- ( 777) 2348 470.1 1.6e-131
XP_011514262 (OMIM: 609907) PREDICTED: semaphorin- ( 777) 2348 470.1 1.6e-131
XP_006713352 (OMIM: 601124) PREDICTED: semaphorin- ( 588) 2255 451.8 3.7e-126
NP_036563 (OMIM: 214800,608166) semaphorin-3E isof ( 775) 2217 444.5  8e-124
NP_001276989 (OMIM: 601281) semaphorin-3B isoform  ( 749) 2208 442.7 2.6e-123
NP_004627 (OMIM: 601281) semaphorin-3B isoform 1 p ( 749) 2208 442.7 2.6e-123
NP_001276990 (OMIM: 601281) semaphorin-3B isoform  ( 754) 2192 439.6 2.3e-122
NP_001171600 (OMIM: 214800,608166) semaphorin-3E i ( 715) 2191 439.4 2.5e-122
NP_001005914 (OMIM: 601281) semaphorin-3B isoform  ( 748) 2191 439.4 2.6e-122
XP_011514263 (OMIM: 609907) PREDICTED: semaphorin- ( 583) 1889 380.3 1.2e-104
XP_011532302 (OMIM: 601124) PREDICTED: semaphorin- ( 512) 1348 274.5 7.6e-73
XP_006713353 (OMIM: 601124) PREDICTED: semaphorin- ( 484) 1312 267.5 9.5e-71
NP_001276991 (OMIM: 601281) semaphorin-3B isoform  ( 406) 1169 239.5 2.1e-62
NP_001276992 (OMIM: 601281) semaphorin-3B isoform  ( 406) 1169 239.5 2.1e-62
NP_064595 (OMIM: 617029) semaphorin-4B isoform 1 p ( 837) 1152 236.3 3.9e-61
NP_945119 (OMIM: 617029) semaphorin-4B isoform 1 p ( 837) 1152 236.3 3.9e-61
NP_001310960 (OMIM: 617029) semaphorin-4B isoform  ( 890) 1152 236.3 4.1e-61
NP_001135759 (OMIM: 601866) semaphorin-4D isoform  ( 738) 1132 232.4 5.3e-60
XP_011516435 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4   6e-60
XP_011516429 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4   6e-60
XP_011516436 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4   6e-60
XP_016869682 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4   6e-60
NP_006369 (OMIM: 601866) semaphorin-4D isoform 1 p ( 862) 1132 232.4   6e-60
XP_005251711 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4   6e-60
XP_011516426 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4   6e-60
XP_011516430 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4   6e-60
XP_016869686 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4   6e-60
XP_011516427 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4   6e-60
XP_016869687 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4   6e-60
XP_011516432 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4   6e-60
XP_011516425 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4   6e-60
XP_011516431 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4   6e-60
XP_016869683 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4   6e-60
XP_016869685 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4   6e-60
XP_011516433 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4   6e-60


>>NP_006370 (OMIM: 602645) semaphorin-3C precursor [Homo  (751 aa)
 initn: 5112 init1: 5112 opt: 5112  Z-score: 5402.4  bits: 1010.3 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5112; 100.0% identity (100.0% similar) in 751 aa overlap (1-751:1-751)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MAFRTICVLVGVFICSICVKGSSQPQARVYLTFDELRETKTSEYFSLSHHPLDYRILLMD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MAFRTICVLVGVFICSICVKGSSQPQARVYLTFDELRETKTSEYFSLSHHPLDYRILLMD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 EDQDRIYVGSKDHILSLNINNISQEALSVFWPASTIKVEECKMAGKDPTHGCGNFVRVIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EDQDRIYVGSKDHILSLNINNISQEALSVFWPASTIKVEECKMAGKDPTHGCGNFVRVIQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 TFNRTHLYVCGSGAFSPVCTYLNRGRRSEDQVFMIDSKCESGKGRCSFNPNVNTVSVMIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TFNRTHLYVCGSGAFSPVCTYLNRGRRSEDQVFMIDSKCESGKGRCSFNPNVNTVSVMIN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 EELFSGMYIDFMGTDAAIFRSLTKRNAVRTDQHNSKWLSEPMFVDAHVIPDGTDPNDAKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EELFSGMYIDFMGTDAAIFRSLTKRNAVRTDQHNSKWLSEPMFVDAHVIPDGTDPNDAKV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 YFFFKEKLTDNNRSTKQIHSMIARICPNDTGGLRSLVNKWTTFLKARLVCSVTDEDGPET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 YFFFKEKLTDNNRSTKQIHSMIARICPNDTGGLRSLVNKWTTFLKARLVCSVTDEDGPET
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 HFDELEDVFLLETDNPRTTLVYGIFTTSSSVFKGSAVCVYHLSDIQTVFNGPFAHKEGPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 HFDELEDVFLLETDNPRTTLVYGIFTTSSSVFKGSAVCVYHLSDIQTVFNGPFAHKEGPN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 HQLISYQGRIPYPRPGTCPGGAFTPNMRTTKEFPDDVVTFIRNHPLMYNSIYPIHKRPLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 HQLISYQGRIPYPRPGTCPGGAFTPNMRTTKEFPDDVVTFIRNHPLMYNSIYPIHKRPLI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 VRIGTDYKYTKIAVDRVNAADGRYHVLFLGTDRGTVQKVVVLPTNNSVSGELILEELEVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VRIGTDYKYTKIAVDRVNAADGRYHVLFLGTDRGTVQKVVVLPTNNSVSGELILEELEVF
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 KNHAPITTMKISSKKQQLYVSSNEGVSQVSLHRCHIYGTACADCCLARDPYCAWDGHSCS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 KNHAPITTMKISSKKQQLYVSSNEGVSQVSLHRCHIYGTACADCCLARDPYCAWDGHSCS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB7 RFYPTGKRRSRRQDVRHGNPLTQCRGFNLKAYRNAAEIVQYGVKNNTTFLECAPKSPQAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 RFYPTGKRRSRRQDVRHGNPLTQCRGFNLKAYRNAAEIVQYGVKNNTTFLECAPKSPQAS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB7 IKWLLQKDKDRRKEVKLNERIIATSQGLLIRSVQGSDQGLYHCIATENSFKQTIAKINFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 IKWLLQKDKDRRKEVKLNERIIATSQGLLIRSVQGSDQGLYHCIATENSFKQTIAKINFK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB7 VLDSEMVAVVTDKWSPWTWASSVRALPFHPKDIMGAFSHSEMQMINQYCKDTRQQHQQGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VLDSEMVAVVTDKWSPWTWASSVRALPFHPKDIMGAFSHSEMQMINQYCKDTRQQHQQGD
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750 
pF1KB7 ESQKMRGDYGKLKALINSRKSRNRRNQLPES
       :::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ESQKMRGDYGKLKALINSRKSRNRRNQLPES
              730       740       750 

>>XP_005250170 (OMIM: 602645) PREDICTED: semaphorin-3C i  (693 aa)
 initn: 4726 init1: 4726 opt: 4726  Z-score: 4995.2  bits: 934.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4726; 100.0% identity (100.0% similar) in 693 aa overlap (59-751:1-693)

       30        40        50        60        70        80        
pF1KB7 VYLTFDELRETKTSEYFSLSHHPLDYRILLMDEDQDRIYVGSKDHILSLNINNISQEALS
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005                               MDEDQDRIYVGSKDHILSLNINNISQEALS
                                             10        20        30

       90       100       110       120       130       140        
pF1KB7 VFWPASTIKVEECKMAGKDPTHGCGNFVRVIQTFNRTHLYVCGSGAFSPVCTYLNRGRRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VFWPASTIKVEECKMAGKDPTHGCGNFVRVIQTFNRTHLYVCGSGAFSPVCTYLNRGRRS
               40        50        60        70        80        90

      150       160       170       180       190       200        
pF1KB7 EDQVFMIDSKCESGKGRCSFNPNVNTVSVMINEELFSGMYIDFMGTDAAIFRSLTKRNAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EDQVFMIDSKCESGKGRCSFNPNVNTVSVMINEELFSGMYIDFMGTDAAIFRSLTKRNAV
              100       110       120       130       140       150

      210       220       230       240       250       260        
pF1KB7 RTDQHNSKWLSEPMFVDAHVIPDGTDPNDAKVYFFFKEKLTDNNRSTKQIHSMIARICPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RTDQHNSKWLSEPMFVDAHVIPDGTDPNDAKVYFFFKEKLTDNNRSTKQIHSMIARICPN
              160       170       180       190       200       210

      270       280       290       300       310       320        
pF1KB7 DTGGLRSLVNKWTTFLKARLVCSVTDEDGPETHFDELEDVFLLETDNPRTTLVYGIFTTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DTGGLRSLVNKWTTFLKARLVCSVTDEDGPETHFDELEDVFLLETDNPRTTLVYGIFTTS
              220       230       240       250       260       270

      330       340       350       360       370       380        
pF1KB7 SSVFKGSAVCVYHLSDIQTVFNGPFAHKEGPNHQLISYQGRIPYPRPGTCPGGAFTPNMR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SSVFKGSAVCVYHLSDIQTVFNGPFAHKEGPNHQLISYQGRIPYPRPGTCPGGAFTPNMR
              280       290       300       310       320       330

      390       400       410       420       430       440        
pF1KB7 TTKEFPDDVVTFIRNHPLMYNSIYPIHKRPLIVRIGTDYKYTKIAVDRVNAADGRYHVLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TTKEFPDDVVTFIRNHPLMYNSIYPIHKRPLIVRIGTDYKYTKIAVDRVNAADGRYHVLF
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       .::::. ::. :: ::::.:::::.:  ::...:::::. ::.:::::::::::::::::
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pF1KB7 VIQTFNRTHLYVCGSGAFSPVCTYLNRGRRSEDQVFMIDS-KCESGKGRCSFNPNVNTVS
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pF1KB7 DAKVYFFFKEKLTDNNRSTKQIHSMIARICPNDTGGLRSLVNKWTTFLKARLVCSVTDED
       : :.::::.:. ..  .:   ... :.::: :: ::   :::::.:::::::::::  ::
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pF1KB7 HSCSRFYPTGKRRSRRQDVRHGNPLTQCRGFNLKAYRNAAEIVQYGVKNNTTFLECAPKS
       ..:::.  ..::::::::::::::. :::::: .: .::.: ::::: ....:::: :.:
NP_001 QACSRYTASSKRRSRRQDVRHGNPIRQCRGFNSNANKNAVESVQYGVAGSAAFLECQPRS
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pF1KB7 PQASIKWLLQKDK-DRRKEVKLNERIIATSQGLLIRSVQGSDQGLYHCIATENSFKQTIA
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NP_001 PQATVKWLFQRDPGDRRREIRAEDRFLRTEQGLLLRALQLSDRGLYSCTATENNFKHVVT
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pF1KB7 KINFKVLDSEMVAVVTDKWSPWTWASSVR--ALPFHP--KDIMGAFSHSEMQMINQYCKD
       .....::  . : ..   . : . ..     : :  :  ...   ... :. .:.:::. 
NP_001 RVQLHVLGRDAVHAAL--FPPLSMSAPPPPGAGPPTPPYQELAQLLAQPEVGLIHQYCQG
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pF1KB7 TRQQHQQGDESQKMRGDYGKLKALINSRKSRNRRNQLPES
          .:     : .      .     ...: ::::.. :..
NP_001 -YWRHV--PPSPREAPGAPRSPEPQDQKKPRNRRHHPPDT
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>>NP_001305727 (OMIM: 601124) semaphorin-3F isoform 3 [H  (686 aa)
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Smith-Waterman score: 2734; 54.9% identity (82.5% similar) in 692 aa overlap (66-751:1-686)

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NP_001                               MYVGSKDYVLSLDLHDINREPLIIHWAASP
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pF1KB7 IKVEECKMAGKDPTHGCGNFVRVIQTFNRTHLYVCGSGAFSPVCTYLNRGRRSEDQVFMI
        ..::: ..::: .  ::::::.:: .:::::::::.::..:.:::.:::::..: .:..
NP_001 QRIEECVLSGKDVNGECGNFVRLIQPWNRTHLYVCGTGAYNPMCTYVNRGRRAQDYIFYL
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pF1KB7 DS-KCESGKGRCSFNPNVNTVSVMINEELFSGMYIDFMGTDAAIFRSLTKRNAVRTDQHN
       .  . :::::.: ..:...:.:..:::::..:.:::::::::::::.: :..:.::::.:
NP_001 EPERLESGKGKCPYDPKLDTASALINEELYAGVYIDFMGTDAAIFRTLGKQTAMRTDQYN
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pF1KB7 SKWLSEPMFVDAHVIPDGTDPNDAKVYFFFKEKLTDNNRSTKQIHSMIARICPNDTGGLR
       :.::..: :. :..:::... :: :.::::.:. ..  .:   ... :.::: :: ::  
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pF1KB7 SLVNKWTTFLKARLVCSVTDEDGPETHFDELEDVFLLETDNPRTTLVYGIFTTSSSVFKG
        :::::.:::::::::::  ::: :::::::.:::. .:.. :. ..:..::.:.:::.:
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pF1KB7 SAVCVYHLSDIQTVFNGPFAHKEGPNHQLISYQGRIPYPRPGTCPGGAFTPNMRTTKEFP
       :::::: ..::. :::::::::::::.: . ..:..:::::::::::.:::.:..::..:
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pF1KB7 DDVVTFIRNHPLMYNSIYPIHKRPLIVRIGTDYKYTKIAVDRVNAADGRYHVLFLGTDRG
       :.:..:.:.:::::...::...:::.:: :. :. : ::::.:.::::::.:::::::::
NP_001 DEVINFMRSHPLMYQAVYPLQRRPLVVRTGAPYRLTTIAVDQVDAADGRYEVLFLGTDRG
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pF1KB7 TVQKVVVLPTNNSVSGELILEELEVFKNHAPITTMKISSKKQQLYVSSNEGVSQVSLHRC
       :::::.::: ...   ::.:::.::::. ::. :: ::::.:::::.:  ::...:::::
NP_001 TVQKVIVLPKDDQELEELMLEEVEVFKDPAPVKTMTISSKRQQLYVASAVGVTHLSLHRC
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pF1KB7 HIYGTACADCCLARDPYCAWDGHSCSRFYPTGKRRSRRQDVRHGNPLTQCRGFNLKAYRN
       . ::.:::::::::::::::::..:::.  ..::::::::::::::. :::::: .: .:
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pF1KB7 AAEIVQYGVKNNTTFLECAPKSPQASIKWLLQKDK-DRRKEVKLNERIIATSQGLLIRSV
       :.: ::::: ....:::: :.::::..:::.:.:  :::.:.. ..:.. : ::::.:..
NP_001 AVESVQYGVAGSAAFLECQPRSPQATVKWLFQRDPGDRRREIRAEDRFLRTEQGLLLRAL
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pF1KB7 QGSDQGLYHCIATENSFKQTIAKINFKVLDSEMVAVVTDKWSPWTWASSVR--ALPFHP-
       : ::.::: : ::::.::.........::  .  :: .  . : . ..     : :  : 
NP_001 QLSDRGLYSCTATENNFKHVVTRVQLHVLGRD--AVHAALFPPLSMSAPPPPGAGPPTPP
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pF1KB7 -KDIMGAFSHSEMQMINQYCKDTRQQHQQGDESQKMRGDYGKLKALINSRKSRNRRNQLP
        ...   ... :. .:.:::.    .:     : .      .     ...: ::::.. :
NP_001 YQELAQLLAQPEVGLIHQYCQG-YWRHVP--PSPREAPGAPRSPEPQDQKKPRNRRHHPP
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     750 
pF1KB7 ES
       ..
NP_001 DT
         

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 initn: 1916 init1: 1330 opt: 2396  Z-score: 2533.2  bits: 479.4 E(85289): 2.3e-134
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pF1KB7   MAFRTICVLVGVFICS-ICVKGSSQPQARVYLTFDELRETKTSEYFSLSHHPLDYRIL
            : .:.. ::.. .    .....   :. :.. :. :...   :.   .  .:. .
XP_005 MGWLTRIVCLFWGVLLTARANYQNGKNNVPRLKLSYKEMLESNNVITFNGLANSSSYHTF
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pF1KB7 LMDEDQDRIYVGSKDHILSLNINNISQEALSVFWPASTIKVEECKMAGKDPTHGCGNFVR
       :.::...:.:::.::::.:... :: ..  .. ::.:  . .::: ::::  . :.::..
XP_005 LLDEERSRLYVGAKDHIFSFDLVNI-KDFQKIVWPVSYTRRDECKWAGKDILKECANFIK
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pF1KB7 VIQTFNRTHLYVCGSGAFSPVCTYLNRGRRSEDQVFMID-SKCESGKGRCSFNPNVNTVS
       :....:.::::.::.::: :.:::.. :.. ::..: .. :. :.:.:.  ..:.. :.:
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pF1KB7 VMINEELFSGMYIDFMGTDAAIFRSLTKRNAVRTDQHNSKWLSEPMFVDAHVIPDGTDPN
       ..:. ::.::   :::: : ::::.: ... .::.::.:.::..: :..::.: .. .:.
XP_005 LLIDGELYSGTAADFMGRDFAIFRTLGHHHPIRTEQHDSRWLNDPKFISAHLISESDNPE
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pF1KB7 DAKVYFFFKEKLTDNNRSTKQIHSMIARICPNDTGGLRSLVNKWTTFLKARLVCSVTDED
       : ::::::.:.  :...: :  :. :..:: :: :: :::::::::::::::.:::   .
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pF1KB7 GPETHFDELEDVFLLETDNPRTTLVYGIFTTSSSVFKGSAVCVYHLSDIQTVFNGPFAHK
       : .::::::.::::..  .:.. .:::.:::::..:::::::.: .::.. :: ::.::.
XP_005 GIDTHFDELQDVFLMNFKDPKNPVVYGVFTTSSNIFKGSAVCMYSMSDVRRVFLGPYAHR
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pF1KB7 EGPNHQLISYQGRIPYPRPGTCPGGAFTPNMRTTKEFPDDVVTFIRNHPLMYNSIYPIHK
       .:::.: . ::::.:::::::::. .:  .. .::..::::.:: :.:: ::: ..:...
XP_005 DGPNYQWVPYQGRVPYPRPGTCPSKTFG-GFDSTKDLPDDVITFARSHPAMYNPVFPMNN
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pF1KB7 RPLIVRIGTDYKYTKIAVDRVNAADGRYHVLFLGTDRGTVQKVVVLPTNNSVS-GELILE
       ::....  ..:..:.:.::::.: ::.: :.:.::: ::: ::: .: ..  .  :..::
XP_005 RPIVIKTDVNYQFTQIVVDRVDAEDGQYDVMFIGTDVGTVLKVVSIPKETWYDLEEVLLE
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pF1KB7 ELEVFKNHAPITTMKISSKKQQLYVSSNEGVSQVSLHRCHIYGTACADCCLARDPYCAWD
       :. ::.. . :..:..:.:.::::..:. ::.:. :::: ::: :::.::::::::::::
XP_005 EMTVFREPTAISAMELSTKQQQLYIGSTAGVAQLPLHRCDIYGKACAECCLARDPYCAWD
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pF1KB7 GHSCSRFYPTGKRRSRRQDVRHGNPLTQCRGFNLKAYRNAA--EIVQYGVKNNTTFLECA
       : .:::..::.:::.::::.:.:.:::.:  ..   ... .  : . :::.:..:::::.
XP_005 GSACSRYFPTAKRRTRRQDIRNGDPLTHCSDLHHDNHHGHSPEERIIYGVENSSTFLECS
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pF1KB7 PKSPQASIKWLLQK-DKDRRKEVKLNERIIATSQGLLIRSVQGSDQGLYHCIATENSFKQ
       ::: .: . : .:. ...:..:......:: :.::::.::.: .:.: : : :.:..: :
XP_005 PKSQRALVYWQFQRRNEERKEEIRVDDHIIRTDQGLLLRSLQQKDSGNYLCHAVEHGFIQ
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pF1KB7 TIAKINFKVLDSEMVAVVT----DKWSPWTWASSVRALPFHP---KDIMGAFSHSEMQMI
       :. :....:.:.: .  .     :  .  :   :    : .    .:.:  ..: ... .
XP_005 TLLKVTLEVIDTEHLEELLHKDDDGDGSKTKEMSNSMTPSQKVWYRDFMQLINHPNLNTM
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pF1KB7 NQYCKDT--RQQHQQGDESQKMRGDYGKLKALINSRKSRNRRNQLPES     
       ...:...  :...:. ..  .  :. .: : : ...:.::::..         
XP_005 DEFCEQVWKRDRKQRRQRPGHTPGNSNKWKHLQENKKGRNRRTHEFERAPRSV
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>>XP_016867162 (OMIM: 603961,614897) PREDICTED: semaphor  (771 aa)
 initn: 1916 init1: 1330 opt: 2396  Z-score: 2533.2  bits: 479.4 E(85289): 2.3e-134
Smith-Waterman score: 2458; 44.9% identity (78.4% similar) in 759 aa overlap (4-747:6-762)

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pF1KB7   MAFRTICVLVGVFICS-ICVKGSSQPQARVYLTFDELRETKTSEYFSLSHHPLDYRIL
            : .:.. ::.. .    .....   :. :.. :. :...   :.   .  .:. .
XP_016 MGWLTRIVCLFWGVLLTARANYQNGKNNVPRLKLSYKEMLESNNVITFNGLANSSSYHTF
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pF1KB7 LMDEDQDRIYVGSKDHILSLNINNISQEALSVFWPASTIKVEECKMAGKDPTHGCGNFVR
       :.::...:.:::.::::.:... :: ..  .. ::.:  . .::: ::::  . :.::..
XP_016 LLDEERSRLYVGAKDHIFSFDLVNI-KDFQKIVWPVSYTRRDECKWAGKDILKECANFIK
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pF1KB7 VIQTFNRTHLYVCGSGAFSPVCTYLNRGRRSEDQVFMID-SKCESGKGRCSFNPNVNTVS
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XP_016 VLKAYNQTHLYACGTGAFHPICTYIEIGHHPEDNIFKLENSHFENGRGKSPYDPKLLTAS
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pF1KB7 VMINEELFSGMYIDFMGTDAAIFRSLTKRNAVRTDQHNSKWLSEPMFVDAHVIPDGTDPN
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XP_016 LLIDGELYSGTAADFMGRDFAIFRTLGHHHPIRTEQHDSRWLNDPKFISAHLISESDNPE
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pF1KB7 DAKVYFFFKEKLTDNNRSTKQIHSMIARICPNDTGGLRSLVNKWTTFLKARLVCSVTDED
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XP_016 DDKVYFFFRENAIDGEHSGKATHARIGQICKNDFGGHRSLVNKWTTFLKARLICSVPGPN
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pF1KB7 GPETHFDELEDVFLLETDNPRTTLVYGIFTTSSSVFKGSAVCVYHLSDIQTVFNGPFAHK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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