Result of FASTA (ccds) for pF1KB7011
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7011, 1045 aa
  1>>>pF1KB7011 1045 - 1045 aa - 1045 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4144+/-0.00108; mu= 2.7971+/- 0.065
 mean_var=202.0470+/-40.488, 0's: 0 Z-trim(110.6): 122  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.090229
 statistics sampled from 11622 (11745) to 11622 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.696), E-opt: 0.2 (0.361), width:  16
 Scan time:  4.560

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS9487.1 FARP1 gene_id:10160|Hs108|chr13         (1045) 6988 923.1       0
CCDS66572.1 FARP1 gene_id:10160|Hs108|chr13        (1076) 5080 674.8 2.7e-193
CCDS33424.1 FARP2 gene_id:9855|Hs108|chr2          (1054) 3387 454.4 5.9e-127
CCDS63197.1 FARP2 gene_id:9855|Hs108|chr2          ( 647) 1729 238.4 3.7e-62
CCDS63198.1 FARP2 gene_id:9855|Hs108|chr2          ( 638) 1725 237.9 5.2e-62
CCDS35397.1 FRMD7 gene_id:90167|Hs108|chrX         ( 714) 1459 203.3 1.5e-51
CCDS78504.1 FRMD7 gene_id:90167|Hs108|chrX         ( 699) 1134 161.0 8.1e-39
CCDS11838.1 EPB41L3 gene_id:23136|Hs108|chr18      (1087)  949 137.0 2.1e-31
CCDS62381.1 EPB41L3 gene_id:23136|Hs108|chr18      ( 865)  940 135.8 3.9e-31
CCDS62382.1 EPB41L3 gene_id:23136|Hs108|chr18      ( 883)  940 135.8 3.9e-31
CCDS82237.1 EPB41L3 gene_id:23136|Hs108|chr18      ( 918)  940 135.8 4.1e-31
CCDS82236.1 EPB41L3 gene_id:23136|Hs108|chr18      ( 756)  938 135.5 4.1e-31
CCDS47474.1 EPB41L2 gene_id:2037|Hs108|chr6        ( 673)  929 134.3 8.5e-31
CCDS59037.1 EPB41L2 gene_id:2037|Hs108|chr6        ( 747)  928 134.2   1e-30
CCDS56450.1 EPB41L2 gene_id:2037|Hs108|chr6        ( 852)  929 134.4   1e-30
CCDS5141.1 EPB41L2 gene_id:2037|Hs108|chr6         (1005)  928 134.3 1.3e-30
CCDS58770.1 EPB41L1 gene_id:2036|Hs108|chr20       ( 701)  919 133.0 2.2e-30
CCDS53289.1 EPB41 gene_id:2035|Hs108|chr1          ( 720)  912 132.1 4.2e-30
CCDS2129.1 PTPN4 gene_id:5775|Hs108|chr2           ( 926)  913 132.3 4.7e-30
CCDS53288.1 EPB41 gene_id:2035|Hs108|chr1          ( 864)  912 132.2 4.8e-30
CCDS13272.1 EPB41L1 gene_id:2036|Hs108|chr20       ( 779)  909 131.7 5.8e-30
CCDS331.1 EPB41 gene_id:2035|Hs108|chr1            ( 588)  897 130.1 1.4e-29
CCDS58771.1 EPB41L1 gene_id:2036|Hs108|chr20       ( 880)  900 130.6 1.5e-29
CCDS13271.1 EPB41L1 gene_id:2036|Hs108|chr20       ( 881)  900 130.6 1.5e-29
CCDS332.1 EPB41 gene_id:2035|Hs108|chr1            ( 641)  897 130.1 1.5e-29
CCDS54392.1 EPB41L5 gene_id:57669|Hs108|chr2       ( 505)  819 119.9 1.4e-26
CCDS54393.1 EPB41L5 gene_id:57669|Hs108|chr2       ( 687)  808 118.6 4.7e-26
CCDS82506.1 EPB41L5 gene_id:57669|Hs108|chr2       ( 732)  808 118.6   5e-26
CCDS2130.1 EPB41L5 gene_id:57669|Hs108|chr2        ( 733)  808 118.6   5e-26
CCDS330.1 EPB41 gene_id:2035|Hs108|chr1            ( 775)  777 114.6 8.6e-25
CCDS43860.1 EPB41L4B gene_id:54566|Hs108|chr9      ( 518)  760 112.3 2.8e-24
CCDS10107.2 FRMD5 gene_id:84978|Hs108|chr15        ( 570)  754 111.5 5.3e-24
CCDS43859.1 EPB41L4B gene_id:54566|Hs108|chr9      ( 900)  756 111.9 6.5e-24
CCDS59133.1 FRMD3 gene_id:257019|Hs108|chr9        ( 556)  734 108.9 3.1e-23
CCDS43840.1 FRMD3 gene_id:257019|Hs108|chr9        ( 597)  734 108.9 3.3e-23
CCDS75852.1 FRMD3 gene_id:257019|Hs108|chr9        ( 553)  702 104.7 5.6e-22
CCDS43350.1 EPB41L4A gene_id:64097|Hs108|chr5      ( 686)  682 102.2 4.1e-21
CCDS6776.1 PTPN3 gene_id:5774|Hs108|chr9           ( 913)  662 99.6 3.2e-20
CCDS73716.1 FRMD5 gene_id:84978|Hs108|chr15        ( 414)  549 84.7 4.4e-16
CCDS31878.1 FGD6 gene_id:55785|Hs108|chr12         (1430)  523 81.6 1.3e-14
CCDS81679.1 FGD4 gene_id:121512|Hs108|chr12        ( 673)  479 75.7 3.6e-13
CCDS8727.1 FGD4 gene_id:121512|Hs108|chr12         ( 766)  479 75.8 4.1e-13
CCDS76544.1 FGD4 gene_id:121512|Hs108|chr12        ( 851)  479 75.8 4.4e-13
CCDS76545.1 FGD4 gene_id:121512|Hs108|chr12        ( 878)  479 75.8 4.6e-13
CCDS43849.1 FGD3 gene_id:89846|Hs108|chr9          ( 725)  461 73.4   2e-12
CCDS48000.1 PTPN3 gene_id:5774|Hs108|chr9          ( 737)  433 69.8 2.5e-11
CCDS4536.1 MYLIP gene_id:29116|Hs108|chr6          ( 445)  417 67.6 6.9e-11
CCDS48001.1 PTPN3 gene_id:5774|Hs108|chr9          ( 782)  419 68.0 9.3e-11


>>CCDS9487.1 FARP1 gene_id:10160|Hs108|chr13              (1045 aa)
 initn: 6988 init1: 6988 opt: 6988  Z-score: 4926.1  bits: 923.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6988; 99.9% identity (100.0% similar) in 1045 aa overlap (1-1045:1-1045)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MGEIEQRPTPGSRLGAPENSGISTLERGQKPPPTPSGKLVSIKIQMLDDTQEAFEVPQRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 MGEIEQRPTPGSRLGAPENSGISTLERGQKPPPTPSGKLVSIKIQMLDDTQEAFEVPQRA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 PGKVLLDAVCNHLNLVEGDYFGLEFPDHKKITVWLDLLKPIVKQIRRPKHVVVKFVVKFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 PGKVLLDAVCNHLNLVEGDYFGLEFPDHKKITVWLDLLKPIVKQIRRPKHVVVKFVVKFF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 PPDHTQLQEELTRYLFALQVKQDLAQGRLTCNDTSAALLISHIVQSEIGDFDEALDREHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 PPDHTQLQEELTRYLFALQVKQDLAQGRLTCNDTSAALLISHIVQSEIGDFDEALDREHL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 AKNKYIPQQDALEDKIVEFHHNHIGQTPAESDFQLLEIARRLEMYGIRLHPAKDREGTKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 AKNKYIPQQDALEDKIVEFHHNHIGQTPAESDFQLLEIARRLEMYGIRLHPAKDREGTKI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 NLAVANTGILVFQGFTKINAFNWAKVRKLSFKRKRFLIKLRPDANSAYQDTLEFLMASRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 NLAVANTGILVFQGFTKINAFNWAKVRKLSFKRKRFLIKLRPDANSAYQDTLEFLMASRD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 FCKSFWKICVEHHAFFRLFEEPKPKPKPVLFSRGSSFRFSGRTQKQVLDYVKEGGHKKVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 FCKSFWKICVEHHAFFRLFEEPKPKPKPVLFSRGSSFRFSGRTQKQVLDYVKEGGHKKVQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 FERKHSKIHSIRSLASQPTELNSEVLEQSQQSTSLTFGEGAESPGGQSCRRGKEPKVSAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 FERKHSKIHSIRSLASQPTELNSEVLEQSQQSTSLTFGEGAESPGGQSCRRGKEPKVSAG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 EPGSHPSPAPRRSPAGNKQADGAASAPTEEEEEVVKDRTQQSKPQPPQPSTGSLTGSPHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 EPGSHPSPAPRRSPAGNKQADGAASAPTEEEEEVVKDRTQQSKPQPPQPSTGSLTGSPHL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 SELSVNSQGGVAPANVTLSPNLSPDTKQASPLISPLLNDQACPRTDDEDEGRRKRFPTDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 SELSVNSQGGVAPANVTLSPNLSPDTKQASPLISPLLNDQACPRTDDEDEGRRKRFPTDK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB7 AYFIAKEVSTTERTYLKDLEVITSWFQSTVSKEDAMPEALKSLIFPNFEPLHKFHTNFLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 AYFIAKEVSTTERTYLKDLEVITSWFQSTVSKEDAMPEALKSLIFPNFEPLHKFHTNFLK
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB7 EIEQRLALWEGRSNAQIRDYQRIGDVMLKNIQGMKHLAAHLWKHSEALEALENGIKSSRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 EIEQRLALWEGRSNAQIRDYQRIGDVMLKNIQGMKHLAAHLWKHSEALEALENGIKSSRR
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB7 LENFCRDFELQKVCYLPLNTFLLRPLHRLMHYNQVLERLCKHHPPSHADFRDCRAALAEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 LENFCRDFELQKVCYLPLNTFLLRPLHRLMHYKQVLERLCKHHPPSHADFRDCRAALAEI
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB7 TEMVAQLHGTMIKMENFQKLHELKKDLIGIDNLVVPGREFIRLGSLSKLSGKGLQQRMFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 TEMVAQLHGTMIKMENFQKLHELKKDLIGIDNLVVPGREFIRLGSLSKLSGKGLQQRMFF
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB7 LFNDVLLYTSRGLTASNQFKVHGQLPLYGMTIEESEDEWGVPHCLTLRGQRQSIIVAASS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 LFNDVLLYTSRGLTASNQFKVHGQLPLYGMTIEESEDEWGVPHCLTLRGQRQSIIVAASS
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB7 RSEMEKWVEDIQMAIDLAEKSSSPAPEFLASSPPDNKSPDEATAADQESEDDLSASRTSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 RSEMEKWVEDIQMAIDLAEKSSSPAPEFLASSPPDNKSPDEATAADQESEDDLSASRTSL
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB7 ERQAPHRGNTMVHVCWHRNTSVSMVDFSIAVENQLSGNLLRKFKNSNGWQKLWVVFTNFC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 ERQAPHRGNTMVHVCWHRNTSVSMVDFSIAVENQLSGNLLRKFKNSNGWQKLWVVFTNFC
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB7 LFFYKSHQDNHPLASLPLLGYSLTIPSESENIQKDYVFKLHFKSHVYYFRAESEYTFERW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 LFFYKSHQDNHPLASLPLLGYSLTIPSESENIQKDYVFKLHFKSHVYYFRAESEYTFERW
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040     
pF1KB7 MEVIRSATSSASRPHVLSHKESLVY
       :::::::::::::::::::::::::
CCDS94 MEVIRSATSSASRPHVLSHKESLVY
             1030      1040     

>>CCDS66572.1 FARP1 gene_id:10160|Hs108|chr13             (1076 aa)
 initn: 5077 init1: 5077 opt: 5080  Z-score: 3583.6  bits: 674.8 E(32554): 2.7e-193
Smith-Waterman score: 6916; 97.0% identity (97.1% similar) in 1076 aa overlap (1-1045:1-1076)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MGEIEQRPTPGSRLGAPENSGISTLERGQKPPPTPSGKLVSIKIQMLDDTQEAFEVPQRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MGEIEQRPTPGSRLGAPENSGISTLERGQKPPPTPSGKLVSIKIQMLDDTQEAFEVPQRA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 PGKVLLDAVCNHLNLVEGDYFGLEFPDHKKITVWLDLLKPIVKQIRRPKHVVVKFVVKFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS33 GTKIQLAVSHMGVLVFQGTTKINTFNWSKVRKLSFKRKRFLIKLHPEVHGPYQDTLEFLL
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CCDS33 GSRDECKNFWKICVEYHTFFRLLDQPKPKAKAVFFSRGSSFRYSGRTQKQLVDYFKDSGM
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pF1KB7 KKVQFERKHSKIH-SIRSL-ASQPTELNSEVLEQSQQSTSLTFGEGAESPGGQSCRRG--
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CCDS33 KRIPYERRHSKTHTSVRALTADLPKQ-------------SISFPEGLRTPASPSSANAFY
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CCDS33 SLSPSTLVPSGLPEFKDSSSSLTDPQVSYVKSPAAERRSGAVAGGPD----------TPS
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CCDS33 AQPLGPPALQPGPGLSTKSPQPSPSSRKSPLSLSPA---FQVPLGPAEQGSSPLLSPVLS
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pF1KB7 DQACPRTDDEDEGRRKRFPTDKAYFIAKEVSTTERTYLKDLEVITSWFQSTVSKEDAMPE
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CCDS33 DAGGAGMDCE-EPRHKRVPADEAYFIVKEILATERTYLKDLEVITVWFRSAVVKEDAMPA
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pF1KB7 ALKSLIFPNFEPLHKFHTNFLKEIEQRLALWEGRSNAQIR-DYQRIGDVMLKNIQGMKHL
       .: .:.: :..:...:: .::.:.::::::::: :.:. . ..:::::..:.:.. .:..
CCDS33 TLMTLLFSNIDPIYEFHRGFLREVEQRLALWEGPSKAHTKGSHQRIGDILLRNMRQLKEF
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pF1KB7 AAHLWKHSEALEALENGIKSSRRLENFCRDFELQKVCYLPLNTFLLRPLHRLMHYNQVLE
       .... .:.:.:  ::.. :  ..::   ..::::::::::::::::.:..::.::  .:.
CCDS33 TSYFQRHDEVLTELEKATKRCKKLEAVYKEFELQKVCYLPLNTFLLKPIQRLLHYRLLLR
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pF1KB7 RLCKHHPPSHADFRDCRAALAEITEMVAQLHGTMIKMENFQKLHELKKDLIGIDNLVVPG
       ::: :. :.: :. ::. ::  :::... :.  .:..::.::: ::..::.::.::..::
CCDS33 RLCGHYSPGHHDYADCHDALKAITEVTTTLQHILIRLENLQKLTELQRDLVGIENLIAPG
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pF1KB7 REFIRLGSLSKLSGKGLQQRMFFLFNDVLLYTSRGLTASNQFKVHGQLPLYGMTIEESED
       ::::: : : ::. :::::::::::.:.:::::.:......:...: ::: :: .:::..
CCDS33 REFIREGCLHKLTKKGLQQRMFFLFSDMLLYTSKGVAGTSHFRIRGLLPLQGMLVEESDN
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pF1KB7 EWGVPHCLTLRGQRQSIIVAASSRSEMEKWVEDIQMAIDLAEKSSSPAPEF----LASSP
       ::.::::.:. . ...:.::::.: : :::. :.. ::. :..... :: .    . . :
CCDS33 EWSVPHCFTIYAAQKTIVVAASTRLEKEKWMLDLNSAIQAAKSGGDTAPALPGRTVCTRP
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pF1KB7 PDNKSPDEATAADQESEDDLSASRTSLERQAPHRGNTMVHVCWHRNTSVSMVDFSIAVEN
       :  .::.:..  .::::::  . :.::: .. ::.:: .::::.:::::: .: : ::::
CCDS33 P--RSPNEVSL-EQESEDDARGVRSSLEGHGQHRANTTMHVCWYRNTSVSRADHSAAVEN
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pF1KB7 QLSGNLLRKFKNSNGWQKLWVVFTNFCLFFYKSHQDNHPLASLPLLGYSLTIPSESENIQ
       :::: ::::::::.::::::::::::::::::.:::..:::::::::::..:: :...:.
CCDS33 QLSGYLLRKFKNSHGWQKLWVVFTNFCLFFYKTHQDDYPLASLPLLGYSVSIPREADGIH
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pF1KB7 KDYVFKLHFKSHVYYFRAESEYTFERWMEVIRSATSSASR-PHVLSHKESLVY       
       :::::::.::::::.:::::.::::::::::..:.:::.: : ..               
CCDS33 KDYVFKLQFKSHVYFFRAESKYTFERWMEVIQGASSSAGRAPSIVQDGPQPSSGLEGMVR
             1000      1010      1020      1030      1040      1050

CCDS33 GKEE
           

>>CCDS63197.1 FARP2 gene_id:9855|Hs108|chr2               (647 aa)
 initn: 2012 init1: 1583 opt: 1729  Z-score: 1229.5  bits: 238.4 E(32554): 3.7e-62
Smith-Waterman score: 2142; 52.2% identity (75.4% similar) in 663 aa overlap (1-640:1-636)

                   10        20        30        40        50      
pF1KB7 MGEIEQR----PTPGSRLGAPENSGISTLERGQKPPPTPSGKLVSIKIQMLDDTQEAFEV
       :::::       : : ::::    :.:::: ::   :  . : . .....::.:.: :..
CCDS63 MGEIEGTYRVLQTAGMRLGAQTPVGVSTLEPGQTLLPRMQEKHLHLRVKLLDNTMEIFDI
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB7 PQRAPGKVLLDAVCNHLNLVEGDYFGLEFPDHKKITVWLDLLKPIVKQIRRPKHVVVKFV
         .  :.:::  : ..::::: ::::.:: . ..  .::. .:::..::::::.::....
CCDS63 EPKCDGQVLLTQVWKRLNLVECDYFGMEFQNTQSYWIWLEPMKPIIRQIRRPKNVVLRLA
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pF1KB7 VKFFPPDHTQLQEELTRYLFALQVKQDLAQGRLTCNDTSAALLISHIVQSEIGDFDEALD
       :::::::  ::::: ::::::::.:.:: . :::: ::.:::: ::..::::::.::.::
CCDS63 VKFFPPDPGQLQEEYTRYLFALQLKRDLLEERLTCADTTAALLTSHLLQSEIGDYDETLD
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pF1KB7 REHLAKNKYIPQQDALEDKIVEFHHNHIGQTPAESDFQLLEIARRLEMYGIRLHPAKDRE
       ::::  :.:.: :.   .::.:::..:.::::::::::.:::::.:::::::.: :.:::
CCDS63 REHLKVNEYLPGQQHCLEKILEFHQKHVGQTPAESDFQVLEIARKLEMYGIRFHMASDRE
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pF1KB7 GTKINLAVANTGILVFQGFTKINAFNWAKVRKLSFKRKRFLIKLRPDANSAYQDTLEFLM
       ::::.:::.. :.::::: ::::.:::.::::::::::::::::.:.... ::::::::.
CCDS63 GTKIQLAVSHMGVLVFQGTTKINTFNWSKVRKLSFKRKRFLIKLHPEVHGPYQDTLEFLL
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pF1KB7 ASRDFCKSFWKICVEHHAFFRLFEEPKPKPKPVLFSRGSSFRFSGRTQKQVLDYVKEGGH
       .::: ::.:::::::.:.::::...:::: : :.::::::::.:::::::..:: :..: 
CCDS63 GSRDECKNFWKICVEYHTFFRLLDQPKPKAKAVFFSRGSSFRYSGRTQKQLVDYFKDSGM
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pF1KB7 KKVQFERKHSKIH-SIRSL-ASQPTELNSEVLEQSQQSTSLTFGEGAESPGGQSCRRG--
       :.. .::.::: : :.:.: :. : .             :..: :: ..:.. :   .  
CCDS63 KRIPYERRHSKTHTSVRALTADLPKQ-------------SISFPEGLRTPASPSSANAFY
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pF1KB7 -KEPK--VSAGEPG--------SHPSPAPRRSPAGNKQADGAASAPTEEEEEVVKDRTQQ
          :.  : .: :         . :. .  .:::..... ..:..:           : .
CCDS63 SLSPSTLVPSGLPEFKDSSSSLTDPQVSYVKSPAAERRSGAVAGGPD----------TPS
       410       420       430       440       450                 

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pF1KB7 SKPQ-PP--QPSTGSLTGSPHLSELSVNSQGGVAPANVTLSPNLSPDTKQASPLISPLLN
       ..:  ::  ::. :  : ::. :  : .:  ...::   ..  :.:  . .:::.::.:.
CCDS63 AQPLGPPALQPGPGLSTKSPQPSPSSRKSPLSLSPA---FQVPLGPAEQGSSPLLSPVLS
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pF1KB7 DQACPRTDDEDEGRRKRFPTDKAYFIAKEVSTTERTYLKDLEVITSWFQSTVSKEDAMPE
       : .    : : : :.:: :.:.::::.::. .::::::::::::: ::.:.: :::::: 
CCDS63 DAGGAGMDCE-EPRHKRVPADEAYFIVKEILATERTYLKDLEVITVWFRSAVVKEDAMPA
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pF1KB7 ALKSLIFPNFEPLHKFHTNFLKEIEQRLALWEGRSNAQIR-DYQRIGDVMLKNIQGMKHL
       .: .:.: :..:...:: .::.:.::::::::: :.:. . ..:::::..:.:.. .: .
CCDS63 TLMTLLFSNIDPIYEFHRGFLREVEQRLALWEGPSKAHTKGSHQRIGDILLRNMRQLKVF
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pF1KB7 AAHLWKHSEALEALENGIKSSRRLENFCRDFELQKVCYLPLNTFLLRPLHRLMHYNQVLE
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CCDS63 QLHEGHVAGVTKME                                              
           640                                                     

>>CCDS63198.1 FARP2 gene_id:9855|Hs108|chr2               (638 aa)
 initn: 2012 init1: 1583 opt: 1725  Z-score: 1226.8  bits: 237.9 E(32554): 5.2e-62
Smith-Waterman score: 2144; 52.5% identity (75.6% similar) in 663 aa overlap (1-640:1-634)

                   10        20        30        40        50      
pF1KB7 MGEIEQR----PTPGSRLGAPENSGISTLERGQKPPPTPSGKLVSIKIQMLDDTQEAFEV
       :::::       : : ::::    :.:::: ::   :  . : . .....::.:.: :..
CCDS63 MGEIEGTYRVLQTAGMRLGAQTPVGVSTLEPGQTLLPRMQEKHLHLRVKLLDNTMEIFDI
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB7 PQRAPGKVLLDAVCNHLNLVEGDYFGLEFPDHKKITVWLDLLKPIVKQIRRPKHVVVKFV
         .  :.:::  : ..::::: ::::.:: . ..  .::. .:::..::::::.::....
CCDS63 EPKCDGQVLLTQVWKRLNLVECDYFGMEFQNTQSYWIWLEPMKPIIRQIRRPKNVVLRLA
               70        80        90       100       110       120

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pF1KB7 VKFFPPDHTQLQEELTRYLFALQVKQDLAQGRLTCNDTSAALLISHIVQSEIGDFDEALD
       :::::::  ::::: ::::::::.:.:: . :::: ::.:::: ::..::::::.::.::
CCDS63 VKFFPPDPGQLQEEYTRYLFALQLKRDLLEERLTCADTTAALLTSHLLQSEIGDYDETLD
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pF1KB7 REHLAKNKYIPQQDALEDKIVEFHHNHIGQTPAESDFQLLEIARRLEMYGIRLHPAKDRE
       ::::  :.:.: :.   .::.:::..:.::::::::::.:::::.:::::::.: :.:::
CCDS63 REHLKVNEYLPGQQHCLEKILEFHQKHVGQTPAESDFQVLEIARKLEMYGIRFHMASDRE
              190       200       210       220       230       240

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pF1KB7 GTKINLAVANTGILVFQGFTKINAFNWAKVRKLSFKRKRFLIKLRPDANSAYQDTLEFLM
       ::::.:::.. :.::::: ::::.:::.::::::::::::::::.:.... ::::::::.
CCDS63 GTKIQLAVSHMGVLVFQGTTKINTFNWSKVRKLSFKRKRFLIKLHPEVHGPYQDTLEFLL
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pF1KB7 ASRDFCKSFWKICVEHHAFFRLFEEPKPKPKPVLFSRGSSFRFSGRTQKQVLDYVKEGGH
       .::: ::.:::::::.:.::::...:::: : :.::::::::.:::::::..:: :..: 
CCDS63 GSRDECKNFWKICVEYHTFFRLLDQPKPKAKAVFFSRGSSFRYSGRTQKQLVDYFKDSGM
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pF1KB7 KKVQFERKHSKIH-SIRSL-ASQPTELNSEVLEQSQQSTSLTFGEGAESPGGQSCRRG--
       :.. .::.::: : :.:.: :. : .             :..: :: ..:.. :   .  
CCDS63 KRIPYERRHSKTHTSVRALTADLPKQ-------------SISFPEGLRTPASPSSANAFY
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pF1KB7 -KEPK--VSAGEPG--------SHPSPAPRRSPAGNKQADGAASAPTEEEEEVVKDRTQQ
          :.  : .: :         . :. .  .:::..... ..:..:           : .
CCDS63 SLSPSTLVPSGLPEFKDSSSSLTDPQVSYVKSPAAERRSGAVAGGPD----------TPS
       410       420       430       440       450                 

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pF1KB7 SKPQ-PP--QPSTGSLTGSPHLSELSVNSQGGVAPANVTLSPNLSPDTKQASPLISPLLN
       ..:  ::  ::. :  : ::. :  : .:  ...::   ..  :.:  . .:::.::.:.
CCDS63 AQPLGPPALQPGPGLSTKSPQPSPSSRKSPLSLSPA---FQVPLGPAEQGSSPLLSPVLS
       460       470       480       490          500       510    

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pF1KB7 DQACPRTDDEDEGRRKRFPTDKAYFIAKEVSTTERTYLKDLEVITSWFQSTVSKEDAMPE
       : .    : : : :.:: :.:.::::.::. .::::::::::::: ::.:.: :::::: 
CCDS63 DAGGAGMDCE-EPRHKRVPADEAYFIVKEILATERTYLKDLEVITVWFRSAVVKEDAMPA
          520        530       540       550       560       570   

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pF1KB7 ALKSLIFPNFEPLHKFHTNFLKEIEQRLALWEGRSNAQIR-DYQRIGDVMLKNIQGMKHL
       .: .:.: :..:...:: .::.:.::::::::: :.:. . ..:::::..:.:.. .:  
CCDS63 TLMTLLFSNIDPIYEFHRGFLREVEQRLALWEGPSKAHTKGSHQRIGDILLRNMRQLK--
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pF1KB7 AAHLWKHSEALEALENGIKSSRRLENFCRDFELQKVCYLPLNTFLLRPLHRLMHYNQVLE
       :::                                                         
CCDS63 AAHEFTT                                                     
                                                                   

>>CCDS35397.1 FRMD7 gene_id:90167|Hs108|chrX              (714 aa)
 initn: 1413 init1: 1413 opt: 1459  Z-score: 1038.9  bits: 203.3 E(32554): 1.5e-51
Smith-Waterman score: 1460; 42.7% identity (69.1% similar) in 609 aa overlap (39-632:1-583)

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pF1KB7 TPGSRLGAPENSGISTLERGQKPPPTPSGKLVSIKIQMLDDTQEAFEVPQRAPGKVLLDA
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CCDS35                               MLHLKVQFLDDSQKIFVVDQKSSGKALFNL
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pF1KB7 VCNHLNLVEGDYFGLEFPDHKKITVWLDLLKPIVKQIRRPKHVVVKFVVKFFPPDHTQLQ
        :.::::.: .:::::: .:.  .:::.:::::.::.. ::..: ::.::::: :  .:.
CCDS35 SCSHLNLAEKEYFGLEFCSHSGNNVWLELLKPITKQVKNPKEIVFKFMVKFFPVDPGHLR
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pF1KB7 EELTRYLFALQVKQDLAQGRLTCNDTSAALLISHIVQSEIGDFDEALDREHLAKNKYIPQ
       ::::::::.::.:.::: ::: :.:. .::..:::.:::.::: :  ::.:::...:.:.
CCDS35 EELTRYLFTLQIKKDLALGRLPCSDNCTALMVSHILQSELGDFHEETDRKHLAQTRYLPN
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pF1KB7 QDALEDKIVEFHHNHIGQTPAESDFQLLEIARRLEMYGIRLHPAKDREGTKINLAVANTG
       :: :: ::..::..:::..:::::. ::.:::.:.::::: :::.: :: .:.::::. :
CCDS35 QDCLEGKIMHFHQKHIGRSPAESDILLLDIARKLDMYGIRPHPASDGEGMQIHLAVAHMG
              160       170       180       190       200       210

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pF1KB7 ILVFQGFTKINAFNWAKVRKLSFKRKRFLIKLRPDANSAYQDTLEFLMASRDFCKSFWKI
       .::..: ::::.:::::.::::::::.:::::. .     .::::: ::::: ::.::: 
CCDS35 VLVLRGNTKINTFNWAKIRKLSFKRKHFLIKLHANILVLCKDTLEFTMASRDACKAFWKT
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       . :  :.  :.: .: :.: .: ..   :..: :         :  :  .: ::..  .:
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       : . :  : ...   .  ....  .:.  .. :. :    .    :     .. :    .
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pF1KB7 CVEHHAFFRLFEEPKPKPKPVLFSRGSSFRFSGRTQKQVLDYVKEGGHKKVQFERKH--S
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CCDS11 EYQQLEDDKLSQKSSSSKLSRSPLKIVKKPKSMQCKVILLDGSEYTCDVEKRSRGQVLFD
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pF1KB7 AVCNHLNLVEGDYFGLEFPDHKKITVWLDLLKPIVKQIRRPK-HVVVKFVVKFFPPDHTQ
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CCDS11 KVCEHLNLLEKDYFGLTYRDAENQKNWLDPAKEIKKQVRSGAWHF--SFNVKFYPPDPAQ
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pF1KB7 LQEELTRYLFALQVKQDLAQGRLTCNDTSAALLISHIVQSEIGDFD-EALDREHLAKNKY
       :.:..::: . ::...:...::: :. .. ::: :. ::::.::.: .    ..... ..
CCDS11 LSEDITRYYLCLQLRDDIVSGRLPCSFVTLALLGSYTVQSELGDYDPDECGSDYISEFRF
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pF1KB7 IPQQDA-LEDKIVEFHHNHIGQTPAESDFQLLEIARRLEMYGIRLHPAKDREGTKINLAV
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pF1KB7 ANTGILVFQGFTKINAFNWAKVRKLSFKRKRFLIKLRPDANSAYQDTLEFLMASRDFCKS
         .:.:...   .:: : : :: :.:.::. : ::.::     ...:. : . ..   : 
CCDS11 CASGLLIYRDRLRINRFAWPKVLKISYKRNNFYIKIRPGEFEQFESTIGFKLPNHRAAKR
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pF1KB7 FWKICVEHHAFFRLFEEPKPKPKPVLFSRGSSFRFSGRTQKQVLDYVKEGGHKKVQFERK
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CCDS11 LWKVCVEHHTFFRLLL-PEAPPKKFL-TLGSKFRYSGRTQAQTRRASALIDRPAPYFERS
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pF1KB7 HSKIHSI-RSLASQ---PTELNSEVLEQSQQSTSLTFGEGAESPGGQSC---RRGKE--P
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CCDS11 SSKRYTMSRSLDGEVGTGQYATTKGISQTNLITTVTPEKKAEEERDEEEDKRRKGEEVTP
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pF1KB7 KVSAGEPGSHPSPAPRRSPAGNKQADGAASAPTEEEEEVVKDRTQQSKPQPP--QPSTGS
         .  . :. :. .    : .  ..  : ..:::     .. : ...  . :  .:: . 
CCDS11 ISAIRHEGKSPGLGTDSCPLSPPSTHCAPTSPTE-----LRRRCKENDCKLPGYEPSRAE
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pF1KB7 -LTGSPHLSELSVNSQGGVAP--ANVTLSPNLSPDTKQASPLISPLLN-DQACPRTDDED
        : : : :     .:.:   :  ..  .. .   .: ... :.:  :.  .. :   :.:
CCDS11 HLPGEPAL-----DSDGPGRPYLGDQDVAFSYRQQTGKGTTLFSFSLQLPESFPSLLDDD
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pF1KB7 EGRRKRFPTDKAYFIAKEVSTTERTYLKDLEVITSWFQSTVSKEDAMPEALKSLIFPNFE
                                                                   
CCDS11 GYLSFPNLSETNLLPQSLQHYLPIRSPSLVPCFLFIFFFLLSASFSVPYALTLSFPLALC
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>>CCDS62381.1 EPB41L3 gene_id:23136|Hs108|chr18           (865 aa)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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