Result of SIM4 for pF1KB4846

seq1 = pF1KB4846.tfa, 1440 bp
seq2 = pF1KB4846/gi568815577r_34692138.tfa (gi568815577r:34692138_35148899), 456762 bp

>pF1KB4846 1440
>gi568815577r:34692138_35148899 (Chr21)

(complement)

1-58  (100001-100058)   100% ->
59-97  (255937-255975)   100% ->
98-351  (261804-262057)   99% ->
352-508  (268187-268343)   100% ->
509-613  (289322-289426)   100% ->
614-805  (314299-314490)   100% ->
806-967  (349438-349599)   100% ->
968-1440  (356290-356762)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTTCAGACAGCATATTTGAGTCATTTCCTTCGTACCCACAGTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTTCAGACAGCATATTTGAGTCATTTCCTTCGTACCCACAGTGCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATGAGAG         AATGCATACTTGGAATGAATCCTTCTAGAGACG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATGAGAGGTG...CAGAATGCATACTTGGAATGAATCCTTCTAGAGACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCCACG         ATGCCAGCACGAGCCGCCGCTTCACGCCGCCTTCC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 255970 TCCACGGTA...TAGATGCCAGCACGAGCCGCCGCTTCACGCCGCCTTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 ACCGCGCTGAGCCCAGGCAAGATGAGCGAGGCGTCGCCGCTGGGCGCCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 261839 ACCGCGCTGAGCCCAGGCAAGATGAGCGAGGCGTTGCCGCTGGGCGCCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGACGCCGGCGCTGCCCTGGCCGGCAAGCTGAGGAGCGGCGACCGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 261889 GGACGCCGGCGCTGCCCTGGCCGGCAAGCTGAGGAGCGGCGACCGCAGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGGTGGAGGTGCTGGCCGACCACCCGGGCGAGCTGGTGCGCACCGACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 261939 TGGTGGAGGTGCTGGCCGACCACCCGGGCGAGCTGGTGCGCACCGACAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCCAACTTCCTCTGCTCCGTGCTGCCTACGCACTGGCGCTGCAACAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 261989 CCCAACTTCCTCTGCTCCGTGCTGCCTACGCACTGGCGCTGCAACAAGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTGCCCATCGCTTTCAAG         GTGGTGGCCCTAGGGGATGTTC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 262039 CCTGCCCATCGCTTTCAAGGTA...TAGGTGGTGGCCCTAGGGGATGTTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CAGATGGCACTCTGGTCACTGTGATGGCTGGCAATGATGAAAACTACTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 268209 CAGATGGCACTCTGGTCACTGTGATGGCTGGCAATGATGAAAACTACTCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCTGAGCTGAGAAATGCTACCGCAGCCATGAAGAACCAGGTTGCAAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 268259 GCTGAGCTGAGAAATGCTACCGCAGCCATGAAGAACCAGGTTGCAAGATT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TAATGACCTCAGGTTTGTCGGTCGAAGTGGAAGAG         GGAAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 268309 TAATGACCTCAGGTTTGTCGGTCGAAGTGGAAGAGGTA...CAGGGAAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GCTTCACTCTGACCATCACTGTCTTCACAAACCCACCGCAAGTCGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 289328 GCTTCACTCTGACCATCACTGTCTTCACAAACCCACCGCAAGTCGCCACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TACCACAGAGCCATCAAAATCACAGTGGATGGGCCCCGAGAACCTCGAA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 289378 TACCACAGAGCCATCAAAATCACAGTGGATGGGCCCCGAGAACCTCGAAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    614         GACATCGGCAGAAACTAGATGATCAGACCAAGCCCGGGAGCT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 289428 TA...TAGGACATCGGCAGAAACTAGATGATCAGACCAAGCCCGGGAGCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGTCCTTTTCCGAGCGGCTCAGTGAACTGGAGCAGCTGCGGCGCACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 314341 TGTCCTTTTCCGAGCGGCTCAGTGAACTGGAGCAGCTGCGGCGCACAGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ATGAGGGTCAGCCCACACCACCCAGCCCCCACGCCCAACCCTCGTGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 314391 ATGAGGGTCAGCCCACACCACCCAGCCCCCACGCCCAACCCTCGTGCCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CCTGAACCACTCCACTGCCTTTAACCCTCAGCCTCAGAGTCAGATGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 314441 CCTGAACCACTCCACTGCCTTTAACCCTCAGCCTCAGAGTCAGATGCAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806          ATACAAGGCAGATCCAACCATCCCCACCGTGGTCCTACGAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 314491 GTA...CAGATACAAGGCAGATCCAACCATCCCCACCGTGGTCCTACGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CAGTCCTACCAATACCTGGGATCCATTGCCTCTCCTTCTGTGCACCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 349479 CAGTCCTACCAATACCTGGGATCCATTGCCTCTCCTTCTGTGCACCCAGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AACGCCCATTTCACCTGGACGTGCCAGCGGCATGACAACCCTCTCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 349529 AACGCCCATTTCACCTGGACGTGCCAGCGGCATGACAACCCTCTCTGCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 AACTTTCCAGTCGACTCTCAA         CGGCACCCGACCTGACAGCG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 349579 AACTTTCCAGTCGACTCTCAAGTA...CAGCGGCACCCGACCTGACAGCG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TTCAGCGACCCGCGCCAGTTCCCCGCGCTGCCCTCCATCTCCGACCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 356310 TTCAGCGACCCGCGCCAGTTCCCCGCGCTGCCCTCCATCTCCGACCCCCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CATGCACTATCCAGGCGCCTTCACCTACTCCCCGACGCCGGTCACCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 356360 CATGCACTATCCAGGCGCCTTCACCTACTCCCCGACGCCGGTCACCTCGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 GCATCGGCATCGGCATGTCGGCCATGGGCTCGGCCACGCGCTACCACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 356410 GCATCGGCATCGGCATGTCGGCCATGGGCTCGGCCACGCGCTACCACACC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 TACCTGCCGCCGCCCTACCCCGGCTCGTCGCAAGCGCAGGGAGGCCCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 356460 TACCTGCCGCCGCCCTACCCCGGCTCGTCGCAAGCGCAGGGAGGCCCGTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CCAAGCCAGCTCGCCCTCCTACCACCTGTACTACGGCGCCTCGGCCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 356510 CCAAGCCAGCTCGCCCTCCTACCACCTGTACTACGGCGCCTCGGCCGGCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 CCTACCAGTTCTCCATGGTGGGCGGCGAGCGCTCGCCGCCGCGCATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 356560 CCTACCAGTTCTCCATGGTGGGCGGCGAGCGCTCGCCGCCGCGCATCCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 CCGCCCTGCACCAACGCCTCCACCGGCTCCGCGCTGCTCAACCCCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 356610 CCGCCCTGCACCAACGCCTCCACCGGCTCCGCGCTGCTCAACCCCAGCCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 CCCGAACCAGAGCGACGTGGTGGAGGCCGAGGGCAGCCACAGCAACTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 356660 CCCGAACCAGAGCGACGTGGTGGAGGCCGAGGGCAGCCACAGCAACTCCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 CCACCAACATGGCGCCCTCCGCGCGCCTGGAGGAGGCCGTGTGGAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 356710 CCACCAACATGGCGCCCTCCGCGCGCCTGGAGGAGGCCGTGTGGAGGCCC

   1500 
   1438 TAC
        |||
 356760 TAC

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