Result of FASTA (ccds) for pF1KB3232
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3232, 713 aa
  1>>>pF1KB3232 713 - 713 aa - 713 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3092+/-0.0011; mu= 10.5921+/- 0.065
 mean_var=181.2332+/-37.176, 0's: 0 Z-trim(108.4): 195  B-trim: 172 in 1/52
 Lambda= 0.095270
 statistics sampled from 9992 (10217) to 9992 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.672), E-opt: 0.2 (0.314), width:  16
 Scan time:  3.220

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1448.1 LRRN2 gene_id:10446|Hs108|chr1          ( 713) 4794 672.3 6.8e-193
CCDS33685.1 LRRN1 gene_id:57633|Hs108|chr3         ( 716) 2174 312.2 1.7e-84
CCDS5754.1 LRRN3 gene_id:54674|Hs108|chr7          ( 708) 2134 306.7 7.7e-83
CCDS10446.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16        ( 605)  450 75.2 3.3e-13
CCDS53982.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16        ( 643)  450 75.2 3.4e-13
CCDS61194.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12          ( 883)  441 74.1   1e-12
CCDS3306.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3        ( 581)  428 72.1 2.6e-12
CCDS46984.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3       ( 587)  428 72.1 2.6e-12
CCDS9000.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12           ( 907)  419 71.1 8.3e-12
CCDS10514.1 VASN gene_id:114990|Hs108|chr16        ( 673)  412 70.0 1.3e-11
CCDS31449.1 LGR4 gene_id:55366|Hs108|chr11         ( 951)  407 69.5 2.7e-11


>>CCDS1448.1 LRRN2 gene_id:10446|Hs108|chr1               (713 aa)
 initn: 4794 init1: 4794 opt: 4794  Z-score: 3576.6  bits: 672.3 E(32554): 6.8e-193
Smith-Waterman score: 4794; 99.9% identity (100.0% similar) in 713 aa overlap (1-713:1-713)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MRLLVAPLLLAWVAGATATVPVVPWHVPCPPQCACQIRPWYTPRSSYREATTVDCNDLFL
       ::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MRLLVAPLLLAWVAGATAAVPVVPWHVPCPPQCACQIRPWYTPRSSYREATTVDCNDLFL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 TAVPPALPAGTQTLLLQSNSIVRVDQSELGYLANLTELDLSQNSFSDARDCDFHALPQLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TAVPPALPAGTQTLLLQSNSIVRVDQSELGYLANLTELDLSQNSFSDARDCDFHALPQLL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 SLHLEENQLTRLEDHSFAGLASLQELYLNHNQLYRIAPRAFSGLSNLLRLHLNSNLLRAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SLHLEENQLTRLEDHSFAGLASLQELYLNHNQLYRIAPRAFSGLSNLLRLHLNSNLLRAI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 DSRWFEMLPNLEILMIGGNKVDAILDMNFRPLANLRSLVLAGMNLREISDYALEGLQSLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DSRWFEMLPNLEILMIGGNKVDAILDMNFRPLANLRSLVLAGMNLREISDYALEGLQSLE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 SLSFYDNQLARVPRRALEQVPGLKFLDLNKNPLQRVGPGDFANMLHLKELGLNNMEELVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SLSFYDNQLARVPRRALEQVPGLKFLDLNKNPLQRVGPGDFANMLHLKELGLNNMEELVS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 IDKFALVNLPELTKLDITNNPRLSFIHPRAFHHLPQMETLMLNNNALSALHQQTVESLPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IDKFALVNLPELTKLDITNNPRLSFIHPRAFHHLPQMETLMLNNNALSALHQQTVESLPN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 LQEVGLHGNPIRCDCVIRWANATGTRVRFIEPQSTLCAEPPDLQRLPVREVPFREMTDHC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LQEVGLHGNPIRCDCVIRWANATGTRVRFIEPQSTLCAEPPDLQRLPVREVPFREMTDHC
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 LPLISPRSFPPSLQVASGESMVLHCRALAEPEPEIYWVTPAGLRLTPAHAGRRYRVYPEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LPLISPRSFPPSLQVASGESMVLHCRALAEPEPEIYWVTPAGLRLTPAHAGRRYRVYPEG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 TLELRRVTAEEAGLYTCVAQNLVGADTKTVSVVVGRALLQPGRDEGQGLELRVQETHPYH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TLELRRVTAEEAGLYTCVAQNLVGADTKTVSVVVGRALLQPGRDEGQGLELRVQETHPYH
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 ILLSWVTPPNTVSTNLTWSSASSLRGQGATALARLPRGTHSYNITRLLQATEYWACLQVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ILLSWVTPPNTVSTNLTWSSASSLRGQGATALARLPRGTHSYNITRLLQATEYWACLQVA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 FADAHTQLACVWARTKEATSCHRALGDRPGLIAILALAVLLLAAGLAAHLGTGQPRKGVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FADAHTQLACVWARTKEATSCHRALGDRPGLIAILALAVLLLAAGLAAHLGTGQPRKGVG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710   
pF1KB3 GRRPLPPAWAFWGWSAPSVRVVSAPLVLPWNPGRKLPRSSEGETLLPPLSQNS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GRRPLPPAWAFWGWSAPSVRVVSAPLVLPWNPGRKLPRSSEGETLLPPLSQNS
              670       680       690       700       710   

>>CCDS33685.1 LRRN1 gene_id:57633|Hs108|chr3              (716 aa)
 initn: 1923 init1: 1724 opt: 2174  Z-score: 1630.4  bits: 312.2 E(32554): 1.7e-84
Smith-Waterman score: 2174; 55.7% identity (79.1% similar) in 592 aa overlap (29-618:32-617)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB3   MRLLVAPLLLAWVAGATATVPVVPWHVPCPPQCACQIRPWYTPRSSYREATTVDCNDL
                                     ::  :.:.::::.::.:.::::::::::::
CCDS33 ARMSFVIAACQLVLGLLMTSLTESSIQNSECPQLCVCEIRPWFTPQSTYREATTVDCNDL
              10        20        30        40        50        60 

       60        70        80         90       100       110       
pF1KB3 FLTAVPPALPAGTQTLLLQSNSIVR-VDQSELGYLANLTELDLSQNSFSDARDCDFHALP
        :: .:  : . ::.::::::.:.. ::  ::  : ::::::.:::.:.. ..  .  : 
CCDS33 RLTRIPSNLSSDTQVLLLQSNNIAKTVD--ELQQLFNLTELDFSQNNFTNIKEVGLANLT
              70        80          90       100       110         

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB3 QLLSLHLEENQLTRLEDHSFAGLASLQELYLNHNQLYRIAPRAFSGLSNLLRLHLNSNLL
       :: .:::::::.:.. :. .  :..:::::.::::.  :. .::.::.:::::::::: :
CCDS33 QLTTLHLEENQITEMTDYCLQDLSNLQELYINHNQISTISAHAFAGLKNLLRLHLNSNKL
     120       130       140       150       160       170         

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB3 RAIDSRWFEMLPNLEILMIGGNKVDAILDMNFRPLANLRSLVLAGMNLREISDYALEGLQ
       ..::::::.  ::::::::: : : .::::::.::::::::::::: : .:   :: ::.
CCDS33 KVIDSRWFDSTPNLEILMIGENPVIGILDMNFKPLANLRSLVLAGMYLTDIPGNALVGLD
     180       190       200       210       220       230         

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB3 SLESLSFYDNQLARVPRRALEQVPGLKFLDLNKNPLQRVGPGDFANMLHLKELGLNNMEE
       ::::::::::.:..::. ::..::.::::::::::....  ::: :::.:::::.::: :
CCDS33 SLESLSFYDNKLVKVPQLALQKVPNLKFLDLNKNPIHKIQEGDFKNMLRLKELGINNMGE
     240       250       260       270       280       290         

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB3 LVSIDKFALVNLPELTKLDITNNPRLSFIHPRAFHHLPQMETLMLNNNALSALHQQTVES
       :::.:..:: ::::::::. ::::.::.::  ::. .: .:.::::::::.:..:.::::
CCDS33 LVSVDRYALDNLPELTKLEATNNPKLSYIHRLAFRSVPALESLMLNNNALNAIYQKTVES
     300       310       320       330       340       350         

       360       370       380       390       400       410       
pF1KB3 LPNLQEVGLHGNPIRCDCVIRWANATGTRVRFIEPQSTLCAEPPDLQRLPVREVPFREMT
       ::::.:...:.::.::::::.: :.. : .::.:: : .:: ::. .   :.:: ... .
CCDS33 LPNLREISIHSNPLRCDCVIHWINSNKTNIRFMEPLSMFCAMPPEYKGHQVKEVLIQDSS
     360       370       380       390       400       410         

       420       430       440       450       460       470       
pF1KB3 DHCLPLISPRSFPPSLQVASGESMVLHCRALAEPEPEIYWVTPAGLRLTPAHAGRRYRVY
       ..:::.::  :::  :.:  : .. : :::.:::::::::::: : ..:    . .:.. 
CCDS33 EQCLPMISHDSFPNRLNVDIGTTVFLDCRAMAEPEPEIYWVTPIGNKITVETLSDKYKLS
     420       430       440       450       460       470         

       480       490       500       510       520       530       
pF1KB3 PEGTLELRRVTAEEAGLYTCVAQNLVGADTKTVSVVVGRALLQPGRDEGQGLELRVQETH
        :::::.  .  :..: :::::::. ::::..... :. .::    :  : :.. :..:.
CCDS33 SEGTLEISNIQIEDSGRYTCVAQNVQGADTRVATIKVNGTLL----DGTQVLKIYVKQTE
     480       490       500       510       520           530     

       540       550       560        570       580       590      
pF1KB3 PYHILLSWVTPPNTVSTNLTWSSAS-SLRGQGATALARLPRGTHSYNITRLLQATEYWAC
        . ::.:: .  :....:: ::::. .. .   :  ::.:  .: ::.:.:  .:.: .:
CCDS33 SHSILVSWKVNSNVMTSNLKWSSATMKIDNPHITYTARVPVDVHEYNLTHLQPSTDYEVC
         540       550       560       570       580       590     

        600       610       620       630       640       650      
pF1KB3 LQVAFADAHTQLACVWARTKEATSCHRALGDRPGLIAILALAVLLLAAGLAAHLGTGQPR
       : :.    .:: .:: . ::.:                                      
CCDS33 LTVSNIHQQTQKSCVNVTTKNAAFAVDISDQETSTALAAVMGSMFAVISLASIAVYFAKR
         600       610       620       630       640       650     

>>CCDS5754.1 LRRN3 gene_id:54674|Hs108|chr7               (708 aa)
 initn: 2329 init1: 1738 opt: 2134  Z-score: 1600.7  bits: 306.7 E(32554): 7.7e-83
Smith-Waterman score: 2134; 52.1% identity (77.6% similar) in 612 aa overlap (7-616:5-612)

               10          20        30        40        50        
pF1KB3 MRLLVAPLLLAWVAG--ATATVPVVPWHVPCPPQCACQIRPWYTPRSSYREATTVDCNDL
             :: .  . :   :. : .:  .: ::  :.:.::::.:::: : ::.:::::::
CCDS57   MKDMPLRIHVLLGLAITTLVQAVDKKVDCPRLCTCEIRPWFTPRSIYMEASTVDCNDL
                 10        20        30        40        50        

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB3 FLTAVPPALPAGTQTLLLQSNSIVRVDQSELGYLANLTELDLSQNSFSDARDCDFHALPQ
        : . :  :::.:: ::::.:.:.... :   . .::: ::::::..:.. . . . .::
CCDS57 GLLTFPARLPANTQILLLQTNNIAKIEYST-DFPVNLTGLDLSQNNLSSVTNINVKKMPQ
       60        70        80         90       100       110       

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB3 LLSLHLEENQLTRLEDHSFAGLASLQELYLNHNQLYRIAPRAFSGLSNLLRLHLNSNLLR
       :::..::::.::.: .. .. :..:::::.::: :  :.: :: :: :::::::::: :.
CCDS57 LLSVYLEENKLTELPEKCLSELSNLQELYINHNLLSTISPGAFIGLHNLLRLHLNSNRLQ
       120       130       140       150       160       170       

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB3 AIDSRWFEMLPNLEILMIGGNKVDAILDMNFRPLANLRSLVLAGMNLREISDYALEGLQS
        :.:.::. :::::::::: : .  : ::::.:: ::::::.::.:: :: : :: ::..
CCDS57 MINSKWFDALPNLEILMIGENPIIRIKDMNFKPLINLRSLVIAGINLTEIPDNALVGLEN
       180       190       200       210       220       230       

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB3 LESLSFYDNQLARVPRRALEQVPGLKFLDLNKNPLQRVGPGDFANMLHLKELGLNNMEEL
       :::.:::::.: .::. ::..: .::::::::::..:.  :::.:::::::::.::: ::
CCDS57 LESISFYDNRLIKVPHVALQKVVNLKFLDLNKNPINRIRRGDFSNMLHLKELGINNMPEL
       240       250       260       270       280       290       

      300       310       320       330       340       350        
pF1KB3 VSIDKFALVNLPELTKLDITNNPRLSFIHPRAFHHLPQMETLMLNNNALSALHQQTVESL
       .:::..:. :::.: :.. :::::::.::: :: .::..:.::::.::::::.. :.:::
CCDS57 ISIDSLAVDNLPDLRKIEATNNPRLSYIHPNAFFRLPKLESLMLNSNALSALYHGTIESL
       300       310       320       330       340       350       

      360       370       380       390       400       410        
pF1KB3 PNLQEVGLHGNPIRCDCVIRWANATGTRVRFIEPQSTLCAEPPDLQRLPVREVPFREMTD
       :::.:...:.::::::::::: : . : .::.::.: .:..::..:   ::.: ::.: .
CCDS57 PNLKEISIHSNPIRCDCVIRWMNMNKTNIRFMEPDSLFCVDPPEFQGQNVRQVHFRDMME
       360       370       380       390       400       410       

      420       430       440       450       460       470        
pF1KB3 HCLPLISPRSFPPSLQVASGESMVLHCRALAEPEPEIYWVTPAGLRLTPAHAGRRYRVYP
        :::::.:.::: .:.: .:  . .:::: :::.:::::.::.: .: :     .. :. 
CCDS57 ICLPLIAPESFPSNLNVEAGSYVSFHCRATAEPQPEIYWITPSGQKLLPNTLTDKFYVHS
       420       430       440       450       460       470       

      480       490       500       510       520       530        
pF1KB3 EGTLELRRVTAEEAGLYTCVAQNLVGADTKTVSVVVGRALLQPGRDEGQGLELRVQETHP
       ::::..  :: .:.:::::.: :::::: :.: . :  .. :   :.. .:...... . 
CCDS57 EGTLDINGVTPKEGGLYTCIATNLVGADLKSVMIKVDGSFPQ---DNNGSLNIKIRDIQA
       480       490       500       510          520       530    

      540       550       560       570       580       590        
pF1KB3 YHILLSWVTPPNTVSTNLTWSSASSLRGQGATALARLPRGTHSYNITRLLQATEYWACLQ
         .:.:: .  . ..... :..  . ... :.  ::.:  .. ::.:.:  .:::  :..
CCDS57 NSVLVSWKASSKILKSSVKWTAFVKTENSHAAQSARIPSDVKVYNLTHLNPSTEYKICID
          540       550       560       570       580       590    

      600       610       620       630       640       650        
pF1KB3 VAFADAHTQLACVWARTKEATSCHRALGDRPGLIAILALAVLLLAAGLAAHLGTGQPRKG
       .     ...  :: . ::                                          
CCDS57 IPTIYQKNRKKCVNVTTKGLHPDQKEYEKNNTTTLMACLGGLLGIIGVICLISCLSPEMN
          600       610       620       630       640       650    

>>CCDS10446.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16             (605 aa)
 initn: 336 init1: 336 opt: 450  Z-score: 350.7  bits: 75.2 E(32554): 3.3e-13
Smith-Waterman score: 450; 30.0% identity (58.6% similar) in 377 aa overlap (3-372:8-375)

                    10               20        30        40        
pF1KB3      MRLLVAPLLLAWVA-------GATATVPVVPWHVPCPPQCACQIRPWYTPRSSYR
              : .: :::.:::       ::   .:       ::  :.:.    :   .   
CCDS10 MALRKGGLALALLLLSWVALGPRSLEGADPGTPGEAEGPACPAACVCS----YDDDA---
               10        20        30        40            50      

       50        60        70        80        90       100        
pF1KB3 EATTVDCNDLFLTAVPPALPAGTQTLLLQSNSIVRVDQSELGYLANLTELDLSQNSFSDA
       .  .: :..  :: .: ..:.:::.: :..:..  :  . .  :..:  :.:. ..... 
CCDS10 DELSVFCSSRNLTRLPDGVPGGTQALWLDGNNLSSVPPAAFQNLSSLGFLNLQGGQLGSL
            60        70        80        90       100       110   

      110       120       130       140       150       160        
pF1KB3 RDCDFHALPQLLSLHLEENQLTRLEDHSFAGLASLQELYLNHNQLYRIAPRAFSGLSNLL
       .   . .: .:  ::::.:::  :   .::   .:  : :..:.: :.    : ::..: 
CCDS10 EPQALLGLENLCHLHLERNQLRSLALGTFAHTPALASLGLSNNRLSRLEDGLFEGLGSLW
           120       130       140       150       160       170   

      170       180       190       200       210       220        
pF1KB3 RLHLNSNLLRAIDSRWFEMLPNLEILMIGGNKVDAILDMNFRPLANLRSLVLAGMNLREI
        :.:. : : .. .  :. : .:. :...::..  .    :  ::.:: : :.   :: :
CCDS10 DLNLGWNSLAVLPDAAFRGLGSLRELVLAGNRLAYLQPALFSGLAELRELDLSRNALRAI
           180       190       200       210       220       230   

      230       240       250       260       270       280        
pF1KB3 SDYALEGLQSLESLSFYDNQLARVPRRALEQVPGLKFLDLNKNPLQRVGPGDFANMLHLK
       .  ..  :  :..: .  : .: :   :.  . .:..:::..: .  .    : ..: :.
CCDS10 KANVFVQLPRLQKLYLDRNLIAAVAPGAFLGLKALRWLDLSHNRVAGLLEDTFPGLLGLR
           240       250       260       270       280       290   

      290       300       310       320       330       340        
pF1KB3 ELGLNNMEELVSIDKFALVNLPELTKLDITNNPRLSFIHPRAFHHLPQMETLMLNNNALS
        : :.. . ..:.   .. .:  : .:.. .: :.  .  :.:. : :.:.: :..: :.
CCDS10 VLRLSH-NAIASLRPRTFKDLHFLEELQLGHN-RIRQLAERSFEGLGQLEVLTLDHNQLQ
            300       310       320        330       340       350 

      350       360       370       380       390       400        
pF1KB3 ALHQQTVESLPNLQEVGLHGNPIRCDCVIRWANATGTRVRFIEPQSTLCAEPPDLQRLPV
        ..  .  .: :.  ..: :: .:                                    
CCDS10 EVKAGAFLGLTNVAVMNLSGNCLRNLPEQVFRGLGKLHSLHLEGSCLGRIRPHTFTGLSG
             360       370       380       390       400       410 

>>CCDS53982.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16             (643 aa)
 initn: 336 init1: 336 opt: 450  Z-score: 350.3  bits: 75.2 E(32554): 3.4e-13
Smith-Waterman score: 450; 30.0% identity (58.6% similar) in 377 aa overlap (3-372:46-413)

                                           10               20     
pF1KB3                             MRLLVAPLLLAWVA-------GATATVPVVPW
                                     : .: :::.:::       ::   .:    
CCDS53 ERRFRLCWYQAHSGRALLGPPPQASPPAGGLALALLLLSWVALGPRSLEGADPGTPGEAE
          20        30        40        50        60        70     

          30        40        50        60        70        80     
pF1KB3 HVPCPPQCACQIRPWYTPRSSYREATTVDCNDLFLTAVPPALPAGTQTLLLQSNSIVRVD
          ::  :.:.    :   .   .  .: :..  :: .: ..:.:::.: :..:..  : 
CCDS53 GPACPAACVCS----YDDDA---DELSVFCSSRNLTRLPDGVPGGTQALWLDGNNLSSVP
          80            90          100       110       120        

          90       100       110       120       130       140     
pF1KB3 QSELGYLANLTELDLSQNSFSDARDCDFHALPQLLSLHLEENQLTRLEDHSFAGLASLQE
        . .  :..:  :.:. ..... .   . .: .:  ::::.:::  :   .::   .:  
CCDS53 PAAFQNLSSLGFLNLQGGQLGSLEPQALLGLENLCHLHLERNQLRSLALGTFAHTPALAS
      130       140       150       160       170       180        

         150       160       170       180       190       200     
pF1KB3 LYLNHNQLYRIAPRAFSGLSNLLRLHLNSNLLRAIDSRWFEMLPNLEILMIGGNKVDAIL
       : :..:.: :.    : ::..:  :.:. : : .. .  :. : .:. :...::..  . 
CCDS53 LGLSNNRLSRLEDGLFEGLGSLWDLNLGWNSLAVLPDAAFRGLGSLRELVLAGNRLAYLQ
      190       200       210       220       230       240        

         210       220       230       240       250       260     
pF1KB3 DMNFRPLANLRSLVLAGMNLREISDYALEGLQSLESLSFYDNQLARVPRRALEQVPGLKF
          :  ::.:: : :.   :: :.  ..  :  :..: .  : .: :   :.  . .:..
CCDS53 PALFSGLAELRELDLSRNALRAIKANVFVQLPRLQKLYLDRNLIAAVAPGAFLGLKALRW
      250       260       270       280       290       300        

         270       280       290       300       310       320     
pF1KB3 LDLNKNPLQRVGPGDFANMLHLKELGLNNMEELVSIDKFALVNLPELTKLDITNNPRLSF
       :::..: .  .    : ..: :. : :.. . ..:.   .. .:  : .:.. .: :.  
CCDS53 LDLSHNRVAGLLEDTFPGLLGLRVLRLSH-NAIASLRPRTFKDLHFLEELQLGHN-RIRQ
      310       320       330        340       350       360       

         330       340       350       360       370       380     
pF1KB3 IHPRAFHHLPQMETLMLNNNALSALHQQTVESLPNLQEVGLHGNPIRCDCVIRWANATGT
       .  :.:. : :.:.: :..: :. ..  .  .: :.  ..: :: .:             
CCDS53 LAERSFEGLGQLEVLTLDHNQLQEVKAGAFLGLTNVAVMNLSGNCLRNLPEQVFRGLGKL
        370       380       390       400       410       420      

         390       400       410       420       430       440     
pF1KB3 RVRFIEPQSTLCAEPPDLQRLPVREVPFREMTDHCLPLISPRSFPPSLQVASGESMVLHC
                                                                   
CCDS53 HSLHLEGSCLGRIRPHTFTGLSGLRRLFLKDNGLVGIEEQSLWGLAELLELDLTSNQLTH
        430       440       450       460       470       480      

>>CCDS61194.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12               (883 aa)
 initn: 420 init1: 311 opt: 441  Z-score: 341.9  bits: 74.1 E(32554): 1e-12
Smith-Waterman score: 452; 30.5% identity (58.4% similar) in 370 aa overlap (3-371:9-362)

                     10        20        30        40        50    
pF1KB3       MRLLVAPLLLAWVAGATATVPVVPWHVPCPPQCACQIRPWYTPRSSYREATTVD
               ::  :.::  ..:...    :  .  :: .: :.      : .  :    ::
CCDS61 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLR-GCPTHCHCE------PDG--RMLLRVD
               10        20        30         40                50 

           60        70        80        90       100       110    
pF1KB3 CNDLFLTAVPPALPAGTQTLLLQSNSIVRVDQSELGYLANLTELDLSQNSFSDARDCDFH
       :.:: :. .:  : . :. : :. :.: ..  . :  :  : :: :. :...      : 
CCDS61 CSDLGLSELPSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFT
              60        70        80        90       100       110 

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB3 ALPQLLSLHLEENQLTRLEDHSFAGLASLQELYLNHNQLYRIAPRAFSGLSNLLRLHLNS
       .: .:  : :..::: ..  ... .: ::: : :. :..  . :  :::: .: .: :..
CCDS61 GLYSLKVLMLQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDD
             120       130       140       150       160       170 

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB3 NLLRAIDSRWFEMLPNLEILMIGGNKVDAILDMNFRPLANLRSLVLAGMNLREISDYALE
       : :  :  . :. :  :. . .. ::.  : :. :  :..:  : : .  .. ..   ..
CCDS61 NALTEIPVQAFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFD
             180       190       200       210       220       230 

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB3 GLQSLESLSFYDNQLARVPRRALEQVPGLKFLDLNKNPLQRVGPGDFANMLHLKELGLNN
       ::.:::.:..  :.: . :  :.. . .:: : .  ::.: :: . : .. .:. : ::.
CCDS61 GLHSLETLDLNYNNLDEFPT-AIRTLSNLKELHFYDNPIQFVGRSAFQHLPELRTLTLNG
             240       250        260       270       280       290

          300        310       320       330       340       350   
pF1KB3 MEELVSI-DKFALVNLPELTKLDITNNPRLSFIHPRAFHHLPQMETLMLNNNALSALHQQ
         ... . :  . .::  ::     .. ..: .   . ..::....: :. : :  : . 
CCDS61 ASQITEFPDLTGTANLESLT----LTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLSYNLLEDLPSF
              300       310           320       330       340      

           360       370       380       390       400       410   
pF1KB3 TVESLPNLQEVGLHGNPIRCDCVIRWANATGTRVRFIEPQSTLCAEPPDLQRLPVREVPF
       .: .  .::.. :. : :                                          
CCDS61 SVCQ--KLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFSTLPSLIKLD
        350         360       370       380       390       400    

>>CCDS3306.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3             (581 aa)
 initn: 590 init1: 333 opt: 428  Z-score: 334.5  bits: 72.1 E(32554): 2.6e-12
Smith-Waterman score: 461; 30.4% identity (57.6% similar) in 368 aa overlap (29-372:25-378)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MRLLVAPLLLAWVAGATATVPVVPWHVPCPPQCACQIRPWYTPRSSYREATTVDCNDLFL
                                   :: .:.:.            .:. :.:.   .
CCDS33     MPLKHYLLLLVGCQAWGAGLAYHGCPSECTCS------------RASQVECTGARI
                   10        20        30                    40    

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pF1KB3 TAVPPALPAGTQTLLLQSNSIVRVDQSELGYLANLTELDLSQNSFSDARDCDFHALPQLL
       .:::  :: ....: . .. :.....: .  .. :  : . .: .:      :. : .: 
CCDS33 VAVPTPLPWNAMSLQILNTHITELNESPFLNISALIALRIEKNELSRITPGAFRNLGSLR
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              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 SLHLEENQLTRLEDHSFAGLASLQELYLNHNQLYRIAPRAFSGLSNLLRLHLNSNLLRAI
        : : .:.:  :    : :: ::. : :. ::: .: :  ::  ::: .:.:..: :. :
CCDS33 YLSLANNKLQVLPIGLFQGLDSLESLLLSSNQLLQIQPAHFSQCSNLKELQLHGNHLEYI
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              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 DSRWFEMLPNLEILMIGGNKVDAILDMNFRPLANLRSLVLAGMNLREISDYALEGLQSLE
        .  :. : .:  : .: :..  :    :. :.::. : :    : .:   ...:: .:.
CCDS33 PDGAFDHLVGLTKLNLGKNSLTHISPRVFQHLGNLQVLRLYENRLTDIPMGTFDGLVNLQ
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                                      250       260       270      
pF1KB3 SLSFYDNQL------------------------ARVPRRALEQVPGLKFLDLNKNPLQRV
        :.. .::.                        ...:  .. :.: :. : :  : :...
CCDS33 ELALQQNQIGLLSPGLFHNNHNLQRLYLSNNHISQLPPSVFMQLPQLNRLTLFGNSLKEL
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pF1KB3 GPGDFANMLHLKELGLNNMEELVSIDKFALVNLPELTKLDITNNPRLSFIHPRAFHHLPQ
       .:: :. : .:.:: : . ... :.   .. :: .:  : .. : ..::: : ::. : .
CCDS33 SPGIFGPMPNLRELWLYD-NHISSLPDNVFSNLRQLQVLILSRN-QISFISPGAFNGLTE
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pF1KB3 METLMLNNNALSALHQQTVESLPNLQEVGLHGNPIRCDCVIRWANATGTRVRFIEPQSTL
       .. : :..:::. :  .. . : :::...:..: .:                        
CCDS33 LRELSLHTNALQDLDGNVFRMLANLQNISLQNNRLRQLPGNIFANVNGLMAIQLQNNQLE
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pF1KB3 CAEPPDLQRLPVREVPFREMTDHCLPLISPRSFPPSLQVASGESMVLHCRALAEPEPEIY
                                                                   
CCDS33 NLPLGIFDHLGKLCELRLYDNPWRCDSDILPLRNWLLLNQPRLGTDTVPVCFSPANVRGQ
            410       420       430       440       450       460  

>>CCDS46984.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3            (587 aa)
 initn: 590 init1: 333 opt: 428  Z-score: 334.5  bits: 72.1 E(32554): 2.6e-12
Smith-Waterman score: 461; 30.4% identity (57.6% similar) in 368 aa overlap (29-372:31-384)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB3   MRLLVAPLLLAWVAGATATVPVVPWHVPCPPQCACQIRPWYTPRSSYREATTVDCNDL
                                     :: .:.:.            .:. :.:.  
CCDS46 MPLDKAMPLKHYLLLLVGCQAWGAGLAYHGCPSECTCS------------RASQVECTGA
               10        20        30                    40        

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pF1KB3 FLTAVPPALPAGTQTLLLQSNSIVRVDQSELGYLANLTELDLSQNSFSDARDCDFHALPQ
        ..:::  :: ....: . .. :.....: .  .. :  : . .: .:      :. : .
CCDS46 RIVAVPTPLPWNAMSLQILNTHITELNESPFLNISALIALRIEKNELSRITPGAFRNLGS
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pF1KB3 LLSLHLEENQLTRLEDHSFAGLASLQELYLNHNQLYRIAPRAFSGLSNLLRLHLNSNLLR
       :  : : .:.:  :    : :: ::. : :. ::: .: :  ::  ::: .:.:..: :.
CCDS46 LRYLSLANNKLQVLPIGLFQGLDSLESLLLSSNQLLQIQPAHFSQCSNLKELQLHGNHLE
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pF1KB3 AIDSRWFEMLPNLEILMIGGNKVDAILDMNFRPLANLRSLVLAGMNLREISDYALEGLQS
        : .  :. : .:  : .: :..  :    :. :.::. : :    : .:   ...:: .
CCDS46 YIPDGAFDHLVGLTKLNLGKNSLTHISPRVFQHLGNLQVLRLYENRLTDIPMGTFDGLVN
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pF1KB3 LESLSFYDNQL------------------------ARVPRRALEQVPGLKFLDLNKNPLQ
       :. :.. .::.                        ...:  .. :.: :. : :  : :.
CCDS46 LQELALQQNQIGLLSPGLFHNNHNLQRLYLSNNHISQLPPSVFMQLPQLNRLTLFGNSLK
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pF1KB3 RVGPGDFANMLHLKELGLNNMEELVSIDKFALVNLPELTKLDITNNPRLSFIHPRAFHHL
       ...:: :. : .:.:: : . ... :.   .. :: .:  : .. : ..::: : ::. :
CCDS46 ELSPGIFGPMPNLRELWLYD-NHISSLPDNVFSNLRQLQVLILSRN-QISFISPGAFNGL
      290       300        310       320       330        340      

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pF1KB3 PQMETLMLNNNALSALHQQTVESLPNLQEVGLHGNPIRCDCVIRWANATGTRVRFIEPQS
        ... : :..:::. :  .. . : :::...:..: .:                      
CCDS46 TELRELSLHTNALQDLDGNVFRMLANLQNISLQNNRLRQLPGNIFANVNGLMAIQLQNNQ
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pF1KB3 TLCAEPPDLQRLPVREVPFREMTDHCLPLISPRSFPPSLQVASGESMVLHCRALAEPEPE
                                                                   
CCDS46 LENLPLGIFDHLGKLCELRLYDNPWRCDSDILPLRNWLLLNQPRLGTDTVPVCFSPANVR
        410       420       430       440       450       460      

>>CCDS9000.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12                (907 aa)
 initn: 778 init1: 297 opt: 419  Z-score: 325.4  bits: 71.1 E(32554): 8.3e-12
Smith-Waterman score: 444; 28.7% identity (56.4% similar) in 456 aa overlap (3-449:9-419)

                     10        20        30        40        50    
pF1KB3       MRLLVAPLLLAWVAGATATVPVVPWHVPCPPQCACQIRPWYTPRSSYREATTVD
               ::  :.::  ..:...    :  .  :: .: :.      : .  :    ::
CCDS90 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLR-GCPTHCHCE------PDG--RMLLRVD
               10        20        30         40                50 

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pF1KB3 CNDLFLTAVPPALPAGTQTLLLQSNSIVRVDQSELGYLANLTELDLSQNSFSDARDCDFH
       :.:: :. .:  : . :. : :. :.: ..  . :  :  : :: :. :...      : 
CCDS90 CSDLGLSELPSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFT
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          120       130       140       150       160       170    
pF1KB3 ALPQLLSLHLEENQLTRLEDHSFAGLASLQELYLNHNQLYRIAPRAFSGLSNLLRLHLNS
       .: .:  : :..::: ..  ... .: ::: : :. :..  . :  :::: .: .: :..
CCDS90 GLYSLKVLMLQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDD
             120       130       140       150       160       170 

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pF1KB3 NLLRAIDSRWFEMLPNLEILMIGGNKVDAILDMNFRPLANLRSLVLAGMNLREISDYALE
       : :  :        :           :.:     :: :. :....::  ....: :::. 
CCDS90 NALTEI--------P-----------VQA-----FRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFG
                                180            190       200       

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pF1KB3 GLQSLESLSFYDNQLARVPRRALEQVPGLKFLDLNKNPLQRVGPGDFANMLHLKELGLNN
       .:.::  : ...:..  . .. .. . .:. :::: : :..  :  . .. .:::::...
CCDS90 NLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLDLNYNNLDEF-PTAIRTLSNLKELGFHS
       210       220       230       240        250       260      

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pF1KB3 MEELVSIDKFALVNLPELTKLDITNNPRLSFIHPRAFHHLPQMETLMLNNNALSALHQQT
        ... :: . :.:. : :  . . .:: ..:.   ::.:::...:: ::. : .  .   
CCDS90 -NNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNP-IQFVGRSAFQHLPELRTLTLNG-ASQITEFPD
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pF1KB3 VESLPNLQEVGLHGNPIR------CDCVIRWANATGTRVRFIE--PQSTLCAEPPDLQRL
       . .  ::. . : :  :       :. .    ..      ..:  :. ..: .   ::..
CCDS90 LTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNL-QVLDLSYNLLEDLPSFSVCQK---LQKI
           330       340       350        360       370            

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pF1KB3 PVREVPFREM-TDHCLPLISPRSFPPSLQVASGESMVLHCRALAEPEPEIYWVTPAGLRL
        .:.  . :. .:    :.: ::    :..: ..  ..:  :..                
CCDS90 DLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRS----LNLAWNKIAIIHPNAFSTLPSLIKLDLSSNLLS
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pF1KB3 TPAHAGRRYRVYPEGTLELRRVTAEEAGLYTCVAQNLVGADTKTVSVVVGRALLQPGRDE
                                                                   
CCDS90 SFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCCAFGVCENAYKISNQW
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>>CCDS10514.1 VASN gene_id:114990|Hs108|chr16             (673 aa)
 initn: 371 init1: 232 opt: 412  Z-score: 321.9  bits: 70.0 E(32554): 1.3e-11
Smith-Waterman score: 434; 26.9% identity (51.7% similar) in 714 aa overlap (4-697:7-666)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB3    MRLLVAPLLLAWVAGATATVPVVPWHVPCPPQCACQIRPWYTPRSSYREATTVDCND
             :. ::::  . :     : :     ::  : :. .:            :: :. 
CCDS10 MCSRVPLLLPLLLLLALG-----PGVQ---GCPSGCQCS-QPQ-----------TVFCTA
               10             20           30                    40

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pF1KB3 LFLTAVPPALPAGTQTLLLQSNSIVRVDQSELGYLANLTELDLSQNSFSDARDCDFHALP
          :.::  .:  :  : .  :.:. .: . .. : .:  ::::::....  .  :. : 
CCDS10 RQGTTVPRDVPPDTVGLYVFENGITMLDAGSFAGLPGLQLLDLSQNQIASLPSGVFQPLA
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pF1KB3 QLLSLHLEENQLTRLEDHSFAGLASLQELYLNHNQLYRIAPRAFSGLSNLLRLHLNSNLL
       .: .: :  :.: .. ...: ::  :..:::..:.. .: : ::. :. ::.:.:..: :
CCDS10 NLSNLDLTANRLHEITNETFRGLRRLERLYLGKNRIRHIQPGAFDTLDRLLELKLQDNEL
              110       120       130       140       150       160

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pF1KB3 RAIDSRWFEMLPNLEILMIGGNKVDAILDMNFRPLANLRSLVLAGMNLREISDYALEGLQ
       ::.       :: : .: .. :.. : :. ..   ::...: :::..:.....  .  :.
CCDS10 RALPPL---RLPRLLLLDLSHNSLLA-LEPGILDTANVEALRLAGLGLQQLDEGLFSRLR
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pF1KB3 SLESLSFYDNQLARVPRRALEQVPGLKFLDLNKNP-LQRVGPGDFANMLHLKELGLNNME
       .:..:.  :::: :::  ... . ::  : :  :  . .. : :.:..  :.:: ..:. 
CCDS10 NLHDLDVSDNQLERVPP-VIRGLRGLTRLRLAGNTRIAQLRPEDLAGLAALQELDVSNLS
        220       230        240       250       260       270     

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pF1KB3 -ELVSIDKFALVNLPELTKLDITNNPRLSFIHPRAFHHLPQMETLMLNNNALSALHQQTV
        . .  :  .:  .:.:  :  . :: .. . : ..   : ..    ....  :  ..: 
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         .:  :  .. :. .     :    ..::   .: .  :: .   .  :       :. 
CCDS10 CHFPPKNAGRLLLELDYADFGCPATTTTATVPTTRPVVREPTALSSSLAPTWLSPTEPAT
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CCDS10 EAPSPPSTAPPTVGPVPQPQDCPPSTCLNGGTCHLGTRHHLACLCPEGFTGLYCESQMGQ
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CCDS10 GTRPSPTPVTPR--PPRSLTLGIEPVSPTSLRVGLQRYLQGSSVQLRSLRLTYRNLSGPD
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       .   . . ::.  .   . . . . :  : :. .   . . . .:. : . :. : ..::
CCDS10 K---RLVTLRLPASLAEYTV-TQLRPNATYSVCVMPLGPGRVPEGEEACGEAHTPPAVHS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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