seq1 = pF1KB3206.tfa, 2385 bp
seq2 = pF1KB3206/gi568815593f_141108908.tfa (gi568815593f:141108908_141311292), 202385 bp

>pF1KB3206 2385
>gi568815593f:141108908_141311292 (Chr5)

1-2385  (100001-102385)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAAACGGAGGGGCAGGCACTCTGCAGATAAGGCAAGTCCTGCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAAACGGAGGGGCAGGCACTCTGCAGATAAGGCAAGTCCTGCTTTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTTGTTTTGCTGGGAATGTCTCAGGCGGGCTCTGAAACTGGGAACTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTTGTTTTGCTGGGAATGTCTCAGGCGGGCTCTGAAACTGGGAACTTTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGTGATGGAGGAATTGCAGAGCGGGAGCTTTGTAGGAAATTTGGCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGTGATGGAGGAATTGCAGAGCGGGAGCTTTGTAGGAAATTTGGCAAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACCCTGGGACTCGAGGTGAGTGAGCTGTCTTCGCGGGGGGCTCGGGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACCCTGGGACTCGAGGTGAGTGAGCTGTCTTCGCGGGGGGCTCGGGTGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTCTAATGATAACAAAGAGTGTTTGCAGCTGGACACAAACACTGGGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTCTAATGATAACAAAGAGTGTTTGCAGCTGGACACAAACACTGGGGATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCTCCTGAGAGAAATGCTAGACAGGGAGGAGCTCTGTGGCTCCAATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCTCCTGAGAGAAATGCTAGACAGGGAGGAGCTCTGTGGCTCCAATGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCTTGTGTGCTGTATTTCCAAGTGTTAATGAAAAACCCCACGCAGTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCTTGTGTGCTGTATTTCCAAGTGTTAATGAAAAACCCCACGCAGTTTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ACAAATTGAGCTCCAGGTCAGGGATATAAATGATCACTCTCCCGTCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ACAAATTGAGCTCCAGGTCAGGGATATAAATGATCACTCTCCCGTCTTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGAAAAAGAAATGCTCTTAGAAATCCCAGAGAACAGTCCTGTTGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGAAAAAGAAATGCTCTTAGAAATCCCAGAGAACAGTCCTGTTGGTGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGTTCTTGCTTGAAAGTGCAAAGGATTTAGATGTAGGAATCAATGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGTTCTTGCTTGAAAGTGCAAAGGATTTAGATGTAGGAATCAATGCTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AAAAAGCTACACAATAAATCCGAACTCTCATTTCCACGTTAAAATAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AAAAAGCTACACAATAAATCCGAACTCTCATTTCCACGTTAAAATAAGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCAATCCAGACAATAGGAAATACCCTGAGTTAGTTCTGGACAAGGCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCAATCCAGACAATAGGAAATACCCTGAGTTAGTTCTGGACAAGGCGCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GATTATGAAGAGCGCCCGGAGCTCAGTTTCATCCTCACTGCTCTGGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GATTATGAAGAGCGCCCGGAGCTCAGTTTCATCCTCACTGCTCTGGATGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CGGGTCCCCTCCCAGGTCTGGAACTGCCTTGGTCAGGGTGGTGGTTGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CGGGTCCCCTCCCAGGTCTGGAACTGCCTTGGTCAGGGTGGTGGTTGTAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATATTAATGACAACTCCCCTGAGTTTGAGCAGGCTTTTTATGAGGTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ATATTAATGACAACTCCCCTGAGTTTGAGCAGGCTTTTTATGAGGTGAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATTCTGGAGAATAGCATCCTTGGCTCCCTGGTTGTGACCGTCTCAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATTCTGGAGAATAGCATCCTTGGCTCCCTGGTTGTGACCGTCTCAGCCTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGATTTAGACTCTGGAACAAACAGTGAACTATCCTATACCTTTTCCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGATTTAGACTCTGGAACAAACAGTGAACTATCCTATACCTTTTCCCATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCTCAGAAGATATTCGCAAGACATTTGAAATTAATCAAAAGTCTGGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCTCAGAAGATATTCGCAAGACATTTGAAATTAATCAAAAGTCTGGTGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ATTACTTTAACAGCACCTTTGGATTTTGAAGCAATTGAGTCATACTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ATTACTTTAACAGCACCTTTGGATTTTGAAGCAATTGAGTCATACTCAAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 AATCATTCAAGCCACAGATGGGGGAGGACTTTTTGGAAAATCTACAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 AATCATTCAAGCCACAGATGGGGGAGGACTTTTTGGAAAATCTACAGTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GAATTCAGGTGATGGATGTAAACGACAACGCTCCTGAAATCACTGTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GAATTCAGGTGATGGATGTAAACGACAACGCTCCTGAAATCACTGTGTCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TCAATTACCAGTCCAATCCCAGAAAACACTCCAGAGACTGTGGTTATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TCAATTACCAGTCCAATCCCAGAAAACACTCCAGAGACTGTGGTTATGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TTTCAGGATACGAGACAGAGACTCTGGGGACAACGGAAAGATGGTTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TTTCAGGATACGAGACAGAGACTCTGGGGACAACGGAAAGATGGTTTGTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CTATCCCGGAGGACATCCCATTCGTGCTAAAATCTTCGGTAAATAATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CTATCCCGGAGGACATCCCATTCGTGCTAAAATCTTCGGTAAATAATTAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 TACACTTTGGAAACAGAGAGACCGCTGGACAGAGAGAGCAGAGCCGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 TACACTTTGGAAACAGAGAGACCGCTGGACAGAGAGAGCAGAGCCGAGTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CAACATCACCATCACCGTCACCGACTTGGGGACCCCCAGGCTAAAAACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CAACATCACCATCACCGTCACCGACTTGGGGACCCCCAGGCTAAAAACCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 AGCACAACATAACCGTGCTGGTCTCCGACGTCAATGACAACGCCCCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 AGCACAACATAACCGTGCTGGTCTCCGACGTCAATGACAACGCCCCCGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 TTCACCCAAACTTCCTACGCCCTGTTCGTCCGCGAGAACAACAGCCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 TTCACCCAAACTTCCTACGCCCTGTTCGTCCGCGAGAACAACAGCCCCGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CCTGCACATCGGCAGCATCAGCGCCACAGACAGAGACTCGGGCACCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CCTGCACATCGGCAGCATCAGCGCCACAGACAGAGACTCGGGCACCAACG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 CCCAGGTCAACTACTCGCTGCTGCCGTCCCAGGACCCGCACCTGCCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 CCCAGGTCAACTACTCGCTGCTGCCGTCCCAGGACCCGCACCTGCCCCTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 GCCTCCCTGGTCTCCATCAACGCGGACAACGGCCACCTGTTTGCCCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 GCCTCCCTGGTCTCCATCAACGCGGACAACGGCCACCTGTTTGCCCTCAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GTCGCTGGACTACGAGGCCCTGCAGGGGTTCCAGTTCCGCGTGGGCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 GTCGCTGGACTACGAGGCCCTGCAGGGGTTCCAGTTCCGCGTGGGCGCCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 CAGACCACGGCTCCCCGGCTTTGAGCAGCGAGGCGCTGGTGCGCGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 CAGACCACGGCTCCCCGGCTTTGAGCAGCGAGGCGCTGGTGCGCGTGCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 GTGCTGGACGCCAACGACAACTCGCCCTTCGTGCTGTACCCGCTGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 GTGCTGGACGCCAACGACAACTCGCCCTTCGTGCTGTACCCGCTGCAGAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 CGGCTCCGCGCCCTGCACCGAGCTGGTGCCCTGGGCGGCCGAGCCGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 CGGCTCCGCGCCCTGCACCGAGCTGGTGCCCTGGGCGGCCGAGCCGGGCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 ACCTGGTGACCAAGGTGGTGGCGGTGGACGGTGACTCGGGCCAGAACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 ACCTGGTGACCAAGGTGGTGGCGGTGGACGGTGACTCGGGCCAGAACGCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 TGGCTGTCGTACCAGCTGCTCAAGGCCACGGAGCCCGGGCTATTCGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 TGGCTGTCGTACCAGCTGCTCAAGGCCACGGAGCCCGGGCTATTCGGCGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 GTGGGCGCACAATGGCGAGGTGCGCACCGCCAGGCTGCTGAGCGAGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 GTGGGCGCACAATGGCGAGGTGCGCACCGCCAGGCTGCTGAGCGAGCGCG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 ACGCGGCCAAGCACAGGCTGGTGGTGCTGGTCAAGGACAATGGCGAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 ACGCGGCCAAGCACAGGCTGGTGGTGCTGGTCAAGGACAATGGCGAGCCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 CCGCGCTCGGCCACCGCCACGCTGCACGTGCTCCTGGTGGACGGCTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 CCGCGCTCGGCCACCGCCACGCTGCACGTGCTCCTGGTGGACGGCTTCTC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 CCAGCCCTACCTGCCTCTCCCGGAGGCGGCCCCGGCCCAGGCCCAGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 CCAGCCCTACCTGCCTCTCCCGGAGGCGGCCCCGGCCCAGGCCCAGGCCG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 ACTCGCTCACTGTCTACCTGGTGGTGGCGTTGGCCTCAGTGTCGTCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 ACTCGCTCACTGTCTACCTGGTGGTGGCGTTGGCCTCAGTGTCGTCGCTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2101 TTCCTCTTCTCGGTGCTCCTGTTCGTGGCGGTGCGGCTGTGCAGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 TTCCTCTTCTCGGTGCTCCTGTTCGTGGCGGTGCGGCTGTGCAGGAGGAG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2151 CAGGGCGGCCCCGGTCGGTCGCTGCTCGGTGCCTGAGGGCCCCTTTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102151 CAGGGCGGCCCCGGTCGGTCGCTGCTCGGTGCCTGAGGGCCCCTTTCCAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2201 GACATCTGGTGGACGTGAGTGGCACCGGGACCCTGTCCCAGAGCTACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102201 GACATCTGGTGGACGTGAGTGGCACCGGGACCCTGTCCCAGAGCTACCAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2251 TATGAGGTGTGTGTGACTGGAGGCTCCAGGTCAAATAAGTTCAAATTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102251 TATGAGGTGTGTGTGACTGGAGGCTCCAGGTCAAATAAGTTCAAATTTCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2301 GAAACCAATTATCCCCAACTTCCTACCCCAGAGCACAGGTAGTGAAGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102301 GAAACCAATTATCCCCAACTTCCTACCCCAGAGCACAGGTAGTGAAGTCG

   2350     .    :    .    :    .    :    .
   2351 AAGAAAATCCCCCATTTCAGAATAATTTGGGTTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102351 AAGAAAATCCCCCATTTCAGAATAATTTGGGTTTC