FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0407, 2135 aa 1>>>pF1KA0407 2135 - 2135 aa - 2135 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.0008+/-0.00134; mu= -15.6428+/- 0.080 mean_var=527.0645+/-108.393, 0's: 0 Z-trim(112.4): 45 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.055865 statistics sampled from 13129 (13161) to 13129 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.71), E-opt: 0.2 (0.404), width: 16 Scan time: 7.490 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS2765.1 PLXNB1 gene_id:5364|Hs108|chr3 (2135) 14586 1192.5 0 CCDS14729.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX (1909) 3067 264.0 4.4e-69 CCDS55536.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX (1932) 3067 264.0 4.4e-69 CCDS43035.1 PLXNB2 gene_id:23654|Hs108|chr22 (1838) 1671 151.5 3.2e-35 CCDS33847.2 PLXNA1 gene_id:5361|Hs108|chr3 (1896) 1243 117.0 7.9e-25 CCDS14752.1 PLXNA3 gene_id:55558|Hs108|chrX (1871) 1178 111.8 2.9e-23 CCDS33854.1 PLXND1 gene_id:23129|Hs108|chr3 (1925) 1144 109.0 2e-22 CCDS31013.1 PLXNA2 gene_id:5362|Hs108|chr1 (1894) 902 89.5 1.5e-16 CCDS43646.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7 (1894) 892 88.7 2.6e-16 CCDS9049.1 PLXNC1 gene_id:10154|Hs108|chr12 (1568) 696 72.9 1.3e-11 >>CCDS2765.1 PLXNB1 gene_id:5364|Hs108|chr3 (2135 aa) initn: 14586 init1: 14586 opt: 14586 Z-score: 6370.5 bits: 1192.5 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 14586; 100.0% identity (100.0% similar) in 2135 aa overlap (1-2135:1-2135) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MPALGPALLQALWAGWVLTLQPLPPTAFTPNGTYLQHLARDPTSGTLYLGATNFLFQLSP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 MPALGPALLQALWAGWVLTLQPLPPTAFTPNGTYLQHLARDPTSGTLYLGATNFLFQLSP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KA0 GLQLEATVSTGPVLDSRDCLPPVMPDECPQAQPTNNPNQLLLVSPGALVVCGSVHQGVCE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 GLQLEATVSTGPVLDSRDCLPPVMPDECPQAQPTNNPNQLLLVSPGALVVCGSVHQGVCE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KA0 QRRLGQLEQLLLRPERPGDTQYVAANDPAVSTVGLVAQGLAGEPLLFVGRGYTSRGVGGG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 QRRLGQLEQLLLRPERPGDTQYVAANDPAVSTVGLVAQGLAGEPLLFVGRGYTSRGVGGG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KA0 IPPITTRALWPPDPQAAFSYEETAKLAVGRLSEYSHHFVSAFARGASAYFLFLRRDLQAQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 IPPITTRALWPPDPQAAFSYEETAKLAVGRLSEYSHHFVSAFARGASAYFLFLRRDLQAQ 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KA0 SRAFRAYVSRVCLRDQHYYSYVELPLACEGGRYGLIQAAAVATSREVAHGEVLFAAFSSA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 SRAFRAYVSRVCLRDQHYYSYVELPLACEGGRYGLIQAAAVATSREVAHGEVLFAAFSSA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KA0 APPTVGRPPSAAAGASGASALCAFPLDEVDRLANRTRDACYTREGRAEDGTEVAYIEYDV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 APPTVGRPPSAAAGASGASALCAFPLDEVDRLANRTRDACYTREGRAEDGTEVAYIEYDV 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KA0 NSDCAQLPVDTLDAYPCGSDHTPSPMASRVPLEATPILEWPGIQLTAVAVTMEDGHTIAF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 NSDCAQLPVDTLDAYPCGSDHTPSPMASRVPLEATPILEWPGIQLTAVAVTMEDGHTIAF 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KA0 LGDSQGQLHRVYLGPGSDGHPYSTQSIQQGSAVSRDLTFDGTFEHLYVMTQSTLLKVPVA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 LGDSQGQLHRVYLGPGSDGHPYSTQSIQQGSAVSRDLTFDGTFEHLYVMTQSTLLKVPVA 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KA0 SCAQHLDCASCLAHRDPYCGWCVLLGRCSRRSECSRGQGPEQWLWSFQPELGCLQVAAMS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 SCAQHLDCASCLAHRDPYCGWCVLLGRCSRRSECSRGQGPEQWLWSFQPELGCLQVAAMS 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KA0 PANISREETREVFLSVPDLPPLWPGESYSCHFGEHQSPALLTGSGVMCPSPDPSEAPVLP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 PANISREETREVFLSVPDLPPLWPGESYSCHFGEHQSPALLTGSGVMCPSPDPSEAPVLP 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KA0 RGADYVSVSVELRFGAVVIAKTSLSFYDCVAVTELRPSAQCQACVSSRWGCNWCVWQHLC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 RGADYVSVSVELRFGAVVIAKTSLSFYDCVAVTELRPSAQCQACVSSRWGCNWCVWQHLC 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KA0 THKASCDAGPMVASHQSPLVSPDPPARGGPSPSPPTAPKALATPAPDTLPVEPGAPSTAT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 THKASCDAGPMVASHQSPLVSPDPPARGGPSPSPPTAPKALATPAPDTLPVEPGAPSTAT 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KA0 ASDISPGASPSLLSPWGPWAGSGSISSPGSTGSPLHEEPSPPSPQNGPGTAVPAPTDFRP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 ASDISPGASPSLLSPWGPWAGSGSISSPGSTGSPLHEEPSPPSPQNGPGTAVPAPTDFRP 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KA0 SATPEDLLASPLSPSEVAAVPPADPGPEALHPTVPLDLPPATVPATTFPGAMGSVKPALD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 SATPEDLLASPLSPSEVAAVPPADPGPEALHPTVPLDLPPATVPATTFPGAMGSVKPALD 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 pF1KA0 WLTREGGELPEADEWTGGDAPAFSTSTLLSGDGDSAELEGPPAPLILPSSLDYQYDTPGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 WLTREGGELPEADEWTGGDAPAFSTSTLLSGDGDSAELEGPPAPLILPSSLDYQYDTPGL 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 pF1KA0 WELEEATLGASSCPCVESVQGSTLMPVHVEREIRLLGRNLHLFQDGPGDNECVMELEGLE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 WELEEATLGASSCPCVESVQGSTLMPVHVEREIRLLGRNLHLFQDGPGDNECVMELEGLE 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KA0 VVVEARVECEPPPDTQCHVTCQQHQLSYEALQPELRVGLFLRRAGRLRVDSAEGLHVVLY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 VVVEARVECEPPPDTQCHVTCQQHQLSYEALQPELRVGLFLRRAGRLRVDSAEGLHVVLY 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KA0 DCSVGHGDCSRCQTAMPQYGCVWCEGERPRCVTREACGEAEAVATQCPAPLIHSVEPLTG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 DCSVGHGDCSRCQTAMPQYGCVWCEGERPRCVTREACGEAEAVATQCPAPLIHSVEPLTG 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KA0 PVDGGTRVTIRGSNLGQHVQDVLGMVTVAGVPCAVDAQEYEVSSSLVCITGASGEEVAGA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 PVDGGTRVTIRGSNLGQHVQDVLGMVTVAGVPCAVDAQEYEVSSSLVCITGASGEEVAGA 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KA0 TAVEVPGRGRGVSEHDFAYQDPKVHSIFPARGPRAGGTRLTLNGSKLLTGRLEDIRVVVG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 TAVEVPGRGRGVSEHDFAYQDPKVHSIFPARGPRAGGTRLTLNGSKLLTGRLEDIRVVVG 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KA0 DQPCHLLPEQQSEQLRCETSPRPTPATLPVAVWFGATERRLQRGQFKYTLDPNITSAGPT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 DQPCHLLPEQQSEQLRCETSPRPTPATLPVAVWFGATERRLQRGQFKYTLDPNITSAGPT 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KA0 KSFLSGGREICVRGQNLDVVQTPRIRVTVVSRMLQPSQGLGRRRRVVPETACSLGPSCSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 KSFLSGGREICVRGQNLDVVQTPRIRVTVVSRMLQPSQGLGRRRRVVPETACSLGPSCSS 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KA0 QQFEEPCHVNSSQLITCRTPALPGLPEDPWVRVEFILDNLVFDFATLNPTPFSYEADPTL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 QQFEEPCHVNSSQLITCRTPALPGLPEDPWVRVEFILDNLVFDFATLNPTPFSYEADPTL 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KA0 QPLNPEDPTMPFRHKPGSVFSVEGENLDLAMSKEEVVAMIGDGPCVVKTLTRHHLYCEPP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 QPLNPEDPTMPFRHKPGSVFSVEGENLDLAMSKEEVVAMIGDGPCVVKTLTRHHLYCEPP 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 pF1KA0 VEQPLPRHHALREAPDSLPEFTVQMGNLRFSLGHVQYDGESPGAFPVAAQVGLGVGTSLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 VEQPLPRHHALREAPDSLPEFTVQMGNLRFSLGHVQYDGESPGAFPVAAQVGLGVGTSLL 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 pF1KA0 ALGVIIIVLMYRRKSKQALRDYKKVQIQLENLESSVRDRCKKEFTDLMTEMTDLTSDLLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 ALGVIIIVLMYRRKSKQALRDYKKVQIQLENLESSVRDRCKKEFTDLMTEMTDLTSDLLG 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 pF1KA0 SGIPFLDYKVYAERIFFPGHRESPLHRDLGVPESRRPTVEQGLGQLSNLLNSKLFLTKFI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 SGIPFLDYKVYAERIFFPGHRESPLHRDLGVPESRRPTVEQGLGQLSNLLNSKLFLTKFI 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 pF1KA0 HTLESQRTFSARDRAYVASLLTVALHGKLEYFTDILRTLLSDLVAQYVAKNPKLMLRRTE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 HTLESQRTFSARDRAYVASLLTVALHGKLEYFTDILRTLLSDLVAQYVAKNPKLMLRRTE 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 pF1KA0 TVVEKLLTNWMSICLYTFVRDSVGEPLYMLFRGIKHQVDKGPVDSVTGKAKYTLNDNRLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 TVVEKLLTNWMSICLYTFVRDSVGEPLYMLFRGIKHQVDKGPVDSVTGKAKYTLNDNRLL 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1800 pF1KA0 REDVEYRPLTLNALLAVGPGAGEAQGVPVKVLDCDTISQAKEKMLDQLYKGVPLTQRPDP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 REDVEYRPLTLNALLAVGPGAGEAQGVPVKVLDCDTISQAKEKMLDQLYKGVPLTQRPDP 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1860 pF1KA0 RTLDVEWRSGVAGHLILSDEDVTSEVQGLWRRLNTLQHYKVPDGATVALVPCLTKHVLRE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 RTLDVEWRSGVAGHLILSDEDVTSEVQGLWRRLNTLQHYKVPDGATVALVPCLTKHVLRE 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 pF1KA0 NQDYVPGERTPMLEDVDEGGIRPWHLVKPSDEPEPPRPRRGSLRGGERERAKAIPEIYLT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 NQDYVPGERTPMLEDVDEGGIRPWHLVKPSDEPEPPRPRRGSLRGGERERAKAIPEIYLT 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1980 pF1KA0 RLLSMKGTLQKFVDDLFQVILSTSRPVPLAVKYFFDLLDEQAQQHGISDQDTIHIWKTNS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 RLLSMKGTLQKFVDDLFQVILSTSRPVPLAVKYFFDLLDEQAQQHGISDQDTIHIWKTNS 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 2010 2020 2030 2040 pF1KA0 LPLRFWINIIKNPQFVFDVQTSDNMDAVLLVIAQTFMDACTLADHKLGRDSPINKLLYAR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 LPLRFWINIIKNPQFVFDVQTSDNMDAVLLVIAQTFMDACTLADHKLGRDSPINKLLYAR 1990 2000 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2070 2080 2090 2100 pF1KA0 DIPRYKRMVERYYADIRQTVPASDQEMNSVLAELSWNYSGDLGARVALHELYKYINKYYD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 DIPRYKRMVERYYADIRQTVPASDQEMNSVLAELSWNYSGDLGARVALHELYKYINKYYD 2050 2060 2070 2080 2090 2100 2110 2120 2130 pF1KA0 QIITALEEDGTAQKMQLGYRLQQIAAAVENKVTDL ::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS27 QIITALEEDGTAQKMQLGYRLQQIAAAVENKVTDL 2110 2120 2130 >>CCDS14729.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX (1909 aa) initn: 4747 init1: 1242 opt: 3067 Z-score: 1353.7 bits: 264.0 E(32554): 4.4e-69 Smith-Waterman score: 5826; 47.0% identity (66.1% similar) in 2164 aa overlap (2-2135:23-1909) 10 20 30 pF1KA0 MPALGPALLQALWAGWVLTLQPLPPTA---FTPNGTYLQ : .: :: : :. ::: :. :. .: :. CCDS14 MCHAAQETPLLHHFMAPVMARWPPFGLCLLLLL-----LSPPPLPLTGAHRFSAPNTTLN 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 90 pF1KA0 HLARDPTSGTLYLGATNFLFQLSPGLQLEATVSTGPVLDSRDCLPPVMPDECPQAQPTNN ::: : ::::.::.: :::::: :::::.. ::::.:: ::.: : :::::: :.: CCDS14 HLALAPGRGTLYVGAVNRLFQLSPELQLEAVAVTGPVIDSPDCVPFRDPAECPQAQLTDN 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KA0 PNQLLLVSPGA--LVVCGSVHQGVCEQRRLGQLEQLLLRPERPGDTQYVAANDPAVSTVG ::::::: : ::.::.:.::::: ::::.. ..: . : ::: :.:::: :.:.::: CCDS14 ANQLLLVSSRAQELVACGQVRQGVCETRRLGDVAEVLYQAEDPGDGQFVAANTPGVATVG 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KA0 LVAQGLAGEPLLFVGRGYTSRGVGGGIPPITTRALWPPDPQAAFSYEETAKLAVGRLSEY ::. : :. ::.:.:: ... ...:.::.. : : .: :: : ..:.:: .:.: CCDS14 LVVP-LPGRDLLLVARGLAGK-LSAGVPPLAIRQLAGSQP---FSSEGLGRLVVGDFSDY 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KA0 SHHFVSAFARGASAYFLFLRRDLQAQSRAFRAYVSRVCLRDQHYYSYVELPLACEGGRYG .. .:.::: . ::::.: :: .::.. .:.::.:::: : . :::::.::::.: : CCDS14 NNSYVGAFADARSAYFVFRRRGARAQAE-YRSYVARVCLGDTNLYSYVEVPLACQG--QG 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 pF1KA0 LIQAAAVATSREVAHGEVLFAAFSSAAPPTVGRPPSAAAGASGA-SALCAFPLDEVDRLA ::::: .: . .:...: ::: :. .::::::. :. CCDS14 LIQAAFLAPG-------TLLGVF--------------AAGPRGTQAALCAFPMVELGASM 290 300 310 320 340 350 360 370 380 390 pF1KA0 NRTRDACYTREGRAEDGTEVAYIEYDVNSDCAQLPVDTLDAYPCGSDHTPSPMASRVPLE ...: ::: ::. .:.: : .:: :.: :. ::.:. ..::::..:::::.:.: ::: CCDS14 EQARRLCYTAGGRGPSGAEEATVEYGVTSRCVTLPLDSPESYPCGDEHTPSPIAGRQPLE 330 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 450 pF1KA0 ATPILEWPGIQLTAVAVTMEDGHTIAFLGDSQGQLHRVYLGPGSDGHPYSTQSI-QQGSA . :.:. : ..:::. . ::: ::::::.::::..:.: ::.:. : .:.. ::: CCDS14 VQPLLKL-GQPVSAVAALQADGHMIAFLGDTQGQLYKVFLH-GSQGQVYHSQQVGPPGSA 390 400 410 420 430 440 460 470 480 490 500 510 pF1KA0 VSRDLTFDGTFEHLYVMTQSTLLKVPVASCAQHLDCASCLAHRDPYCGWCVLLGRCSRRS .: :: .:.. ::::.: . ..:::.: : :::::: .:: :::::: :::.:.. CCDS14 ISPDLLLDSSGSHLYVLTAHQVDRIPVAACPQFPDCASCLQAQDPLCGWCVLQGRCTRKG 450 460 470 480 490 500 520 530 540 550 560 570 pF1KA0 ECSRGQGPEQWLWSFQPELGCLQVAAMSPANISREETREVFLSVPDLPPLWPGESYSCHF .:.:. .:::::.. . ::.. .. :.. :.: .: :::: :: : : . : : CCDS14 QCGRAGQLNQWLWSYEEDSHCLHIQSLLPGHHPRQEQGQVTLSVPRLPILDADEYFHCAF 510 520 530 540 550 560 580 590 600 610 620 630 pF1KA0 GEHQSPALLTGSGVMCPSPDPSEAPVLPRGADYVSVSVELRFGAVVIAKTSLSFYDCVAV :...: : . : : : .: ...:. : :.:.:.: . : : :..: :..::::: :: CCDS14 GDYDSLAHVEGPHVACVTPPQDQVPLNPPGTDHVTVPLALMFEDVTVAATNFSFYDCSAV 570 580 590 600 610 620 640 650 660 670 680 690 pF1KA0 TELRPSAQCQACVSSRWGCNWCVWQHLCTHKASCDAGPMVASHQSPLVSPDPPARGGPSP :. .: :.:::.: : :.:: . :.. : CCDS14 QALEAAAPCRACVGSIWRCHWCPQSSHCVYGEHC-------------------------- 630 640 650 700 710 720 730 740 750 pF1KA0 SPPTAPKALATPAPDTLPVEPGAPSTATASDISPGASPSLLSPWGPWAGSGSISSPGSTG CCDS14 ------------------------------------------------------------ 760 770 780 790 800 810 pF1KA0 SPLHEEPSPPSPQNGPGTAVPAPTDFRPSATPEDLLASPLSPSEVAAVPPADPGPEALHP :: CCDS14 -------------------------------PE--------------------------- 660 820 830 840 850 860 870 pF1KA0 TVPLDLPPATVPATTFPGAMGSVKPALDWLTREGGELPEADEWTGGDAPAFSTSTLLSGD :. .:.. . CCDS14 ---------------------------------------------GERTIYSAQEV---- 670 880 890 900 910 920 930 pF1KA0 GDSAELEGPPAPLILPSSLDYQYDTPGLWELEEATLGASSCPCVESVQGSTLMPVHVERE : : :: .:: ::.. : :.:: : . CCDS14 -------------------DIQVRGPG------------ACPQVEGLAGPHLVPVGWESH 680 690 700 940 950 960 970 980 990 pF1KA0 IRLLGRNLHLFQDGPGDNECVMELEGLEVVVEARVECEPPPDTQCHVTCQQHQLSYEALQ . : :::. :. :.. .: .:: : . : .: : :. . :: ::. : CCDS14 LALRVRNLQHFRGLPASFHCWLELPGELRGLPATLE-ETAGDSGL-IHCQAHQFYPSMSQ 710 720 730 740 750 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KA0 PELRVGLFLRRAGRLRVDSAEGLHVVLYDCSVGHGDCSRCQTAMPQYGCVWCEGERPRCV :: : ... .. :.:....:.:.::::..:: :::.::.: . ::.:: .: : CCDS14 RELPVPIYVTQGEAQRLDNTHALYVILYDCAMGHPDCSHCQAANRSLGCLWCADGQPACR 760 770 780 790 800 810 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KA0 TREACGEAEAVATQCPAPLIHSVEPLTGPVDGGTRVTIRGSNLGQHVQDVLGMVTVAGVP : . :: :::: : .::::::: .:: .:: :::::. :: :.::. : CCDS14 YGPLCPPG-AVELLCPAPSIDAVEPLTGPPEGGLALTILGSNLGRAFADVQYAVSVASRP 820 830 840 850 860 870 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KA0 CAVDAQEYEVSSSLVCITGASGEEVAGATAVEVPGRGRGVSEHDFAYQDPKVHSIFPARG : . . :..:. .::.:. . . ..: . : . .. :.: . :.:::: . :. : : CCDS14 CNPEPSLYRTSARIVCVTSPAPNGTTGPVRVAIKSQPPGISSQHFTYQDPVLLSLSPRWG 880 890 900 910 920 930 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KA0 PRAGGTRLTLNGSKLLTGRLEDIRVVVGDQPCHLLPEQQSEQLRCETSPRPTPATLPVAV :.::::.::. :..: :: . . :: ::: .: : . :.: :. .:. : : CCDS14 PQAGGTQLTIRGQHLQTG--GNTSAFVGGQPCPILEPVCPEAIVCRTRPQAAPGEAAVLV 940 950 960 970 980 990 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KA0 WFGATERRLQRGQFKYTLDPNITSAGPTKSFLSGGREICVRGQNLDVVQTPRIRV----- :: ..: : . :.:: .:....: :. :: .::: : ::: .::::: : . : CCDS14 VFGHAQRTLLASPFRYTANPQLVAAEPSASFRGGGRLIRVRGTGLDVVQRPLLSVWLEAD 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KA0 -TVVSRMLQPSQGLGRRRRVVPET---AC-SLGPSCSSQQFEEPCHVNSSQLITCRTPAL : . ::.. :: .: . :: .:: . : : ::::.:. ::.::. CCDS14 AEVQASRAQPQDPQPRRSCGAPAADPQACIQLGGGL--LQCSTVCSVNSSSLLLCRSPAV 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1350 1360 1370 1380 1390 1400 pF1KA0 PGLPEDPWVRVEFILDNLVFDFATLNPTP-FSYEADPTLQPLNPEDPTMPFRHKPGSVFS : . : :: : :::. :::. . : :. .: : ::. : :. :.: ::: :.. CCDS14 PDRAH-PQ-RVFFTLDNVQVDFASASGGQGFLYQPNPRLAPLSREGPARPYRLKPGHVLD 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1410 1420 1430 1440 1450 1460 pF1KA0 VEGENLDLAMSKEEVVAMIGDGPCVVKTLTRHHLYCEPPVEQPLPRHHALREAPDSLPEF ::::.:.:..::::: . :: : :.:::::: :::::::.. : : . . .::.: CCDS14 VEGEGLNLGISKEEVRVHIGRGECLVKTLTRTHLYCEPPAHAPQPANGS------GLPQF 1180 1190 1200 1210 1220 1470 1480 1490 1500 1510 1520 pF1KA0 TVQMGNLRFSLGHVQYDGESP-GAFPVAAQVGLGVGTSLLALGVIIIVLMYRRKSKQALR .:::::....:: :::..: : .:::: ::.:.:.:...: .:....::::.::::::: CCDS14 VVQMGNVQLALGPVQYEAEPPLSAFPVEAQAGVGMGAAVLIAAVLLLTLMYRHKSKQALR 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1530 1540 1550 1560 1570 1580 pF1KA0 DYKKVQIQLENLESSVRDRCKKEFTDLMTEMTDLTSDLLGSGIPFLDYKVYAERIFFPGH ::.:: .:::.::..: :.:.:::::::::::::.::: :::::::::..:::: ::::: CCDS14 DYQKVLVQLESLETGVGDQCRKEFTDLMTEMTDLSSDLEGSGIPFLDYRTYAERAFFPGH 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1590 1600 1610 1620 1630 pF1KA0 RESPLH-RDLGVPESRR-PTVEQGLGQLSNLLNSKLFLTKFIHTLESQRTFSARDRAYVA ::. . : :. . ::.::: :::::::::::: .::::: : .:: ::: .:: CCDS14 GGCPLQPKPEGPGEDGHCATVRQGLTQLSNLLNSKLFLLTLIHTLEEQPSFSQRDRCHVA 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1640 1650 1660 1670 1680 1690 pF1KA0 SLLTVALHGKLEYFTDILRTLLSDLVAQYVAKNPKLMLRRTETVVEKLLTNWMSICLYTF :::..::::::::.:::.::::.::.:.:: .:::::::::::.::::::::.:::::.: CCDS14 SLLSLALHGKLEYLTDIMRTLLGDLAAHYVHRNPKLMLRRTETMVEKLLTNWLSICLYAF 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1700 1710 1720 1730 1740 1750 pF1KA0 VRDSVGEPLYMLFRGIKHQVDKGPVDSVTGKAKYTLNDNRLLREDVEYRPLTLNALLAVG .:. .:::::::::.:..::::::::.:::::: ::::.::::::::..:::: .: :: CCDS14 LREVAGEPLYMLFRAIQYQVDKGPVDAVTGKAKRTLNDSRLLREDVEFQPLTLMVL--VG 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1760 1770 1780 1790 1800 1810 pF1KA0 PGAGEAQG------VPVKVLDCDTISQAKEKMLDQLYKGVPLTQRPDPRTLDVEWRSGVA :::: : : ::..::: :::.:.:::.:::.:::.:..:::. ..::.:::::.: CCDS14 PGAGGAAGSSEMQRVPARVLDTDTITQVKEKVLDQVYKGTPFSQRPSVHALDLEWRSGLA 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1820 1830 1840 1850 1860 pF1KA0 GHLILSDEDVTSEVQGLWRRLNTLQHYKVPDGATVALVPCLTKH--VLRENQDYVP-GER ::: :::::.:: .:. :.::::::::::::::::.::: : . . . . : :: CCDS14 GHLTLSDEDLTSVTQNHWKRLNTLQHYKVPDGATVGLVPQLHRGSTISQSLAQRCPLGEN 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1870 1880 1890 1900 1910 1920 pF1KA0 TPMLEDVDEGGIRPWHLVKPSDEPEPPRPRRGSLRGGERERAKAIPEIYLTRLLSMKGTL : ::: .:::. ::::: ..::: . : .::: : :::::::::::::::::::: CCDS14 IPTLEDGEEGGVCLWHLVKATEEPEGAKVRCSSLREREPARAKAIPEIYLTRLLSMKGTL 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1930 1940 1950 1960 1970 1980 pF1KA0 QKFVDDLFQVILSTSRPVPLAVKYFFDLLDEQAQQHGISDQDTIHIWKTNSLPLRFWINI :::::: ::.:::..::.:.::::.:::::: :..::: : :.:::::::: ::::.: CCDS14 QKFVDDTFQAILSVNRPIPIAVKYLFDLLDELAEKHGIEDPGTLHIWKTNSLLLRFWVNA 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1990 2000 2010 2020 2030 2040 pF1KA0 IKNPQFVFDVQTSDNMDAVLLVIAQTFMDACTLADHKLGRDSPINKLLYARDIPRYKRMV .::::..:::..:::.::.: ::::::.:.:: ..::.:::::.:::::::.:::::.:: CCDS14 LKNPQLIFDVRVSDNVDAILAVIAQTFIDSCTTSEHKVGRDSPVNKLLYAREIPRYKQMV 1770 1780 1790 1800 1810 1820 2050 2060 2070 2080 2090 2100 pF1KA0 ERYYADIRQTVPASDQEMNSVLAELSWNYSGDLGARVALHELYKYINKYYDQIITALEED :::::::::. ::: :::::.::::: ::.. ::.:::..:..::::::.::::: CCDS14 ERYYADIRQSSPASYQEMNSALAELSGNYTSAPHCLEALQELYNHIHRYYDQIISALEED 1830 1840 1850 1860 1870 1880 2110 2120 2130 pF1KA0 GTAQKMQLGYRLQQIAAAVENKVTDL ..::.::. ::::.:: :::::::: CCDS14 PVGQKLQLACRLQQVAALVENKVTDL 1890 1900 >>CCDS55536.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX (1932 aa) initn: 4747 init1: 1242 opt: 3067 Z-score: 1353.7 bits: 264.0 E(32554): 4.4e-69 Smith-Waterman score: 5826; 47.0% identity (66.1% similar) in 2164 aa overlap (2-2135:46-1932) 10 20 pF1KA0 MPALGPALLQALWAGWVLTLQPLPPTA---F : .: :: : :. ::: :. : CCDS55 PRLPGSFPQLRRVPPCSRPWLPKAPVMARWPPFGLCLLLLL-----LSPPPLPLTGAHRF 20 30 40 50 60 70 30 40 50 60 70 80 pF1KA0 TPNGTYLQHLARDPTSGTLYLGATNFLFQLSPGLQLEATVSTGPVLDSRDCLPPVMPDEC . .: :.::: : ::::.::.: :::::: :::::.. ::::.:: ::.: : :: CCDS55 SAPNTTLNHLALAPGRGTLYVGAVNRLFQLSPELQLEAVAVTGPVIDSPDCVPFRDPAEC 80 90 100 110 120 130 90 100 110 120 130 140 pF1KA0 PQAQPTNNPNQLLLVSPGA--LVVCGSVHQGVCEQRRLGQLEQLLLRPERPGDTQYVAAN :::: :.: ::::::: : ::.::.:.::::: ::::.. ..: . : ::: :.:::: CCDS55 PQAQLTDNANQLLLVSSRAQELVACGQVRQGVCETRRLGDVAEVLYQAEDPGDGQFVAAN 140 150 160 170 180 190 150 160 170 180 190 200 pF1KA0 DPAVSTVGLVAQGLAGEPLLFVGRGYTSRGVGGGIPPITTRALWPPDPQAAFSYEETAKL :.:.:::::. : :. ::.:.:: ... ...:.::.. : : .: :: : ..: CCDS55 TPGVATVGLVVP-LPGRDLLLVARGLAGK-LSAGVPPLAIRQLAGSQP---FSSEGLGRL 200 210 220 230 240 210 220 230 240 250 260 pF1KA0 AVGRLSEYSHHFVSAFARGASAYFLFLRRDLQAQSRAFRAYVSRVCLRDQHYYSYVELPL .:: .:.:.. .:.::: . ::::.: :: .::.. .:.::.:::: : . :::::.:: CCDS55 VVGDFSDYNNSYVGAFADARSAYFVFRRRGARAQAE-YRSYVARVCLGDTNLYSYVEVPL 250 260 270 280 290 300 270 280 290 300 310 320 pF1KA0 ACEGGRYGLIQAAAVATSREVAHGEVLFAAFSSAAPPTVGRPPSAAAGASGA-SALCAFP ::.: :::::: .: . .:...: ::: :. .:::::: CCDS55 ACQG--QGLIQAAFLAPG-------TLLGVF--------------AAGPRGTQAALCAFP 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 pF1KA0 LDEVDRLANRTRDACYTREGRAEDGTEVAYIEYDVNSDCAQLPVDTLDAYPCGSDHTPSP . :. ...: ::: ::. .:.: : .:: :.: :. ::.:. ..::::..::::: CCDS55 MVELGASMEQARRLCYTAGGRGPSGAEEATVEYGVTSRCVTLPLDSPESYPCGDEHTPSP 350 360 370 380 390 400 390 400 410 420 430 440 pF1KA0 MASRVPLEATPILEWPGIQLTAVAVTMEDGHTIAFLGDSQGQLHRVYLGPGSDGHPYSTQ .:.: :::. :.:. : ..:::. . ::: ::::::.::::..:.: ::.:. : .: CCDS55 IAGRQPLEVQPLLKL-GQPVSAVAALQADGHMIAFLGDTQGQLYKVFLH-GSQGQVYHSQ 410 420 430 440 450 450 460 470 480 490 500 pF1KA0 SI-QQGSAVSRDLTFDGTFEHLYVMTQSTLLKVPVASCAQHLDCASCLAHRDPYCGWCVL .. :::.: :: .:.. ::::.: . ..:::.: : :::::: .:: :::::: CCDS55 QVGPPGSAISPDLLLDSSGSHLYVLTAHQVDRIPVAACPQFPDCASCLQAQDPLCGWCVL 460 470 480 490 500 510 510 520 530 540 550 560 pF1KA0 LGRCSRRSECSRGQGPEQWLWSFQPELGCLQVAAMSPANISREETREVFLSVPDLPPLWP :::.:...:.:. .:::::.. . ::.. .. :.. :.: .: :::: :: : CCDS55 QGRCTRKGQCGRAGQLNQWLWSYEEDSHCLHIQSLLPGHHPRQEQGQVTLSVPRLPILDA 520 530 540 550 560 570 570 580 590 600 610 620 pF1KA0 GESYSCHFGEHQSPALLTGSGVMCPSPDPSEAPVLPRGADYVSVSVELRFGAVVIAKTSL : . : ::...: : . : : : .: ...:. : :.:.:.: . : : :..: :.. CCDS55 DEYFHCAFGDYDSLAHVEGPHVACVTPPQDQVPLNPPGTDHVTVPLALMFEDVTVAATNF 580 590 600 610 620 630 630 640 650 660 670 680 pF1KA0 SFYDCVAVTELRPSAQCQACVSSRWGCNWCVWQHLCTHKASCDAGPMVASHQSPLVSPDP ::::: :: :. .: :.:::.: : :.:: . :.. : CCDS55 SFYDCSAVQALEAAAPCRACVGSIWRCHWCPQSSHCVYGEHC------------------ 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 pF1KA0 PARGGPSPSPPTAPKALATPAPDTLPVEPGAPSTATASDISPGASPSLLSPWGPWAGSGS CCDS55 ------------------------------------------------------------ 750 760 770 780 790 800 pF1KA0 ISSPGSTGSPLHEEPSPPSPQNGPGTAVPAPTDFRPSATPEDLLASPLSPSEVAAVPPAD :: CCDS55 ---------------------------------------PE------------------- 810 820 830 840 850 860 pF1KA0 PGPEALHPTVPLDLPPATVPATTFPGAMGSVKPALDWLTREGGELPEADEWTGGDAPAFS :. .: CCDS55 -----------------------------------------------------GERTIYS 690 870 880 890 900 910 920 pF1KA0 TSTLLSGDGDSAELEGPPAPLILPSSLDYQYDTPGLWELEEATLGASSCPCVESVQGSTL .. . : : :: .:: ::.. : : CCDS55 AQEV-----------------------DIQVRGPG------------ACPQVEGLAGPHL 700 710 930 940 950 960 970 980 pF1KA0 MPVHVEREIRLLGRNLHLFQDGPGDNECVMELEGLEVVVEARVECEPPPDTQCHVTCQQH .:: : .. : :::. :. :.. .: .:: : . : .: : :. . :: : CCDS55 VPVGWESHLALRVRNLQHFRGLPASFHCWLELPGELRGLPATLE-ETAGDSGL-IHCQAH 720 730 740 750 760 770 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KA0 QLSYEALQPELRVGLFLRRAGRLRVDSAEGLHVVLYDCSVGHGDCSRCQTAMPQYGCVWC :. : :: : ... .. :.:....:.:.::::..:: :::.::.: . ::.:: CCDS55 QFYPSMSQRELPVPIYVTQGEAQRLDNTHALYVILYDCAMGHPDCSHCQAANRSLGCLWC 780 790 800 810 820 830 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KA0 EGERPRCVTREACGEAEAVATQCPAPLIHSVEPLTGPVDGGTRVTIRGSNLGQHVQDVLG .: : : . :: :::: : .::::::: .:: .:: :::::. :: CCDS55 ADGQPACRYGPLCPPG-AVELLCPAPSIDAVEPLTGPPEGGLALTILGSNLGRAFADVQY 840 850 860 870 880 890 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KA0 MVTVAGVPCAVDAQEYEVSSSLVCITGASGEEVAGATAVEVPGRGRGVSEHDFAYQDPKV :.::. :: . . :..:. .::.:. . . ..: . : . .. :.: . :.:::: . CCDS55 AVSVASRPCNPEPSLYRTSARIVCVTSPAPNGTTGPVRVAIKSQPPGISSQHFTYQDPVL 900 910 920 930 940 950 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KA0 HSIFPARGPRAGGTRLTLNGSKLLTGRLEDIRVVVGDQPCHLLPEQQSEQLRCETSPRPT :. : ::.::::.::. :..: :: . . :: ::: .: : . :.: :. . CCDS55 LSLSPRWGPQAGGTQLTIRGQHLQTG--GNTSAFVGGQPCPILEPVCPEAIVCRTRPQAA 960 970 980 990 1000 1010 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KA0 PATLPVAVWFGATERRLQRGQFKYTLDPNITSAGPTKSFLSGGREICVRGQNLDVVQTPR :. : : :: ..: : . :.:: .:....: :. :: .::: : ::: .::::: : CCDS55 PGEAAVLVVFGHAQRTLLASPFRYTANPQLVAAEPSASFRGGGRLIRVRGTGLDVVQRPL 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KA0 IRV------TVVSRMLQPSQGLGRRRRVVPET---AC-SLGPSCSSQQFEEPCHVNSSQL . : : . ::.. :: .: . :: .:: . : : ::::.: CCDS55 LSVWLEADAEVQASRAQPQDPQPRRSCGAPAADPQACIQLGGGL--LQCSTVCSVNSSSL 1080 1090 1100 1110 1120 1340 1350 1360 1370 1380 1390 pF1KA0 ITCRTPALPGLPEDPWVRVEFILDNLVFDFATLNPTP-FSYEADPTLQPLNPEDPTMPFR . ::.::.: . : :: : :::. :::. . : :. .: : ::. : :. :.: CCDS55 LLCRSPAVPDRAH-PQ-RVFFTLDNVQVDFASASGGQGFLYQPNPRLAPLSREGPARPYR 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1400 1410 1420 1430 1440 1450 pF1KA0 HKPGSVFSVEGENLDLAMSKEEVVAMIGDGPCVVKTLTRHHLYCEPPVEQPLPRHHALRE ::: :..::::.:.:..::::: . :: : :.:::::: :::::::.. : : . . CCDS55 LKPGHVLDVEGEGLNLGISKEEVRVHIGRGECLVKTLTRTHLYCEPPAHAPQPANGS--- 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1460 1470 1480 1490 1500 1510 pF1KA0 APDSLPEFTVQMGNLRFSLGHVQYDGESP-GAFPVAAQVGLGVGTSLLALGVIIIVLMYR .::.:.:::::....:: :::..: : .:::: ::.:.:.:...: .:....:::: CCDS55 ---GLPQFVVQMGNVQLALGPVQYEAEPPLSAFPVEAQAGVGMGAAVLIAAVLLLTLMYR 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1520 1530 1540 1550 1560 1570 pF1KA0 RKSKQALRDYKKVQIQLENLESSVRDRCKKEFTDLMTEMTDLTSDLLGSGIPFLDYKVYA .:::::::::.:: .:::.::..: :.:.:::::::::::::.::: :::::::::..:: CCDS55 HKSKQALRDYQKVLVQLESLETGVGDQCRKEFTDLMTEMTDLSSDLEGSGIPFLDYRTYA 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1580 1590 1600 1610 1620 1630 pF1KA0 ERIFFPGHRESPLH-RDLGVPESRR-PTVEQGLGQLSNLLNSKLFLTKFIHTLESQRTFS :: ::::: ::. . : :. . ::.::: :::::::::::: .::::: : .:: CCDS55 ERAFFPGHGGCPLQPKPEGPGEDGHCATVRQGLTQLSNLLNSKLFLLTLIHTLEEQPSFS 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1640 1650 1660 1670 1680 1690 pF1KA0 ARDRAYVASLLTVALHGKLEYFTDILRTLLSDLVAQYVAKNPKLMLRRTETVVEKLLTNW ::: .:::::..::::::::.:::.::::.::.:.:: .:::::::::::.:::::::: CCDS55 QRDRCHVASLLSLALHGKLEYLTDIMRTLLGDLAAHYVHRNPKLMLRRTETMVEKLLTNW 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1700 1710 1720 1730 1740 1750 pF1KA0 MSICLYTFVRDSVGEPLYMLFRGIKHQVDKGPVDSVTGKAKYTLNDNRLLREDVEYRPLT .:::::.:.:. .:::::::::.:..::::::::.:::::: ::::.::::::::..::: CCDS55 LSICLYAFLREVAGEPLYMLFRAIQYQVDKGPVDAVTGKAKRTLNDSRLLREDVEFQPLT 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1760 1770 1780 1790 1800 pF1KA0 LNALLAVGPGAGEAQG------VPVKVLDCDTISQAKEKMLDQLYKGVPLTQRPDPRTLD : .: :::::: : : ::..::: :::.:.:::.:::.:::.:..:::. ..:: CCDS55 LMVL--VGPGAGGAAGSSEMQRVPARVLDTDTITQVKEKVLDQVYKGTPFSQRPSVHALD 1550 1560 1570 1580 1590 1810 1820 1830 1840 1850 1860 pF1KA0 VEWRSGVAGHLILSDEDVTSEVQGLWRRLNTLQHYKVPDGATVALVPCLTKH--VLRENQ .:::::.:::: :::::.:: .:. :.::::::::::::::::.::: : . . . CCDS55 LEWRSGLAGHLTLSDEDLTSVTQNHWKRLNTLQHYKVPDGATVGLVPQLHRGSTISQSLA 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1870 1880 1890 1900 1910 1920 pF1KA0 DYVP-GERTPMLEDVDEGGIRPWHLVKPSDEPEPPRPRRGSLRGGERERAKAIPEIYLTR . : :: : ::: .:::. ::::: ..::: . : .::: : :::::::::::: CCDS55 QRCPLGENIPTLEDGEEGGVCLWHLVKATEEPEGAKVRCSSLREREPARAKAIPEIYLTR 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1930 1940 1950 1960 1970 1980 pF1KA0 LLSMKGTLQKFVDDLFQVILSTSRPVPLAVKYFFDLLDEQAQQHGISDQDTIHIWKTNSL :::::::::::::: ::.:::..::.:.::::.:::::: :..::: : :.:::::::: CCDS55 LLSMKGTLQKFVDDTFQAILSVNRPIPIAVKYLFDLLDELAEKHGIEDPGTLHIWKTNSL 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1990 2000 2010 2020 2030 2040 pF1KA0 PLRFWINIIKNPQFVFDVQTSDNMDAVLLVIAQTFMDACTLADHKLGRDSPINKLLYARD ::::.: .::::..:::..:::.::.: ::::::.:.:: ..::.:::::.:::::::. CCDS55 LLRFWVNALKNPQLIFDVRVSDNVDAILAVIAQTFIDSCTTSEHKVGRDSPVNKLLYARE 1780 1790 1800 1810 1820 1830 2050 2060 2070 2080 2090 2100 pF1KA0 IPRYKRMVERYYADIRQTVPASDQEMNSVLAELSWNYSGDLGARVALHELYKYINKYYDQ :::::.:::::::::::. ::: :::::.::::: ::.. ::.:::..:..:::: CCDS55 IPRYKQMVERYYADIRQSSPASYQEMNSALAELSGNYTSAPHCLEALQELYNHIHRYYDQ 1840 1850 1860 1870 1880 1890 2110 2120 2130 pF1KA0 IITALEEDGTAQKMQLGYRLQQIAAAVENKVTDL ::.::::: ..::.::. ::::.:: :::::::: CCDS55 IISALEEDPVGQKLQLACRLQQVAALVENKVTDL 1900 1910 1920 1930 >>CCDS43035.1 PLXNB2 gene_id:23654|Hs108|chr22 (1838 aa) initn: 3300 init1: 1036 opt: 1671 Z-score: 745.9 bits: 151.5 E(32554): 3.2e-35 Smith-Waterman score: 4463; 39.3% identity (62.4% similar) in 2150 aa overlap (8-2135:10-1838) 10 20 30 40 50 pF1KA0 MPALGPALLQALWAGWVLTLQPLPPTAFTPNGTYLQHLARDPTSGTLYLGATNFLFQL :: : :: .:.: : . :.::: : .::..::::.: :.:: CCDS43 MALQLWALTLLGLLGAG--ASLRPRKLDFFRSEKE-LNHLAVDEASGVVYLGAVNALYQL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KA0 SPGLQLEATVSTGPVLDSRDCLPPVMPDECPQAQPTNNPNQLLLVSPGA--LVVCGSVHQ . :::: :.:::.::.. : ::. ..: .:. :.: :::::..: :: :::. . CCDS43 DAKLQLEQQVATGPALDNKKCTPPIEASQCHEAEMTDNVNQLLLLDPPRKRLVECGSLFK 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KA0 GVCEQRRLGQLEQLLLRPERPGDTQYVAANDPAVSTVGLVAQ-GLAGEPLLFVGRGYTSR :.: : :... :. . :. ..::.:: .:.:::::.. : .:. .::::.: . CCDS43 GICALRALSNISLRLFYEDGSGEKSFVASNDEGVATVGLVSSTGPGGDRVLFVGKGNGPH 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KA0 GVGGGIPPITTRALWPPDPQAAF-SYEETAKLAVGRLSEYSHHFVSAFARGASAYFLFLR .:: ..:: : : . :: .: . : .: :: ...::.:: : ..:.: . CCDS43 --DNGII-VSTRLLDRTDSREAFEAYTDHATYKAGYLSTNTQQFVAAFEDGPYVFFVFNQ 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KA0 RDLQAQSRAFRAYVSRVCLRDQHYYSYVELPLACE-----GGRYGLIQAAAVATSREVAH .: . .: :. ..:.: .: .::::.:. : :. .. .: ::.::. . CCDS43 QD-KHPARN-RTLLARMCREDPNYYSYLEMDLQCRDPDIHAAAFGTCLAASVAAP---GS 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KA0 GEVLFAAFSSAAPPTVGRPPSAAAGASGASALCAFPLDEVDRLANRTRDACYTREGRAED :.::.:.:: : ..:. ::. :: ::::.: . .:.:::: .:.: CCDS43 GRVLYAVFSR---------DSRSSGGPGAG-LCLFPLDKVHAKMEANRNACYTGTREARD 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 pF1KA0 GTEVAYIEYDVNSDCAQLPVDTLDAYPCGSDHTPSPMASRVPLEATPILEWPGIQLTAVA . : . . .:. . ..::::.: : :..:: :..: .:. :..::::. CCDS43 ---IFYKPFHGDIQCGGHAPGSSKSFPCGSEHLPYPLGSRDGLRGTAVLQRGGLNLTAVT 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KA0 VTMEDGHTIAFLGDSQGQLHRVYLGPGSDGHPYSTQSIQQGSAVSRDLTFDGTFEHLYVM :. :..::.:::: :.:.. .::: : . . :.. .. .. :.:::...: . ::.: CCDS43 VAAENNHTVAFLGTSDGRILKVYLTPDGTSSEYDSILVEINKRVKRDLVLSGDLGSLYAM 400 410 420 430 440 450 470 480 490 500 510 520 pF1KA0 TQSTLLKVPVASCAQHLDCASCLAHRDPYCGWCVLLGRCSRRSECSRGQGPEQWLWSFQP ::. ....:: : .. :..: .::::::::. :::.:..:: :.. .:::: . CCDS43 TQDKVFRLPVQECLSYPTCTQCRDSQDPYCGWCVVEGRCTRKAECPRAEEASHWLWSRSK 460 470 480 490 500 510 530 540 550 560 570 580 pF1KA0 ELGCLQVAAMSPANISREETREVFLSVPDLPPLWPGESYSCHFGEHQS-PALLTGSGVMC .:. :.. .: :.::. :: :.: :: : . : ::: :: . : .:.: CCDS43 --SCVAVTSAQPQNMSRRAQGEVQLTVSPLPALSEEDELLCLFGESPPHPARVEGEAVIC 520 530 540 550 560 570 590 600 610 620 630 640 pF1KA0 PSPDPSEAPVLPRGADYVSVSVEL--RFGAVVIAKTSLSFYDCVAVTELRPSAQCQACVS :: : :: : : :.:.:...: : : . ... . :::: . :. . : .::: CCDS43 NSP--SSIPVTPPGQDHVAVTIQLLLRRGNIFLTSYQYPFYDCRQAMSLEENLPCISCVS 580 590 600 610 620 630 650 660 670 680 690 700 pF1KA0 SRWGCNWCVWQHLCTHKASCDAGPMVASHQSPLVSPDPPARGGPSPSPPTAPKALATPAP .:: :.: . : : . :.: : CCDS43 NRWTCQWDLRYHECRE---------------------------------------ASPNP 640 650 710 720 730 740 750 760 pF1KA0 DTLPVEPGAPSTATASDISPGASPSLLSPWGPWAGSGSISSPGSTGSPLHEEPSPPSPQN . .: . . : : : :: CCDS43 E----------------------------------DGIVRA--------HMEDS--CPQ- 660 770 780 790 800 810 820 pF1KA0 GPGTAVPAPTDFRPSATPEDLLASPLSPSEVAAVPPADPGPEALHPTVPLDLPPATVPAT CCDS43 ------------------------------------------------------------ 830 840 850 860 870 880 pF1KA0 TFPGAMGSVKPALDWLTREGGELPEADEWTGGDAPAFSTSTLLSGDGDSAELEGPPAPLI : : :.::. CCDS43 -FLG---------------------------------------------------PSPLV 670 890 900 910 920 930 940 pF1KA0 LPSSLDYQYDTPGLWELEEATLGASSCPCVESVQGSTLMPVHVEREIRLLGRNLHLFQDG .: . . . . : ...:.::.: :: : .: :.. CCDS43 IPMNHETDVNFQG--------------KNLDTVKGSSL---HV-------GSDLLKFME- 680 690 700 710 950 960 970 980 990 1000 pF1KA0 PGDNECVMELEGLEVVVEARVECEPPPDTQCHVTCQQHQLSYEALQPELRVGLFLRRAGR : .:. : . . : .::..: . : . :... :. CCDS43 P----VTMQESGTFAF-------RTP------------KLSHDA-NETLPLHLYVKSYGK 720 730 740 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KA0 LRVDSAEGLHVVLYDCSVGHGDCSRCQTAMPQYGCVWCEGERPRCVTREACGEAEAVATQ .:: :::.::.:: :..::: :..: :.: :.:: :. ::: . :. .... CCDS43 -NIDSK--LHVTLYNCSFGRSDCSLCRAANPDYRCAWCGGQS-RCVYEALCN----TTSE 750 760 770 780 790 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KA0 CPAPLIHSVEPLTGPVDGGTRVTIRGSNLGQHVQDVLGMVTVAGVPCAVDAQEYEVSSSL :: :.: ..: :::. :: :.:: ::::: .. :. ..::: :. . ..: ::. . CCDS43 CPPPVITRIQPETGPLGGGIRITILGSNLGVQAGDIQ-RISVAGRNCSFQPERYSVSTRI 800 810 820 830 840 850 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KA0 VCITGASGEEVAGATAVEVPGR-GRGVSEHDFAYQDPKVHSIFPARGPRAGGTRLTLNGS ::. :. .:.. :.: :. ::. . .:..:.:: :. : .::.:::: ::..:. CCDS43 VCVIEAAETPFTGGVEVDVFGKLGRSPPNVQFTFQQPKPLSVEPQQGPQAGGTTLTIHGT 860 870 880 890 900 910 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KA0 KLLTGRLEDIRVVVGDQPCHLLPEQQSEQLRCETSPRPTPATLPVAVWFGATERRLQRGQ .: :: ::.::... ::.. . . ::.: :.:. : . . . : .:.. CCDS43 HLDTGSQEDVRVTLNGVPCKV--TKFGAQLQCVTGPQATRGQMLLEVSYGGSPVPNPGIF 920 930 940 950 960 970 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KA0 FKYTLDPNITSAGPTKSFLSGGREICVRGQNLDVVQTPRIRVTVVSRMLQPSQGLGRRRR : : .: . . : .:: :::: : : ::.....: :. ..:... :: : CCDS43 FTYRENPVLRAFEPLRSFASGGRSINVTGQGFSLIQ--RFAMVVIAEPLQSWQP------ 980 990 1000 1010 1020 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KA0 VVPETACSLGPSCSSQQFEEPCHVNSSQLITCRTPALPGLPEDPWVRVEFILDNLVFDFA :. : :: : . . : :..... .::.: :: . : . .:. . CCDS43 --PREAESLQPM-TVVGTDYVFH-NDTKVVFL-SPAVPEEPEAYNLTVLIEMDGHRALLR 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KA0 TLNPTPFSYEADPTLQPLNPEDPTMPFRHKPGSVFSVEGENLDLAMSKEEVVAMIGDGPC : . : : :::. :. : ... .... ..: ::. ::. .:. :..: : CCDS43 T-EAGAFEYVPDPTF-----ENFTGGVKKQVNKLIHARGTNLNKAMTLQEAEAFVGAERC 1090 1100 1110 1120 1130 1430 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KA0 VVKTLTRHHLYCEPPVEQPLPRHHALREAPDSLPEFTVQMGNLRFSLGHVQYDGESPGAF ..::::. :::::: :: :... :.. .:::: :..:. .. ::.:.:: . CCDS43 TMKTLTETDLYCEPPEVQPPPKRRQKRDTTHNLPEFIVKFGSREWVLGRVEYDTR----- 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1490 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KA0 PVAAQVGLGVGTSLLALGVIIIVLM----YRRKSKQALRDYKKVQIQLENLESSVRDRCK ...: :.. :. . ..... . : :::.:: :.:.:.. :::.:: ::::::: CCDS43 --VSDVPLSLILPLVIVPMVVVIAVSVYCYWRKSQQAEREYEKIKSQLEGLEESVRDRCK 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1550 1560 1570 1580 1590 pF1KA0 KEFTDLMTEMTDLTSDLLGSGIPFLDYKVYAERIFF-P---GHRESPLHRDLGVPESRRP ::::::: :: : :.:. .::: ::::.:..:.:: : : .. . : .:: ::: CCDS43 KEFTDLMIEMEDQTNDVHEAGIPVLDYKTYTDRVFFLPSKDGDKDVMITGKLDIPEPRRP 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1600 1610 1620 1630 1640 1650 pF1KA0 TVEQGLGQLSNLLNSKLFLTKFIHTLESQRTFSARDRAYVASLLTVALHGKLEYFTDILR .:::.: :.::::::: :: .::::::.:: :::: ..: ::::::::::::::.:::.. CCDS43 VVEQALYQFSNLLNSKSFLINFIHTLENQREFSARAKVYFASLLTVALHGKLEYYTDIMH 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1660 1670 1680 1690 1700 1710 pF1KA0 TLLSDLVAQYV-AKNPKLMLRRTETVVEKLLTNWMSICLYTFVRDSVGEPLYMLFRGIKH ::. .:. ::: ::::::::::.:::::..:.:::::::: ...::.::::: ::..::: CCDS43 TLFLELLEQYVVAKNPKLMLRRSETVVERMLSNWMSICLYQYLKDSAGEPLYKLFKAIKH 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1720 1730 1740 1750 1760 1770 pF1KA0 QVDKGPVDSVTGKAKYTLNDNRLLREDVEYRPLTLNALLAVGPGAGEAQGVPVKVLDCDT ::.:::::.: ::::::::. :: .:::: :::..... :. ...:::::.::: CCDS43 QVEKGPVDAVQKKAKYTLNDTGLLGDDVEYAPLTVSVIVQ-DEGV---DAIPVKVLNCDT 1440 1450 1460 1470 1480 1780 1790 1800 1810 1820 1830 pF1KA0 ISQAKEKMLDQLYKGVPLTQRPDPRTLDVEWRSGVAGHLILSDEDVTSEVQGLWRRLNTL :::.:::..::.:.: : . : : .. .::: : ... :::: :.::. .: :.:.::: CCDS43 ISQVKEKIIDQVYRGQPCSCWPRPDSVVLEWRPGSTAQ-ILSDLDLTSQREGRWKRVNTL 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1840 1850 1860 1870 1880 1890 pF1KA0 QHYKVPDGATVALVPCLTKHVLRENQDYVPGERTPMLEDVDEGGIRPWHLVKPSDEPEPP .::.: ::::. : ... ...:. .:::: .::. . : ::::.:.:: . CCDS43 MHYNVRDGATLILSKVGVSQQPEDSQQDLPGERHALLEEEN----RVWHLVRPTDEVDEG 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1900 1910 1920 1930 1940 1950 pF1KA0 RPRRGSLRGGERERAKAIPEIYLTRLLSMKGTLQKFVDDLFQVILSTSRPVPLAVKYFFD . .:::.. :.::.::: :::::::::.:::::.:::..:: .:. .. :: ::::::: CCDS43 KSKRGSVK--EKERTKAITEIYLTRLLSVKGTLQQFVDNFFQSVLAPGHAVPPAVKYFFD 1610 1620 1630 1640 1650 1960 1970 1980 1990 2000 2010 pF1KA0 LLDEQAQQHGISDQDTIHIWKTNSLPLRFWINIIKNPQFVFDVQTSDNMDAVLLVIAQTF .:::::..:.:.:.::::::::::::::::.::.:::.:.:::.. . .:: : :::::: CCDS43 FLDEQAEKHNIQDEDTIHIWKTNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEVVDASLSVIAQTF 1660 1670 1680 1690 1700 1710 2020 2030 2040 2050 2060 2070 pF1KA0 MDACTLADHKLGRDSPINKLLYARDIPRYKRMVERYYADIRQTVPASDQEMNSVLAELSW ::::: ..:::.:::: ::::::..: ::.::: :: ::: : .:::.::. :::.: CCDS43 MDACTRTEHKLSRDSPSNKLLYAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSDQDMNTHLAEISR 1720 1730 1740 1750 1760 1770 2080 2090 2100 2110 2120 2130 pF1KA0 NYSGDLGARVALHELYKYINKYYDQIITALEEDGTAQKMQLGYRLQQIAAAVENKVTDL .. .:.. ::::.::.: .::::.::.::::: .::::::..::::::::.::::::: CCDS43 AHTDSLNTLVALHQLYQYTQKYYDEIINALEEDPAAQKMQLAFRLQQIAAALENKVTDL 1780 1790 1800 1810 1820 1830 >>CCDS33847.2 PLXNA1 gene_id:5361|Hs108|chr3 (1896 aa) initn: 2737 init1: 684 opt: 1243 Z-score: 559.3 bits: 117.0 E(32554): 7.9e-25 Smith-Waterman score: 3341; 32.9% identity (57.1% similar) in 2216 aa overlap (8-2124:20-1888) 10 20 30 40 pF1KA0 MPALGPALLQALWAGWVLTL-----QPLPPTAFTPNGTYLQHLARDPT :: ..:: : :: : .:. . : ::. CCDS33 MPLPPRSLQVLLLLLLLLLLLPGMWAEAGLPRAGGGSQP-PFRTFSASDWGLTHLVVHEQ 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KA0 SGTLYLGATNFLFQLSPGLQLEATVSTGPVLDSRDCLPPVMPDECPQAQ-PTNNPNQLLL .: .:.::.: ...:: .: : . :::: :.. : :: . ::.. :.: :.::: CCDS33 TGEVYVGAVNRIYKLSGNLTLLRAHVTGPVEDNEKCYPPPSVQSCPHGLGSTDNVNKLLL 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KA0 VSPGA--LVVCGSVHQGVCEQRRLGQLEQLLLRPERPGDTQYVAANDPAVSTVGLVAQGL .. .: :..:::. ::.:. :: .: .: .:.. . .:... . : : .:.. : CCDS33 LDYAANRLLACGSASQGICQFLRLDDLFKLG-EPHHRKE-HYLSSVQEAGSMAGVLIAGP 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 pF1KA0 AGEPL--LFVGRGYTSRGVGGGIPPITTRALWPPDPQA---AFSYEE---TAKLAV---- :. :::: : . .: ...: : . .: .: :.. ...: . CCDS33 PGQGQAKLFVGTPID--GKSEYFPTLSSRRLMANEEDADMFGFVYQDEFVSSQLKIPSDT 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 pF1KA0 -GRLSEYSHHFVSAFARGASAYFLFLRRDLQAQS------RAFRAYVSRVCLRDQHYYSY ... .. ..: .: .:.: :. : : : . : . . :.:. : ..::: CCDS33 LSKFPAFDIYYVYSFRSEQFVYYLTLQLDTQLTSPDAAGEHFFTSKIVRLCVDDPKFYSY 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 pF1KA0 VELPLACE--GGRYGLIQAAAVAT-SREVAHG-------EVLFAAFSSAAPPTVGRPPSA ::.:..:: : .: :.: : .. .: .:: .:::..:... : .::. CCDS33 VEFPIGCEQAGVEYRLVQDAYLSRPGRALAHQLGLAEDEDVLFTVFAQGQKNRV-KPPKE 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 pF1KA0 AAGASGASALCAFPLDEVDRLANRTRDACYTREGRAEDGTEVAYIEYDVNSD--CAQLPV :::: : : . . .. ..:: ::. . . .:.. : . :. CCDS33 -------SALCLFTLRAIKEKIKERIQSCYRGEGKLS-------LPWLLNKELGCINSPL 360 370 380 390 400 370 380 390 400 410 420 pF1KA0 DTLDAYPCGSDHTPSPMASRVPLEATPILEWPGIQLTAVAVTMEDGHTIAFLGDSQGQLH . : . ::.: . .:... : .:.::.. :::::. :.:..: : .:... CCDS33 QIDDDF-CGQDFN-QPLGGTVTIEGTPLFVDKDDGLTAVAAYDYRGRTVVFAGTRSGRIR 410 420 430 440 450 430 440 450 460 470 480 pF1KA0 RVYL---GPGSDGHP---YSTQSIQQGSAVSRDLTFDGTFEHLYVMTQSTLLKVPVASCA .. . .:: :.: : . :.:: . :::... . ..::.::.. . .::: ::. CCDS33 KILVDLSNPG--GRPALAYESVVAQEGSPILRDLVLSPNHQYLYAMTEKQVTRVPVESCV 460 470 480 490 500 510 490 500 510 520 530 540 pF1KA0 QHLDCASCLAHRDPYCGWCVLLGRCSRRSECSRGQGPEQWLWSFQPELGCLQVAAMSPAN :. .: ::. :::.:::::: . ::::. : :.. :... .. : :.:.. ..: : CCDS33 QYTSCELCLGSRDPHCGWCVLHSICSRRDACERADEPQRFAADL---LQCVQLT-VQPRN 520 530 540 550 560 570 550 560 570 580 590 600 pF1KA0 ISREETR-EVFLSVPDLPPLWPGESYSCHFGEH-QSPALLTGSGVMCPSPDPSEAPVLPR .: .. . :.. ..: : : .: : . .: ..: . . : ::. :. . : CCDS33 VSVTMSQVPLVLQAWNVPDLSAG--VNCSFEDFTESESVLEDGRIHCRSPSAREVAPITR 580 590 600 610 620 630 610 620 630 640 650 pF1KA0 G-ADYVSVSVELRFGAV--VIAKTSLSFYDCVAVTELRPSAQCQACVSSRWGCNWCVWQH : .: :.. :. . .:.... ::.: .: . .: .::.. . :.:: ..: CCDS33 GQGDQRVVKLYLKSKETGKKFASVDFVFYNC-SVHQ-----SCLSCVNGSFPCHWCKYRH 640 650 660 670 680 660 670 680 690 700 710 pF1KA0 LCTHK-ASCDAGPMVASHQSPLVSPDPPARGGPSPSPPTAPKALATPAPDTLPVEPGAPS .:::. :.: CCDS33 VCTHNVADC--------------------------------------------------- 690 720 730 740 750 760 770 pF1KA0 TATASDISPGASPSLLSPWGPWAGSGSISSPGSTGSPLHEEPSPPSPQNGPGTAVPAPTD CCDS33 ------------------------------------------------------------ 780 790 800 810 820 830 pF1KA0 FRPSATPEDLLASPLSPSEVAAVPPADPGPEALHPTVPLDLPPATVPATTFPGAMGSVKP CCDS33 ------------------------------------------------------------ 840 850 860 870 880 890 pF1KA0 ALDWLTREGGELPEADEWTGGDAPAFSTSTLLSGDGDSAELEGPPAPLILPSSLDYQYDT :: : : . .: : ::::. : CCDS33 ------------------------AF-----LEGRVNVSE----DCPQILPSTQIY---- 700 710 900 910 920 930 940 950 pF1KA0 PGLWELEEATLGASSCPCVESVQGSTLMPVHVEREIRLLGRNLHLFQDGPGDNECVMELE .:: : . : : .::: :.: ::.... CCDS33 ---------------------------VPVGVVKPITLAARNLPQPQSGQRGYECLFHIP 720 730 740 960 970 980 990 1000 1010 pF1KA0 GLEVVVEARVECEPPPDTQCHVTCQQHQLSYEALQ-PELRVGLFLRRAGRLRVDSAEGLH : ::: ... . ::. . :::. . .: :.: . : . .:. .... CCDS33 G----SPARVTALRFNSSS--LQCQNSSYSYEGNDVSDLPVNLSVVWNGNFVIDNPQNIQ 750 760 770 780 790 800 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KA0 VVLYDCSVGHGDCSRCQTAMPQYGCVWCEGERPRCVTREACG--------EAEAVATQCP . :: : . . .:. : : :.. : :: .:: :: :. :. .:. ...: CCDS33 AHLYKCPALRESCGLCLKADPRFECGWCVAER-RCSLRHHCAADTPASWMHARHGSSRCT 810 820 830 840 850 860 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KA0 APLIHSVEPLTGPVDGGTRVTIRGSNLGQHVQDVLGMVTVAGVPCAVDAQEYEVSSSLVC : : .. : ::: .::::.:: : ::: . .:: : :. : :. .:: . ..:: CCDS33 DPKILKLSPETGPRQGGTRLTITGENLGLRFEDVRLGVRVGKVLCSPVESEYISAEQIVC 870 880 890 900 910 920 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KA0 ITGASGEEVAGATAVEVPGRG-----RGVSEHDFAYQDPKVHSIFPARGPRAGGTRLTLN : .. : . ::: : :..: . :.. : . . :.::: .::: . .. CCDS33 EIGDASSVRAHDALVEVCVRDCSPHYRALSPKRFTFVTPTFYRVSPSRGPLSGGTWIGIE 930 940 950 960 970 980 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KA0 GSKLLTGRLEDIRVVVGDQPCHLLPEQQSEQLRCETSPRPTPATLPVAVWFGATERRLQR ::.: .: :. : :: .:: . ..:...:: : : .:.. :. . .. .. . CCDS33 GSHLNAG--SDVAVSVGGRPCSF-SWRNSREIRCLTPPGQSPGSAPIIININRAQLTNPE 990 1000 1010 1020 1030 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KA0 GQFKYTLDPNITSAGPTKSFLSGGREICVRGQNLDVVQTPRIRVTVVSRMLQPSQGLGRR ...:: ::.: : :. ::: . : : :: .:. ::::. :. : CCDS33 VKYNYTEDPTILRIDPEWSINSGGTLLTVTGTNLATVREPRIRAKY--------GGIER- 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KA0 RRVVPETACSLGPSCSSQQFEEPCHVNSSQLITCRTPAL-------PGLPEDPWVRVEFI :. : : .. ..::.:.. : : : : .. :. CCDS33 --------------------ENGCLVYNDTTMVCRAPSVANPVRSPPELGERP-DELGFV 1100 1110 1120 1360 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KA0 LDNLVFDFATLNPTPFSYEADPTLQPLNPEDPTMPFRHKPGSVFSVEGENL---DLAMSK .:: : .. .:: : : : ::.:.::.: : .. ::.: . ..:.:: . :. CCDS33 MDN-VRSLLVLNSTSFLYYPDPVLEPLSP---TGLLELKPSSPLILKGRNLLPPAPGNSR 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1420 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KA0 EEVVAMIGDGPCVVKTLTRHHLYCEPPVEQPLPRHHALREAPDSLPEFTVQMGNLRFSLG . ...::. ::.. :... .: :: : : .: . ::. :...:: : CCDS33 LNYTVLIGSTPCTL-TVSETQLLCEAP---NLTGQHKV----------TVRAGGFEFSPG 1190 1200 1210 1220 1230 1480 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KA0 HVQYDGESPGAFPVAAQVGLGVGTSLLALGVIIIVLMYRRKSKQALRDYKKVQIQLENLE .: ..: ..: : ::.: : .:: : .. ... :.:::..: : :..:.:..::: CCDS33 TLQVYSDSLLTLP--AIVGIGGGGGLLLLVIVAVLIAYKRKSRDADRTLKRLQLQMDNLE 1240 1250 1260 1270 1280 1540 1550 1560 1570 1580 1590 pF1KA0 SSVRDRCKKEFTDLMTEMTDLTSDLLGSGIPFLDYKVYAERIFFPGHRESPLHRDLGVPE : : .::. :..:.:.. .::.:: :.:::::::..:: :..::: .. :. ... : CCDS33 SRVALECKEAFAELQTDIHELTNDLDGAGIPFLDYRTYAMRVLFPGIEDHPVLKEMEV-- 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1600 1610 1620 1630 1640 1650 pF1KA0 SRRPTVEQGLGQLSNLLNSKLFLTKFIHTLESQRTFSARDRAYVASLLTVALHGKLEYFT . .::..: ...::..: :: ::.:::.::.:: :::. ::::. .::.:..:: : CCDS33 --QANVEKSLTLFGQLLTKKHFLLTFIRTLEAQRSFSMRDRGNVASLIMTALQGEMEYAT 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1660 1670 1680 1690 1700 1710 pF1KA0 DILRTLLSDLVAQYV-AKN-PKLMLRRTETVVEKLLTNWMSICLYTFVRDSVGEPLYMLF .:. :::::. . . .:: :::.:::::.:.::.::::... :: :... .::::.::. CCDS33 GVLKQLLSDLIEKNLESKNHPKLLLRRTESVAEKMLTNWFTFLLYKFLKECAGEPLFMLY 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1720 1730 1740 1750 1760 1770 pF1KA0 RGIKHQVDKGPVDSVTGKAKYTLNDNRLLREDVEYRPLTLNALLAVGPGAGEAQGVPVKV .::.:..:::.:..::.:.:.:....:.:....:. :::: :.: .: :::: CCDS33 CAIKQQMEKGPIDAITGEARYSLSEDKLIRQQIDYKTLTLN---CVNPENENAPEVPVKG 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1780 1790 1800 1810 1820 1830 pF1KA0 LDCDTISQAKEKMLDQLYKGVPLTQRPDPRTLDVEWRSGVAGHLILSDEDVTSEVQGLWR :::::..:::::.:: ::::: .::: .:.:::.: ...::.:::::..... :. CCDS33 LDCDTVTQAKEKLLDAAYKGVPYSQRPKAADMDLEWRQGRMARIILQDEDVTTKIDNDWK 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1840 1850 1860 1870 pF1KA0 RLNTLQHYKVPDGATVALVP------------CLTKHVLR-ENQDYVPGE------RTPM ::::: ::.: ::..::::: .:: . : :.. . . :::: CCDS33 RLNTLAHYQVTDGSSVALVPKQTSAYNISNSSTFTKSLSRYESMLRTASSPDSLRSRTPM 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1880 1890 1900 1910 1920 1930 pF1KA0 LEDVDEGGIRPWHLVKPSDEPEPPRPRRGSLRGGERERAKAIPEIYLTRLLSMKGTLQKF . :.: . ::::: :. . . ::: : . ::::::::. ::::::: CCDS33 ITPDLESGTKLWHLVKNHDHLDQREGDRGS---------KMVSEIYLTRLLATKGTLQKF 1650 1660 1670 1680 1690 1940 1950 1960 1970 1980 pF1KA0 VDDLFQVILSTSR---PVPLAVKYFFDLLDEQAQQHGISDQDTIHIWKTNSLPLRFWINI :::::..:.::.. .:::.::.::.:::::..: : : :. : ::.: ::::::.:. CCDS33 VDDLFETIFSTAHRGSALPLAIKYMFDFLDEQADKHQIHDADVRHTWKSNCLPLRFWVNV 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1990 2000 2010 2020 2030 2040 pF1KA0 IKNPQFVFDVQTSDNMDAVLLVIAQTFMDACTLADHKLGRDSPINKLLYARDIPRYKRMV :::::::::.. .. :: : :.::::::.:. ..::::.::: ::::::.::: :: : CCDS33 IKNPQFVFDIHKNSITDACLSVVAQTFMDSCSTSEHKLGKDSPSNKLLYAKDIPNYKSWV 1760 1770 1780 1790 1800 1810 2050 2060 2070 2080 2090 2100 pF1KA0 ERYYADIRQTVPASDQEMNSVLAELSWNYSGDLGARVALHELYKYINKYYDQIITALEED ::::::: . :::.:.. ::: : . ..... ::::.:.::.:: :.:..:::.: CCDS33 ERYYADIAKMPAISDQDMSAYLAEQSRLHLSQFNSMSALHEIYSYITKYKDEILAALEKD 1820 1830 1840 1850 1860 1870 2110 2120 2130 pF1KA0 GTAQKMQLGYRLQQIAAAVENKVTDL :....: .:.:. CCDS33 EQARRQRLRSKLEQVVDTMALSS 1880 1890 >>CCDS14752.1 PLXNA3 gene_id:55558|Hs108|chrX (1871 aa) initn: 2561 init1: 690 opt: 1178 Z-score: 531.0 bits: 111.8 E(32554): 2.9e-23 Smith-Waterman score: 3152; 31.9% identity (56.4% similar) in 2219 aa overlap (1-2128:1-1867) 10 20 30 40 50 60 pF1KA0 MPALGPALLQALWAGWVLTLQPLPPTAFTPNGTYLQHLARDPTSGTLYLGATNFLFQLSP ::.. :: : .: .: .:. ::. . : : ::: ..: ...::.: .:.:.: CCDS14 MPSVCLLLLLFLAVGGALGNRPF--RAFVVTDTTLTHLAVHRVTGEVFVGAVNRVFKLAP 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KA0 GL-QLEATVSTGPVLDSRDCLPPVMPDECPQA-QPTNNPNQLLLVSPGA--LVVCGSVHQ .: .:.: : :::: :. : :: : . :..: :.:::.. .: ::.:::. : CCDS14 NLTELRAHV-TGPVEDNARCYPPPSMRVCAHRLAPVDNINKLLLIDYAARRLVACGSIWQ 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KA0 GVCEQRRLGQLEQLLLRPERPGDTQYVAANDPAVSTVGLVAQGLAGEPLLFVGRGYTSRG :.:. :: .: .: .:.. . .:..: : .:.... : :::: . : CCDS14 GICQFLRLDDLFKLG-EPHHRKEHYLSGAQEPD-SMAGVIVEQGQGPSKLFVGTAVD--G 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KA0 VGGGIPPITTRALWPPDPQA-AFS--YEET-----AKLAVGRLSEYSH---HFVSAFARG . .: ...: : . .: :: :.. :. :: : ... .:. . CCDS14 KSEYFPTLSSRKLISDEDSADMFSLVYQDEFVSSQIKIPSDTLSLYPAFDIYYIYGFVSA 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KA0 ASAYFLFLRRDLQ------AQSRAFRAYVSRVCLRDQHYYSYVELPLAC--EGGRYGLIQ . .::: :. : : : . : . . :.: :...:::::.:..: .: .: :.: CCDS14 SFVYFLTLQLDTQQTLLDTAGEKFFTSKIVRMCAGDSEFYSYVEFPIGCSWRGVEYRLVQ 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 pF1KA0 AAAVATSREV--------AHGEVLFAAFSSAAPPTVGRPPSAAAGASGASALCAFPLDEV .: .: . : .:::. ::.. .. :: . :: : :... CCDS14 SAHLAKPGLLLAQALGVPADEDVLFTIFSQGQKNRAS-PPRQ-------TILCLFTLSNI 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 pF1KA0 DRLANRTRDACYTREGRAEDGTEVAYIEYDVNSD--CAQLPVDTLDAYPCGSDHTPSPMA . : ..:: :: . . .:.. : . :.. ... :: . .:.. CCDS14 NAHIRRRIQSCYRGEGTLA-------LPWLLNKELPCINTPMQ-INGNFCGLVLN-QPLG 350 360 370 380 390 390 400 410 420 430 440 pF1KA0 SRVPLEATPILEWPGIQLTAVAVTMEDGHTIAFLGDSQGQLHRVYLGPGSDGHPYSTQSI . .:. :.: ...::. :...:.: .:.:..: . .:.: : : . CCDS14 GLHVIEGLPLLADSTDGMASVAAYTYRQHSVVFIGTRSGSLKKVRVDGFQDAHLYETVPV 400 410 420 430 440 450 450 460 470 480 490 500 pF1KA0 QQGSAVSRDLTFDGTFEHLYVMTQSTLLKVPVASCAQHLDCASCLAHRDPYCGWCVLLGR .:: . ::: :. .:.:..... . ..:: .: :. .::.::. ::.:::::: : CCDS14 VDGSPILRDLLFSPDHRHIYLLSEKQVSQLPVETCEQYQSCAACLGSGDPHCGWCVLRHR 460 470 480 490 500 510 510 520 530 540 550 560 pF1KA0 CSRRSECSRGQGPEQWLWSFQPELG-CLQVAAMSPANIS-REETREVFLSVPDLPPLWPG : :.. : ...:. .: ::. :.:: . : :.: .. ... ..: : : CCDS14 CCREGACLGASAPH----GFAEELSKCVQVR-VRPNNVSVTSPGVQLTVTLHNVPDLSAG 520 530 540 550 560 570 570 580 590 600 610 620 pF1KA0 ESYSCHF-GEHQSPALLTGSG-VMCPSPDPSEAPVLPRGADYV-SVSVEL--RFGAVVIA :: : . .. :.: :: ..::::. .: .: :: . .: ..: . .: .: CCDS14 --VSCAFEAAAENEAVLLPSGELLCPSPSLQELRALTRGHGATRTVRLQLLSKETGVRFA 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 pF1KA0 KTSLSFYDCVAVTELRPSAQCQACVSSRWGCNWCVWQHLCTHKASCDAGPMVASHQSPLV ... ::.: .. .:..::.: . :.:: ..: :: . : : : CCDS14 GADFVFYNCSVL------QSCMSCVGSPYPCHWCKYRHTCTSR------PHECSFQE--- 630 640 650 660 670 690 700 710 720 730 740 pF1KA0 SPDPPARGGPSPSPPTAPKALATPAPDTLPVEPGAPSTATASDISPGASPSLLSPWGPWA CCDS14 ------------------------------------------------------------ 750 760 770 780 790 800 pF1KA0 GSGSISSPGSTGSPLHEEPSPPSPQNGPGTAVPAPTDFRPSATPEDLLASPLSPSEVAAV : . :: CCDS14 --GRVHSP---------------------------------------------------- 680 810 820 830 840 850 860 pF1KA0 PPADPGPEALHPTVPLDLPPATVPATTFPGAMGSVKPALDWLTREGGELPEADEWTGGDA :: CCDS14 --------------------------------------------EG-------------- 870 880 890 900 910 920 pF1KA0 PAFSTSTLLSGDGDSAELEGPPAPLILPSSLDYQYDTPGLWELEEATLGASSCPCVESVQ : :::: CCDS14 ----------------------CPEILPS------------------------------- 930 940 950 960 970 980 pF1KA0 GSTLMPVHVEREIRLLGRNLHLFQDGPGDNECVMELEGLEVVVEARVECEPPPDTQCHVT :. :.:: : . . : ..:: :.: . :::....: . : : :. . . : CCDS14 GDLLIPVGVMQPLTLRAKNLPQPQSGQKNYECVVRVQGRQQRVPA-VRFN-----SSSVQ 690 700 710 720 730 740 990 1000 1010 1020 1030 pF1KA0 CQQHQLSYEALQP-ELRVGLFLRRAGRLRVDSAEGLHVVLYDCSVGHGDCSRCQTAMPQY ::. . :::. . . .. . . : . .:. .....:: : . . .:. : : :.. CCDS14 CQNASYSYEGDEHGDTELDFSVVWDGDFPIDKPPSFRALLYKCWAQRPSCGLCLKADPRF 750 760 770 780 790 800 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KA0 GCVWCEGERPRCVTREACGEAEAV-------ATQCPAPLIHSVEPLTGPVDGGTRVTIRG .: :: .:. :: : : .. .:.: : : ...::.:: .::::::: : CCDS14 NCGWCISEH-RCQLRTHCPAPKTNWMHLSQKGTRCSHPRITQIHPLVGPKEGGTRVTIVG 810 820 830 840 850 860 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KA0 SNLGQHVQDVLGMVTVAGVPCAVDAQEYEVSSSLVCITGASGEEVAGATAVEV-----PG ::: ..: :. :::: : :: . .:: : ::. . CCDS14 ENLGLLSREV-GL-RVAGVRCNSIPAEYISAERIVCEMEESLVPSPPPGPVELCVGDCSA 870 880 890 900 910 920 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KA0 RGRGVSEHDFAYQDPKVHSIFPARGPRAGGTRLTLNGSKLLTGRLEDIRVVVGDQPCHLL : ::. ... : .. :.::: .::::::..::.: .: . :.: :. :... CCDS14 DFRTQSEQVYSFVTPTFDQVSPSRGPASGGTRLTISGSSLDAG--SRVTVTVRDSECQFV 930 940 950 960 970 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KA0 PEQQSEQLRCETSPRPT--PATLPVAVWFGATERRLQRGQFKYTLDPNITSAGPTKSFLS ..... . : :: : :. :... . .. . :: ::..: :: :... CCDS14 -RRDAKAIVC-ISPLSTLGPSQAPITLAIDRANISSPGLIYTYTQDPTVTRLEPTWSIIN 980 990 1000 1010 1020 1030 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KA0 GGREICVRGQNLDVVQTPRIRVTVVSRMLQPSQGLGRRRRVVPETACSLGPSCSSQQFEE :. : : : .: .:: ::.:. . : . ::. . CCDS14 GSTAITVSGTHLLTVQEPRVRA--------------KYRGI--ETTNT------------ 1040 1050 1060 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KA0 PCHVNSSQLITCRTPALP-GLPEDPWVRVE------FILDNLVFDFATLNPTPFSYEADP :.: .. . :..:.. : :. : .. : :.::. : .:: . :.: :: CCDS14 -CQVINDTAMLCKAPGIFLGRPQ-PRAQGEHPDEFGFLLDH-VQTARSLNRSSFTYYPDP 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KA0 TLQPLNPEDPTMPFRHKPGSVFSVEGENLDLAM---SKEEVVAMIGDGPCVVKTLTRHHL ...::. :. . :::: ..:.:: : :. . ...:: :: . :.. .: CCDS14 SFEPLG---PSGVLDVKPGSHVVLKGKNLIPAAAGSSRLNYTVLIGGQPCSL-TVSDTQL 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KA0 YCEPPVEQPLPRHHALREAPDSLPEFTVQMGNLRFSLGHVQYDGESPGAFPVAAQVGLGV :. : . :. .. : .:.:.: :: .. ..: ..: :..::.. CCDS14 LCDSPSQTG--RQPVM-----------VLVGGLEFWLGTLHISAERALTLP--AMMGLAA 1190 1200 1210 1220 1500 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KA0 GTSLLALGVIIIVLMYRRKSKQALRDYKKVQIQLENLESSVRDRCKKEFTDLMTEMTDLT : .:: :.. ... :.::...: : :..:.:..:::: : .::. :..:.:....:: CCDS14 GGGLLLLAITAVLVAYKRKTQDADRTLKRLQLQMDNLESRVALECKEAFAELQTDINELT 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1560 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KA0 SDLLGSGIPFLDYKVYAERIFFPGHRESPLHRDLGVPESRRPTVEQGLGQLSNLLNSKLF . . ::::::..:: :..::: . :. ..: .: :.::..: ...::.:. : CCDS14 NHMDEVQIPFLDYRTYAVRVLFPGIEAHPVLKELDTP----PNVEKALRLFGQLLHSRAF 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1620 1630 1640 1650 1660 1670 pF1KA0 LTKFIHTLESQRTFSARDRAYVASLLTVALHGKLEYFTDILRTLLSDLVAQYV-AKN-PK . ::::::.: .:: :::. :::: :::...:.: : .:. ::.::. . . .:: :: CCDS14 VLTFIHTLEAQSSFSMRDRGTVASLTMVALQSRLDYATGLLKQLLADLIEKNLESKNHPK 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1680 1690 1700 1710 1720 1730 pF1KA0 LMLRRTETVVEKLLTNWMSICLYTFVRDSVGEPLYMLFRGIKHQVDKGPVDSVTGKAKYT :.:::::.:.::.::::... :. :... .::::..:. .::.:..:::.:..::.:.:. CCDS14 LLLRRTESVAEKMLTNWFTFLLHKFLKECAGEPLFLLYCAIKQQMEKGPIDAITGEARYS 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1740 1750 1760 1770 1780 1790 pF1KA0 LNDNRLLREDVEYRPLTLNALLAVGP-GAGEAQGVPVKVLDCDTISQAKEKMLDQLYKGV :....:.:....:. :::. : : . : :: ::::::.::.:.:::.:.:: .:::. CCDS14 LSEDKLIRQQIDYKTLTLHC---VCPENEGSAQ-VPVKVLNCDSITQAKDKLLDTVYKGI 1470 1480 1490 1500 1510 1800 1810 1820 1830 1840 1850 pF1KA0 PLTQRPDPRTLDVEWRSGVAGHLILSDEDVTSEVQGLWRRLNTLQHYKVPDGATVALVP- : .::: . .:.:::.: ..::.:::::.... :.:::.: ::.: ::. ::::: CCDS14 PYSQRPKAEDMDLEWRQGRMTRIILQDEDVTTKIECDWKRLNSLAHYQVTDGSLVALVPK 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1860 1870 1880 1890 pF1KA0 ---------------CLTKH--VLRE--NQDYVPGERTPMLEDVDEGGIRPWHLVKPSDE :... .:: . : . . :.::. .: : . ::::: :. CCDS14 QVSAYNMANSFTFTRSLSRYESLLRTASSPDSLRS-RAPMITPDQETGTKLWHLVKNHDH 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1900 1910 1920 1930 1940 pF1KA0 PEPPRPRRGSLRGGERERAKAIPEIYLTRLLSMKGTLQKFVDDLFQVILSTSR---PVPL . . ::: : . ::::::::. ::::::::::::....::.. .:: CCDS14 ADHREGDRGS---------KMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETVFSTAHRGSALPL 1640 1650 1660 1670 1680 1950 1960 1970 1980 1990 2000 pF1KA0 AVKYFFDLLDEQAQQHGISDQDTIHIWKTNSLPLRFWINIIKNPQFVFDVQTSDNMDAVL :.::.::.:::::.:. ::: :. : ::.: ::::::.:.:::::::::.. .. :: : CCDS14 AIKYMFDFLDEQADQRQISDPDVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKNSITDACL 1690 1700 1710 1720 1730 1740 2010 2020 2030 2040 2050 2060 pF1KA0 LVIAQTFMDACTLADHKLGRDSPINKLLYARDIPRYKRMVERYYADIRQTVPASDQEMNS :.::::::.:. ..:.::.::: ::::::.::: :: ::::: :: . . :::.:.. CCDS14 SVVAQTFMDSCSTSEHRLGKDSPSNKLLYAKDIPNYKSWVERYYRDIAKMASISDQDMDA 1750 1760 1770 1780 1790 1800 2070 2080 2090 2100 2110 2120 pF1KA0 VLAELSWNYSGDLGARVALHELYKYINKYYDQIITALEEDGTAQKMQLGYRLQQIAAAVE :.: : ...:... ::.::: :..:: ..:.:::..:.. .: .: .:.:: . : CCDS14 YLVEQSRLHASDFSVLSALNELYFYVTKYRQEILTALDRDASCRKHKLRQKLEQIISLVS 1810 1820 1830 1840 1850 1860 2130 pF1KA0 NKVTDL CCDS14 SDS 1870 >>CCDS33854.1 PLXND1 gene_id:23129|Hs108|chr3 (1925 aa) initn: 2493 init1: 757 opt: 1144 Z-score: 516.1 bits: 109.0 E(32554): 2e-22 Smith-Waterman score: 3178; 32.9% identity (56.8% similar) in 2250 aa overlap (1-2132:31-1918) 10 20 30 pF1KA0 MPALGPALLQALWAGWVLTLQPLPPTAFTP .: : :: : :: .: .: :. :: CCDS33 MAPRAAGGAPLSARAAAASPPPFQTPPRCPVPLLLLLLLGAARAG-ALEIQRRFPSP-TP 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 pF1KA0 NGTYLQHLARDPTSGTLYLGATNFLFQLS-PGLQLEATVSTGPVLDSRDCLPPVMPDE-C .... : : ..::.::.:.: :.::: .:.::: ...::: :: : : .:. : CCDS33 TNNF----ALDGAAGTVYLAAVNRLYQLSGANLSLEAEAAVGPVPDSPLCHAPQLPQASC 60 70 80 90 100 110 90 100 110 120 130 pF1KA0 PQAQP-TNNPNQLLLVSPGA--LVVCGSVHQGVCEQRRLGQLEQLLLR------PERP-- . . :.: :..: ..:: .:::::..:: :. :: :.. . .: : .: CCDS33 EHPRRLTDNYNKILQLDPGQGLVVVCGSIYQGFCQLRRRGNISAVAVRFPPAAPPAEPVT 120 130 140 150 160 170 140 150 160 170 pF1KA0 --GDTQYVAANDPAVSTVGLV---AQGLAGEPLLFVGRGYTSRGVG-------------G . :::: : .:::::: : : .: :: :: ::. : . CCDS33 VFPSMLNVAANHPNASTVGLVLPPAAGAGGSRLL-VGATYTGYGSSFFPRNRSLEDHRFE 180 190 200 210 220 230 180 190 200 210 220 pF1KA0 GIPPITTRALWP-PDPQAAFSYE------ETAKLAVGRLSEYSHHFVSAFAR------GA . : :. :.: : :... . :. : ... ::::: . :: CCDS33 NTPEIAIRSLDTRGDLAKLFTFDLNPSDDNILKIKQGAKEQHKLGFVSAFLHPSDPPPGA 240 250 260 270 280 290 230 240 250 260 270 pF1KA0 SAY-FLFLRRDLQA---QSRAFRAYVSRVCL-------RDQHYYSYVELPLACEGGR-YG ..: .: : . .: .:.: :. ..:.:: . ::..: : : :: : CCDS33 QSYAYLALNSEARAGDKESQA-RSLLARICLPHGAGGDAKKLTESYIQLGLQCAGGAGRG 300 310 320 330 340 350 280 290 300 310 320 330 pF1KA0 LIQAAAVATSREVAHGEVLFAAFSSAAPPTVGRPPSAAAGASGASALCAFPLDEVDRLAN . . :.. : :::.: :: .. :. .. .::::: . .: : : CCDS33 DLYSRLVSV---FPARERLFAVFE--------RPQGSPAARAAPAALCAFRFADV-RAAI 360 370 380 390 400 340 350 360 370 380 pF1KA0 RT-RDACYTREGRAEDGTEVA-YIEYDVNSDCA-----QLPVDTLDAYPCGSDHTPSPMA :. : ::... : : . : . .. : :: . :: ::. : :.. CCDS33 RAARTACFVEP--APDVVAVLDSVVQGTGPACERKLNIQLQPEQLD---CGAAHLQHPLS 410 420 430 440 450 390 400 410 420 430 440 pF1KA0 SRVPLEATPILEWPGIQLTAVAVTMEDGHTIAFLGDSQGQLHRVYLGPGSDGHPYSTQSI ::.:::... :: ::.:::. ...: .::: .:.: .. :. . . . .. CCDS33 ILQPLKATPVFRAPG--LTSVAVASVNNYTAVFLGTVNGRLLKINLNESMQVVSRRVVTV 460 470 480 490 500 510 450 460 470 480 490 500 pF1KA0 QQGSAVSRDLTFD-GTFEHLYVMTQSTLLKVPVASCAQHLDCASCLAHRDPYCGWCVLLG : : . . :: . .::.::. . .: ::.: : :..:.. : :::::.: CCDS33 AYGEPVHHVMQFDPADSGYLYLMTSHQMARVKVAACNVHSTCGDCVGAADAYCGWCALET 520 530 540 550 560 570 510 520 530 540 550 560 pF1KA0 RCSRRSECSRGQGPEQWLWSFQPELGCLQVAAMS--PANIS-REETREVFLSVPDLPPLW ::. ...:. .. .: .:. : : . ::. :..:. :.: ..:.. : CCDS33 RCTLQQDCTNSS--QQHFWTSASE-GPSRCPAMTVLPSEIDVRQEYPGMILQISGSLPSL 580 590 600 610 620 630 570 580 590 600 610 pF1KA0 PGESYSCHFGEH-----QSPALLTGSGV-MCPSPDPSEAPVLPRGADYVSVSVELRFGAV : ..: .:.. . :. : . .: .. : .: . :.:.: . .: .. CCDS33 SGMEMACDYGNNIRTVARVPGPAFGHQIAYCNLLPRDQFPPFPPNQDHVTVEMSVRVNGR 640 650 660 670 680 690 620 630 640 650 660 670 pF1KA0 VIAKTSLSFYDCVAVTELRPSAQCQACVSSRWGCNWCVWQHLC-THKASCDAGPMVASHQ :.:.....::: .... : . : .:.:..: : :: :: : .... :.:.: CCDS33 NIVKANFTIYDCSRTAQVYPHTACTSCLSAQWPCFWCSQQHSCVSNQSRCEASP------ 700 710 720 730 740 680 690 700 710 720 730 pF1KA0 SPLVSPDPPARGGPSPSPPTAPKALATPAPDTLPVEPGAPSTATASDISPGASPSLLSPW CCDS33 ------------------------------------------------------------ 740 750 760 770 780 790 pF1KA0 GPWAGSGSISSPGSTGSPLHEEPSPPSPQNGPGTAVPAPTDFRPSATPEDLLASPLSPSE .: :::. : : : :::.: CCDS33 -----------------------NPTSPQDCPRT-----------------LLSPLAP-- 750 760 800 810 820 830 840 850 pF1KA0 VAAVPPADPGPEALHPTVPLDLPPATVPATTFPGAMGSVKPALDWLTREGGELPEADEWT :: : CCDS33 ---VP------------------------------------------------------T 860 870 880 890 900 910 pF1KA0 GGDAPAFSTSTLLSGDGDSAELEGPPAPLILPSSLDYQYDTPGLWELEEATLGASSCPCV :: ....: ...: ..: ..:. .. :: :. :: CCDS33 GG------SQNILVPLANTAFFQG--------AALECSF---GLEEIFEA---------- 770 780 790 920 930 940 950 960 970 pF1KA0 ESVQGSTLMPVHVEREIRLLGRNLHLFQDGPGDNECVMELEGLEVVVEARVECEPPPDTQ : : :: : :.:. .. CCDS33 ----------VWV--------------------NESV-------------VRCD---QVV 800 810 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KA0 CHVTCQQHQLSYEALQPELRVGLFLRRAGRLRVDSAEGLHVVLYDCSVGHGDCSRCQTAM :.: .. :. .:: . : . :: :: : . :..:.:..: :::.: . CCDS33 LHTT-RKSQVFPLSLQLKGRPARFL--------DSPEPMTVMVYNCAMGSPDCSQC-LGR 820 830 840 850 860 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KA0 PQYG--CVWCEGERPRCVTREACGEAEAVATQCPAPLIHSVEPLTGPVDGGTRVTIRGSN . : :.: .: : : : . .: :::: ::..:::.::.:::: .:::: : CCDS33 EDLGHLCMWSDGCRLR-------GPLQPMAGTCPAPEIHAIEPLSGPLDGGTLLTIRGRN 870 880 890 900 910 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KA0 LGQHVQDVLGMVTVAGVPCAVDAQEYEVSSSLVCITGASGEEVAGATAVEVPGRGRGVSE ::....:: : ..:: : ..: :: .::.:: . ..:...:.. .:. :. CCDS33 LGRRLSDVAHGVWIGGVACEPLPDRYTVSEEIVCVTGPAPGPLSGVVTVNASKEGK--SR 920 930 940 950 960 970 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KA0 HDFAYQDPKVHSIFPARGPRAGGTRLTLNGSKLLTGRLEDIRVVVGD-QPCHLLPEQQSE :.: : :::. :. ::.:::::.:..:. : .: ...:.:.: .:: : . .. CCDS33 DRFSYVLPLVHSLEPTMGPKAGGTRITIHGNDLHVG--SELQVLVNDTDPCTELMRTDT- 980 990 1000 1010 1020 1030 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KA0 QLRCETSPRPTPATLPVAVWFGATERR-LQRGQ--FKYTLDPNITSAGPTKSFLSGGREI .. : :: .:: : : ::: .:. : : .: ::. .: .: .:::: : CCDS33 SIACTMPEGALPAPVPVCVRF---ERRGCVHGNLTFWYMQNPVITAISPRRSPVSGGRTI 1040 1050 1060 1070 1080 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KA0 CVRGQNLDVVQTPRIRVTVVSRMLQPSQGLGRRRRVVPETACSLGPSCSSQQFEEPCHVN : :. . .::. . : ..: .:. :.: CCDS33 TVAGERFHMVQNVSMAVHHIGR--EPTL----------------------------CKVL 1090 1100 1110 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KA0 SSQLITCRTP-ALPGL--PEDPWVRVEFILDNLVFDFATLNPTPFSYEADPTLQPL-NPE .: :::: .: :: . : : .. . :... :.: . . :. : ::. CCDS33 NSTLITCPSPGALSNASAPVDFFINGRAYADEVAVAEELLDPEEAQRGSRFRLDYLPNPQ 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KA0 DPTMP----FRHKPGSVFS--VEGENLDLAMSKEEVVAMIGDGPCVVKTLTRHHLYCEPP : ..:.:: .. .. :. .:.....: . ::. : .. .. . ..: CCDS33 FSTAKREKWIKHHPGEPLTLVIHKEQDSLGLQSHEYRVKIGQVSCDIQIVSDRIIHCSV- 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1450 1460 1470 1480 1490 1500 pF1KA0 VEQPLPRHHALREAPDSLPEFTVQMGNLRFSLGHVQYDGESPGAFPVAAQVGLGVGTSLL ...: : .:: .:.:.::. ... .: : .: :.. . . :: CCDS33 -------NESLGAAVGQLP-ITIQVGNFNQTIATLQLGGSE-----TAIIVSIVICSVLL 1240 1250 1260 1270 1280 1510 1520 1530 1540 1550 1560 pF1KA0 ALGVIIIVLMYRRKSKQALRDYKKVQIQLENLESSVRDRCKKEFTDLMTEMTDLTSDLLG :.:. . ... ::..: : ..:. .:.:..::..:.. .: :..:.:.:::::..: CCDS33 LLSVVAL-FVFCTKSRRAERYWQKTLLQMEEMESQIREEIRKGFAELQTDMTDLTKELNR 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1570 1580 1590 pF1KA0 S-GIPFLDYKVYAERIFFP--------------------GHRES----PLHRDLGVPESR : :::::.:: .. : ::: : .. :: . .::: CCDS33 SQGIPFLEYKHFVTRTFFPKCSSLYEERYVLPSQTLNSQGSSQAQETHPLLGEWKIPESC 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1600 1610 1620 1630 1640 1650 pF1KA0 RPTVEQGLGQLSNLLNSKLFLTKFIHTLESQRTFSARDRAYVASLLTVALHGKLEYFTDI ::..:.:.. .:.:::.: :: :.:.::.:. :..::: .:::::.::::::::.:.: CCDS33 RPNMEEGISLFSSLLNNKHFLIVFVHALEQQKDFAVRDRCSLASLLTIALHGKLEYYTSI 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1660 1670 1680 1690 1700 1710 pF1KA0 LRTLLSDLVAQYVAKNPKLMLRRTETVVEKLLTNWMSICLYTFVRDSVGEPLYMLFRGIK .. :: ::. .::::::::::::.::::.::::::::.:. .:..::::...:. .:: CCDS33 MKELLVDLIDASAAKNPKLMLRRTESVVEKMLTNWMSICMYSCLRETVGEPFFLLLCAIK 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1720 1730 1740 1750 1760 1770 pF1KA0 HQVDKGPVDSVTGKAKYTLNDNRLLREDVEYRPLTLNALLAVGPGAGEAQGVPVKVLDCD .:..:: .:..::::.:::... ::::..: .: .::. . : : ... :...: : CCDS33 QQINKGSIDAITGKARYTLSEEWLLRENIEAKPRNLNVSFQ---GCG-MDSLSVRAMDTD 1530 1540 1550 1560 1570 1780 1790 1800 1810 1820 1830 pF1KA0 TISQAKEKMLDQLYKGVPLTQRPDPRTLDVEWRSGVAGHLILSDEDVTSEVQGLWRRLNT :..:.:::.:. . :.:: .: : . .:.:: .. . :: : : :: :. ..::: CCDS33 TLTQVKEKILEAFCKNVPYSQWPRAEDVDLEWFASSTQSYILRDLDDTSVVEDGRKKLNT 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1840 1850 1860 1870 1880 1890 pF1KA0 LQHYKVPDGATVALVPCLTKHVLRENQDYVPGERTPMLEDVDEGGIRPWHLVKPSDE-PE : :::.:.::..:. : ...: . :. ..:.: . .::: :.:: : CCDS33 LAHYKIPEGASLAM-------SLIDKKDNTLGR----VKDLDTE--KYFHLVLPTDELAE 1640 1650 1660 1670 1680 1900 1910 1920 1930 1940 1950 pF1KA0 PPRPRRGSLRGGERERAKAIPEIYLTRLLSMKGTLQKFVDDLFQVILST--SRPVPLAVK : . .: : .: :..:::::::::: :::::::.::::..::: ..: ::::: CCDS33 PKKSHRQS------HRKKVLPEIYLTRLLSTKGTLQKFLDDLFKAILSIREDKP-PLAVK 1690 1700 1710 1720 1730 1960 1970 1980 1990 2000 2010 pF1KA0 YFFDLLDEQAQQHGISDQDTIHIWKTNSLPLRFWINIIKNPQFVFDVQTSDNMDAVLLVI ::::.:.:::...:::: ::.:::::::::::::.::.::::::::.. .:..:: : :: CCDS33 YFFDFLEEQAEKRGISDPDTLHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIDKTDHIDACLSVI 1740 1750 1760 1770 1780 1790 2020 2030 2040 2050 2060 2070 pF1KA0 AQTFMDACTLADHKLGRDSPINKLLYARDIPRYKRMVERYYADIRQTVPASDQEMNSVLA ::.:.:::...: .::.::: ::::::..::.:...:.::: .:.. .: :.::::. :: CCDS33 AQAFIDACSISDLQLGKDSPTNKLLYAKEIPEYRKIVQRYYKQIQDMTPLSEQEMNAHLA 1800 1810 1820 1830 1840 1850 2080 2090 2100 2110 2120 2130 pF1KA0 ELSWNYSGDLGARVALHELYKYINKYYDQIITALEEDGTAQKMQLGYRLQQIAAAVENKV : : .:...... ::. :.::: ..: ::..::: . ::.. :: ....:..: .:... CCDS33 EESRKYQNEFNTNVAMAEIYKYAKRYRPQIMAALEANPTARRTQLQHKFEQVVALMEDNI 1860 1870 1880 1890 1900 1910 pF1KA0 TDL CCDS33 YECYSEA 1920 >>CCDS31013.1 PLXNA2 gene_id:5362|Hs108|chr1 (1894 aa) initn: 2720 init1: 697 opt: 902 Z-score: 410.7 bits: 89.5 E(32554): 1.5e-16 Smith-Waterman score: 3343; 32.3% identity (57.0% similar) in 2212 aa overlap (16-2128:25-1890) 10 20 30 40 pF1KA0 MPALGPALLQALWAGWVLTLQPLPPTAFTPNGTYLQHLARDPT-------- ::: ::.: :. . .. :: : CCDS31 MEQRRPWPRALEVDSRSVVLLSVVWVLLA---PPAAGMPQFSTFHSENRDWTFNHLTVHQ 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KA0 -SGTLYLGATNFLFQLSPGLQLEATVSTGPVLDSRDCLPPVMPDECPQAQP-TNNPNQLL .:..:.:: : ...:. .: .... .::: :...: ::.. . : .. ::: :.:: CCDS31 GTGAVYVGAINRVYKLTGNLTIQVAHKTGPEEDNKSCYPPLIVQPCSEVLTLTNNVNKLL 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 pF1KA0 LV--SPGALVVCGSVHQGVCEQRRLGQLEQLLLRPERPGDTQYVAANDPAVSTVGLVAQG .. : . :..:::..::::. :: .: .:..: . . .:... . . . :..... CCDS31 IIDYSENRLLACGSLYQGVCKLLRLDDLF-ILVEPSHKKE-HYLSSVNKTGTMYGVIVRS 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KA0 LAGEPLLFVGRGYTSRGVGGGIPPITTRALWPPDPQ--AAFSYE-------ETAKLAVGR . . ::.: . : .: ...: : : ::. : ..:: :. CCDS31 EGEDGKLFIGTAVD--GKQDYFPTLSSRKL-PRDPESSAMLDYELHSDFVSSLIKIPSDT 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 pF1KA0 LSEYSHH---FVSAFARGASAYFLFLRRDL-------QAQSRAFRAYVSRVCLRDQHYYS :. :: .. .:: :. .::: .. . .: . . . . :.: : ...: CCDS31 LALVSHFDIFYIYGFASGGFVYFLTVQPETPEGVAINSAGDLFYTSRIVRLCKDDPKFHS 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 pF1KA0 YVELPLACE--GGRYGLIQAAAVATSRE--------VAHGEVLFAAFSSAAPPTVGRPPS :: ::..: : .: :.::: .: . ... .:::: ::.. .::. CCDS31 YVSLPFGCTRAGVEYRLLQAAYLAKPGDSLAQAFNITSQDDVLFAIFSKGQKQ-YHHPPD 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 370 pF1KA0 AAAGASGASALCAFPLDEVDRLANRTRDACYTREGRAEDGTEVAYIEYDVNSDCAQLPVD :::::::. .. .. ..:: :: : . . ::. :.. :: CCDS31 D-------SALCAFPIRAINLQIKERLQSCYQGEGNLELN---WLLGKDVQ--CTKAPVP 360 370 380 390 380 390 400 410 420 430 pF1KA0 TLDAYPCGSDHTPSPMASRVPLEATPILEWPGIQLTAVAVTMEDGHTIAFLGDSQGQLHR : . :: : .:... .:.:. . ..:.:: . .:....:.: ..:.:.. CCDS31 IDDNF-CGLD-INQPLGGSTPVEGLTLYTTSRDRMTSVASYVYNGYSVVFVGTKSGKLKK 400 410 420 430 440 450 440 450 460 470 480 pF1KA0 VYL-GPGSDGHPYSTQSI-QQGSAVSRDLTFDGTFEHLYVMTQSTLLKVPVASCAQHLDC . :: : : :. ..:: . ::..:. ..::::.. . .::: :: :. : CCDS31 IRADGPPHGGVQYEMVSVLKDGSPILRDMAFSIDQRYLYVMSERQVTRVPVESCEQYTTC 460 470 480 490 500 510 490 500 510 520 530 540 pF1KA0 ASCLAHRDPYCGWCVLLGRCSRRSECSRGQGPEQWLWSFQPELGCLQVAAMSPANIS-RE . ::. ::.::::.: . ::::..:... :... :.. :...: . :..:: : CCDS31 GECLSSGDPHCGWCALHNMCSRRDKCQQAWEPNRFAASISQ---CVSLA-VHPSSISVSE 520 530 540 550 560 570 550 560 570 580 590 600 pF1KA0 ETREVFLSVPDLPPLWPGESYSCHFGE-HQSPALLTGSGVMCPSPDPSEAPVLPRGADYV ..: . : : : : : : .: ::. . . ..:: :.: :: :...::.: :. CCDS31 HSRLLSLVVSDAPDLSAG--IACAFGNLTEVEGQVSGSQVICISPGPKDVPVIPLDQDWF 580 590 600 610 620 630 610 620 630 640 650 660 pF1KA0 SVSVELR---FGAVVIAKTSLSFYDCVAVTELRPSAQCQACVSSRWGCNWCVWQHLCTHK .. ..:: : . .. : ..::.: : : .::.: . :.:: ...:::: CCDS31 GLELQLRSKETGKIFVS-TEFKFYNCSA------HQLCLSCVNSAFRCHWCKYRNLCTHD 640 650 660 670 680 670 680 690 700 710 720 pF1KA0 ASCDAGPMVASHQSPLVSPDPPARGGPSPSPPTAPKALATPAPDTLPVEPGAPSTATASD : . : : CCDS31 ------PTTCSFQE---------------------------------------------- 690 730 740 750 760 770 780 pF1KA0 ISPGASPSLLSPWGPWAGSGSISSPGSTGSPLHEEPSPPSPQNGPGTAVPAPTDFRPSAT : :. : :: CCDS31 -------------------GRINI------------SEDCPQ------------------ 700 790 800 810 820 830 840 pF1KA0 PEDLLASPLSPSEVAAVPPADPGPEALHPTVPLDLPPATVPATTFPGAMGSVKPALDWLT : :.: .: .: ::: .: CCDS31 --------LVPTEEILIP------------------------------VGEVKP----IT 710 720 850 860 870 880 890 900 pF1KA0 REGGELPEADEWTGGDAPAFSTSTLLSGDGDSAELEGPPAPLILPSSLDYQYDTPGLWEL .. .::. :.: . :. CCDS31 LKARNLPQ------------------------------------PQSGQRGYE------- 730 910 920 930 940 950 960 pF1KA0 EEATLGASSCPCVESVQGSTLMPVHVEREIRLLGRNLHLFQDGPGDNECVMELEGLEVVV :: ..::. .: .:. CCDS31 -----------CVLNIQGA----IHRVPALRF---------------------------- 740 750 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KA0 EARVECEPPPDTQCHVTCQQHQLSYEALQ-PELRVGLFLRRAGRLRVDSAEGLHVVLYDC .. : ::. . .:.... .: : . . : . .:. . :.: :: : CCDS31 -----------NSSSVQCQNSSYQYDGMDISNLAVDFAVVWNGNFIIDNPQDLKVHLYKC 760 770 780 790 800 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KA0 SVGHGDCSRCQTAMPQYGCVWCEGERPRCVTREACGEAEAV-------ATQCPAPLIHSV .. . .:. : : .. : :: ::: ::. .. : . ..: : : . CCDS31 AAQRESCGLCLKADRKFECGWCSGER-RCTLHQHCTSPSSPWLDWSSHNVKCSNPQITEI 810 820 830 840 850 860 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KA0 EPLTGPVDGGTRVTIRGSNLGQHVQDVLGMVTVAGVPCAVDAQEYEVSSSLVCITGASGE ..:: .:::::::.: ::: ... : ::::::. :: .. ..:: :. CCDS31 LTVSGPPEGGTRVTIHGVNLGLDFSEIAHHVQVAGVPCTPLPGEYIIAEQIVC---EMGH 870 880 890 900 910 920 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KA0 EVAGATAVEVP---GRGRGV----SEHDFAYQDPKVHSIFPARGPRAGGTRLTLNGSKLL ..:.:. : :. . :...... .:.: :. : :::..::: .:..: : CCDS31 ALVGTTSGPVRLCIGECKPEFMTKSHQQYTFVNPSVLSLNPIRGPESGGTMVTITGHYLG 930 940 950 960 970 980 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KA0 TGRLEDIRVVVGDQPCHLLPEQQSEQLRCETSPRPTPATLPVAVWFGATERRLQRG-QFK .: .. : .:.: :.. ...:: . : .:: . . :: : .. . ... . ::. CCDS31 AG--SSVAVYLGNQTCEFYGRSMSE-IVC-VSPPSSNGLGPVPVSVSVDRAHVDSNLQFE 990 1000 1010 1020 1030 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KA0 YTLDPNITSAGPTKSFLSGGREICVRGQNLDVVQTPRIRVTVVSRMLQPSQGLGRRRRVV : :: . : :. :: . . : ::::.: ::::: :.. : CCDS31 YIDDPRVQRIEPEWSIASGHTPLTITGFNLDVIQEPRIRVKFN----------GKESVNV 1040 1050 1060 1070 1080 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KA0 PETACSLGPSCSSQQFEEPCHVNSSQLITCRTPAL-----PGLP--EDPWVRVEFILDNL :.: .. .:: .:.: ::: : : . :...: CCDS31 -------------------CKVVNTTTLTCLAPSLTTDYRPGLDTVERP-DEFGFVFNN- 1090 1100 1110 1120 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KA0 VFDFATLNPTPFSYEADPTLQPLNPEDPTMPFRHKPGSVFSVEGENLDLAMS---KEEVV : .. : : : : .::.. :.: : . .:::: . ..:.:: : : . . CCDS31 VQSLLIYNDTKFIYYPNPTFELLSP---TGVLDQKPGSPIILKGKNLCPPASGGAKLNYT 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1420 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KA0 AMIGDGPCVVKTLTRHHLYCEPPVEQPLPRHHALREAPDSLPEFTVQMGNLRFSLGHVQY ..::. ::.: :... .: :::: : .: . :..:.. :: : :. CCDS31 VLIGETPCAV-TVSETQLLCEPP---NLTGQHKV----------MVHVGGMVFSPGSVSV 1190 1200 1210 1220 1480 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KA0 DGESPGAFPVAAQVGLGVGTSLLALGVIIIVLMYRRKSKQALRDYKKVQIQLENLESSVR ..: ..: : :....: ::: . :::... :.:::.. :..:.:..:::: : CCDS31 ISDSLLTLP--AIVSIAAGGSLLLIIVIIVLIAYKRKSRENDLTLKRLQMQMDNLESRVA 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1540 1550 1560 1570 1580 1590 pF1KA0 DRCKKEFTDLMTEMTDLTSDLLGSGIPFLDYKVYAERIFFPGHRESPLHRDLGVPESRRP .::. :..:.:....::::: ::::.:::..:: :..::: .. :. :.: : . . CCDS31 LECKEAFAELQTDINELTSDLDRSGIPYLDYRTYAMRVLFPGIEDHPVLRELEVQGNGQQ 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1600 1610 1620 1630 1640 1650 pF1KA0 TVEQGLGQLSNLLNSKLFLTKFIHTLESQRTFSARDRAYVASLLTVALHGKLEYFTDILR ::..: ...:.:.:.:: ::.::: ::.:: :::. ::::. ..:.:.::: ::.:. CCDS31 HVEKALKLFAQLINNKVFLLTFIRTLELQRSFSMRDRGNVASLIMTGLQGRLEYATDVLK 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1660 1670 1680 1690 1700 1710 pF1KA0 TLLSDLVAQYVA-KN-PKLMLRRTETVVEKLLTNWMSICLYTFVRDSVGEPLYMLFRGIK :::::. . . :: :::.:::::.:.::.::::... :. :... .::::.::. .:: CCDS31 QLLSDLIDKNLENKNHPKLLLRRTESVAEKMLTNWFAFLLHKFLKECAGEPLFMLYCAIK 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1720 1730 1740 1750 1760 1770 pF1KA0 HQVDKGPVDSVTGKAKYTLNDNRLLREDVEYRPLTLNALLAVGPGAGEAQGVPVKVLDCD .:..:::.:..::.:.:.:....:.:...::. : :: :.: .. .:::::.:: CCDS31 QQMEKGPIDAITGEARYSLSEDKLIRQQIEYKTLILN---CVNPDNENSPEIPVKVLNCD 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1780 1790 1800 1810 1820 1830 pF1KA0 TISQAKEKMLDQLYKGVPLTQRPDPRTLDVEWRSGVAGHLILSDEDVTSEVQGLWRRLNT ::.:.:::.:: .::.:: .::: .:.:::.: ....:.:::.:....: :.:::: CCDS31 TITQVKEKILDAVYKNVPYSQRPRAVDMDLEWRQGRIARVVLQDEDITTKIEGDWKRLNT 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1840 1850 1860 1870 pF1KA0 LQHYKVPDGATVALVPCLTKH-------------VLRENQDY----VPGE---RTPMLED :.::.: : ..::::: :. . : .... : :.::. CCDS31 LMHYQVSDRSVVALVPKQTSSYNIPASASISRTSISRYDSSFRYTGSPDSLRSRAPMITP 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1880 1890 1900 1910 1920 1930 pF1KA0 VDEGGIRPWHLVKPSDEPEPPRPRRGSLRGGERERAKAIPEIYLTRLLSMKGTLQKFVDD :.:.. ::::: :. . . ::: : . ::::::::. :::::::::: CCDS31 DLESGVKVWHLVKNHDHGDQKEGDRGS---------KMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDD 1650 1660 1670 1680 1690 1940 1950 1960 1970 1980 1990 pF1KA0 LFQVILST---SRPVPLAVKYFFDLLDEQAQQHGISDQDTIHIWKTNSLPLRFWINIIKN ::....:: . .:::.::.::.:::::..:.: : :. : ::.: ::::::.:.::: CCDS31 LFETLFSTVHRGSALPLAIKYMFDFLDEQADRHSIHDTDVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKN 1700 1710 1720 1730 1740 1750 2000 2010 2020 2030 2040 2050 pF1KA0 PQFVFDVQTSDNMDAVLLVIAQTFMDACTLADHKLGRDSPINKLLYARDIPRYKRMVERY ::::::.. .. :: : :.::::::.:. ..:.::.::: ::::::.::: :: :::: CCDS31 PQFVFDIHKGSITDACLSVVAQTFMDSCSTSEHRLGKDSPSNKLLYAKDIPSYKSWVERY 1760 1770 1780 1790 1800 1810 2060 2070 2080 2090 2100 2110 pF1KA0 YADIRQTVPASDQEMNSVLAELSWNYSGDLGARVALHELYKYINKYYDQIITALEEDGTA :::: . :::.::. ::: : .. ... ::.:.:.:..:: ...: :::.: : CCDS31 YADIAKLPAISDQDMNAYLAEQSRLHAVEFNMLSALNEIYSYVSKYSEELIGALEQDEQA 1820 1830 1840 1850 1860 1870 2120 2130 pF1KA0 QKMQLGYRLQQIAAAVENKVTDL ....:.:...:. :. CCDS31 RRQRLAYKVEQLINAMSIES 1880 1890 >>CCDS43646.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7 (1894 aa) initn: 2738 init1: 639 opt: 892 Z-score: 406.4 bits: 88.7 E(32554): 2.6e-16 Smith-Waterman score: 3227; 31.4% identity (57.7% similar) in 2216 aa overlap (4-2124:12-1886) 10 20 30 40 pF1KA0 MPALGPALLQALWAGWVLTLQPLPPT----AF-TPNGTY---LQHLARDPTS :. :. .. .. .:: :: : . .: : : ..::. : . CCDS43 MKAMPWNWTCLLSHLLMVGMGSSTLLTRQPAPLSQKQRSFVTFRGEPAEGFNHLVVDERT 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KA0 GTLYLGATNFLFQLSPGLQLEATVSTGPVLDSRDCLPPVMPDECPQA-QPTNNPNQLLLV : .::::.: ...:: :.. .: ::: :. : :: . . : . ::: :..::. CCDS43 GHIYLGAVNRIYKLSSDLKVLVTHETGPDEDNPKCYPPRIVQTCNEPLTTTNNVNKMLLI 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KA0 S--PGALVVCGSVHQGVCEQRRLGQLEQLLLRPERPGDTQYVAANDPAVSTVGLVAQGLA . . :..:::..::.:. :: .: .: .: . . .:... . . :. :.... CCDS43 DYKENRLIACGSLYQGICKLLRLEDLFKLG-EPYHKKE-HYLSGVNESGSVFGVIVSYSN 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 pF1KA0 GEPLLFVGRGYTSRGVGGGIPPITTRALWP-PDPQAAFSY----EETAKL------AVGR . ::.. . : .: :..: : . .. :.: : .:.. . CCDS43 LDDKLFIATAVD--GKPEYFPTISSRKLTKNSEADGMFAYVFHDEFVASMIKIPSDTFTI 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 pF1KA0 LSEYSHHFVSAFARGASAYFLFLRRDL------QAQSRAFRAYVSRVCLRDQHYYSYVEL . ... ..: .:. : .::: :. .. .. ... . . :.: .: . ::::. CCDS43 IPDFDIYYVYGFSSGNFVYFLTLQPEMVSPPGSTTKEQVYTSKLVRLCKEDTAFNSYVEV 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 pF1KA0 PLACE--GGRYGLIQAAAVATSREV------AH--GEVLFAAFSSAAPPTVGRPPSAAAG :..:: : .: :.::: .. . : .: ..::..:: . . CCDS43 PIGCERSGVEYRLLQAAYLSKAGAVLGRTLGVHPDDDLLFTVFS--------KGQKRKMK 300 310 320 330 340 320 330 340 350 360 370 pF1KA0 ASGASALCAFPLDEV-DRLANRTRDACYTREGRAEDGTEVAYIEY-DVNSDCAQLPVDTL . :::: : : .. ::. .: . .:: :.: ..:... :. . : : .: CCDS43 SLDESALCIFILKQINDRIKERLQ-SCY----RGEGTLDLAWLKVKDIPCSSALLTID-- 350 360 370 380 390 400 380 390 400 410 420 430 pF1KA0 DAYPCGSDHTPSPMASRVPLEATPILEWPGIQLTAVAVTMEDGHTIAFLGDSQGQLHRVY : . :: : . .:.. ... :.. ..:.: . . .:..::.: ..:.:... CCDS43 DNF-CGLDMN-APLGVSDMVRGIPVFTEDRDRMTSVIAYVYKNHSLAFVGTKSGKLKKIR 410 420 430 440 450 440 450 460 470 480 490 pF1KA0 L-GPGSDGHPYSTQSIQQGSAVSRDLTFDGTFEHLYVMTQSTLLKVPVASCAQHLDCASC . :: ... : : .. . . : ::..:. :.::.:.. : .::: ::.:. .:. : CCDS43 VDGPRGNALQYETVQVVDPGPVLRDMAFSKDHEQLYIMSERQLTRVPVESCGQYQSCGEC 460 470 480 490 500 510 500 510 520 530 540 550 pF1KA0 LAHRDPYCGWCVLLGRCSRRSECSRGQGPEQWLWSFQPELG-CLQVAAMSPANISREETR :. ::.:::::: . :.:. .: :.. :.. : :. :.... . : ::: . CCDS43 LGSGDPHCGWCVLHNTCTRKERCERSKEPRR----FASEMKQCVRLT-VHPNNISVSQYN 520 530 540 550 560 570 560 570 580 590 600 pF1KA0 EVF-LSVPDLPPLWPGESYSCHFGE-HQSPALLTGSGVMCPSPDPSEAP-VLPRGADYVS .. : . ..: : : .: : . . .:..:. ..: :: .:.: .. ...:. CCDS43 VLLVLETYNVPELSAG--VNCTFEDLSEMDGLVVGNQIQCYSPAAKEVPRIITENGDHHV 580 590 600 610 620 630 610 620 630 640 650 660 pF1KA0 VSVELRFG--AVVIAKTSLSFYDCVAVTELRPSAQCQACVSSRWGCNWCVWQHLCTHKAS :...:. ....:.::. ::.: . .: .:: : . :.:: ..:.::: CCDS43 VQLQLKSKETGMTFASTSFVFYNCSV------HNSCLSCVESPYRCHWCKYRHVCTHD-- 640 650 660 670 680 670 680 690 700 710 720 pF1KA0 CDAGPMVASHQSPLVSPDPPARGGPSPSPPTAPKALATPAPDTLPVEPGAPSTATASDIS : . : : CCDS43 ----PKTCSFQE------------------------------------------------ 690 730 740 750 760 770 780 pF1KA0 PGASPSLLSPWGPWAGSGSISSPGSTGSPLHEEPSPPSPQNGPGTAVPAPTDFRPSATPE CCDS43 ------------------------------------------------------------ 790 800 810 820 830 840 pF1KA0 DLLASPLSPSEVAAVPPADPGPEALHPTVPLDLPPATVPATTFPGAMGSVKPALDWLTRE : :: CCDS43 -----------------------------------------------GRVK--------- 850 860 870 880 890 900 pF1KA0 GGELPEADEWTGGDAPAFSTSTLLSGDGDSAELEGPPAPLILPSSLDYQYDTPGLWELEE ::: : : : .... CCDS43 ---LPE--------------------------------------------DCPQLLRVDK 700 910 920 930 940 950 960 pF1KA0 ATLGASSCPCVESVQGSTLMPVHVEREIRLLGRNLHLFQDGPGDNECVMELEGLEVVVEA :.::.: . : : ..:: :.: ::.....: : : : CCDS43 I-----------------LVPVEVIKPITLKAKNLPQPQSGQRGYECILNIQGSEQRVPA 710 720 730 740 750 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KA0 -RVECEPPPDTQCHVTCQQHQLSYEALQ-PELRVGLFLRRAGRLRVDSAEGLHVVLYDCS : . . : ::. . :::... .: : : . :.. .:. .: :: :. CCDS43 LRFN-------SSSVQCQNTSYSYEGMEINNLPVELTVVWNGHFNIDNPAQNKVHLYKCG 760 770 780 790 800 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KA0 VGHGDCSRCQTAMPQYGCVWCEGERPRCVTREACGEAEA-------VATQCPAPLIHSVE . . .:. : : :...: ::.: .:. :. : :. . ..: : : . CCDS43 AMRESCGLCLKADPDFACGWCQGP-GQCTLRQHCPAQESQWLELSGAKSKCTNPRITEII 810 820 830 840 850 860 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KA0 PLTGPVDGGTRVTIRGSNLGQHVQDVLGMVTVAGVPCAVDAQEYEVSSSLVCITG-ASGE :.::: .:::.::::: ::: . .:. . : :::: :. .. : . ..:: : :. CCDS43 PVTGPREGGTKVTIRGENLGLEFRDIASHVKVAGVECSPLVDGYIPAEQIVCEMGEAKPS 870 880 890 900 910 920 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KA0 EVAGATAVEVP-GRGRGV--SEHDFAYQDPKVHSIFPARGPRAGGTRLTLNGSKLLTGRL . :: . . : : . . : . . .. . .. :.::: .:::..:..:..: .: CCDS43 QHAGFVEICVAVCRPEFMARSSQLYYFMTLTLSDLKPSRGPMSGGTQVTITGTNLNAG-- 930 940 950 960 970 980 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KA0 EDIRVVVGDQPCHLLPEQQSEQLRCETSPRPTPATLPVAVWFGATERRLQRGQFKYTLDP .. :. : ::: :. ... . :.:. . :.: .. . : :.:. :: CCDS43 SNVVVMFGKQPC-LFHRRSPSYIVCNTTSSDEVLEMKVSVQVDRAKIH-QDLVFQYVEDP 990 1000 1010 1020 1030 1040 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KA0 NITSAGPTKSFLSGGREICVRGQNLDVVQTPRIRVTVVSRMLQPSQGLGRRRRVVPETAC .:. : :..::. : : : .::..:.:.::. ..: :... . CCDS43 TIVRIEPEWSIVSGNTPIAVWGTHLDLIQNPQIRA---------KHG-GKEHINI----- 1050 1060 1070 1080 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KA0 SLGPSCSSQQFEEPCHVNSSQLITCRTPAL---PGLPEDPWVRVE---FILDNLVFDFAT :.: .. .::..::: : : : : ::::: : .. CCDS43 --------------CEVLNATEMTCQAPALALGPDHQSDLTERPEEFGFILDN-VQSLLI 1090 1100 1110 1120 1130 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KA0 LNPTPFSYEADPTLQPLNPEDPTMPFRHKPGSVFSVEGENLDLAMS----KEEVVAMIGD :: : :.: .:... ..: . .. :::. . ..:.:: .. : . ....:. CCDS43 LNKTNFTYYPNPVFEAFGP---SGILELKPGTPIILKGKNLIPPVAGGNVKLNYTVLVGE 1140 1150 1160 1170 1180 1430 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KA0 GPCVVKTLTRHHLYCEPPVEQPLPRHHALREAPDSLPEFTVQMGNLRFSLGHVQYDGESP ::.: :.. .: :: : . . ::... ...:....: : : .:: CCDS43 KPCTV-TVSDVQLLCESP--NLIGRHKVM-----------ARVGGMEYSPGMVYIAPDSP 1190 1200 1210 1220 1230 1490 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KA0 GAFPVAAQVGLGVGTSLLALGVIIIVLMYRRKSKQALRDYKKVQIQLENLESSVRDRCKK ..: : :...:. .:: . .. ... :.:::... :..:.:..:::: : .::. CCDS43 LSLP--AIVSIAVAGGLLIIFIVAVLIAYKRKSRESDLTLKRLQMQMDNLESRVALECKE 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1550 1560 1570 1580 1590 1600 pF1KA0 EFTDLMTEMTDLTSDLLGSGIPFLDYKVYAERIFFPGHRESPLHRDLGVPESRRPTVEQG :..:.:.. .::::: :.:::::::..:. :..::: .. :. ::: :: :. ::.: CCDS43 AFAELQTDIHELTSDLDGAGIPFLDYRTYTMRVLFPGIEDHPVLRDLEVPGYRQERVEKG 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1610 1620 1630 1640 1650 1660 pF1KA0 LGQLSNLLNSKLFLTKFIHTLESQRTFSARDRAYVASLLTVALHGKLEYFTDILRTLLSD : ...:.:.:.:: .::.::::::.:: :::. ::::. ..:..:::: ::.:. ::.: CCDS43 LKLFAQLINNKVFLLSFIRTLESQRSFSMRDRGNVASLIMTVLQSKLEYATDVLKQLLAD 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1670 1680 1690 1700 1710 1720 pF1KA0 LVAQYV-AKN-PKLMLRRTETVVEKLLTNWMSICLYTFVRDSVGEPLYMLFRGIKHQVDK :. . . .:: :::.:::::.:.::.::::... :: :... .::::. :: .::.:..: CCDS43 LIDKNLESKNHPKLLLRRTESVAEKMLTNWFTFLLYKFLKECAGEPLFSLFCAIKQQMEK 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1730 1740 1750 1760 1770 1780 pF1KA0 GPVDSVTGKAKYTLNDNRLLREDVEYRPLTLNALLAVGPGAGEAQGVPVKVLDCDTISQA ::.:..::.:.:.:....:.:....:. :.:. :.: ... ::::.:.::::.:. CCDS43 GPIDAITGEARYSLSEDKLIRQQIDYKTLVLSC---VSPDNANSPEVPVKILNCDTITQV 1480 1490 1500 1510 1520 1790 1800 1810 1820 1830 1840 pF1KA0 KEKMLDQLYKGVPLTQRPDPRTLDVEWRSGVAGHLILSDEDVTSEVQGLWRRLNTLQHYK :::.:: ..:.:: ..:: .:.:::.: ....::.:::.:..... :.::::: ::. CCDS43 KEKILDAIFKNVPCSHRPKAADMDLEWRQGSGARMILQDEDITTKIENDWKRLNTLAHYQ 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1850 1860 1870 1880 pF1KA0 VPDGATVALVPC-LTKH-------VLR------ENQDYVPGE------RTPMLEDVDEGG ::::..:::: .: . : : ::. : ::::. :.: CCDS43 VPDGSVVALVSKQVTAYNAVNNSTVSRTSASKYENMIRYTGSPDSLRSRTPMITPDLESG 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1890 1900 1910 1920 1930 1940 pF1KA0 IRPWHLVKPSDEPEPPRPRRGSLRGGERERAKAIPEIYLTRLLSMKGTLQKFVDDLFQVI .. ::::: .. . . ::: : . ::::::::. ::::::::::::..: CCDS43 VKMWHLVKNHEHGDQKEGDRGS---------KMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETI 1650 1660 1670 1680 1690 1950 1960 1970 1980 1990 pF1KA0 LSTSR---PVPLAVKYFFDLLDEQAQQHGISDQDTIHIWKTNSLPLRFWINIIKNPQFVF .::.. .:::.::.::.:::::..::: : . : ::.: ::::::.:.:::::::: CCDS43 FSTAHRGSALPLAIKYMFDFLDEQADKHGIHDPHVRHTWKSNCLPLRFWVNMIKNPQFVF 1700 1710 1720 1730 1740 1750 2000 2010 2020 2030 2040 2050 pF1KA0 DVQTSDNMDAVLLVIAQTFMDACTLADHKLGRDSPINKLLYARDIPRYKRMVERYYADIR :.. .. :: : :.::::::.:. ..:.::.::: ::::::.::: :: :::::.:: CCDS43 DIHKNSITDACLSVVAQTFMDSCSTSEHRLGKDSPSNKLLYAKDIPSYKNWVERYYSDIG 1760 1770 1780 1790 1800 1810 2060 2070 2080 2090 2100 2110 pF1KA0 QTVPASDQEMNSVLAELSWNYSGDLGARVALHELYKYINKYYDQIITALEEDGTAQKMQL . :::.::. ::: : . ..... :: :...:..:: ..:. :..: :..: CCDS43 KMPAISDQDMNAYLAEQSRMHMNEFNTMSALSEIFSYVGKYSEEILGPLDHDDQCGKQKL 1820 1830 1840 1850 1860 1870 2120 2130 pF1KA0 GYRLQQIAAAVENKVTDL .:.:.:. CCDS43 AYKLEQVITLMSLDS 1880 1890 >>CCDS9049.1 PLXNC1 gene_id:10154|Hs108|chr12 (1568 aa) initn: 1547 init1: 599 opt: 696 Z-score: 322.2 bits: 72.9 E(32554): 1.3e-11 Smith-Waterman score: 1448; 33.0% identity (61.6% similar) in 1037 aa overlap (1114-2121:621-1557) 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KA0 GGTRVTIRGSNLGQHVQDVLGMVTVAGVPCAVDAQEYEVSSSLVCITGASGEEVAGATAV : : ..:: .. : ... :...:. CCDS90 NCSSLKECPACVETGCAWCKSARRCIHPFTACDPSDYERNQEQ-CPVAV--EKTSGGGR- 600 610 620 630 640 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KA0 EVPGRGRGVSEHDFAYQDPKVHSIFPARGPRAGGTRLTLNGSKLLTGRLEDIRVVV-GDQ : ...: .. . : : ..:: : . : . . ..:... : .: ... : . CCDS90 --PKENKG-NRTNQALQVFYIKSIEPQKVSTLGKSNVIVTGANFT--RASNITMILKGTS 650 660 670 680 690 700 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KA0 PCHLLPEQQSEQLRCETSPRPTPATLP----VAVWF-GATERRLQRGQFKYTLDPNITSA : : :. : :.. : . : :.. . :...: :. . CCDS90 TCDKDVIQVSHVLNDTHMKFSLPSSRKEMKDVCIQFDGGNCSSV--GSLSYIALPHCSLI 710 720 730 740 750 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KA0 GPTKSFLSGGREICVRGQNLDVVQTPRIRVTVVSRMLQPSQGLGRRRRVVPETACS-LGP :. ...:::..: . :.:.::... ..:. :. . .... : :. :.: CCDS90 FPATTWISGGQNITMMGRNFDVIDN-----LIISHELKGNINVSE---YCVATYCGFLAP 760 770 780 790 800 810 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KA0 SCSSQQFEEPCHVNSSQLITCRTPALPGLPEDPWVRVEFILDNLVFDFATLNPTPFSYEA : ..::.. :: : :.. ... .: .:: .:. CCDS90 S-----------LKSSKV---RTN----------VTVKLRVQDTYLDCGTL-----QYRE 820 830 840 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KA0 DPTLQPLNPE---DPTMPFR-HKPGSVFSVEGENLDLAMSKEEVVAMIGDGPCVVKTLTR :: . : : . . .: .. :.. ....... . : :. : ...:: CCDS90 DPRFTGYRVESEVDTELEVKIQKENDNFNISKKDIEITLFHGEN----GQLNCSFENITR 850 860 870 880 890 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KA0 HHLYCEPPVEQPLPRHHALREAP---DSLPEFTVQMGNLRFSLGHVQYDGESPGAFPVAA .. . : . .... : .: . :..:::.. . : . : : .. CCDS90 NQ-----DLTTILCKIKGIKTASTIANSSKKVRVKLGNLELYVE--QESVPSTWYFLIVL 900 910 920 930 940 950 1490 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KA0 QVGLGVGTSLLALGVIIIVLMYRRKSKQALRDYKKVQIQLENLESSVRDRCKKEFTDLMT : ::.. .. : . :.:::. : :. : ::: ::: .: . . :..:. CCDS90 PV-------LLVIVIFAAVGVTRHKSKELSR--KQSQ-QLELLESELRKEIRDGFAELQM 960 970 980 990 1000 1550 1560 1570 1580 1590 1600 pF1KA0 EMTDLTSDLLGSGIPFLDYKVYAERIFFP--GHRESPLHRDLGVPESRRPTVEQGLGQLS . :.. : .:. .:::::: .: : ::: : . .:. .. ...: :. CCDS90 DKLDVV-DSFGT-VPFLDYKHFALRTFFPESGGFTHIFTEDMHNRDANDK--NESLTALD 1010 1020 1030 1040 1050 1610 1620 1630 1640 1650 1660 pF1KA0 NLLNSKLFLTKFIHTLESQRTFSARDRAYVASLLTVALHGKLEYFTDILRTLLSDLVAQY :. .: ::. :::::.:..::..:: ::.::.::. :: :.:.::..: ::. : CCDS90 ALICNKSFLVTVIHTLEKQKNFSVKDRCLFASFLTIALQTKLVYLTSILEVLTRDLMEQC 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1670 1680 1690 1700 1710 1720 pF1KA0 VAKNPKLMLRRTETVVEKLLTNWMSICLYTFVRDSVGEPLYMLFRGIKHQVDKGPVDSVT .:::::::::.:::::::::::.:: :.:..::::.:.: ......::::: .: CCDS90 SNMQPKLMLRRTESVVEKLLTNWMSVCLSGFLRETVGEPFYLLVTTLNQKINKGPVDVIT 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1730 1740 1750 1760 1770 1780 pF1KA0 GKAKYTLNDNRLLREDVEYRPLTLNALLAVGP---GAGEAQGVPVKVLDCDTISQAKEKM :: ::::.. :: . :. ..::... : .: ... :.:::::::.:::::. CCDS90 CKALYTLNEDWLLWQVPEFSTVALNVVFEKIPENESADVCRNISVNVLDCDTIGQAKEKI 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1790 1800 1810 1820 1830 1840 pF1KA0 LDQLYK--GVPLTQRPDPRTLDVEWRSGVAGHLILSDEDVTSEV--QGLWRRLNTLQHYK .. . . : : . . . .: . :. . .: : : .: . .:. .:::. ::. CCDS90 FQAFLSKNGSPYGLQLNE--IGLELQMGTRQKELL-DIDSSSVILEDGI-TKLNTIGHYE 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1850 1860 1870 1880 1890 pF1KA0 VPDGATVALVPCLTKHVLRENQDYVPGERTPMLEDVDEGGIRPWHLVKPSDEP-EPPRPR . .:.:. .:... .. : .: :. ::. :..: . . . CCDS90 ISNGSTI--------KVFKKIANF-----TSDVEYSDDHC----HLILPDSEAFQDVQGK 1300 1310 1320 1330 1900 1910 1920 1930 1940 1950 pF1KA0 RGSLRGGERERAKAIPEIYLTRLLSMKGTLQKFVDDLFQVI--LSTSRPVPLAVKYFFDL : :: .. ..: :.:::.::: : .... .. ::. : : .:: .:.:.:::::. CCDS90 RH--RGKHKFKVK---EMYLTKLLSTKVAIHSVLEKLFRSIWSLPNSR-APFAIKYFFDF 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1960 1970 1980 1990 2000 2010 pF1KA0 LDEQAQQHGISDQDTIHIWKTNSLPLRFWINIIKNPQFVFDVQTSDNMDAVLLVIAQTFM :: ::... :.: :..:::::::::::::.::.::::::::.. . ..:. : ::::.:: CCDS90 LDAQAENKKITDPDVVHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIKKTPHIDGCLSVIAQAFM 1400 1410 1420 1430 1440 1450 2020 2030 2040 2050 2060 2070 pF1KA0 DACTLADHKLGRDSPINKLLYARDIPRYKRMVERYYADIRQTVPASDQEMNSVLAELSWN :: .:....::...: ::::::.::: ::. :. :: ::. : :..::. :.. : . CCDS90 DAFSLTEQQLGKEAPTNKLLYAKDIPTYKEEVKSYYKAIRDLPPLSSSEMEEFLTQESKK 1460 1470 1480 1490 1500 1510 2080 2090 2100 2110 2120 2130 pF1KA0 YSGDLGARVALHELYKYINKYYDQIITALE-EDGT--AQKMQLGYRLQQIAAAVENKVTD . .... .::: :.:::: ::.:.:.. :: : : :::. : .. CCDS90 HENEFNEEVALTEIYKYIVKYFDEILNKLERERGLEEAQKQLLHVKVLFDEKKKCKWM 1520 1530 1540 1550 1560 pF1KA0 L 2135 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 19:39:54 2016 done: Thu Nov 3 19:39:55 2016 Total Scan time: 7.490 Total Display time: 1.750 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]