Result of FASTA (ccds) for pF1KE2505
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2505, 1040 aa
  1>>>pF1KE2505 1040 - 1040 aa - 1040 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8554+/-0.00118; mu= 10.2785+/- 0.070
 mean_var=227.1130+/-49.137, 0's: 0 Z-trim(109.1): 189  B-trim: 37 in 1/49
 Lambda= 0.085105
 statistics sampled from 10446 (10652) to 10446 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.659), E-opt: 0.2 (0.327), width:  16
 Scan time:  3.900

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1449.1 CNTN2 gene_id:6900|Hs108|chr1           (1040) 6991 872.9       0
CCDS8737.1 CNTN1 gene_id:1272|Hs108|chr12          (1018) 3362 427.3 8.1e-119
CCDS8738.1 CNTN1 gene_id:1272|Hs108|chr12          (1007) 3356 426.6 1.3e-118
CCDS33790.1 CNTN3 gene_id:5067|Hs108|chr3          (1028) 3084 393.2 1.5e-108
CCDS53697.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11        (1026) 3057 389.9 1.5e-107
CCDS53696.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11        (1100) 3054 389.5 2.1e-107
CCDS43041.1 CNTN4 gene_id:152330|Hs108|chr3        (1026) 3050 389.0 2.8e-107
CCDS2557.1 CNTN6 gene_id:27255|Hs108|chr3          (1028) 2912 372.1 3.5e-102
CCDS58168.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11        ( 911) 2653 340.2 1.2e-92
CCDS2558.1 CNTN4 gene_id:152330|Hs108|chr3         ( 698) 2192 283.5 1.1e-75
CCDS58225.1 CNTN1 gene_id:1272|Hs108|chr12         ( 627) 2090 270.9   6e-72
CCDS58812.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3          (1208) 1415 188.3 8.3e-47
CCDS55153.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7          (1192) 1271 170.6 1.7e-41
CCDS48192.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX          (1248) 1217 164.0 1.8e-39
CCDS14734.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX          (1253) 1217 164.0 1.8e-39
CCDS14733.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX          (1257) 1217 164.0 1.8e-39
CCDS53460.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1         (1240) 1209 163.1 3.5e-39
CCDS74887.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3          (1171) 1169 158.1   1e-37
CCDS2556.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3           (1224) 1169 158.1   1e-37
CCDS5751.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7           (1183) 1159 156.9 2.4e-37
CCDS34590.1 SDK1 gene_id:221935|Hs108|chr7         (2213) 1110 151.2 2.3e-35
CCDS53461.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1         ( 619)  767 108.5 4.7e-23
CCDS30982.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1         (1169)  699 100.4 2.4e-20
CCDS53462.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1         (1174)  699 100.4 2.4e-20
CCDS2971.1 BOC gene_id:91653|Hs108|chr3            (1114)  611 89.6 4.1e-17
CCDS53957.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15          (1408)  609 89.4 5.7e-17
CCDS58378.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15          (1450)  609 89.5 5.8e-17
CCDS10247.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15          (1461)  609 89.5 5.8e-17
CCDS77788.1 BOC gene_id:91653|Hs108|chr3           (1115)  606 89.0 6.2e-17
CCDS10205.1 IGDCC3 gene_id:9543|Hs108|chr15        ( 814)  540 80.7 1.4e-14
CCDS42040.1 PRTG gene_id:283659|Hs108|chr15        (1150)  533 80.0 3.2e-14
CCDS4884.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6            (1070)  521 78.5 8.4e-14
CCDS59021.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6           (1078)  521 78.5 8.5e-14
CCDS42929.1 DSCAM gene_id:1826|Hs108|chr21         (2012)  473 72.9 7.6e-12
CCDS4887.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6            (1014)  467 71.9   8e-12
CCDS54610.1 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3          (1551)  466 71.9 1.2e-11
CCDS46872.2 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3          (1606)  466 72.0 1.2e-11
CCDS12140.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19         (1910)  465 71.9 1.5e-11
CCDS10206.1 IGDCC4 gene_id:57722|Hs108|chr15       (1250)  453 70.2   3e-11


>>CCDS1449.1 CNTN2 gene_id:6900|Hs108|chr1                (1040 aa)
 initn: 6991 init1: 6991 opt: 6991  Z-score: 4654.6  bits: 872.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6991; 99.8% identity (99.9% similar) in 1040 aa overlap (1-1040:1-1040)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MGTATRRKPHLLLVAAVALVSSSAWSSALGSQTTFGPVFEDQPLSVLFPEESTEEQVLLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MGTATRRKPHLLLVAAVALVSSSAWSSALGSQTTFGPVFEDQPLSVLFPEESTEEQVLLA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 CRARASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASNPVGTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CRARASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASNPVGTV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 VSREAILRFGFLQEFSKEERDPVKTHEGWGVMLPCNPPAHYPGLSYRWLLNEFPNFIPTD
       ::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VSREAILRFGFLQEFSKEERDPVKAHEGWGVMLPCNPPAHYPGLSYRWLLNEFPNFIPTD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 GRHFVSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQLNLAAEDTRLFAPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GRHFVSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQLNLAAEDTRLFAPS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 IKARFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDGSLSPQWTTAEPTLQIPSVSFED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IKARFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDGSLSPQWTTAEPTLQIPSVSFED
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 EGTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGCAAAGKPRPTVRW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EGTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGCAAAGKPRPTVRW
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 LRNGELLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASAELAVQALAPDFR
       ::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LRNGEPLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASAELAVQALAPDFR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 LNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVTPDGTLIIRNISR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVTPDGTLIIRNISR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 SDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTLQCHASHDPTMDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTLQCHASHDPTMDL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 TFTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCMAQTVVDSASKEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TFTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCMAQTVVDSASKEA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 TVLVRGPPGPPGGVVVRDIGDTTIQLSWSRGFDNHSPIAKYTLQARTPPAGKWKQVRTNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TVLVRGPPGPPGGVVVRDIGDTTIQLSWSRGFDNHSPIAKYTLQARTPPAGKWKQVRTNP
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 ANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREAAPSVAPSGLSGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREAAPSVAPSGLSGG
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 GGAPGELIVNWTPMSREYQNGDGFGYLLSFRRQGSTHWQTARVPGADAQYFVYSNESVRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GGAPGELIVNWTPMSREYQNGDGFGYLLSFRRQGSTHWQTARVPGADAQYFVYSNESVRP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 YTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSEMNVTWEPVQQDM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSEMNVTWEPVQQDM
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE2 NGILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTVRAYNRAGTGPAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NGILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTVRAYNRAGTGPAS
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE2 PSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYKMLYQNDLHLTPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYKMLYQNDLHLTPT
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE2 LHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAEVHIVRNGGTSMMVENMAVRPAPH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAEVHIVRNGGTSMMVENMAVRPAPH
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040
pF1KE2 PGTVISHSVAMLILIGSLEL
       ::::::::::::::::::::
CCDS14 PGTVISHSVAMLILIGSLEL
             1030      1040

>>CCDS8737.1 CNTN1 gene_id:1272|Hs108|chr12               (1018 aa)
 initn: 2772 init1: 1723 opt: 3362  Z-score: 2246.7  bits: 427.3 E(32554): 8.1e-119
Smith-Waterman score: 3362; 50.5% identity (75.1% similar) in 1003 aa overlap (10-1000:9-992)

               10        20        30             40        50     
pF1KE2 MGTATRRKPHLLLVAAVALVSSSAWSSALGSQTT-----FGPVFEDQPLSVLFPEESTEE
                ::.... .. ..  .:    :  ..     :::.::.::.....:::: : 
CCDS87  MKMWLLVSHLVIISITTCLAEFTWYRRYGHGVSEEDKGFGPIFEEQPINTIYPEESLEG
                10        20        30        40        50         

          60        70        80        90       100       110     
pF1KE2 QVLLACRARASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASN
       .: : :::::::  .:.:.::. .. :  ..:...::::::: :: : .:::.: :::::
CCDS87 KVSLNCRARASPFPVYKWRMNNGDVDLT-SDRYSMVGGNLVINNPDKQKDAGIYYCLASN
      60        70        80         90       100       110        

         120       130       140       150       160        170    
pF1KE2 PVGTVVSREAILRFGFLQEFSKEERDPVKTHEGWGVMLPCNPPAHYPG-LSYRWLLNEFP
         : : : :: : ::.:. :  :::  :...:: :..: :.:: :.:  :::::::::::
CCDS87 NYGMVRSTEATLSFGYLDPFPPEERPEVRVKEGKGMVLLCDPPYHFPDDLSYRWLLNEFP
      120       130       140       150       160       170        

          180       190       200       210       220        230   
pF1KE2 NFIPTDGRHFVSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQL-NLAAED
        ::  : :.:::::.:::::: ..::: :::::...:     ::::::::  :  .  . 
CCDS87 VFITMDKRRFVSQTNGNLYIANVEASDKGNYSCFVSSPS--ITKSVFSKFIPLIPIPERT
      180       190       200       210         220       230      

           240       250       260       270       280       290   
pF1KE2 TRLFAPSIKARFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDGSLSPQWTTAEPT---
       :. .  .: ..:  ..:::.::.:::::::.::::: :.::::   : :. .::: .   
CCDS87 TKPYPADIVVQFK-DVYALMGQNVTLECFALGNPVPDIRWRKV---LEPMPSTAEISTSG
        240        250       260       270          280       290  

                300       310       320       330       340        
pF1KE2 --LQIPSVSFEDEGTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGC
         :.: ....:::: ::::::: .:.:  :.:: ::: :::.. :.:::.::::.: : :
CCDS87 AVLKIFNIQLEDEGIYECEAENIRGKDKHQARIYVQAFPEWVEHINDTEVDIGSDLYWPC
            300       310       320       330       340       350  

      350       360       370       380       390       400        
pF1KE2 AAAGKPRPTVRWLRNGELLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASA
       .:.::: ::.:::.::             :.::.  ...:..:::::.::: .:.:::.:
CCDS87 VATGKPIPTIRWLKNG--------YAYHKGELRLYDVTFENAGMYQCIAENTYGAIYANA
            360               370       380       390       400    

      410       420       430       440       450       460        
pF1KE2 ELAVQALAPDFRLNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVT
       :: . :::: :..::... : ::.::...: :.:.::::    :::::: ::::::. . 
CCDS87 ELKILALAPTFEMNPMKKKILAAKGGRVIIECKPKAAPKPKFSWSKGTEWLVNSSRILIW
          410       420       430       440       450       460    

      470       480       490       500       510       520        
pF1KE2 PDGTLIIRNISRSDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTL
        ::.: : ::.:.: : :::::::  ::::::: : . : :.: ::: .:::..:.: :.
CCDS87 EDGSLEINNITRNDGGIYTCFAENNRGKANSTGTLVITDPTRIILAPINADITVGENATM
          470       480       490       500       510       520    

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pF1KE2 QCHASHDPTMDLTFTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCM
       :: :: ::..::::.:... . :::.: . ::.:. . .. :.: : ::::.:.:.::: 
CCDS87 QCAASFDPALDLTFVWSFNGYVIDFNKENIHYQRNFMLDSNGELLIRNAQLKHAGRYTCT
          530       540       550       560       570       580    

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pF1KE2 AQTVVDSASKEATVLVRGPPGPPGGVVVRDIGDTTIQLSWSRGFDNHSPIAKYTLQARTP
       :::.::..:  : ..::::::::::. ..::  :.. :.:::: ::::::.:::.:..: 
CCDS87 AQTIVDNSSASADLVVRGPPGPPGGLRIEDIRATSVALTWSRGSDNHSPISKYTIQTKTI
          590       600       610       620       630       640    

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pF1KE2 PAGKWKQVRTNPANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREA
        .  ::...:.:  :::: :.:... : :::.:::::.:.: :: :::: ::..:.:  :
CCDS87 LSDDWKDAKTDPPIIEGNMEAARAVDLIPWMEYEFRVVATNTLGRGEPSIPSNRIKTDGA
          650       660       670       680       690       700    

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pF1KE2 APSVAPSGLSGGGGAPGELIVNWTPMSREYQNGDGFGYLLSFRRQGSTHWQTARVPGADA
       ::.:::: ..::::   :: ..:.:.::::. :..:::...:.   . .:. . : . :.
CCDS87 APNVAPSDVGGGGGRNRELTITWAPLSREYHYGNNFGYIVAFKPFDGEEWKKVTVTNPDT
          710       720       730       740       750       760    

      770       780       790       800       810       820        
pF1KE2 QYFVYSNESVRPYTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSE
         .:...:.. : : :.::....: .:::: ::.:.. ::.. :  :::.: .: .::::
CCDS87 GRYVHKDETMSPSTAFQVKVKAFNNKGDGPYSLVAVINSAQDAPSEAPTEVGVKVLSSSE
          770       780       790       800       810       820    

      830       840       850       860       870       880        
pF1KE2 MNVTWEPVQQDMNGILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTV
       ..: :: :   .. :. .:.:::: : ::: ::.::.... . :::. .: :.:.: . :
CCDS87 ISVHWEHV---LEKIVESYQIRYWAAHDKEEAANRVQVTSQEYSARLENLLPDTQYFIEV
          830          840       850       860       870       880 

      890       900       910       920       930       940        
pF1KE2 RAYNRAGTGPASPSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYK
        : : :: :: :   .: : : :: .::  :: . :.:   : :: :: . :::.:::::
CCDS87 GACNSAGCGPPSDMIEAFTKKAPPSQPPRIISSVRSGSRYIITWDHVVALSNESTVTGYK
             890       900       910       920       930       940 

      950       960       970       980       990      1000        
pF1KE2 MLYQNDLHLTPTLHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAEVHIVRNGGTSM
       .::. : .    :. : :. ::.:.:.: :. .:..:. . ::::. ..:.:        
CCDS87 VLYRPDGQHDGKLYSTHKHSIEVPIPRD-GEYVVEVRAHSDGGDGVVSQVKISGAPTLSP
             950       960        970       980       990      1000

     1010      1020      1030      1040
pF1KE2 MVENMAVRPAPHPGTVISHSVAMLILIGSLEL
                                       
CCDS87 SLLGLLLPAFGILVYLEF              
             1010                      

>>CCDS8738.1 CNTN1 gene_id:1272|Hs108|chr12               (1007 aa)
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               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MGTATRRKPHLLLVAAVALVSSSAWSSALGSQTTFGPVFEDQPLSVLFPEESTEEQVLLA
                  :::. ....: ..  ..   .  :::.::.::.....:::: : .: : 
CCDS87        MKMWLLVSHLVIISITTCLAVSEEDKGFGPIFEEQPINTIYPEESLEGKVSLN
                      10        20        30        40        50   

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 CRARASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASNPVGTV
       :::::::  .:.:.::. .. :  ..:...::::::: :: : .:::.: :::::  : :
CCDS87 CRARASPFPVYKWRMNNGDVDLT-SDRYSMVGGNLVINNPDKQKDAGIYYCLASNNYGMV
            60        70         80        90       100       110  

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pF1KE2 VSREAILRFGFLQEFSKEERDPVKTHEGWGVMLPCNPPAHYPG-LSYRWLLNEFPNFIPT
        : :: : ::.:. :  :::  :...:: :..: :.:: :.:  ::::::::::: ::  
CCDS87 RSTEATLSFGYLDPFPPEERPEVRVKEGKGMVLLCDPPYHFPDDLSYRWLLNEFPVFITM
            120       130       140       150       160       170  

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pF1KE2 DGRHFVSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQL-NLAAEDTRLFA
       : :.:::::.:::::: ..::: :::::...:     ::::::::  :  .  . :. . 
CCDS87 DKRRFVSQTNGNLYIANVEASDKGNYSCFVSSPS--ITKSVFSKFIPLIPIPERTTKPYP
            180       190       200         210       220       230

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE2 PSIKARFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDGSLSPQWTTAEPT-----LQI
        .: ..:  ..:::.::.:::::::.::::: :.::::   : :. .::: .     :.:
CCDS87 ADIVVQFK-DVYALMGQNVTLECFALGNPVPDIRWRKV---LEPMPSTAEISTSGAVLKI
               240       250       260          270       280      

           300       310       320       330       340       350   
pF1KE2 PSVSFEDEGTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGCAAAGK
        ....:::: ::::::: .:.:  :.:: ::: :::.. :.:::.::::.: : :.:.::
CCDS87 FNIQLEDEGIYECEAENIRGKDKHQARIYVQAFPEWVEHINDTEVDIGSDLYWPCVATGK
        290       300       310       320       330       340      

           360       370       380       390       400       410   
pF1KE2 PRPTVRWLRNGELLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASAELAVQ
       : ::.:::.::    .        :.::.  ...:..:::::.::: .:.:::.::: . 
CCDS87 PIPTIRWLKNGYAYHK--------GELRLYDVTFENAGMYQCIAENTYGAIYANAELKIL
        350       360               370       380       390        

           420       430       440       450       460       470   
pF1KE2 ALAPDFRLNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVTPDGTL
       :::: :..::... : ::.::...: :.:.::::    :::::: ::::::. .  ::.:
CCDS87 ALAPTFEMNPMKKKILAAKGGRVIIECKPKAAPKPKFSWSKGTEWLVNSSRILIWEDGSL
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pF1KE2 IIRNISRSDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTLQCHAS
        : ::.:.: : :::::::  ::::::: : . : :.: ::: .:::..:.: :.:: ::
CCDS87 EINNITRNDGGIYTCFAENNRGKANSTGTLVITDPTRIILAPINADITVGENATMQCAAS
      460       470       480       490       500       510        

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pF1KE2 HDPTMDLTFTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCMAQTVV
        ::..::::.:... . :::.: . ::.:. . .. :.: : ::::.:.:.::: :::.:
CCDS87 FDPALDLTFVWSFNGYVIDFNKENIHYQRNFMLDSNGELLIRNAQLKHAGRYTCTAQTIV
      520       530       540       550       560       570        

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pF1KE2 DSASKEATVLVRGPPGPPGGVVVRDIGDTTIQLSWSRGFDNHSPIAKYTLQARTPPAGKW
       :..:  : ..::::::::::. ..::  :.. :.:::: ::::::.:::.:..:  .  :
CCDS87 DNSSASADLVVRGPPGPPGGLRIEDIRATSVALTWSRGSDNHSPISKYTIQTKTILSDDW
      580       590       600       610       620       630        

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pF1KE2 KQVRTNPANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREAAPSVA
       :...:.:  :::: :.:... : :::.:::::.:.: :: :::: ::..:.:  :::.::
CCDS87 KDAKTDPPIIEGNMEAARAVDLIPWMEYEFRVVATNTLGRGEPSIPSNRIKTDGAAPNVA
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pF1KE2 PSGLSGGGGAPGELIVNWTPMSREYQNGDGFGYLLSFRRQGSTHWQTARVPGADAQYFVY
       :: ..::::   :: ..:.:.::::. :..:::...:.   . .:. . : . :.  .:.
CCDS87 PSDVGGGGGRNRELTITWAPLSREYHYGNNFGYIVAFKPFDGEEWKKVTVTNPDTGRYVH
      700       710       720       730       740       750        

           780       790       800       810       820       830   
pF1KE2 SNESVRPYTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSEMNVTW
       ..:.. : : :.::....: .:::: ::.:.. ::.. :  :::.: .: .::::..: :
CCDS87 KDETMSPSTAFQVKVKAFNNKGDGPYSLVAVINSAQDAPSEAPTEVGVKVLSSSEISVHW
      760       770       780       790       800       810        

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pF1KE2 EPVQQDMNGILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTVRAYNR
       : :   .. :. .:.:::: : ::: ::.::.... . :::. .: :.:.: . : : : 
CCDS87 EHV---LEKIVESYQIRYWAAHDKEEAANRVQVTSQEYSARLENLLPDTQYFIEVGACNS
      820          830       840       850       860       870     

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pF1KE2 AGTGPASPSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYKMLYQN
       :: :: :   .: : : :: .::  :: . :.:   : :: :: . :::.:::::.::. 
CCDS87 AGCGPPSDMIEAFTKKAPPSQPPRIISSVRSGSRYIITWDHVVALSNESTVTGYKVLYRP
         880       890       900       910       920       930     

           960       970       980       990      1000      1010   
pF1KE2 DLHLTPTLHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAEVHIVRNGGTSMMVENM
       : .    :. : :. ::.:.:.: :. .:..:. . ::::. ..:.:             
CCDS87 DGQHDGKLYSTHKHSIEVPIPRD-GEYVVEVRAHSDGGDGVVSQVKISGAPTLSPSLLGL
         940       950        960       970       980       990    

          1020      1030      1040
pF1KE2 AVRPAPHPGTVISHSVAMLILIGSLEL
                                  
CCDS87 LLPAFGILVYLEF              
         1000                     

>>CCDS33790.1 CNTN3 gene_id:5067|Hs108|chr3               (1028 aa)
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                                   ::..  . ::::  .: . .::  : .... :
CCDS33             MMFPWKQLILLSFIGCLGGELLLQGPVFIKEPSNSIFPVGSEDKKITL
                           10        20        30        40        

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pF1KE2 ACRARASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASNPVGT
        :.::..:   :::..::... .    :..: :::::..::..  :.:.:::.:.: .::
CCDS33 HCEARGNPSPHYRWQLNGSDIDMSMEHRYKLNGGNLVVINPNRNWDTGTYQCFATNSLGT
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pF1KE2 VVSREAILRFGFLQEFSKEERDPVKTHEGWGVMLPCNPPAHYPGLSYRWLLNEFPNFIPT
       .::::: :.:..:..:. . :. :...:: ::.: :.:: :   ::: :..::.:.:.  
CCDS33 IVSREAKLQFAYLENFKTKMRSTVSVREGQGVVLLCGPPPHSGELSYAWIFNEYPSFVEE
      110       120       130       140       150       160        

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pF1KE2 DGRHFVSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQLNLAAEDTR-LFA
       :.:.:::: ::.:::.... ::.:::.:..:: .  ..  :... . : : .. .   . 
CCDS33 DSRRFVSQETGHLYISKVEPSDVGNYTCVVTSMV--TNARVLGSPTPLVLRSDGVMGEYE
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pF1KE2 PSIKARFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDG---SLSPQWTTAEPTLQIPS
       :.:...::    :  :. : :::::.:::.:.:.::. ::   : . .      .:.::.
CCDS33 PKIEVQFPETLPAAKGSTVKLECFALGNPIPQINWRRSDGLPFSSKIKLRKFSGVLEIPN
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pF1KE2 VSFEDEGTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGCAAAGKPR
        . :: :.::: ::::.:.....::.   :.:.:...:.:.:  . ..: : : :.:::.
CCDS33 FQQEDAGSYECIAENSRGKNVARGRLTYYAKPHWVQLIKDVEIAVEDSLYWECRASGKPK
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pF1KE2 PTVRWLRNGELLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASAELAVQAL
       :. :::.::  :. ..:...  : : .:.::. ::::.::.:::::: .:.:::: : : 
CCDS33 PSYRWLKNGAALVLEERTQIENGALTISNLSVTDSGMFQCIAENKHGLVYSSAELKVVAS
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pF1KE2 APDFRLNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVTPDGTLII
       ::::  ::...:. .  :. . . :.:::.:.:.  :.::   . .  :...  :: : :
CCDS33 APDFSKNPMKKLVQVQVGSLVSLDCKPRASPRALSSWKKGDVSVQEHERISLLNDGGLKI
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pF1KE2 RNISRSDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTLQCHASHD
        :....: : :::.::: .::::.:  : : . :.::::::. :...:... : :...::
CCDS33 ANVTKADAGTYTCMAENQFGKANGTTHLVVTEPTRITLAPSNMDVSVGESVILPCQVQHD
        470       480       490       500       510       520      

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pF1KE2 PTMDLTFTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCMAQTVVDS
       : .:. ::: ..    :: : :.:..... . . ::: : : ::.:.:::.::.:: :::
CCDS33 PLLDIIFTWYFNGALADFKKDGSHFEKVGGSSS-GDLMIRNIQLKHSGKYVCMVQTGVDS
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pF1KE2 ASKEATVLVRGPPGPPGGVVVRDIGDTTIQLSWSRGFDNHSPIAKYTLQARTPPAGKWKQ
       .:. : ..::: :::: .: : .: ::: ::::..: :::::. .:..::::: .  :. 
CCDS33 VSSAADLIVRGSPGPPENVKVDEITDTTAQLSWKEGKDNHSPVISYSIQARTPFSVGWQT
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pF1KE2 VRTNPANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREAAPSVAPS
       : : :  :.:...:: :. :.::..:::::.::: .: :::: :: :.::.::.: : ::
CCDS33 VTTVPEVIDGKTHTATVVELNPWVEYEFRVVASNKIGGGEPSLPSEKVRTEEAVPEVPPS
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pF1KE2 GLSGGGGAPGELIVNWTPMSREYQNGDGFGYLLSFRRQGSTHWQTARVPGADAQYFVYSN
        ..::::. .::...: :. .: :::.::::...::  : : :  . : . :.  .:. :
CCDS33 EVNGGGGSRSELVITWDPVPEELQNGEGFGYVVAFRPLGVTTWIQTVVTSPDTPRYVFRN
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pF1KE2 ESVRPYTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSEMNVTWEP
       ::. ::.:.:::.  :: .:.:: : .. :.:::::: :::..: :...::::..:.:. 
CCDS33 ESIVPYSPYEVKVGVYNNKGEGPFSPVTTVFSAEEEPTVAPSQVSANSLSSSEIEVSWNT
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pF1KE2 VQQDM-NGILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTVRAYNRA
       .   . :: :::::.:::..: :: .......:: .::::. ::. :  :...::::: :
CCDS33 IPWKLSNGHLLGYEVRYWNGGGKEESSSKMKVAGNETSARLRGLKSNLAYYTAVRAYNSA
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pF1KE2 GTGPASPSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYKMLY---
       :.:: : ..:.:: : :: .::::. :. ..... ..:. :  ..::: :::::..:   
CCDS33 GAGPFSATVNVTTKKTPPSQPPGNVVWNATDTKVLLNWEQVKAMENESEVTGYKVFYRTS
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pF1KE2 -QNDLHLTPTLHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAE-VHIVRNGGTSMM
        ::....  : . ...  . .:. ::    ......:  ::::  .: ..: :  . .  
CCDS33 SQNNVQVLNTNKTSAE--LVLPIKEDY---IIEVKATTDGGDGTSSEQIRIPRITSMDAR
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    1010      1020      1030      1040
pF1KE2 VENMAVRPAPHPGTVISHSVAMLILIGSLEL
         . :.  . :: .     : .::.      
CCDS33 GSTSAISNV-HPMSSYMPIVLFLIVYVLW  
              1010      1020          

>>CCDS53697.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11             (1026 aa)
 initn: 2964 init1: 1884 opt: 3057  Z-score: 2044.2  bits: 389.9 E(32554): 1.5e-107
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pF1KE2 MGTATRRKPHLLLVAAVALVSSSAWSSALGSQTTFGPVFEDQPLSVLFPEESTEEQVLLA
                                   :. .. .:::: ..: ...:: .: :..: : 
CCDS53             MASSWKLMLFLSVTMCLSESVDYGPVFVQEPDDIIFPTDSDEKKVALN
                           10        20        30        40        

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pF1KE2 CRARASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASNPVGTV
       :..:..:  .:::  ::::. ::   :..:. :...: ::..:.:.: :::::.: ::..
CCDS53 CEVRGNPVPSYRWLRNGTEIDLESDYRYSLIDGTFIISNPSEAKDSGHYQCLATNTVGSI
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pF1KE2 VSREAILRFGFLQEFSKEERDPVKTHEGWGVMLPCNPPAHYPGLSYRWLLNEFPNFIPTD
       .:::: :.:..: .:: . :. :...:: ::.: :.:: : : . : :..::::.:.  :
CCDS53 LSREATLQFAYLGNFSGRTRSAVSVREGQGVVLMCSPPPHSPEIIYSWVFNEFPSFVAED
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pF1KE2 GRHFVSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQLNLAAEDTR-LFAP
       .:.:.:: ::::::.....::.:.: ::. . .  ..  :.:  . :.:  . .   . :
CCDS53 SRRFISQETGNLYISKVQTSDVGSYICLVKNTV--TNARVLSPPTPLTLRNDGVMGEYEP
      170       180       190       200         210       220      

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pF1KE2 SIKARFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDGSLSPQ--WTTAEPTLQIPSVS
       .:...::  . :  :  : .::::.::::: : : ::.: .  .     .. .:.::.:.
CCDS53 KIEVHFPFTVTAAKGTTVKMECFALGNPVPTITWMKVNGYIPSKARLRKSQAVLEIPNVQ
        230       240       250       260       270       280      

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pF1KE2 FEDEGTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGCAAAGKPRPT
       ..: : :::.::::.:... .:.. : . :.:.. ..::. : :: ::: : :.::::::
CCDS53 LDDAGIYECRAENSRGKNSFRGQLQVYTYPHWVEKLNDTQLDSGSPLRWECKATGKPRPT
        290       300       310       320       330       340      

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pF1KE2 VRWLRNGELLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASAELAVQALAP
        :::.::  :. :.:::.. : : . ...  :.:::::.::::.:.::::::: . : ::
CCDS53 YRWLKNGVPLSPQSRVEMVNGVLMIHNVNQSDAGMYQCLAENKYGAIYASAELKILASAP
        350       360       370       380       390       400      

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pF1KE2 DFRLNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVTPDGTLIIRN
        : :: ... : ...  :..: :.:...:: .. :.:: . . ...:... :::.: : :
CCDS53 TFALNQLKKTIIVTKDQEVVIECKPQGSPKPTISWKKGDRAVRENKRIAILPDGSLRILN
        410       420       430       440       450       460      

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pF1KE2 ISRSDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTLQCHASHDPT
        :.::::::.: .:: .:.:.  . :::.. :.: :.:. .....:....:.:.: :: .
CCDS53 ASKSDEGKYVCRGENVFGSAEIIASLSVKEPTRIELTPKRTELTVGESIVLNCKAIHDAS
        470       480       490       500       510       520      

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pF1KE2 MDLTFTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCMAQTVVDSAS
       .:.:: :::   ::::.. :::..   .. . .:: : :  : :.:.: : .::..::.:
CCDS53 LDVTFYWTLKGQPIDFEEEGGHFESIRAQASSADLMIRNILLMHAGRYGCRVQTTADSVS
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pF1KE2 KEATVLVRGPPGPPGGVVVRDIGDTTIQLSWSRGFDNHSPIAKYTLQARTPPAGKWKQVR
        :: .:::::::::: :.:..: ..:  :::: . ::::::..:.::::.: .  :. :.
CCDS53 DEAELLVRGPPGPPGIVIVEEITESTATLSWSPAADNHSPISSYNLQARSPFSLGWQTVK
        590       600       610       620       630       640      

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pF1KE2 TNPANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREAAPSVAPSGL
       : :  : :. :.:... :.::..:::::.:.: .:::.:: ::  ::: ::.:..::...
CCDS53 TVPEIITGDMESAMAVDLNPWVEYEFRVVATNPIGTGDPSTPSRMIRTNEAVPKTAPTNV
        650       660       670       680       690       700      

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pF1KE2 SGGGGAPGELIVNWTPMSREYQNGDGFGYLLSFRRQGSTHWQTARVPGADAQYFVYSNES
       :: .:   ::.. : :.:.:.:::.::::...:: .:.  :.   : ...:. :.: .::
CCDS53 SGRSGRRHELVIAWEPVSEEFQNGEGFGYIVAFRPNGTRGWKEKMVTSSEASKFIYRDES
        710       720       730       740       750       760      

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pF1KE2 VRPYTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSEMNVTWEPVQ
       : : ::::::.  :: .:::: :  ... ::: :: .::: : : .:: ::. :.:. ..
CCDS53 VPPLTPFEVKVGVYNNKGDGPFSQIVVICSAEGEPSAAPTDVKATSVSVSEILVAWKHIK
        770       780       790       800       810       820      

       840       850       860       870       880       890       
pF1KE2 QDMNGILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTVRAYNRAGTG
       ... :   :.:. :::  ..: .:. :.: : .. . ..::. :: :: :::::: :: :
CCDS53 ESL-GRPQGFEVGYWKDMEQEDTAETVKTRGNESFVILTGLEGNTLYHFTVRAYNGAGYG
         830       840       850       860       870       880     

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pF1KE2 PASPSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYKMLYQNDLHL
       : :  ..::: : :: . :.:. :  ..:..:. :.::.:. ::: :.:::..:... : 
CCDS53 PPSSEVSATTKKSPPSQAPSNLRWEQQGSQVSLGWEPVIPLANESEVVGYKVFYRQEGHS
         890       900       910       920       930       940     

       960       970       980       990       1000      1010      
pF1KE2 TPTLHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPA-EVHIVRNGGTSMMVENMAVR
       .  .  : :    .:.: : :  ....:. . ::::  . ....   .: ..     ...
CCDS53 NSQVIETQKLQAVVPLP-DAGVYIIEVRAYSEGGDGTASSQIRVPSYSGGKIT----SAQ
         950       960        970       980       990          1000

       1020      1030      1040  
pF1KE2 PAPHPGTVISHSVAMLILIGSLEL  
        . :  .. : ::..:.         
CCDS53 STLHSLSTSSSSVTLLLALMIPSTSW
             1010      1020      

>>CCDS53696.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11             (1100 aa)
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           10        20        30        40        50        60    
pF1KE2 TRRKPHLLLVAAVALVSSSAWSSALGSQTTFGPVFEDQPLSVLFPEESTEEQVLLACRAR
                                     .:::: ..: ...:: .: :..: : :..:
CCDS53 PSWLGAAQNYYSPINLYHSSDAFKQDESVDYGPVFVQEPDDIIFPTDSDEKKVALNCEVR
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pF1KE2 ASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASNPVGTVVSRE
       ..:  .:::  ::::. ::   :..:. :...: ::..:.:.: :::::.: ::...:::
CCDS53 GNPVPSYRWLRNGTEIDLESDYRYSLIDGTFIISNPSEAKDSGHYQCLATNTVGSILSRE
        130       140       150       160       170       180      

          130       140       150       160       170       180    
pF1KE2 AILRFGFLQEFSKEERDPVKTHEGWGVMLPCNPPAHYPGLSYRWLLNEFPNFIPTDGRHF
       : :.:..: .:: . :. :...:: ::.: :.:: : : . : :..::::.:.  :.:.:
CCDS53 ATLQFAYLGNFSGRTRSAVSVREGQGVVLMCSPPPHSPEIIYSWVFNEFPSFVAEDSRRF
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          190       200       210       220       230        240   
pF1KE2 VSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQLNLAAEDTR-LFAPSIKA
       .:: ::::::.....::.:.: ::. . .  ..  :.:  . :.:  . .   . :.:..
CCDS53 ISQETGNLYISKVQTSDVGSYICLVKNTV--TNARVLSPPTPLTLRNDGVMGEYEPKIEV
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           250       260       270       280         290       300 
pF1KE2 RFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDGSLSPQ--WTTAEPTLQIPSVSFEDE
       .::  . :  :  : .::::.::::: : : ::.: .  .     .. .:.::.:...: 
CCDS53 HFPFTVTAAKGTTVKMECFALGNPVPTITWMKVNGYIPSKARLRKSQAVLEIPNVQLDDA
          310       320       330       340       350       360    

             310       320       330       340       350       360 
pF1KE2 GTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGCAAAGKPRPTVRWL
       : :::.::::.:... .:.. : . :.:.. ..::. : :: ::: : :.:::::: :::
CCDS53 GIYECRAENSRGKNSFRGQLQVYTYPHWVEKLNDTQLDSGSPLRWECKATGKPRPTYRWL
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pF1KE2 RNGELLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASAELAVQALAPDFRL
       .::  :. :.:::.. : : . ...  :.:::::.::::.:.::::::: . : :: : :
CCDS53 KNGVPLSPQSRVEMVNGVLMIHNVNQSDAGMYQCLAENKYGAIYASAELKILASAPTFAL
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pF1KE2 NPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVTPDGTLIIRNISRS
       : ... : ...  :..: :.:...:: .. :.:: . . ...:... :::.: : : :.:
CCDS53 NQLKKTIIVTKDQEVVIECKPQGSPKPTISWKKGDRAVRENKRIAILPDGSLRILNASKS
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pF1KE2 DEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTLQCHASHDPTMDLT
       :::::.: .:: .:.:.  . :::.. :.: :.:. .....:....:.:.: :: ..:.:
CCDS53 DEGKYVCRGENVFGSAEIIASLSVKEPTRIELTPKRTELTVGESIVLNCKAIHDASLDVT
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pF1KE2 FTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCMAQTVVDSASKEAT
       : :::   ::::.. :::..   .. . .:: : :  : :.:.: : .::..::.: :: 
CCDS53 FYWTLKGQPIDFEEEGGHFESIRAQASSADLMIRNILLMHAGRYGCRVQTTADSVSDEAE
          610       620       630       640       650       660    

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pF1KE2 VLVRGPPGPPGGVVVRDIGDTTIQLSWSRGFDNHSPIAKYTLQARTPPAGKWKQVRTNPA
       .:::::::::: :.:..: ..:  :::: . ::::::..:.::::.: .  :. :.: : 
CCDS53 LLVRGPPGPPGIVIVEEITESTATLSWSPAADNHSPISSYNLQARSPFSLGWQTVKTVPE
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pF1KE2 NIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREAAPSVAPSGLSGGG
        : :. :.:... :.::..:::::.:.: .:::.:: ::  ::: ::.:..::...:: .
CCDS53 IITGDMESAMAVDLNPWVEYEFRVVATNPIGTGDPSTPSRMIRTNEAVPKTAPTNVSGRS
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pF1KE2 GAPGELIVNWTPMSREYQNGDGFGYLLSFRRQGSTHWQTARVPGADAQYFVYSNESVRPY
       :   ::.. : :.:.:.:::.::::...:: .:.  :.   : ...:. :.: .::: : 
CCDS53 GRRHELVIAWEPVSEEFQNGEGFGYIVAFRPNGTRGWKEKMVTSSEASKFIYRDESVPPL
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pF1KE2 TPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSEMNVTWEPVQQDMN
       ::::::.  :: .:::: :  ... ::: :: .::: : : .:: ::. :.:. ..... 
CCDS53 TPFEVKVGVYNNKGDGPFSQIVVICSAEGEPSAAPTDVKATSVSVSEILVAWKHIKESL-
          850       860       870       880       890       900    

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pF1KE2 GILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTVRAYNRAGTGPASP
       :   :.:. :::  ..: .:. :.: : .. . ..::. :: :: :::::: :: :: : 
CCDS53 GRPQGFEVGYWKDMEQEDTAETVKTRGNESFVILTGLEGNTLYHFTVRAYNGAGYGPPSS
           910       920       930       940       950       960   

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pF1KE2 SANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYKMLYQNDLHLTPTL
        ..::: : :: . :.:. :  ..:..:. :.::.:. ::: :.:::..:... : .  .
CCDS53 EVSATTKKSPPSQAPSNLRWEQQGSQVSLGWEPVIPLANESEVVGYKVFYRQEGHSNSQV
           970       980       990      1000      1010      1020   

             970       980       990       1000      1010      1020
pF1KE2 HLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPA-EVHIVRNGGTSMMVENMAVRPAPH
         : :    .:.: : :  ....:. . ::::  . ....   .: ..     ... . :
CCDS53 IETQKLQAVVPLP-DAGVYIIEVRAYSEGGDGTASSQIRVPSYSGGKIT----SAQSTLH
          1030       1040      1050      1060      1070            

             1030      1040  
pF1KE2 PGTVISHSVAMLILIGSLEL  
         .. : ::..:.         
CCDS53 SLSTSSSSVTLLLALMIPSTSW
     1080      1090      1100

>>CCDS43041.1 CNTN4 gene_id:152330|Hs108|chr3             (1026 aa)
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Smith-Waterman score: 3050; 44.4% identity (75.1% similar) in 969 aa overlap (33-997:22-985)

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pF1KE2 TATRRKPHLLLVAAVALVSSSAWSSALGSQTTFGPVFEDQPLSVLFPEESTEEQVLLACR
                                     :  ::.: ..:  :.:: .: :..: : :.
CCDS43          MRLPWELLVLQSFILCLADDSTLHGPIFIQEPSPVMFPLDSEEKKVKLNCE
                        10        20        30        40        50 

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pF1KE2 ARASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASNPVGTVVS
       ....:    :::.:::..      :...: :.:.: ::.:.::::.::: :.:  ::.::
CCDS43 VKGNPKPHIRWKLNGTDVDTGMDFRYSVVEGSLLINNPNKTQDAGTYQCTATNSFGTIVS
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pF1KE2 REAILRFGFLQEFSKEERDPVKTHEGWGVMLPCNPPAHYPGLSYRWLLNEFPNFIPTDGR
       ::: :.:..:..:. . :. :....: :..: :.:: :   ::: :..::.:..   :.:
CCDS43 REAKLQFAYLDNFKTRTRSTVSVRRGQGMVLLCGPPPHSGELSYAWIFNEYPSY--QDNR
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            190       200       210       220       230        240 
pF1KE2 HFVSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQLNLAAEDTR-LFAPSI
       .:::: :::::::... ::.:::.:..:. .  ....:..  . : :  . .   . :.:
CCDS43 RFVSQETGNLYIAKVEKSDVGNYTCVVTNTV--TNHKVLGPPTPLILRNDGVMGEYEPKI
     170       180       190       200         210       220       

             250       260       270          280       290        
pF1KE2 KARFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDG---SLSPQWTTAEPTLQIPSVSF
       ...::  . .  :  : :::::.::::: : ::..::   . . .   ..  :.::. . 
CCDS43 EVQFPETVPTAKGATVKLECFALGNPVPTIIWRRADGKPIARKARRHKSNGILEIPNFQQ
       230       240       250       260       270       280       

      300       310       320       330       340       350        
pF1KE2 EDEGTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGCAAAGKPRPTV
       :: : ::: ::::.:.....:..   :::.:.. :.: .. .  :. : : : :.:.:: 
CCDS43 EDAGLYECVAENSRGKNVARGQLTFYAQPNWIQKINDIHVAMEENVFWECKANGRPKPTY
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pF1KE2 RWLRNGELLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASAELAVQALAPD
       .::.::: : ...:...  : : .. ..: :.:::::.::::::.:...:::.: :..::
CCDS43 KWLKNGEPLLTRDRIQIEQGTLNITIVNLSDAGMYQCLAENKHGVIFSNAELSVIAVGPD
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      420       430       440       450       460       470        
pF1KE2 FRLNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVTPDGTLIIRNI
       :  . ..:.  .  :::..: :.:.:.:: :  :.:: .:: .. :.:.. ::.: : :.
CCDS43 FSRTLLKRVTLVKVGGEVVIECKPKASPKPVYTWKKGRDILKENERITISEDGNLRIINV
       410       420       430       440       450       460       

      480       490       500       510       520       530        
pF1KE2 SRSDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTLQCHASHDPTM
       ..:: :.:::.: : .: :.::: : :.: :.. . ::: :...:....: :...:: ..
CCDS43 TKSDAGSYTCIATNHFGTASSTGNLVVKDPTRVMVPPSSMDVTVGESIVLPCQVTHDHSL
       470       480       490       500       510       520       

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pF1KE2 DLTFTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCMAQTVVDSASK
       :..:::...   ::::. : :..:.. ... ::: : : ::.:.:::.::.:: ::  : 
CCDS43 DIVFTWSFNGHLIDFDRDGDHFERVGGQDSAGDLMIRNIQLKHAGKYVCMVQTSVDRLSA
       530       540       550       560       570       580       

      600       610       620       630       640       650        
pF1KE2 EATVLVRGPPGPPGGVVVRDIGDTTIQLSWSRGFDNHSPIAKYTLQARTPPAGKWKQVRT
        : ..:::::::: .:.. .: ::: ::::  : ::::::. :..::::: .  :. : :
CCDS43 AADLIVRGPPGPPEAVTIDEITDTTAQLSWRPGPDNHSPITMYVIQARTPFSVGWQAVST
       590       600       610       620       630       640       

      660       670       680       690       700       710        
pF1KE2 NPANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREAAPSVAPSGLS
        :  :.:.. :: :.::.::..::::..:.:..: :::: :: : ::.:: : :.:...:
CCDS43 VPELIDGKTFTATVVGLNPWVEYEFRTVAANVIGIGEPSRPSEKRRTEEALPEVTPANVS
       650       660       670       680       690       700       

      720       730       740       750       760       770        
pF1KE2 GGGGAPGELIVNWTPMSREYQNGDGFGYLLSFRRQGSTHWQTARVPGADAQYFVYSNESV
       ::::. .::...:  . .: ::: ::::...::  :.  :. . . .:::. .:. ::::
CCDS43 GGGGSKSELVITWETVPEELQNGRGFGYVVAFRPYGKMIWMLTVLASADASRYVFRNESV
       710       720       730       740       750       760       

      780       790       800       810       820       830        
pF1KE2 RPYTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSEMNVTWEPVQQ
       .:..:::::.  .: .:.:: : :..::::::::   :....:...:.....: :    .
CCDS43 HPFSPFEVKVGVFNNKGEGPFSPTTVVYSAEEEPTKPPASIFARSLSATDIEVFWASPLE
       770       780       790       800       810       820       

      840       850       860       870       880       890        
pF1KE2 DMNGILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTVRAYNRAGTGP
          : . :::..::.  :::  : ..::.: .::.....:. .. ::..:.::: :::::
CCDS43 KNRGRIQGYEVKYWRHEDKEENARKIRTVGNQTSTKITNLKGSVLYHLAVKAYNSAGTGP
       830       840       850       860       870       880       

      900       910       920       930       940       950        
pF1KE2 ASPSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYKMLYQNDLHLT
       .: ..:.:: :::: .::::: :. :.:.. ..:: :  . ::: : :::.::. . . .
CCDS43 SSATVNVTTRKPPPSQPPGNIIWNSSDSKIILNWDQVKALDNESEVKGYKVLYRWNRQSS
       890       900       910       920       930       940       

      960       970       980       990      1000      1010        
pF1KE2 PTLHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAEVHIVRNGGTSMMVENMAVRPA
        ..  :.:. .:. .: :  . ...:.  . ::::  .:                     
CCDS43 TSVIETNKTSVELSLPFDEDY-IIEIKPFSDGGDGSSSEQIRIPKISNAYARGSGASTSN
       950       960        970       980       990      1000      

     1020      1030      1040
pF1KE2 PHPGTVISHSVAMLILIGSLEL
                             
CCDS43 ACTLSAISTIMISLTARSSL  
       1010      1020        

>>CCDS2557.1 CNTN6 gene_id:27255|Hs108|chr3               (1028 aa)
 initn: 1715 init1: 978 opt: 2912  Z-score: 1948.0  bits: 372.1 E(32554): 3.5e-102
Smith-Waterman score: 2912; 43.0% identity (71.2% similar) in 1038 aa overlap (13-1035:7-1028)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MGTATRRKPHLLLVAAVALVSSSAWSSALGSQTTFGPVFEDQPLSVLFPEESTEEQVLLA
                   ::  . :..::: .. :.      :.: ..: .:.:: . .. .:.: 
CCDS25       MRLLWKLVILLPLINSSAGDGLLSR-----PIFTQEPHDVIFPLDLSKSEVILN
                     10        20             30        40         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 CRARASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASNPVGTV
       : : . :   ::::.:::.. .  . ...: ::.:.: .:   :: :.:::::.: .::.
CCDS25 CAANGYPSPHYRWKQNGTDIDFTMSYHYRLDGGSLAINSPHTDQDIGMYQCLATNLLGTI
      50        60        70        80        90       100         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 VSREAILRFGFLQEFSKEERDPVKTHEGWGVMLPCNPPAHYPGLSYRWLLNEFPNFIPTD
       .::.: :.:.....:  . :. :...:: ::.: :.:: :.  ::: : .:. : ..  :
CCDS25 LSRKAKLQFAYIEDFETKTRSTVSVREGQGVVLLCGPPPHFGDLSYAWTFNDNPLYVQED
     110       120       130       140       150       160         

              190       200       210       220       230          
pF1KE2 GRHFVSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQLNLAAEDTRL--FA
       .:.:::: :::::::... ::.:::.:. :..   . .:: .  . : .   :  .  . 
CCDS25 NRRFVSQETGNLYIAKVEPSDVGNYTCFITNKE--AQRSVQGPPTPL-VQRTDGVMGEYE
     170       180       190       200         210        220      

      240       250       260       270       280          290     
pF1KE2 PSIKARFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDGSLSP---QWTTAEPTLQIPS
       :.:..:::    :   ..: :::::.::::: :.::..:::  :   ... ..  :.::.
CCDS25 PKIEVRFPETIQAAKDSSVKLECFALGNPVPDISWRRLDGSPLPGKVKYSKSQAILEIPN
        230       240       250       260       270       280      

         300       310       320       330       340       350     
pF1KE2 VSFEDEGTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGCAAAGKPR
        . :::: ::: : : .::. ..:..:  : ::: . :..:. .: .:: : : :.::: 
CCDS25 FQQEDEGFYECIASNLRGRNLAKGQLIFYAPPEWEQKIQNTHLSIYDNLLWECKASGKPN
        290       300       310       320       330       340      

         360       370       380       390       400       410     
pF1KE2 PTVRWLRNGELLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASAELAVQAL
       :   ::.::: :  ..:...  : : .. :.. :::.:::.::::.  :::.::: : : 
CCDS25 PWYTWLKNGERLNPEERIQIENGTLIITMLNVSDSGVYQCAAENKYQIIYANAELRVLAS
        350       360       370       380       390       400      

         420       430       440       450       460       470     
pF1KE2 APDFRLNPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVTPDGTLII
       ::::  .::..   .  ::.:.: :.: : :.:.. :..::: : .:.:. .  ::.: :
CCDS25 APDFSKSPVKKKSFVQVGGDIVIGCKPNAFPRAAISWKRGTETLRQSKRIFLLEDGSLKI
        410       420       430       440       450       460      

         480       490       500       510       520       530     
pF1KE2 RNISRSDEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTLQCHASHD
        ::.::: :.:::.: : .: :..:: : :.. : ::. ::. :...:....: :..:::
CCDS25 YNITRSDAGSYTCIATNQFGTAKNTGSLIVKERTVITVPPSKMDVTVGESIVLPCQVSHD
        470       480       490       500       510       520      

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pF1KE2 PTMDLTFTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCMAQTVVDS
       :.....:.: ..   ::. :  .:..: .  :..::: : : ::.:.::: : .::...:
CCDS25 PSIEVVFVWFFNGDVIDLKKGVAHFERIG-GESVGDLMIRNIQLHHSGKYLCTVQTTLES
        530       540       550        560       570       580     

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pF1KE2 ASKEATVLVRGPPGPPGGVVVRDIGDTTIQLSWSRGFDNHSPIAKYTLQARTPPAGKWKQ
        :  : ..::::::::  : :.::..:: ::::  : ::.:::  .:.:.::: .  :. 
CCDS25 LSAVADIIVRGPPGPPEDVQVEDISSTTSQLSWRAGPDNNSPIQIFTIQTRTPFSVGWQA
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         660       670       680       690       700       710     
pF1KE2 VRTNPANIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREAAPSVAPS
       : : :  ..:.. .: :.::.::..:::::.:.: .: :::: ::  .::. ..: ::: 
CCDS25 VATVPEILNGKTYNATVVGLSPWVEYEFRVVAGNSIGIGEPSEPSELLRTKASVPVVAPV
         650       660       670       680       690       700     

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pF1KE2 GLSGGGGAPGELIVNWTPMSREYQNGDGFGYLLSFRRQGSTHWQTARVPGADAQYFVYSN
       .. ::::. .::...:  . .: :::.::::.. ::  ::: :.  .: ..... ::: :
CCDS25 NIHGGGGSRSELVITWESIPEELQNGEGFGYIIMFRPVGSTTWSKEKVSSVESSRFVYRN
         710       720       730       740       750       760     

         780       790       800       810       820       830     
pF1KE2 ESVRPYTPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSEMNVTWEP
       ::. : .:::::.  :: .:.:  : ...:::.:.::..::  .  .. :.:::.:.:. 
CCDS25 ESIIPLSPFEVKVGVYNNEGEGSLSTVTIVYSGEDEPQLAPRGTSLQSFSASEMEVSWNA
         770       780       790       800       810       820     

         840        850       860       870       880       890    
pF1KE2 VQQDMN-GILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTVRAYNRA
       .  . : : .::::. ::   .::.   ..:..:  :.  ..::. :: : ..::::: :
CCDS25 IAWNRNTGRVLGYEVLYWTDDSKESMIGKIRVSGNVTTKNITGLKANTIYFASVRAYNTA
         830       840       850       860       870       880     

          900       910       920       930       940       950    
pF1KE2 GTGPASPSANATTMKPPPRRPPGNISWTFSSSSLSIKWDPVVPFRNESAVTGYKMLY---
       ::::.:: .:.:: : :: .::.::.: ...:.: ..:. :  ..::: : :::.::   
CCDS25 GTGPSSPPVNVTTKKSPPSQPPANIAWKLTNSKLCLNWEHVKTMENESEVLGYKILYRQN
         890       900       910       920       930       940     

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pF1KE2 -QNDLHLTPTLHLTGKNWIEIPVPEDIGHALVQIRTTGPGGDGIPAE-VHIVRNGGTSMM
        :.  :.  : . ...  . .:  ::    :..:::.. ::::  .: ..: .   .:. 
CCDS25 RQSKTHILETNNTSAE--LLVPFEEDY---LIEIRTVSDGGDGSSSEEIRIPKM--SSLS
         950       960         970          980       990          

    1010       1020         1030      1040
pF1KE2 VENMA-VRPAPHPGT---VISHSVAMLILIGSLEL
        ...  ..:. :  .   :: :  :.  ::     
CCDS25 SRGIQFLEPSTHFLSIVIVIFHCFAIQPLI     
     1000      1010      1020             

>>CCDS58168.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11             (911 aa)
 initn: 2739 init1: 1875 opt: 2653  Z-score: 1776.8  bits: 340.2 E(32554): 1.2e-92
Smith-Waterman score: 2653; 45.7% identity (75.8% similar) in 818 aa overlap (35-849:97-911)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KE2 TRRKPHLLLVAAVALVSSSAWSSALGSQTTFGPVFEDQPLSVLFPEESTEEQVLLACRAR
                                     .:::: ..: ...:: .: :..: : :..:
CCDS58 PSWLGAAQNYYSPINLYHSSDAFKQDESVDYGPVFVQEPDDIIFPTDSDEKKVALNCEVR
         70        80        90       100       110       120      

           70        80        90       100       110       120    
pF1KE2 ASPPATYRWKMNGTEMKLEPGSRHQLVGGNLVIMNPTKAQDAGVYQCLASNPVGTVVSRE
       ..:  .:::  ::::. ::   :..:. :...: ::..:.:.: :::::.: ::...:::
CCDS58 GNPVPSYRWLRNGTEIDLESDYRYSLIDGTFIISNPSEAKDSGHYQCLATNTVGSILSRE
        130       140       150       160       170       180      

          130       140       150       160       170       180    
pF1KE2 AILRFGFLQEFSKEERDPVKTHEGWGVMLPCNPPAHYPGLSYRWLLNEFPNFIPTDGRHF
       : :.:..: .:: . :. :...:: ::.: :.:: : : . : :..::::.:.  :.:.:
CCDS58 ATLQFAYLGNFSGRTRSAVSVREGQGVVLMCSPPPHSPEIIYSWVFNEFPSFVAEDSRRF
        190       200       210       220       230       240      

          190       200       210       220       230        240   
pF1KE2 VSQTTGNLYIARTNASDLGNYSCLATSHMDFSTKSVFSKFAQLNLAAEDTR-LFAPSIKA
       .:: ::::::.....::.:.: ::. . .  ..  :.:  . :.:  . .   . :.:..
CCDS58 ISQETGNLYISKVQTSDVGSYICLVKNTV--TNARVLSPPTPLTLRNDGVMGEYEPKIEV
        250       260       270         280       290       300    

           250       260       270       280         290       300 
pF1KE2 RFPAETYALVGQQVTLECFAFGNPVPRIKWRKVDGSLSPQ--WTTAEPTLQIPSVSFEDE
       .::  . :  :  : .::::.::::: : : ::.: .  .     .. .:.::.:...: 
CCDS58 HFPFTVTAAKGTTVKMECFALGNPVPTITWMKVNGYIPSKARLRKSQAVLEIPNVQLDDA
          310       320       330       340       350       360    

             310       320       330       340       350       360 
pF1KE2 GTYECEAENSKGRDTVQGRIIVQAQPEWLKVISDTEADIGSNLRWGCAAAGKPRPTVRWL
       : :::.::::.:... .:.. : . :.:.. ..::. : :: ::: : :.:::::: :::
CCDS58 GIYECRAENSRGKNSFRGQLQVYTYPHWVEKLNDTQLDSGSPLRWECKATGKPRPTYRWL
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pF1KE2 RNGELLASQNRVEVLAGDLRFSKLSLEDSGMYQCVAENKHGTIYASAELAVQALAPDFRL
       .::  :. :.:::.. : : . ...  :.:::::.::::.:.::::::: . : :: : :
CCDS58 KNGVPLSPQSRVEMVNGVLMIHNVNQSDAGMYQCLAENKYGAIYASAELKILASAPTFAL
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pF1KE2 NPVRRLIPAARGGEILIPCQPRAAPKAVVLWSKGTEILVNSSRVTVTPDGTLIIRNISRS
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CCDS58 NQLKKTIIVTKDQEVVIECKPQGSPKPTISWKKGDRAVRENKRIAILPDGSLRILNASKS
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pF1KE2 DEGKYTCFAENFMGKANSTGILSVRDATKITLAPSSADINLGDNLTLQCHASHDPTMDLT
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CCDS58 DEGKYVCRGENVFGSAEIIASLSVKEPTRIELTPKRTELTVGESIVLNCKAIHDASLDVT
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pF1KE2 FTWTLDDFPIDFDKPGGHYRRTNVKETIGDLTILNAQLRHGGKYTCMAQTVVDSASKEAT
       : :::   ::::.. :::..   .. . .:: : :  : :.:.: : .::..::.: :: 
CCDS58 FYWTLKGQPIDFEEEGGHFESIRAQASSADLMIRNILLMHAGRYGCRVQTTADSVSDEAE
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pF1KE2 VLVRGPPGPPGGVVVRDIGDTTIQLSWSRGFDNHSPIAKYTLQARTPPAGKWKQVRTNPA
       .:::::::::: :.:..: ..:  :::: . ::::::..:.::::.: .  :. :.: : 
CCDS58 LLVRGPPGPPGIVIVEEITESTATLSWSPAADNHSPISSYNLQARSPFSLGWQTVKTVPE
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pF1KE2 NIEGNAETAQVLGLTPWMDYEFRVIASNILGTGEPSGPSSKIRTREAAPSVAPSGLSGGG
        : :. :.:... :.::..:::::.:.: .:::.:: ::  ::: ::.:..::...:: .
CCDS58 IITGDMESAMAVDLNPWVEYEFRVVATNPIGTGDPSTPSRMIRTNEAVPKTAPTNVSGRS
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pF1KE2 GAPGELIVNWTPMSREYQNGDGFGYLLSFRRQGSTHWQTARVPGADAQYFVYSNESVRPY
       :   ::.. : :.:.:.:::.::::...:: .:.  :.   : ...:. :.: .::: : 
CCDS58 GRRHELVIAWEPVSEEFQNGEGFGYIVAFRPNGTRGWKEKMVTSSEASKFIYRDESVPPL
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pF1KE2 TPFEVKIRSYNRRGDGPESLTALVYSAEEEPRVAPTKVWAKGVSSSEMNVTWEPVQQDMN
       ::::::.  :: .:::: :  ... ::: :: .::: : : .:: ::. :.:. ..... 
CCDS58 TPFEVKVGVYNNKGDGPFSQIVVICSAEGEPSAAPTDVKATSVSVSEILVAWKHIKESL-
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pF1KE2 GILLGYEIRYWKAGDKEAAADRVRTAGLDTSARVSGLHPNTKYHVTVRAYNRAGTGPASP
       :   :.:.                                                    
CCDS58 GRPQGFEV                                                    
           910                                                     

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CCDS25                            MEENVFWECKANGRPKPTYKWLKNGEPLLTRDR
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CCDS25 AVTIDEITDTTAQLSWRPGPDNHSPITMYVIQARTPFSVGWQAVSTVPELIDGKTFTATV
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CCDS25 VGLNPWVEYEFRTVAANVIGIGEPSRPSEKRRTEEALPEVTPANVSGGGGSKSELVITWE
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CCDS25 NKGEGPFSPTTVVYSAEEEPTKPPASIFARSLSATDIEVFWASPLEKNRGRIQGYEVKYW
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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