Result of FASTA (ccds) for pF1KSDB0025
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDB0025, 564 aa
  1>>>pF1KSDB0025 564 - 564 aa - 564 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6847+/-0.00106; mu= 16.1780+/- 0.063
 mean_var=65.7805+/-13.139, 0's: 0 Z-trim(102.7): 18  B-trim: 138 in 1/50
 Lambda= 0.158134
 statistics sampled from 7078 (7091) to 7078 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.582), E-opt: 0.2 (0.218), width:  16
 Scan time:  3.190

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1730.1 DPYSL5 gene_id:56896|Hs108|chr2         ( 564) 3751 865.2       0
CCDS6302.1 DPYS gene_id:1807|Hs108|chr8            ( 519) 2002 466.1 4.6e-131
CCDS33950.1 CRMP1 gene_id:1400|Hs108|chr4          ( 686) 1979 460.9 2.2e-129
CCDS75102.1 CRMP1 gene_id:1400|Hs108|chr4          ( 570) 1973 459.5 4.9e-129
CCDS43207.1 CRMP1 gene_id:1400|Hs108|chr4          ( 572) 1973 459.5 4.9e-129
CCDS83268.1 DPYSL2 gene_id:1808|Hs108|chr8         ( 677) 1973 459.5 5.7e-129
CCDS6051.1 DPYSL2 gene_id:1808|Hs108|chr8          ( 572) 1967 458.2 1.3e-128
CCDS43381.1 DPYSL3 gene_id:1809|Hs108|chr5         ( 570) 1936 451.1 1.7e-126
CCDS56387.1 DPYSL3 gene_id:1809|Hs108|chr5         ( 684) 1936 451.1  2e-126
CCDS7665.1 DPYSL4 gene_id:10570|Hs108|chr10        ( 572) 1894 441.5 1.3e-123
CCDS59096.1 DPYSL2 gene_id:1808|Hs108|chr8         ( 536) 1866 435.1  1e-121


>>CCDS1730.1 DPYSL5 gene_id:56896|Hs108|chr2              (564 aa)
 initn: 3751 init1: 3751 opt: 3751  Z-score: 4622.4  bits: 865.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3751; 100.0% identity (100.0% similar) in 564 aa overlap (1-564:1-564)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MLANSASVRILIKGGKVVNDDCTHEADVYIENGIIQQVGRELMIPGGAKVIDATGKLVIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 MLANSASVRILIKGGKVVNDDCTHEADVYIENGIIQQVGRELMIPGGAKVIDATGKLVIP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD GGIDTSTHFHQTFMNATCVDDFYHGTKAALVGGTTMIIGHVLPDKETSLVDAYEKCRGLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 GGIDTSTHFHQTFMNATCVDDFYHGTKAALVGGTTMIIGHVLPDKETSLVDAYEKCRGLA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD DPKVCCDYALHVGITWWAPKVKAEMETLVREKGVNSFQMFMTYKDLYMLRDSELYQVLHA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 DPKVCCDYALHVGITWWAPKVKAEMETLVREKGVNSFQMFMTYKDLYMLRDSELYQVLHA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD CKDIGAIARVHAENGELVAEGAKEALDLGITGPEGIEISRPEELEAEATHRVITIANRTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 CKDIGAIARVHAENGELVAEGAKEALDLGITGPEGIEISRPEELEAEATHRVITIANRTH
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD CPIYLVNVSSISAGDVIAAAKMQGKVVLAETTTAHATLTGLHYYHQDWSHAAAYVTVPPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 CPIYLVNVSSISAGDVIAAAKMQGKVVLAETTTAHATLTGLHYYHQDWSHAAAYVTVPPL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD RLDTNTSTYLMSLLANDTLNIVASDHRPFTTKQKAMGKEDFTKIPHGVSGVQDRMSVIWE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 RLDTNTSTYLMSLLANDTLNIVASDHRPFTTKQKAMGKEDFTKIPHGVSGVQDRMSVIWE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD RGVVGGKMDENRFVAVTSSNAAKLLNLYPRKGRIIPGADADVVVWDPEATKTISASTQVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 RGVVGGKMDENRFVAVTSSNAAKLLNLYPRKGRIIPGADADVVVWDPEATKTISASTQVQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD GGDFNLYENMRCHGVPLVTISRGRVVYENGVFMCAEGTGKFCPLRSFPDTVYKKLVQREK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 GGDFNLYENMRCHGVPLVTISRGRVVYENGVFMCAEGTGKFCPLRSFPDTVYKKLVQREK
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD TLKVRGVDRTPYLGDVAVVVHPGKKEMGTPLADTPTRPVTRHGGMRDLHESSFSLSGSQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 TLKVRGVDRTPYLGDVAVVVHPGKKEMGTPLADTPTRPVTRHGGMRDLHESSFSLSGSQI
              490       500       510       520       530       540

              550       560    
pF1KSD DDHVPKRASARILAPPGGRSSGIW
       ::::::::::::::::::::::::
CCDS17 DDHVPKRASARILAPPGGRSSGIW
              550       560    

>>CCDS6302.1 DPYS gene_id:1807|Hs108|chr8                 (519 aa)
 initn: 1868 init1: 1868 opt: 2002  Z-score: 2466.5  bits: 466.1 E(32554): 4.6e-131
Smith-Waterman score: 2002; 57.5% identity (80.9% similar) in 518 aa overlap (5-518:2-519)

               10        20        30        40            50      
pF1KSD MLANSASVRILIKGGKVVNDDCTHEADVYIENGIIQQVGRELMIPGGA----KVIDATGK
           .:  :.::.::.::::: .. ::: .:.:... .:..:. ::::    .:.::.::
CCDS63    MAAPSRLLIRGGRVVNDDFSEVADVLVEDGVVRALGHDLLPPGGAPAGLRVLDAAGK
                  10        20        30        40        50       

         60        70        80        90       100       110      
pF1KSD LVIPGGIDTSTHFHQTFMNATCVDDFYHGTKAALVGGTTMIIGHVLPDKETSLVDAYEKC
       ::.:::::: ::..  ::..  .:::..:::::: :::::::  ..:.:  ::..:.:  
CCDS63 LVLPGGIDTHTHMQFPFMGSRSIDDFHQGTKAALSGGTTMIIDFAIPQKGGSLIEAFETW
        60        70        80        90       100       110       

        120       130       140       150       160       170      
pF1KSD RGLADPKVCCDYALHVGITWWAPKVKAEMETLVREKGVNSFQMFMTYKDLYMLRDSELYQ
       :. :::::::::.:::..:::. .:: ::. ::..::::::.:::.::::::. : :::.
CCDS63 RSWADPKVCCDYSLHVAVTWWSDQVKEEMKILVQDKGVNSFKMFMAYKDLYMVTDLELYE
       120       130       140       150       160       170       

        180       190       200       210       220       230      
pF1KSD VLHACKDIGAIARVHAENGELVAEGAKEALDLGITGPEGIEISRPEELEAEATHRVITIA
       ..  ::.:::::.::::::.:.:::::. : :::::::: :. ::: .::::: :.::::
CCDS63 AFSRCKEIGAIAQVHAENGDLIAEGAKKMLALGITGPEGHELCRPEAVEAEATLRAITIA
       180       190       200       210       220       230       

        240       250       260       270       280       290      
pF1KSD NRTHCPIYLVNVSSISAGDVIAAAKMQGKVVLAETTTAHATLTGLHYYHQDWSHAAAYVT
       . ..::.:.:.: : ::. ::: :. .:::: .:  .:     : ::....: ::: .: 
CCDS63 SAVNCPLYIVHVMSKSAAKVIADARRDGKVVYGEPIAASLGTDGTHYWNKEWHHAAHHVM
       240       250       260       270       280       290       

        300       310       320       330       340       350      
pF1KSD VPPLRLDTNTSTYLMSLLANDTLNIVASDHRPFTTKQKAMGKEDFTKIPHGVSGVQDRMS
        :::: : .:  .::.::::: :. ...:.  :.: :::.::.::::::.::.::.::::
CCDS63 GPPLRPDPSTPDFLMNLLANDDLTTTGTDNCTFNTCQKALGKDDFTKIPNGVNGVEDRMS
       300       310       320       330       340       350       

        360       370       380       390       400       410      
pF1KSD VIWERGVVGGKMDENRFVAVTSSNAAKLLNLYPRKGRIIPGADADVVVWDPEATKTISAS
       ::::.:: .:::::::::::::.::::..:::::::::  :.:::.:.:::..:.::::.
CCDS63 VIWEKGVHSGKMDENRFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADIVIWDPKGTRTISAK
       360       370       380       390       400       410       

        420       430       440       450       460       470      
pF1KSD TQVQGGDFNLYENMRCHGVPLVTISRGRVVYENGVFMCAEGTGKFCPLRSFPDTVYKKLV
       :. :. .::..:.: ::::::::::::.:::: :::  . : ::: : . : . .::.. 
CCDS63 THHQAVNFNIFEGMVCHGVPLVTISRGKVVYEAGVFSVTAGDGKFIPRKPFAEYIYKRIK
       420       430       440       450       460       470       

        480       490       500       510       520       530      
pF1KSD QREKTLKVRGVDRTPYLGDVAVVVHPGKKEMGTPLADTPTRPVTRHGGMRDLHESSFSLS
       ::..:     :.:.:: :.::..     :: .:  .   ..:                  
CCDS63 QRDRTCTPTPVERAPYKGEVATLKSRVTKEDATAGTRKQAHP                  
       480       490       500       510                           

        540       550       560    
pF1KSD GSQIDDHVPKRASARILAPPGGRSSGIW

>>CCDS33950.1 CRMP1 gene_id:1400|Hs108|chr4               (686 aa)
 initn: 1925 init1: 1773 opt: 1979  Z-score: 2436.2  bits: 460.9 E(32554): 2.2e-129
Smith-Waterman score: 1979; 50.9% identity (81.1% similar) in 560 aa overlap (4-561:125-681)

                                          10        20        30   
pF1KSD                            MLANSASVRILIKGGKVVNDDCTHEADVYIENG
                                     :. : :.:::::...::: .  ::::.:.:
CCDS33 AVSSPGERDERPPTLRIRRPAPRDLPLGRDNGQSDRLLIKGGRIINDDQSLYADVYLEDG
          100       110       120       130       140       150    

            40        50        60        70        80        90   
pF1KSD IIQQVGRELMIPGGAKVIDATGKLVIPGGIDTSTHFHQTFMNATCVDDFYHGTKAALVGG
       .:.:.:..:..:::.:.:.:.:..:::::::..:....  .. : .:::..::.::::::
CCDS33 LIKQIGENLIVPGGVKTIEANGRMVIPGGIDVNTYLQKPSQGMTAADDFFQGTRAALVGG
          160       170       180       190       200       210    

           100       110       120       130       140       150   
pF1KSD TTMIIGHVLPDKETSLVDAYEKCRGLADPKVCCDYALHVGITWWAPKVKAEMETLVREKG
       ::::: ::.:.  .::. ..:: .  :: : ::::.::: :: :   :. :.:.::..::
CCDS33 TTMIIDHVVPEPGSSLLTSFEKWHEAADTKSCCDYSLHVDITSWYDGVREELEVLVQDKG
          220       230       240       250       260       270    

           160       170       180       190       200       210   
pF1KSD VNSFQMFMTYKDLYMLRDSELYQVLHACKDIGAIARVHAENGELVAEGAKEALDLGITGP
       :::::..:.:::.:.. ::.::...   : .::.  ::::::.:.:.  :. :..:::::
CCDS33 VNSFQVYMAYKDVYQMSDSQLYEAFTFLKGLGAVILVHAENGDLIAQEQKRILEMGITGP
          280       290       300       310       320       330    

           220       230       240       250       260       270   
pF1KSD EGIEISRPEELEAEATHRVITIANRTHCPIYLVNVSSISAGDVIAAAKMQGKVVLAETTT
       ::  .::::::::::. :.::::.: .::.:...: : ::.:.:: :. .: .:..:  .
CCDS33 EGHALSRPEELEAEAVFRAITIAGRINCPVYITKVMSKSAADIIALARKKGPLVFGEPIA
          340       350       360       370       380       390    

           280       290       300       310       320       330   
pF1KSD AHATLTGLHYYHQDWSHAAAYVTVPPLRLDTNTSTYLMSLLANDTLNIVASDHRPFTTKQ
       :     : ::. ..:..:::.:: :::  : .:  :: ::::   :....: : :..: :
CCDS33 ASLGTDGTHYWSKNWAKAAAFVTSPPLSPDPTTPDYLTSLLACGDLQVTGSGHCPYSTAQ
          400       410       420       430       440       450    

           340       350       360       370       380       390   
pF1KSD KAMGKEDFTKIPHGVSGVQDRMSVIWERGVVGGKMDENRFVAVTSSNAAKLLNLYPRKGR
       ::.::..:: ::.::.:...::.:.:...:. ::::::.::::::.::::..::::::::
CCDS33 KAVGKDNFTLIPEGVNGIEERMTVVWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGR
          460       470       480       490       500       510    

           400       410       420       430       440       450   
pF1KSD IIPGADADVVVWDPEATKTISASTQVQGGDFNLYENMRCHGVPLVTISRGRVVYENGVFM
       :  :.:::::.:::.  :::.:... .. ..:..:.:.::: :::.::.:..:.:.: . 
CCDS33 IAVGSDADVVIWDPDKLKTITAKSHKSAVEYNIFEGMECHGSPLVVISQGKIVFEDGNIN
          520       530       540       550       560       570    

           460       470       480       490       500       510   
pF1KSD CAEGTGKFCPLRSFPDTVYKKLVQREKTLKVRGVDRTPYLGDVAVVVHPGKKEMGTPLAD
         .: :.: : ..::. .:...  :.:.. ..::.:  : : :  :  :.  ...::  .
CCDS33 VNKGMGRFIPRKAFPEHLYQRVKIRNKVFGLQGVSRGMYDGPVYEV--PATPKYATPAPS
          580       590       600       610       620         630  

           520         530       540       550       560      
pF1KSD TPTRPVTRHGG--MRDLHESSFSLSGSQIDDHVPKRASARILAPPGGRSSGIW  
       . . : ..:    .:.::.:.:::::.::::. :.:.. ::.:::::::.     
CCDS33 AKSSP-SKHQPPPIRNLHQSNFSLSGAQIDDNNPRRTGHRIVAPPGGRSNITSLG
             640       650       660       670       680      

>>CCDS75102.1 CRMP1 gene_id:1400|Hs108|chr4               (570 aa)
 initn: 1925 init1: 1773 opt: 1973  Z-score: 2430.1  bits: 459.5 E(32554): 4.9e-129
Smith-Waterman score: 1973; 51.0% identity (81.1% similar) in 557 aa overlap (7-561:12-565)

                    10        20        30        40        50     
pF1KSD      MLANSASVRILIKGGKVVNDDCTHEADVYIENGIIQQVGRELMIPGGAKVIDATG
                  : :.:::::...::: .  ::::.:.:.:.:.:..:..:::.:.:.:.:
CCDS75 MQKMNNEVVDKSDRLLIKGGRIINDDQSLYADVYLEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEANG
               10        20        30        40        50        60

          60        70        80        90       100       110     
pF1KSD KLVIPGGIDTSTHFHQTFMNATCVDDFYHGTKAALVGGTTMIIGHVLPDKETSLVDAYEK
       ..:::::::..:....  .. : .:::..::.::::::::::: ::.:.  .::. ..::
CCDS75 RMVIPGGIDVNTYLQKPSQGMTAADDFFQGTRAALVGGTTMIIDHVVPEPGSSLLTSFEK
               70        80        90       100       110       120

         120       130       140       150       160       170     
pF1KSD CRGLADPKVCCDYALHVGITWWAPKVKAEMETLVREKGVNSFQMFMTYKDLYMLRDSELY
        .  :: : ::::.::: :: :   :. :.:.::..:::::::..:.:::.:.. ::.::
CCDS75 WHEAADTKSCCDYSLHVDITSWYDGVREELEVLVQDKGVNSFQVYMAYKDVYQMSDSQLY
              130       140       150       160       170       180

         180       190       200       210       220       230     
pF1KSD QVLHACKDIGAIARVHAENGELVAEGAKEALDLGITGPEGIEISRPEELEAEATHRVITI
       ...   : .::.  ::::::.:.:.  :. :..:::::::  .::::::::::. :.:::
CCDS75 EAFTFLKGLGAVILVHAENGDLIAQEQKRILEMGITGPEGHALSRPEELEAEAVFRAITI
              190       200       210       220       230       240

         240       250       260       270       280       290     
pF1KSD ANRTHCPIYLVNVSSISAGDVIAAAKMQGKVVLAETTTAHATLTGLHYYHQDWSHAAAYV
       :.: .::.:...: : ::.:.:: :. .: .:..:  .:     : ::. ..:..:::.:
CCDS75 AGRINCPVYITKVMSKSAADIIALARKKGPLVFGEPIAASLGTDGTHYWSKNWAKAAAFV
              250       260       270       280       290       300

         300       310       320       330       340       350     
pF1KSD TVPPLRLDTNTSTYLMSLLANDTLNIVASDHRPFTTKQKAMGKEDFTKIPHGVSGVQDRM
       : :::  : .:  :: ::::   :....: : :..: :::.::..:: ::.::.:...::
CCDS75 TSPPLSPDPTTPDYLTSLLACGDLQVTGSGHCPYSTAQKAVGKDNFTLIPEGVNGIEERM
              310       320       330       340       350       360

         360       370       380       390       400       410     
pF1KSD SVIWERGVVGGKMDENRFVAVTSSNAAKLLNLYPRKGRIIPGADADVVVWDPEATKTISA
       .:.:...:. ::::::.::::::.::::..:::::::::  :.:::::.:::.  :::.:
CCDS75 TVVWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADVVIWDPDKLKTITA
              370       380       390       400       410       420

         420       430       440       450       460       470     
pF1KSD STQVQGGDFNLYENMRCHGVPLVTISRGRVVYENGVFMCAEGTGKFCPLRSFPDTVYKKL
       ... .. ..:..:.:.::: :::.::.:..:.:.: .   .: :.: : ..::. .:...
CCDS75 KSHKSAVEYNIFEGMECHGSPLVVISQGKIVFEDGNINVNKGMGRFIPRKAFPEHLYQRV
              430       440       450       460       470       480

         480       490       500       510       520         530   
pF1KSD VQREKTLKVRGVDRTPYLGDVAVVVHPGKKEMGTPLADTPTRPVTRHGG--MRDLHESSF
         :.:.. ..::.:  : : :  :  :.  ...::  .. . : ..:    .:.::.:.:
CCDS75 KIRNKVFGLQGVSRGMYDGPVYEV--PATPKYATPAPSAKSSP-SKHQPPPIRNLHQSNF
              490       500         510       520        530       

           540       550       560      
pF1KSD SLSGSQIDDHVPKRASARILAPPGGRSSGIW  
       ::::.::::. :.:.. ::.:::::::.     
CCDS75 SLSGAQIDDNNPRRTGHRIVAPPGGRSNITSLG
       540       550       560       570

>>CCDS43207.1 CRMP1 gene_id:1400|Hs108|chr4               (572 aa)
 initn: 1925 init1: 1773 opt: 1973  Z-score: 2430.1  bits: 459.5 E(32554): 4.9e-129
Smith-Waterman score: 1973; 51.0% identity (81.1% similar) in 557 aa overlap (7-561:14-567)

                      10        20        30        40        50   
pF1KSD        MLANSASVRILIKGGKVVNDDCTHEADVYIENGIIQQVGRELMIPGGAKVIDA
                    : :.:::::...::: .  ::::.:.:.:.:.:..:..:::.:.:.:
CCDS43 MSYQGKKSIPHITSDRLLIKGGRIINDDQSLYADVYLEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEA
               10        20        30        40        50        60

            60        70        80        90       100       110   
pF1KSD TGKLVIPGGIDTSTHFHQTFMNATCVDDFYHGTKAALVGGTTMIIGHVLPDKETSLVDAY
       .:..:::::::..:....  .. : .:::..::.::::::::::: ::.:.  .::. ..
CCDS43 NGRMVIPGGIDVNTYLQKPSQGMTAADDFFQGTRAALVGGTTMIIDHVVPEPGSSLLTSF
               70        80        90       100       110       120

           120       130       140       150       160       170   
pF1KSD EKCRGLADPKVCCDYALHVGITWWAPKVKAEMETLVREKGVNSFQMFMTYKDLYMLRDSE
       :: .  :: : ::::.::: :: :   :. :.:.::..:::::::..:.:::.:.. ::.
CCDS43 EKWHEAADTKSCCDYSLHVDITSWYDGVREELEVLVQDKGVNSFQVYMAYKDVYQMSDSQ
              130       140       150       160       170       180

           180       190       200       210       220       230   
pF1KSD LYQVLHACKDIGAIARVHAENGELVAEGAKEALDLGITGPEGIEISRPEELEAEATHRVI
       ::...   : .::.  ::::::.:.:.  :. :..:::::::  .::::::::::. :.:
CCDS43 LYEAFTFLKGLGAVILVHAENGDLIAQEQKRILEMGITGPEGHALSRPEELEAEAVFRAI
              190       200       210       220       230       240

           240       250       260       270       280       290   
pF1KSD TIANRTHCPIYLVNVSSISAGDVIAAAKMQGKVVLAETTTAHATLTGLHYYHQDWSHAAA
       :::.: .::.:...: : ::.:.:: :. .: .:..:  .:     : ::. ..:..:::
CCDS43 TIAGRINCPVYITKVMSKSAADIIALARKKGPLVFGEPIAASLGTDGTHYWSKNWAKAAA
              250       260       270       280       290       300

           300       310       320       330       340       350   
pF1KSD YVTVPPLRLDTNTSTYLMSLLANDTLNIVASDHRPFTTKQKAMGKEDFTKIPHGVSGVQD
       .:: :::  : .:  :: ::::   :....: : :..: :::.::..:: ::.::.:...
CCDS43 FVTSPPLSPDPTTPDYLTSLLACGDLQVTGSGHCPYSTAQKAVGKDNFTLIPEGVNGIEE
              310       320       330       340       350       360

           360       370       380       390       400       410   
pF1KSD RMSVIWERGVVGGKMDENRFVAVTSSNAAKLLNLYPRKGRIIPGADADVVVWDPEATKTI
       ::.:.:...:. ::::::.::::::.::::..:::::::::  :.:::::.:::.  :::
CCDS43 RMTVVWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADVVIWDPDKLKTI
              370       380       390       400       410       420

           420       430       440       450       460       470   
pF1KSD SASTQVQGGDFNLYENMRCHGVPLVTISRGRVVYENGVFMCAEGTGKFCPLRSFPDTVYK
       .:... .. ..:..:.:.::: :::.::.:..:.:.: .   .: :.: : ..::. .:.
CCDS43 TAKSHKSAVEYNIFEGMECHGSPLVVISQGKIVFEDGNINVNKGMGRFIPRKAFPEHLYQ
              430       440       450       460       470       480

           480       490       500       510       520         530 
pF1KSD KLVQREKTLKVRGVDRTPYLGDVAVVVHPGKKEMGTPLADTPTRPVTRHGG--MRDLHES
       ..  :.:.. ..::.:  : : :  :  :.  ...::  .. . : ..:    .:.::.:
CCDS43 RVKIRNKVFGLQGVSRGMYDGPVYEV--PATPKYATPAPSAKSSP-SKHQPPPIRNLHQS
              490       500         510       520        530       

             540       550       560      
pF1KSD SFSLSGSQIDDHVPKRASARILAPPGGRSSGIW  
       .:::::.::::. :.:.. ::.:::::::.     
CCDS43 NFSLSGAQIDDNNPRRTGHRIVAPPGGRSNITSLG
       540       550       560       570  

>>CCDS83268.1 DPYSL2 gene_id:1808|Hs108|chr8              (677 aa)
 initn: 1961 init1: 1769 opt: 1973  Z-score: 2428.9  bits: 459.5 E(32554): 5.7e-129
Smith-Waterman score: 1973; 52.0% identity (81.1% similar) in 560 aa overlap (4-561:116-672)

                                          10        20        30   
pF1KSD                            MLANSASVRILIKGGKVVNDDCTHEADVYIENG
                                     :. : :.::::::.:::: .  ::.:.:.:
CCDS83 GRRAGGEPSVESGRKVEIRRASGKEALQNINDQSDRLLIKGGKIVNDDQSFYADIYMEDG
          90       100       110       120       130       140     

            40        50        60        70        80        90   
pF1KSD IIQQVGRELMIPGGAKVIDATGKLVIPGGIDTSTHFHQTFMNATCVDDFYHGTKAALVGG
       .:.:.:..:..:::.:.:.: ...:::::::. :.:..  .. : .:::..::::::.::
CCDS83 LIKQIGENLIVPGGVKTIEAHSRMVIPGGIDVHTRFQMPDQGMTSADDFFQGTKAALAGG
         150       160       170       180       190       200     

           100       110       120       130       140       150   
pF1KSD TTMIIGHVLPDKETSLVDAYEKCRGLADPKVCCDYALHVGITWWAPKVKAEMETLVREKG
       ::::: ::.:.  :::. :... :  :: : ::::.::: :. :   .. :::.::...:
CCDS83 TTMIIDHVVPEPGTSLLAAFDQWREWADSKSCCDYSLHVDISEWHKGIQEEMEALVKDHG
         210       220       230       240       250       260     

           160       170       180       190       200       210   
pF1KSD VNSFQMFMTYKDLYMLRDSELYQVLHACKDIGAIARVHAENGELVAEGAKEALDLGITGP
       :::: ..:..:: ..: : ..:.:: . .::::::.::::::...::  .. ::::::::
CCDS83 VNSFLVYMAFKDRFQLTDCQIYEVLSVIRDIGAIAQVHAENGDIIAEEQQRILDLGITGP
         270       280       290       300       310       320     

           220       230       240       250       260       270   
pF1KSD EGIEISRPEELEAEATHRVITIANRTHCPIYLVNVSSISAGDVIAAAKMQGKVVLAETTT
       ::  .:::::.::::..:.:::::.:.::.:...: : :...::: :. .: :: .:  :
CCDS83 EGHVLSRPEEVEAEAVNRAITIANQTNCPLYITKVMSKSSAEVIAQARKKGTVVYGEPIT
         330       340       350       360       370       380     

           280       290       300       310       320       330   
pF1KSD AHATLTGLHYYHQDWSHAAAYVTVPPLRLDTNTSTYLMSLLANDTLNIVASDHRPFTTKQ
       :     : ::. ..:..:::.:: :::  : .:  .: :::.   :....: :  :.: :
CCDS83 ASLGTDGSHYWSKNWAKAAAFVTSPPLSPDPTTPDFLNSLLSCGDLQVTGSAHCTFNTAQ
         390       400       410       420       430       440     

           340       350       360       370       380       390   
pF1KSD KAMGKEDFTKIPHGVSGVQDRMSVIWERGVVGGKMDENRFVAVTSSNAAKLLNLYPRKGR
       ::.::..:: ::.:..:...::::::...:: ::::::.::::::.::::..::::::::
CCDS83 KAVGKDNFTLIPEGTNGTEERMSVIWDKAVVTGKMDENQFVAVTSTNAAKVFNLYPRKGR
         450       460       470       480       490       500     

           400       410       420       430       440       450   
pF1KSD IIPGADADVVVWDPEATKTISASTQVQGGDFNLYENMRCHGVPLVTISRGRVVYENGVFM
       :  :.:::.:.:::...:::::.:. .. ..:..:.:.:.: :::.::.:..: :.:.. 
CCDS83 IAVGSDADLVIWDPDSVKTISAKTHNSSLEYNIFEGMECRGSPLVVISQGKIVLEDGTLH
         510       520       530       540       550       560     

           460       470       480       490        500       510  
pF1KSD CAEGTGKFCPLRSFPDTVYKKLVQREKTLKVRGVDRTPYLGDVA-VVVHPGKKEMGTPLA
        .::.:.. : . ::: :::..  : .  ..::: :  : : :  : : :   .  :: .
CCDS83 VTEGSGRYIPRKPFPDFVYKRIKARSRLAELRGVPRGLYDGPVCEVSVTP---KTVTPAS
         570       580       590       600       610          620  

            520        530       540       550       560      
pF1KSD DTPTRPVTRHGG-MRDLHESSFSLSGSQIDDHVPKRASARILAPPGGRSSGIW  
       .. : :. ...  .:.::.:.:::::.::::..:.:.. ::.::::::..     
CCDS83 SAKTSPAKQQAPPVRNLHQSGFSLSGAQIDDNIPRRTTQRIVAPPGGRANITSLG
            630       640       650       660       670       

>>CCDS6051.1 DPYSL2 gene_id:1808|Hs108|chr8               (572 aa)
 initn: 1951 init1: 1769 opt: 1967  Z-score: 2422.7  bits: 458.2 E(32554): 1.3e-128
Smith-Waterman score: 1967; 52.1% identity (81.1% similar) in 557 aa overlap (7-561:14-567)

                      10        20        30        40        50   
pF1KSD        MLANSASVRILIKGGKVVNDDCTHEADVYIENGIIQQVGRELMIPGGAKVIDA
                    : :.::::::.:::: .  ::.:.:.:.:.:.:..:..:::.:.:.:
CCDS60 MSYQGKKNIPRITSDRLLIKGGKIVNDDQSFYADIYMEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEA
               10        20        30        40        50        60

            60        70        80        90       100       110   
pF1KSD TGKLVIPGGIDTSTHFHQTFMNATCVDDFYHGTKAALVGGTTMIIGHVLPDKETSLVDAY
        ...:::::::. :.:..  .. : .:::..::::::.::::::: ::.:.  :::. :.
CCDS60 HSRMVIPGGIDVHTRFQMPDQGMTSADDFFQGTKAALAGGTTMIIDHVVPEPGTSLLAAF
               70        80        90       100       110       120

           120       130       140       150       160       170   
pF1KSD EKCRGLADPKVCCDYALHVGITWWAPKVKAEMETLVREKGVNSFQMFMTYKDLYMLRDSE
       .. :  :: : ::::.::: :. :   .. :::.::...::::: ..:..:: ..: : .
CCDS60 DQWREWADSKSCCDYSLHVDISEWHKGIQEEMEALVKDHGVNSFLVYMAFKDRFQLTDCQ
              130       140       150       160       170       180

           180       190       200       210       220       230   
pF1KSD LYQVLHACKDIGAIARVHAENGELVAEGAKEALDLGITGPEGIEISRPEELEAEATHRVI
       .:.:: . .::::::.::::::...::  .. ::::::::::  .:::::.::::..:.:
CCDS60 IYEVLSVIRDIGAIAQVHAENGDIIAEEQQRILDLGITGPEGHVLSRPEEVEAEAVNRAI
              190       200       210       220       230       240

           240       250       260       270       280       290   
pF1KSD TIANRTHCPIYLVNVSSISAGDVIAAAKMQGKVVLAETTTAHATLTGLHYYHQDWSHAAA
       ::::.:.::.:...: : :...::: :. .: :: .:  ::     : ::. ..:..:::
CCDS60 TIANQTNCPLYITKVMSKSSAEVIAQARKKGTVVYGEPITASLGTDGSHYWSKNWAKAAA
              250       260       270       280       290       300

           300       310       320       330       340       350   
pF1KSD YVTVPPLRLDTNTSTYLMSLLANDTLNIVASDHRPFTTKQKAMGKEDFTKIPHGVSGVQD
       .:: :::  : .:  .: :::.   :....: :  :.: :::.::..:: ::.:..:...
CCDS60 FVTSPPLSPDPTTPDFLNSLLSCGDLQVTGSAHCTFNTAQKAVGKDNFTLIPEGTNGTEE
              310       320       330       340       350       360

           360       370       380       390       400       410   
pF1KSD RMSVIWERGVVGGKMDENRFVAVTSSNAAKLLNLYPRKGRIIPGADADVVVWDPEATKTI
       ::::::...:: ::::::.::::::.::::..:::::::::  :.:::.:.:::...:::
CCDS60 RMSVIWDKAVVTGKMDENQFVAVTSTNAAKVFNLYPRKGRIAVGSDADLVIWDPDSVKTI
              370       380       390       400       410       420

           420       430       440       450       460       470   
pF1KSD SASTQVQGGDFNLYENMRCHGVPLVTISRGRVVYENGVFMCAEGTGKFCPLRSFPDTVYK
       ::.:. .. ..:..:.:.:.: :::.::.:..: :.:..  .::.:.. : . ::: :::
CCDS60 SAKTHNSSLEYNIFEGMECRGSPLVVISQGKIVLEDGTLHVTEGSGRYIPRKPFPDFVYK
              430       440       450       460       470       480

           480       490        500       510       520        530 
pF1KSD KLVQREKTLKVRGVDRTPYLGDVA-VVVHPGKKEMGTPLADTPTRPVTRHGG-MRDLHES
       ..  : .  ..::: :  : : :  : : :   .  :: ... : :. ...  .:.::.:
CCDS60 RIKARSRLAELRGVPRGLYDGPVCEVSVTP---KTVTPASSAKTSPAKQQAPPVRNLHQS
              490       500       510          520       530       

             540       550       560      
pF1KSD SFSLSGSQIDDHVPKRASARILAPPGGRSSGIW  
       .:::::.::::..:.:.. ::.::::::..     
CCDS60 GFSLSGAQIDDNIPRRTTQRIVAPPGGRANITSLG
       540       550       560       570  

>>CCDS43381.1 DPYSL3 gene_id:1809|Hs108|chr5              (570 aa)
 initn: 1916 init1: 1761 opt: 1936  Z-score: 2384.5  bits: 451.1 E(32554): 1.7e-126
Smith-Waterman score: 1936; 51.6% identity (80.5% similar) in 558 aa overlap (7-561:14-565)

                      10        20        30        40        50   
pF1KSD        MLANSASVRILIKGGKVVNDDCTHEADVYIENGIIQQVGRELMIPGGAKVIDA
                    : :.:::::..:::: .  ::.:.:.:.:.:.: .:..:::.:.:.:
CCDS43 MSYQGKKNIPRITSDRLLIKGGRIVNDDQSFYADIYMEDGLIKQIGDNLIVPGGVKTIEA
               10        20        30        40        50        60

            60        70        80        90       100       110   
pF1KSD TGKLVIPGGIDTSTHFHQTFMNATCVDDFYHGTKAALVGGTTMIIGHVLPDKETSLVDAY
       .::.:::::::. :::.. . . : ::::..::::::.::::::: ::.:. :.::..::
CCDS43 NGKMVIPGGIDVHTHFQMPYKGMTTVDDFFQGTKAALAGGTTMIIDHVVPEPESSLTEAY
               70        80        90       100       110       120

           120       130       140       150       160       170   
pF1KSD EKCRGLADPKVCCDYALHVGITWWAPKVKAEMETLVREKGVNSFQMFMTYKDLYMLRDSE
       :: :  :: : :::::::: :: :  .:: :...:...::::::...:.:::::.. ..:
CCDS43 EKWREWADGKSCCDYALHVDITHWNDSVKQEVQNLIKDKGVNSFMVYMAYKDLYQVSNTE
              130       140       150       160       170       180

           180       190       200       210       220       230   
pF1KSD LYQVLHACKDIGAIARVHAENGELVAEGAKEALDLGITGPEGIEISRPEELEAEATHRVI
       ::...    ..::::.::::::...:.   . :..:::::::  .::::::::::. :.:
CCDS43 LYEIFTCLGELGAIAQVHAENGDIIAQEQTRMLEMGITGPEGHVLSRPEELEAEAVFRAI
              190       200       210       220       230       240

           240       250       260       270       280       290   
pF1KSD TIANRTHCPIYLVNVSSISAGDVIAAAKMQGKVVLAETTTAHATLTGLHYYHQDWSHAAA
       :::..:.::.:...: : ::.:.:. :. .:.::..:  ::   . : ::. ..:..:::
CCDS43 TIASQTNCPLYVTKVMSKSAADLISQARKKGNVVFGEPITASLGIDGTHYWSKNWAKAAA
              250       260       270       280       290       300

           300       310       320       330       340       350   
pF1KSD YVTVPPLRLDTNTSTYLMSLLANDTLNIVASDHRPFTTKQKAMGKEDFTKIPHGVSGVQD
       .:: :::  : .:  :. ::::.  :.. .: :  :.: :::.::..:: ::.:..::..
CCDS43 FVTSPPLSPDPTTPDYINSLLASGDLQLSGSAHCTFSTAQKAIGKDNFTAIPEGTNGVEE
              310       320       330       340       350       360

           360       370       380       390       400       410   
pF1KSD RMSVIWERGVVGGKMDENRFVAVTSSNAAKLLNLYPRKGRIIPGADADVVVWDPEATKTI
       ::::::...:. ::::::.::::::.::::..:::::::::  :.:.:.:.:::.:.: .
CCDS43 RMSVIWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRISVGSDSDLVIWDPDAVKIV
              370       380       390       400       410       420

           420       430       440       450       460       470   
pF1KSD SASTQVQGGDFNLYENMRCHGVPLVTISRGRVVYENGVFMCAEGTGKFCPLRSFPDTVYK
       ::... .....:..:.:. .:.:::.: .:... :.: .  ..:.:.: :   : : :::
CCDS43 SAKNHQSAAEYNIFEGMELRGAPLVVICQGKIMLEDGNLHVTQGAGRFIPCSPFSDYVYK
              430       440       450       460       470       480

           480       490       500       510          520       530
pF1KSD KLVQREKTLKVRGVDRTPYLGDVAVVVHPGKKEMGTPLAD---TPTRPVTRHGGMRDLHE
       ..  :.:   ...: :  : : :  ..   :   ::: ..   .::::   .  .:.::.
CCDS43 RIKARRKMADLHAVPRGMYDGPVFDLTTTPKG--GTPAGSARGSPTRP---NPPVRNLHQ
              490       500       510         520          530     

              540       550       560      
pF1KSD SSFSLSGSQIDDHVPKRASARILAPPGGRSSGIW  
       :.:::::.:.:. : . :: ::.:::::::.     
CCDS43 SGFSLSGTQVDEGV-RSASKRIVAPPGGRSNITSLS
         540        550       560       570

>>CCDS56387.1 DPYSL3 gene_id:1809|Hs108|chr5              (684 aa)
 initn: 1916 init1: 1761 opt: 1936  Z-score: 2383.2  bits: 451.1 E(32554): 2e-126
Smith-Waterman score: 1936; 51.6% identity (80.5% similar) in 558 aa overlap (7-561:128-679)

                                       10        20        30      
pF1KSD                         MLANSASVRILIKGGKVVNDDCTHEADVYIENGIIQ
                                     : :.:::::..:::: .  ::.:.:.:.:.
CCDS56 PAPASPAPAGVEIRSATGKEVLQNLGPKDKSDRLLIKGGRIVNDDQSFYADIYMEDGLIK
       100       110       120       130       140       150       

         40        50        60        70        80        90      
pF1KSD QVGRELMIPGGAKVIDATGKLVIPGGIDTSTHFHQTFMNATCVDDFYHGTKAALVGGTTM
       :.: .:..:::.:.:.:.::.:::::::. :::.. . . : ::::..::::::.:::::
CCDS56 QIGDNLIVPGGVKTIEANGKMVIPGGIDVHTHFQMPYKGMTTVDDFFQGTKAALAGGTTM
       160       170       180       190       200       210       

        100       110       120       130       140       150      
pF1KSD IIGHVLPDKETSLVDAYEKCRGLADPKVCCDYALHVGITWWAPKVKAEMETLVREKGVNS
       :: ::.:. :.::..:::: :  :: : :::::::: :: :  .:: :...:...:::::
CCDS56 IIDHVVPEPESSLTEAYEKWREWADGKSCCDYALHVDITHWNDSVKQEVQNLIKDKGVNS
       220       230       240       250       260       270       

        160       170       180       190       200       210      
pF1KSD FQMFMTYKDLYMLRDSELYQVLHACKDIGAIARVHAENGELVAEGAKEALDLGITGPEGI
       :...:.:::::.. ..:::...    ..::::.::::::...:.   . :..::::::: 
CCDS56 FMVYMAYKDLYQVSNTELYEIFTCLGELGAIAQVHAENGDIIAQEQTRMLEMGITGPEGH
       280       290       300       310       320       330       

        220       230       240       250       260       270      
pF1KSD EISRPEELEAEATHRVITIANRTHCPIYLVNVSSISAGDVIAAAKMQGKVVLAETTTAHA
        .::::::::::. :.::::..:.::.:...: : ::.:.:. :. .:.::..:  ::  
CCDS56 VLSRPEELEAEAVFRAITIASQTNCPLYVTKVMSKSAADLISQARKKGNVVFGEPITASL
       340       350       360       370       380       390       

        280       290       300       310       320       330      
pF1KSD TLTGLHYYHQDWSHAAAYVTVPPLRLDTNTSTYLMSLLANDTLNIVASDHRPFTTKQKAM
        . : ::. ..:..:::.:: :::  : .:  :. ::::.  :.. .: :  :.: :::.
CCDS56 GIDGTHYWSKNWAKAAAFVTSPPLSPDPTTPDYINSLLASGDLQLSGSAHCTFSTAQKAI
       400       410       420       430       440       450       

        340       350       360       370       380       390      
pF1KSD GKEDFTKIPHGVSGVQDRMSVIWERGVVGGKMDENRFVAVTSSNAAKLLNLYPRKGRIIP
       ::..:: ::.:..::..::::::...:. ::::::.::::::.::::..:::::::::  
CCDS56 GKDNFTAIPEGTNGVEERMSVIWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRISV
       460       470       480       490       500       510       

        400       410       420       430       440       450      
pF1KSD GADADVVVWDPEATKTISASTQVQGGDFNLYENMRCHGVPLVTISRGRVVYENGVFMCAE
       :.:.:.:.:::.:.: .::... .....:..:.:. .:.:::.: .:... :.: .  ..
CCDS56 GSDSDLVIWDPDAVKIVSAKNHQSAAEYNIFEGMELRGAPLVVICQGKIMLEDGNLHVTQ
       520       530       540       550       560       570       

        460       470       480       490       500       510      
pF1KSD GTGKFCPLRSFPDTVYKKLVQREKTLKVRGVDRTPYLGDVAVVVHPGKKEMGTPLAD---
       :.:.: :   : : :::..  :.:   ...: :  : : :  ..   :   ::: ..   
CCDS56 GAGRFIPCSPFSDYVYKRIKARRKMADLHAVPRGMYDGPVFDLTTTPKG--GTPAGSARG
       580       590       600       610       620         630     

           520       530       540       550       560      
pF1KSD TPTRPVTRHGGMRDLHESSFSLSGSQIDDHVPKRASARILAPPGGRSSGIW  
       .::::   .  .:.::.:.:::::.:.:. : . :: ::.:::::::.     
CCDS56 SPTRP---NPPVRNLHQSGFSLSGTQVDEGV-RSASKRIVAPPGGRSNITSLS
         640          650       660        670       680    

>>CCDS7665.1 DPYSL4 gene_id:10570|Hs108|chr10             (572 aa)
 initn: 1847 init1: 1693 opt: 1894  Z-score: 2332.7  bits: 441.5 E(32554): 1.3e-123
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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