Result of FASTA (ccds) for pF1KSDB0018
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDB0018, 880 aa
  1>>>pF1KSDB0018 880 - 880 aa - 880 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9867+/-0.00085; mu= 6.3730+/- 0.051
 mean_var=234.4824+/-47.688, 0's: 0 Z-trim(116.0): 29  B-trim: 268 in 2/52
 Lambda= 0.083757
 statistics sampled from 16577 (16602) to 16577 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.788), E-opt: 0.2 (0.51), width:  16
 Scan time:  5.480

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11298.1 GAS2L2 gene_id:246176|Hs108|chr17      ( 880) 6109 751.4 1.6e-216
CCDS74840.1 GAS2L1 gene_id:10634|Hs108|chr22       ( 681)  788 108.4 4.7e-23
CCDS63438.1 GAS2L1 gene_id:10634|Hs108|chr22       ( 454)  755 104.2 5.5e-22
CCDS7858.1 GAS2 gene_id:2620|Hs108|chr11           ( 313)  697 97.1 5.3e-20
CCDS9079.1 GAS2L3 gene_id:283431|Hs108|chr12       ( 694)  688 96.3 2.1e-19
CCDS76590.1 GAS2L3 gene_id:283431|Hs108|chr12      ( 590)  583 83.5 1.2e-15


>>CCDS11298.1 GAS2L2 gene_id:246176|Hs108|chr17           (880 aa)
 initn: 6109 init1: 6109 opt: 6109  Z-score: 4000.8  bits: 751.4 E(32554): 1.6e-216
Smith-Waterman score: 6109; 100.0% identity (100.0% similar) in 880 aa overlap (1-880:1-880)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSQPAGGRRKPRTLGPPVCSIRPFKSSEQYLEAMKEDLAEWLRDLYGLDIDAANFLQVLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSQPAGGRRKPRTLGPPVCSIRPFKSSEQYLEAMKEDLAEWLRDLYGLDIDAANFLQVLE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD TGLVLCQHANVVTDAALAFLAEAPAQAQKIPMPRVGVSCNGAAQPGTFQARDNVSNFIQW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TGLVLCQHANVVTDAALAFLAEAPAQAQKIPMPRVGVSCNGAAQPGTFQARDNVSNFIQW
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD CRKEMGIQEVLMFETEDLVLRKNVKNVVLCLLELGRRAWRFGVAAPTLVQLEEEIEEEVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CRKEMGIQEVLMFETEDLVLRKNVKNVVLCLLELGRRAWRFGVAAPTLVQLEEEIEEEVR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD RELALPPPDPSPPAPPRRQPCHFRNLDQMVQSLVSHCTCPVQFSMVKVSEGKYRVGDSNT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RELALPPPDPSPPAPPRRQPCHFRNLDQMVQSLVSHCTCPVQFSMVKVSEGKYRVGDSNT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD LIFIRILRNHVMVRVGGGWDTLGHYLDKHDPCRCTSLSHKPGSFLKPPAPPVQHEVRVQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LIFIRILRNHVMVRVGGGWDTLGHYLDKHDPCRCTSLSHKPGSFLKPPAPPVQHEVRVQD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD GPSQTQPTMTISRSQSPPPPVDWKTYTSSDRRLRPPTPSSPRPRRERGAGTGASREMAPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GPSQTQPTMTISRSQSPPPPVDWKTYTSSDRRLRPPTPSSPRPRRERGAGTGASREMAPF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD LRCQERSLIPSWRQPTAGDSPPSPQSSSTQKGRDPQCTSSGKREERYPPELPRGRIPTSW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LRCQERSLIPSWRQPTAGDSPPSPQSSSTQKGRDPQCTSSGKREERYPPELPRGRIPTSW
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD VHEETDSWGTDAGNPTPQRLRAIEATTKGISARGPSPLPRSFGPAECLGLRLPLRDEAKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VHEETDSWGTDAGNPTPQRLRAIEATTKGISARGPSPLPRSFGPAECLGLRLPLRDEAKG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD AFFQFREPESVRSPTPVQGLTKIPIRLPPARPPTPGRSFPGATSGSPRTELGRDPIPLRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AFFQFREPESVRSPTPVQGLTKIPIRLPPARPPTPGRSFPGATSGSPRTELGRDPIPLRA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD VTVDLAGSTHGDCSVEVRQEDQQLDIQVMAEARESWDLGLQEQEGRYTPLPLGGNKEQAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VTVDLAGSTHGDCSVEVRQEDQQLDIQVMAEARESWDLGLQEQEGRYTPLPLGGNKEQAI
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD YCSLEEEILGNMKLLEVRSACPQGTRSGVIPRSGVYIPRLAGQWPEPGGPYDKAIQELAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YCSLEEEILGNMKLLEVRSACPQGTRSGVIPRSGVYIPRLAGQWPEPGGPYDKAIQELAQ
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD GSPSLLKVDLEAWKAAPTGSPKPAVTPGPGSLKGKLGARQSGPRTKASLSAKGTHMRKVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GSPSLLKVDLEAWKAAPTGSPKPAVTPGPGSLKGKLGARQSGPRTKASLSAKGTHMRKVP
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD PQGGQDCSASTVSASPEAPTPSPLDPNSDKAKACLSKGRRTLRKPKRVPSIYKLKLRPRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PQGGQDCSASTVSASPEAPTPSPLDPNSDKAKACLSKGRRTLRKPKRVPSIYKLKLRPRI
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD RPRRDHRPEKQPSRIPRPLAYVFLGPARQPPKDRLLRAVLGSKGGEASRVDGASVGEEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RPRRDHRPEKQPSRIPRPLAYVFLGPARQPPKDRLLRAVLGSKGGEASRVDGASVGEEEE
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880
pF1KSD EGKEEKEPAAPLESSPQPPEGLQPHWLNQAPLPPEEESWV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EGKEEKEPAAPLESSPQPPEGLQPHWLNQAPLPPEEESWV
              850       860       870       880

>>CCDS74840.1 GAS2L1 gene_id:10634|Hs108|chr22            (681 aa)
 initn: 1196 init1: 469 opt: 788  Z-score: 527.4  bits: 108.4 E(32554): 4.7e-23
Smith-Waterman score: 1187; 37.4% identity (54.6% similar) in 815 aa overlap (1-788:1-659)

               10        20        30        40        50          
pF1KSD MSQPAGGRRKPRTLGPPVCSIRPFKSSEQYLEAMKEDLAEWLRDLYGLDIDAAN--FLQV
       :..:..:       :  . :.:::.::: :.:::::::::::  :::: . ...  ::  
CCDS74 MADPVAG-----IAGSAAKSVRPFRSSEAYVEAMKEDLAEWLNALYGLGLPGGGDGFLTG
                    10        20        30        40        50     

       60        70        80        90       100        110       
pF1KSD LETGLVLCQHANVVTDAALAFLAEAPAQAQKIPMPRVGVSCNG-AAQPGTFQARDNVSNF
       : :: .::::::.::.:: :. :  ::.         ::. .. .. ::.:.:::::..:
CCDS74 LATGTTLCQHANAVTEAARALAAARPAR---------GVAFQAHSVVPGSFMARDNVATF
          60        70        80                 90       100      

       120       130       140       150       160       170       
pF1KSD IQWCRKEMGIQEVLMFETEDLVLRKNVKNVVLCLLELGRRAWRFGVAAPTLVQLEEEIEE
       : ::: :.:. ::::::::::::::: :.:::::::..::. :.:. :: :::.:.:::.
CCDS74 IGWCRVELGVPEVLMFETEDLVLRKNEKSVVLCLLEVARRGARLGLLAPRLVQFEQEIER
        110       120       130       140       150       160      

       180       190                       200       210       220 
pF1KSD EVRRELALPPPDPSP----------PAP------PRRQPCHFRNLDQMVQSLVSHCTCPV
       :.:   : ::   .:          :::      ::  :  .::::..:. ....:::: 
CCDS74 ELR---AAPPAPNAPAAGEDTTETAPAPGTPARGPRMTPSDLRNLDELVREILGRCTCPD
           170       180       190       200       210       220   

             230       240       250       260       270       280 
pF1KSD QFSMVKVSEGKYRVGDSNTLIFIRILRNHVMVRVGGGWDTLGHYLDKHDPCRCTSLSHKP
       :: :.::::::::::::. :::.:.::.::::::::::::: :::::::::::.: .:.:
CCDS74 QFPMIKVSEGKYRVGDSSLLIFVRVLRSHVMVRVGGGWDTLEHYLDKHDPCRCSSTAHRP
           230       240       250       260       270       280   

             290       300       310       320       330           
pF1KSD GSFLKPPAPPVQHEVRVQDGPSQTQPTMTISRSQSPPPPVDWKTYTSSDRR-LRPP-TPS
             : : :        .:....:: :  :  :: :        .:.::  ::  :: 
CCDS74 ------PQPRV-----CTFSPQRVSPT-TSPRPASPVP--------GSERRGSRPEMTPV
                      290        300               310       320   

     340       350       360       370        380       390        
pF1KSD SPRPRRERGAGTGASREMAPFLRCQERSLIPSWRQPT-AGDSPPSPQSSSTQK-GRDPQC
       : :  .:   :     :  :  : :   : :  :.   .:::  : .:...   :   . 
CCDS74 SLRSTKE---GP----ETPPRPRDQ---LPPHPRSRRYSGDSDSSASSAQSGPLGTRSDD
           330              340          350       360       370   

       400       410       420       430       440       450       
pF1KSD TSSGKREERYPPELPRGRIPTSWVHEETDSWGTDAGNPTPQRLRAIEATTKGISARGPSP
       :..: :.::     :  :. :          :: :   .:.:  :... ..    ::   
CCDS74 TGTGPRRER-----PSRRLTT----------GTPA---SPRRPPALRSQSRDRLDRGR--
           380                      390          400       410     

       460       470       480       490          500       510    
pF1KSD LPRSFGPAECLGLRLPLRDEAKGAFFQFREPESV---RSPTPVQGLTKIPIRLPPARPPT
        ::  :     : .: . . :. :  : :: ..:   :     :  . .:      :   
CCDS74 -PR--GAPGGRGAQLSVPSPARRARSQSREEQAVLLVRRDRDGQH-SWVP------R---
              420       430       440       450              460   

          520       530       540       550       560       570    
pF1KSD PGRSFPGATSGSPRTELGRDPIPLRAVTVDLAGSTHGDCSVEVRQEDQQLDIQVMAEARE
        ::.  :.  ..:.:  .:.:   :   :                            .  
CCDS74 -GRGSGGSGRSTPQTPRARSPAAPRLSRV----------------------------SSP
               470       480                                   490 

          580       590       600       610        620       630   
pF1KSD SWDLGLQEQEGRYTPLPLGGNKEQAIYCSLEEEILGNMKLLE-VRSACPQGTRSGVIPRS
       : .::        ::: :  ..:: ..  ::::.:.: . :: : :. :    .:  :  
CCDS74 SPELGTTPASIFRTPLQLDPQQEQQLFRRLEEEFLANARALEAVASVTP----TGPAPD-
             500       510       520       530       540           

           640       650       660       670       680       690   
pF1KSD GVYIPRLAGQWPEPGGPYDKAIQELAQGSPSLLKVDLEAWKAAPTGSPKPAVTPGPGSLK
           :  :   :.: .: :.:    ...: ::  .      ..  :.:        :. .
CCDS74 ----PARA---PDPPAP-DSAYCSSSSSSSSLSVL------GGKCGQP--------GD-S
            550           560       570             580            

           700       710       720       730       740       750   
pF1KSD GKLGARQSGPRTKASLSAKGTHMRKVPPQGGQDCSASTVSASPEAPTPSPLDPNSDKAKA
       :. .    :::..: ::... .    : .::       . .:: : :    .:.   :..
CCDS74 GRTANGLPGPRSQA-LSSSSDEGSPCPGMGGP----LDAPGSPLACT----EPSRTWARG
           590        600       610           620           630    

           760       770       780       790       800       810   
pF1KSD CLSKGRRTLRKPKRVPSIYKLKLRPRIRPRRDHRPEKQPSRIPRPLAYVFLGPARQPPKD
        ..   .  :::.:.:.       ::  :::   :                         
CCDS74 RMDT--QPDRKPSRIPT-------PR-GPRRPSGPAELGTWHALHSVTPRAEPDSWM   
            640              650        660       670       680    

           820       830       840       850       860       870   
pF1KSD RLLRAVLGSKGGEASRVDGASVGEEEEEGKEEKEPAAPLESSPQPPEGLQPHWLNQAPLP

>>CCDS63438.1 GAS2L1 gene_id:10634|Hs108|chr22            (454 aa)
 initn: 1115 init1: 469 opt: 755  Z-score: 508.2  bits: 104.2 E(32554): 5.5e-22
Smith-Waterman score: 1114; 44.2% identity (61.7% similar) in 491 aa overlap (1-469:1-436)

               10        20        30        40        50          
pF1KSD MSQPAGGRRKPRTLGPPVCSIRPFKSSEQYLEAMKEDLAEWLRDLYGLDIDAAN--FLQV
       :..:..:       :  . :.:::.::: :.:::::::::::  :::: . ...  ::  
CCDS63 MADPVAG-----IAGSAAKSVRPFRSSEAYVEAMKEDLAEWLNALYGLGLPGGGDGFLTG
                    10        20        30        40        50     

       60        70        80        90       100        110       
pF1KSD LETGLVLCQHANVVTDAALAFLAEAPAQAQKIPMPRVGVSCNG-AAQPGTFQARDNVSNF
       : :: .::::::.::.:: :. :  ::.         ::. .. .. ::.:.:::::..:
CCDS63 LATGTTLCQHANAVTEAARALAAARPAR---------GVAFQAHSVVPGSFMARDNVATF
          60        70        80                 90       100      

       120       130       140       150       160       170       
pF1KSD IQWCRKEMGIQEVLMFETEDLVLRKNVKNVVLCLLELGRRAWRFGVAAPTLVQLEEEIEE
       : ::: :.:. ::::::::::::::: :.:::::::..::. :.:. :: :::.:.:::.
CCDS63 IGWCRVELGVPEVLMFETEDLVLRKNEKSVVLCLLEVARRGARLGLLAPRLVQFEQEIER
        110       120       130       140       150       160      

       180       190                       200       210       220 
pF1KSD EVRRELALPPPDPSP----------PAP------PRRQPCHFRNLDQMVQSLVSHCTCPV
       :.:   : ::   .:          :::      ::  :  .::::..:. ....:::: 
CCDS63 ELR---AAPPAPNAPAAGEDTTETAPAPGTPARGPRMTPSDLRNLDELVREILGRCTCPD
           170       180       190       200       210       220   

             230       240       250       260       270       280 
pF1KSD QFSMVKVSEGKYRVGDSNTLIFIRILRNHVMVRVGGGWDTLGHYLDKHDPCRCTSLSHKP
       :: :.::::::::::::. :::.:.::.::::::::::::: :::::::::::.: .:.:
CCDS63 QFPMIKVSEGKYRVGDSSLLIFVRVLRSHVMVRVGGGWDTLEHYLDKHDPCRCSSTAHRP
           230       240       250       260       270       280   

             290       300       310       320       330           
pF1KSD GSFLKPPAPPVQHEVRVQDGPSQTQPTMTISRSQSPPPPVDWKTYTSSDRR-LRPP-TPS
             : : :        .:....:: :  :  :: :        .:.::  ::  :: 
CCDS63 ------PQPRV-----CTFSPQRVSPT-TSPRPASPVP--------GSERRGSRPEMTPV
                      290        300               310       320   

     340       350       360       370       380        390        
pF1KSD SPRPRRERGAGTGASREMAPFLRCQERSLIPSWRQPTAGDSP-PSPQSSSTQKGRDPQCT
       : :  .: :  :  :   . .     .   :.    ::.  : :  :. :... .   : 
CCDS63 SLRSTKE-GPETPPSSSSSSLSVLGGKCGQPGDSGRTANGLPGPRSQALSSSSDEGSPCP
           330        340       350       360       370       380  

      400       410       420       430       440       450        
pF1KSD SSGKREERYPPELPRGRIPTSWVHEETDSWGTDAGNPTPQRLRAIEATTKGISARGPSPL
       . :      : . : . .  .   : . .:.    .  :.:       ..  . :::   
CCDS63 GMGG-----PLDAPGSPLACT---EPSRTWARGRMDTQPDR-----KPSRIPTPRGPR--
                 390          400       410            420         

      460       470       480       490       500       510        
pF1KSD PRSFGPAECLGLRLPLRDEAKGAFFQFREPESVRSPTPVQGLTKIPIRLPPARPPTPGRS
        :  :::: ::                                                 
CCDS63 -RPSGPAE-LGTWHALHSVTPRAEPDSWM                               
        430        440       450                                   

>>CCDS7858.1 GAS2 gene_id:2620|Hs108|chr11                (313 aa)
 initn: 547 init1: 293 opt: 697  Z-score: 472.5  bits: 97.1 E(32554): 5.3e-20
Smith-Waterman score: 697; 41.7% identity (69.4% similar) in 271 aa overlap (28-293:30-292)

                 10        20        30        40        50        
pF1KSD   MSQPAGGRRKPRTLGPPVCSIRPFKSSEQYLEAMKEDLAEWLRDLYGLDIDAANFLQV
                                    :  :  :::::: :: .: : .: : .:.. 
CCDS78 MCTALSPKVRSGPGLSDMHQYSQWLASRHEANLLPMKEDLALWLTNLLGKEITAETFMEK
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KSD LETGLVLCQHANVVTDAALAFLAEAPAQAQKIPMPRVGVSCNGAAQPGTFQARDNVSNFI
       :..: .::: :... .  .    .:   ....:. ..   :. .:  :.: ::::..::.
CCDS78 LDNGALLCQLAETMQEK-FKESMDANKPTKNLPLKKI--PCKTSAPSGSFFARDNTANFL
               70         80        90         100       110       

      120       130       140       150       160       170        
pF1KSD QWCRKEMGIQEVLMFETEDLVLRKNVKNVVLCLLELGRRAWRFGVAAPTLVQLEEEIEEE
       .::: ..:..:. .::.: :::.:. ..: :::::::: : :.::  : :..::.:::.:
CCDS78 SWCR-DLGVDETCLFESEGLVLHKQPREVCLCLLELGRIAARYGVEPPGLIKLEKEIEQE
       120        130       140       150       160       170      

      180       190       200       210         220       230      
pF1KSD VRRELALPPPDPSPPAPPRRQPCHFRNLDQMVQSLVSH--CTCPVQFSMVKVSEGKYRVG
         . :. : :.::: .    .      ::. :. .     : :: .: . ..:.:.::::
CCDS78 --ETLSAPSPSPSPSSKSSGKKSTGNLLDDAVKRISEDPPCKCPNKFCVERLSQGRYRVG
          180       190       200       210       220       230    

        240        250       260       270       280         290   
pF1KSD DSNTLIFIRILRN-HVMVRVGGGWDTLGHYLDKHDPCRCTSLSHKPG--SFLKPPAPPVQ
       ..  ..:::.:.: ::::::::::.:.. :: ::::::  ..:.  :  : ..  .: ..
CCDS78 EK--ILFIRMLHNKHVMVRVGGGWETFAGYLLKHDPCRMLQISRVDGKTSPIQSKSPTLK
            240       250       260       270       280       290  

           300       310       320       330       340       350   
pF1KSD HEVRVQDGPSQTQPTMTISRSQSPPPPVDWKTYTSSDRRLRPPTPSSPRPRRERGAGTGA
                                                                   
CCDS78 DMNPDNYLVVSASYKAKKEIK                                       
            300       310                                          

>>CCDS9079.1 GAS2L3 gene_id:283431|Hs108|chr12            (694 aa)
 initn: 570 init1: 167 opt: 688  Z-score: 462.0  bits: 96.3 E(32554): 2.1e-19
Smith-Waterman score: 707; 32.7% identity (58.2% similar) in 538 aa overlap (11-519:23-515)

                           10           20          30        40   
pF1KSD             MSQPAGGRRKPRTLGPP---VCSIRPFKS--SEQYLEAMKEDLAEWLR
                             ::  ::    ::.   . .   :  :  :.:::. :: 
CCDS90 MQPAIQVWFGEDLPLSPRSPLTPRH-GPGLANVCQYDEWIAVRHEATLLPMQEDLSIWLS
               10        20         30        40        50         

            50        60        70        80        90       100   
pF1KSD DLYGLDIDAANFLQVLETGLVLCQHANVVTDAALAFLAEAPAQAQKIPMPRVGVSCNGAA
        : :. . : ..:. :..:..:::  .:. . . .  .:   .. ..:: .:   :.  :
CCDS90 GLLGIKVKAEKLLEELDNGVLLCQLIDVLQNMVKTCNSE---ESGNFPMRKV--PCKKDA
      60        70        80        90          100         110    

           110       120       130       140       150       160   
pF1KSD QPGTFQARDNVSNFIQWCRKEMGIQEVLMFETEDLVLRKNVKNVVLCLLELGRRAWRFGV
         :.: ::::..::..::: ..:..:. .::.: :::.:. ..: :::::.:: . :.::
CCDS90 ASGSFFARDNTANFLHWCR-DIGVDETYLFESEGLVLHKDPRQVYLCLLEIGRIVSRYGV
          120       130        140       150       160       170   

           170       180       190       200       210         220 
pF1KSD AAPTLVQLEEEIEEEVRRELALPPPDPSPPAPPRRQPCHFRNLDQMVQSLVSH--CTCPV
         :.::.::.::: : .  :    :. :   :  .. :. ..: . :. ..    :.:  
CCDS90 EPPVLVKLEKEIELE-ETLLNTSGPEDSISIP--KSCCRHEELHEAVKHIAEDPPCSCSH
           180        190       200         210       220       230

             230       240        250       260       270          
pF1KSD QFSMVKVSEGKYRVGDSNTLIFIRILRN-HVMVRVGGGWDTLGHYLDKHDPCRC---TSL
       .::.  .:::.::.::.  ..:::.:.. :::::::::::::  .: :.::::    ..:
CCDS90 RFSIEYLSEGRYRLGDK--ILFIRMLHGKHVMVRVGGGWDTLQGFLLKYDPCRILQFATL
              240         250       260       270       280        

       280       290       300               310       320         
pF1KSD SHKPGSFLKPPAPPVQHEVRVQDGPSQT-QP-------TMTISRSQSPPPPVDWKTYTSS
        .:  .: :     :..:  : :.:..: ::       .... ..:.  : :  .   :.
CCDS90 EQKILAFQKG----VSNE-SVPDSPARTPQPPEMNPLSAVNMFQKQNSKPSVPVSIPKSK
      290           300        310       320       330       340   

     330       340       350       360       370       380         
pF1KSD DRRLRPPTPSSPRPRRERGAGTGASREMAPFLRCQERSLIPSWRQPTAGDSPPSPQSSS-
       ... :::    :     .:.. :.   :.       :: .:.  .:.:.. :   .:.. 
CCDS90 EKQGRPPGALVP-ASSLKGGNLGS---MSV------RSKLPN--SPAASSHPKLKSSKGI
           350        360                370         380       390 

      390       400              410       420       430       440 
pF1KSD TQKGRDPQCTSSGKREERYP-------PELPRGRIPTSWVHEETDSWGTDAGNPTPQRLR
       :.: . :. ..:..     :       : :::    :.    :.     .. : ::.   
CCDS90 TKKPQAPSNNASSSLASLNPVGKNTSSPALPR----TAPCISESPRKCISSPN-TPK---
             400       410       420           430       440       

             450       460        470       480       490       500
pF1KSD AIEATTKGISARGPSPLPRS-FGPAECLGLRLPLRDEAKGAFFQFREPESVRSPTPVQGL
            .: : :.. . ::.: . : .: :   :     :   .. :.    .  .  .. 
CCDS90 -----AKVIPAQNSADLPESTLLPNKCSGKTQP--KYLKHNHISSRDNAVSHLAAHSNSS
                450       460       470         480       490      

              510        520       530       540       550         
pF1KSD TKIPIRLPPARPPT-PGRSFPGATSGSPRTELGRDPIPLRAVTVDLAGSTHGDCSVEVRQ
       .: : .:: :  :. :  ::                                        
CCDS90 SKCP-KLPKANIPVRPKPSFQSSAKMTKTSSKTIATGLGTQSQPSDGAPQAKPVPAQKLK
        500        510       520       530       540       550     

>>CCDS76590.1 GAS2L3 gene_id:283431|Hs108|chr12           (590 aa)
 initn: 478 init1: 167 opt: 583  Z-score: 394.4  bits: 83.5 E(32554): 1.2e-15
Smith-Waterman score: 602; 33.3% identity (58.4% similar) in 447 aa overlap (97-519:4-411)

         70        80        90       100       110       120      
pF1KSD QHANVVTDAALAFLAEAPAQAQKIPMPRVGVSCNGAAQPGTFQARDNVSNFIQWCRKEMG
                                     : :.  :  :.: ::::..::..::: ..:
CCDS76                            MRKVPCKKDAASGSFFARDNTANFLHWCR-DIG
                                          10        20         30  

        130       140       150       160       170       180      
pF1KSD IQEVLMFETEDLVLRKNVKNVVLCLLELGRRAWRFGVAAPTLVQLEEEIEEEVRRELALP
       ..:. .::.: :::.:. ..: :::::.:: . :.::  :.::.::.::: : .  :   
CCDS76 VDETYLFESEGLVLHKDPRQVYLCLLEIGRIVSRYGVEPPVLVKLEKEIELE-ETLLNTS
             40        50        60        70        80         90 

        190       200       210         220       230       240    
pF1KSD PPDPSPPAPPRRQPCHFRNLDQMVQSLVSH--CTCPVQFSMVKVSEGKYRVGDSNTLIFI
        :. :   :  .. :. ..: . :. ..    :.:  .::.  .:::.::.::.  ..::
CCDS76 GPEDSISIP--KSCCRHEELHEAVKHIAEDPPCSCSHRFSIEYLSEGRYRLGDK--ILFI
             100         110       120       130       140         

           250       260       270          280       290       300
pF1KSD RILRN-HVMVRVGGGWDTLGHYLDKHDPCRC---TSLSHKPGSFLKPPAPPVQHEVRVQD
       :.:.. :::::::::::::  .: :.::::    ..: .:  .: :     :..:  : :
CCDS76 RMLHGKHVMVRVGGGWDTLQGFLLKYDPCRILQFATLEQKILAFQKG----VSNE-SVPD
       150       160       170       180       190            200  

                      310       320       330       340       350  
pF1KSD GPSQT-QP-------TMTISRSQSPPPPVDWKTYTSSDRRLRPPTPSSPRPRRERGAGTG
       .:..: ::       .... ..:.  : :  .   :.... :::    :     .:.. :
CCDS76 SPARTPQPPEMNPLSAVNMFQKQNSKPSVPVSIPKSKEKQGRPPGALVP-ASSLKGGNLG
            210       220       230       240       250        260 

            360       370       380        390       400           
pF1KSD ASREMAPFLRCQERSLIPSWRQPTAGDSPPSPQSSS-TQKGRDPQCTSSGKREERYP---
       .   :.       :: .:.  .:.:.. :   .:.. :.: . :. ..:..     :   
CCDS76 S---MSV------RSKLPN--SPAASSHPKLKSSKGITKKPQAPSNNASSSLASLNPVGK
                      270         280       290       300       310

          410       420       430       440       450       460    
pF1KSD ----PELPRGRIPTSWVHEETDSWGTDAGNPTPQRLRAIEATTKGISARGPSPLPRS-FG
           : :::    :.    :.     .. : ::.        .: : :.. . ::.: . 
CCDS76 NTSSPALPR----TAPCISESPRKCISSPN-TPK--------AKVIPAQNSADLPESTLL
                  320       330                340       350       

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pF1KSD PAECLGLRLPLRDEAKGAFFQFREPESVRSPTPVQGLTKIPIRLPPARPPT-PGRSFPGA
       : .: :   :     :   .. :.    .  .  .. .: : .:: :  :. :  ::   
CCDS76 PNKCSGKTQP--KYLKHNHISSRDNAVSHLAAHSNSSSKCP-KLPKANIPVRPKPSFQSS
       360         370       380       390        400       410    

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pF1KSD TSGSPRTELGRDPIPLRAVTVDLAGSTHGDCSVEVRQEDQQLDIQVMAEARESWDLGLQE
                                                                   
CCDS76 AKMTKTSSKTIATGLGTQSQPSDGAPQAKPVPAQKLKSALNLNQPVSVSSVSPVKATQKS
          420       430       440       450       460       470    




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