Result of FASTA (omim) for pF1KSDA1820
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1820, 1640 aa
  1>>>pF1KSDA1820 1640 - 1640 aa - 1640 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.2197+/-0.000441; mu= -18.4729+/- 0.027
 mean_var=483.9105+/-98.639, 0's: 0 Z-trim(123.1): 24  B-trim: 0 in 0/60
 Lambda= 0.058303
 statistics sampled from 42202 (42236) to 42202 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.773), E-opt: 0.2 (0.495), width:  16
 Scan time: 20.520

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_109590 (OMIM: 182290,607642) retinoic acid-indu (1906) 10906 933.3       0
XP_016879516 (OMIM: 182290,607642) PREDICTED: reti (1967) 10906 933.3       0
XP_016879515 (OMIM: 182290,607642) PREDICTED: reti (1967) 10906 933.3       0
XP_016879517 (OMIM: 182290,607642) PREDICTED: reti (1967) 10906 933.3       0
XP_016879514 (OMIM: 182290,607642) PREDICTED: reti (1967) 10906 933.3       0
XP_011528656 (OMIM: 603107) PREDICTED: transcripti (1938)  793 82.6 3.6e-14
NP_852469 (OMIM: 603107) transcription factor 20 i (1938)  793 82.6 3.6e-14
XP_011528655 (OMIM: 603107) PREDICTED: transcripti (1949)  793 82.7 3.6e-14
XP_006724376 (OMIM: 603107) PREDICTED: transcripti (1960)  793 82.7 3.6e-14
XP_005261779 (OMIM: 603107) PREDICTED: transcripti (1960)  793 82.7 3.6e-14
NP_005641 (OMIM: 603107) transcription factor 20 i (1960)  793 82.7 3.6e-14


>>NP_109590 (OMIM: 182290,607642) retinoic acid-induced   (1906 aa)
 initn: 10906 init1: 10906 opt: 10906  Z-score: 4972.8  bits: 933.3 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 10906; 99.9% identity (100.0% similar) in 1598 aa overlap (1-1598:1-1598)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MQSFRERCGFHGKQQNYQQTSQETSRLENYRQPSQAGLSCDRQRLLAKDYYNPQPYPSYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 MQSFRERCGFHGKQQNYQQTSQETSRLENYRQPSQAGLSCDRQRLLAKDYYNPQPYPSYE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD GGAGTPSGTAAAVAADKYHRGSKALPTQQGLQGRPAFPGYGVQDSSPYPGRYAGEESLQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 GGAGTPSGTAAAVAADKYHRGSKALPTQQGLQGRPAFPGYGVQDSSPYPGRYAGEESLQA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD WGAPQPPPPQPQPLPAGVAKYDENLMKKTAVPPSRQYAEQGAQVPFRTHSLHVQQPPPPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 WGAPQPPPPQPQPLPAGVAKYDENLMKKTAVPPSRQYAEQGAQVPFRTHSLHVQQPPPPQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD QPLAYPKLQRQKLQNDIASPLPFPQGTHFPQHSQSFPTSSTYSSSVQGGGQGAHSYKSCT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 QPLAYPKLQRQKLQNDIASPLPFPQGTHFPQHSQSFPTSSTYSSSVQGGGQGAHSYKSCT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD APTAQPHDRPLTASSSLAPGQRVQNLHAYQSGRLSYDQQQQQQQQQQQQQQALQSRHHAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 APTAQPHDRPLTASSSLAPGQRVQNLHAYQSGRLSYDQQQQQQQQQQQQQQALQSRHHAQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD ETLHYQNLAKYQHYGQQGQGYCQPDAAVRTPEQYYQTFSPSSSHSPARSVGRSPSYSSTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 ETLHYQNLAKYQHYGQQGQGYCQPDAAVRTPEQYYQTFSPSSSHSPARSVGRSPSYSSTP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD SPLMPNLENFPYSQQPLSTGAFPAGITDHSHFMPLLNPSPTDATSSVDTQAGNCKPLQKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 SPLMPNLENFPYSQQPLSTGAFPAGITDHSHFMPLLNPSPTDATSSVDTQAGNCKPLQKD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD KLPENLLSDLSLQSLTALTSQVENISNTVQQLLLSKAAVPQKKGVKNLVSRTPEQHKSQH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 KLPENLLSDLSLQSLTALTSQVENISNTVQQLLLSKAAVPQKKGVKNLVSRTPEQHKSQH
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD CSPEGSGYSAEPAGTPLSEPPSSTPQSTHAEPQEADYLSGSEDPLERSFLYCNQARGSPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 CSPEGSGYSAEPAGTPLSEPPSSTPQSTHAEPQEADYLSGSEDPLERSFLYCNQARGSPA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD RVNSNSKAKPESVSTCSVTSPDDMSTKSDDSFQSLHGSLPLDSFSKFVAGERDCPRLLLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 RVNSNSKAKPESVSTCSVTSPDDMSTKSDDSFQSLHGSLPLDSFSKFVAGERDCPRLLLS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD ALAQEDLASEILGLQEAIGEKADKAWAEAPSLVKDSSKPPFSLENHSACLDSVAKSAWPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 ALAQEDLASEILGLQEAIGEKADKAWAEAPSLVKDSSKPPFSLENHSACLDSVAKSAWPR
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD PGEPEALPDSLQLDKGGNAKDFSPGLFEDPSVAFATPDPKKTTGPLSFGTKPTLGVPAPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 PGEPEALPDSLQLDKGGNAKDFSPGLFEDPSVAFATPDPKKTTGPLSFGTKPTLGVPAPD
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD PTTAAFDCFPDTTAASSADSANPFAWPEENLGDACPRWGLHPGELTKGLEQGGKASDGIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 PTTAAFDCFPDTTAASSADSANPFAWPEENLGDACPRWGLHPGELTKGLEQGGKASDGIS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD KGDTHEASACLGFQEEDPPGEKVASLPGDFKQEEVGGVKEEAGGLLQCPEVAKADRWLED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 KGDTHEASACLGFQEEDPPGEKVASLPGDFKQEEVGGVKEEAGGLLQCPEVAKADRWLED
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD SRHCCSTADFGDLPLLPPTSRKEDLEAEEEYSSLCELLGSPEQRPGMQDPLSPKAPLICT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 SRHCCSTADFGDLPLLPPTSRKEDLEAEEEYSSLCELLGSPEQRPGMQDPLSPKAPLICT
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD KEEVEEVLDSKAGWGSPCHLSGESVILLGPTVGTESKVQSWFESSLSHMKPGEEGPDGER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 KEEVEEVLDSKAGWGSPCHLSGESVILLGPTVGTESKVQSWFESSLSHMKPGEEGPDGER
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD APGDSTTSDASLAQKPNKPAVPEAPIAKKEPVPRGKSLRSRRVHRGLPEAEDSPCRAPVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 APGDSTTSDASLAQKPNKPAVPEAPIAKKEPVPRGKSLRSRRVHRGLPEAEDSPCRAPVL
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD PKDLLLPESCTGPPQGQMEGAGAPGRGASEGLPRMCTRSLTALSEPRTPGPPGLTTTPAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 PKDLLLPESCTGPPQGQMEGAGAPGRGASEGLPRMCTRSLTALSEPRTPGPPGLTTTPAP
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD PDKLGGKQRAAFKSGKRVGKPSPKAASSPSNPAALPVASDSSPMGSKTKETDSPSTPGKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 PDKLGGKQRAAFKSGKRVGKPSPKAASSPSNPAALPVASDSSPMGSKTKETDSPSTPGKD
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD QRSMILRSRTKTQEIFHSKRRRPSEGRLPNCRATKKLLDNSHLPATFKVSSSPQKEGRVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 QRSMILRSRTKTQEIFHSKRRRPSEGRLPNCRATKKLLDNSHLPATFKVSSSPQKEGRVS
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD QRARVPKPGAGSKLSDRPLHALKRKSAFMAPVPTKKRNLVLRSRSSSSSNASGNGGDGKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 QRARVPKPGAGSKLSDRPLHALKRKSAFMAPVPTKKRNLVLRSRSSSSSNASGNGGDGKE
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD ERPEGSPTLFKRMSSPKKAKPTKGNGEPATKLPPPETPDACLKLASRAAFQGAMKTKVLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 ERPEGSPTLFKRMSSPKKAKPTKGNGEPATKLPPPETPDACLKLASRAAFQGAMKTKVLP
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD PRKGRGLKLEAIVQKITSPSLKKFACKAPGASPGNPLSPSLSDKDRGLKGAGGSPVGVEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 PRKGRGLKLEAIVQKITSPSLKKFACKAPGASPGNPLSPSLSDKDRGLKGAGGSPVGVEE
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KSD GLVNVGTGQKLPTSGADPLCRNPTNRSLKGKLMNSKKLSSTDCFKTEAFTSPEALQPGGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 GLVNVGTGQKLPTSGADPLCRNPTNRSLKGKLMNSKKLSSTDCFKTEAFTSPEALQPGGT
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KSD ALAPKKRSRKGRAGAHGLSKGPLEKRPYLGPALLLTPRDRASGTQGASEDNSGGGGKKPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 ALAPKKRSRKGRAGAHGLSKGPLEKRPYLGPALLLTPRDRASGTQGASEDNSGGGGKKPK
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KSD MEELGLASQPPEGRPCQPQTRAQKQPGHTNYSSYSKRKRLTRGRAKNTTSSPCKGRAKRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_109 MEELGLASQPPEGRPCQPQTRAQKQPGHTNYSSYSKRKRLTRGRAKNTTSSPCKGRAKRR
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KSD RQQQVLPLDPAEPEIRLKYISSCKRLRSDSRTPAFSPLEPSLGAQNPRSGQNAPPAPADA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.                      
NP_109 RQQQVLPLDPAEPEIRLKYISSCKRLRSDSRTPAFSPFVRVEKRDAFTTICTVVNSPGDA
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640                                        
pF1KSD RPLCTTRDRRAYSAREQGQR                                        
                                                                   
NP_109 PKPHRKPSSSASSSSSSSSFSLDAAGASLATLPGGSILQPRPSLPLSSTMHLGPVVSKAL
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

>>XP_016879516 (OMIM: 182290,607642) PREDICTED: retinoic  (1967 aa)
 initn: 10906 init1: 10906 opt: 10906  Z-score: 4972.6  bits: 933.3 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 10906; 99.9% identity (100.0% similar) in 1598 aa overlap (1-1598:1-1598)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MQSFRERCGFHGKQQNYQQTSQETSRLENYRQPSQAGLSCDRQRLLAKDYYNPQPYPSYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MQSFRERCGFHGKQQNYQQTSQETSRLENYRQPSQAGLSCDRQRLLAKDYYNPQPYPSYE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD GGAGTPSGTAAAVAADKYHRGSKALPTQQGLQGRPAFPGYGVQDSSPYPGRYAGEESLQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GGAGTPSGTAAAVAADKYHRGSKALPTQQGLQGRPAFPGYGVQDSSPYPGRYAGEESLQA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD WGAPQPPPPQPQPLPAGVAKYDENLMKKTAVPPSRQYAEQGAQVPFRTHSLHVQQPPPPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WGAPQPPPPQPQPLPAGVAKYDENLMKKTAVPPSRQYAEQGAQVPFRTHSLHVQQPPPPQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD QPLAYPKLQRQKLQNDIASPLPFPQGTHFPQHSQSFPTSSTYSSSVQGGGQGAHSYKSCT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QPLAYPKLQRQKLQNDIASPLPFPQGTHFPQHSQSFPTSSTYSSSVQGGGQGAHSYKSCT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD APTAQPHDRPLTASSSLAPGQRVQNLHAYQSGRLSYDQQQQQQQQQQQQQQALQSRHHAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 APTAQPHDRPLTASSSLAPGQRVQNLHAYQSGRLSYDQQQQQQQQQQQQQQALQSRHHAQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD ETLHYQNLAKYQHYGQQGQGYCQPDAAVRTPEQYYQTFSPSSSHSPARSVGRSPSYSSTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ETLHYQNLAKYQHYGQQGQGYCQPDAAVRTPEQYYQTFSPSSSHSPARSVGRSPSYSSTP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD SPLMPNLENFPYSQQPLSTGAFPAGITDHSHFMPLLNPSPTDATSSVDTQAGNCKPLQKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SPLMPNLENFPYSQQPLSTGAFPAGITDHSHFMPLLNPSPTDATSSVDTQAGNCKPLQKD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD KLPENLLSDLSLQSLTALTSQVENISNTVQQLLLSKAAVPQKKGVKNLVSRTPEQHKSQH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KLPENLLSDLSLQSLTALTSQVENISNTVQQLLLSKAAVPQKKGVKNLVSRTPEQHKSQH
              430       440       450       460       470       480

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pF1KSD CSPEGSGYSAEPAGTPLSEPPSSTPQSTHAEPQEADYLSGSEDPLERSFLYCNQARGSPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CSPEGSGYSAEPAGTPLSEPPSSTPQSTHAEPQEADYLSGSEDPLERSFLYCNQARGSPA
              490       500       510       520       530       540

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pF1KSD RVNSNSKAKPESVSTCSVTSPDDMSTKSDDSFQSLHGSLPLDSFSKFVAGERDCPRLLLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RVNSNSKAKPESVSTCSVTSPDDMSTKSDDSFQSLHGSLPLDSFSKFVAGERDCPRLLLS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD ALAQEDLASEILGLQEAIGEKADKAWAEAPSLVKDSSKPPFSLENHSACLDSVAKSAWPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALAQEDLASEILGLQEAIGEKADKAWAEAPSLVKDSSKPPFSLENHSACLDSVAKSAWPR
              610       620       630       640       650       660

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pF1KSD PGEPEALPDSLQLDKGGNAKDFSPGLFEDPSVAFATPDPKKTTGPLSFGTKPTLGVPAPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PGEPEALPDSLQLDKGGNAKDFSPGLFEDPSVAFATPDPKKTTGPLSFGTKPTLGVPAPD
              670       680       690       700       710       720

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pF1KSD PTTAAFDCFPDTTAASSADSANPFAWPEENLGDACPRWGLHPGELTKGLEQGGKASDGIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PTTAAFDCFPDTTAASSADSANPFAWPEENLGDACPRWGLHPGELTKGLEQGGKASDGIS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD KGDTHEASACLGFQEEDPPGEKVASLPGDFKQEEVGGVKEEAGGLLQCPEVAKADRWLED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KGDTHEASACLGFQEEDPPGEKVASLPGDFKQEEVGGVKEEAGGLLQCPEVAKADRWLED
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD SRHCCSTADFGDLPLLPPTSRKEDLEAEEEYSSLCELLGSPEQRPGMQDPLSPKAPLICT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SRHCCSTADFGDLPLLPPTSRKEDLEAEEEYSSLCELLGSPEQRPGMQDPLSPKAPLICT
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD KEEVEEVLDSKAGWGSPCHLSGESVILLGPTVGTESKVQSWFESSLSHMKPGEEGPDGER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KEEVEEVLDSKAGWGSPCHLSGESVILLGPTVGTESKVQSWFESSLSHMKPGEEGPDGER
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD APGDSTTSDASLAQKPNKPAVPEAPIAKKEPVPRGKSLRSRRVHRGLPEAEDSPCRAPVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 APGDSTTSDASLAQKPNKPAVPEAPIAKKEPVPRGKSLRSRRVHRGLPEAEDSPCRAPVL
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD PKDLLLPESCTGPPQGQMEGAGAPGRGASEGLPRMCTRSLTALSEPRTPGPPGLTTTPAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PKDLLLPESCTGPPQGQMEGAGAPGRGASEGLPRMCTRSLTALSEPRTPGPPGLTTTPAP
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD PDKLGGKQRAAFKSGKRVGKPSPKAASSPSNPAALPVASDSSPMGSKTKETDSPSTPGKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PDKLGGKQRAAFKSGKRVGKPSPKAASSPSNPAALPVASDSSPMGSKTKETDSPSTPGKD
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

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pF1KSD QRSMILRSRTKTQEIFHSKRRRPSEGRLPNCRATKKLLDNSHLPATFKVSSSPQKEGRVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QRSMILRSRTKTQEIFHSKRRRPSEGRLPNCRATKKLLDNSHLPATFKVSSSPQKEGRVS
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD QRARVPKPGAGSKLSDRPLHALKRKSAFMAPVPTKKRNLVLRSRSSSSSNASGNGGDGKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QRARVPKPGAGSKLSDRPLHALKRKSAFMAPVPTKKRNLVLRSRSSSSSNASGNGGDGKE
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD ERPEGSPTLFKRMSSPKKAKPTKGNGEPATKLPPPETPDACLKLASRAAFQGAMKTKVLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ERPEGSPTLFKRMSSPKKAKPTKGNGEPATKLPPPETPDACLKLASRAAFQGAMKTKVLP
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD PRKGRGLKLEAIVQKITSPSLKKFACKAPGASPGNPLSPSLSDKDRGLKGAGGSPVGVEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PRKGRGLKLEAIVQKITSPSLKKFACKAPGASPGNPLSPSLSDKDRGLKGAGGSPVGVEE
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KSD GLVNVGTGQKLPTSGADPLCRNPTNRSLKGKLMNSKKLSSTDCFKTEAFTSPEALQPGGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLVNVGTGQKLPTSGADPLCRNPTNRSLKGKLMNSKKLSSTDCFKTEAFTSPEALQPGGT
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KSD ALAPKKRSRKGRAGAHGLSKGPLEKRPYLGPALLLTPRDRASGTQGASEDNSGGGGKKPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALAPKKRSRKGRAGAHGLSKGPLEKRPYLGPALLLTPRDRASGTQGASEDNSGGGGKKPK
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KSD MEELGLASQPPEGRPCQPQTRAQKQPGHTNYSSYSKRKRLTRGRAKNTTSSPCKGRAKRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MEELGLASQPPEGRPCQPQTRAQKQPGHTNYSSYSKRKRLTRGRAKNTTSSPCKGRAKRR
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KSD RQQQVLPLDPAEPEIRLKYISSCKRLRSDSRTPAFSPLEPSLGAQNPRSGQNAPPAPADA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.                      
XP_016 RQQQVLPLDPAEPEIRLKYISSCKRLRSDSRTPAFSPFVRVEKRDAFTTICTVVNSPGDA
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640                                        
pF1KSD RPLCTTRDRRAYSAREQGQR                                        
                                                                   
XP_016 PKPHRKPSSSASSSSSSSSFSLDAAGASLATLPGGSILQPRPSLPLSSTMHLGPVVSKAL
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

>>XP_016879515 (OMIM: 182290,607642) PREDICTED: retinoic  (1967 aa)
 initn: 10906 init1: 10906 opt: 10906  Z-score: 4972.6  bits: 933.3 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 10906; 99.9% identity (100.0% similar) in 1598 aa overlap (1-1598:1-1598)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MQSFRERCGFHGKQQNYQQTSQETSRLENYRQPSQAGLSCDRQRLLAKDYYNPQPYPSYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MQSFRERCGFHGKQQNYQQTSQETSRLENYRQPSQAGLSCDRQRLLAKDYYNPQPYPSYE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD GGAGTPSGTAAAVAADKYHRGSKALPTQQGLQGRPAFPGYGVQDSSPYPGRYAGEESLQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GGAGTPSGTAAAVAADKYHRGSKALPTQQGLQGRPAFPGYGVQDSSPYPGRYAGEESLQA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD WGAPQPPPPQPQPLPAGVAKYDENLMKKTAVPPSRQYAEQGAQVPFRTHSLHVQQPPPPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WGAPQPPPPQPQPLPAGVAKYDENLMKKTAVPPSRQYAEQGAQVPFRTHSLHVQQPPPPQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD QPLAYPKLQRQKLQNDIASPLPFPQGTHFPQHSQSFPTSSTYSSSVQGGGQGAHSYKSCT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QPLAYPKLQRQKLQNDIASPLPFPQGTHFPQHSQSFPTSSTYSSSVQGGGQGAHSYKSCT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD APTAQPHDRPLTASSSLAPGQRVQNLHAYQSGRLSYDQQQQQQQQQQQQQQALQSRHHAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 APTAQPHDRPLTASSSLAPGQRVQNLHAYQSGRLSYDQQQQQQQQQQQQQQALQSRHHAQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD ETLHYQNLAKYQHYGQQGQGYCQPDAAVRTPEQYYQTFSPSSSHSPARSVGRSPSYSSTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ETLHYQNLAKYQHYGQQGQGYCQPDAAVRTPEQYYQTFSPSSSHSPARSVGRSPSYSSTP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD SPLMPNLENFPYSQQPLSTGAFPAGITDHSHFMPLLNPSPTDATSSVDTQAGNCKPLQKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SPLMPNLENFPYSQQPLSTGAFPAGITDHSHFMPLLNPSPTDATSSVDTQAGNCKPLQKD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD KLPENLLSDLSLQSLTALTSQVENISNTVQQLLLSKAAVPQKKGVKNLVSRTPEQHKSQH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KLPENLLSDLSLQSLTALTSQVENISNTVQQLLLSKAAVPQKKGVKNLVSRTPEQHKSQH
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD CSPEGSGYSAEPAGTPLSEPPSSTPQSTHAEPQEADYLSGSEDPLERSFLYCNQARGSPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CSPEGSGYSAEPAGTPLSEPPSSTPQSTHAEPQEADYLSGSEDPLERSFLYCNQARGSPA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD RVNSNSKAKPESVSTCSVTSPDDMSTKSDDSFQSLHGSLPLDSFSKFVAGERDCPRLLLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RVNSNSKAKPESVSTCSVTSPDDMSTKSDDSFQSLHGSLPLDSFSKFVAGERDCPRLLLS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD ALAQEDLASEILGLQEAIGEKADKAWAEAPSLVKDSSKPPFSLENHSACLDSVAKSAWPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALAQEDLASEILGLQEAIGEKADKAWAEAPSLVKDSSKPPFSLENHSACLDSVAKSAWPR
              610       620       630       640       650       660

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pF1KSD PGEPEALPDSLQLDKGGNAKDFSPGLFEDPSVAFATPDPKKTTGPLSFGTKPTLGVPAPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PGEPEALPDSLQLDKGGNAKDFSPGLFEDPSVAFATPDPKKTTGPLSFGTKPTLGVPAPD
              670       680       690       700       710       720

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pF1KSD PTTAAFDCFPDTTAASSADSANPFAWPEENLGDACPRWGLHPGELTKGLEQGGKASDGIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PTTAAFDCFPDTTAASSADSANPFAWPEENLGDACPRWGLHPGELTKGLEQGGKASDGIS
              730       740       750       760       770       780

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pF1KSD KGDTHEASACLGFQEEDPPGEKVASLPGDFKQEEVGGVKEEAGGLLQCPEVAKADRWLED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KGDTHEASACLGFQEEDPPGEKVASLPGDFKQEEVGGVKEEAGGLLQCPEVAKADRWLED
              790       800       810       820       830       840

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pF1KSD SRHCCSTADFGDLPLLPPTSRKEDLEAEEEYSSLCELLGSPEQRPGMQDPLSPKAPLICT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SRHCCSTADFGDLPLLPPTSRKEDLEAEEEYSSLCELLGSPEQRPGMQDPLSPKAPLICT
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pF1KSD KEEVEEVLDSKAGWGSPCHLSGESVILLGPTVGTESKVQSWFESSLSHMKPGEEGPDGER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KEEVEEVLDSKAGWGSPCHLSGESVILLGPTVGTESKVQSWFESSLSHMKPGEEGPDGER
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pF1KSD APGDSTTSDASLAQKPNKPAVPEAPIAKKEPVPRGKSLRSRRVHRGLPEAEDSPCRAPVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 APGDSTTSDASLAQKPNKPAVPEAPIAKKEPVPRGKSLRSRRVHRGLPEAEDSPCRAPVL
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pF1KSD PKDLLLPESCTGPPQGQMEGAGAPGRGASEGLPRMCTRSLTALSEPRTPGPPGLTTTPAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PKDLLLPESCTGPPQGQMEGAGAPGRGASEGLPRMCTRSLTALSEPRTPGPPGLTTTPAP
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

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pF1KSD PDKLGGKQRAAFKSGKRVGKPSPKAASSPSNPAALPVASDSSPMGSKTKETDSPSTPGKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PDKLGGKQRAAFKSGKRVGKPSPKAASSPSNPAALPVASDSSPMGSKTKETDSPSTPGKD
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pF1KSD QRSMILRSRTKTQEIFHSKRRRPSEGRLPNCRATKKLLDNSHLPATFKVSSSPQKEGRVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QRSMILRSRTKTQEIFHSKRRRPSEGRLPNCRATKKLLDNSHLPATFKVSSSPQKEGRVS
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pF1KSD QRARVPKPGAGSKLSDRPLHALKRKSAFMAPVPTKKRNLVLRSRSSSSSNASGNGGDGKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QRARVPKPGAGSKLSDRPLHALKRKSAFMAPVPTKKRNLVLRSRSSSSSNASGNGGDGKE
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pF1KSD ERPEGSPTLFKRMSSPKKAKPTKGNGEPATKLPPPETPDACLKLASRAAFQGAMKTKVLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ERPEGSPTLFKRMSSPKKAKPTKGNGEPATKLPPPETPDACLKLASRAAFQGAMKTKVLP
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

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pF1KSD PRKGRGLKLEAIVQKITSPSLKKFACKAPGASPGNPLSPSLSDKDRGLKGAGGSPVGVEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PRKGRGLKLEAIVQKITSPSLKKFACKAPGASPGNPLSPSLSDKDRGLKGAGGSPVGVEE
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

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pF1KSD GLVNVGTGQKLPTSGADPLCRNPTNRSLKGKLMNSKKLSSTDCFKTEAFTSPEALQPGGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLVNVGTGQKLPTSGADPLCRNPTNRSLKGKLMNSKKLSSTDCFKTEAFTSPEALQPGGT
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pF1KSD ALAPKKRSRKGRAGAHGLSKGPLEKRPYLGPALLLTPRDRASGTQGASEDNSGGGGKKPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALAPKKRSRKGRAGAHGLSKGPLEKRPYLGPALLLTPRDRASGTQGASEDNSGGGGKKPK
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             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KSD MEELGLASQPPEGRPCQPQTRAQKQPGHTNYSSYSKRKRLTRGRAKNTTSSPCKGRAKRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MEELGLASQPPEGRPCQPQTRAQKQPGHTNYSSYSKRKRLTRGRAKNTTSSPCKGRAKRR
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pF1KSD RQQQVLPLDPAEPEIRLKYISSCKRLRSDSRTPAFSPLEPSLGAQNPRSGQNAPPAPADA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.                      
XP_016 RQQQVLPLDPAEPEIRLKYISSCKRLRSDSRTPAFSPFVRVEKRDAFTTICTVVNSPGDA
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pF1KSD RPLCTTRDRRAYSAREQGQR                                        
                                                                   
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             1630      1640      1650      1660      1670      1680

>>XP_016879517 (OMIM: 182290,607642) PREDICTED: retinoic  (1967 aa)
 initn: 10906 init1: 10906 opt: 10906  Z-score: 4972.6  bits: 933.3 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 10906; 99.9% identity (100.0% similar) in 1598 aa overlap (1-1598:1-1598)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MQSFRERCGFHGKQQNYQQTSQETSRLENYRQPSQAGLSCDRQRLLAKDYYNPQPYPSYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MQSFRERCGFHGKQQNYQQTSQETSRLENYRQPSQAGLSCDRQRLLAKDYYNPQPYPSYE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD GGAGTPSGTAAAVAADKYHRGSKALPTQQGLQGRPAFPGYGVQDSSPYPGRYAGEESLQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GGAGTPSGTAAAVAADKYHRGSKALPTQQGLQGRPAFPGYGVQDSSPYPGRYAGEESLQA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WGAPQPPPPQPQPLPAGVAKYDENLMKKTAVPPSRQYAEQGAQVPFRTHSLHVQQPPPPQ
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pF1KSD QPLAYPKLQRQKLQNDIASPLPFPQGTHFPQHSQSFPTSSTYSSSVQGGGQGAHSYKSCT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QPLAYPKLQRQKLQNDIASPLPFPQGTHFPQHSQSFPTSSTYSSSVQGGGQGAHSYKSCT
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pF1KSD APTAQPHDRPLTASSSLAPGQRVQNLHAYQSGRLSYDQQQQQQQQQQQQQQALQSRHHAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 APTAQPHDRPLTASSSLAPGQRVQNLHAYQSGRLSYDQQQQQQQQQQQQQQALQSRHHAQ
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pF1KSD ETLHYQNLAKYQHYGQQGQGYCQPDAAVRTPEQYYQTFSPSSSHSPARSVGRSPSYSSTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ETLHYQNLAKYQHYGQQGQGYCQPDAAVRTPEQYYQTFSPSSSHSPARSVGRSPSYSSTP
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pF1KSD SPLMPNLENFPYSQQPLSTGAFPAGITDHSHFMPLLNPSPTDATSSVDTQAGNCKPLQKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SPLMPNLENFPYSQQPLSTGAFPAGITDHSHFMPLLNPSPTDATSSVDTQAGNCKPLQKD
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pF1KSD KLPENLLSDLSLQSLTALTSQVENISNTVQQLLLSKAAVPQKKGVKNLVSRTPEQHKSQH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KLPENLLSDLSLQSLTALTSQVENISNTVQQLLLSKAAVPQKKGVKNLVSRTPEQHKSQH
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pF1KSD CSPEGSGYSAEPAGTPLSEPPSSTPQSTHAEPQEADYLSGSEDPLERSFLYCNQARGSPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CSPEGSGYSAEPAGTPLSEPPSSTPQSTHAEPQEADYLSGSEDPLERSFLYCNQARGSPA
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pF1KSD RVNSNSKAKPESVSTCSVTSPDDMSTKSDDSFQSLHGSLPLDSFSKFVAGERDCPRLLLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RVNSNSKAKPESVSTCSVTSPDDMSTKSDDSFQSLHGSLPLDSFSKFVAGERDCPRLLLS
              550       560       570       580       590       600

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pF1KSD ALAQEDLASEILGLQEAIGEKADKAWAEAPSLVKDSSKPPFSLENHSACLDSVAKSAWPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALAQEDLASEILGLQEAIGEKADKAWAEAPSLVKDSSKPPFSLENHSACLDSVAKSAWPR
              610       620       630       640       650       660

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pF1KSD PGEPEALPDSLQLDKGGNAKDFSPGLFEDPSVAFATPDPKKTTGPLSFGTKPTLGVPAPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PGEPEALPDSLQLDKGGNAKDFSPGLFEDPSVAFATPDPKKTTGPLSFGTKPTLGVPAPD
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pF1KSD PTTAAFDCFPDTTAASSADSANPFAWPEENLGDACPRWGLHPGELTKGLEQGGKASDGIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PTTAAFDCFPDTTAASSADSANPFAWPEENLGDACPRWGLHPGELTKGLEQGGKASDGIS
              730       740       750       760       770       780

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pF1KSD KGDTHEASACLGFQEEDPPGEKVASLPGDFKQEEVGGVKEEAGGLLQCPEVAKADRWLED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KGDTHEASACLGFQEEDPPGEKVASLPGDFKQEEVGGVKEEAGGLLQCPEVAKADRWLED
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD SRHCCSTADFGDLPLLPPTSRKEDLEAEEEYSSLCELLGSPEQRPGMQDPLSPKAPLICT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SRHCCSTADFGDLPLLPPTSRKEDLEAEEEYSSLCELLGSPEQRPGMQDPLSPKAPLICT
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD KEEVEEVLDSKAGWGSPCHLSGESVILLGPTVGTESKVQSWFESSLSHMKPGEEGPDGER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KEEVEEVLDSKAGWGSPCHLSGESVILLGPTVGTESKVQSWFESSLSHMKPGEEGPDGER
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD APGDSTTSDASLAQKPNKPAVPEAPIAKKEPVPRGKSLRSRRVHRGLPEAEDSPCRAPVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 APGDSTTSDASLAQKPNKPAVPEAPIAKKEPVPRGKSLRSRRVHRGLPEAEDSPCRAPVL
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD PKDLLLPESCTGPPQGQMEGAGAPGRGASEGLPRMCTRSLTALSEPRTPGPPGLTTTPAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PKDLLLPESCTGPPQGQMEGAGAPGRGASEGLPRMCTRSLTALSEPRTPGPPGLTTTPAP
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD PDKLGGKQRAAFKSGKRVGKPSPKAASSPSNPAALPVASDSSPMGSKTKETDSPSTPGKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PDKLGGKQRAAFKSGKRVGKPSPKAASSPSNPAALPVASDSSPMGSKTKETDSPSTPGKD
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD QRSMILRSRTKTQEIFHSKRRRPSEGRLPNCRATKKLLDNSHLPATFKVSSSPQKEGRVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QRSMILRSRTKTQEIFHSKRRRPSEGRLPNCRATKKLLDNSHLPATFKVSSSPQKEGRVS
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD QRARVPKPGAGSKLSDRPLHALKRKSAFMAPVPTKKRNLVLRSRSSSSSNASGNGGDGKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QRARVPKPGAGSKLSDRPLHALKRKSAFMAPVPTKKRNLVLRSRSSSSSNASGNGGDGKE
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD ERPEGSPTLFKRMSSPKKAKPTKGNGEPATKLPPPETPDACLKLASRAAFQGAMKTKVLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ERPEGSPTLFKRMSSPKKAKPTKGNGEPATKLPPPETPDACLKLASRAAFQGAMKTKVLP
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD PRKGRGLKLEAIVQKITSPSLKKFACKAPGASPGNPLSPSLSDKDRGLKGAGGSPVGVEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PRKGRGLKLEAIVQKITSPSLKKFACKAPGASPGNPLSPSLSDKDRGLKGAGGSPVGVEE
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KSD GLVNVGTGQKLPTSGADPLCRNPTNRSLKGKLMNSKKLSSTDCFKTEAFTSPEALQPGGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLVNVGTGQKLPTSGADPLCRNPTNRSLKGKLMNSKKLSSTDCFKTEAFTSPEALQPGGT
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KSD ALAPKKRSRKGRAGAHGLSKGPLEKRPYLGPALLLTPRDRASGTQGASEDNSGGGGKKPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALAPKKRSRKGRAGAHGLSKGPLEKRPYLGPALLLTPRDRASGTQGASEDNSGGGGKKPK
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KSD MEELGLASQPPEGRPCQPQTRAQKQPGHTNYSSYSKRKRLTRGRAKNTTSSPCKGRAKRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MEELGLASQPPEGRPCQPQTRAQKQPGHTNYSSYSKRKRLTRGRAKNTTSSPCKGRAKRR
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KSD RQQQVLPLDPAEPEIRLKYISSCKRLRSDSRTPAFSPLEPSLGAQNPRSGQNAPPAPADA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.                      
XP_016 RQQQVLPLDPAEPEIRLKYISSCKRLRSDSRTPAFSPFVRVEKRDAFTTICTVVNSPGDA
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640                                        
pF1KSD RPLCTTRDRRAYSAREQGQR                                        
                                                                   
XP_016 PKPHRKPSSSASSSSSSSSFSLDAAGASLATLPGGSILQPRPSLPLSSTMHLGPVVSKAL
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

>>XP_016879514 (OMIM: 182290,607642) PREDICTED: retinoic  (1967 aa)
 initn: 10906 init1: 10906 opt: 10906  Z-score: 4972.6  bits: 933.3 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 10906; 99.9% identity (100.0% similar) in 1598 aa overlap (1-1598:1-1598)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MQSFRERCGFHGKQQNYQQTSQETSRLENYRQPSQAGLSCDRQRLLAKDYYNPQPYPSYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MQSFRERCGFHGKQQNYQQTSQETSRLENYRQPSQAGLSCDRQRLLAKDYYNPQPYPSYE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD GGAGTPSGTAAAVAADKYHRGSKALPTQQGLQGRPAFPGYGVQDSSPYPGRYAGEESLQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GGAGTPSGTAAAVAADKYHRGSKALPTQQGLQGRPAFPGYGVQDSSPYPGRYAGEESLQA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD WGAPQPPPPQPQPLPAGVAKYDENLMKKTAVPPSRQYAEQGAQVPFRTHSLHVQQPPPPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WGAPQPPPPQPQPLPAGVAKYDENLMKKTAVPPSRQYAEQGAQVPFRTHSLHVQQPPPPQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD QPLAYPKLQRQKLQNDIASPLPFPQGTHFPQHSQSFPTSSTYSSSVQGGGQGAHSYKSCT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QPLAYPKLQRQKLQNDIASPLPFPQGTHFPQHSQSFPTSSTYSSSVQGGGQGAHSYKSCT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD APTAQPHDRPLTASSSLAPGQRVQNLHAYQSGRLSYDQQQQQQQQQQQQQQALQSRHHAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 APTAQPHDRPLTASSSLAPGQRVQNLHAYQSGRLSYDQQQQQQQQQQQQQQALQSRHHAQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD ETLHYQNLAKYQHYGQQGQGYCQPDAAVRTPEQYYQTFSPSSSHSPARSVGRSPSYSSTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ETLHYQNLAKYQHYGQQGQGYCQPDAAVRTPEQYYQTFSPSSSHSPARSVGRSPSYSSTP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD SPLMPNLENFPYSQQPLSTGAFPAGITDHSHFMPLLNPSPTDATSSVDTQAGNCKPLQKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SPLMPNLENFPYSQQPLSTGAFPAGITDHSHFMPLLNPSPTDATSSVDTQAGNCKPLQKD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD KLPENLLSDLSLQSLTALTSQVENISNTVQQLLLSKAAVPQKKGVKNLVSRTPEQHKSQH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KLPENLLSDLSLQSLTALTSQVENISNTVQQLLLSKAAVPQKKGVKNLVSRTPEQHKSQH
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD CSPEGSGYSAEPAGTPLSEPPSSTPQSTHAEPQEADYLSGSEDPLERSFLYCNQARGSPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CSPEGSGYSAEPAGTPLSEPPSSTPQSTHAEPQEADYLSGSEDPLERSFLYCNQARGSPA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD RVNSNSKAKPESVSTCSVTSPDDMSTKSDDSFQSLHGSLPLDSFSKFVAGERDCPRLLLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RVNSNSKAKPESVSTCSVTSPDDMSTKSDDSFQSLHGSLPLDSFSKFVAGERDCPRLLLS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD ALAQEDLASEILGLQEAIGEKADKAWAEAPSLVKDSSKPPFSLENHSACLDSVAKSAWPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALAQEDLASEILGLQEAIGEKADKAWAEAPSLVKDSSKPPFSLENHSACLDSVAKSAWPR
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD PGEPEALPDSLQLDKGGNAKDFSPGLFEDPSVAFATPDPKKTTGPLSFGTKPTLGVPAPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PGEPEALPDSLQLDKGGNAKDFSPGLFEDPSVAFATPDPKKTTGPLSFGTKPTLGVPAPD
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD PTTAAFDCFPDTTAASSADSANPFAWPEENLGDACPRWGLHPGELTKGLEQGGKASDGIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PTTAAFDCFPDTTAASSADSANPFAWPEENLGDACPRWGLHPGELTKGLEQGGKASDGIS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD KGDTHEASACLGFQEEDPPGEKVASLPGDFKQEEVGGVKEEAGGLLQCPEVAKADRWLED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KGDTHEASACLGFQEEDPPGEKVASLPGDFKQEEVGGVKEEAGGLLQCPEVAKADRWLED
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD SRHCCSTADFGDLPLLPPTSRKEDLEAEEEYSSLCELLGSPEQRPGMQDPLSPKAPLICT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SRHCCSTADFGDLPLLPPTSRKEDLEAEEEYSSLCELLGSPEQRPGMQDPLSPKAPLICT
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD KEEVEEVLDSKAGWGSPCHLSGESVILLGPTVGTESKVQSWFESSLSHMKPGEEGPDGER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KEEVEEVLDSKAGWGSPCHLSGESVILLGPTVGTESKVQSWFESSLSHMKPGEEGPDGER
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD APGDSTTSDASLAQKPNKPAVPEAPIAKKEPVPRGKSLRSRRVHRGLPEAEDSPCRAPVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 APGDSTTSDASLAQKPNKPAVPEAPIAKKEPVPRGKSLRSRRVHRGLPEAEDSPCRAPVL
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD PKDLLLPESCTGPPQGQMEGAGAPGRGASEGLPRMCTRSLTALSEPRTPGPPGLTTTPAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PKDLLLPESCTGPPQGQMEGAGAPGRGASEGLPRMCTRSLTALSEPRTPGPPGLTTTPAP
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD PDKLGGKQRAAFKSGKRVGKPSPKAASSPSNPAALPVASDSSPMGSKTKETDSPSTPGKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PDKLGGKQRAAFKSGKRVGKPSPKAASSPSNPAALPVASDSSPMGSKTKETDSPSTPGKD
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD QRSMILRSRTKTQEIFHSKRRRPSEGRLPNCRATKKLLDNSHLPATFKVSSSPQKEGRVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QRSMILRSRTKTQEIFHSKRRRPSEGRLPNCRATKKLLDNSHLPATFKVSSSPQKEGRVS
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD QRARVPKPGAGSKLSDRPLHALKRKSAFMAPVPTKKRNLVLRSRSSSSSNASGNGGDGKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QRARVPKPGAGSKLSDRPLHALKRKSAFMAPVPTKKRNLVLRSRSSSSSNASGNGGDGKE
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pF1KSD VNVGTGQKLPTSG--ADPLCRNPTNRSL--KGKLMNSK---KLSSTDCFKTE--AFTSPE
       : :  ..    .:  :. :  .:.:. :  .  :  :.   . :  :  :::  : :   
XP_011 VAVQDADIEKRKGEVASDLV-SPANQELHVEKPLPRSSEEWRGSVDDKVKTETHAETVTA
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pF1KSD ALQPGG---TALAPKKRSRKGRAGAHGLSKGPL--EKRPYLGPALLLTPR------DRAS
       . .: :   .. . :  : .::  .   . .::       . :. .:.:.      .. .
XP_011 GKEPPGAMTSTTSQKPGSNQGRPDGSLGGTAPLIFPDSKNVPPVGILAPEANPKAEEKEN
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        :   :  . :    :   .::: : . .: . .:  . .:  :  .  . : : ..   
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         :..:  : : :   ..:     ..:. .:..:. .: ::::.::: ..    ..:...
XP_011 KPKKQRQRRERRK-PGAQP-----RKRKTKQAVPIVEPQEPEIKLKYATQ-PLDKTDAKN
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NP_852 PVQSYGPPQGSSFGNQYGSEGHVGQFQAQHSGLGGVSHYQQDYTGPFS-PGSAQYQQQAS
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pF1KSD FPQHSQSFPTSSTYSS--SVQGGGQGAHSYK-SCTAPTAQPHDRPLTASSSLAPGQRVQN
       : :: ::  .::. ::  : :  .:...::  : .. ... ..   ..:.. : :  .:.
NP_852 FGQHYQSSASSSSSSSFPSPQRFSQSGQSYDGSYNVNAGSQYEGHNVGSNAQAYG--TQS
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NP_852 NYSYQPQSMKNFEQAKIPQGTQQGQQQQQPQQQQHPSQHVMQYTNAATKLPLQSQVGQ-Y
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NP_852 NQPEVPVRSPMQFHQNFSPISNPSPAASVVQSPSCSSTPSPLMQTGENLQCGQ-----GS
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NP_852 QVANLPNTVQHMLLSDALTPQKKTSK----RPSSSKKADSCTNSEGSSQPEEQLKSPMAE
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NP_852 SLDGGCSSSSEDQGERVRQLSGQSTSSDTTYKGGASEKAGSSPAQ---GAQNEPPRLNAS
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NP_852 KPGGQDKGSQEDDPAA---TQRPP---SNGGAKETSHASLPQPEPPGGGGSKGNKNGDNN
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NP_852 LEGTTRPNVLVSQTNELASR--GLLNKSIGSLLENPH------WGPWERKSSSTAPEMKQ
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       . :   :  :: ..: .   ::  :  ::  .: ..   .::   ..  ..   . :   
NP_852 INLTDYPIPRKFEIEPQ---SSAHEPGGSLSERRSVICDISPLRQIV--RDPGAHSLGHM
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NP_852 DHCHPPSIKHESYRGNASPGAATHDSLSDYGPQDSRPTPMRRVPGRVGGREGM-RGRS--
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pF1KSD SRRVHRGLPEAEDSP--CRAPVLPKDLLLPESCTGPPQGQMEGAGAPGRGASEGLPRMCT
         . :    . . ::   :.:      . :.  :   ...  .  .:    :: :    .
NP_852 PSQYHDFAEKLKMSPGRSRGPGGDPHHMNPHM-TFSERANRSSLHTPFSPNSETL----A
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NP_852 SAYHANTRAHAYGDPNAGLNSQLHYKRQMYQQQPEEYKDWSSGSAQGVIAAAQHRQEGPR
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NP_852 HGSQKLQESCWDLSRQTSPAKSSGPPGMSSQKRYGPPHETDGHGLAEATQSSKPGSVMLR
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NP_852 L----PGQEDHSSQNPLIMRRRVRSFISPIPSKRQSQDVKN---SSTEDKGRLLHSSKEG
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NP_852 ADKAFNSYAHLSHSQDIK-SIPKRDSSKDLPSPDSRN-C----PAVTLTSPAKTKILPPR
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pF1KSD KGRGLKLEAIVQKITSPSLKKFACKAPGASPGNPLSPSLSDKDRGLKGAGGSPVGVEEGL
       :::::::::::::::::.... : .  . . :. .  .:.:    :.  .: : :   : 
NP_852 KGRGLKLEAIVQKITSPNIRRSASSNSAEAGGDTV--TLDDI---LSLKSGPPEG---GS
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       . .: :   .. . :  : .::  .   . .::       . :. .:.:.      .. .
NP_852 GKEPPGAMTSTTSQKPGSNQGRPDGSLGGTAPLIFPDSKNVPPVGILAPEANPKAEEKEN
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NP_852 KPKKQRQRRERRK-PGAQP-----RKRKTKQAVPIVEPQEPEIKLKYATQ-PLDKTDAKN
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