seq1 = pF1KSDA1436.tfa, 2637 bp seq2 = pF1KSDA1436/gi568815597f_116810204.tfa (gi568815597f:116810204_117086964), 276761 bp >pF1KSDA1436 2637 >gi568815597f:116810204_117086964 (Chr1) 1-49 (100001-100049) 100% -> 50-418 (131512-131880) 100% -> 419-832 (134476-134889) 99% -> 833-1213 (138989-139369) 100% -> 1214-1639 (151040-151465) 100% -> 1640-2059 (156708-157127) 100% -> 2060-2167 (164013-164120) 100% -> 2168-2473 (174477-174782) 100% -> 2474-2637 (176598-176761) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGGGCGCCTGGCCTCGAGGCCGCTGCTGCTGGCGCTCCTGTCGTTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||> 100001 ATGGGGCGCCTGGCCTCGAGGCCGCTGCTGCTGGCGCTCCTGTCGTTGGG 50 . : . : . : . : . : 50 CTCTTTGCCGAGGGCGTGTGGTGAGAGTCCCCACAGCGACCC >>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 TG...CAGCTCTTTGCCGAGGGCGTGTGGTGAGAGTCCCCACAGCGACCC 100 . : . : . : . : . : 92 TGGTTCGAGTGGTGGGCACTGAGCTGGTCATCCCCTGCAACGTCAGTGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 131554 TGGTTCGAGTGGTGGGCACTGAGCTGGTCATCCCCTGCAACGTCAGTGAC 150 . : . : . : . : . : 142 TATGATGGCCCCAGCGAGCAAAACTTTGACTGGAGCTTCTCATCTTTGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 131604 TATGATGGCCCCAGCGAGCAAAACTTTGACTGGAGCTTCTCATCTTTGGG 200 . : . : . : . : . : 192 GAGCAGCTTTGTGGAGCTTGCAAGCACCTGGGAGGTGGGGTTCCCAGCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 131654 GAGCAGCTTTGTGGAGCTTGCAAGCACCTGGGAGGTGGGGTTCCCAGCCC 250 . : . : . : . : . : 242 AGCTGTACCAGGAGCGGCTGCAGAGGGGCGAGATCCTGTTAAGGCGGACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 131704 AGCTGTACCAGGAGCGGCTGCAGAGGGGCGAGATCCTGTTAAGGCGGACT 300 . : . : . : . : . : 292 GCCAACGACGCCGTGGAGCTCCACATAAAGAACGTCCAGCCTTCAGACCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 131754 GCCAACGACGCCGTGGAGCTCCACATAAAGAACGTCCAGCCTTCAGACCA 350 . : . : . : . : . : 342 AGGCCACTACAAATGTTCAACCCCCAGCACAGATGCCACTGTCCAGGGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 131804 AGGCCACTACAAATGTTCAACCCCCAGCACAGATGCCACTGTCCAGGGAA 400 . : . : . : . : . : 392 ACTATGAGGACACAGTGCAGGTTAAAG TGCTGGCCGACTCC |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||| 131854 ACTATGAGGACACAGTGCAGGTTAAAGGTA...CAGTGCTGGCCGACTCC 450 . : . : . : . : . : 433 CTGCACGTGGGCCCCAGCGCGCGGCCCCCGCCGAGCCTGAGCCTGCGGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 134490 CTGCACGTGGGCCCCAGCGCGCGGCCCCCGCCGAGCCTGAGCCTGCGGGA 500 . : . : . : . : . : 483 GGGGGAGCCCTTCGAGCTGCGCTGCACTGCCGCCTCCGCCTCGCCGCTGC ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| 134540 GGGGGAGCCCTTCGAGCTGCGCTGCACCGCCGCCTCCGCCTCGCCGCTGC 550 . : . : . : . : . : 533 ACACGCACCTGGCGCTGCTGTGGGAGGTGCACCGCGGCCCGGCCAGGCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 134590 ACACGCACCTGGCGCTGCTGTGGGAGGTGCACCGCGGCCCGGCCAGGCGG 600 . : . : . : . : . : 583 AGCGTCCTCGCCCTGACCCACGAGGGCAGGTTCCACCCGGGCCTGGGGTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 134640 AGCGTCCTCGCCCTGACCCACGAGGGCAGGTTCCACCCGGGCCTGGGGTA 650 . : . : . : . : . : 633 CGAGCAGCGCTACCACAGTGGGGACGTGCGCCTCGACACCGTGGGCAGCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 134690 CGAGCAGCGCTACCACAGTGGGGACGTGCGCCTCGACACCGTGGGCAGCG 700 . : . : . : . : . : 683 ACGCCTACCGCCTCTCAGTGTCCCGGGCTCTGTCTGCCGACCAGGGCTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 134740 ACGCCTACCGCCTCTCAGTGTCCCGGGCTCTGTCTGCCGACCAGGGCTCC 750 . : . : . : . : . : 733 TACAGGTGTATCGTCAGCGAGTGGATCGCCGAGCAGGGCAACTGGCAGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 134790 TACAGGTGTATCGTCAGCGAGTGGATCGCCGAGCAGGGCAACTGGCAGGA 800 . : . : . : . : . : 783 AATCCAAGAAAAGGCCGTGGAAGTTGCCACCGTGGTGATCCAGCCATCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 134840 AATCCAAGAAAAGGCCGTGGAAGTTGCCACCGTGGTGATCCAGCCATCAG 850 . : . : . : . : . : 833 TTCTGCGAGCAGCTGTGCCCAAGAATGTGTCTGTGGCTGAA >>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 134890 GTG...AAGTTCTGCGAGCAGCTGTGCCCAAGAATGTGTCTGTGGCTGAA 900 . : . : . : . : . : 874 GGAAAGGAACTGGACCTGACCTGTAACATCACAACAGACCGAGCCGATGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 139030 GGAAAGGAACTGGACCTGACCTGTAACATCACAACAGACCGAGCCGATGA 950 . : . : . : . : . : 924 CGTCCGGCCCGAGGTGACGTGGTCCTTCAGCAGGATGCCTGACAGCACCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 139080 CGTCCGGCCCGAGGTGACGTGGTCCTTCAGCAGGATGCCTGACAGCACCC 1000 . : . : . : . : . : 974 TACCTGGCTCCCGCGTGTTGGCGCGGCTTGACCGTGATTCCCTGGTGCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 139130 TACCTGGCTCCCGCGTGTTGGCGCGGCTTGACCGTGATTCCCTGGTGCAC 1050 . : . : . : . : . : 1024 AGCTCGCCTCATGTTGCTTTGAGTCATGTGGATGCACGCTCCTACCATTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 139180 AGCTCGCCTCATGTTGCTTTGAGTCATGTGGATGCACGCTCCTACCATTT 1100 . : . : . : . : . : 1074 ACTGGTTCGGGATGTTAGCAAAGAAAACTCTGGCTACTATTACTGCCACG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 139230 ACTGGTTCGGGATGTTAGCAAAGAAAACTCTGGCTACTATTACTGCCACG 1150 . : . : . : . : . : 1124 TGTCCCTGTGGGCACCCGGACACAACAGGAGCTGGCACAAAGTGGCAGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 139280 TGTCCCTGTGGGCACCCGGACACAACAGGAGCTGGCACAAAGTGGCAGAG 1200 . : . : . : . : . : 1174 GCCGTGTCTTCCCCAGCTGGTGTGGGTGTGACCTGGCTAG A ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>| 139330 GCCGTGTCTTCCCCAGCTGGTGTGGGTGTGACCTGGCTAGGTG...CAGA 1250 . : . : . : . : . : 1215 ACCAGACTACCAGGTGTACCTGAATGCTTCCAAGGTCCCCGGGTTTGCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 151041 ACCAGACTACCAGGTGTACCTGAATGCTTCCAAGGTCCCCGGGTTTGCGG 1300 . : . : . : . : . : 1265 ATGACCCCACAGAGCTGGCATGCCGGGTGGTGGACACGAAGAGTGGGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 151091 ATGACCCCACAGAGCTGGCATGCCGGGTGGTGGACACGAAGAGTGGGGAG 1350 . : . : . : . : . : 1315 GCGAATGTCCGATTCACGGTTTCGTGGTACTACAGGATGAACCGGCGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 151141 GCGAATGTCCGATTCACGGTTTCGTGGTACTACAGGATGAACCGGCGCAG 1400 . : . : . : . : . : 1365 CGACAATGTGGTGACCAGCGAGCTGCTTGCAGTCATGGACGGGGACTGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 151191 CGACAATGTGGTGACCAGCGAGCTGCTTGCAGTCATGGACGGGGACTGGA 1450 . : . : . : . : . : 1415 CGCTAAAATATGGAGAGAGGAGCAAGCAGCGGGCCCAGGATGGAGACTTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 151241 CGCTAAAATATGGAGAGAGGAGCAAGCAGCGGGCCCAGGATGGAGACTTT 1500 . : . : . : . : . : 1465 ATTTTTTCTAAGGAACATACAGACACGTTCAATTTCCGGATCCAAAGGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 151291 ATTTTTTCTAAGGAACATACAGACACGTTCAATTTCCGGATCCAAAGGAC 1550 . : . : . : . : . : 1515 TACAGAGGAAGACAGAGGCAATTATTACTGTGTTGTGTCTGCCTGGACCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 151341 TACAGAGGAAGACAGAGGCAATTATTACTGTGTTGTGTCTGCCTGGACCA 1600 . : . : . : . : . : 1565 AACAGCGGAACAACAGCTGGGTGAAAAGCAAGGATGTCTTCTCCAAGCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 151391 AACAGCGGAACAACAGCTGGGTGAAAAGCAAGGATGTCTTCTCCAAGCCT 1650 . : . : . : . : . : 1615 GTTAACATATTTTGGGCATTAGAAG ATTCCGTGCTTGTGGT |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||| 151441 GTTAACATATTTTGGGCATTAGAAGGTA...CAGATTCCGTGCTTGTGGT 1700 . : . : . : . : . : 1656 GAAGGCGAGGCAGCCAAAGCCTTTCTTTGCTGCCGGAAATACATTTGAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 156724 GAAGGCGAGGCAGCCAAAGCCTTTCTTTGCTGCCGGAAATACATTTGAGA 1750 . : . : . : . : . : 1706 TGACTTGCAAAGTATCTTCCAAGAATATTAAGTCGCCACGCTACTCTGTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 156774 TGACTTGCAAAGTATCTTCCAAGAATATTAAGTCGCCACGCTACTCTGTT 1800 . : . : . : . : . : 1756 CTCATCATGGCTGAGAAGCCTGTCGGCGACCTCTCCAGTCCCAATGAAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 156824 CTCATCATGGCTGAGAAGCCTGTCGGCGACCTCTCCAGTCCCAATGAAAC 1850 . : . : . : . : . : 1806 GAAGTACATCATCTCTCTGGACCAGGATTCTGTGGTGAAGCTGGAGAATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 156874 GAAGTACATCATCTCTCTGGACCAGGATTCTGTGGTGAAGCTGGAGAATT 1900 . : . : . : . : . : 1856 GGACAGATGCATCACGGGTGGATGGCGTTGTTTTAGAAAAAGTGCAGGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 156924 GGACAGATGCATCACGGGTGGATGGCGTTGTTTTAGAAAAAGTGCAGGAG 1950 . : . : . : . : . : 1906 GATGAGTTCCGCTATCGAATGTACCAGACTCAGGTCTCAGACGCAGGGCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 156974 GATGAGTTCCGCTATCGAATGTACCAGACTCAGGTCTCAGACGCAGGGCT 2000 . : . : . : . : . : 1956 GTACCGCTGCATGGTGACAGCCTGGTCTCCTGTCAGGGGCAGCCTTTGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 157024 GTACCGCTGCATGGTGACAGCCTGGTCTCCTGTCAGGGGCAGCCTTTGGC 2050 . : . : . : . : . : 2006 GAGAAGCAGCAACCAGTCTCTCCAATCCTATTGAGATAGACTTCCAAACC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 157074 GAGAAGCAGCAACCAGTCTCTCCAATCCTATTGAGATAGACTTCCAAACC 2100 . : . : . : . : . : 2056 TCAG GTCCTATATTTAATGCTTCTGTGCATTCAGACACACC ||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 157124 TCAGGTG...CAGGTCCTATATTTAATGCTTCTGTGCATTCAGACACACC 2150 . : . : . : . : . : 2097 ATCAGTAATTCGGGGAGATCTGATCAAATTGTTCTGTATCATCACTGTCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 164050 ATCAGTAATTCGGGGAGATCTGATCAAATTGTTCTGTATCATCACTGTCG 2200 . : . : . : . : . : 2147 AGGGAGCAGCACTGGATCCAG ATGACATGGCCTTTGATGTG |||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||| 164100 AGGGAGCAGCACTGGATCCAGGTA...TAGATGACATGGCCTTTGATGTG 2250 . : . : . : . : . : 2188 TCCTGGTTTGCGGTGCACTCTTTTGGCCTGGACAAGGCTCCTGTGCTCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 174497 TCCTGGTTTGCGGTGCACTCTTTTGGCCTGGACAAGGCTCCTGTGCTCCT 2300 . : . : . : . : . : 2238 GTCTTCCCTGGATCGGAAGGGCATCGTGACCACCTCCCGGAGGGACTGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 174547 GTCTTCCCTGGATCGGAAGGGCATCGTGACCACCTCCCGGAGGGACTGGA 2350 . : . : . : . : . : 2288 AGAGCGACCTCAGCCTGGAGCGCGTGAGTGTGCTGGAATTCTTGCTGCAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 174597 AGAGCGACCTCAGCCTGGAGCGCGTGAGTGTGCTGGAATTCTTGCTGCAA 2400 . : . : . : . : . : 2338 GTGCATGGCTCCGAGGACCAGGACTTTGGCAACTACTACTGTTCCGTGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 174647 GTGCATGGCTCCGAGGACCAGGACTTTGGCAACTACTACTGTTCCGTGAC 2450 . : . : . : . : . : 2388 TCCATGGGTGAAGTCACCAACAGGTTCCTGGCAGAAGGAGGCAGAGATCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 174697 TCCATGGGTGAAGTCACCAACAGGTTCCTGGCAGAAGGAGGCAGAGATCC 2500 . : . : . : . : . : 2438 ACTCCAAGCCCGTTTTTATAACTGTGAAGATGGATG TGCTG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||| 174747 ACTCCAAGCCCGTTTTTATAACTGTGAAGATGGATGGTA...CAGTGCTG 2550 . : . : . : . : . : 2479 AACGCCTTCAAGTATCCCTTGCTGATCGGCGTCGGTCTGTCCACGGTCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 176603 AACGCCTTCAAGTATCCCTTGCTGATCGGCGTCGGTCTGTCCACGGTCAT 2600 . : . : . : . : . : 2529 CGGGCTCCTGTCCTGTCTCATCGGGTACTGCAGCTCCCACTGGTGTTGTA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 176653 CGGGCTCCTGTCCTGTCTCATCGGGTACTGCAGCTCCCACTGGTGTTGTA 2650 . : . : . : . : . : 2579 AGAAGGAGGTTCAGGAGACACGGCGCGAGCGCCGCAGGCTCATGTCGATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 176703 AGAAGGAGGTTCAGGAGACACGGCGCGAGCGCCGCAGGCTCATGTCGATG 2700 . 2629 GAGATGGAC ||||||||| 176753 GAGATGGAC