seq1 = pF1KSDA1073.tfa, 1929 bp seq2 = pF1KSDA1073/gi568815587r_95735293.tfa (gi568815587r:95735293_96023954), 288662 bp >pF1KSDA1073 1929 >gi568815587r:95735293_96023954 (Chr11) (complement) 1-80 (100001-100080) 98% -> 81-186 (135694-135799) 100% -> 187-262 (158279-158354) 100% -> 263-357 (161589-161683) 100% -> 358-468 (161853-161963) 100% -> 469-570 (165323-165424) 100% -> 571-654 (166320-166403) 100% -> 655-804 (173206-173355) 100% -> 805-993 (174093-174281) 100% -> 994-1179 (176056-176241) 99% -> 1180-1386 (178796-179002) 100% -> 1387-1479 (182246-182338) 100% -> 1480-1593 (185748-185861) 100% -> 1594-1770 (187631-187807) 100% -> 1771-1929 (188504-188662) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGAGACGAGCTCGAGCTGCGAGAGTCTTGGCTCCCAGCCGGCGGCGGC ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGGAGAAGAGCTCGAGCTGCGAGAGTCTTGGCTCCCAGCCGGCGGCGGC 50 . : . : . : . : . : 51 TCGGCCGCCCAGCGTGGACTCCTTGTCCAG TGCCTCCACTT ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| 100051 TCGGCCGCCCAGCGTGGACTCCTTGTCCAGGTA...TAGTGCCTCCACTT 100 . : . : . : . : . : 92 CTCATTCAGAGAATTCAGTGCATACAAAATCAGCTTCTGTTGTATCATCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 135705 CTCATTCAGAGAATTCAGTGCATACAAAATCAGCTTCTGTTGTATCATCA 150 . : . : . : . : . : 142 GATTCCATTTCAACTTCTGCCGACAACTTTTCTCCTGATTTGAGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.. 135755 GATTCCATTTCAACTTCTGCCGACAACTTTTCTCCTGATTTGAGGGTA.. 200 . : . : . : . : . : 187 GTCCTGAGGGAGTCTAACAAGTTAGCAGAAATGGAAGAACCACCCT .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 135805 .CAGGTCCTGAGGGAGTCTAACAAGTTAGCAGAAATGGAAGAACCACCCT 250 . : . : . : . : . : 233 TGCTTCCAGGAGAAAATATTAAAGACATGG CCAAAGATGTA ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||| 158325 TGCTTCCAGGAGAAAATATTAAAGACATGGGTC...CAGCCAAAGATGTA 300 . : . : . : . : . : 274 ACTTATATATGTCCATTCACTGGCGCTGTACGAGGAACTCTGACTGTCAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 161600 ACTTATATATGTCCATTCACTGGCGCTGTACGAGGAACTCTGACTGTCAC 350 . : . : . : . : . : 324 GAATTATAGGTTATATTTCAAAAGCATGGAACGG GATCCCC ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||| 161650 GAATTATAGGTTATATTTCAAAAGCATGGAACGGGTA...TAGGATCCCC 400 . : . : . : . : . : 365 CATTTGTTTTAGATGCTTCCCTTGGTGTGATAAATAGAGTAGAAAAAATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 161860 CATTTGTTTTAGATGCTTCCCTTGGTGTGATAAATAGAGTAGAAAAAATT 450 . : . : . : . : . : 415 GGTGGTGCTTCTAGTCGAGGTGAAAATTCTTATGGACTAGAAACTGTGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 161910 GGTGGTGCTTCTAGTCGAGGTGAAAATTCTTATGGACTAGAAACTGTGTG 500 . : . : . : . : . : 465 TAAG GATATTAGGAATTTACGATTTGCTCATAAACCTGAGG ||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 161960 TAAGGTA...TAGGATATTAGGAATTTACGATTTGCTCATAAACCTGAGG 550 . : . : . : . : . : 506 GGCGGACAAGAAGATCCATATTTGAGAATCTAATGAAATATGCATTTCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 165360 GGCGGACAAGAAGATCCATATTTGAGAATCTAATGAAATATGCATTTCCT 600 . : . : . : . : . : 556 GTCTCTAATAACCTG CCTCTTTTTGCTTTTGAATACAAAGA |||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||| 165410 GTCTCTAATAACCTGGTA...TAGCCTCTTTTTGCTTTTGAATACAAAGA 650 . : . : . : . : . : 597 AGTATTCCCTGAAAATGGGTGGAAGCTATATGACCCTCTTTTAGAGTATA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 166346 AGTATTCCCTGAAAATGGGTGGAAGCTATATGACCCTCTTTTAGAGTATA 700 . : . : . : . : . : 647 GAAGGCAG GGAATTCCAAATGAAAGCTGGAGAATAACAAAG ||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||| 166396 GAAGGCAGGTA...TAGGGAATTCCAAATGAAAGCTGGAGAATAACAAAG 750 . : . : . : . : . : 688 ATAAATGAACGATATGAACTTTGTGATACATACCCTGCCCTCCTGGTTGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 173239 ATAAATGAACGATATGAACTTTGTGATACATACCCTGCCCTCCTGGTTGT 800 . : . : . : . : . : 738 GCCAGCAAATATTCCTGATGAAGAATTAAAGAGAGTGGCATCCTTCAGAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 173289 GCCAGCAAATATTCCTGATGAAGAATTAAAGAGAGTGGCATCCTTCAGAT 850 . : . : . : . : . : 788 CAAGAGGCCGTATCCCA GTTTTATCATGGATTCATCCTGAA |||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||| 173339 CAAGAGGCCGTATCCCAGTA...AAGGTTTTATCATGGATTCATCCTGAA 900 . : . : . : . : . : 829 AGTCAAGCCACAATCACTCGGTGTAGCCAGCCCATGGTTGGAGTGAGTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 174117 AGTCAAGCCACAATCACTCGGTGTAGCCAGCCCATGGTTGGAGTGAGTGG 950 . : . : . : . : . : 879 AAAGCGAAGCAAAGAAGATGAAAAATACCTTCAAGCTATCATGGATTCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 174167 AAAGCGAAGCAAAGAAGATGAAAAATACCTTCAAGCTATCATGGATTCCA 1000 . : . : . : . : . : 929 ATGCCCAGTCTCACAAAATCTTTATATTTGATGCCCGGCCAAGTGTTAAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 174217 ATGCCCAGTCTCACAAAATCTTTATATTTGATGCCCGGCCAAGTGTTAAT 1050 . : . : . : . : . : 979 GCTGTTGCCAACAAG GCAAAGGGTGGAGGTTATGAAAGTGA |||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||| 174267 GCTGTTGCCAACAAGGTC...CAGGCAAAGGGTGGAGGTTATGAAAGTGA 1100 . : . : . : . : . : 1020 AGATGCCTATCAAAATGCTGAACTAGTTTTCCTGGATATCCACAATATTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 176082 AGATGCCTATCAAAATGCTGAACTAGTTTTCCTGGATATCCACAATATTC 1150 . : . : . : . : . : 1070 ATGTTATGAGAGAATCATTACGAAAACTTAAGGAGATTGTGTACCCCAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 176132 ATGTTATGAGAGAATCATTACGAAAACTTAAGGAGATTGTGTACCCCAAC 1200 . : . : . : . : . : 1120 ATTGAGGAAACTCACTGGTTGTCTAACTTGGAATCTACTCATTGGCTAGA ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 176182 ATTGAGGAAACCCACTGGTTGTCTAACTTGGAATCTACTCATTGGCTAGA 1250 . : . : . : . : . : 1170 ACATATTAAG CTTATTCTTGCAGGGGCTCTTAGGATTGCTG ||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| 176232 ACATATTAAGGTG...CAGCTTATTCTTGCAGGGGCTCTTAGGATTGCTG 1300 . : . : . : . : . : 1211 ACAAGGTAGAGTCAGGGAAGACGTCTGTGGTAGTGCATTGCAGTGATGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 178827 ACAAGGTAGAGTCAGGGAAGACGTCTGTGGTAGTGCATTGCAGTGATGGT 1350 . : . : . : . : . : 1261 TGGGATCGCACAGCTCAGCTCACTTCCCTTGCCATGCTCATGTTGGATGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 178877 TGGGATCGCACAGCTCAGCTCACTTCCCTTGCCATGCTCATGTTGGATGG 1400 . : . : . : . : . : 1311 ATACTATCGAACCATCCGAGGATTTGAAGTCCTTGTGGAGAAAGAATGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 178927 ATACTATCGAACCATCCGAGGATTTGAAGTCCTTGTGGAGAAAGAATGGC 1450 . : . : . : . : . : 1361 TAAGTTTTGGACATCGATTTCAACTA AGAGTTGGCCATGGA ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||| 178977 TAAGTTTTGGACATCGATTTCAACTAGTA...CAGAGAGTTGGCCATGGA 1500 . : . : . : . : . : 1402 GATAAGAACCATGCAGATGCAGACAGATCGCCTGTTTTTCTTCAATTTAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 182261 GATAAGAACCATGCAGATGCAGACAGATCGCCTGTTTTTCTTCAATTTAT 1550 . : . : . : . : . : 1452 TGACTGTGTCTGGCAGATGACAAGACAG TTTCCTACCGCAT ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||| 182311 TGACTGTGTCTGGCAGATGACAAGACAGGTA...CAGTTTCCTACCGCAT 1600 . : . : . : . : . : 1493 TTGAATTCAATGAGTATTTTCTCATTACCATTTTGGACCACCTATACAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 185761 TTGAATTCAATGAGTATTTTCTCATTACCATTTTGGACCACCTATACAGC 1650 . : . : . : . : . : 1543 TGCTTATTCGGAACATTCCTCTGTAATAGTGAACAACAGAGAGGAAAAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 185811 TGCTTATTCGGAACATTCCTCTGTAATAGTGAACAACAGAGAGGAAAAGA 1700 . : . : . : . : . : 1593 G AATCTTCCTAAAAGGACTGTGTCACTGTGGTCTTACATAA |>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 185861 GGTA...CAGAATCTTCCTAAAAGGACTGTGTCACTGTGGTCTTACATAA 1750 . : . : . : . : . : 1634 ACAGCCAGCTGGAAGACTTCACTAATCCTCTCTATGGGAGCTATTCCAAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 187671 ACAGCCAGCTGGAAGACTTCACTAATCCTCTCTATGGGAGCTATTCCAAT 1800 . : . : . : . : . : 1684 CATGTCCTTTATCCAGTAGCCAGCATGCGCCACCTAGAGCTCTGGGTGGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 187721 CATGTCCTTTATCCAGTAGCCAGCATGCGCCACCTAGAGCTCTGGGTGGG 1850 . : . : . : . : . : 1734 ATATTACATAAGGTGGAATCCACGGATGAAACCACAG GAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||| 187771 ATATTACATAAGGTGGAATCCACGGATGAAACCACAGGTA...CAGGAAC 1900 . : . : . : . : . : 1775 CTATTCACAACAGATACAAAGAACTTCTTGCTAAACGAGCAGAGCTTCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 188508 CTATTCACAACAGATACAAAGAACTTCTTGCTAAACGAGCAGAGCTTCAG 1950 . : . : . : . : . : 1825 AAAAAAGTAGAGGAACTACAGAGAGAGATTTCTAACCGATCAACCTCATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 188558 AAAAAAGTAGAGGAACTACAGAGAGAGATTTCTAACCGATCAACCTCATC 2000 . : . : . : . : . : 1875 CTCAGAGAGAGCCAGCTCTCCTGCACAGTGTGTCACTCCTGTCCAAACTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 188608 CTCAGAGAGAGCCAGCTCTCCTGCACAGTGTGTCACTCCTGTCCAAACTG 2050 . 1925 TTGTA ||||| 188658 TTGTA