Result of FASTA (omim) for pF1KSDA0587
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0587, 1134 aa
  1>>>pF1KSDA0587 1134 - 1134 aa - 1134 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5418+/-0.000582; mu= 21.0502+/- 0.036
 mean_var=66.3997+/-13.062, 0's: 0 Z-trim(105.3): 34  B-trim: 96 in 1/49
 Lambda= 0.157395
 statistics sampled from 13515 (13523) to 13515 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.492), E-opt: 0.2 (0.159), width:  16
 Scan time: 14.620

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_995314 (OMIM: 604891) nck-associated protein 1  (1134) 7370 1683.7       0
XP_006712263 (OMIM: 604891) PREDICTED: nck-associa (1132) 7342 1677.3       0
NP_038464 (OMIM: 604891) nck-associated protein 1  (1128) 7300 1667.8       0
XP_006712264 (OMIM: 604891) PREDICTED: nck-associa (1126) 7272 1661.4       0
NP_005328 (OMIM: 141180) nck-associated protein 1- (1127) 4570 1047.9       0
NP_001171905 (OMIM: 141180) nck-associated protein (1077) 4379 1004.5       0


>>NP_995314 (OMIM: 604891) nck-associated protein 1 isof  (1134 aa)
 initn: 7370 init1: 7370 opt: 7370  Z-score: 9035.2  bits: 1683.7 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 7370; 100.0% identity (100.0% similar) in 1134 aa overlap (1-1134:1-1134)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSRSVLQPSQQKLAEKLTILNDRGVGMLTRLYNIKKQGQVWKACGDPKAKPSYLIDKNLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 MSRSVLQPSQQKLAEKLTILNDRGVGMLTRLYNIKKQGQVWKACGDPKAKPSYLIDKNLE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD SAVKFIVRKFPAVETRNNNQQLAQLQKEKSEILKNLALYYFTFVDVMEFKDHVCELLNTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 SAVKFIVRKFPAVETRNNNQQLAQLQKEKSEILKNLALYYFTFVDVMEFKDHVCELLNTI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD DVCQVFFDITVNFDLTKNYLDLIITYTTLMILLSRIEERKAIIGLYNYAHEMTHGASDRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 DVCQVFFDITVNFDLTKNYLDLIITYTTLMILLSRIEERKAIIGLYNYAHEMTHGASDRE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD YPRLGQMIVDYENPLKKMMEEFVPHSKSLSDALISLQMVYPRRNLSADQWRNAQLLSLIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 YPRLGQMIVDYENPLKKMMEEFVPHSKSLSDALISLQMVYPRRNLSADQWRNAQLLSLIS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD APSTMLNPAQSDTMPCEYLSLDAMEKWIIFGFILCHGILNTDATALNLWKLALQSSSCLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 APSTMLNPAQSDTMPCEYLSLDAMEKWIIFGFILCHGILNTDATALNLWKLALQSSSCLS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD LFRDEVFHIHKAAEDLFVNIRGYNKRINDIRECKEAAVSHAGSMHRERRKFLRSALKELA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 LFRDEVFHIHKAAEDLFVNIRGYNKRINDIRECKEAAVSHAGSMHRERRKFLRSALKELA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD TVLSDQPGLLGPKALFVFMALSFARDEIIWLLRHADNMPKKSADDFIDKHIAELIFYMEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 TVLSDQPGLLGPKALFVFMALSFARDEIIWLLRHADNMPKKSADDFIDKHIAELIFYMEE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD LRAHVRKYGPVMQRYYVQYLSGFDAVVLNELVQNLSVCPEDESIIMSSFVNTMTSLSVKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 LRAHVRKYGPVMQRYYVQYLSGFDAVVLNELVQNLSVCPEDESIIMSSFVNTMTSLSVKQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD VEDGEVFDFRGMRLDWFRLQAYTSVSKASLGLADHRELGKMMNTIIFHTKMVDSLVEMLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 VEDGEVFDFRGMRLDWFRLQAYTSVSKASLGLADHRELGKMMNTIIFHTKMVDSLVEMLV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD ETSDLSIFCFYSRAFEKMFQQCLELPSQSRYSIAFPLLCTHFMSCTHELCPEERHHIGDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 ETSDLSIFCFYSRAFEKMFQQCLELPSQSRYSIAFPLLCTHFMSCTHELCPEERHHIGDR
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD SLSLCNMFLDEMAKQARNLITDICTEQCTLSDQLLPKHCAKTISQAVNKKSKKQTGKKGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 SLSLCNMFLDEMAKQARNLITDICTEQCTLSDQLLPKHCAKTISQAVNKKSKKQTGKKGE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD PEREKPGVESMRKNRLVVTNLDKLHTALSELCFSINYVPNMVVWEHTFTPREYLTSHLEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 PEREKPGVESMRKNRLVVTNLDKLHTALSELCFSINYVPNMVVWEHTFTPREYLTSHLEI
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD RFTKSIVGMTMYNQATQEIAKPSELLTSVRAYMTVLQSIENYVQIDITRVFNNVLLQQTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 RFTKSIVGMTMYNQATQEIAKPSELLTSVRAYMTVLQSIENYVQIDITRVFNNVLLQQTQ
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD HLDSHGEPTITSLYTNWYLETLLRQVSNGHIAYFPAMKAFVNLPTENELTFNAEEYSDIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 HLDSHGEPTITSLYTNWYLETLLRQVSNGHIAYFPAMKAFVNLPTENELTFNAEEYSDIS
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD EMRSLSELLGPYGMKFLSESLMWHISSQVAELKKLVVENVDVLTQMRTSFDKPDQMAALF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 EMRSLSELLGPYGMKFLSESLMWHISSQVAELKKLVVENVDVLTQMRTSFDKPDQMAALF
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD KRLSSVDSVLKRMTIIGVILSFRSLAQEALRDVLSYHIPFLVSSIEDFKDHIPRETDMKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 KRLSSVDSVLKRMTIIGVILSFRSLAQEALRDVLSYHIPFLVSSIEDFKDHIPRETDMKV
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD AMNVYELSSAAGLPCEIDPALVVALSSQKSENISPEEEYKIACLLMVFVAVSLPTLASNV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 AMNVYELSSAAGLPCEIDPALVVALSSQKSENISPEEEYKIACLLMVFVAVSLPTLASNV
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD MSQYSPAIEGHCNNIHCLAKAINQIAAALFTIHKGSIEDRLKEFLALASSSLLKIGQETD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 MSQYSPAIEGHCNNIHCLAKAINQIAAALFTIHKGSIEDRLKEFLALASSSLLKIGQETD
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130    
pF1KSD KTTTRNRESVYLLLDMIVQESPFLTMDLLESCFPYVLLRNAYHAVYKQSVTSSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_995 KTTTRNRESVYLLLDMIVQESPFLTMDLLESCFPYVLLRNAYHAVYKQSVTSSA
             1090      1100      1110      1120      1130    

>>XP_006712263 (OMIM: 604891) PREDICTED: nck-associated   (1132 aa)
 initn: 6848 init1: 6848 opt: 7342  Z-score: 9000.8  bits: 1677.3 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 7342; 99.8% identity (99.8% similar) in 1134 aa overlap (1-1134:1-1132)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSRSVLQPSQQKLAEKLTILNDRGVGMLTRLYNIKKQGQVWKACGDPKAKPSYLIDKNLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MSRSVLQPSQQKLAEKLTILNDRGVGMLTRLYNIKKQGQVWKACGDPKAKPSYLIDKNLE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD SAVKFIVRKFPAVETRNNNQQLAQLQKEKSEILKNLALYYFTFVDVMEFKDHVCELLNTI
       :::::::::::::::::::  :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SAVKFIVRKFPAVETRNNN--LAQLQKEKSEILKNLALYYFTFVDVMEFKDHVCELLNTI
               70          80        90       100       110        

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD DVCQVFFDITVNFDLTKNYLDLIITYTTLMILLSRIEERKAIIGLYNYAHEMTHGASDRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DVCQVFFDITVNFDLTKNYLDLIITYTTLMILLSRIEERKAIIGLYNYAHEMTHGASDRE
      120       130       140       150       160       170        

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD YPRLGQMIVDYENPLKKMMEEFVPHSKSLSDALISLQMVYPRRNLSADQWRNAQLLSLIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 YPRLGQMIVDYENPLKKMMEEFVPHSKSLSDALISLQMVYPRRNLSADQWRNAQLLSLIS
      180       190       200       210       220       230        

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD APSTMLNPAQSDTMPCEYLSLDAMEKWIIFGFILCHGILNTDATALNLWKLALQSSSCLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 APSTMLNPAQSDTMPCEYLSLDAMEKWIIFGFILCHGILNTDATALNLWKLALQSSSCLS
      240       250       260       270       280       290        

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD LFRDEVFHIHKAAEDLFVNIRGYNKRINDIRECKEAAVSHAGSMHRERRKFLRSALKELA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LFRDEVFHIHKAAEDLFVNIRGYNKRINDIRECKEAAVSHAGSMHRERRKFLRSALKELA
      300       310       320       330       340       350        

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD TVLSDQPGLLGPKALFVFMALSFARDEIIWLLRHADNMPKKSADDFIDKHIAELIFYMEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TVLSDQPGLLGPKALFVFMALSFARDEIIWLLRHADNMPKKSADDFIDKHIAELIFYMEE
      360       370       380       390       400       410        

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD LRAHVRKYGPVMQRYYVQYLSGFDAVVLNELVQNLSVCPEDESIIMSSFVNTMTSLSVKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LRAHVRKYGPVMQRYYVQYLSGFDAVVLNELVQNLSVCPEDESIIMSSFVNTMTSLSVKQ
      420       430       440       450       460       470        

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD VEDGEVFDFRGMRLDWFRLQAYTSVSKASLGLADHRELGKMMNTIIFHTKMVDSLVEMLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VEDGEVFDFRGMRLDWFRLQAYTSVSKASLGLADHRELGKMMNTIIFHTKMVDSLVEMLV
      480       490       500       510       520       530        

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD ETSDLSIFCFYSRAFEKMFQQCLELPSQSRYSIAFPLLCTHFMSCTHELCPEERHHIGDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ETSDLSIFCFYSRAFEKMFQQCLELPSQSRYSIAFPLLCTHFMSCTHELCPEERHHIGDR
      540       550       560       570       580       590        

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD SLSLCNMFLDEMAKQARNLITDICTEQCTLSDQLLPKHCAKTISQAVNKKSKKQTGKKGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SLSLCNMFLDEMAKQARNLITDICTEQCTLSDQLLPKHCAKTISQAVNKKSKKQTGKKGE
      600       610       620       630       640       650        

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD PEREKPGVESMRKNRLVVTNLDKLHTALSELCFSINYVPNMVVWEHTFTPREYLTSHLEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PEREKPGVESMRKNRLVVTNLDKLHTALSELCFSINYVPNMVVWEHTFTPREYLTSHLEI
      660       670       680       690       700       710        

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD RFTKSIVGMTMYNQATQEIAKPSELLTSVRAYMTVLQSIENYVQIDITRVFNNVLLQQTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RFTKSIVGMTMYNQATQEIAKPSELLTSVRAYMTVLQSIENYVQIDITRVFNNVLLQQTQ
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pF1KSD HLDSHGEPTITSLYTNWYLETLLRQVSNGHIAYFPAMKAFVNLPTENELTFNAEEYSDIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 HLDSHGEPTITSLYTNWYLETLLRQVSNGHIAYFPAMKAFVNLPTENELTFNAEEYSDIS
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pF1KSD EMRSLSELLGPYGMKFLSESLMWHISSQVAELKKLVVENVDVLTQMRTSFDKPDQMAALF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 EMRSLSELLGPYGMKFLSESLMWHISSQVAELKKLVVENVDVLTQMRTSFDKPDQMAALF
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KRLSSVDSVLKRMTIIGVILSFRSLAQEALRDVLSYHIPFLVSSIEDFKDHIPRETDMKV
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AMNVYELSSAAGLPCEIDPALVVALSSQKSENISPEEEYKIACLLMVFVAVSLPTLASNV
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pF1KSD MSQYSPAIEGHCNNIHCLAKAINQIAAALFTIHKGSIEDRLKEFLALASSSLLKIGQETD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MSQYSPAIEGHCNNIHCLAKAINQIAAALFTIHKGSIEDRLKEFLALASSSLLKIGQETD
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pF1KSD KTTTRNRESVYLLLDMIVQESPFLTMDLLESCFPYVLLRNAYHAVYKQSVTSSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KTTTRNRESVYLLLDMIVQESPFLTMDLLESCFPYVLLRNAYHAVYKQSVTSSA
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>>NP_038464 (OMIM: 604891) nck-associated protein 1 isof  (1128 aa)
 initn: 7107 init1: 7107 opt: 7300  Z-score: 8949.3  bits: 1667.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 7300; 99.5% identity (99.5% similar) in 1134 aa overlap (1-1134:1-1128)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSRSVLQPSQQKLAEKLTILNDRGVGMLTRLYNIKKQGQVWKACGDPKAKPSYLIDKNLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::      ::::::::::::::::::
NP_038 MSRSVLQPSQQKLAEKLTILNDRGVGMLTRLYNIKK------ACGDPKAKPSYLIDKNLE
               10        20        30              40        50    

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 SAVKFIVRKFPAVETRNNNQQLAQLQKEKSEILKNLALYYFTFVDVMEFKDHVCELLNTI
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pF1KSD DVCQVFFDITVNFDLTKNYLDLIITYTTLMILLSRIEERKAIIGLYNYAHEMTHGASDRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 DVCQVFFDITVNFDLTKNYLDLIITYTTLMILLSRIEERKAIIGLYNYAHEMTHGASDRE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 YPRLGQMIVDYENPLKKMMEEFVPHSKSLSDALISLQMVYPRRNLSADQWRNAQLLSLIS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 APSTMLNPAQSDTMPCEYLSLDAMEKWIIFGFILCHGILNTDATALNLWKLALQSSSCLS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 LFRDEVFHIHKAAEDLFVNIRGYNKRINDIRECKEAAVSHAGSMHRERRKFLRSALKELA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 TVLSDQPGLLGPKALFVFMALSFARDEIIWLLRHADNMPKKSADDFIDKHIAELIFYMEE
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pF1KSD LRAHVRKYGPVMQRYYVQYLSGFDAVVLNELVQNLSVCPEDESIIMSSFVNTMTSLSVKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 LRAHVRKYGPVMQRYYVQYLSGFDAVVLNELVQNLSVCPEDESIIMSSFVNTMTSLSVKQ
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pF1KSD VEDGEVFDFRGMRLDWFRLQAYTSVSKASLGLADHRELGKMMNTIIFHTKMVDSLVEMLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 VEDGEVFDFRGMRLDWFRLQAYTSVSKASLGLADHRELGKMMNTIIFHTKMVDSLVEMLV
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pF1KSD ETSDLSIFCFYSRAFEKMFQQCLELPSQSRYSIAFPLLCTHFMSCTHELCPEERHHIGDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 ETSDLSIFCFYSRAFEKMFQQCLELPSQSRYSIAFPLLCTHFMSCTHELCPEERHHIGDR
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pF1KSD SLSLCNMFLDEMAKQARNLITDICTEQCTLSDQLLPKHCAKTISQAVNKKSKKQTGKKGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 SLSLCNMFLDEMAKQARNLITDICTEQCTLSDQLLPKHCAKTISQAVNKKSKKQTGKKGE
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pF1KSD PEREKPGVESMRKNRLVVTNLDKLHTALSELCFSINYVPNMVVWEHTFTPREYLTSHLEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 PEREKPGVESMRKNRLVVTNLDKLHTALSELCFSINYVPNMVVWEHTFTPREYLTSHLEI
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pF1KSD RFTKSIVGMTMYNQATQEIAKPSELLTSVRAYMTVLQSIENYVQIDITRVFNNVLLQQTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 RFTKSIVGMTMYNQATQEIAKPSELLTSVRAYMTVLQSIENYVQIDITRVFNNVLLQQTQ
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pF1KSD HLDSHGEPTITSLYTNWYLETLLRQVSNGHIAYFPAMKAFVNLPTENELTFNAEEYSDIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 HLDSHGEPTITSLYTNWYLETLLRQVSNGHIAYFPAMKAFVNLPTENELTFNAEEYSDIS
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pF1KSD EMRSLSELLGPYGMKFLSESLMWHISSQVAELKKLVVENVDVLTQMRTSFDKPDQMAALF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 EMRSLSELLGPYGMKFLSESLMWHISSQVAELKKLVVENVDVLTQMRTSFDKPDQMAALF
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pF1KSD KRLSSVDSVLKRMTIIGVILSFRSLAQEALRDVLSYHIPFLVSSIEDFKDHIPRETDMKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 KRLSSVDSVLKRMTIIGVILSFRSLAQEALRDVLSYHIPFLVSSIEDFKDHIPRETDMKV
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pF1KSD AMNVYELSSAAGLPCEIDPALVVALSSQKSENISPEEEYKIACLLMVFVAVSLPTLASNV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 AMNVYELSSAAGLPCEIDPALVVALSSQKSENISPEEEYKIACLLMVFVAVSLPTLASNV
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pF1KSD MSQYSPAIEGHCNNIHCLAKAINQIAAALFTIHKGSIEDRLKEFLALASSSLLKIGQETD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 MSQYSPAIEGHCNNIHCLAKAINQIAAALFTIHKGSIEDRLKEFLALASSSLLKIGQETD
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pF1KSD KTTTRNRESVYLLLDMIVQESPFLTMDLLESCFPYVLLRNAYHAVYKQSVTSSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_038 KTTTRNRESVYLLLDMIVQESPFLTMDLLESCFPYVLLRNAYHAVYKQSVTSSA
         1080      1090      1100      1110      1120        

>>XP_006712264 (OMIM: 604891) PREDICTED: nck-associated   (1126 aa)
 initn: 7056 init1: 6848 opt: 7272  Z-score: 8915.0  bits: 1661.4 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 7272; 99.3% identity (99.3% similar) in 1134 aa overlap (1-1134:1-1126)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSRSVLQPSQQKLAEKLTILNDRGVGMLTRLYNIKKQGQVWKACGDPKAKPSYLIDKNLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::      ::::::::::::::::::
XP_006 MSRSVLQPSQQKLAEKLTILNDRGVGMLTRLYNIKK------ACGDPKAKPSYLIDKNLE
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               70        80        90       100       110       120
pF1KSD SAVKFIVRKFPAVETRNNNQQLAQLQKEKSEILKNLALYYFTFVDVMEFKDHVCELLNTI
       :::::::::::::::::::  :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SAVKFIVRKFPAVETRNNN--LAQLQKEKSEILKNLALYYFTFVDVMEFKDHVCELLNTI
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pF1KSD DVCQVFFDITVNFDLTKNYLDLIITYTTLMILLSRIEERKAIIGLYNYAHEMTHGASDRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DVCQVFFDITVNFDLTKNYLDLIITYTTLMILLSRIEERKAIIGLYNYAHEMTHGASDRE
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pF1KSD YPRLGQMIVDYENPLKKMMEEFVPHSKSLSDALISLQMVYPRRNLSADQWRNAQLLSLIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 YPRLGQMIVDYENPLKKMMEEFVPHSKSLSDALISLQMVYPRRNLSADQWRNAQLLSLIS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 APSTMLNPAQSDTMPCEYLSLDAMEKWIIFGFILCHGILNTDATALNLWKLALQSSSCLS
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pF1KSD LFRDEVFHIHKAAEDLFVNIRGYNKRINDIRECKEAAVSHAGSMHRERRKFLRSALKELA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LFRDEVFHIHKAAEDLFVNIRGYNKRINDIRECKEAAVSHAGSMHRERRKFLRSALKELA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TVLSDQPGLLGPKALFVFMALSFARDEIIWLLRHADNMPKKSADDFIDKHIAELIFYMEE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LRAHVRKYGPVMQRYYVQYLSGFDAVVLNELVQNLSVCPEDESIIMSSFVNTMTSLSVKQ
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pF1KSD VEDGEVFDFRGMRLDWFRLQAYTSVSKASLGLADHRELGKMMNTIIFHTKMVDSLVEMLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VEDGEVFDFRGMRLDWFRLQAYTSVSKASLGLADHRELGKMMNTIIFHTKMVDSLVEMLV
            480       490       500       510       520       530  

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD ETSDLSIFCFYSRAFEKMFQQCLELPSQSRYSIAFPLLCTHFMSCTHELCPEERHHIGDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ETSDLSIFCFYSRAFEKMFQQCLELPSQSRYSIAFPLLCTHFMSCTHELCPEERHHIGDR
            540       550       560       570       580       590  

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD SLSLCNMFLDEMAKQARNLITDICTEQCTLSDQLLPKHCAKTISQAVNKKSKKQTGKKGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SLSLCNMFLDEMAKQARNLITDICTEQCTLSDQLLPKHCAKTISQAVNKKSKKQTGKKGE
            600       610       620       630       640       650  

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD PEREKPGVESMRKNRLVVTNLDKLHTALSELCFSINYVPNMVVWEHTFTPREYLTSHLEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PEREKPGVESMRKNRLVVTNLDKLHTALSELCFSINYVPNMVVWEHTFTPREYLTSHLEI
            660       670       680       690       700       710  

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pF1KSD RFTKSIVGMTMYNQATQEIAKPSELLTSVRAYMTVLQSIENYVQIDITRVFNNVLLQQTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RFTKSIVGMTMYNQATQEIAKPSELLTSVRAYMTVLQSIENYVQIDITRVFNNVLLQQTQ
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pF1KSD HLDSHGEPTITSLYTNWYLETLLRQVSNGHIAYFPAMKAFVNLPTENELTFNAEEYSDIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 HLDSHGEPTITSLYTNWYLETLLRQVSNGHIAYFPAMKAFVNLPTENELTFNAEEYSDIS
            780       790       800       810       820       830  

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pF1KSD EMRSLSELLGPYGMKFLSESLMWHISSQVAELKKLVVENVDVLTQMRTSFDKPDQMAALF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 EMRSLSELLGPYGMKFLSESLMWHISSQVAELKKLVVENVDVLTQMRTSFDKPDQMAALF
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              910       920       930       940       950       960
pF1KSD KRLSSVDSVLKRMTIIGVILSFRSLAQEALRDVLSYHIPFLVSSIEDFKDHIPRETDMKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KRLSSVDSVLKRMTIIGVILSFRSLAQEALRDVLSYHIPFLVSSIEDFKDHIPRETDMKV
            900       910       920       930       940       950  

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD AMNVYELSSAAGLPCEIDPALVVALSSQKSENISPEEEYKIACLLMVFVAVSLPTLASNV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AMNVYELSSAAGLPCEIDPALVVALSSQKSENISPEEEYKIACLLMVFVAVSLPTLASNV
            960       970       980       990      1000      1010  

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pF1KSD MSQYSPAIEGHCNNIHCLAKAINQIAAALFTIHKGSIEDRLKEFLALASSSLLKIGQETD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MSQYSPAIEGHCNNIHCLAKAINQIAAALFTIHKGSIEDRLKEFLALASSSLLKIGQETD
           1020      1030      1040      1050      1060      1070  

             1090      1100      1110      1120      1130    
pF1KSD KTTTRNRESVYLLLDMIVQESPFLTMDLLESCFPYVLLRNAYHAVYKQSVTSSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KTTTRNRESVYLLLDMIVQESPFLTMDLLESCFPYVLLRNAYHAVYKQSVTSSA
           1080      1090      1100      1110      1120      

>>NP_005328 (OMIM: 141180) nck-associated protein 1-like  (1127 aa)
 initn: 4467 init1: 1936 opt: 4570  Z-score: 5599.1  bits: 1047.9 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4570; 58.9% identity (86.1% similar) in 1127 aa overlap (4-1127:2-1122)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSRSVLQPSQQKLAEKLTILNDRGVGMLTRLYNIKKQGQVWKACGDPKAKPSYLIDKNLE
          :. .  :.::::::::::::: :.: :.:::::      .:.:::.:: .:..:..:
NP_005   MSLTSAYQHKLAEKLTILNDRGQGVLIRMYNIKK------TCSDPKSKPPFLLEKSME
                 10        20        30              40        50  

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD SAVKFIVRKFPAVETRNNNQQLAQLQKEKSEILKNLALYYFTFVDVMEFKDHVCELLNTI
        ..:.: .::: ...::..:.:. ...::.::.. :. :: .:::::::.::: ::::::
NP_005 PSLKYINKKFPNIDVRNSTQHLGPVHREKAEIIRFLTNYYQSFVDVMEFRDHVYELLNTI
             60        70        80        90       100       110  

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD DVCQVFFDITVNFDLTKNYLDLIITYTTLMILLSRIEERKAIIGLYNYAHEMTHGASDRE
       :.::  :::..:::.:..:::::.:::....::::::.:. .::.:: :::: :: .:  
NP_005 DACQCHFDINLNFDFTRSYLDLIVTYTSVILLLSRIEDRRILIGMYNCAHEMLHGHGDPS
            120       130       140       150       160       170  

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD YPRLGQMIVDYENPLKKMMEEFVPHSKSLSDALISLQMVYPRRNLSADQWRNAQLLSLIS
       . :::::...:..::::. ::: ::.:..: ::.::.... ::: .:.:::.::::::::
NP_005 FARLGQMVLEYDHPLKKLTEEFGPHTKAVSGALLSLHFLFVRRNQGAEQWRSAQLLSLIS
            180       190       200       210       220       230  

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD APSTMLNPAQSDTMPCEYLSLDAMEKWIIFGFILCHGILNTDATALNLWKLALQSSSCLS
        : .:.:::.:::: :::::...::.:::.::.:::: ::...   .:::: ::.:  ..
NP_005 NPPAMINPANSDTMACEYLSVEVMERWIIIGFLLCHGCLNSNSQCQKLWKLCLQGSLYIT
            240       250       260       270       280       290  

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD LFRDEVFHIHKAAEDLFVNIRGYNKRINDIRECKEAAVSHAGSMHRERRKFLRSALKELA
       :.:..:...::..:::: ...::.::. ::.: :: .....:..: .::.::: :.::: 
NP_005 LIREDVLQVHKVTEDLFSSLKGYGKRVADIKESKEHVIANSGQFHCQRRQFLRMAVKELE
            300       310       320       330       340       350  

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pF1KSD TVLSDQPGLLGPKALFVFMALSFARDEIIWLLRHADNMPK-KSADDFIDKHIAELIFYME
       :::.:.::::::::::.:::::: :::. ::.::..:. : :. .:. :. ::::.: .:
NP_005 TVLADEPGLLGPKALFAFMALSFIRDEVTWLVRHTENVTKTKTPEDYADSSIAELLFLLE
            360       370       380       390       400       410  

     420       430       440       450       460       470         
pF1KSD ELRAHVRKYGPVMQRYYVQYLSGFDAVVLNELVQNLSVCPEDESIIMSSFVNTMTSLSVK
        .:. ::..  :.:.:..:::. :::.::....::::::::.:::::::::. ..::..:
NP_005 GIRSLVRRHIKVIQQYHLQYLARFDALVLSDIIQNLSVCPEEESIIMSSFVSILSSLNLK
            420       430       440       450       460       470  

     480       490       500       510       520       530         
pF1KSD QVEDGEVFDFRGMRLDWFRLQAYTSVSKASLGLADHRELGKMMNTIIFHTKMVDSLVEML
       ::..:: :.: :.:::::::::::::.:: : : .. .:.:.:: :.::..:.::. ..:
NP_005 QVDNGEKFEFSGLRLDWFRLQAYTSVAKAPLHLHENPDLAKVMNLIVFHSRMLDSVEKLL
            480       490       500       510       520       530  

     540       550       560       570       580       590         
pF1KSD VETSDLSIFCFYSRAFEKMFQQCLELPSQSRYSIAFPLLCTHFMSCTHELCPEERHHIGD
       ::::::: :::. : ::::: . ::  .. ::.:::::.:.::. ::::.::::  :. .
NP_005 VETSDLSTFCFHLRIFEKMFAMTLEESAMLRYAIAFPLICAHFVHCTHEMCPEEYPHLKN
            540       550       560       570       580       590  

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pF1KSD RSLSLCNMFLDEMAKQARNLITDICTEQCTLSDQLLPKHCAKTISQAVNKKSKKQ--TGK
       ..:  :: ::.:.:::. : . .::.:: .::.:::::::: :::.: :::..::  : .
NP_005 HGLHHCNSFLEELAKQTSNCVLEICAEQRNLSEQLLPKHCATTISKAKNKKTRKQRQTPR
            600       610       620       630       640       650  

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pF1KSD KGEPEREKPGVESMRKNRLVVTNLDKLHTALSELCFSINYVPNMVVWEHTFTPREYLTSH
       ::::::.:::.:: :::: .:::.::::  :.:: ...:.: .. :.:::. : :::.::
NP_005 KGEPERDKPGAESHRKNRSIVTNMDKLHLNLTELALTMNHVYSFSVFEHTIFPSEYLSSH
            660       670       680       690       700       710  

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pF1KSD LEIRFTKSIVGMTMYNQATQEIAKPSELLTSVRAYMTVLQSIENYVQIDITRVFNNVLLQ
       :: :....:: .. :: .::::..:::::..:.::.  .::. ...  : .::. :.:::
NP_005 LEARLNRAIVWLAGYNATTQEIVRPSELLAGVKAYIGFIQSLAQFLGADASRVIRNALLQ
            720       730       740       750       760       770  

       780       790       800       810       820       830       
pF1KSD QTQHLDSHGEPTITSLYTNWYLETLLRQVSNGHIAYFPAMKAFVNLPTENELTFNAEEYS
       ::: ::: :: :::.::::::::.::::.:.: :   :::.:::.:: :.: .:.:::.:
NP_005 QTQPLDSCGEQTITTLYTNWYLESLLRQASSGTIILSPAMQAFVSLPREGEQNFSAEEFS
            780       790       800       810       820       830  

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pF1KSD DISEMRSLSELLGPYGMKFLSESLMWHISSQVAELKKLVVENVDVLTQMRTSFDKPDQMA
       ::::::.:.:::::::::::::.::::..::..:::::::::.:.:.:.:..:.::: ::
NP_005 DISEMRALAELLGPYGMKFLSENLMWHVTSQIVELKKLVVENMDILVQIRSNFSKPDLMA
            840       850       860       870       880       890  

       900       910       920       930       940       950       
pF1KSD ALFKRLSSVDSVLKRMTIIGVILSFRSLAQEALRDVLSYHIPFLVSSIEDFKDHIPRETD
       .:. .:.....:::::::::::::::..:::.::.:.: : :::.. :: .:. .  .::
NP_005 SLLPQLTGAENVLKRMTIIGVILSFRAMAQEGLREVFSSHCPFLMGPIECLKEFVTPDTD
            900       910       920       930       940       950  

       960       970       980       990      1000      1010       
pF1KSD MKVAMNVYELSSAAGLPCEIDPALVVALSSQKSENISPEEEYKIACLLMVFVAVSLPTLA
       .::.....::.::::. :.::::::.:... :... :::::::.::::..:.::::: ::
NP_005 IKVTLSIFELASAAGVGCDIDPALVAAIANLKADTSSPEEEYKVACLLLIFLAVSLPLLA
            960       970       980       990      1000      1010  

      1020      1030      1040      1050      1060      1070       
pF1KSD SNVMSQYSPAIEGHCNNIHCLAKAINQIAAALFTIHKGSIEDRLKEFLALASSSLLKIGQ
       ..  : ::   .:. ::::::.::: :..:::::... .:: .:::::..:: :::..::
NP_005 TDPSSFYSIEKDGYNNNIHCLTKAIIQVSAALFTLYNKNIETHLKEFLVVASVSLLQLGQ
           1020      1030      1040      1050      1060      1070  

      1080      1090      1100      1110      1120      1130    
pF1KSD ETDKTTTRNRESVYLLLDMIVQESPFLTMDLLESCFPYVLLRNAYHAVYKQSVTSSA
       ::::  ::::::. ::. ..:.:: :::.:.::::::::::::::. : .       
NP_005 ETDKLKTRNRESISLLMRLVVEESSFLTLDMLESCFPYVLLRNAYREVSRAFHLN  
           1080      1090      1100      1110      1120         

>>NP_001171905 (OMIM: 141180) nck-associated protein 1-l  (1077 aa)
 initn: 4387 init1: 1936 opt: 4379  Z-score: 5365.0  bits: 1004.5 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4379; 59.0% identity (86.5% similar) in 1072 aa overlap (59-1127:1-1072)

       30        40        50        60        70        80        
pF1KSD TRLYNIKKQGQVWKACGDPKAKPSYLIDKNLESAVKFIVRKFPAVETRNNNQQLAQLQKE
                                     .: ..:.: .::: ...::..:.:. ...:
NP_001                               MEPSLKYINKKFPNIDVRNSTQHLGPVHRE
                                             10        20        30

       90       100       110       120       130       140        
pF1KSD KSEILKNLALYYFTFVDVMEFKDHVCELLNTIDVCQVFFDITVNFDLTKNYLDLIITYTT
       :.::.. :. :: .:::::::.::: :::::::.::  :::..:::.:..:::::.:::.
NP_001 KAEIIRFLTNYYQSFVDVMEFRDHVYELLNTIDACQCHFDINLNFDFTRSYLDLIVTYTS
               40        50        60        70        80        90

      150       160       170       180       190       200        
pF1KSD LMILLSRIEERKAIIGLYNYAHEMTHGASDREYPRLGQMIVDYENPLKKMMEEFVPHSKS
       ...::::::.:. .::.:: :::: :: .:  . :::::...:..::::. ::: ::.:.
NP_001 VILLLSRIEDRRILIGMYNCAHEMLHGHGDPSFARLGQMVLEYDHPLKKLTEEFGPHTKA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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