seq1 = pF1KB9397.tfa, 1950 bp seq2 = pF1KB9397/gi568815597r_50341443.tfa (gi568815597r:50341443_51059811), 718369 bp >pF1KB9397 1950 >gi568815597r:50341443_51059811 (Chr1) (complement) 39-114 (201808-201883) 98% -> 115-161 (258135-258181) 100% -> 162-367 (271607-271812) 100% -> 368-459 (315037-315128) 100% -> 460-551 (320858-320949) 100% -> 552-657 (353921-354026) 100% -> 658-744 (404284-404370) 100% -> 745-840 (463596-463691) 100% -> 841-967 (475001-475127) 100% -> 968-1031 (476097-476160) 100% -> 1032-1113 (477113-477194) 100% -> 1114-1268 (492581-492735) 100% -> 1269-1405 (520084-520220) 100% -> 1406-1494 (524355-524443) 100% -> 1495-1575 (568011-568091) 100% -> 1576-1653 (569147-569224) 100% -> 1654-1869 (584133-584348) 100% -> 1870-1950 (618289-618369) 100% 0 . : . : . : . : . : 39 TTTTCAGGCATGTACTGGCATTGAAAACATTGACGAAGCTATTACATTGC ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 201808 TTTCCAGGCATGTACTGGCATTGAAAACATTGACGAAGCTATTACATTGC 50 . : . : . : . : . : 89 TTGAACAAAATAATTGGGACTTAGTG GCAGCTATCAATGGT ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||| 201858 TTGAACAAAATAATTGGGACTTAGTGGTA...CAGGCAGCTATCAATGGT 100 . : . : . : . : . : 130 GTAATACCACAGGAAAATGGCATTCTACAAAG TGAATATGG ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||| 258150 GTAATACCACAGGAAAATGGCATTCTACAAAGGTA...TAGTGAATATGG 150 . : . : . : . : . : 171 AGGTGAGACCATACCAGGACCTGCATTTAATCCAGCAAGTCATCCAGCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 271616 AGGTGAGACCATACCAGGACCTGCATTTAATCCAGCAAGTCATCCAGCTT 200 . : . : . : . : . : 221 CAGCTCCTACTTCCTCTTCTTCTTCAGCGTTTCGACCTGTAATGCCATCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 271666 CAGCTCCTACTTCCTCTTCTTCTTCAGCGTTTCGACCTGTAATGCCATCC 250 . : . : . : . : . : 271 AGGCAGATTGTAGAAAGGCAACCTCGGATGCTGGACTTCAGGGTTGAATA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 271716 AGGCAGATTGTAGAAAGGCAACCTCGGATGCTGGACTTCAGGGTTGAATA 300 . : . : . : . : . : 321 CAGAGACAGAAATGTTGATGTGGTACTTGAAGACACCTGTACTGTTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>> 271766 CAGAGACAGAAATGTTGATGTGGTACTTGAAGACACCTGTACTGTTGGTA 350 . : . : . : . : . : 368 GAGAGATTAAACAGATTCTAGAAAATGAACTTCAGATACCTGTG ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 271816 ...CAGGAGAGATTAAACAGATTCTAGAAAATGAACTTCAGATACCTGTG 400 . : . : . : . : . : 412 TCCAAAATGCTGTTAAAAGGCTGGAAGACGGGAGATGTGGAAGACAGT ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>> 315081 TCCAAAATGCTGTTAAAAGGCTGGAAGACGGGAGATGTGGAAGACAGTGT 450 . : . : . : . : . : 460 ACGGTCCTAAAATCTCTACACTTGCCAAAAAACAACAGTCTTT >...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 315131 G...CAGACGGTCCTAAAATCTCTACACTTGCCAAAAAACAACAGTCTTT 500 . : . : . : . : . : 503 ATGTCCTTACACCAGATTTGCCACCACCTTCATCATCTAGTCATGCTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||> 320901 ATGTCCTTACACCAGATTTGCCACCACCTTCATCATCTAGTCATGCTGGG 550 . : . : . : . : . : 552 TGCCCTGCAGGAGTCATTAAATCAAAACTTCATGCTGATCAT >>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 320951 TA...CAGTGCCCTGCAGGAGTCATTAAATCAAAACTTCATGCTGATCAT 600 . : . : . : . : . : 594 CACCCACCGAGAAGTCCAGCGGGAGTACAACCTGAACTTCTCAGGAAGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 353963 CACCCACCGAGAAGTCCAGCGGGAGTACAACCTGAACTTCTCAGGAAGCA 650 . : . : . : . : . : 644 GTACTATTCAAGAG GTAAAGAGAAATGTGTATGACCTTACA ||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||| 354013 GTACTATTCAAGAGGTG...TAGGTAAAGAGAAATGTGTATGACCTTACA 700 . : . : . : . : . : 685 AGTATCCCCGTTCGCCACCAATTATGGGAGGGCTGGCCAACTTCTGCTAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 404311 AGTATCCCCGTTCGCCACCAATTATGGGAGGGCTGGCCAACTTCTGCTAC 750 . : . : . : . : . : 735 AGACGACTCA ATGTGTCTTGCTGAATCAGGGCTCTCTTATC ||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| 404361 AGACGACTCAGTA...CAGATGTGTCTTGCTGAATCAGGGCTCTCTTATC 800 . : . : . : . : . : 776 CCTGCCATCGACTTACAGTGGGAAGAAGATCTTCACCTGCACAGACCCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 463627 CCTGCCATCGACTTACAGTGGGAAGAAGATCTTCACCTGCACAGACCCGG 850 . : . : . : . : . : 826 GAACAGTCGGAAGAA CAAATCACCGATGTTCATATGGTTAG |||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||| 463677 GAACAGTCGGAAGAAGTA...TAGCAAATCACCGATGTTCATATGGTTAG 900 . : . : . : . : . : 867 TGATAGCGATGGAGATGACTTTGAAGATGCTACAGAATTTGGGGTGGATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 475027 TGATAGCGATGGAGATGACTTTGAAGATGCTACAGAATTTGGGGTGGATG 950 . : . : . : . : . : 917 ATGGAGAAGTATTTGGCATGGCGTCATCTGCCTTGAGAAAATCTCCAATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 475077 ATGGAGAAGTATTTGGCATGGCGTCATCTGCCTTGAGAAAATCTCCAATG 1000 . : . : . : . : . : 967 A TGCCAGAAAACGCAGAAAATGAAGGAGATGCCTTATTACA |>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 475127 AGTG...TAGTGCCAGAAAACGCAGAAAATGAAGGAGATGCCTTATTACA 1050 . : . : . : . : . : 1008 ATTTACAGCAGAGTTTTCTTCAAG ATATGGTGATTGCCATC ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||| 476137 ATTTACAGCAGAGTTTTCTTCAAGGTA...TAGATATGGTGATTGCCATC 1100 . : . : . : . : . : 1049 CTGTATTTTTTATTGGCTCATTAGAAGCTGCTTTTCAAGAGGCCTTCTAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 477130 CTGTATTTTTTATTGGCTCATTAGAAGCTGCTTTTCAAGAGGCCTTCTAT 1150 . : . : . : . : . : 1099 GTGAAAGCCCGAGAT AGAAAGCTTCTTGCTATCTACCTCCA |||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||| 477180 GTGAAAGCCCGAGATGTA...CAGAGAAAGCTTCTTGCTATCTACCTCCA 1200 . : . : . : . : . : 1140 CCATGATGAAAGTGTGTTAACCAACGTGTTCTGCTCACAAATGCTTTGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 492607 CCATGATGAAAGTGTGTTAACCAACGTGTTCTGCTCACAAATGCTTTGTG 1250 . : . : . : . : . : 1190 CTGAATCCATTGTTTCTTATCTGAGTCAAAATTTTATAACCTGGGCTTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 492657 CTGAATCCATTGTTTCTTATCTGAGTCAAAATTTTATAACCTGGGCTTGG 1300 . : . : . : . : . : 1240 GATCTGACAAAGGACTCCAACAGAGCAAG ATTTCTCACTAT |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||| 492707 GATCTGACAAAGGACTCCAACAGAGCAAGGTA...TAGATTTCTCACTAT 1350 . : . : . : . : . : 1281 GTGCAATAGACACTTTGGCAGTGTTGTGGCACAAACCATTCGGACTCAAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 520096 GTGCAATAGACACTTTGGCAGTGTTGTGGCACAAACCATTCGGACTCAAA 1400 . : . : . : . : . : 1331 AAACGGATCAGTTTCCGCTTTTCCTGATTATTATGGGAAAGCGATCATCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 520146 AAACGGATCAGTTTCCGCTTTTCCTGATTATTATGGGAAAGCGATCATCT 1450 . : . : . : . : . : 1381 AATGAAGTGTTGAATGTGATACAAG GGAACACAACAGTAGA |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||| 520196 AATGAAGTGTTGAATGTGATACAAGGTA...TAGGGAACACAACAGTAGA 1500 . : . : . : . : . : 1422 TGAGTTAATGATGAGACTCATGGCTGCAATGGAGATCTTCACAGCCCAAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 524371 TGAGTTAATGATGAGACTCATGGCTGCAATGGAGATCTTCACAGCCCAAC 1550 . : . : . : . : . : 1472 AACAGGAAGATATAAAGGACGAG GATGAACGTGAAGCCAGA |||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||| 524421 AACAGGAAGATATAAAGGACGAGGTA...AAGGATGAACGTGAAGCCAGA 1600 . : . : . : . : . : 1513 GAAAATGTGAAGAGAGAGCAAGATGAGGCCTATCGCCTTTCACTTGAGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 568029 GAAAATGTGAAGAGAGAGCAAGATGAGGCCTATCGCCTTTCACTTGAGGC 1650 . : . : . : . : . : 1563 TGACAGAGCAAAG AGGGAAGCTCACGAGAGAGAGATGGCAG |||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||| 568079 TGACAGAGCAAAGGTA...CAGAGGGAAGCTCACGAGAGAGAGATGGCAG 1700 . : . : . : . : . : 1604 AACAGTTTCGTTTGGAGCAGATTCGCAAAGAACAAGAAGAGGAACGTGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 569175 AACAGTTTCGTTTGGAGCAGATTCGCAAAGAACAAGAAGAGGAACGTGAG 1750 . : . : . : . : . : 1654 GCCATCCGGCTGTCCTTAGAGCAAGCCCTGCCTCCTGAGCC >>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 569225 GTG...TAGGCCATCCGGCTGTCCTTAGAGCAAGCCCTGCCTCCTGAGCC 1800 . : . : . : . : . : 1695 AAAGGAAGAAAATGCTGAGCCTGTGAGCAAACTGCGGATCCGGACCCCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 584174 AAAGGAAGAAAATGCTGAGCCTGTGAGCAAACTGCGGATCCGGACCCCCA 1850 . : . : . : . : . : 1745 GTGGCGAGTTCTTGGAGCGGCGTTTCCTGGCCAGCAACAAGCTCCAGATT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 584224 GTGGCGAGTTCTTGGAGCGGCGTTTCCTGGCCAGCAACAAGCTCCAGATT 1900 . : . : . : . : . : 1795 GTCTTTGATTTTGTAGCTTCCAAAGGATTTCCATGGGATGAGTACAAGTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 584274 GTCTTTGATTTTGTAGCTTCCAAAGGATTTCCATGGGATGAGTACAAGTT 1950 . : . : . : . : . : 1845 ACTGAGCACCTTTCCTAGGAGAGAC GTAACTCAACTGGACC |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||| 584324 ACTGAGCACCTTTCCTAGGAGAGACGTA...TAGGTAACTCAACTGGACC 2000 . : . : . : . : . : 1886 CAAATAAATCATTATTGGAGGTAAAGTTGTTCCCTCAAGAAACCCTTTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 618305 CAAATAAATCATTATTGGAGGTAAAGTTGTTCCCTCAAGAAACCCTTTTC 2050 . : . 1936 CTTGAAGCAAAAGAG ||||||||||||||| 618355 CTTGAAGCAAAAGAG