seq1 = pF1KB9101.tfa, 3474 bp
seq2 = pF1KB9101/gi568815577r_14864719.tfa (gi568815577r:14864719_15068192), 203474 bp

>pF1KB9101 3474
>gi568815577r:14864719_15068192 (Chr21)

(complement)

1-3474  (100001-103474)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTCATGGAGAAGAGCTTGGCTCTGATGTGCACCAGGATTCTATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTCATGGAGAAGAGCTTGGCTCTGATGTGCACCAGGATTCTATTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTAACTTACCTAGAAGGATTACTAATGCATCAGGCAGCAGGGGGATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTAACTTACCTAGAAGGATTACTAATGCATCAGGCAGCAGGGGGATCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTACTGCCGTTGACAAAAAGTCTGCTGGGCATAATGAAGAGGATCAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTACTGCCGTTGACAAAAAGTCTGCTGGGCATAATGAAGAGGATCAGAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTTAACATTTCTGGCAGTGCATTTCCCACCTGTCAAAGTAATGGTCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTTAACATTTCTGGCAGTGCATTTCCCACCTGTCAAAGTAATGGTCCAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCTCAATACACATACATATCAGGGATCTGGCATGCTGCACCTCAAAAAAG
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 100201 TCTCAATACACATACATATCAGGGGTCTGGCATGCTGCACCTCAAAAAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCAGACTGTTGCAGTCTTCTGAGGACTGGAATGCAGCAAAGCGGAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCAGACTGTTGCAGTCTTCTGAGGACTGGAATGCAGCAAAGCGGAAGAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGTCTGATTCTATCATGAATTTAAACGTAAAGAAGGAAGCTTTGCTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGTCTGATTCTATCATGAATTTAAACGTAAAGAAGGAAGCTTTGCTAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGGCATGGTTGACAGTGTGCCTAAAGGCAAACAGGATAGCACATTACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGGCATGGTTGACAGTGTGCCTAAAGGCAAACAGGATAGCACATTACTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCTCTTTGCTTCAGTCATTCAGCTCTAGGCTGCAGACTGTTGCTCTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCTCTTTGCTTCAGTCATTCAGCTCTAGGCTGCAGACTGTTGCTCTGTCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CAACAAATCAGGCAGAGCCTCAAGGAGCAAGGATATGCCCTCAGTCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CAACAAATCAGGCAGAGCCTCAAGGAGCAAGGATATGCCCTCAGTCATGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTCTTTAAAAGTGGAGAAGGATTTAAGGTGCTATGGTGTTGCATCAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTCTTTAAAAGTGGAGAAGGATTTAAGGTGCTATGGTGTTGCATCAAGTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACTTAAAAACTTTGTTGAAGAAAAGTAAAGTTAAAGATCAAAAGCCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACTTAAAAACTTTGTTGAAGAAAAGTAAAGTTAAAGATCAAAAGCCTGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACGAATCTTCCTGATGTGACTAAAAACCTCATCAGAGATAGGTTTGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACGAATCTTCCTGATGTGACTAAAAACCTCATCAGAGATAGGTTTGCAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GTCTCCTCATCATGTTGGACAAAGTGGAACAAAGGTCATGAGTGAACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GTCTCCTCATCATGTTGGACAAAGTGGAACAAAGGTCATGAGTGAACCGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGTCATGTGCTGCAAGATTACAGGCTGTTGCAAGCATGGTGGAAAAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGTCATGTGCTGCAAGATTACAGGCTGTTGCAAGCATGGTGGAAAAAAGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCTAGTCCTGCCACCTCACCTAAACCTAGTGTTGCTTGTAGCCAGTTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCTAGTCCTGCCACCTCACCTAAACCTAGTGTTGCTTGTAGCCAGTTAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 ATTACTTCTGTCAAGCGAAGCCCATTTGCAGCAGTATTCTCGAGAACACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 ATTACTTCTGTCAAGCGAAGCCCATTTGCAGCAGTATTCTCGAGAACACG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CTTTAAAAACGCAAAATGCAAATCAAGCAGCAAGTGAAAGACTTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CTTTAAAAACGCAAAATGCAAATCAAGCAGCAAGTGAAAGACTTGCTGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ATGGCCAGATTGCAAGAAAATGGCCAGAAGGATGTTGGCAGTTACCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ATGGCCAGATTGCAAGAAAATGGCCAGAAGGATGTTGGCAGTTACCAGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CCCAAAAGGAATGTCAAGCCATCTTAATGGTCAGGCAAGAACATCATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CCCAAAAGGAATGTCAAGCCATCTTAATGGTCAGGCAAGAACATCATCAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GCAAACTGATGGCTAGCAAAAGTAGTGCTACAGTGTTTCAAAATCCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GCAAACTGATGGCTAGCAAAAGTAGTGCTACAGTGTTTCAAAATCCAATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GGTATCATTCCTTCTTCCCCTAAAAATGCAGGTTATAAGAACTCACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GGTATCATTCCTTCTTCCCCTAAAAATGCAGGTTATAAGAACTCACTGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 AAGAAACAATATAAAACAAGCTGCTAACAATAGTTTGCTTTTACATCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 AAGAAACAATATAAAACAAGCTGCTAACAATAGTTTGCTTTTACATCTTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TTAAAAGCCAGACTATACCTAAGCCAATGAATGGACACAGTCACAGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TTAAAAGCCAGACTATACCTAAGCCAATGAATGGACACAGTCACAGTGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 AGAGGAAGCATTTTTGAGGAAAGTAGTACACCTACAACTATTGATGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 AGAGGAAGCATTTTTGAGGAAAGTAGTACACCTACAACTATTGATGAATA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TTCAGATAACAATCCTAGTTTTACAGATGACAGCAGTGGTGATGAAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TTCAGATAACAATCCTAGTTTTACAGATGACAGCAGTGGTGATGAAAGTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CTTATTCCAACTGTGTTCCCATAGACTTGTCTTGCAAACACCGAACTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CTTATTCCAACTGTGTTCCCATAGACTTGTCTTGCAAACACCGAACTGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 AAATCAGAATCTGACCAACCTGTTTCCCTGGATAACTTCACTCAATCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 AAATCAGAATCTGACCAACCTGTTTCCCTGGATAACTTCACTCAATCCTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GCTAAACACTTGGGATCCAAAAGTCCCAGATGTAGATATCAAAGAAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GCTAAACACTTGGGATCCAAAAGTCCCAGATGTAGATATCAAAGAAGATC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 AAGATACCTCAAAGAATTCTAAGCTAAACTCACACCAGAAAGTAACACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 AAGATACCTCAAAGAATTCTAAGCTAAACTCACACCAGAAAGTAACACTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CTTCAATTGCTACTTGGCCATAAGAATGAAGAAAATGTAGAAAAAAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CTTCAATTGCTACTTGGCCATAAGAATGAAGAAAATGTAGAAAAAAACAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 CAGCCCTCAGGGAGTACACAATGATGTGAGCAAGTTCAATACACAAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 CAGCCCTCAGGGAGTACACAATGATGTGAGCAAGTTCAATACACAAAATT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 ATGCAAGGACTTCTGTGATAGAAAGCCCCAGTACAAATCGGACTACTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 ATGCAAGGACTTCTGTGATAGAAAGCCCCAGTACAAATCGGACTACTCCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 GTGAGCACTCCACCTTTACTTACATCAAGCAAAGCAGGGTCTCCCATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 GTGAGCACTCCACCTTTACTTACATCAAGCAAAGCAGGGTCTCCCATCAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 TCTCTCTCAACACTCTCTGGTCATCAAATGGAATTCCCCACCATATGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 TCTCTCTCAACACTCTCTGGTCATCAAATGGAATTCCCCACCATATGTCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 GCAGTACTCAGTCTGAAAAGCTAACAAATACTGCATCTAACCACTCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 GCAGTACTCAGTCTGAAAAGCTAACAAATACTGCATCTAACCACTCAATG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 GACCTTACAAAAAGCAAAGACCCACCAGGAGAGAAACCAGCCCAAAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 GACCTTACAAAAAGCAAAGACCCACCAGGAGAGAAACCAGCCCAAAATGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 AGGTGCACAGAACTCTGCAACGTTTAGTGCCAGTAAGCTGTTACAAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 AGGTGCACAGAACTCTGCAACGTTTAGTGCCAGTAAGCTGTTACAAAATT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 TAGCACAATGTGGAATGCAGTCATCCATGTCAGTGGAAGAGCAGAGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 TAGCACAATGTGGAATGCAGTCATCCATGTCAGTGGAAGAGCAGAGACCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 AGCAAACAGCTGTTAACTGGAAACACAGATAAACCGATAGGTATGATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 AGCAAACAGCTGTTAACTGGAAACACAGATAAACCGATAGGTATGATTGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 TAGATTAAATAGCCCTTTGCTCTCAAATAAAACAAATGCAGTTGAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 TAGATTAAATAGCCCTTTGCTCTCAAATAAAACAAATGCAGTTGAAGAAA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 ATAAAGCATTTAGTAGTCAACCAACAGGTCCTGAACCAGGGCTTTCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 ATAAAGCATTTAGTAGTCAACCAACAGGTCCTGAACCAGGGCTTTCTGGT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2101 TCTGAAATAGAAAATCTGCTTGAAAGACGTACTGTCCTCCAGTTGCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 TCTGAAATAGAAAATCTGCTTGAAAGACGTACTGTCCTCCAGTTGCTCCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2151 GGGGAACCCCAACAAAGGGAAGAGTGAAAAAAAAGAGAAAACTCCCTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102151 GGGGAACCCCAACAAAGGGAAGAGTGAAAAAAAAGAGAAAACTCCCTTAA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2201 GAGATGAAAGTACTCAGGAACACTCAGAGAGAGCTTTAAGTGAACAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102201 GAGATGAAAGTACTCAGGAACACTCAGAGAGAGCTTTAAGTGAACAAATA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2251 CTGATGGTGAAAATAAAATCTGAGCCTTGTGATGACTTACAAATTCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102251 CTGATGGTGAAAATAAAATCTGAGCCTTGTGATGACTTACAAATTCCTAA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2301 CACAAATGTGCACTTGAGCCATGATGCTAAGAGTGCCCCATTCTTGGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102301 CACAAATGTGCACTTGAGCCATGATGCTAAGAGTGCCCCATTCTTGGGTA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2351 TGGCTCCTGCTGTGCAGAGAAGCGCACCTGCCTTACCAGTGTCCGAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102351 TGGCTCCTGCTGTGCAGAGAAGCGCACCTGCCTTACCAGTGTCCGAAGAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2401 TTTAAATCGGAGCCTGTTTCACCTCAGGATTTTTCTTTCTCCAAGAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102401 TTTAAATCGGAGCCTGTTTCACCTCAGGATTTTTCTTTCTCCAAGAATGG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2451 TCTGCTAAGTCGATTGCTAAGACAAAATCAAGATAGTTACCTGGCAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102451 TCTGCTAAGTCGATTGCTAAGACAAAATCAAGATAGTTACCTGGCAGATG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2501 ATTCAGACAGGAGTCACAGAAATAATGAAATGGCACTTCTAGAATCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102501 ATTCAGACAGGAGTCACAGAAATAATGAAATGGCACTTCTAGAATCAAAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2551 AATCTTTGCATGGTCCCTAAGAAAAGGAAGCTTTATACTGAGCCATTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102551 AATCTTTGCATGGTCCCTAAGAAAAGGAAGCTTTATACTGAGCCATTAGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2601 AAATCCATTTAAAAAGATGAAAAACAACATTGTTGATGCTGCAAACAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102601 AAATCCATTTAAAAAGATGAAAAACAACATTGTTGATGCTGCAAACAATC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2651 ACAGTGCCCCAGAAGTACTGTATGGGTCCTTGCTTAACCAGGAAGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102651 ACAGTGCCCCAGAAGTACTGTATGGGTCCTTGCTTAACCAGGAAGAGCTG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2701 AAATTTAGCAGAAATGATCTTGAATTTAAATATCCTGCTGGTCATGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102701 AAATTTAGCAGAAATGATCTTGAATTTAAATATCCTGCTGGTCATGGCTC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2751 AGCCAGCGAAAGTGAACACAGGAGTTGGGCCAGAGAGAGCAAAAGCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102751 AGCCAGCGAAAGTGAACACAGGAGTTGGGCCAGAGAGAGCAAAAGCTTTA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2801 ATGTTCTGAAACAGCTGCTTCTCTCAGAAAACTGTGTGCGAGATTTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102801 ATGTTCTGAAACAGCTGCTTCTCTCAGAAAACTGTGTGCGAGATTTGTCC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2851 CCGCACAGAAGTAACTCTGTGGCTGACAGTAAAAAGAAAGGACACAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102851 CCGCACAGAAGTAACTCTGTGGCTGACAGTAAAAAGAAAGGACACAAAAA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2901 TAATGTGACCAACAGCAAACCTGAATTTAGCATTTCTTCTTTAAATGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102901 TAATGTGACCAACAGCAAACCTGAATTTAGCATTTCTTCTTTAAATGGAC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2951 TGATGTACAGTTCCACTCAGCCCAGCAGTTGCATGGATAACAGGACATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102951 TGATGTACAGTTCCACTCAGCCCAGCAGTTGCATGGATAACAGGACATTT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3001 TCATACCCAGGTGTAGTAAAAACTCCTGTGAGTCCTACTTTCCCTGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103001 TCATACCCAGGTGTAGTAAAAACTCCTGTGAGTCCTACTTTCCCTGAGCA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3051 CTTGGGCTGTGCAGGGTCTAGACCAGAATCTGGGCTTTTGAATGGGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103051 CTTGGGCTGTGCAGGGTCTAGACCAGAATCTGGGCTTTTGAATGGGTGTT

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3101 CCATGCCCAGTGAGAAAGGACCCATTAAGTGGGTTATCACTGATGCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103101 CCATGCCCAGTGAGAAAGGACCCATTAAGTGGGTTATCACTGATGCGGAG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3151 AAGAATGAGTATGAAAAAGACTCTCCAAGATTGACCAAAACCAACCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103151 AAGAATGAGTATGAAAAAGACTCTCCAAGATTGACCAAAACCAACCCAAT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3201 ACTATATTACATGCTTCAAAAAGGAGGCAATTCTGTTACCAGTCGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103201 ACTATATTACATGCTTCAAAAAGGAGGCAATTCTGTTACCAGTCGAGAAA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3251 CACAAGACAAGGACATTTGGAGGGAGCCTTCATCTGCTGAAAGTGTCTCA
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 103251 CACAAGACAAGGACATTTGGAGGGAGGCTTCATCTGCTGAAAGTGTCTCA

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3301 CAGGTCACAGCCAAAGAAGAGTTACTTCCTACTGCAGAAACGAAAGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103301 CAGGTCACAGCCAAAGAAGAGTTACTTCCTACTGCAGAAACGAAAGCTTC

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3351 TTTCTTTAATTTAAGAAGCCCTTACAATAGCCATATGGGAAATAATGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103351 TTTCTTTAATTTAAGAAGCCCTTACAATAGCCATATGGGAAATAATGCTT

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3401 CTCGCCCACACAGCGCAAATGGAGAAGTTTATGGACTTCTGGGAAGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103401 CTCGCCCACACAGCGCAAATGGAGAAGTTTATGGACTTCTGGGAAGCGTG

   3450     .    :    .    :
   3451 CTAACGATAAAGAAAGAATCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||
 103451 CTAACGATAAAGAAAGAATCAGAA