Result of FASTA (ccds) for pF1KB5591
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5591, 926 aa
  1>>>pF1KB5591 926 - 926 aa - 926 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1974+/-0.000974; mu= 16.4600+/- 0.059
 mean_var=78.5170+/-16.044, 0's: 0 Z-trim(105.6): 131  B-trim: 23 in 2/49
 Lambda= 0.144741
 statistics sampled from 8355 (8489) to 8355 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.62), E-opt: 0.2 (0.261), width:  16
 Scan time:  3.780

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS46496.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2           ( 926) 6426 1352.1       0
CCDS2364.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2            ( 931) 6406 1347.9       0
CCDS46498.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2           ( 901) 5631 1186.1       0
CCDS2365.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2            ( 906) 5631 1186.1       0
CCDS46497.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2           ( 909) 5631 1186.1       0
CCDS46499.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2           ( 555) 3791 801.8       0
CCDS7177.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10           ( 923) 2429 517.4 4.8e-146
CCDS31179.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10          ( 609) 2193 468.1 2.3e-131
CCDS81448.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10          ( 906) 2190 467.5  5e-131
CCDS31180.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10          ( 644) 2180 465.4 1.6e-130
CCDS58460.1 NETO2 gene_id:81831|Hs108|chr16        ( 518)  459 106.0   2e-22
CCDS44026.1 F8 gene_id:2157|Hs108|chrX             ( 216)  438 101.5 1.9e-21
CCDS35457.1 F8 gene_id:2157|Hs108|chrX             (2351)  438 101.8 1.6e-20
CCDS7113.1 CUBN gene_id:8029|Hs108|chr10           (3623)  438 101.9 2.4e-20
CCDS1281.1 F5 gene_id:2153|Hs108|chr1              (2224)  404 94.7 2.1e-18
CCDS7449.1 TLL2 gene_id:7093|Hs108|chr10           (1015)  381 89.8 2.9e-17
CCDS588.2 CDCP2 gene_id:200008|Hs108|chr1          ( 449)  370 87.4 6.8e-17
CCDS3811.1 TLL1 gene_id:7092|Hs108|chr4            (1013)  375 88.5 6.9e-17
CCDS64195.1 EDIL3 gene_id:10085|Hs108|chr5         ( 470)  361 85.5 2.6e-16
CCDS4062.1 EDIL3 gene_id:10085|Hs108|chr5          ( 480)  361 85.5 2.7e-16
CCDS46878.1 DCBLD2 gene_id:131566|Hs108|chr3       ( 775)  357 84.7 7.3e-16
CCDS34856.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8            ( 730)  348 82.8 2.5e-15
CCDS6026.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8             ( 986)  348 82.9 3.3e-15
CCDS81918.1 MFGE8 gene_id:4240|Hs108|chr15         ( 343)  341 81.3 3.6e-15
CCDS10347.1 MFGE8 gene_id:4240|Hs108|chr15         ( 387)  341 81.3   4e-15
CCDS12000.1 NETO1 gene_id:81832|Hs108|chr18        ( 533)  326 78.2 4.6e-14
CCDS10727.1 NETO2 gene_id:81831|Hs108|chr16        ( 525)  321 77.2 9.4e-14
CCDS5476.1 AEBP1 gene_id:165|Hs108|chr7            (1158)  324 77.9 1.2e-13
CCDS1241.1 DDR2 gene_id:4921|Hs108|chr1            ( 855)  322 77.4 1.3e-13
CCDS42444.1 NETO1 gene_id:81832|Hs108|chr18        ( 156)  306 73.8 2.8e-13
CCDS34522.1 DCBLD1 gene_id:285761|Hs108|chr6       ( 539)  311 75.1 4.1e-13
CCDS5700.1 PCOLCE gene_id:5118|Hs108|chr7          ( 449)  308 74.4 5.4e-13
CCDS14187.1 RS1 gene_id:6247|Hs108|chrX            ( 224)  303 73.3 5.9e-13
CCDS73251.1 OVCH2 gene_id:341277|Hs108|chr11       ( 565)  308 74.4 6.6e-13
CCDS7637.1 CPXM2 gene_id:119587|Hs108|chr10        ( 756)  305 73.9 1.3e-12
CCDS55189.1 CSMD1 gene_id:64478|Hs108|chr8         (3564)  310 75.1 2.6e-12
CCDS7631.1 CUZD1 gene_id:50624|Hs108|chr10         ( 607)  298 72.4   3e-12
CCDS75419.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6            ( 767)  292 71.2 8.8e-12
CCDS4690.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6             ( 876)  292 71.2 9.9e-12
CCDS56411.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6            ( 894)  292 71.2   1e-11
CCDS34385.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6            ( 913)  292 71.2   1e-11
CCDS47396.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6            ( 919)  292 71.2   1e-11
CCDS380.1 CSMD2 gene_id:114784|Hs108|chr1          (3487)  294 71.8 2.6e-11
CCDS60082.1 CSMD2 gene_id:114784|Hs108|chr1        (3631)  294 71.8 2.7e-11
CCDS13033.1 CPXM1 gene_id:56265|Hs108|chr20        ( 734)  276 67.8 8.6e-11


>>CCDS46496.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2                (926 aa)
 initn: 6426 init1: 6426 opt: 6426  Z-score: 7246.1  bits: 1352.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6426; 100.0% identity (100.0% similar) in 926 aa overlap (1-926:1-926)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MDMFPLTWVFLALYFSRHQVRGQPDPPCGGRLNSKDAGYITSPGYPQDYPSHQNCEWIVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MDMFPLTWVFLALYFSRHQVRGQPDPPCGGRLNSKDAGYITSPGYPQDYPSHQNCEWIVY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 APEPNQKIVLNFNPHFEIEKHDCKYDFIEIRDGDSESADLLGKHCGNIAPPTIISSGSML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 APEPNQKIVLNFNPHFEIEKHDCKYDFIEIRDGDSESADLLGKHCGNIAPPTIISSGSML
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 YIKFTSDYARQGAGFSLRYEIFKTGSEDCSKNFTSPNGTIESPGFPEKYPHNLDCTFTIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YIKFTSDYARQGAGFSLRYEIFKTGSEDCSKNFTSPNGTIESPGFPEKYPHNLDCTFTIL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 AKPKMEIILQFLIFDLEHDPLQVGEGDCKYDWLDIWDGIPHVGPLIGKYCGTKTPSELRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AKPKMEIILQFLIFDLEHDPLQVGEGDCKYDWLDIWDGIPHVGPLIGKYCGTKTPSELRS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 STGILSLTFHTDMAVAKDGFSARYYLVHQEPLENFQCNVPLGMESGRIANEQISASSTYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 STGILSLTFHTDMAVAKDGFSARYYLVHQEPLENFQCNVPLGMESGRIANEQISASSTYS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 DGRWTPQQSRLHGDDNGWTPNLDSNKEYLQVDLRFLTMLTAIATQGAISRETQNGYYVKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DGRWTPQQSRLHGDDNGWTPNLDSNKEYLQVDLRFLTMLTAIATQGAISRETQNGYYVKS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 YKLEVSTNGEDWMVYRHGKNHKVFQANNDATEVVLNKLHAPLLTRFVRIRPQTWHSGIAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YKLEVSTNGEDWMVYRHGKNHKVFQANNDATEVVLNKLHAPLLTRFVRIRPQTWHSGIAL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 RLELFGCRVTDAPCSNMLGMLSGLIADSQISASSTQEYLWSPSAARLVSSRSGWFPRIPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RLELFGCRVTDAPCSNMLGMLSGLIADSQISASSTQEYLWSPSAARLVSSRSGWFPRIPQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 AQPGEEWLQVDLGTPKTVKGVIIQGARGGDSITAVEARAFVRKFKVSYSLNGKDWEYIQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AQPGEEWLQVDLGTPKTVKGVIIQGARGGDSITAVEARAFVRKFKVSYSLNGKDWEYIQD
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 PRTQQPKLFEGNMHYDTPDIRRFDPIPAQYVRVYPERWSPAGIGMRLEVLGCDWTDSKPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PRTQQPKLFEGNMHYDTPDIRRFDPIPAQYVRVYPERWSPAGIGMRLEVLGCDWTDSKPT
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 VETLGPTVKSEETTTPYPTEEEATECGENCSFEDDKDLQLPSGFNCNFDFLEEPCGWMYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VETLGPTVKSEETTTPYPTEEEATECGENCSFEDDKDLQLPSGFNCNFDFLEEPCGWMYD
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 HAKWLRTTWASSSSPNDRTFPDDRNFLRLQSDSQREGQYARLISPPVHLPRSPVCMEFQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HAKWLRTTWASSSSPNDRTFPDDRNFLRLQSDSQREGQYARLISPPVHLPRSPVCMEFQY
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB5 QATGGRGVALQVVREASQESKLLWVIREDQGGEWKHGRIILPSYDMEYQIVFEGVIGKGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QATGGRGVALQVVREASQESKLLWVIREDQGGEWKHGRIILPSYDMEYQIVFEGVIGKGR
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB5 SGEIAIDDIRISTDVPLENCMEPISAFAVDIPEIHEREGYEDEIDDEYEVDWSNSSSATS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SGEIAIDDIRISTDVPLENCMEPISAFAVDIPEIHEREGYEDEIDDEYEVDWSNSSSATS
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB5 GSGAPSTDKEKSWLYTLDPILITIIAMSSLGVLLGATCAGLLLYCTCSYSGLSSRSCTTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GSGAPSTDKEKSWLYTLDPILITIIAMSSLGVLLGATCAGLLLYCTCSYSGLSSRSCTTL
              850       860       870       880       890       900

              910       920      
pF1KB5 ENYNFELYDGLKHKVKMNHQKCCSEA
       ::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ENYNFELYDGLKHKVKMNHQKCCSEA
              910       920      

>>CCDS2364.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2                 (931 aa)
 initn: 5631 init1: 5631 opt: 6406  Z-score: 7223.5  bits: 1347.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6406; 99.5% identity (99.5% similar) in 931 aa overlap (1-926:1-931)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MDMFPLTWVFLALYFSRHQVRGQPDPPCGGRLNSKDAGYITSPGYPQDYPSHQNCEWIVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 MDMFPLTWVFLALYFSRHQVRGQPDPPCGGRLNSKDAGYITSPGYPQDYPSHQNCEWIVY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 APEPNQKIVLNFNPHFEIEKHDCKYDFIEIRDGDSESADLLGKHCGNIAPPTIISSGSML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 APEPNQKIVLNFNPHFEIEKHDCKYDFIEIRDGDSESADLLGKHCGNIAPPTIISSGSML
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 YIKFTSDYARQGAGFSLRYEIFKTGSEDCSKNFTSPNGTIESPGFPEKYPHNLDCTFTIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 YIKFTSDYARQGAGFSLRYEIFKTGSEDCSKNFTSPNGTIESPGFPEKYPHNLDCTFTIL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 AKPKMEIILQFLIFDLEHDPLQVGEGDCKYDWLDIWDGIPHVGPLIGKYCGTKTPSELRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 AKPKMEIILQFLIFDLEHDPLQVGEGDCKYDWLDIWDGIPHVGPLIGKYCGTKTPSELRS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 STGILSLTFHTDMAVAKDGFSARYYLVHQEPLENFQCNVPLGMESGRIANEQISASSTYS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 DGRWTPQQSRLHGDDNGWTPNLDSNKEYLQVDLRFLTMLTAIATQGAISRETQNGYYVKS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 YKLEVSTNGEDWMVYRHGKNHKVFQANNDATEVVLNKLHAPLLTRFVRIRPQTWHSGIAL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 RLELFGCRVTDAPCSNMLGMLSGLIADSQISASSTQEYLWSPSAARLVSSRSGWFPRIPQ
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 AQPGEEWLQVDLGTPKTVKGVIIQGARGGDSITAVEARAFVRKFKVSYSLNGKDWEYIQD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 PRTQQPKLFEGNMHYDTPDIRRFDPIPAQYVRVYPERWSPAGIGMRLEVLGCDWTDSKPT
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 QATGGRGVALQVVREASQESKLLWVIREDQGGEWKHGRIILPSYDMEYQIVFEGVIGKGR
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       ::::::::::::::::::::::::::::     :::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 SGEIAIDDIRISTDVPLENCMEPISAFAGENFKVDIPEIHEREGYEDEIDDEYEVDWSNS
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pF1KB5 SSATSGSGAPSTDKEKSWLYTLDPILITIIAMSSLGVLLGATCAGLLLYCTCSYSGLSSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 SSATSGSGAPSTDKEKSWLYTLDPILITIIAMSSLGVLLGATCAGLLLYCTCSYSGLSSR
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pF1KB5 SCTTLENYNFELYDGLKHKVKMNHQKCCSEA
       :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 SCTTLENYNFELYDGLKHKVKMNHQKCCSEA
              910       920       930 

>>CCDS46498.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2                (901 aa)
 initn: 5631 init1: 5631 opt: 5631  Z-score: 6349.1  bits: 1186.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5631; 100.0% identity (100.0% similar) in 808 aa overlap (1-808:1-808)

               10        20        30        40        50        60
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MDMFPLTWVFLALYFSRHQVRGQPDPPCGGRLNSKDAGYITSPGYPQDYPSHQNCEWIVY
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 APEPNQKIVLNFNPHFEIEKHDCKYDFIEIRDGDSESADLLGKHCGNIAPPTIISSGSML
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YIKFTSDYARQGAGFSLRYEIFKTGSEDCSKNFTSPNGTIESPGFPEKYPHNLDCTFTIL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AKPKMEIILQFLIFDLEHDPLQVGEGDCKYDWLDIWDGIPHVGPLIGKYCGTKTPSELRS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 STGILSLTFHTDMAVAKDGFSARYYLVHQEPLENFQCNVPLGMESGRIANEQISASSTYS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RLELFGCRVTDAPCSNMLGMLSGLIADSQISASSTQEYLWSPSAARLVSSRSGWFPRIPQ
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AQPGEEWLQVDLGTPKTVKGVIIQGARGGDSITAVEARAFVRKFKVSYSLNGKDWEYIQD
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pF1KB5 PRTQQPKLFEGNMHYDTPDIRRFDPIPAQYVRVYPERWSPAGIGMRLEVLGCDWTDSKPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PRTQQPKLFEGNMHYDTPDIRRFDPIPAQYVRVYPERWSPAGIGMRLEVLGCDWTDSKPT
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pF1KB5 VETLGPTVKSEETTTPYPTEEEATECGENCSFEDDKDLQLPSGFNCNFDFLEEPCGWMYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VETLGPTVKSEETTTPYPTEEEATECGENCSFEDDKDLQLPSGFNCNFDFLEEPCGWMYD
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pF1KB5 HAKWLRTTWASSSSPNDRTFPDDRNFLRLQSDSQREGQYARLISPPVHLPRSPVCMEFQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HAKWLRTTWASSSSPNDRTFPDDRNFLRLQSDSQREGQYARLISPPVHLPRSPVCMEFQY
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pF1KB5 QATGGRGVALQVVREASQESKLLWVIREDQGGEWKHGRIILPSYDMEYQIVFEGVIGKGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QATGGRGVALQVVREASQESKLLWVIREDQGGEWKHGRIILPSYDMEYQIVFEGVIGKGR
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pF1KB5 SGEIAIDDIRISTDVPLENCMEPISAFAVDIPEIHEREGYEDEIDDEYEVDWSNSSSATS
       ::::::::::::::::::::::::::::                                
CCDS46 SGEIAIDDIRISTDVPLENCMEPISAFAGGTLLPGTEPTVDTVPMQPIPAYWYYVMAAGG
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>>CCDS2365.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2                 (906 aa)
 initn: 5631 init1: 5631 opt: 5631  Z-score: 6349.1  bits: 1186.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5631; 100.0% identity (100.0% similar) in 808 aa overlap (1-808:1-808)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MDMFPLTWVFLALYFSRHQVRGQPDPPCGGRLNSKDAGYITSPGYPQDYPSHQNCEWIVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 MDMFPLTWVFLALYFSRHQVRGQPDPPCGGRLNSKDAGYITSPGYPQDYPSHQNCEWIVY
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pF1KB5 APEPNQKIVLNFNPHFEIEKHDCKYDFIEIRDGDSESADLLGKHCGNIAPPTIISSGSML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 APEPNQKIVLNFNPHFEIEKHDCKYDFIEIRDGDSESADLLGKHCGNIAPPTIISSGSML
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 YIKFTSDYARQGAGFSLRYEIFKTGSEDCSKNFTSPNGTIESPGFPEKYPHNLDCTFTIL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 AKPKMEIILQFLIFDLEHDPLQVGEGDCKYDWLDIWDGIPHVGPLIGKYCGTKTPSELRS
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pF1KB5 STGILSLTFHTDMAVAKDGFSARYYLVHQEPLENFQCNVPLGMESGRIANEQISASSTYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 STGILSLTFHTDMAVAKDGFSARYYLVHQEPLENFQCNVPLGMESGRIANEQISASSTYS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 DGRWTPQQSRLHGDDNGWTPNLDSNKEYLQVDLRFLTMLTAIATQGAISRETQNGYYVKS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 YKLEVSTNGEDWMVYRHGKNHKVFQANNDATEVVLNKLHAPLLTRFVRIRPQTWHSGIAL
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pF1KB5 RLELFGCRVTDAPCSNMLGMLSGLIADSQISASSTQEYLWSPSAARLVSSRSGWFPRIPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 RLELFGCRVTDAPCSNMLGMLSGLIADSQISASSTQEYLWSPSAARLVSSRSGWFPRIPQ
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pF1KB5 AQPGEEWLQVDLGTPKTVKGVIIQGARGGDSITAVEARAFVRKFKVSYSLNGKDWEYIQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 AQPGEEWLQVDLGTPKTVKGVIIQGARGGDSITAVEARAFVRKFKVSYSLNGKDWEYIQD
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pF1KB5 PRTQQPKLFEGNMHYDTPDIRRFDPIPAQYVRVYPERWSPAGIGMRLEVLGCDWTDSKPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 PRTQQPKLFEGNMHYDTPDIRRFDPIPAQYVRVYPERWSPAGIGMRLEVLGCDWTDSKPT
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pF1KB5 VETLGPTVKSEETTTPYPTEEEATECGENCSFEDDKDLQLPSGFNCNFDFLEEPCGWMYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 VETLGPTVKSEETTTPYPTEEEATECGENCSFEDDKDLQLPSGFNCNFDFLEEPCGWMYD
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pF1KB5 HAKWLRTTWASSSSPNDRTFPDDRNFLRLQSDSQREGQYARLISPPVHLPRSPVCMEFQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 HAKWLRTTWASSSSPNDRTFPDDRNFLRLQSDSQREGQYARLISPPVHLPRSPVCMEFQY
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pF1KB5 QATGGRGVALQVVREASQESKLLWVIREDQGGEWKHGRIILPSYDMEYQIVFEGVIGKGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 QATGGRGVALQVVREASQESKLLWVIREDQGGEWKHGRIILPSYDMEYQIVFEGVIGKGR
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pF1KB5 SGEIAIDDIRISTDVPLENCMEPISAFAVDIPEIHEREGYEDEIDDEYEVDWSNSSSATS
       ::::::::::::::::::::::::::::                                
CCDS23 SGEIAIDDIRISTDVPLENCMEPISAFAGENFKGGTLLPGTEPTVDTVPMQPIPAYWYYV
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>>CCDS46497.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2                (909 aa)
 initn: 6295 init1: 5631 opt: 5631  Z-score: 6349.1  bits: 1186.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6265; 98.2% identity (98.2% similar) in 926 aa overlap (1-926:1-909)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MDMFPLTWVFLALYFSRHQVRGQPDPPCGGRLNSKDAGYITSPGYPQDYPSHQNCEWIVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MDMFPLTWVFLALYFSRHQVRGQPDPPCGGRLNSKDAGYITSPGYPQDYPSHQNCEWIVY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 APEPNQKIVLNFNPHFEIEKHDCKYDFIEIRDGDSESADLLGKHCGNIAPPTIISSGSML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 APEPNQKIVLNFNPHFEIEKHDCKYDFIEIRDGDSESADLLGKHCGNIAPPTIISSGSML
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pF1KB5 YIKFTSDYARQGAGFSLRYEIFKTGSEDCSKNFTSPNGTIESPGFPEKYPHNLDCTFTIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YIKFTSDYARQGAGFSLRYEIFKTGSEDCSKNFTSPNGTIESPGFPEKYPHNLDCTFTIL
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pF1KB5 AKPKMEIILQFLIFDLEHDPLQVGEGDCKYDWLDIWDGIPHVGPLIGKYCGTKTPSELRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AKPKMEIILQFLIFDLEHDPLQVGEGDCKYDWLDIWDGIPHVGPLIGKYCGTKTPSELRS
              190       200       210       220       230       240

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pF1KB5 STGILSLTFHTDMAVAKDGFSARYYLVHQEPLENFQCNVPLGMESGRIANEQISASSTYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 STGILSLTFHTDMAVAKDGFSARYYLVHQEPLENFQCNVPLGMESGRIANEQISASSTYS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DGRWTPQQSRLHGDDNGWTPNLDSNKEYLQVDLRFLTMLTAIATQGAISRETQNGYYVKS
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pF1KB5 YKLEVSTNGEDWMVYRHGKNHKVFQANNDATEVVLNKLHAPLLTRFVRIRPQTWHSGIAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YKLEVSTNGEDWMVYRHGKNHKVFQANNDATEVVLNKLHAPLLTRFVRIRPQTWHSGIAL
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pF1KB5 RLELFGCRVTDAPCSNMLGMLSGLIADSQISASSTQEYLWSPSAARLVSSRSGWFPRIPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RLELFGCRVTDAPCSNMLGMLSGLIADSQISASSTQEYLWSPSAARLVSSRSGWFPRIPQ
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pF1KB5 AQPGEEWLQVDLGTPKTVKGVIIQGARGGDSITAVEARAFVRKFKVSYSLNGKDWEYIQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AQPGEEWLQVDLGTPKTVKGVIIQGARGGDSITAVEARAFVRKFKVSYSLNGKDWEYIQD
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pF1KB5 PRTQQPKLFEGNMHYDTPDIRRFDPIPAQYVRVYPERWSPAGIGMRLEVLGCDWTDSKPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PRTQQPKLFEGNMHYDTPDIRRFDPIPAQYVRVYPERWSPAGIGMRLEVLGCDWTDSKPT
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pF1KB5 VETLGPTVKSEETTTPYPTEEEATECGENCSFEDDKDLQLPSGFNCNFDFLEEPCGWMYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VETLGPTVKSEETTTPYPTEEEATECGENCSFEDDKDLQLPSGFNCNFDFLEEPCGWMYD
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pF1KB5 HAKWLRTTWASSSSPNDRTFPDDRNFLRLQSDSQREGQYARLISPPVHLPRSPVCMEFQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 HAKWLRTTWASSSSPNDRTFPDDRNFLRLQSDSQREGQYARLISPPVHLPRSPVCMEFQY
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pF1KB5 QATGGRGVALQVVREASQESKLLWVIREDQGGEWKHGRIILPSYDMEYQIVFEGVIGKGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QATGGRGVALQVVREASQESKLLWVIREDQGGEWKHGRIILPSYDMEYQIVFEGVIGKGR
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pF1KB5 SGEIAIDDIRISTDVPLENCMEPISAFAVDIPEIHEREGYEDEIDDEYEVDWSNSSSATS
       ::::::::::::::::::::::::::::                 :::::::::::::::
CCDS46 SGEIAIDDIRISTDVPLENCMEPISAFA-----------------DEYEVDWSNSSSATS
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pF1KB5 GSGAPSTDKEKSWLYTLDPILITIIAMSSLGVLLGATCAGLLLYCTCSYSGLSSRSCTTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GSGAPSTDKEKSWLYTLDPILITIIAMSSLGVLLGATCAGLLLYCTCSYSGLSSRSCTTL
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              910       920      
pF1KB5 ENYNFELYDGLKHKVKMNHQKCCSEA
       ::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ENYNFELYDGLKHKVKMNHQKCCSEA
           890       900         

>>CCDS46499.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2                (555 aa)
 initn: 4122 init1: 3791 opt: 3791  Z-score: 4276.0  bits: 801.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3791; 99.8% identity (100.0% similar) in 548 aa overlap (1-548:1-548)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MDMFPLTWVFLALYFSRHQVRGQPDPPCGGRLNSKDAGYITSPGYPQDYPSHQNCEWIVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MDMFPLTWVFLALYFSRHQVRGQPDPPCGGRLNSKDAGYITSPGYPQDYPSHQNCEWIVY
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB5 APEPNQKIVLNFNPHFEIEKHDCKYDFIEIRDGDSESADLLGKHCGNIAPPTIISSGSML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 APEPNQKIVLNFNPHFEIEKHDCKYDFIEIRDGDSESADLLGKHCGNIAPPTIISSGSML
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pF1KB5 YIKFTSDYARQGAGFSLRYEIFKTGSEDCSKNFTSPNGTIESPGFPEKYPHNLDCTFTIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YIKFTSDYARQGAGFSLRYEIFKTGSEDCSKNFTSPNGTIESPGFPEKYPHNLDCTFTIL
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pF1KB5 AKPKMEIILQFLIFDLEHDPLQVGEGDCKYDWLDIWDGIPHVGPLIGKYCGTKTPSELRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AKPKMEIILQFLIFDLEHDPLQVGEGDCKYDWLDIWDGIPHVGPLIGKYCGTKTPSELRS
              190       200       210       220       230       240

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pF1KB5 STGILSLTFHTDMAVAKDGFSARYYLVHQEPLENFQCNVPLGMESGRIANEQISASSTYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 STGILSLTFHTDMAVAKDGFSARYYLVHQEPLENFQCNVPLGMESGRIANEQISASSTYS
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pF1KB5 DGRWTPQQSRLHGDDNGWTPNLDSNKEYLQVDLRFLTMLTAIATQGAISRETQNGYYVKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DGRWTPQQSRLHGDDNGWTPNLDSNKEYLQVDLRFLTMLTAIATQGAISRETQNGYYVKS
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pF1KB5 YKLEVSTNGEDWMVYRHGKNHKVFQANNDATEVVLNKLHAPLLTRFVRIRPQTWHSGIAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YKLEVSTNGEDWMVYRHGKNHKVFQANNDATEVVLNKLHAPLLTRFVRIRPQTWHSGIAL
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pF1KB5 RLELFGCRVTDAPCSNMLGMLSGLIADSQISASSTQEYLWSPSAARLVSSRSGWFPRIPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RLELFGCRVTDAPCSNMLGMLSGLIADSQISASSTQEYLWSPSAARLVSSRSGWFPRIPQ
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pF1KB5 AQPGEEWLQVDLGTPKTVKGVIIQGARGGDSITAVEARAFVRKFKVSYSLNGKDWEYIQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AQPGEEWLQVDLGTPKTVKGVIIQGARGGDSITAVEARAFVRKFKVSYSLNGKDWEYIQD
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pF1KB5 PRTQQPKLFEGNMHYDTPDIRRFDPIPAQYVRVYPERWSPAGIGMRLEVLGCDWTDSKPT
       :::::::.                                                    
CCDS46 PRTQQPKVGCSWRPL                                             
              550                                                  

>>CCDS7177.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10                (923 aa)
 initn: 1933 init1: 773 opt: 2429  Z-score: 2735.4  bits: 517.4 E(32554): 4.8e-146
Smith-Waterman score: 2785; 45.8% identity (72.5% similar) in 928 aa overlap (28-926:27-923)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MDMFPLTWVFLALYFSRHQVRGQPDPPCGGRLNSKDAGYITSPGYPQDYPSHQNCEWIVY
                                  ::  .. .. ::.::::::..:   ..:::.. 
CCDS71  MERGLPLLCAVLALVLAPAGAFRNDKCGDTIKIESPGYLTSPGYPHSYHPSEKCEWLIQ
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 APEPNQKIVLNFNPHFEIEKHDCKYDFIEIRDGDSESADLLGKHCGNIAPPTIISSGSML
       ::.: :.:..::::::..: .:::::..:. ::..:.. . :: ::.:::: ..::: .:
CCDS71 APDPYQRIMINFNPHFDLEDRDCKYDYVEVFDGENENGHFRGKFCGKIAPPPVVSSGPFL
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pF1KB5 LRLELFGCRVTDAPCSNMLGMLSGLIADSQISASSTQEYLWSPSAARLVSSRSGW-FPRI
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pF1KB5 PQAQPGEEWLQVDLGTPKTVKGVIIQGARGGDSITAVEARAFVRKFKVSYSLNGKDWEYI
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CCDS31 PHSYINE-WLQIDLGEEKIVRGIIIQGGKHR------ENKVFMRKFKIGYSNNGSDWKMI
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CCDS31 TVLATEKPTVIDSTIQSGIK                                        
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>>CCDS81448.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10               (906 aa)
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CCDS81 TYGFNCEFGWGSHKTFCHWEHDNHVQLKWSVLTSKTGPIQDHTGDGNFIYSQADENQKGK
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CCDS81 EGRVLLHKSLKLYQVIFEGEIGKGNLGGIAVDDISINNHISQEDC-------ARSTP---
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          ::: : . . ..                . :  . : :::::::::::::.::::::
CCDS81 ---GYEGEGEGDKNI----------------SRKPGNVLKTLDPILITIIAMSALGVLLG
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       :.: :..:::.: ..:.: :. ..:::::::: ::.: .: :.: :.  :::
CCDS81 AVC-GVVLYCACWHNGMSERNLSALENYNFELVDGVKLKKDKLNTQSTYSEA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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