Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5096
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5096, 582 aa
1>>>pF1KB5096 582 - 582 aa - 582 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6328+/-0.000792; mu= 18.2413+/- 0.048
mean_var=84.8829+/-16.794, 0's: 0 Z-trim(110.1): 33 B-trim: 150 in 2/50
Lambda= 0.139208
statistics sampled from 11332 (11365) to 11332 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.714), E-opt: 0.2 (0.349), width: 16
Scan time: 2.850
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9577.1 MMP14 gene_id:4323|Hs108|chr14 ( 582) 4072 827.7 0
CCDS10492.1 MMP25 gene_id:64386|Hs108|chr16 ( 562) 1255 261.9 1.5e-69
CCDS6246.1 MMP16 gene_id:4325|Hs108|chr8 ( 607) 1158 242.4 1.2e-63
CCDS31927.1 MMP17 gene_id:4326|Hs108|chr12 ( 603) 1134 237.6 3.4e-62
CCDS46593.1 MMP24 gene_id:10893|Hs108|chr20 ( 645) 1130 236.8 6.2e-62
CCDS10792.1 MMP15 gene_id:4324|Hs108|chr16 ( 669) 1071 225.0 2.4e-58
CCDS13816.1 MMP11 gene_id:4320|Hs108|chr22 ( 488) 906 191.8 1.7e-48
CCDS74036.1 MMP28 gene_id:79148|Hs108|chr17 ( 520) 747 159.8 7.5e-39
CCDS8318.1 MMP20 gene_id:9313|Hs108|chr11 ( 483) 734 157.2 4.3e-38
CCDS8895.1 MMP19 gene_id:4327|Hs108|chr12 ( 508) 633 136.9 5.8e-32
CCDS8323.1 MMP3 gene_id:4314|Hs108|chr11 ( 477) 549 120.1 6.6e-27
CCDS8321.1 MMP10 gene_id:4319|Hs108|chr11 ( 476) 544 119.0 1.3e-26
CCDS76996.1 MMP28 gene_id:79148|Hs108|chr17 ( 393) 531 116.4 6.9e-26
CCDS8324.1 MMP13 gene_id:4322|Hs108|chr11 ( 471) 496 109.4 1e-23
CCDS76869.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16 ( 584) 494 109.1 1.6e-23
CCDS45487.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16 ( 610) 494 109.1 1.7e-23
CCDS10752.1 MMP2 gene_id:4313|Hs108|chr16 ( 660) 494 109.1 1.8e-23
CCDS8322.1 MMP1 gene_id:4312|Hs108|chr11 ( 469) 487 107.6 3.6e-23
CCDS8317.1 MMP7 gene_id:4316|Hs108|chr11 ( 267) 479 105.8 7.1e-23
CCDS73375.1 MMP12 gene_id:4321|Hs108|chr11 ( 470) 467 103.6 5.9e-22
CCDS8320.1 MMP8 gene_id:4317|Hs108|chr11 ( 467) 445 99.2 1.3e-20
CCDS8319.1 MMP27 gene_id:64066|Hs108|chr11 ( 513) 355 81.1 3.7e-15
CCDS13390.1 MMP9 gene_id:4318|Hs108|chr20 ( 707) 349 80.0 1.1e-14
CCDS7752.1 MMP26 gene_id:56547|Hs108|chr11 ( 261) 339 77.7 2e-14
CCDS11229.1 VTN gene_id:7448|Hs108|chr17 ( 478) 304 70.8 4.3e-12
CCDS30559.1 MMP23B gene_id:8510|Hs108|chr1 ( 390) 289 67.8 2.9e-11
>>CCDS9577.1 MMP14 gene_id:4323|Hs108|chr14 (582 aa)
initn: 4072 init1: 4072 opt: 4072 Z-score: 4419.2 bits: 827.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4072; 100.0% identity (100.0% similar) in 582 aa overlap (1-582:1-582)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSPAPRPPRCLLLPLLTLGTALASLGSAQSSSFSPEAWLQQYGYLPPGDLRTHTQRSPQS
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CCDS95 MSPAPRPPRCLLLPLLTLGTALASLGSAQSSSFSPEAWLQQYGYLPPGDLRTHTQRSPQS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LSAAIAAMQKFYGLQVTGKADADTMKAMRRPRCGVPDKFGAEIKANVRRKRYAIQGLKWQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 LSAAIAAMQKFYGLQVTGKADADTMKAMRRPRCGVPDKFGAEIKANVRRKRYAIQGLKWQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 HNEITFCIQNYTPKVGEYATYEAIRKAFRVWESATPLRFREVPYAYIREGHEKQADIMIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 HNEITFCIQNYTPKVGEYATYEAIRKAFRVWESATPLRFREVPYAYIREGHEKQADIMIF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 FAEGFHGDSTPFDGEGGFLAHAYFPGPNIGGDTHFDSAEPWTVRNEDLNGNDIFLVAVHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 FAEGFHGDSTPFDGEGGFLAHAYFPGPNIGGDTHFDSAEPWTVRNEDLNGNDIFLVAVHE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 LGHALGLEHSSDPSAIMAPFYQWMDTENFVLPDDDRRGIQQLYGGESGFPTKMPPQPRTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 LGHALGLEHSSDPSAIMAPFYQWMDTENFVLPDDDRRGIQQLYGGESGFPTKMPPQPRTT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SRPSVPDKPKNPTYGPNICDGNFDTVAMLRGEMFVFKERWFWRVRNNQVMDGYPMPIGQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 SRPSVPDKPKNPTYGPNICDGNFDTVAMLRGEMFVFKERWFWRVRNNQVMDGYPMPIGQF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 WRGLPASINTAYERKDGKFVFFKGDKHWVFDEASLEPGYPKHIKELGRGLPTDKIDAALF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 WRGLPASINTAYERKDGKFVFFKGDKHWVFDEASLEPGYPKHIKELGRGLPTDKIDAALF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 WMPNGKTYFFRGNKYYRFNEELRAVDSEYPKNIKVWEGIPESPRGSFMGSDEVFTYFYKG
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CCDS95 WMPNGKTYFFRGNKYYRFNEELRAVDSEYPKNIKVWEGIPESPRGSFMGSDEVFTYFYKG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 NKYWKFNNQKLKVEPGYPKSALRDWMGCPSGGRPDEGTEEETEVIIIEVDEEGGGAVSAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 NKYWKFNNQKLKVEPGYPKSALRDWMGCPSGGRPDEGTEEETEVIIIEVDEEGGGAVSAA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KB5 AVVLPVLLLLLVLAVGLAVFFFRRHGTPRRLLYCQRSLLDKV
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CCDS95 AVVLPVLLLLLVLAVGLAVFFFRRHGTPRRLLYCQRSLLDKV
550 560 570 580
>>CCDS10492.1 MMP25 gene_id:64386|Hs108|chr16 (562 aa)
initn: 1174 init1: 245 opt: 1255 Z-score: 1361.9 bits: 261.9 E(32554): 1.5e-69
Smith-Waterman score: 1336; 40.6% identity (65.0% similar) in 566 aa overlap (12-556:10-557)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSPAPRPPRCLLLPLLTLGTALASLGSAQSSSFSPEAWLQQYGYLPPGDLRTHTQRSPQS
:: :: : : :::. :.. . :: .:::::: .::..
CCDS10 MRLRLRLLALLLLLLAPPARAPKPSAQDVSLGVD-WLTRYGYLPPPHPAQAQLQSPEK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LSAAIAAMQKFYGLQVTGKADADTMKAMRRPRCGVPDKFGAEIKANVRRKRYAIQGLKWQ
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CCDS10 LRDAIKVMQRFAGLPETGRMDPGTVATMRKPRCSLPDVLGVAGLVR-RRRRYALSGSVWK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB5 HNEITFCIQNYTPKVGEYATYEAIR----KAFRVWESATPLRFREVPYAYIREGHEKQAD
. .:. .... :. .. . :..: :. .: . : :.:: .:.: :
CCDS10 KRTLTWRVRSF-PQSSQL-SQETVRVLMSYALMAWGMESGLTFHEVDSP---QGQE--PD
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 IMIFFAEGFHGDSTPFDGEGGFLAHAYFPGPN-IGGDTHFDSAEPWTVRNEDLNGNDIFL
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CCDS10 ILIDFARAFHQDSYPFDGLGGTLAHAFFPGEHPISGDTHFDDEETWTFGSKDGEGTDLFA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 VAVHELGHALGLEHSSDPSAIMAPFYQWM--DTENFVLPDDDRRGIQQLYGGESGFPTKM
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CCDS10 VAVHEFGHALGLGHSSAPNSIMRPFYQGPVGDPDKYRLSQDDRDGLQQLYGKAPQTPYDK
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 PPQPRTTSRPSVPDKP-KNPTYG-PNICDGNFDTVAMLRGEMFVFKERWFWRVR-NNQVM
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CCDS10 PTRKPLAPPPQPPASPTHSPSFPIPDRCEGNFDAIANIRGETFFFKGPWFWRLQPSGQLV
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KB5 DGYPMPIGQFWRGLPASI---NTAYER-KDGKFVFFKGDKHWVFDEASLEPGYPKHIKEL
. : . .::.::::.. ..:: : .::....:.: . :::.. .:: : . . ::
CCDS10 SPRPARLHRFWEGLPAQVRVVQAAYARHRDGRILLFSGPQFWVFQDRQLEGG-ARPLTEL
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 GRGLPTDKIDAALFWMPNGKTYFFRGNKYYRFNEELRAVDSEYPKNIKVWEGIPESPRGS
: : ...::.. : :::::. :: .:.:..: : ::.....::: : ::
CCDS10 GLP-PGEEVDAVFSWPQNGKTYLVRGRQYWRYDEAAARPDPGYPRDLSLWEGAPPSPDDV
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510
pF1KB5 FMGSDEVFTYFYKGNKYWKFNNQKLKVEPGYPKSALRDWMGCP--SGG----RPDEGTE-
. :. :::.:: .::.: ....:.:: :. .:. :: :.: :: ..:
CCDS10 TV-SNAGDTYFFKGAHYWRFPKNSIKTEPDAPQPMGPNWLDCPAPSSGPRAPRPPKATPV
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 EETEVIIIEVDEEGGGAVSAAAVVLPVLLLLLVLAVGLAVFFFRRHGTPRRLLYCQRSLL
:: :... .: . :. :::: : ::
CCDS10 SETCDCQCELNQAAGRWPA------PIPLLLLPLLVGGVASR
530 540 550 560
580
pF1KB5 DKV
>>CCDS6246.1 MMP16 gene_id:4325|Hs108|chr8 (607 aa)
initn: 1674 init1: 962 opt: 1158 Z-score: 1256.1 bits: 242.4 E(32554): 1.2e-63
Smith-Waterman score: 2294; 56.7% identity (80.9% similar) in 570 aa overlap (33-582:41-607)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 PAPRPPRCLLLPLLTLGTALASLGSAQSSSFSPEAWLQQYGYLPPGDLRTHTQRSPQSLS
:. :.:::.:::::: : : . :: ....
CCDS62 RLDFVHHSGVFFLQTLLWILCATVCGTEQYFNVEVWLQKYGYLPPTDPRMSVLRSAETMQ
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 AAIAAMQKFYGLQVTGKADADTMKAMRRPRCGVPDKFGAEIKANVRRKRYAIQGLKWQHN
.:.::::.:::...:::.: .:. :..:::::::. . : ..::::::. : ::::.
CCDS62 SALAAMQQFYGINMTGKVDRNTIDWMKKPRCGVPDQTRGSSKFHIRRKRYALTGQKWQHK
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EITFCIQNYTPKVGEYATYEAIRKAFRVWESATPLRFREVPYAYIREGHEKQADIMIFFA
.::. :.: :::::. : .:::.:: ::...::: :.::::. ...: ....:: :.::
CCDS62 HITYSIKNVTPKVGDPETRKAIRRAFDVWQNVTPLTFEEVPYSELENG-KRDVDITIIFA
140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 EGFHGDSTPFDGEGGFLAHAYFPGPNIGGDTHFDSAEPWTVRNEDLNGNDIFLVAVHELG
::::::.:::::::::::::::::.::::::::: ::::. : . .:::.:::::::::
CCDS62 SGFHGDSSPFDGEGGFLAHAYFPGPGIGGDTHFDSDEPWTLGNPNHDGNDLFLVAVHELG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB5 HALGLEHSSDPSAIMAPFYQWMDTENFVLPDDDRRGIQQLYGGESGFPT-----------
::::::::.::.::::::::.:.:.:: ::.:: .:::..:: . .:
CCDS62 HALGLEHSNDPTAIMAPFYQYMETDNFKLPNDDLQGIQKIYGPPDKIPPPTRPLPTVPPH
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KB5 -KMPP-QPRTTSRPSVPDKPKN-PTYG---PNICDGNFDTVAMLRGEMFVFKERWFWRVR
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CCDS62 RSIPPADPRKNDRPKPPRPPTGRPSYPGAKPNICDGNFNTLAILRREMFVFKDQWFWRVR
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 NNQVMDGYPMPIGQFWRGLPASINTAYERKDGKFVFFKGDKHWVFDEASLEPGYPKHIKE
::.::::::: : :::::: ::...:: .::.::::::.:.::: ...:.::::. .
CCDS62 NNRVMDGYPMQITYFWRGLPPSIDAVYENSDGNFVFFKGNKYWVFKDTTLQPGYPHDLIT
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 LGRGLPTDKIDAALFWMPNGKTYFFRGNKYYRFNEELRAVDSEYPKNIKVWEGIPESPRG
:: :.: ::.:..: ::::::.:..:.:..::....: ::: : ::.::::::.:
CCDS62 LGSGIPPHGIDSAIWWEDVGKTYFFKGDRYWRYSEEMKTMDPGYPKPITVWKGIPESPQG
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 SFMGSDEVFTYFYKGNKYWKFNNQKLKVEPGYPKSALRDWMGC--PSGGRPDEGTEEETE
.:. ... :::::::..::::::: ::::::::.: :.:.::: :. : :: .
CCDS62 AFVHKENGFTYFYKGKEYWKFNNQILKVEPGYPRSILKDFMGCDGPTD-RVKEGHSPPDD
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 V-IIIEVDEEGGGAVSAAAVVLPVLLLLLVLAVGLAVFFFRRHGTPRRLLYCQRSLLDKV
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CCDS62 VDIVIKLDNTAS-TVKAIAIVIPCILALCLLVLVYTVFQFKRKGTPRHILYCKRSMQEWV
550 560 570 580 590 600
>>CCDS31927.1 MMP17 gene_id:4326|Hs108|chr12 (603 aa)
initn: 1061 init1: 219 opt: 1134 Z-score: 1230.1 bits: 237.6 E(32554): 3.4e-62
Smith-Waterman score: 1280; 38.6% identity (64.8% similar) in 546 aa overlap (3-518:9-531)
10 20 30 40
pF1KB5 MSPAPRPP----RCLLLPLLTLGTALASLGSAQSSSFSPEA--------WLQQY
:.: :: : :::: : ::.. :. . . .:.: ::...
CCDS31 MRRRAARGPGPPPPGPGLSRLPLPLLLL-LALGTRGGCAAPAPAPRAEDLSLGVEWLSRF
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 GYLPPGDLRTHTQRSPQSLSAAIAAMQKFYGLQVTGKADADTMKAMRRPRCGVPDKFGAE
:::::.: : .. . :: ::.:::.: ::..:: : :. :. :::..::
CCDS31 GYLPPADPTTGQLQTQEELSKAITAMQQFGGLEATGILDEATLALMKTPRCSLPD---LP
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KB5 IKANVRRKRYAIQGLKWQHNEITFCIQNYTPK---VGEYATYEAIRKAFRVWESATPLRF
. ...::.: : ::.. .... .... :. .:. .. . :..:: . .:: :
CCDS31 VLTQARRRRQAPAPTKWNKRNLSWRVRTF-PRDSPLGHDTVRALMYYALKVWSDIAPLNF
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 REVPYAYIREGHEKQADIMIFFAEGFHGDSTPFDGEGGFLAHAYFPGPN-IGGDTHFDSA
.:: . :::.: :... :.:. :::: :: .:::.::: . .::::::.
CCDS31 HEVAGS--------AADIQIDFSKADHNDGYPFDGPGGTVAHAFFPGHHHTAGDTHFDDD
180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 EPWTVRNEDLNGNDIFLVAVHELGHALGLEHSSDPSAIMAPFYQWM--DTENFVLPDDDR
: :: :. : .: :.: :::::.:::.:: : . .:: :.:: : . :: .:.
CCDS31 EAWTFRSSDAHGMDLFAVAVHEFGHAIGLSHVAAAHSIMRPYYQGPVGDPLRYGLPYEDK
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320
pF1KB5 RGIQQLYG-GESGFPTKMPPQPRTTSRPSVPDKPKNPTYGP------NICDGNFDTVAML
. :::: :: :: .: .: : .:. : : . .: . :. .::.::..
CCDS31 VRVWQLYGVRESVSPTAQPEEP-----PLLPEPPDNRSSAPPRKDVPHRCSTHFDAVAQI
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 RGEMFVFKERWFWRV-RNNQVMDGYPMPIGQFWRGLPA---SINTAYER-KDGKFVFFKG
::: : :: ..:::. :. .... : . .:::::: :....::: .: :.:::::
CCDS31 RGEAFFFKGKYFWRLTRDRHLVSLQPAQMHRFWRGLPLHLDSVDAVYERTSDHKIVFFKG
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 DKHWVFDEASLEPGYPKHIKELGRGLPTDKIDAALFWMPNGKTYFFRGNKYYRFNEELRA
:..::: . ..: :::. ..... :: ::::. : : .::::. . :.:.... :
CCDS31 DRYWVFKDNNVEEGYPRPVSDFS--LPPGGIDAAFSWAHNDRTYFFKDQLYWRYDDHTRH
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 VDSEYPKNIKVWEGIPESPRGSFMGSDEVFTYFYKGNKYWKFNNQKLKVEPGYPKSALRD
.: :: . .:.:.: . .. :: . .::..:..::: . .:.: ::::.:. ::
CCDS31 MDPGYPAQSPLWRGVPSTLDDAMRWSDGA-SYFFRGQEYWKVLDGELEVAPGYPQSTARD
470 480 490 500 510
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 WMGCPSGGRPDEGTEEETEVIIIEVDEEGGGAVSAAAVVLPVLLLLLVLAVGLAVFFFRR
:. : : .:.
CCDS31 WLVC--GDSQADGSVAAGVDAAEGPRAPPGQHDQSRSEDGYEVCSCTSGASSPPGAPGPL
520 530 540 550 560 570
>>CCDS46593.1 MMP24 gene_id:10893|Hs108|chr20 (645 aa)
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10 20 30 40
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...:.: :.. :. . ::..:::: :
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50 60 70 80 90 100
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: :. . .: ..:..:...::.:::. ::: : :.. :..:::::::. ...
CCDS46 YDSRASALHSAKALQSAVSTMQQFYGIPVTGVLDQTTIEWMKKPRCGVPDH--PHLSRRR
100 110 120 130 140 150
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 RRKRYAIQGLKWQHNEITFCIQNYTPKVGEYATYEAIRKAFRVWESATPLRFREVPYAYI
: ::::. : ::....::. :.:::::::: : .:::.:: ::...::: :.:::: :
CCDS46 RNKRYALTGQKWRQKHITYSIHNYTPKVGELDTRKAIRQAFDVWQKVTPLTFEEVPYHEI
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 REGHEKQADIMIFFAEGFHGDSTPFDGEGGFLAHAYFPGPNIGGDTHFDSAEPWTVRNED
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CCDS46 K-SDRKEADIMIFFASGFHGDSSPFDGEGGFLAHAYFPGPGIGGDTHFDSDEPWTLGNAN
220 230 240 250 260 270
230 240 250 260 270 280
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.:::.:::::::::::::::::::::::::::::.:.:.:: ::.:: .:::..:: .
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280 290 300 310 320 330
290 300 310 320
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: ::. : ::: :: . :.:..: ::::::::.:::.
CCDS46 EPLEPTRPLPTLPVRRIHSPSERKHERQPRPP-RPPLGDRPSTPGTKPNICDGNFNTVAL
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330 340 350 360 370 380
pF1KB5 LRGEMFVFKERWFWRVRNNQVMDGYPMPIGQFWRGLPASINTAYERKDGKFVFFKGDKHW
.::::::::.:::::.:::.:..:::: : :::.:::: :..:::: ::.::::::::.:
CCDS46 FRGEMFVFKDRWFWRLRNNRVQEGYPMQIEQFWKGLPARIDAAYERADGRFVFFKGDKYW
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390 400 410 420 430 440
pF1KB5 VFDEASLEPGYPKHIKELGRGLPTDKIDAALFWMPNGKTYFFRGNKYYRFNEELRAVDSE
:: :...:::::. . ::: :: . ::.:: : : ::::::.:..:.:..:: ::.:
CCDS46 VFKEVTVEPGYPHSLGELGSCLPREGIDTALRWEPVGKTYFFKGERYWRYSEERRATDPG
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450 460 470 480 490 500
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::: : ::.:::..:.:.:.... .:::::: ::::.::::.::::::.. :::::::
CCDS46 YPKPITVWKGIPQAPQGAFISKEGYYTYFYKGRDYWKFDNQKLSVEPGYPRNILRDWMGC
510 520 530 540 550 560
510 520 530 540 550 560
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. : : . .: :. . .. :.:.:.:::.: .: : .:.. ..: :. .
CCDS46 NQKEVERRKERRLPQDDVDIMVTINDVPGSVNAVAVVIPCILSLCILVLVYTIFQFKNKT
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570 580
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:. . : .: . . :
CCDS46 GPQPVTYYKRPVQEWV
630 640
>>CCDS10792.1 MMP15 gene_id:4324|Hs108|chr16 (669 aa)
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10 20 30 40
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:: ::::: . . .:: .:... : ::.
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10 20 30 40 50
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CCDS10 LYGYLPQPSRHMSTMRSAQILASALAEMQRFYGIPVTGVLDEETKEWMKRPRCGVPDQFG
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...:::.:: ::::. : ::.....:: ::::: :.: : ..::.:.::::::.::::
CCDS10 VRVKANLRRRRKRYALTGRKWNNHHLTFSIQNYTEKLGWYHSMEAVRRAFRVWEQATPLV
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160 170 180 190 200 210
pF1KB5 FREVPYAYIREGHEKQADIMIFFAEGFHGDSTPFDGEGGFLAHAYFPGPNIGGDTHFDSA
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CCDS10 FQEVPYEDIRLRRQKEADIMVLFASGFHGDSSPFDGTGGFLAHAYFPGPGLGGDTHFDAD
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220 230 240 250 260 270
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CCDS10 EPWTFSSTDLHGNNLFLVAVHELGHALGLEHSSNPNAIMAPFYQWKDVDNFKLPEDDLRG
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280 290 300 310
pF1KB5 IQQLYGGESGFPTKMPPQPRTTSR-PSVPD--------------KPKNPT----------
:::::: .: : : : .: : :. :: ::. :
CCDS10 IQQLYGTPDGQPQPTQPLPTVTPRRPGRPDHRPPRPPQPPPPGGKPERPPKPGPPVQPRA
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320 330 340 350 360
pF1KB5 ------YGPNICDGNFDTVAMLRGEMFVFKERWFWRVRNNQVMDGYPMPIGQFWRGLPAS
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CCDS10 TERPDQYGPNICDGDFDTVAMLRGEMFVFKGRWFWRVRHNRVLDNYPMPIGHFWRGLPGD
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370 380 390 400 410 420
pF1KB5 INTAYERKDGKFVFFKGDKHWVFDEASLEPGYPKHIKELGRGLPTDKIDAALFWMPNGKT
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CCDS10 ISAAYERQDGRFVFFKGDRYWLFREANLEPGYPQPLTSYGLGIPYDRIDTAIWWEPTGHT
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460 470 480
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CCDS10 FFFQEDRYWRFNEETQRGDPGYPKPISVWQGIPASPKGAFLSNDAAYTYFYKGTKYWKFD
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490 500 510 520
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:..:..::::::: :::.::: : :: . : .:
CCDS10 NERLRMEPGYPKSILRDFMGCQEHVEPGPRWPDVARPPFNPHGGAEPGADSAEGDVGDGD
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pF1KB5 --IIIEVDEEGGG-----------AVSAAAVVLPVLLLLLVLAVGLAVFFFRRHGTPRRL
. :...::. .:... :..:.:::: ::.. :. ..:.:.:: :
CCDS10 GDFGAGVNKDGGSRVVVQMEEVARTVNVVMVLVPLLLLLCVLGLTYALVQMQRKGAPRVL
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580
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:::.:::
CCDS10 LYCKRSLQEWV
660
>>CCDS13816.1 MMP11 gene_id:4320|Hs108|chr22 (488 aa)
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20 30 40 50 60 70
pF1KB5 LLTLGTALASLGSAQSSSFSPEAWLQQYGYLPPGDLRTHTQR-SPQSLSAAIAAMQKFYG
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.: .: . ...: ::::::: . ..: :.::....: .:.....:. : .
CCDS13 APATQEAPRPA-SSLRPPRCGVPDPSDG-LSARNRQKRFVLSGGRWEKTDLTYRILRFPW
70 80 90 100 110
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pF1KB5 KVGEYATYEAIRKAFRVWESATPLRFREVPYAYIREGHEKQADIMIFFAEGFHGDSTPFD
.. . . ... .:..:: ..::: : :: :: .::::: ::. .:::. :::
CCDS13 QLVQEQVRQTMAEALKVWSDVTPLTFTEV--------HEGRADIMIDFARYWHGDDLPFD
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pF1KB5 GEGGFLAHAYFPGPNIGGDTHFDSAEPWTVRNEDLNGNDIFLVAVHELGHALGLEHSSDP
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CCDS13 GPGGILAHAFFPKTHREGDVHFDYDETWTI--GDDQGTDLLQVAAHEFGHVLGLQHTTAA
180 190 200 210 220
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.:.:. :: . . : :: ::.:.::: . .:: . : :: . .:
CCDS13 KALMSAFYTF--RYPLSLSPDDCRGVQHLYG--QPWPTVTSRTPALGPQAGIDTNEIAPL
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
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.: : :. :...::.:. .:::.: :: . ::.:..:.. ::: .. :.:::.
CCDS13 EPDAP---PDACEASFDAVSTIRGELFFFKAGFVWRLRGGQLQPGYPALASRHWQGLPSP
290 300 310 320 330 340
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pF1KB5 INTAYERKDGKFVFFKGDKHWVFDEASLEPGYPKHIKELGRGLPTDKIDAALFWMPN-GK
...:.: .:.. ::.: ..::.: . : : . ::: : . ::: : :. .:
CCDS13 VDAAFEDAQGHIWFFQGAQYWVYDGEKPVLG-PAPLTELG--LVRFPVHAALVWGPEKNK
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pF1KB5 TYFFRGNKYYRFNEELRAVDSEYPKNIKVWEGIPESPRGSFMGSDEVFTYFYKGNKYWKF
::::: :.::. : ::: :. :.:.: ..:. .: ..:: .: ::::
CCDS13 IYFFRGRDYWRFHPSTRRVDSPVPRRATDWRGVPSEIDAAFQDADG-YAYFLRGRLYWKF
400 410 420 430 440 450
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pF1KB5 NNQKLKVEPGYPKSALRDWMGCPSGGRPDEGTEEETEVIIIEVDEEGGGAVSAAAVVLPV
. :.:. :.:. . :..::
CCDS13 DPVKVKALEGFPRLVGPDFFGCAEPANTFL
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>>CCDS74036.1 MMP28 gene_id:79148|Hs108|chr17 (520 aa)
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10 20 30 40 50 60
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CCDS74 LLLRALQLLLWGHLDAQPAERGGQELRKEAEAFLEKYGY-----LNEQVPKAPTSTRFSD
10 20 30 40 50 60
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pF1KB5 AIAAMQKFYGLQVTGKADADTMKAMRRPRCGVPDK------------FGAEIKANVRRK-
:: :.: : :.: : :.. : :::::: : . :. ....:::
CCDS74 AIRAFQWVSQLPVSGVLDRATLRQMTRPRCGVTDTNSYAAWAERISDLFARHRTKMRRKK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 RYAIQGLKWQHNEITFCIQNYTPKVGEYATYEAIRKAFRVWESATPLRFREVPYAYIREG
:.: :: :: ...... . :. .. : :. :.: ::..: ... :.: :.: . :
CCDS74 RFAKQGNKWYKQHLSYRLVNWPEHLPEPAVRGAVRAAFQLWSNVSALEFWEAPAT----G
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pF1KB5 HEKQADIMIFFAEGFHGDS--TPFDGEGGFLAHAYFPGPNIGGDTHFDSAEPWTVRNEDL
::: . : .: :.:. . ::: :: ::::..: :..:::. : :.. .
CCDS74 ---PADIRLTFFQGDHNDGLGNAFDGPGGALAHAFLPRR---GEAHFDQDERWSLSRR--
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CCDS74 RGRNLFVVLAHEIGHTLGLTHSPAPRALMAPYYKRLGRDAL-LSWDDVLAVQSLYGKPLG
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.: :. . .: . : :. . : ::. : ..::.... : . ...:: :
CCDS74 GSVAVQLPGKLFTDFETWDSYS-PQGRRPETQGPKYCHSSFDAITVDRQQQLYIFKGSHF
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pF1KB5 WRVRNNQVMDGYPMPIGQFWRGLPASINTA-YERKDGKFVFFKGDKHWVFDEASLEPGYP
:.: . .. : :. . : ::: .:..: .:: : :::: . : : . : :
CCDS74 WEVAADGNVS-EPRPLQERWVGLPPNIEAAAVSLNDGDFYFFKGGRCWRFRGPKPVWGLP
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. . . : ::: :::::. : . .:.: .:: . . :. ::.... : :::
CCDS74 Q-LCRAG-GLPRHP-DAALFFPPLRRLILFKGARYYVLARGGLQVEPYYPRSLQDWGGIP
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: :.. : . :.. ..::.... ::.. . .. ::::
CCDS74 EEVSGALPRPDGSII-FFRDDRYWRLDQAKLQATTSGRWATELPWMGCWHANSGSALF
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>>CCDS8318.1 MMP20 gene_id:9313|Hs108|chr11 (483 aa)
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CCDS83 MKVLPASGLAVFLIMALKFSTAAPSLVAASPRTWRNNYRLAQAYLDKYYTNKEGHQIGEM
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pF1KB5 TQRSPQSLSAAIAAMQKFYGLQVTGKADADTMKAMRRPRCGVPDKFGAEIKANVRRKRYA
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CCDS83 VARGSNSMIRKIKELQAFFGLQVTGKLDQTTMNVIKKPRCGVPD------VANYR----L
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CCDS83 FPGEPKWKKNTLTYRISKYTPSMSSVEVDKAVEMALQAWSSAVPLSF-----VRINSG--
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CCDS83 -EADIMISFENGDHGDSYPFDGPRGTLAHAFAPGEGLGGDTHFDNAEKWTM---GTNGFN
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pF1KB5 IFLVAVHELGHALGLEHSSDPSAIMAPFYQWMDTENFVLPDDDRRGIQQLYGGESGFPTK
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CCDS83 LFTVAAHEFGHALGLAHSTDPSALMYPTYKYKNPYGFHLPKDDVKGIQALYG--------
220 230 240 250 260 270
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pF1KB5 MPPQPRTTSRPSVPDKPKNPTYGPNICDGN--FDTVAMLRGEMFVFKERWFWRVRNNQVM
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CCDS83 --PRKVFLGKPTLPHAPHHKPSIPDLCDSSSSFDAVTMLGKELLLFKDRIFWR-RQVHLR
280 290 300 310 320
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pF1KB5 DGY-PMPIGQFWRGLPASINTAYERKD-GKFVFFKGDKHWVFDEASLEPGYPKHIKELGR
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CCDS83 TGIRPSTITSSFPQLMSNVDAAYEVAERGTAYFFKGPHYWITRGFQMQ-GPPRTIYDFGF
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pF1KB5 GLPTDKIDAALFWMPNGKTYFFRGNKYYRFNEELRAVDSEYPKNIKV-WEGIPESPRGSF
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CCDS83 PRHVQQIDAAVYLREPQKTLFFVGDEYYSYDERKRKMEKDYPKNTEEEFSGV----NGQI
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pF1KB5 MGSDEV--FTYFYKGNKYWKFNNQKLKVEPGYPKSALRDWMGCPSGGRPDEGTEEETEVI
.. :. . ::..: : .:....: : .:. :.::
CCDS83 DAAVELNGYIYFFSGPKTYKYDTEKEDVVSVVKSSS---WIGC
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>>CCDS8895.1 MMP19 gene_id:4327|Hs108|chr12 (508 aa)
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CCDS88 MNCQQLWLGFLLPMTVSGRVL---GLAE---VAPVDYLSQYGYLQK-PLEGSNNFKPED
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