Result of FASTA (ccds) for pF1KB4303
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4303, 635 aa
  1>>>pF1KB4303 635 - 635 aa - 635 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7035+/-0.000961; mu= 4.4163+/- 0.056
 mean_var=278.5145+/-62.443, 0's: 0 Z-trim(113.6): 538  B-trim: 390 in 1/51
 Lambda= 0.076851
 statistics sampled from 13615 (14256) to 13615 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.766), E-opt: 0.2 (0.438), width:  16
 Scan time:  4.270

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS46117.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19          ( 625) 3951 452.0 1.1e-126
CCDS46119.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19          ( 639) 3754 430.1 4.3e-120
CCDS46118.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19          ( 624) 3308 380.7 3.3e-105
CCDS12674.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19          ( 629) 3288 378.5 1.5e-104
CCDS74400.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19          ( 530) 3189 367.4 2.7e-101
CCDS1559.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1        (1638) 1580 189.6 2.9e-47
CCDS1558.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1        (1719) 1580 189.6   3e-47
CCDS31601.1 CDC42BPG gene_id:55561|Hs108|chr11     (1551) 1552 186.4 2.4e-46
CCDS9978.1 CDC42BPB gene_id:9578|Hs108|chr14       (1711) 1540 185.1 6.5e-46
CCDS11870.2 ROCK1 gene_id:6093|Hs108|chr18         (1354) 1206 148.0 7.8e-35
CCDS42654.1 ROCK2 gene_id:9475|Hs108|chr2          (1388) 1191 146.4 2.5e-34
CCDS9192.1 CIT gene_id:11113|Hs108|chr12           (2027) 1080 134.2 1.6e-30
CCDS55891.1 CIT gene_id:11113|Hs108|chr12          (2069) 1080 134.2 1.7e-30
CCDS46014.1 MAST3 gene_id:23031|Hs108|chr19        (1309)  709 92.9   3e-18
CCDS41326.1 MAST2 gene_id:23139|Hs108|chr1         (1798)  703 92.4 5.8e-18
CCDS75254.1 MAST4 gene_id:375449|Hs108|chr5        (2429)  693 91.4 1.5e-17
CCDS47225.1 MAST4 gene_id:375449|Hs108|chr5        (2434)  693 91.4 1.5e-17
CCDS1824.1 PRKCE gene_id:5581|Hs108|chr2           ( 737)  682 89.6 1.6e-17
CCDS54861.1 MAST4 gene_id:375449|Hs108|chr5        (2623)  693 91.4 1.6e-17
CCDS32921.1 MAST1 gene_id:22983|Hs108|chr19        (1570)  680 89.8 3.1e-17
CCDS73313.1 RPS6KA4 gene_id:8986|Hs108|chr11       ( 765)  660 87.2 8.9e-17
CCDS8073.1 RPS6KA4 gene_id:8986|Hs108|chr11        ( 772)  660 87.2   9e-17
CCDS45149.1 RPS6KA5 gene_id:9252|Hs108|chr14       ( 549)  657 86.7   9e-17
CCDS3212.2 PRKCI gene_id:5584|Hs108|chr3           ( 596)  657 86.7 9.5e-17
CCDS9893.1 RPS6KA5 gene_id:9252|Hs108|chr14        ( 802)  657 86.9 1.2e-16
CCDS41229.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1          ( 409)  640 84.7 2.7e-16
CCDS55563.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1          ( 488)  640 84.8 3.1e-16
CCDS37.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1             ( 592)  640 84.9 3.5e-16
CCDS4822.1 STK38 gene_id:11329|Hs108|chr6          ( 465)  614 81.9 2.2e-15
CCDS31761.1 STK38L gene_id:23012|Hs108|chr12       ( 464)  612 81.6 2.6e-15
CCDS9752.1 PRKCH gene_id:5583|Hs108|chr14          ( 683)  583 78.6 3.1e-14
CCDS11664.1 PRKCA gene_id:5578|Hs108|chr17         ( 672)  577 77.9 4.8e-14
CCDS10618.1 PRKCB gene_id:5579|Hs108|chr16         ( 671)  576 77.8 5.2e-14
CCDS81839.1 RPS6KA5 gene_id:9252|Hs108|chr14       ( 723)  572 77.4 7.4e-14
CCDS83480.1 RPS6KA6 gene_id:27330|Hs108|chrX       ( 745)  565 76.6 1.3e-13
CCDS14451.1 RPS6KA6 gene_id:27330|Hs108|chrX       ( 745)  565 76.6 1.3e-13
CCDS9994.1 AKT1 gene_id:207|Hs108|chr14            ( 480)  558 75.7 1.7e-13
CCDS7666.1 STK32C gene_id:282974|Hs108|chr10       ( 486)  556 75.4   2e-13
CCDS5170.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6            ( 431)  551 74.8 2.6e-13
CCDS47478.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6           ( 445)  551 74.8 2.7e-13
CCDS47477.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6           ( 459)  551 74.9 2.8e-13
CCDS47476.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6           ( 526)  551 74.9   3e-13
CCDS10619.1 PRKCB gene_id:5579|Hs108|chr16         ( 673)  551 75.0 3.6e-13
CCDS6195.1 SGK3 gene_id:23678|Hs108|chr8           ( 496)  545 74.2 4.6e-13
CCDS3380.1 STK32B gene_id:55351|Hs108|chr4         ( 414)  540 73.6   6e-13
CCDS58411.1 PDPK1 gene_id:5170|Hs108|chr16         ( 454)  540 73.6 6.4e-13
CCDS12867.1 PRKCG gene_id:5582|Hs108|chr19         ( 697)  543 74.2 6.7e-13
CCDS10472.1 PDPK1 gene_id:5170|Hs108|chr16         ( 556)  540 73.7 7.3e-13
CCDS14197.1 RPS6KA3 gene_id:6197|Hs108|chrX        ( 740)  542 74.1 7.6e-13
CCDS30649.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1        ( 744)  542 74.1 7.6e-13


>>CCDS46117.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19               (625 aa)
 initn: 3947 init1: 3947 opt: 3951  Z-score: 2387.7  bits: 452.0 E(32554): 1.1e-126
Smith-Waterman score: 3951; 97.5% identity (98.3% similar) in 591 aa overlap (45-635:36-625)

           20        30        40        50        60        70    
pF1KB4 MWGSPWEADSPRVKLRGREKGRQTEGGAFPLVSSALSGDPRFFSPTTPPAEPIVVRLKEV
                                     : .: :. : .. .     :::::::::::
CCDS46 RLRRLQQLVLDPGFLGLEPLLDLLLGVHQELGASELAQD-KYVADFLQWAEPIVVRLKEV
          10        20        30        40         50        60    

           80        90       100       110       120       130    
pF1KB4 RLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLV
           70        80        90       100       110       120    

          140       150       160       170       180       190    
pF1KB4 NGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAID
          130       140       150       160       170       180    

          200       210       220       230       240       250    
pF1KB4 SVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGTPDYLSPEILQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGTPDYLSPEILQ
          190       200       210       220       230       240    

          260       270       280       290       300       310    
pF1KB4 AVGGGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYKEHLSLPLVDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AVGGGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYKEHLSLPLVDE
          250       260       270       280       290       300    

          320       330       340       350       360       370    
pF1KB4 GVPEEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDSVPPFTPDFEGATDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GVPEEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDSVPPFTPDFEGATDT
          310       320       330       340       350       360    

          380       390       400       410       420       430    
pF1KB4 CNFDLVEDGLTAMETLSDIREGAPLGVHLPFVGYSYSCMALRDSEVPGPTPMELEAEQLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CNFDLVEDGLTAMETLSDIREGAPLGVHLPFVGYSYSCMALRDSEVPGPTPMELEAEQLL
          370       380       390       400       410       420    

          440       450       460       470       480       490    
pF1KB4 EPHVQAPSLEPSVSPQDETAEVAVPAAVPAAEAEAEVTLRELQEALEEEVLTRQSLSREM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EPHVQAPSLEPSVSPQDETAEVAVPAAVPAAEAEAEVTLRELQEALEEEVLTRQSLSREM
          430       440       450       460       470       480    

          500       510       520       530       540       550    
pF1KB4 EAIRTDNQNFASQLREAEARNRDLEAHVRQLQERMELLQAEGATAVTGVPSPRATDPPSH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EAIRTDNQNFASQLREAEARNRDLEAHVRQLQERMELLQAEGATAVTGVPSPRATDPPSH
          490       500       510       520       530       540    

          560       570       580       590       600       610    
pF1KB4 MAPRPWLWASARWWGQAPCTAATCCSLPGSLGLAYRRRFPCSCSPLFCLVPPPWAALGWW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MAPRPWLWASARWWGQAPCTAATCCSLPGSLGLAYRRRFPCSCSPLFCLVPPPWAALGWW
          550       560       570       580       590       600    

          620       630     
pF1KB4 PTPANSPQSGAAQEPPALPEP
       :::::::::::::::::::::
CCDS46 PTPANSPQSGAAQEPPALPEP
          610       620     

>>CCDS46119.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19               (639 aa)
 initn: 3760 init1: 2698 opt: 3754  Z-score: 2269.5  bits: 430.1 E(32554): 4.3e-120
Smith-Waterman score: 3754; 98.4% identity (98.6% similar) in 564 aa overlap (1-559:1-564)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MGGHFWPPEPYTVFMWGSPWEADSPRVKLRGREKGRQTEGGAFPLVSSALSGDPRFFSPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MGGHFWPPEPYTVFMWGSPWEADSPRVKLRGREKGRQTEGGAFPLVSSALSGDPRFFSPT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 TPPAEPIVVRLKEVRLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TPPAEPIVVRLKEVRLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 GEVSCFREERDVLVNGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GEVSCFREERDVLVNGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 MARFYLAEIVMAIDSVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MARFYLAEIVMAIDSVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 AVGTPDYLSPEILQAVGGGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AVGTPDYLSPEILQAVGGGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 VHYKEHLSLPLVDEGVPEEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VHYKEHLSLPLVDEGVPEEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDS
              310       320       330       340       350       360

              370       380            390       400       410     
pF1KB4 VPPFTPDFEGATDTCNFDLVEDGLTAM-----ETLSDIREGAPLGVHLPFVGYSYSCMAL
       :::::::::::::::::::::::::::     ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VPPFTPDFEGATDTCNFDLVEDGLTAMVSGGGETLSDIREGAPLGVHLPFVGYSYSCMAL
              370       380       390       400       410       420

         420       430       440       450       460       470     
pF1KB4 RDSEVPGPTPMELEAEQLLEPHVQAPSLEPSVSPQDETAEVAVPAAVPAAEAEAEVTLRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RDSEVPGPTPMELEAEQLLEPHVQAPSLEPSVSPQDETAEVAVPAAVPAAEAEAEVTLRE
              430       440       450       460       470       480

         480       490       500       510       520       530     
pF1KB4 LQEALEEEVLTRQSLSREMEAIRTDNQNFASQLREAEARNRDLEAHVRQLQERMELLQAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LQEALEEEVLTRQSLSREMEAIRTDNQNFASQLREAEARNRDLEAHVRQLQERMELLQAE
              490       500       510       520       530       540

         540       550       560       570       580       590     
pF1KB4 GATAVTGVPSPRATDPPSHMAPRPWLWASARWWGQAPCTAATCCSLPGSLGLAYRRRFPC
       :::::::::::::::::::.   :                                    
CCDS46 GATAVTGVPSPRATDPPSHLDGPPAVAVGQCPLVGPGPMHRRHLLLPARVPRPGLSEALS
              550       560       570       580       590       600

>>CCDS46118.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19               (624 aa)
 initn: 3304 init1: 3304 opt: 3308  Z-score: 2002.4  bits: 380.7 E(32554): 3.3e-105
Smith-Waterman score: 3308; 96.3% identity (97.5% similar) in 515 aa overlap (45-559:36-549)

           20        30        40        50        60        70    
pF1KB4 MWGSPWEADSPRVKLRGREKGRQTEGGAFPLVSSALSGDPRFFSPTTPPAEPIVVRLKEV
                                     : .: :. : .. .     :::::::::::
CCDS46 RLRRLQQLVLDPGFLGLEPLLDLLLGVHQELGASELAQD-KYVADFLQWAEPIVVRLKEV
          10        20        30        40         50        60    

           80        90       100       110       120       130    
pF1KB4 RLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLV
           70        80        90       100       110       120    

          140       150       160       170       180       190    
pF1KB4 NGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAID
          130       140       150       160       170       180    

          200       210       220       230       240       250    
pF1KB4 SVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGTPDYLSPEILQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGTPDYLSPEILQ
          190       200       210       220       230       240    

          260       270       280       290       300       310    
pF1KB4 AVGGGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYKEHLSLPLVDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AVGGGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYKEHLSLPLVDE
          250       260       270       280       290       300    

          320       330       340       350       360       370    
pF1KB4 GVPEEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDSVPPFTPDFEGATDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GVPEEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDSVPPFTPDFEGATDT
          310       320       330       340       350       360    

          380       390       400       410       420       430    
pF1KB4 CNFDLVEDGLTAMETLSDIREGAPLGVHLPFVGYSYSCMALRDSEVPGPTPMELEAEQLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CNFDLVEDGLTAMETLSDIREGAPLGVHLPFVGYSYSCMALRDSEVPGPTPMELEAEQLL
          370       380       390       400       410       420    

          440       450       460       470       480       490    
pF1KB4 EPHVQAPSLEPSVSPQDETAEVAVPAAVPAAEAEAEVTLRELQEALEEEVLTRQSLSREM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EPHVQAPSLEPSVSPQDETAEVAVPAAVPAAEAEAEVTLRELQEALEEEVLTRQSLSREM
          430       440       450       460       470       480    

          500       510       520       530       540       550    
pF1KB4 EAIRTDNQNFASQLREAEARNRDLEAHVRQLQERMELLQAEGATAVTGVPSPRATDPPSH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EAIRTDNQNFASQLREAEARNRDLEAHVRQLQERMELLQAEGATAVTGVPSPRATDPPSH
          490       500       510       520       530       540    

          560       570       580       590       600       610    
pF1KB4 MAPRPWLWASARWWGQAPCTAATCCSLPGSLGLAYRRRFPCSCSPLFCLVPPPWAALGWW
       .   :                                                       
CCDS46 LDGPPAVAVGQCPLVGPGPMHRRHLLLPARVPRPGLSEALSLLLFAVVLSRAAALGCIGL
          550       560       570       580       590       600    

>>CCDS12674.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19               (629 aa)
 initn: 3290 init1: 2228 opt: 3288  Z-score: 1990.4  bits: 378.5 E(32554): 1.5e-104
Smith-Waterman score: 3288; 95.4% identity (96.5% similar) in 520 aa overlap (45-559:36-554)

           20        30        40        50        60        70    
pF1KB4 MWGSPWEADSPRVKLRGREKGRQTEGGAFPLVSSALSGDPRFFSPTTPPAEPIVVRLKEV
                                     : .: :. : .. .     :::::::::::
CCDS12 RLRRLQQLVLDPGFLGLEPLLDLLLGVHQELGASELAQD-KYVADFLQWAEPIVVRLKEV
          10        20        30        40         50        60    

           80        90       100       110       120       130    
pF1KB4 RLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLV
           70        80        90       100       110       120    

          140       150       160       170       180       190    
pF1KB4 NGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAID
          130       140       150       160       170       180    

          200       210       220       230       240       250    
pF1KB4 SVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGTPDYLSPEILQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGTPDYLSPEILQ
          190       200       210       220       230       240    

          260       270       280       290       300       310    
pF1KB4 AVGGGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYKEHLSLPLVDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AVGGGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYKEHLSLPLVDE
          250       260       270       280       290       300    

          320       330       340       350       360       370    
pF1KB4 GVPEEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDSVPPFTPDFEGATDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GVPEEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDSVPPFTPDFEGATDT
          310       320       330       340       350       360    

          380            390       400       410       420         
pF1KB4 CNFDLVEDGLTAM-----ETLSDIREGAPLGVHLPFVGYSYSCMALRDSEVPGPTPMELE
       :::::::::::::     ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CNFDLVEDGLTAMVSGGGETLSDIREGAPLGVHLPFVGYSYSCMALRDSEVPGPTPMELE
          370       380       390       400       410       420    

     430       440       450       460       470       480         
pF1KB4 AEQLLEPHVQAPSLEPSVSPQDETAEVAVPAAVPAAEAEAEVTLRELQEALEEEVLTRQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AEQLLEPHVQAPSLEPSVSPQDETAEVAVPAAVPAAEAEAEVTLRELQEALEEEVLTRQS
          430       440       450       460       470       480    

     490       500       510       520       530       540         
pF1KB4 LSREMEAIRTDNQNFASQLREAEARNRDLEAHVRQLQERMELLQAEGATAVTGVPSPRAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LSREMEAIRTDNQNFASQLREAEARNRDLEAHVRQLQERMELLQAEGATAVTGVPSPRAT
          490       500       510       520       530       540    

     550       560       570       580       590       600         
pF1KB4 DPPSHMAPRPWLWASARWWGQAPCTAATCCSLPGSLGLAYRRRFPCSCSPLFCLVPPPWA
       :::::.   :                                                  
CCDS12 DPPSHLDGPPAVAVGQCPLVGPGPMHRRHLLLPARVPRPGLSEALSLLLFAVVLSRAAAL
          550       560       570       580       590       600    

>>CCDS74400.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19               (530 aa)
 initn: 3185 init1: 3185 opt: 3189  Z-score: 1931.9  bits: 367.4 E(32554): 2.7e-101
Smith-Waterman score: 3189; 97.0% identity (98.0% similar) in 494 aa overlap (45-538:36-528)

           20        30        40        50        60        70    
pF1KB4 MWGSPWEADSPRVKLRGREKGRQTEGGAFPLVSSALSGDPRFFSPTTPPAEPIVVRLKEV
                                     : .: :. : .. .     :::::::::::
CCDS74 RLRRLQQLVLDPGFLGLEPLLDLLLGVHQELGASELAQD-KYVADFLQWAEPIVVRLKEV
          10        20        30        40         50        60    

           80        90       100       110       120       130    
pF1KB4 RLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLV
           70        80        90       100       110       120    

          140       150       160       170       180       190    
pF1KB4 NGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 NGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAID
          130       140       150       160       170       180    

          200       210       220       230       240       250    
pF1KB4 SVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGTPDYLSPEILQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGTPDYLSPEILQ
          190       200       210       220       230       240    

          260       270       280       290       300       310    
pF1KB4 AVGGGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYKEHLSLPLVDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 AVGGGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYKEHLSLPLVDE
          250       260       270       280       290       300    

          320       330       340       350       360       370    
pF1KB4 GVPEEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDSVPPFTPDFEGATDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GVPEEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDSVPPFTPDFEGATDT
          310       320       330       340       350       360    

          380       390       400       410       420       430    
pF1KB4 CNFDLVEDGLTAMETLSDIREGAPLGVHLPFVGYSYSCMALRDSEVPGPTPMELEAEQLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 CNFDLVEDGLTAMETLSDIREGAPLGVHLPFVGYSYSCMALRDSEVPGPTPMELEAEQLL
          370       380       390       400       410       420    

          440       450       460       470       480       490    
pF1KB4 EPHVQAPSLEPSVSPQDETAEVAVPAAVPAAEAEAEVTLRELQEALEEEVLTRQSLSREM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 EPHVQAPSLEPSVSPQDETAEVAVPAAVPAAEAEAEVTLRELQEALEEEVLTRQSLSREM
          430       440       450       460       470       480    

          500       510       520       530       540       550    
pF1KB4 EAIRTDNQNFASQLREAEARNRDLEAHVRQLQERMELLQAEGATAVTGVPSPRATDPPSH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                
CCDS74 EAIRTDNQNFASQLREAEARNRDLEAHVRQLQERMELLQAEGATGP              
          490       500       510       520       530              

          560       570       580       590       600       610    
pF1KB4 MAPRPWLWASARWWGQAPCTAATCCSLPGSLGLAYRRRFPCSCSPLFCLVPPPWAALGWW

>>CCDS1559.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1             (1638 aa)
 initn: 1585 init1: 1013 opt: 1580  Z-score: 961.9  bits: 189.6 E(32554): 2.9e-47
Smith-Waterman score: 1611; 52.3% identity (75.5% similar) in 493 aa overlap (64-535:60-543)

            40        50        60        70        80        90   
pF1KB4 KGRQTEGGAFPLVSSALSGDPRFFSPTTPPAEPIVVRLKEVRLQRDDFEILKVIGRGAFS
                                     :.:.. ..:..::.:.:::::::::::::.
CCDS15 TLLDILICLYDECNNSPLRREKNILEYLEWAKPFTSKVKQMRLHREDFEILKVIGRGAFG
      30        40        50        60        70        80         

           100       110       120       130       140       150   
pF1KB4 EVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLVNGDRRWITQLHFAFQDENY
       ::::::.:.. .:.::::.:::.::::.:..::::::::::::: .::: ::.::::.: 
CCDS15 EVAVVKLKNADKVFAMKILNKWEMLKRAETACFREERDVLVNGDNKWITTLHYAFQDDNN
      90       100       110       120       130       140         

           160       170       180       190       200       210   
pF1KB4 LYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAIDSVHRLGYVHRDIKPDNILL
       :::::.:::::::::::::: .:.: .::::::::.:.::::::.: ::::::::::::.
CCDS15 LYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDRLPEDMARFYLAEMVIAIDSVHQLHYVHRDIKPDNILM
     150       160       170       180       190       200         

           220       230       240       250       260       270   
pF1KB4 DRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGTPDYLSPEILQAVGGGPGTGSYGPECDWWA
       :  ::::::::::::::  ::::.: ::::::::.:::::::.  : :   ::::::::.
CCDS15 DMNGHIRLADFGSCLKLMEDGTVQSSVAVGTPDYISPEILQAMEDGKG--RYGPECDWWS
     210       220       230       240       250         260       

           280       290       300       310       320       330   
pF1KB4 LGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYKEHLSLPLVDEGVPEEARDFIQRLLCPPET
       :::  :::.::.:::::.: .::::::...::....:     : :.:.:.:.::.:  : 
CCDS15 LGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHKERFQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSREH
       270       280       290       300       310       320       

           340       350       360       370       380       390   
pF1KB4 RLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDSVPPFTPDFEGATDTCNFDLVEDGLTAMETLSDI
       :::..:  ::. :::: :.:::..:.   :. :.  . ::: :::. .: :   ::.   
CCDS15 RLGQNGIEDFKKHPFFSGIDWDNIRNCEAPYIPEVSSPTDTSNFDVDDDCLKNSETMPPP
       330       340       350       360       370       380       

           400       410             420       430         440     
pF1KB4 REGAPLGVHLPFVGYSY--SCMALRDSE----VPGPTPMELEA--EQLLEPHVQAPSLEP
        . :  : ::::::..:  ::. : :      . ::: ..:..  .. :. .. . . : 
CCDS15 THTAFSGHHLPFVGFTYTSSCV-LSDRSCLRVTAGPTSLDLDVNVQRTLDNNLATEAYER
       390       400        410       420       430       440      

          450       460       470       480             490        
pF1KB4 SVSP-QDETAEVAVPAAVPAAEAEAEVTLRELQEALEEEVLTR------QSLSREMEAIR
        ..  ..:  :..          :.  :.. :: .  .  ::       ..:..:.: .:
CCDS15 RIKRLEQEKLELSRKLQ------ESTQTVQALQYSTVDGPLTASKDLEIKNLKEEIEKLR
        450       460             470       480       490       500

         500       510       520          530       540       550  
pF1KB4 ---TDNQNFASQLREAEARNRDLEAHVRQLQ---ERMELLQAEGATAVTGVPSPRATDPP
          :..... .::.::.:  ..:.   ::..   .... :: :                 
CCDS15 KQVTESSHLEQQLEEANAVRQELDDAFRQIKAYEKQIKTLQQEREDLNKLEVHTEALAAE
              510       520       530       540       550       560

            560       570       580       590       600       610  
pF1KB4 SHMAPRPWLWASARWWGQAPCTAATCCSLPGSLGLAYRRRFPCSCSPLFCLVPPPWAALG
                                                                   
CCDS15 ASKDRKLREQSEHYSKQLENELEGLKQKQISYSPGVCSIEHQQEITKLKTDLEKKSIFYE
              570       580       590       600       610       620

>>CCDS1558.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1             (1719 aa)
 initn: 1585 init1: 1013 opt: 1580  Z-score: 961.7  bits: 189.6 E(32554): 3e-47
Smith-Waterman score: 1611; 52.3% identity (75.5% similar) in 493 aa overlap (64-535:60-543)

            40        50        60        70        80        90   
pF1KB4 KGRQTEGGAFPLVSSALSGDPRFFSPTTPPAEPIVVRLKEVRLQRDDFEILKVIGRGAFS
                                     :.:.. ..:..::.:.:::::::::::::.
CCDS15 TLLDILICLYDECNNSPLRREKNILEYLEWAKPFTSKVKQMRLHREDFEILKVIGRGAFG
      30        40        50        60        70        80         

           100       110       120       130       140       150   
pF1KB4 EVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLVNGDRRWITQLHFAFQDENY
       ::::::.:.. .:.::::.:::.::::.:..::::::::::::: .::: ::.::::.: 
CCDS15 EVAVVKLKNADKVFAMKILNKWEMLKRAETACFREERDVLVNGDNKWITTLHYAFQDDNN
      90       100       110       120       130       140         

           160       170       180       190       200       210   
pF1KB4 LYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAIDSVHRLGYVHRDIKPDNILL
       :::::.:::::::::::::: .:.: .::::::::.:.::::::.: ::::::::::::.
CCDS15 LYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDRLPEDMARFYLAEMVIAIDSVHQLHYVHRDIKPDNILM
     150       160       170       180       190       200         

           220       230       240       250       260       270   
pF1KB4 DRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGTPDYLSPEILQAVGGGPGTGSYGPECDWWA
       :  ::::::::::::::  ::::.: ::::::::.:::::::.  : :   ::::::::.
CCDS15 DMNGHIRLADFGSCLKLMEDGTVQSSVAVGTPDYISPEILQAMEDGKG--RYGPECDWWS
     210       220       230       240       250         260       

           280       290       300       310       320       330   
pF1KB4 LGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYKEHLSLPLVDEGVPEEARDFIQRLLCPPET
       :::  :::.::.:::::.: .::::::...::....:     : :.:.:.:.::.:  : 
CCDS15 LGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHKERFQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSREH
       270       280       290       300       310       320       

           340       350       360       370       380       390   
pF1KB4 RLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDSVPPFTPDFEGATDTCNFDLVEDGLTAMETLSDI
       :::..:  ::. :::: :.:::..:.   :. :.  . ::: :::. .: :   ::.   
CCDS15 RLGQNGIEDFKKHPFFSGIDWDNIRNCEAPYIPEVSSPTDTSNFDVDDDCLKNSETMPPP
       330       340       350       360       370       380       

           400       410             420       430         440     
pF1KB4 REGAPLGVHLPFVGYSY--SCMALRDSE----VPGPTPMELEA--EQLLEPHVQAPSLEP
        . :  : ::::::..:  ::. : :      . ::: ..:..  .. :. .. . . : 
CCDS15 THTAFSGHHLPFVGFTYTSSCV-LSDRSCLRVTAGPTSLDLDVNVQRTLDNNLATEAYER
       390       400        410       420       430       440      

          450       460       470       480             490        
pF1KB4 SVSP-QDETAEVAVPAAVPAAEAEAEVTLRELQEALEEEVLTR------QSLSREMEAIR
        ..  ..:  :..          :.  :.. :: .  .  ::       ..:..:.: .:
CCDS15 RIKRLEQEKLELSRKLQ------ESTQTVQALQYSTVDGPLTASKDLEIKNLKEEIEKLR
        450       460             470       480       490       500

         500       510       520          530       540       550  
pF1KB4 ---TDNQNFASQLREAEARNRDLEAHVRQLQ---ERMELLQAEGATAVTGVPSPRATDPP
          :..... .::.::.:  ..:.   ::..   .... :: :                 
CCDS15 KQVTESSHLEQQLEEANAVRQELDDAFRQIKAYEKQIKTLQQEREDLNKELVQASERLKN
              510       520       530       540       550       560

            560       570       580       590       600       610  
pF1KB4 SHMAPRPWLWASARWWGQAPCTAATCCSLPGSLGLAYRRRFPCSCSPLFCLVPPPWAALG
                                                                   
CCDS15 QSKELKDAHCQRKLAMQEFMEINERLTELHTQKQKLARHVRDKEEEVDLVMQKVESLRQE
              570       580       590       600       610       620

>>CCDS31601.1 CDC42BPG gene_id:55561|Hs108|chr11          (1551 aa)
 initn: 1611 init1: 965 opt: 1552  Z-score: 945.4  bits: 186.4 E(32554): 2.4e-46
Smith-Waterman score: 1582; 49.9% identity (73.2% similar) in 523 aa overlap (64-535:54-574)

            40        50        60        70        80        90   
pF1KB4 KGRQTEGGAFPLVSSALSGDPRFFSPTTPPAEPIVVRLKEVRLQRDDFEILKVIGRGAFS
                                     : :.: ..::.::::::::::::::::::.
CCDS31 GLLDLLLALHHELSSGPLRRERSVAQFLSWASPFVSKVKELRLQRDDFEILKVIGRGAFG
            30        40        50        60        70        80   

           100       110       120       130       140       150   
pF1KB4 EVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLVNGDRRWITQLHFAFQDENY
       ::.::....:::..:::...::.::::.:..::::::::::.:: ::.: ::.:::::.:
CCDS31 EVTVVRQRDTGQIFAMKMLHKWEMLKRAETACFREERDVLVKGDSRWVTTLHYAFQDEEY
            90       100       110       120       130       140   

           160       170       180       190       200       210   
pF1KB4 LYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAIDSVHRLGYVHRDIKPDNILL
       :::::.::.:::::::::.: .:.: :.:.:::::.:.:: :.:.:::::::.::::.::
CCDS31 LYLVMDYYAGGDLLTLLSRFEDRLPPELAQFYLAEMVLAIHSLHQLGYVHRDVKPDNVLL
           150       160       170       180       190       200   

           220       230       240       250       260       270   
pF1KB4 DRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGTPDYLSPEILQAVGGGPGTGSYGPECDWWA
       :  ::::::::::::.: ..: : : ::::::::.:::::::.    : : :::.::::.
CCDS31 DVNGHIRLADFGSCLRLNTNGMVDSSVAVGTPDYISPEILQAME--EGKGHYGPQCDWWS
           210       220       230       240         250       260 

           280       290       300       310       320       330   
pF1KB4 LGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYKEHLSLPLVDEGVPEEARDFIQRLLCPPET
       ::: :::...:.:::::.: .::::::.....::..:     ::  :.:.:..:::  : 
CCDS31 LGVCAYELLFGETPFYAESLVETYGKIMNHEDHLQFPPDVPDVPASAQDLIRQLLCRQEE
             270       280       290       300       310       320 

           340       350       360       370       380       390   
pF1KB4 RLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDSVPPFTPDFEGATDTCNFDLVEDGLTAMETLSDI
       ::::::  :::.:::: :.::. : .:. :. :...:  :: :::. .: :.   ::   
CCDS31 RLGRGGLDDFRNHPFFEGVDWERLASSTAPYIPELRGPMDTSNFDVDDDTLNHPGTLPPP
             330       340       350       360       370       380 

           400       410        420            430            440  
pF1KB4 REGAPLGVHLPFVGYSYSCMALR-DSEVPGPTPME-----LEAEQ--LLEPH---VQAPS
        .::  : ::::::..:.  .   .:   . . .:     :: :.  : . :   ..::.
CCDS31 SHGAFSGHHLPFVGFTYTSGSHSPESSSEAWAALERKLQCLEQEKVELSRKHQEALHAPT
             390       400       410       420       430       440 

                    450                  460       470             
pF1KB4 -------LEPSVSP-QDETAEV-----------AVPAAVPAAEAEAEVTL----RELQEA
              :.  :.  .:.  :.           . ::. :. ... .  :    ::: :.
CCDS31 DHRELEQLRKEVQTLRDRLPEMLRDKASLSQTDGPPAGSPGQDSDLRQELDRLHRELAEG
             450       460       470       480       490       500 

                     480       490        500       510       520  
pF1KB4 ----------------LEEEVLTRQSLSREMEAIR-TDNQNFASQLREAEARNRDLEAHV
                        .::.: : . ..: ::   .... ..:::.::.: .:.:::.:
CCDS31 RAGLQAQEQELCRAQGQQEELLQRLQEAQEREAATASQTRALSSQLEEARAAQRELEAQV
             510       520       530       540       550       560 

            530       540       550       560       570       580  
pF1KB4 RQLQERMELLQAEGATAVTGVPSPRATDPPSHMAPRPWLWASARWWGQAPCTAATCCSLP
        .:....  ::..                                               
CCDS31 SSLSRQVTQLQGQWEQRLEESSQAKTIHTASETNGMGPPEGGPQEAQLRKEVAALREQLE
             570       580       590       600       610       620 

>>CCDS9978.1 CDC42BPB gene_id:9578|Hs108|chr14            (1711 aa)
 initn: 1141 init1: 987 opt: 1540  Z-score: 937.7  bits: 185.1 E(32554): 6.5e-46
Smith-Waterman score: 1551; 49.1% identity (72.9% similar) in 509 aa overlap (48-529:44-549)

        20        30        40        50        60        70       
pF1KB4 SPWEADSPRVKLRGREKGRQTEGGAFPLVSSALSGDPRFFSPTTPPAEPIVVRLKEVRLQ
                                     :::  : .. .     :.:..  .::..:.
CCDS99 LLDGPWRNESALSVETLLDVLVCLYTECSHSALRRD-KYVAEFLEWAKPFTQLVKEMQLH
            20        30        40         50        60        70  

        80        90       100       110       120       130       
pF1KB4 RDDFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLVNGD
       :.::::.::::::::.::::::::.: ..:::::.:::.::::.:..:::::::::::::
CCDS99 REDFEIIKVIGRGAFGEVAVVKMKNTERIYAMKILNKWEMLKRAETACFREERDVLVNGD
             80        90       100       110       120       130  

       140       150       160       170       180       190       
pF1KB4 RRWITQLHFAFQDENYLYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAIDSVH
        .::: ::.::::::.:::::.:::::::::::::: ...: .:::::..:.:.::::.:
CCDS99 CQWITALHYAFQDENHLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDKLPEDMARFYIGEMVLAIDSIH
            140       150       160       170       180       190  

       200       210       220       230       240       250       
pF1KB4 RLGYVHRDIKPDNILLDRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGTPDYLSPEILQAVG
       .: ::::::::::.:::  :::::::::::::.  ::::.: ::::::::.:::::::. 
CCDS99 QLHYVHRDIKPDNVLLDVNGHIRLADFGSCLKMNDDGTVQSSVAVGTPDYISPEILQAME
            200       210       220       230       240       250  

       260       270       280       290       300       310       
pF1KB4 GGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYKEHLSLPLVDEGVP
          : :.::::::::.:::  :::.::.:::::.: .::::::....:....:     : 
CCDS99 D--GMGKYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHEERFQFPSHVTDVS
              260       270       280       290       300       310

       320       330       340       350       360       370       
pF1KB4 EEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDSVPPFTPDFEGATDTCNF
       :::.:.::::.:  : :::..:  ::. : :: ::.:...:.   :. ::  . .:: ::
CCDS99 EEAKDLIQRLICSRERRLGQNGIEDFKKHAFFEGLNWENIRNLEAPYIPDVSSPSDTSNF
              320       330       340       350       360       370

       380       390       400       410                        420
pF1KB4 DLVEDGLTAMETLSDIREGAPLGVHLPFVGYSY---SCMALR--------------DSEV
       :. .: :   : :    . .  :.::::.:...   ::.. :              : .:
CCDS99 DVDDDVLRNTEILPPGSHTGFSGLHLPFIGFTFTTESCFSDRGSLKSIMQSNTLTKDEDV
              380       390       400       410       420       430

                430       440       450           460       470    
pF1KB4 PGPTP--MELEAEQLLEPHVQAPSLEPSVSPQDETAEV----AVPAAVPAAEAEAEVT-L
              ...:: .    ...  .:: : . :. :  :    .   :.  .. . :.  :
CCDS99 QRDLEHSLQMEAYERRIRRLEQEKLELSRKLQESTQTVQSLHGSSRALSNSNRDKEIKKL
              440       450       460       470       480       490

           480       490          500       510       520       530
pF1KB4 RELQEALEEEVLTRQSLSREME---AIRTDNQNFASQLREAEARNRDLEAHVRQLQERME
        :  : :....   . : :..:   :.: . .. ...::  : ..: .. . ..:.... 
CCDS99 NEEIERLKNKIADSNRLERQLEDTVALRQEREDSTQRLRGLEKQHRVVRQEKEELHKQLV
              500       510       520       530       540       550

              540       550       560       570       580       590
pF1KB4 LLQAEGATAVTGVPSPRATDPPSHMAPRPWLWASARWWGQAPCTAATCCSLPGSLGLAYR
                                                                   
CCDS99 EASERLKSQAKELKDAHQQRKLALQEFSELNERMAELRAQKQKVSRQLRDKEEEMEVATQ
              560       570       580       590       600       610

>>CCDS11870.2 ROCK1 gene_id:6093|Hs108|chr18              (1354 aa)
 initn: 890 init1: 388 opt: 1206  Z-score: 738.8  bits: 148.0 E(32554): 7.8e-35
Smith-Waterman score: 1206; 39.9% identity (70.6% similar) in 479 aa overlap (68-533:63-527)

        40        50        60        70        80        90       
pF1KB4 TEGGAFPLVSSALSGDPRFFSPTTPPAEPIVVRLKEVRLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAV
                                     . .....:.. .:.:..::::::::.:: .
CCDS11 GLDALVYDLDFPALRKNKNIDNFLSRYKDTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQL
             40        50        60        70        80        90  

       100       110       120       130       140       150       
pF1KB4 VKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLVNGDRRWITQLHFAFQDENYLYLV
       :. :.: .:::::...:..:.::.. . : ::::... ..  :..:: .::::. :::.:
CCDS11 VRHKSTRKVYAMKLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMV
            100       110       120       130       140       150  

       160       170       180       190       200       210       
pF1KB4 MEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAIDSVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCG
       :::. ::::..:.:..   .: . :::: ::.:.:.:..: .:..:::.::::.:::. :
CCDS11 MEYMPGGDLVNLMSNYD--VPEKWARFYTAEVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSG
            160         170       180       190       200       210

       220       230       240       250       260       270       
pF1KB4 HIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGTPDYLSPEILQAVGGGPGTGSYGPECDWWALGVF
       :..:::::.:.:.  .: ::  .:::::::.:::.:.. ::    : :: :::::..:::
CCDS11 HLKLADFGTCMKMNKEGMVRCDTAVGTPDYISPEVLKSQGGD---GYYGRECDWWSVGVF
              220       230       240       250          260       

       280       290       300       310       320       330       
pF1KB4 AYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYKEHLSLPLVDEGVPEEARDFIQRLLCPPETRLGR
        :::. :.::::::: . ::.::...:. :..:  :. . .::...:  .:   :.::::
CCDS11 LYEMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMNHKNSLTFPD-DNDISKEAKNLICAFLTDREVRLGR
       270       280       290       300        310       320      

       340       350          360       370       380       390    
pF1KB4 GGAGDFRTHPFFFGLD---WDGLRDSVPPFTPDFEGATDTCNFDLVEDGLTAMETLSDIR
       .:. ... : .::  :   :. :::.: : .::. .  :: ::: .:.     ::.   .
CCDS11 NGVEEIKRH-LFFKNDQWAWETLRDTVAPVVPDLSSDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPIPK
        330        340       350       360       370       380     

          400       410        420       430       440       450   
pF1KB4 EGAPLGVHLPFVGYSY-SCMALRDSEVPGPTPMELEAEQLLEPHVQAPSLEPSVSPQDET
         : .: .:::::..: :     .:  :. .    .:.. :.      ::. ..   .: 
CCDS11 --AFVGNQLPFVGFTYYSNRRYLSSANPNDNRTSSNADKSLQE-----SLQKTIYKLEEQ
           390       400       410       420            430        

             460       470       480       490       500           
pF1KB4 --AEVAVPAAVPAAEAEAEVTLRELQEALEEEVLTRQSLSREMEAIRTDNQNFASQL---
          :. .   .      ... : .... :.::   :..:   .  :. ... .  ..   
CCDS11 LHNEMQLKDEMEQKCRTSNIKLDKIMKELDEEGNQRRNLESTVSQIEKEKMLLQHRINEY
      440       450       460       470       480       490        

       510          520       530       540       550       560    
pF1KB4 -REAEARN---RDLEAHVRQLQERMELLQAEGATAVTGVPSPRATDPPSHMAPRPWLWAS
        :.:: .:   :..: .:  :....: :.                               
CCDS11 QRKAEQENEKRRNVENEVSTLKDQLEDLKKVSQNSQLANEKLSQLQKQLEEANDLLRTES
      500       510       520       530       540       550        




635 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 14:43:17 2016 done: Thu Nov  3 14:43:18 2016
 Total Scan time:  4.270 Total Display time:  0.150

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com