Result of FASTA (ccds) for pF1KB4151
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4151, 1058 aa
  1>>>pF1KB4151 1058 - 1058 aa - 1058 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8823+/-0.00104; mu= 18.8313+/- 0.063
 mean_var=74.6021+/-14.841, 0's: 0 Z-trim(104.3): 30  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.148490
 statistics sampled from 7815 (7833) to 7815 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.605), E-opt: 0.2 (0.241), width:  16
 Scan time:  4.640

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS14275.1 UBA1 gene_id:7317|Hs108|chrX           (1058) 7085 1528.0       0
CCDS2805.1 UBA7 gene_id:7318|Hs108|chr3            (1012) 2975 647.5 4.3e-185
CCDS3516.1 UBA6 gene_id:55236|Hs108|chr4           (1052) 2606 568.4 2.8e-161
CCDS12439.1 UBA2 gene_id:10054|Hs108|chr19         ( 640)  445 105.4 4.1e-22
CCDS54284.1 SAE1 gene_id:10055|Hs108|chr19         ( 266)  363 87.7 3.7e-17
CCDS54285.1 SAE1 gene_id:10055|Hs108|chr19         ( 299)  363 87.7 4.1e-17
CCDS12696.1 SAE1 gene_id:10055|Hs108|chr19         ( 346)  363 87.7 4.6e-17


>>CCDS14275.1 UBA1 gene_id:7317|Hs108|chrX                (1058 aa)
 initn: 7085 init1: 7085 opt: 7085  Z-score: 8194.7  bits: 1528.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 7085; 100.0% identity (100.0% similar) in 1058 aa overlap (1-1058:1-1058)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MSSSPLSKKRRVSGPDPKPGSNCSPAQSVLSEVPSVPTNGMAKNGSEADIDEGLYSRQLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MSSSPLSKKRRVSGPDPKPGSNCSPAQSVLSEVPSVPTNGMAKNGSEADIDEGLYSRQLY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 VLGHEAMKRLQTSSVLVSGLRGLGVEIAKNIILGGVKAVTLHDQGTAQWADLSSQFYLRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VLGHEAMKRLQTSSVLVSGLRGLGVEIAKNIILGGVKAVTLHDQGTAQWADLSSQFYLRE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 EDIGKNRAEVSQPRLAELNSYVPVTAYTGPLVEDFLSGFQVVVLTNTPLEDQLRVGEFCH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EDIGKNRAEVSQPRLAELNSYVPVTAYTGPLVEDFLSGFQVVVLTNTPLEDQLRVGEFCH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 NRGIKLVVADTRGLFGQLFCDFGEEMILTDSNGEQPLSAMVSMVTKDNPGVVTCLDEARH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NRGIKLVVADTRGLFGQLFCDFGEEMILTDSNGEQPLSAMVSMVTKDNPGVVTCLDEARH
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 GFESGDFVSFSEVQGMVELNGNQPMEIKVLGPYTFSICDTSNFSDYIRGGIVSQVKVPKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GFESGDFVSFSEVQGMVELNGNQPMEIKVLGPYTFSICDTSNFSDYIRGGIVSQVKVPKK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 ISFKSLVASLAEPDFVVTDFAKFSRPAQLHIGFQALHQFCAQHGRPPRPRNEEDAAELVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ISFKSLVASLAEPDFVVTDFAKFSRPAQLHIGFQALHQFCAQHGRPPRPRNEEDAAELVA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 LAQAVNARALPAVQQNNLDEDLIRKLAYVAAGDLAPINAFIGGLAAQEVMKACSGKFMPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LAQAVNARALPAVQQNNLDEDLIRKLAYVAAGDLAPINAFIGGLAAQEVMKACSGKFMPI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 MQWLYFDALECLPEDKEVLTEDKCLQRQNRYDGQVAVFGSDLQEKLGKQKYFLVGAGAIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MQWLYFDALECLPEDKEVLTEDKCLQRQNRYDGQVAVFGSDLQEKLGKQKYFLVGAGAIG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 CELLKNFAMIGLGCGEGGEIIVTDMDTIEKSNLNRQFLFRPWDVTKLKSDTAAAAVRQMN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CELLKNFAMIGLGCGEGGEIIVTDMDTIEKSNLNRQFLFRPWDVTKLKSDTAAAAVRQMN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 PHIRVTSHQNRVGPDTERIYDDDFFQNLDGVANALDNVDARMYMDRRCVYYRKPLLESGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PHIRVTSHQNRVGPDTERIYDDDFFQNLDGVANALDNVDARMYMDRRCVYYRKPLLESGT
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 LGTKGNVQVVIPFLTESYSSSQDPPEKSIPICTLKNFPNAIEHTLQWARDEFEGLFKQPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LGTKGNVQVVIPFLTESYSSSQDPPEKSIPICTLKNFPNAIEHTLQWARDEFEGLFKQPA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB4 ENVNQYLTDPKFVERTLRLAGTQPLEVLEAVQRSLVLQRPQTWADCVTWACHHWHTQYSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ENVNQYLTDPKFVERTLRLAGTQPLEVLEAVQRSLVLQRPQTWADCVTWACHHWHTQYSN
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB4 NIRQLLHNFPPDQLTSSGAPFWSGPKRCPHPLTFDVNNPLHLDYVMAAANLFAQTYGLTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NIRQLLHNFPPDQLTSSGAPFWSGPKRCPHPLTFDVNNPLHLDYVMAAANLFAQTYGLTG
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB4 SQDRAAVATFLQSVQVPEFTPKSGVKIHVSDQELQSANASVDDSRLEELKATLPSPDKLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SQDRAAVATFLQSVQVPEFTPKSGVKIHVSDQELQSANASVDDSRLEELKATLPSPDKLP
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB4 GFKMYPIDFEKDDDSNFHMDFIVAASNLRAENYDIPSADRHKSKLIAGKIIPAIATTTAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GFKMYPIDFEKDDDSNFHMDFIVAASNLRAENYDIPSADRHKSKLIAGKIIPAIATTTAA
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB4 VVGLVCLELYKVVQGHRQLDSYKNGFLNLALPFFGFSEPLAAPRHQYYNQEWTLWDRFEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VVGLVCLELYKVVQGHRQLDSYKNGFLNLALPFFGFSEPLAAPRHQYYNQEWTLWDRFEV
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB4 QGLQPNGEEMTLKQFLDYFKTEHKLEITMLSQGVSMLYSFFMPAAKLKERLDQPMTEIVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QGLQPNGEEMTLKQFLDYFKTEHKLEITMLSQGVSMLYSFFMPAAKLKERLDQPMTEIVS
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050        
pF1KB4 RVSKRKLGRHVRALVLELCCNDESGEDVEVPYVRYTIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RVSKRKLGRHVRALVLELCCNDESGEDVEVPYVRYTIR
             1030      1040      1050        

>>CCDS2805.1 UBA7 gene_id:7318|Hs108|chr3                 (1012 aa)
 initn: 2595 init1: 670 opt: 2975  Z-score: 3436.6  bits: 647.5 E(32554): 4.3e-185
Smith-Waterman score: 2977; 46.7% identity (72.7% similar) in 1019 aa overlap (50-1057:10-1012)

      20        30        40        50        60        70         
pF1KB4 GSNCSPAQSVLSEVPSVPTNGMAKNGSEADIDEGLYSRQLYVLGHEAMKRLQTSSVLVSG
                                     .:: ::::::::::  ::.:.: . :::::
CCDS28                      MDALDASKLLDEELYSRQLYVLGSPAMQRIQGARVLVSG
                                    10        20        30         

      80        90       100       110       120       130         
pF1KB4 LRGLGVEIAKNIILGGVKAVTLHDQGTAQWADLSSQFYLREEDIGKNRAEVSQPRLAELN
       :.:::.:.:::..: :: ..::::   . :.::..:: : :.:. ..:::.::  ::.::
CCDS28 LQGLGAEVAKNLVLMGVGSLTLHDPHPTCWSDLAAQFLLSEQDLERSRAEASQELLAQLN
      40        50        60        70        80        90         

     140       150       160       170       180       190         
pF1KB4 SYVPVTAYTGPLVEDFLSGFQVVVLTNTPLEDQLRVGEFCHNRGIKLVVADTRGLFGQLF
         : :...:: ..::.:  ::::::: . ::.::.:: .::..:. ...:::::: ::::
CCDS28 RAVQVVVHTGDITEDLLLDFQVVVLTAAKLEEQLKVGTLCHKHGVCFLAADTRGLVGQLF
     100       110       120       130       140       150         

     200       210       220       230        240       250        
pF1KB4 CDFGEEMILTDSNGEQPLSAMVSMVTKDNPGVVTCLDEAR-HGFESGDFVSFSEVQGMVE
       :::::.. . : .  .::.: .. ... .::..:    :  : :..::.:.:: ..::::
CCDS28 CDFGEDFTVQDPTEAEPLTAAIQHISQGSPGILTLRKGANTHYFRDGDLVTFSGIEGMVE
     160       170       180       190       200       210         

      260       270       280       290       300       310        
pF1KB4 LNGNQPMEIKVLGPYTFSICDTSNFSDYIRGGIVSQVKVPKKISFKSLVASLAEPDFVVT
       ::  .:  :.:    .. : ::..:: :.::: ...:: :: .  ::: ..: .:  :. 
CCDS28 LNDCDPRSIHVREDGSLEIGDTTTFSRYLRGGAITEVKRPKTVRHKSLDTALLQPHVVAQ
     220       230       240       250       260       270         

      320       330       340       350       360         370      
pF1KB4 DFAKFSRPAQLHIGFQALHQFCAQHGRPPRPRNEEDAAELVALAQAVNA--RALPAVQQN
       .  .  .   :: .: :::.:   :::::.: .  ::  .:.::. ..   :.     ..
CCDS28 SSQEVHHAHCLHQAFCALHKFQHLHGRPPQPWDPVDAETVVGLARDLEPLKRTEEEPLEE
     280       290       300       310       320       330         

        380       390       400       410       420       430      
pF1KB4 NLDEDLIRKLAYVAAGDLAPINAFIGGLAAQEVMKACSGKFMPIMQWLYFDALECLPEDK
        ::: :.: .:  .:: :.:. :..:..:::::.:: : ::::. ::::::::.::::: 
CCDS28 PLDEALVRTVALSSAGVLSPMVAMLGAVAAQEVLKAISRKFMPLDQWLYFDALDCLPEDG
     340       350       360       370       380       390         

         440       450       460       470       480       490     
pF1KB4 EVL-TEDKCLQRQNRYDGQVAVFGSDLQEKLGKQKYFLVGAGAIGCELLKNFAMIGLGCG
       :.: . . :  : .:::::.::::. .:::: .:.:.::::::::::::: ::..::: :
CCDS28 ELLPSPEDCALRGSRYDGQIAVFGAGFQEKLRRQHYLLVGAGAIGCELLKVFALVGLGAG
     400       410       420       430       440       450         

         500       510       520       530       540       550     
pF1KB4 EGGEIIVTDMDTIEKSNLNRQFLFRPWDVTKLKSDTAAAAVRQMNPHIRVTSHQNRVGPD
       ..: . :.::: ::.:::.::::::  :: . :...::::.: .:: ..:      . : 
CCDS28 NSGGLTVVDMDHIERSNLSRQFLFRSQDVGRPKAEVAAAAARGLNPDLQVIPLTYPLDPT
     460       470       480       490       500       510         

         560       570       580       590       600       610     
pF1KB4 TERIYDDDFFQNLDGVANALDNVDARMYMDRRCVYYRKPLLESGTLGTKGNVQVVIPFLT
       ::.:: :.::. .:::: :::. .:: :.  ::..: :::::.:: :: :.. : .: .:
CCDS28 TEHIYGDNFFSRVDGVAAALDSFQARRYVAARCTHYLKPLLEAGTSGTWGSATVFMPHVT
     520       530       540       550       560       570         

               620       630       640       650       660         
pF1KB4 ESY------SSSQDPPEKSIPICTLKNFPNAIEHTLQWARDEFEGLFKQPAENVNQYLTD
       :.:      ..:.: :    :.::.. ::.. :::::::: ::: ::.  ::..:..   
CCDS28 EAYRAPASAAASEDAP---YPVCTVRYFPSTAEHTLQWARHEFEELFRLSAETINHH---
     580       590          600       610       620       630      

     670        680       690       700       710       720        
pF1KB4 PKFVERTLR-LAGTQPLEVLEAVQRSLVLQRPQTWADCVTWACHHWHTQYSNNIRQLLHN
        . .. .:  .   : : .:. :   : . :::.: :::.::  ::.  .  .:.:::..
CCDS28 -QQAHTSLADMDEPQTLTLLKPVLGVLRV-RPQNWQDCVAWALGHWKLCFHYGIKQLLRH
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        .:.   .:.  :.. . : .:. :: ::.:     . .::. .:   .  : .:  :. 
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CCDS28 FEKDDDSNFHVDFVVAAASLRCQNYGIPPVNRAQSKRIVGQIIPAIATTTAAVAGLLGLE
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CCDS28 LYKVVSGPRPRSAFRHSYLHLAENYLIRYMPFAPAIQTFHHLKWTSWDRLKVPAGQP---
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CCDS28 ERTLESLLAHLQEQHGLRVRILLHGSALLYAAGWSPEKQAQHLPLRVTELVQQLTGQAPA
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CCDS28 PGQRVLVLELSCEGDD-EDTAFPPLHYEL 
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CCDS35 AAHQGEEASCSSWGTGSTNKNLPIMSTASVEIDDALYSRQRYVLGDTAMQKMAKSHVFLS
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CCDS35 GMGGLGLEIAKNLVLAGIKAVTIHDTEKCQAWDLGTNFFLSEDDVVNKRNRAEAVLKHIA
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CCDS35 ELNPYVHVTSSSVPFNETTDLSFLDKYQCVVLTEMKLPLQKKINDFCRSQCPPIKFISAD
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CCDS35 REINGMTGLNGSI-QQITVISPFSFSIGDTTELEPYLHGGIAVQVKTPKTVFFESLERQL
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CCDS35 KHPKCLIVDFSNPEAPLEIHTAMLALDQFQEKYSRKPNVGCQQDSEELLKLATSIS-ETL
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CCDS35 E--EKPDVNADIVHWLSWTAQGFLSPLAAAVGGVASQEVLKAVTGKFSPLCQWLYLEAAD
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        .    : : . .:   : : .:::.  : .:. : .:: . . :::: ::::::.::::
CCDS35 IV----ESLGKPECEEFLPRGDRYDALRACIGDTLCQKLQNLNIFLVGCGAIGCEMLKNF
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pF1KB4 AMIGLGCG-EGGEIIVTDMDTIEKSNLNRQFLFRPWDVTKLKSDTAAAAVRQMNPHIRVT
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CCDS35 ALLGVGTSKEKGMITVTDPDLIEKSNLNRQFLFRPHHIQKPKSYTAADATLKINSQIKID
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CCDS35 AHLNKVCPTTETIYNDEFYTKQDVIITALDNVEARRYVDSRCLANLRPLLDSGTMGTKGH
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CCDS35 TEVIVPHLTESYNSHRDPPEEEIPFCTLKSFPAAIEHTIQWARDKFESSFSHKPSLFNKF
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CCDS35 WQTYSSAEEVLQKIQSGHSLEGCFQVIK-LLSRRPRNWSQCVELARLKFEKYFNHKALQL
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       .: : .  :. :.. :: :..  :.  .:.  .. .    : .: :   ..  :: : . 
CCDS35 SADALLNILSEVKIQEFKPSN--KVVQTDETARKPDHVPISSEDERNAIFQLEKAILSNE
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pF1KB4 DKLPGFKMYPIDFEKDDDSNFHMDFIVAASNLRAENYDIPSADRHKSKLIAGKIIPAIAT
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CCDS35 ATKSDLQMAVLSFEKDDDHNGHIDFITAASNLRAKMYSIEPADRFKTKRIAGKIIPAIAT
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pF1KB4 TTAAVVGLVCLELYKVVQGHRQLDSYKNGFLNLALPFFGFSEPLAAPRHQYYNQ-EWTLW
       :::.: ::: ::. ::. :.  ...::: :::::.:.  :.:   . . .  :   .:.:
CCDS35 TTATVSGLVALEMIKVTGGY-PFEAYKNCFLNLAIPIVVFTETTEVRKTKIRNGISFTIW
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       ::. :.:     :..:: .:..  : .. .: ::. :::.:::   ::.    .::   :
CCDS35 DRWTVHG----KEDFTLLDFINAVKEKYGIEPTMVVQGVKMLYVPVMPGH--AKRLKLTM
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pF1KB4 TEIVSRVSKRKLGRHVRALVLELCCNDESGEDVEVPYVRYTIR    
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CCDS35 HKLVKPTTEKK---YVD-LTVSFAPDIDGDEDLPGPPVRYYFSHDTD
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CCDS12                      MALSRGLPRELAEAVAGGRVLVVGAGGIGCELLKNLVLT
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pF1KB4 GLGCGEGGEIIVTDMDTIEKSNLNRQFLFRPWDVTKLKSDTAAAAVRQMNPHIRVTSHQN
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CCDS12 GFS-----HIDLIDLDTIDVSNLNRQFLFQKKHVGRSKAQVAKESVLQFYPKANIVAYHD
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pF1KB4 RV-GPDTERIYDDDFFQNLDGVANALDNVDARMYMDRRCVYYRKPLLESGTLGTKGNVQV
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CCDS12 SIMNPD----YNVEFFRQFILVMNALDNRAARNHVNRMCLAADVPLIESGTAGYLGQVTT
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pF1KB4 VIPFLTESYSSSQDPPEKSIPICTLKNFPNAIEHTLQWARDEFEGLFKQPAENVNQYLTD
       .   .:: :     : ....: ::..: :.   : . ::.  :. :: .  :...: .. 
CCDS12 IKKGVTECYECHPKPTQRTFPGCTIRNTPSEPIHCIVWAKYLFNQLFGE--EDADQEVS-
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pF1KB4 PKFVERTLRLAGTQPLEVLEAVQRSLV----LQRPQT--WADCVTWACHHWHTQ-YSNNI
       :   .:.   :. .: :. ::  :.      ..: .:  ::  . .   .  :. ....:
CCDS12 P---DRADPEAAWEPTEA-EARARASNEDGDIKRISTKEWAKSTGYDPVKLFTKLFKDDI
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pF1KB4 RQLLHNFPPDQLTSSGAPFWSGPKRCPHPLTFDVNNPLHLDYVMAAANLFAQTYGLTGSQ
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CCDS12 RYLLTM---DKL-------WR--KRKP---------PVPLDWAEVQ------------SQ
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pF1KB4 DRAAVATFLQSVQVPEFTPKSGVKIHVSDQELQSAN--ASVDDSRLEELKATLPSPDKLP
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CCDS12 GEETNASDQQN------EPQLGLK----DQQVLDVKSYARLFSKSIETLRVHLA--EKGD
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pF1KB4 GFKMYPIDFEKDDDSNFHMDFIVAASNLRAENYDIPSADRHKSKLIAGKIIPAIATTTAA
       : ..    ..::: :   :::...:.::: . ...   .:   : .::.::::::::.:.
CCDS12 GAELI---WDKDDPSA--MDFVTSAANLRMHIFSMNMKSRFDIKSMAGNIIPAIATTNAV
      340          350         360       370       380       390   

              910       920       930       940       950       960
pF1KB4 VVGLVCLELYKVVQGHRQLDSYKNGFLNLALPFFGFSEPLAAPRHQYYNQEWTLWDRFEV
       ..::. ::  :...:  ..:. .. :::                                
CCDS12 IAGLIVLEGLKILSG--KIDQCRTIFLNKQPNPRKKLLVPCALDPPNPNCYVCASKPEVT
           400         410       420       430       440       450 

>>CCDS54284.1 SAE1 gene_id:10055|Hs108|chr19              (266 aa)
 initn: 394 init1: 263 opt: 363  Z-score: 421.6  bits: 87.7 E(32554): 3.7e-17
Smith-Waterman score: 363; 36.7% identity (67.6% similar) in 188 aa overlap (45-229:9-192)

           20        30        40        50        60        70    
pF1KB4 PDPKPGSNCSPAQSVLSEVPSVPTNGMAKNGSEADIDEGLYSRQLYVLGHEAMKRLQTSS
                                     :. .. . . :.::. . : ::.:::..: 
CCDS54                       MVEKEEAGGGISEEEAAQYDRQIRLWGLEAQKRLRASR
                                     10        20        30        

           80        90       100       110       120       130    
pF1KB4 VLVSGLRGLGVEIAKNIILGGVKAVTLHDQGTAQWADLSSQFYLREEDIGKNRAEVSQPR
       ::. ::.:::.:::::.::.:::..:. :.  .   : ..:: .:  ..:.::::.:  :
CCDS54 VLLVGLKGLGAEIAKNLILAGVKGLTMLDHEQVTPEDPGAQFLIRTGSVGRNRAEASLER
       40        50        60        70        80        90        

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pF1KB4 LAELNSYVPVTAYTGPLV---EDFLSGFQVVVLTNTPLEDQLRVGEFCHNRGIKLVVADT
         .:: .: : . :  .    :.:.. :..: ::    .  ..: ..::. .::. ..:.
CCDS54 AQNLNPMVDVKVDTEDIEKKPESFFTQFDAVCLTCCSRDVIVKVDQICHKNSIKFFTGDV
      100       110       120       130       140       150        

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pF1KB4 RGLFGQLFCDFGEEMILTDSNGEQPLSAMVSMVTKDNPGVVTCLDEARHGFESGDFVSFS
        :  :  : ..::. ..     :.   : ::. ..:.:                      
CCDS54 FGYHGYTFANLGEHEFVE----EKTKVAKVSQGVEDGPDTKRAKLDSSETTMVKKKVVFC
      160       170           180       190       200       210    

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pF1KB4 EVQGMVELNGNQPMEIKVLGPYTFSICDTSNFSDYIRGGIVSQVKVPKKISFKSLVASLA
                                                                   
CCDS54 PVKEALEVDWSSEKAKAALKRTTSDYFLLQGTASPRWPQCVRWLEGFWHRKL        
          220       230       240       250       260              

>>CCDS54285.1 SAE1 gene_id:10055|Hs108|chr19              (299 aa)
 initn: 358 init1: 263 opt: 363  Z-score: 420.8  bits: 87.7 E(32554): 4.1e-17
Smith-Waterman score: 363; 36.7% identity (67.6% similar) in 188 aa overlap (45-229:9-192)

           20        30        40        50        60        70    
pF1KB4 PDPKPGSNCSPAQSVLSEVPSVPTNGMAKNGSEADIDEGLYSRQLYVLGHEAMKRLQTSS
                                     :. .. . . :.::. . : ::.:::..: 
CCDS54                       MVEKEEAGGGISEEEAAQYDRQIRLWGLEAQKRLRASR
                                     10        20        30        

           80        90       100       110       120       130    
pF1KB4 VLVSGLRGLGVEIAKNIILGGVKAVTLHDQGTAQWADLSSQFYLREEDIGKNRAEVSQPR
       ::. ::.:::.:::::.::.:::..:. :.  .   : ..:: .:  ..:.::::.:  :
CCDS54 VLLVGLKGLGAEIAKNLILAGVKGLTMLDHEQVTPEDPGAQFLIRTGSVGRNRAEASLER
       40        50        60        70        80        90        

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pF1KB4 LAELNSYVPVTAYTGPLV---EDFLSGFQVVVLTNTPLEDQLRVGEFCHNRGIKLVVADT
         .:: .: : . :  .    :.:.. :..: ::    .  ..: ..::. .::. ..:.
CCDS54 AQNLNPMVDVKVDTEDIEKKPESFFTQFDAVCLTCCSRDVIVKVDQICHKNSIKFFTGDV
      100       110       120       130       140       150        

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pF1KB4 RGLFGQLFCDFGEEMILTDSNGEQPLSAMVSMVTKDNPGVVTCLDEARHGFESGDFVSFS
        :  :  : ..::. ..     :.   : ::. ..:.:                      
CCDS54 FGYHGYTFANLGEHEFVE----EKTKVAKVSQGVEDGPDTKRAKLDSSETTMVKKKVVFC
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pF1KB4 EVQGMVELNGNQPMEIKVLGPYTFSICDTSNFSDYIRGGIVSQVKVPKKISFKSLVASLA
                                                                   
CCDS54 PVKEALEVDWSSEKAKAALKRTTSDYFLLQGPVSAGPSSQQLLLLRWHEGEWDCGVPWPQ
          220       230       240       250       260       270    

>>CCDS12696.1 SAE1 gene_id:10055|Hs108|chr19              (346 aa)
 initn: 445 init1: 263 opt: 363  Z-score: 419.8  bits: 87.7 E(32554): 4.6e-17
Smith-Waterman score: 413; 28.7% identity (56.7% similar) in 397 aa overlap (45-432:9-343)

           20        30        40        50        60        70    
pF1KB4 PDPKPGSNCSPAQSVLSEVPSVPTNGMAKNGSEADIDEGLYSRQLYVLGHEAMKRLQTSS
                                     :. .. . . :.::. . : ::.:::..: 
CCDS12                       MVEKEEAGGGISEEEAAQYDRQIRLWGLEAQKRLRASR
                                     10        20        30        

           80        90       100       110       120       130    
pF1KB4 VLVSGLRGLGVEIAKNIILGGVKAVTLHDQGTAQWADLSSQFYLREEDIGKNRAEVSQPR
       ::. ::.:::.:::::.::.:::..:. :.  .   : ..:: .:  ..:.::::.:  :
CCDS12 VLLVGLKGLGAEIAKNLILAGVKGLTMLDHEQVTPEDPGAQFLIRTGSVGRNRAEASLER
       40        50        60        70        80        90        

          140       150          160       170       180       190 
pF1KB4 LAELNSYVPVTAYTGPLV---EDFLSGFQVVVLTNTPLEDQLRVGEFCHNRGIKLVVADT
         .:: .: : . :  .    :.:.. :..: ::    .  ..: ..::. .::. ..:.
CCDS12 AQNLNPMVDVKVDTEDIEKKPESFFTQFDAVCLTCCSRDVIVKVDQICHKNSIKFFTGDV
      100       110       120       130       140       150        

             200       210       220       230       240       250 
pF1KB4 RGLFGQLFCDFGEEMILTDSNGEQPLSAMVSMVTKDNPGVVTCLDEARHGFESGDFVSFS
        :  :  : ..::. ..     :.   : ::. ..:.:      :  :  ..:.. .   
CCDS12 FGYHGYTFANLGEHEFVE----EKTKVAKVSQGVEDGP------DTKRAKLDSSETT---
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pF1KB4 EVQGMVELNGNQPMEIKVLGPYTFSICDTSNFSDYIRGGIVSQVKVPKKISFKSLVASLA
           ::.         ::.      .:                ::   .....:  :.  
CCDS12 ----MVKK--------KVV------FCP---------------VKEALEVDWSSEKAK--
                     210                            220       230  

             320       330       340       350       360       370 
pF1KB4 EPDFVVTDFAKFSRPAQLHIGFQALHQFCAQHGRPPRPRNEEDAAELVALAQAVNARALP
                : ..: .. .. .:.: .: ...:: :   . :. .::.   .     .: 
CCDS12 ---------AALKRTTSDYFLLQVLLKFRTDKGRDPSSDTYEEDSELLLQIRNDVLDSL-
                       240       250       260       270       280 

             380       390       400       410       420           
pF1KB4 AVQQNNLDEDLIRKLAYVAAGDLAPINAFIGGLAAQEVMKACSGKFMPIMQWLYFDAL--
       ... . : ::..:       ...::. : .::. :::..:: : .  :  ....::..  
CCDS12 GISPDLLPEDFVR----YCFSEMAPVCAVVGGILAQEIVKALSQRDPPHNNFFFFDGMKG
              290           300       310       320       330      

         430       440       450       460       470       480     
pF1KB4 ----ECLPEDKEVLTEDKCLQRQNRYDGQVAVFGSDLQEKLGKQKYFLVGAGAIGCELLK
           :::                                                     
CCDS12 NGIVECLGPK                                                  
        340                                                        




1058 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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