Result of SIM4 for pF1KB4085

seq1 = pF1KB4085.tfa, 2919 bp
seq2 = pF1KB4085/gi568815593f_140775377.tfa (gi568815593f:140775377_141109835), 334459 bp

>pF1KB4085 2919
>gi568815593f:140775377_141109835 (Chr5)

1-2463  (100001-102463)   100% ->
2464-2522  (203573-203631)   100% ->
2523-2611  (207099-207187)   100% ->
2612-2919  (234251-234558)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTACTTACAGAAAAGGGTGACTGCTCATAAAATACCTCAGGCAAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTACTTACAGAAAAGGGTGACTGCTCATAAAATACCTCAGGCAAGCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCCCTTAAAACTGATTGTCCCAACTCAGAGGCCCTCATTTTCTGCAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCCCTTAAAACTGATTGTCCCAACTCAGAGGCCCTCATTTTCTGCAATGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGATTATCGGACCAAGAGGCCCGGGATCCCAGCGTCTGCTGCTCTCGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGATTATCGGACCAAGAGGCCCGGGATCCCAGCGTCTGCTGCTCTCGCTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGCTCCTTGCAGCCTGGGAGGTGGGGAGCGGCCAGCTCCACTACTCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGCTCCTTGCAGCCTGGGAGGTGGGGAGCGGCCAGCTCCACTACTCCGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTACGAGGAGGCCAAACACGGCACCTTCGTGGGCCGCATCGCTCAGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTACGAGGAGGCCAAACACGGCACCTTCGTGGGCCGCATCGCTCAGGACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGGGCTGGAGCTGGCGGAGCTGGTGCCGCGCCTGTTCCGGGTGGCGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGGGCTGGAGCTGGCGGAGCTGGTGCCGCGCCTGTTCCGGGTGGCGTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAAAGACACGGGGACCTTCTGGAGGTAAATCTGCAGAATGGCATTTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAAAGACACGGGGACCTTCTGGAGGTAAATCTGCAGAATGGCATTTTGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGTGAATTCTCGGATCGACCGCGAGAAGCTGTGCGGGCGGAGCGCGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGTGAATTCTCGGATCGACCGCGAGAAGCTGTGCGGGCGGAGCGCGGAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCAGTATCCACCTGGAGGTGATCGTGGACAGGCCGCTGCAGGTTTTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCAGTATCCACCTGGAGGTGATCGTGGACAGGCCGCTGCAGGTTTTCCAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGGACGTGGAGGTGAAGGACATTAACGACAACCCGCCGGTGTTCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGGACGTGGAGGTGAAGGACATTAACGACAACCCGCCGGTGTTCAGAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AAGGGAACAAAAGGTACCTGTTTCTGAATCTGCGCCTCTGGACTCTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AAGGGAACAAAAGGTACCTGTTTCTGAATCTGCGCCTCTGGACTCTCATT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTCCTCTAGAGGGCGCTTCTGATGCGGATATCGGCGTAAACTCTCTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTCCTCTAGAGGGCGCTTCTGATGCGGATATCGGCGTAAACTCTCTTTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACCTATGCGTTAAGTCTAAATGAGAATTTTGAGCTTAAAATAAAAACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACCTATGCGTTAAGTCTAAATGAGAATTTTGAGCTTAAAATAAAAACAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AAAAGATAAAAGTATATTGCCTGAATTAGTTCTTCGGAAGTTATTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AAAAGATAAAAGTATATTGCCTGAATTAGTTCTTCGGAAGTTATTGGACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GAGAGCAAACGCCAAAACTCAATTTATTGCTGATGGTAATCGATGGCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GAGAGCAAACGCCAAAACTCAATTTATTGCTGATGGTAATCGATGGCGGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AAACCAGAACTAACAGGGTCTGTCCAGATTCAAATAACCGTCCTGGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AAACCAGAACTAACAGGGTCTGTCCAGATTCAAATAACCGTCCTGGATGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GAATGACAATGGTCCGGCGTTTGATAAGCCCAGCTATAAAGTAGTGTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GAATGACAATGGTCCGGCGTTTGATAAGCCCAGCTATAAAGTAGTGTTGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CTGAAAATGTCCAAAACGACACAAGAGTGATCCAACTAAATGCTTCCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CTGAAAATGTCCAAAACGACACAAGAGTGATCCAACTAAATGCTTCCGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CCAGACGAAGGACTTAATGGAGAAATTTCCTATGGGATCAAAATGATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CCAGACGAAGGACTTAATGGAGAAATTTCCTATGGGATCAAAATGATTTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCCAGTGAGTGAGAAATGTATGTTTTCAATAAATCCAGACACAGGTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCCAGTGAGTGAGAAATGTATGTTTTCAATAAATCCAGACACAGGTGAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TTAGAATTTATGGTGAACTGGATTTTGAAGAGAATAATGCCTATGAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TTAGAATTTATGGTGAACTGGATTTTGAAGAGAATAATGCCTATGAAATT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CAGGTTAACGCCATTGATAAAGGGATTCCTTCCATGGCAGGTCACAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CAGGTTAACGCCATTGATAAAGGGATTCCTTCCATGGCAGGTCACAGCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGTCCTGGTGGAAGTTCTGGACGTGAATGACAATGTCCCTGAAGTAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGTCCTGGTGGAAGTTCTGGACGTGAATGACAATGTCCCTGAAGTAATGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TTACTTCACTGTCGCTCCCTGTGCAAGAGGATGCTCAGGTGGGTACCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TTACTTCACTGTCGCTCCCTGTGCAAGAGGATGCTCAGGTGGGTACCGTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 ATTGCCCTGATTAGCGTGTCGGATCGTGACTCTGGAGCCAATGGACAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 ATTGCCCTGATTAGCGTGTCGGATCGTGACTCTGGAGCCAATGGACAGGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CATCTGCTCACTGACACCTCATGTTCCCTTCAAGCTGGTGTCCACCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CATCTGCTCACTGACACCTCATGTTCCCTTCAAGCTGGTGTCCACCTACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 AGAATTACTACTCGTTGGTGCTGGACAGCGCCCTGGACCGCGAGAGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 AGAATTACTACTCGTTGGTGCTGGACAGCGCCCTGGACCGCGAGAGCGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 TCGGCCTATGAGCTGGTGGTGACTGCGCGGGATGGGGGCTCGCCTTCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 TCGGCCTATGAGCTGGTGGTGACTGCGCGGGATGGGGGCTCGCCTTCGCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GTGGGCCACGGCTAGAGTGTCCGTGGAGGTGGCCGACGTGAACGACAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GTGGGCCACGGCTAGAGTGTCCGTGGAGGTGGCCGACGTGAACGACAATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 CGCCTGCGTTCGCGCAGCCCGAGTACACAGTGTTCGTGAAGGAGAACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 CGCCTGCGTTCGCGCAGCCCGAGTACACAGTGTTCGTGAAGGAGAACAAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CCGCCGGGCTGCCACATCTTCACGGTGTCGGCATGGGACGCGGACGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CCGCCGGGCTGCCACATCTTCACGGTGTCGGCATGGGACGCGGACGCGCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GAAGAACGCGCTGGTGTCCTACTCGCTGGTGGAGCGGCGGGTGGGCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 GAAGAACGCGCTGGTGTCCTACTCGCTGGTGGAGCGGCGGGTGGGCGAGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 ACGCACTGTCGAGCTACGTGTCGGTGCACGCGGAGAGCGGCAAGGTGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 ACGCACTGTCGAGCTACGTGTCGGTGCACGCGGAGAGCGGCAAGGTGTAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 GCGCTGCAGCCGCTAGACCACGAGGAGCTGGAGCTGCTGCAGTTCCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 GCGCTGCAGCCGCTAGACCACGAGGAGCTGGAGCTGCTGCAGTTCCAGGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 GAGCGCGCGCGACGCCGGCGTGCCGCCTCTGGGCAGCAACGTGACGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 GAGCGCGCGCGACGCCGGCGTGCCGCCTCTGGGCAGCAACGTGACGCTGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 AGGTGTTCGTGCTGGACGAGAACGACAACGCGCCGGCACTGCTGGCGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 AGGTGTTCGTGCTGGACGAGAACGACAACGCGCCGGCACTGCTGGCGACT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 CCGGCTGGCAGCGCAGGAGGCGCAGTTAGCGAGTTGGTACCGCGGTCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 CCGGCTGGCAGCGCAGGAGGCGCAGTTAGCGAGTTGGTACCGCGGTCGGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 GGGTGCGGGCCACGTGGTGGCGAAAGTGCGCGCGGTGGACGCTGACTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 GGGTGCGGGCCACGTGGTGGCGAAAGTGCGCGCGGTGGACGCTGACTCCG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 GCTATAACGCTTGGCTGTCCTACGAGTTGCAACCGGCGGCGGTCGGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 GCTATAACGCTTGGCTGTCCTACGAGTTGCAACCGGCGGCGGTCGGCGCG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 CACATCCCGTTCCACGTGGGGCTGTACACTGGCGAGATCAGCACGACACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 CACATCCCGTTCCACGTGGGGCTGTACACTGGCGAGATCAGCACGACACG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 CATCCTGGATGAGGCGGACGCTCCGCGCCACCGCCTGCTGGTGCTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 CATCCTGGATGAGGCGGACGCTCCGCGCCACCGCCTGCTGGTGCTGGTGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 AGGACCACGGTGAGCCCGCGCTGACGTCCACGGCCACGGTGCTGGTGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 AGGACCACGGTGAGCCCGCGCTGACGTCCACGGCCACGGTGCTGGTGTCG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2101 CTGGTGGAGAACGGCCAGGCCCCAAAGACGTCGTCGCGGGCCTCAGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 CTGGTGGAGAACGGCCAGGCCCCAAAGACGTCGTCGCGGGCCTCAGTGGG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2151 CGCTGTGGATCCCGAAGCGGCTCTGGTGGATATTAACGTGTACCTCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102151 CGCTGTGGATCCCGAAGCGGCTCTGGTGGATATTAACGTGTACCTCATCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2201 TCGCCATCTGTGCGGTGTCCAGCCTGCTGGTGCTCACGCTGCTGCTGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102201 TCGCCATCTGTGCGGTGTCCAGCCTGCTGGTGCTCACGCTGCTGCTGTAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2251 ACTGCGCTGCGTTGCTCAGCGCCGCCCACCGTGAGCCGGTGCGCGCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102251 ACTGCGCTGCGTTGCTCAGCGCCGCCCACCGTGAGCCGGTGCGCGCCGGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2301 CAAGCCCACGCTGGTGTGCTCCAGCGCCGTGGGGAGTTGGTCTTACTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102301 CAAGCCCACGCTGGTGTGCTCCAGCGCCGTGGGGAGTTGGTCTTACTCGC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2351 AGCAGAGGAGGCAGAGGGTGTGCTCTGCAGAGAGCCCGCCCAAGACGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102351 AGCAGAGGAGGCAGAGGGTGTGCTCTGCAGAGAGCCCGCCCAAGACGGAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2401 CTCATGGCCTTCAGCCCAAGCCTTCAGCTGTCTCGAGAAGATTGTTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102401 CTCATGGCCTTCAGCCCAAGCCTTCAGCTGTCTCGAGAAGATTGTTTAAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2451 TCCTCCCAGTGAA         CCACGACAGCCCAACCCTGACTGGCGTT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 102451 TCCTCCCAGTGAAGTA...CAGCCACGACAGCCCAACCCTGACTGGCGTT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2492 ACTCTGCCTCCCTGAGAGCAGGCATGCACAG         CTCTGTGCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 203601 ACTCTGCCTCCCTGAGAGCAGGCATGCACAGGTA...CAGCTCTGTGCAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2533 CTAGAGGAGGCTGGCATTCTACGGGCTGGTCCAGGAGGGCCTGATCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207109 CTAGAGGAGGCTGGCATTCTACGGGCTGGTCCAGGAGGGCCTGATCAGCA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2583 GTGGCCAACAGTATCCAGTGCAACACCAG         AACCAGAGGCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 207159 GTGGCCAACAGTATCCAGTGCAACACCAGGTA...CAGAACCAGAGGCAG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2624 GAGAAGTGTCCCCTCCAGTCGGTGCGGGTGTCAACAGCAACAGCTGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234263 GAGAAGTGTCCCCTCCAGTCGGTGCGGGTGTCAACAGCAACAGCTGGACC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2674 TTTAAATACGGACCAGGCAACCCCAAACAATCCGGTCCCGGTGAGTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234313 TTTAAATACGGACCAGGCAACCCCAAACAATCCGGTCCCGGTGAGTTGCC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2724 CGACAAATTCATTATCCCAGGATCTCCTGCAATCATCTCCATCCGGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234363 CGACAAATTCATTATCCCAGGATCTCCTGCAATCATCTCCATCCGGCAGG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2774 AGCCTACTAACAGCCAAATTGACAAAAGTGACTTCATAACCTTCGGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234413 AGCCTACTAACAGCCAAATTGACAAAAGTGACTTCATAACCTTCGGCAAA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2824 AAGGAGGAGACCAAGAAAAAGAAGAAAAAGAAGAAGGGTAACAAGACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234463 AAGGAGGAGACCAAGAAAAAGAAGAAAAAGAAGAAGGGTAACAAGACCCA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2874 GGAGAAAAAAGAGAAAGGGAACAGCACGACTGACAACAGTGACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234513 GGAGAAAAAAGAGAAAGGGAACAGCACGACTGACAACAGTGACCAG

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