Result of FASTA (omim) for pF1KB4076
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4076, 573 aa
  1>>>pF1KB4076 573 - 573 aa - 573 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8241+/-0.000849; mu= 13.7198+/- 0.052
 mean_var=315.5068+/-64.727, 0's: 0 Z-trim(111.1): 2098  B-trim: 99 in 1/52
 Lambda= 0.072205
 statistics sampled from 17259 (19599) to 17259 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.55), E-opt: 0.2 (0.23), width:  16
 Scan time:  9.690

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_056209 (OMIM: 194538) zinc finger protein 10 [H ( 573) 4039 436.1 1.5e-121
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1813 204.3   1e-51
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1808 203.8 1.5e-51
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1808 203.8 1.5e-51
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1701 192.6 3.2e-48
NP_001159353 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 947) 1630 185.5 6.7e-46
NP_003406 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 i ( 947) 1630 185.5 6.7e-46
NP_008887 (OMIM: 194536) zinc finger protein 12 is ( 659) 1624 184.6 8.6e-46
NP_001159354 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 864) 1621 184.5 1.2e-45
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1591 181.1 9.1e-45
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1591 181.2 9.4e-45
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1591 181.2 9.4e-45
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1591 181.2 9.4e-45
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1591 181.2 9.5e-45
NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 625) 1580 180.0   2e-44
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1563 178.2 6.8e-44
NP_001284552 (OMIM: 608640) zinc finger protein 46 ( 540) 1544 176.1 2.5e-43
NP_001278562 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 665) 1538 175.7 4.3e-43
NP_001265438 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 665) 1538 175.7 4.3e-43
NP_001265437 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 667) 1538 175.7 4.3e-43
NP_001275688 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 691) 1538 175.7 4.4e-43
NP_037388 (OMIM: 606740) zinc finger protein 180 i ( 692) 1538 175.7 4.4e-43
XP_011525582 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 734) 1538 175.7 4.5e-43
NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 73 ( 536) 1534 175.1 5.2e-43
XP_016882744 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1526 173.9 7.4e-43
NP_001275690 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 349) 1526 173.9 7.4e-43
XP_016882740 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1526 173.9 7.4e-43
XP_016882745 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1526 173.9 7.4e-43
XP_016882742 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1526 173.9 7.4e-43
NP_001275689 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 349) 1526 173.9 7.4e-43
XP_016882739 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1526 173.9 7.4e-43
XP_016882741 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1526 173.9 7.4e-43
XP_016882743 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1526 173.9 7.4e-43
NP_001275691 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 349) 1526 173.9 7.4e-43
XP_005259333 (OMIM: 613905) PREDICTED: zinc finger ( 792) 1517 173.6 2.1e-42
NP_079303 (OMIM: 613905) zinc finger protein 606 [ ( 792) 1517 173.6 2.1e-42
XP_006723247 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger ( 566) 1502 171.8 5.3e-42
XP_016882229 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger ( 585) 1502 171.8 5.4e-42
XP_016870103 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1506 172.7 5.5e-42
XP_011543981 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1506 172.7 5.5e-42
NP_149350 (OMIM: 616290) zinc finger protein 658 [ (1059) 1506 172.7 5.5e-42
NP_001304845 (OMIM: 616290) zinc finger protein 65 (1059) 1506 172.7 5.5e-42
XP_005272572 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1506 172.7 5.5e-42
XP_005258908 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger ( 567) 1490 170.5 1.3e-41
XP_016881868 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1467 168.1 6.5e-41
NP_001317411 (OMIM: 613904) zinc finger protein 56 ( 527) 1467 168.1 6.5e-41
XP_016881869 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1467 168.1 6.5e-41
XP_016881871 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1467 168.1 6.5e-41
XP_016881867 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 650) 1467 168.2 7.2e-41
XP_016881866 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1467 168.3 7.4e-41


>>NP_056209 (OMIM: 194538) zinc finger protein 10 [Homo   (573 aa)
 initn: 4039 init1: 4039 opt: 4039  Z-score: 2303.2  bits: 436.1 E(85289): 1.5e-121
Smith-Waterman score: 4039; 100.0% identity (100.0% similar) in 573 aa overlap (1-573:1-573)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MDAKSLTAWSRTLVTFKDVFVDFTREEWKLLDTAQQIVYRNVMLENYKNLVSLGYQLTKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 MDAKSLTAWSRTLVTFKDVFVDFTREEWKLLDTAQQIVYRNVMLENYKNLVSLGYQLTKP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 DVILRLEKGEEPWLVEREIHQETHPDSETAFEIKSSVSSRSIFKDKQSCDIKMEGMARND
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 DVILRLEKGEEPWLVEREIHQETHPDSETAFEIKSSVSSRSIFKDKQSCDIKMEGMARND
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 LWYLSLEEVWKCRDQLDKYQENPERHLRQVAFTQKKVLTQERVSESGKYGGNCLLPAQLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LWYLSLEEVWKCRDQLDKYQENPERHLRQVAFTQKKVLTQERVSESGKYGGNCLLPAQLV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 LREYFHKRDSHTKSLKHDLVLNGHQDSCASNSNECGQTFCQNIHLIQFARTHTGDKSYKC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LREYFHKRDSHTKSLKHDLVLNGHQDSCASNSNECGQTFCQNIHLIQFARTHTGDKSYKC
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 PDNDNSLTHGSSLGISKGIHREKPYECKECGKFFSWRSNLTRHQLIHTGEKPYECKECGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 PDNDNSLTHGSSLGISKGIHREKPYECKECGKFFSWRSNLTRHQLIHTGEKPYECKECGK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 SFSRSSHLIGHQKTHTGEEPYECKECGKSFSWFSHLVTHQRTHTGDKLYTCNQCGKSFVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 SFSRSSHLIGHQKTHTGEEPYECKECGKSFSWFSHLVTHQRTHTGDKLYTCNQCGKSFVH
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 SSRLIRHQRTHTGEKPYECPECGKSFRQSTHLILHQRTHVRVRPYECNECGKSYSQRSHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 SSRLIRHQRTHTGEKPYECPECGKSFRQSTHLILHQRTHVRVRPYECNECGKSYSQRSHL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 VVHHRIHTGLKPFECKDCGKCFSRSSHLYSHQRTHTGEKPYECHDCGKSFSQSSALIVHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 VVHHRIHTGLKPFECKDCGKCFSRSSHLYSHQRTHTGEKPYECHDCGKSFSQSSALIVHQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 RIHTGEKPYECCQCGKAFIRKNDLIKHQRIHVGEETYKCNQCGIIFSQNSPFIVHQIAHT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 RIHTGEKPYECCQCGKAFIRKNDLIKHQRIHVGEETYKCNQCGIIFSQNSPFIVHQIAHT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570   
pF1KB4 GEQFLTCNQCGTALVNTSNLIGYQTNHIRENAY
       :::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 GEQFLTCNQCGTALVNTSNLIGYQTNHIRENAY
              550       560       570   

>>XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro  (670 aa)
 initn: 6767 init1: 1415 opt: 1813  Z-score: 1049.4  bits: 204.3 E(85289): 1e-51
Smith-Waterman score: 1817; 48.8% identity (69.8% similar) in 582 aa overlap (8-573:20-590)

                           10        20        30        40        
pF1KB4             MDAKSLTAWSRTLVTFKDVFVDFTREEWKLLDTAQQIVYRNVMLENYK
                          :  :  :::.:: : :..:::  :  ::. .::.:::....
XP_005 MELGSRRRSVGCRCRGLCLAVRREQVTFEDVVVGFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDTFR
               10        20        30        40        50        60

       50        60        70        80        90       100        
pF1KB4 NLVSLGYQLTKPDVILRLEKGEEPWLVEREIHQETHPDSETAFEIKSSVSSRSIFKDKQS
        :::.:. : ::.::  ::.  : : :: .. : ..:: ::  ..: :: ...: .. ..
XP_005 LLVSVGHWLPKPNVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEISN
               70        80        90       100       110       120

      110       120            130       140       150       160   
pF1KB4 CDIKMEGMARNDLWYLSLEEV-----WKCRDQLDKYQENPERHLRQVAFTQKKVLTQERV
         : .: .  . :::   :..     :.:        :. :     ::::  :. . :. 
XP_005 SVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSC--------ESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQW
              130       140               150       160       170  

           170       180       190             200       210       
pF1KB4 SESGKYGGNCLLPAQLVLREYFHKRDS-HT-----KSLKHDLVLNGHQDSCASNS----N
       ...: .: :  :  .:  . .  .:.: ::     :  : ::  :  : .:....    .
XP_005 QRNG-FGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDL--NVLQKTCVKEKPYKCQ
             180       190       200       210         220         

           220       230       240       250       260        270  
pF1KB4 ECGQTFCQNIHLIQFARTHTGDKSYKCPDNDNSLTHGSSLGISKGIHR-EKPYECKECGK
       :::..: ..  ::.  :::::.. :.: .  ... ..:.:   . ::  ::::.: .::.
XP_005 ECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGR
     230       240       250       260       270       280         

            280       290       300       310       320       330  
pF1KB4 FFSWRSNLTRHQLIHTGEKPYECKECGKSFSRSSHLIGHQKTHTGEEPYECKECGKSFSW
        :.  . : .::  :::::::::.:::::::  : .  :..:::::.::::.::::.:  
XP_005 TFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQ
     290       300       310       320       330       340         

            340       350       360       370       380       390  
pF1KB4 FSHLVTHQRTHTGDKLYTCNQCGKSFVHSSRLIRHQRTHTGEKPYECPECGKSFRQSTHL
         ::. : : :::.: : :..:::.: ::: : .::: ::::::::: ::::.: : : :
XP_005 SIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPL
     350       360       370       380       390       400         

            400       410       420       430       440       450  
pF1KB4 ILHQRTHVRVRPYECNECGKSYSQRSHLVVHHRIHTGLKPFECKDCGKCFSRSSHLYSHQ
       : :::::.  .::::.::::..:: . :. :.::::: ::. :..::: ::.:: : .:.
XP_005 IQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHE
     410       420       430       440       450       460         

            460       470       480       490       500       510  
pF1KB4 RTHTGEKPYECHDCGKSFSQSSALIVHQRIHTGEKPYECCQCGKAFIRKNDLIKHQRIHV
       ::::::::::: .:::.: ::. :  ::::::::::::: .::::: ....: ::::::.
XP_005 RTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHT
     470       480       490       500       510       520         

            520       530       540       550       560       570  
pF1KB4 GEETYKCNQCGIIFSQNSPFIVHQIAHTGEQFLTCNQCGTALVNTSNLIGYQTNHIRENA
       ::. :.:::::  ::: .:.: ::  ::::.   ::::: :. ..: :: .:  : .:. 
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pF1KB4 Y                                                           
       :                                                           
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>--
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       :::::: ::. :  :.::::::::: : .::::: ....: :::: :.:           
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pF1KB4 IFSQNSPFIVHQIAHTGEQFLTCNQCGTALVNTSNLIGYQTNHIRENAY

>>XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro  (658 aa)
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pF1KB4 YECNECGKSYSQRSHLVVHHRIHTGLKPFECKDCGKCFSRSSHLYSHQRTHTGEKPYECH
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pF1KB4 IFSQNSPFIVHQIAHTGEQFLTCNQCGTALVNTSNLIGYQTNHIRENAY           
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>--
 initn: 727 init1: 395 opt: 395  Z-score: 251.2  bits: 56.6 E(85289): 3e-07
Smith-Waterman score: 407; 68.4% identity (84.8% similar) in 79 aa overlap (435-513:580-658)

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pF1KB4 YECNECGKSYSQRSHLVVHHRIHTGLKPFECKDCGKCFSRSSHLYSHQRTHTGEKPYECH
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pF1KB4 DCGKSFSQSSALIVHQRIHTGEKPYECCQCGKAFIRKNDLIKHQRIHVGEETYKCNQCGI
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pF1KB4 IFSQNSPFIVHQIAHTGEQFLTCNQCGTALVNTSNLIGYQTNHIRENAY

>>NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 is  (658 aa)
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pF1KB4 DVILRLEKGEEPWLVEREIHQETHPDSETAFEIKSSVSSRSIFKDKQSCDIKMEGMARND
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pF1KB4 PAQLVLREYFHKRDS-HT-----KSLKHDLVLNGHQDSCASNS----NECGQTFCQNIHL
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NP_001 NPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPD--LNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSAL
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pF1KB4 IQFARTHTGDKSYKCPDNDNSLTHGSSLGISKGIHR-EKPYECKECGKFFSWRSNLTRHQ
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NP_001 IEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQ
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pF1KB4 YECNECGKSYSQRSHLVVHHRIHTGLKPFECKDCGKCFSRSSHLYSHQRTHTGEKPYECH
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pF1KB4 IFSQNSPFIVHQIAHTGEQFLTCNQCGTALVNTSNLIGYQTNHIRENAY           
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>--
 initn: 727 init1: 395 opt: 395  Z-score: 251.2  bits: 56.6 E(85289): 3e-07
Smith-Waterman score: 407; 68.4% identity (84.8% similar) in 79 aa overlap (435-513:580-658)

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pF1KB4 YECNECGKSYSQRSHLVVHHRIHTGLKPFECKDCGKCFSRSSHLYSHQRTHTGEKPYECH
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NP_001 YECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECH
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pF1KB4 DCGKSFSQSSALIVHQRIHTGEKPYECCQCGKAFIRKNDLIKHQRIHVGEETYKCNQCGI
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       : :: .. : ..:: ::  ..: :: ...: .. ..  : .: .  . :::   :..   
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         :.:        :. :     ::::  :. . :. ...: .: :  :  .:  . .  .
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       :.: ::     :  : :  ::  : .:....    .:::..: ..  ::.  :::::.. 
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       :.: .  ... ..:.:   . ::  ::::.: .::. :.  . : .::  :::::::::.
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       :::::::  : .  :..:::::.::::.::::.:    ::. : : :::.: : :..:::
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       .: ::: : .::: ::::::::: ::::.: : : :: :::::.  .::::.::::..::
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        . :. :.::::: ::. :..::: ::.:: : .:.::::::::::: .:::.: ::. :
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pF1KB4 IVHQRIHTGEKPYECCQCGKAFIRKNDLIKHQRIHVGEETYKCNQCGIIFSQNSPFIVHQ
         ::::::::::::: .::::: ....: ::::::.::. :.:::::  ::: .:.: ::
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NP_001 GEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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pF1KB4 IFSQNSPFIVHQIAHTGEQFLTCNQCGTALVNTSNLIGYQTNHIRENAY

>>NP_001159353 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 is  (947 aa)
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NP_001 QKQKSRRIEKVLEWLFISQEQPKITKSWGPLSFMDVFVDFTWEEWQLLDPAQKCLYRSVM
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       ::::.:::::::: ::::.:..::.:::  .:. .. ..: :.  :...: . .. ..  
NP_001 LENYSNLVSLGYQHTKPDIIFKLEQGEELCMVQAQVPNQTCPN--TVWKIDDLMDWHQEN
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       ::: .   : .:  . . :      ::: ..  ::  .           :  ..::   .
NP_001 KDKLGSTAKSFECTTFGKLCLLSTKYLSRQKPHKCGTHGKSLKYIDFTSDYARNNPNGFQ
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NP_001 SYLLVHQQTHAEEKPYGCNECGKDFSSKSYLIVHQRIHTGEKLHECSECRKTFSFHSQLV
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pF1KB4 ISKGIHR-EKPYECKECGKFFSWRSNLTRHQLIHTGEKPYECKECGKSFSRSSHLIGHQK
       : . ::  :.:::: :::: :: ...:. ::  :.:.::: :.::::.:. .:.:: :..
NP_001 IHQRIHTGENPYECCECGKVFSRKDQLVSHQKTHSGQKPYVCNECGKAFGLKSQLIIHER
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NP_001 IHTGEKPYECNECQKAFNTKSNLMVHQRTHTGEKPYVCSDCGKAFTFKSQLIVHQGIHTG
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        ::: : .:::.:  ...::.:::.:. ..:: ::::::.. ..:.:..: : ::: :  
NP_001 VKPYGCIQCGKGFSLKSQLIVHQRSHTGMKPYVCNECGKAFRSKSYLIIHTRTHTGEKLH
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NP_001 CGKAFGLKSQLIIHQRTHTGEKPFECSECQKAFNTKSNLIVHQRTHTGEKPYSCNECGKA
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pF1KB4 LVNTSNLIGYQTNHIRENAY                                        
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NP_001 FTFKSQLIVHKGVHTGVKPYGCSQCAKTFSLKSQLIVHQRSHTGVKPYGCSECGKAFRSK
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NP_001 GEKPYSCNECGKAFTFKSQLIVHKGVHTGVKPYGCSQCAKTFSLKSQLIVHQRSHTGVKP
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NP_001 YGCSECGKAFRSKSYLIIHMRTHTGEKPHECRECGKSFSFNSQLIVHQRIHTGENPYECS
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NP_001 AFIWKSLLIVHERTHAGVNPYKCSQCEKSFSGKLRLLVHQRMHTREKPYECSECGKAFIR
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       .: :::::: :.::::: : .:::.: .:. :  ::: :.::.  ::..::  :  .: .
NP_001 NSQLIVHQRTHSGEKPYGCNECGKTFSQKSILSAHQRTHTGEKPCKCTECGKAFCWKSQL
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pF1KB4 IVHQIAHTGEQFLTCNQCGTALVNTSNLIGYQTNHIRENAY
       :.:: .:. ..                              
NP_001 IMHQRTHVDDKH                             
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>>NP_003406 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 isofo  (947 aa)
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                                     ..: ::::::: :::.::: ::. .::.::
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pF1KB4 LENYKNLVSLGYQLTKPDVILRLEKGEEPWLVEREIHQETHPDSETAFEIKSSVSSRSIF
       ::::.:::::::: ::::.:..::.:::  .:. .. ..: :.  :...: . .. ..  
NP_003 LENYSNLVSLGYQHTKPDIIFKLEQGEELCMVQAQVPNQTCPN--TVWKIDDLMDWHQEN
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pF1KB4 KDKQSCDIK-MEGMARNDL-----WYLSLEEVWKCRDQ----------LDKYQENP---E
       ::: .   : .:  . . :      ::: ..  ::  .           :  ..::   .
NP_003 KDKLGSTAKSFECTTFGKLCLLSTKYLSRQKPHKCGTHGKSLKYIDFTSDYARNNPNGFQ
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pF1KB4 RHLRQVAFTQ-KKVLTQERVSESGKYGGNCLLPAQLVLREYFHKRDSH-----TKSLKHD
        : ..   .. ....   .  :: . : .    .::. ....  .         :...  
NP_003 VHGKSFFHSKHEQTVIGIKYCESIESGKTVNKKSQLMCQQMYMGEKPFGCSCCEKAFSSK
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pF1KB4 LVLNGHQDSCASNS----NECGQTFCQNIHLIQFARTHTGDKSYKCPDNDNSLTHGSSLG
         :  ::.. : ..    ::::. : .. .::   : :::.: ..: .  ....  :.: 
NP_003 SYLLVHQQTHAEEKPYGCNECGKDFSSKSYLIVHQRIHTGEKLHECSECRKTFSFHSQLV
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pF1KB4 ISKGIHR-EKPYECKECGKFFSWRSNLTRHQLIHTGEKPYECKECGKSFSRSSHLIGHQK
       : . ::  :.:::: :::: :: ...:. ::  :.:.::: :.::::.:. .:.:: :..
NP_003 IHQRIHTGENPYECCECGKVFSRKDQLVSHQKTHSGQKPYVCNECGKAFGLKSQLIIHER
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pF1KB4 THTGEEPYECKECGKSFSWFSHLVTHQRTHTGDKLYTCNQCGKSFVHSSRLIRHQRTHTG
        ::::.::::.:: :.:.  :.:..:::::::.: :.:..:::.:. .:.:: ::  :::
NP_003 IHTGEKPYECNECQKAFNTKSNLMVHQRTHTGEKPYVCSDCGKAFTFKSQLIVHQGIHTG
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pF1KB4 EKPYECPECGKSFRQSTHLILHQRTHVRVRPYECNECGKSYSQRSHLVVHHRIHTGLKPF
        ::: : .:::.:  ...::.:::.:. ..:: ::::::.. ..:.:..: : ::: :  
NP_003 VKPYGCIQCGKGFSLKSQLIVHQRSHTGMKPYVCNECGKAFRSKSYLIIHTRTHTGEKLH
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pF1KB4 ECKDCGKCFSRSSHLYSHQRTHTGEKPYECHDCGKSFSQSSALIVHQRIHTGEKPYECCQ
       ::..::: :: .:.:  ::: ::::.:::::.:::.::..  :: ::: :.::::::: .
NP_003 ECNNCGKAFSFKSQLIIHQRIHTGENPYECHECGKAFSRKYQLISHQRTHAGEKPYECTD
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pF1KB4 CGKAFIRKNDLIKHQRIHVGEETYKCNQCGIIFSQNSPFIVHQIAHTGEQFLTCNQCGTA
       :::::  :..:: ::: :.::. ..:..:   :. .: .:::: .::::.  .::.:: :
NP_003 CGKAFGLKSQLIIHQRTHTGEKPFECSECQKAFNTKSNLIVHQRTHTGEKPYSCNECGKA
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pF1KB4 LVNTSNLIGYQTNHIRENAY                                        
       ..  :.:: ..  :                                              
NP_003 FTFKSQLIVHKGVHTGVKPYGCSQCAKTFSLKSQLIVHQRSHTGVKPYGCSECGKAFRSK
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>--
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Smith-Waterman score: 1184; 55.2% identity (80.1% similar) in 281 aa overlap (263-543:666-946)

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pF1KB4 TGDKSYKCPDNDNSLTHGSSLGISKGIHREKPYECKECGKFFSWRSNLTRHQLIHTGEKP
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NP_003 GEKPYSCNECGKAFTFKSQLIVHKGVHTGVKPYGCSQCAKTFSLKSQLIVHQRSHTGVKP
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pF1KB4 YECKECGKSFSRSSHLIGHQKTHTGEEPYECKECGKSFSWFSHLVTHQRTHTGDKLYTCN
       : :.::::.:  .:.:: :..:::::.:.::.:::::::. :.:..::: :::.. : :.
NP_003 YGCSECGKAFRSKSYLIIHMRTHTGEKPHECRECGKSFSFNSQLIVHQRIHTGENPYECS
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pF1KB4 QCGKSFVHSSRLIRHQRTHTGEKPYECPECGKSFRQSTHLILHQRTHVRVRPYECNECGK
       .:::.: ....:: :::::.::::: : ::::.: ....::.:.:::   .:::::::::
NP_003 ECGKAFNRKDQLISHQRTHAGEKPYGCSECGKAFSSKSYLIIHMRTHSGEKPYECNECGK
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pF1KB4 SYSQRSHLVVHHRIHTGLKPFECKDCGKCFSRSSHLYSHQRTHTGEKPYECHDCGKSFSQ
       ..  .: :.::.: :.:..:..:..: : :: . .:  ::: :: :::::: .:::.: .
NP_003 AFIWKSLLIVHERTHAGVNPYKCSQCEKSFSGKLRLLVHQRMHTREKPYECSECGKAFIR
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pF1KB4 SSALIVHQRIHTGEKPYECCQCGKAFIRKNDLIKHQRIHVGEETYKCNQCGIIFSQNSPF
       .: :::::: :.::::: : .:::.: .:. :  ::: :.::.  ::..::  :  .: .
NP_003 NSQLIVHQRTHSGEKPYGCNECGKTFSQKSILSAHQRTHTGEKPCKCTECGKAFCWKSQL
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pF1KB4 IVHQIAHTGEQFLTCNQCGTALVNTSNLIGYQTNHIRENAY
       :.:: .:. ..                              
NP_003 IMHQRTHVDDKH                             
         940                                    

>>NP_008887 (OMIM: 194536) zinc finger protein 12 isofor  (659 aa)
 initn: 1467 init1: 1467 opt: 1624  Z-score: 943.1  bits: 184.6 E(85289): 8.6e-46
Smith-Waterman score: 1682; 43.9% identity (67.6% similar) in 590 aa overlap (14-573:8-595)

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pF1KB4 MDAKSLTAWSRTLVTFKDVFVDFTREEWKLLDTAQQIVYRNVMLENYKNLVSLGYQLTKP
                    :.:::: ::::.:::. ::  :.:.::.::::::.::::.::.. ::
NP_008       MNKSLGPVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPEQKITYRDVMLENYSNLVSVGYHIIKP
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pF1KB4 DVILRLEKGEEPWLVEREIHQETHPDS--------ETAFEIKSSVSSRSIF-------KD
       ::: .::.:::::.:: :.  ...::         :   : ... : ...:       ..
NP_008 DVISKLEQGEEPWIVEGEFLLQSYPDEVWQTDDLIERIQEEENKPSRQTVFIETLIEERE
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pF1KB4 KQSCDIKMEGMARND-------LWYLSLEEVWKCRDQLDKYQENPERH-LRQVAFTQK-K
         : : ..  :  ..       : ...::.. .  ::  ....: : . : . .. :: .
NP_008 YISSDGSYARMKADECSGCGKSLLHIKLEKT-HPGDQAYEFNQNGEPYTLNEESLYQKIR
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pF1KB4 VLTQ--ERVSESGKYGGNCLLPAQLVLREYFHKRDSHTKSLKH-DLVLN--GHQDSCASN
       .: .  : .  .  .  . ..  ..  . : .   :.   :.  ::...  .:..    .
NP_008 ILEKPFEYIECQKAFQKDTVFVNHMEEKPY-KWNGSEIAFLQMSDLTVHQTSHMEMKPYE
           180       190       200        210       220       230  

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pF1KB4 SNECGQTFCQNIHLIQFARTHTGDKSYKCPDNDNSLTHGSSLGISKGIHR-EKPYECKEC
        .:::..::.. ..:   :::::.: :.: .  .:. . ..: . .  :  ::::::.::
NP_008 CSECGKSFCKKSKFIIHQRTHTGEKPYECNQCGKSFCQKGTLTVHQRTHTGEKPYECNEC
            240       250       260       270       280       290  

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pF1KB4 GKFFSWRSNLTRHQLIHTGEKPYECKECGKSFSRSSHLIGHQKTHTGEEPYECKECGKSF
       :: :  . .: .::  :.:::::::. ::::: ...::  ::.::.::.:: :..:::.:
NP_008 GKNFYQKLHLIQHQRTHSGEKPYECSYCGKSFCQKTHLTQHQRTHSGERPYVCHDCGKTF
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pF1KB4 SWFSHLVTHQRTHTGDKLYTCNQCGKSFVHSSRLIRHQRTHTGEKPYECPECGKSFRQST
       :  : :  ::. ::: ::: :..::: : ..: :  : ::::::::::: :::: : . .
NP_008 SQKSALNDHQKIHTGVKLYKCSECGKCFCRKSTLTTHLRTHTGEKPYECNECGKFFSRLS
            360       370       380       390       400       410  

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pF1KB4 HLILHQRTHVRVRPYECNECGKSYSQRSHLVVHHRIHTGLKPFECKDCGKCFSRSSHLYS
       .: .: :::   .:::::::::..   : :. :.:.::: ::.::..::: ::. :.:  
NP_008 YLTVHYRTHSGEKPYECNECGKTFYLNSALMRHQRVHTGEKPYECNECGKLFSQLSYLTI
            420       430       440       450       460       470  

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pF1KB4 HQRTHTGEKPYECHDCGKSFSQSSALIVHQRIHTGEKPYECCQCGKAFIRKNDLIKHQRI
       :.:::.: ::::: .:::.: :.:::  :.::: :::::::  ::: : . . :  :.::
NP_008 HHRTHSGVKPYECSECGKTFYQNSALCRHRRIHKGEKPYECYICGKFFSQMSYLTIHHRI
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pF1KB4 HVGEETYKCNQCGIIFSQNSPFIVHQIAHTGEQFLTCNQCGTALVNTSNLIGYQTNHIRE
       : ::. :.:..::  : ::: .  :: .::::.   : .::  . . : :  ..  :  :
NP_008 HSGEKPYECSECGKTFCQNSALNRHQRTHTGEKAYECYECGKCFSQMSYLTIHHRIHSGE
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pF1KB4 NAY                                                         
       . .                                                         
NP_008 KPFECNECGKAFSRMSYLTVHYRTHSGEKPYECTECGKKFYHKSAFNSHQRIHRRGNMNV
            600       610       620       630       640       650  

>>NP_001159354 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 is  (864 aa)
 initn: 9059 init1: 1399 opt: 1621  Z-score: 940.4  bits: 184.5 E(85289): 1.2e-45
Smith-Waterman score: 1648; 44.7% identity (70.7% similar) in 580 aa overlap (18-567:2-579)

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pF1KB4 MDAKSLTAWSRTLVTFKDVFVDFTREEWKLLDTAQQIVYRNVMLENYKNLVSLGYQLTKP
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        .  :: . : .    .::. ....  .         :...    :  ::.. : ..   
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       :.::. ..:..:   :. .: .:::: .::::.  .::.:: :..  :.:: ..  :   
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pF1KB4 LIHTGEKPYECKECGKSFSRSSHLIGHQKTHTGEEPYECKECGKSFSWFSHLVTHQRTHT
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       :.: : :..:::.: ::: : .::: ::::::::: ::::.: : : :: :::::.  .:
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pF1KB4 IFSQNSPFIVHQIAHTGEQFLTCNQCGTALVNTSNLIGYQTNHIRENAY




573 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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