Result of FASTA (ccds) for pF1KB3736
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3736, 451 aa
  1>>>pF1KB3736 451 - 451 aa - 451 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7605+/-0.000725; mu= 16.3984+/- 0.044
 mean_var=117.5229+/-36.710, 0's: 0 Z-trim(111.0): 242  B-trim: 1265 in 2/49
 Lambda= 0.118308
 statistics sampled from 11588 (12030) to 11588 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.711), E-opt: 0.2 (0.37), width:  16
 Scan time:  3.530

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS801.1 GPR61 gene_id:83873|Hs108|chr1           ( 451) 2993 521.9  5e-148
CCDS197.1 HTR6 gene_id:3362|Hs108|chr1             ( 440)  452 88.2 1.8e-17
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20         ( 572)  405 80.3 5.5e-15
CCDS1268.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1         ( 529)  380 76.0   1e-13
CCDS72978.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1        ( 546)  380 76.0   1e-13
CCDS58043.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1        ( 549)  380 76.0   1e-13
CCDS2838.1 GPR62 gene_id:118442|Hs108|chr3         ( 368)  348 70.4 3.5e-12
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5           ( 520)  333 68.0 2.6e-11
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5            ( 446)  331 67.6   3e-11
CCDS7376.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10          ( 478)  326 66.8 5.6e-11
CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8            ( 408)  323 66.2 7.2e-11


>>CCDS801.1 GPR61 gene_id:83873|Hs108|chr1                (451 aa)
 initn: 2993 init1: 2993 opt: 2993  Z-score: 2771.0  bits: 521.9 E(32554): 5e-148
Smith-Waterman score: 2993; 100.0% identity (100.0% similar) in 451 aa overlap (1-451:1-451)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MESSPIPQSSGNSSTLGRVPQTPGPSTASGVPEVGLRDVASESVALFFMLLLDLTAVAGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 MESSPIPQSSGNSSTLGRVPQTPGPSTASGVPEVGLRDVASESVALFFMLLLDLTAVAGN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 AAVMAVIAKTPALRKFVFVFHLCLVDLLAALTLMPLAMLSSSALFDHALFGEVACRLYLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 AAVMAVIAKTPALRKFVFVFHLCLVDLLAALTLMPLAMLSSSALFDHALFGEVACRLYLF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 LSVCFVSLAILSVSAINVERYYYVVHPMRYEVRMTLGLVASVLVGVWVKALAMASVPVLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 LSVCFVSLAILSVSAINVERYYYVVHPMRYEVRMTLGLVASVLVGVWVKALAMASVPVLG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 RVSWEEGAPSVPPGCSLQWSHSAYCQLFVVVFAVLYFLLPLLLILVVYCSMFRVARVAAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 RVSWEEGAPSVPPGCSLQWSHSAYCQLFVVVFAVLYFLLPLLLILVVYCSMFRVARVAAM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 QHGPLPTWMETPRQRSESLSSRSTMVTSSGAPQTTPHRTFGGGKAAVVLLAVGGQFLLCW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 QHGPLPTWMETPRQRSESLSSRSTMVTSSGAPQTTPHRTFGGGKAAVVLLAVGGQFLLCW
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 LPYFSFHLYVALSAQPISTGQVESVVTWIGYFCFTSNPFFYGCLNRQIRGELSKQFVCFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 LPYFSFHLYVALSAQPISTGQVESVVTWIGYFCFTSNPFFYGCLNRQIRGELSKQFVCFF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 KPAPEEELRLPSREGSIEENFLQFLQGTGCPSESWVSRPLPSPKQEPPAVDFRIPGQIAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 KPAPEEELRLPSREGSIEENFLQFLQGTGCPSESWVSRPLPSPKQEPPAVDFRIPGQIAE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450 
pF1KB3 ETSEFLEQQLTSDIIMSDSYLRPAASPRLES
       :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 ETSEFLEQQLTSDIIMSDSYLRPAASPRLES
              430       440       450 

>>CCDS197.1 HTR6 gene_id:3362|Hs108|chr1                  (440 aa)
 initn: 347 init1: 165 opt: 452  Z-score: 427.2  bits: 88.2 E(32554): 1.8e-17
Smith-Waterman score: 463; 31.7% identity (58.7% similar) in 407 aa overlap (19-411:2-379)

               10        20        30        40            50      
pF1KB3 MESSPIPQSSGNSSTLGRVPQTPGPSTASGVPEVGLRDVASES----VALFFMLLLDLTA
                         ::. ::: ::...:  :    .. .    ::  . ... :::
CCDS19                  MVPE-PGP-TANSTPAWGAGPPSAPGGSGWVAAALCVVIALTA
                                  10        20        30        40 

         60        70          80        90       100       110    
pF1KB3 VAGNAAVMAVIAKTPALRKF--VFVFHLCLVDLLAALTLMPLAMLSSSALFDHALFGEVA
        :.:. ..:.:   ::::.    :.  :   ::...:..:: :::.  ::. . ....  
CCDS19 -AANSLLIALICTQPALRNTSNFFLVSLFTSDLMVGLVVMPPAMLN--ALYGRWVLARGL
               50        60        70        80          90        

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB3 CRLYLFLSVCFVSLAILSVSAINVERYYYVVHPMRYEVRMTLGLVASVLVGVWVKALAMA
       : :.  ..:   : .::..  :...::  .. :.::..:::   . ....:.:  : :.:
CCDS19 CLLWTAFDVMCCSASILNLCLISLDRYLLILSPLRYKLRMTPLRALALVLGAWSLA-ALA
      100       110       120       130       140       150        

           180          190       200       210       220       230
pF1KB3 S-VPVLGRVSWEE---GAPSVPPGCSLQWSHSAYCQLFVVVFAVLYFLLPLLLILVVYCS
       : .:.:  ..:.:   . : ::  : :  :       ::.: . : :.::   :  .:: 
CCDS19 SFLPLL--LGWHELGHARPPVPGQCRLLASLP-----FVLVASGLTFFLPSGAICFTYCR
       160         170       180            190       200       210

              240       250       260          270       280       
pF1KB3 MFRVARVAAMQHGPLPTWMETPRQRSESLSSRSTM---VTSSGAPQTTPHRTFGGGKAAV
       .. .::  :.: . : : : .  : ::.:.   :    : :. . . . ...  . ::..
CCDS19 ILLAARKQAVQVASLTTGMAS--QASETLQVPRTPRPGVESADSRRLATKHSRKALKASL
              220       230         240       250       260        

       290       300       310       320       330       340       
pF1KB3 VLLAVGGQFLLCWLPYFSFHLYVALSAQPISTGQVESVVTWIGYFCFTSNPFFYGCLNRQ
       .:  . :.:.. :::.:  ..  :.  . :: :  . :.::.::   : ::..:  . :.
CCDS19 TLGILLGMFFVTWLPFFVANIVQAVC-DCISPGLFD-VLTWLGYCNSTMNPIIYPLFMRD
      270       280       290        300        310       320      

       350       360       370        380       390       400      
pF1KB3 IRGELSKQFVCFFKPAPEEELRLPS-REGSIEENFLQFLQGTGCPSESWVSRPLPSPKQE
       ..  :..     : : :    : :  :..:.    :.  ..   :. : ... :: :   
CCDS19 FKRALGR-----FLPCP----RCPRERQASLASPSLRTSHSGPRPGLS-LQQVLPLPL--
        330                340       350       360        370      

        410       420       430       440       450                
pF1KB3 PPAVDFRIPGQIAEETSEFLEQQLTSDIIMSDSYLRPAASPRLES               
       ::  :                                                       
CCDS19 PPDSDSDSDAGSGGSSGLRLTAQLLLPGEATQDPPLPTRAAAAVNFFNIDPAEPELRPHP
          380       390       400       410       420       430    

>>CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20              (572 aa)
 initn: 419 init1: 173 opt: 405  Z-score: 382.5  bits: 80.3 E(32554): 5.5e-15
Smith-Waterman score: 420; 26.2% identity (55.7% similar) in 465 aa overlap (12-446:65-515)

                                  10        20         30        40
pF1KB3                    MESSPIPQSSGNSSTLGRVPQTPGPS-TASGVPEVGLRDVA
                                     : :. :. : . : .  ..:.  ::   :.
CCDS13 AAPSEGPAVGGVPGGAGGGGGVVGAGSGEDNRSSAGE-PGSAGAGGDVNGTAAVGGLVVS
           40        50        60        70         80        90   

                50        60        70          80        90       
pF1KB3 SESVAL-FFMLLLDLTAVAGNAAVMAVIAKTPALRKFV--FVFHLCLVDLLAALTLMPLA
       ...:..  :.  . : :::::  :.  .: .  :.  .  :. .: ..::: . :..:..
CCDS13 AQGVGVGVFLAAFILMAVAGNLLVILSVACNRHLQTVTNYFIVNLAVADLLLSATVLPFS
           100       110       120       130       140       150   

       100       110       120       130       140       150       
pF1KB3 MLSSSALFDHALFGEVACRLYLFLSVCFVSLAILSVSAINVERYYYVVHPMRYEVRMTLG
         ..  ..    ::.. : ..  ..:   . .:::. .:.:.::  : : ..: . ::  
CCDS13 --ATMEVLGFWAFGRAFCDVWAAVDVLCCTASILSLCTISVDRYVGVRHSLKYPAIMTER
             160       170       180       190       200       210 

       160       170       180       190       200       210       
pF1KB3 LVASVLVGVWVKALAMASVPVLGRVSWEEGAPSVPPGCSLQWSHSAYCQLFVVVFAVLYF
        .:..:. .:: ::...  :.::   :.: .:     :..  .. :    ..:  .:  :
CCDS13 KAAAILALLWVVALVVSVGPLLG---WKEPVPPDERFCGI--TEEAG---YAVFSSVCSF
             220       230          240         250          260   

       220       230       240       250           260       270   
pF1KB3 LLPLLLILVVYCSMFRVARVAAMQHGPLPTWMETPRQR-SE---SLSSRSTMVTSSGAP-
        ::. .:.:.:: .. ::: .. .   : . ..  : . ::    .  :.. . ..::  
CCDS13 YLPMAVIVVMYCRVYVVARSTTRS---LEAGVKRERGKASEVVLRIHCRGAATGADGAHG
           270       280          290       300       310       320

             280                   290       300       310         
pF1KB3 -QTTPHRTFGGG------------KAAVVLLAVGGQFLLCWLPYFSFHLYVALSAQPIST
        ...  .:: ..            ::: .:  : : :.:::.:.:      .:  :   .
CCDS13 MRSAKGHTFRSSLSVRLLKFSREKKAAKTLAIVVGVFVLCWFPFFFVLPLGSLFPQLKPS
              330       340       350       360       370       380

     320       330       340       350       360         370       
pF1KB3 GQVESVVTWIGYFCFTSNPFFYGCLNRQIRGELSKQFVCFFKPAPEEE--LRLPSREGSI
         : .:. :.:::    ::..: : .:...  . . . :  .   ...   :. ...   
CCDS13 EGVFKVIFWLGYFNSCVNPLIYPCSSREFKRAFLRLLRCQCRRRRRRRPLWRVYGHHWRA
              390       400       410       420       430       440

       380           390       400       410         420       430 
pF1KB3 EENFLQF----LQGTGCPSESWVSRPLPSPKQEPPAV-DFRIP-GQIAEETSEFLEQQLT
         . :.      .: . :.   .   ::.:  :::.. ... : ..  .  : : : .: 
CCDS13 STSGLRQDCAPSSGDAPPGAPLALTALPDPDPEPPGTPEMQAPVASRRKPPSAFREWRLL
              450       460       470       480       490       500

             440       450                                         
pF1KB3 SDIIMSDSYLRPAASPRLES                                        
       . .    . ::  .:                                             
CCDS13 GPFRRPTTQLRAKVSSLSHKIRAGGAQRAEAACAQRSEVEAVSLGVPHEVAEGATCQAYE
              510       520       530       540       550       560

>>CCDS1268.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1              (529 aa)
 initn: 345 init1: 134 opt: 380  Z-score: 359.8  bits: 76.0 E(32554): 1e-13
Smith-Waterman score: 380; 27.1% identity (58.7% similar) in 317 aa overlap (49-359:34-340)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KB3 VPQTPGPSTASGVPEVGLRDVASESVALFFMLLLDLTAVAGNAAVMAVIAKTPALRKFV-
                                     .... . .  :: ...... :   :  .  
CCDS12 NSSLSCRKELSNLTEEEGGEGGVIITQFIAIIVITIFVCLGNLVIVVTLYKKSYLLTLSN
            10        20        30        40        50        60   

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>>CCDS72978.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1             (546 aa)
 initn: 345 init1: 134 opt: 380  Z-score: 359.7  bits: 76.0 E(32554): 1e-13
Smith-Waterman score: 380; 27.1% identity (58.7% similar) in 317 aa overlap (49-359:51-357)

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>>CCDS58043.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1             (549 aa)
 initn: 345 init1: 134 opt: 380  Z-score: 359.6  bits: 76.0 E(32554): 1e-13
Smith-Waterman score: 380; 27.1% identity (58.7% similar) in 317 aa overlap (49-359:54-360)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KB3 VPQTPGPSTASGVPEVGLRDVASESVALFFMLLLDLTAVAGNAAVMAVIAKTPALRKFV-
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CCDS58 NSSLSCRKELSNLTEEEGGEGGVIITQFIAIIVITIFVCLGNLVIVVTLYKKSYLLTLSN
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CCDS58 KFVFSLTLSNFLLSVLVLPFVVTSS--IRREWIFGVVWCNFSALLYLLISSASMLTLGVI
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CCDS58 WGKSSVSPSLETWATWLSFASAVCHPLIYGLWNKTVRKELLG--MCFGDRYYREPFVQRQ
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>>CCDS2838.1 GPR62 gene_id:118442|Hs108|chr3              (368 aa)
 initn: 565 init1: 156 opt: 348  Z-score: 332.3  bits: 70.4 E(32554): 3.5e-12
Smith-Waterman score: 563; 33.6% identity (61.2% similar) in 387 aa overlap (43-423:15-366)

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pF1KB3 SSTLGRVPQTPGPSTASGVPEVGLRDVASESVALFFMLLLDLTAVAGNAAVMAVIAKTPA
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CCDS28                 MANSTGLNASEVAGSLGLILAAVVEVGALLGNGALLVVVLRTPG
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pF1KB3 LRKFVFVFHLCLVDLLAALTLMPLAMLSSSAL-FDHALFGEVACRLYLFLSVCFVSLAIL
       ::  ... :::.:::::: ..:::..:..    . .. .: . ::   :::. ..    :
CCDS28 LRDALYLAHLCVVDLLAAASIMPLGLLAAPPPGLGRVRLGPAPCRAARFLSAALLPACTL
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pF1KB3 SVSAINVERYYYVVHPMRYEVRMTLGLVASVLVGVWVKALAMASVPVLGRVSWEEGAPSV
       .:.:... ::  .:::.:   :    ::   :..::. :  .... .::      . : .
CCDS28 GVAALGLARYRLIVHPLRPGSRPPPVLV---LTAVWAAAGLLGALSLLGT---PPAPPPA
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pF1KB3 PPGCSLQWSHSAYCQLFVVVFAVLYFLLPLLLILVVYCSMFRVARVAAMQHGPLPTWMET
       :  ::.    ..    :  ..:.: : :: ::.: .: ..: ::: ::..  : :.  . 
CCDS28 PARCSVL---AGGLGPFRPLWALLAFALPALLLLGAYGGIFVVARRAALRP-PRPA--RG
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pF1KB3 PRQRSESLSSRSTMVTSSGAPQTTPHRTFGGGKAAVV-LLAVGGQFLLCWLPYFSFHLYV
        : .:.::.:: ...     :   :.  . :::::..  :::: ::  :::::       
CCDS28 SRLHSDSLDSRLSIL-----PPLRPR--LPGGKAALAPALAVG-QFAACWLPY-----GC
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pF1KB3 ALSAQPISTGQVESVVTWIGYFCFTSNPFFYGCLNRQIR---GELSKQFVCFFKPAPEEE
       :  :    ....:..:::..:  :...::.:: :.: .:   :.::.. .    :.:   
CCDS28 ACLAPAARAAEAEAAVTWVAYSAFAAHPFLYGLLQRPVRLALGRLSRRAL----PGP---
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pF1KB3 LRLPSREGSIEENFLQFLQGTGCPSESWVSRPLPSPKQEPPAVDFRIPG-QIAEETSEFL
       .:  . ..   . .:: ::    : :. .  :  .:.: :  .  : :. :   :.:   
CCDS28 VRACTPQAWHPRALLQCLQR---PPEGPAVGPSEAPEQTPELAGGRSPAYQGPPESSLS 
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pF1KB3 EQQLTSDIIMSDSYLRPAASPRLES

>>CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5                (520 aa)
 initn: 282 init1: 150 opt: 333  Z-score: 316.6  bits: 68.0 E(32554): 2.6e-11
Smith-Waterman score: 395; 25.5% identity (57.7% similar) in 385 aa overlap (24-387:27-394)

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pF1KB3    MESSPIPQSSGNSSTLGRVPQTPGP---STASGVPEVGLRDVASESVALFFMLLLDL
                                 ::   :. : .:.. .  . : ...:  ..:.  
CCDS43 MNPDLDTGHNTSAPAHWGELKNANFTGPNQTSSNSTLPQLDITRAISVGLVLGAFILF--
               10        20        30        40        50          

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pF1KB3 TAVAGNAAVMAVIAKTPALRKFV--FVFHLCLVDLLAALTLMPLAMLSSSALFDHALFGE
        :..::  :.  .: .  ::  .  :. .: ..::: ..:..:..  ..  .. . ..:.
CCDS43 -AIVGNILVILSVACNRHLRTPTNYFIVNLAMADLLLSFTVLPFS--AALEVLGYWVLGR
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pF1KB3 VACRLYLFLSVCFVSLAILSVSAINVERYYYVVHPMRYEVRMTLGLVASVLVGVWVKALA
       . : ..  ..:   . .:::. ::...::  : . ..: . .:   .  .:..::: . .
CCDS43 IFCDIWAAVDVLCCTASILSLCAISIDRYIGVRYSLQYPTLVTRRKAILALLSVWVLSTV
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pF1KB3 MASVPVLGRVSWEEGAPSVPPGCSLQWSHSAYCQLFVVVFAVL-YFLLPLLLILVVYCSM
       ..  :.::   :.: ::.    :..        . : ..:. :  : .:: .:::.:: .
CCDS43 ISIGPLLG---WKEPAPNDDKECGVTE------EPFYALFSSLGSFYIPLAVILVMYCRV
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pF1KB3 FRVAR--VAAMQHGPLPTWMETPRQRSESLSSRS---TMVTSSGAPQTTPHRTFG-----
       . ::.  .  .. : .   : . .. .  . :..     ..:. :   .:. ...     
CCDS43 YIVAKRTTKNLEAGVMKE-MSNSKELTLRIHSKNFHEDTLSSTKAKGHNPRSSIAVKLFK
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pF1KB3 ---GGKAAVVLLAVGGQFLLCWLPYF-SFHLYVALSA-QPISTGQVESVVTWIGYFCFTS
            ::: .:  : :.:.:::::.: .. :   .:. .:     : .:: :.:::    
CCDS43 FSREKKAAKTLGIVVGMFILCWLPFFIALPLGSLFSTLKP--PDAVFKVVFWLGYFNSCL
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pF1KB3 NPFFYGCLNRQIRGELSKQFVCFFKPAPEEELRLPSREGSIEENFLQFLQGTGCPSESWV
       ::..: : .....  . . . :  .   ... :   : :.   ..  . .:         
CCDS43 NPIIYPCSSKEFKRAFVRILGCQCRGRGRRRRRRRRRLGGCAYTYRPWTRGGSLERSQSR
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pF1KB3 SRPLPSPKQEPPAVDFRIPGQIAEETSEFLEQQLTSDIIMSDSYLRPAASPRLES     
                                                                   
CCDS43 KDSLDDSGSCLSGSQRTLPSASPSPGYLGRGAPPPVELCAFPEWKAPGALLSLPAPEPPG
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>>CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5                 (446 aa)
 initn: 199 init1: 133 opt: 331  Z-score: 315.5  bits: 67.6 E(32554): 3e-11
Smith-Waterman score: 369; 24.9% identity (56.8% similar) in 449 aa overlap (21-446:2-421)

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                           .: . :. .:.  :  :: . . ..  :. :: :... ::
CCDS43                    MRTLNTSAMDGTGLVVERDFSVRILTACFLSLLILSTLLGN
                                  10        20        30        40 

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pF1KB3 AAVMAVIAKTPALRKFV---FVFHLCLVDLLAALTLMPLAMLSSSALFDHALFGEVACRL
       . : :.. .   ::. :   ::. : . :::.:. .::   ..  : :    ::   : .
CCDS43 TLVCAAVIRFRHLRSKVTNFFVISLAVSDLLVAVLVMPWKAVAEIAGF--WPFGSF-CNI
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pF1KB3 YLFLSVCFVSLAILSVSAINVERYYYVVHPMRYEVRMTLGLVASVLVGV-WVKALAMASV
       .. ...   . .::.. .:.:.::. .  :.::: .::   .: .:..: :. .. .. .
CCDS43 WVAFDIMCSTASILNLCVISVDRYWAISSPFRYERKMT-PKAAFILISVAWTLSVLISFI
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       ::  ..::... :. :    . ::  .     :.  . ...  .:. : .:. ...:.: 
CCDS43 PV--QLSWHKAKPTSPSDGNATSLAETIDNCDSSLSRTYAISSSVISFYIPVAIMIVTYT
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pF1KB3 SMFRVA-----RVAAMQHGPLPTWMETPRQRSESLSSRSTMVTSSGAPQTTPHRTFGG-G
        ..:.:     :.::.... . .      .  .. .. .  :  :  :... . .:    
CCDS43 RIYRIAQKQIRRIAALERAAVHA------KNCQTTTGNGKPVECS-QPESSFKMSFKRET
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pF1KB3 KAAVVLLAVGGQFLLCWLPYFSFHLYVALSA----QPIST-GQVESVVTWIGYFCFTSNP
       :.  .: .. : :. ::::.: ..  . . .    ::.   ... .: .:.:.   . ::
CCDS43 KVLKTLSVIMGVFVCCWLPFFILNCILPFCGSGETQPFCIDSNTFDVFVWFGWANSSLNP
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pF1KB3 FFYGCLNRQIRGELSKQFVCFFKPAPEEELRL-PSREGSIEENFLQFLQGTGCPSESWVS
       ..:. .: ..:  .:  . :.         :: :. ...::   .   ...:    :   
CCDS43 IIYA-FNADFRKAFSTLLGCY---------RLCPATNNAIETVSI---NNNGAAMFSSHH
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pF1KB3 RPLPSPKQEPPAVDFRIPGQIAEETSEFLEQQLTSDIIMSDSYLRPAASPRLES      
       .:  : ..:   : . ::  ..  .:: :... .. :      : :: :           
CCDS43 EPRGSISKECNLV-YLIPHAVG--SSEDLKKEEAAGIARPLEKLSPALSVILDYDTDVSL
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CCDS43 EKIQPITQNGQHPT
            440      

>>CCDS7376.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10               (478 aa)
 initn: 242 init1: 198 opt: 326  Z-score: 310.6  bits: 66.8 E(32554): 5.6e-11
Smith-Waterman score: 367; 26.3% identity (56.2% similar) in 372 aa overlap (3-359:21-368)

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pF1KB3                   MESSPIPQSSGNSS-----TLGRVPQ----TPGPSTASGVP-
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CCDS73 MNPPSGPRVPPSPTQEPSCMATPAPPSWWDSSQSSISSLGRLPSISPTAPGTWAAAWVPL
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pF1KB3 -EVGLRDVASESVALFFMLLLDLTAVAGNAAVMAVIAKTPALRKF--VFVFHLCLVDLLA
         : . : :  ...   .::. ::.. :: .:. .. .. .::    .:...: . :.: 
CCDS73 PTVDVPDHAHYTLGTV-ILLVGLTGMLGNLTVIYTFCRSRSLRTPANMFIINLAVSDFLM
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pF1KB3 ALTLMPLAMLSSSALFDHALFGEVACRLYLFLSVCFVSLAILSVSAINVERYYYVVHPMR
       ..:  :.  . .:.:. . ::::..:..: : .. :   ......:: ..::  ...:. 
CCDS73 SFTQAPV--FFTSSLYKQWLFGETGCEFYAFCGALFGISSMITLTAIALDRYLVITRPLA
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pF1KB3 YEVRMTLGLVASVLVGVWVKALAMASVPVLGRVSWEEGAP-SVPPGCSLQW-SHSAYCQL
            .   .: ::.:::. ::: .  : .:   :   .: ..  .:: .. : .   . 
CCDS73 TFGVASKRRAAFVLLGVWLYALAWSLPPFFG---WSAYVPEGLLTSCSWDYMSFTPAVRA
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pF1KB3 FVVVFAVLYFLLPLLLILVVYCSMFRVARVAAMQHGPLPTWMETPRQRSESLSSRSTMVT
       .....  . :.::::.:.  :  .::. : ..     : :.    .  .::: .:. . .
CCDS73 YTMLLCCFVFFLPLLIIIYCYIFIFRAIRETGR---ALQTFGAC-KGNGESLWQRQRLQS
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pF1KB3 SSGAPQTTPHRTFGGGKAAVVLLAVGGQFLLCWLPYFSFHLYVALSAQPISTGQVESVVT
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CCDS73 EC--------------KMAKIMLLVILLFVLSWAPYSAVALVAFAGYAHVLTPYMSSVPA
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pF1KB3 WIGYFCFTSNPFFYGCLNRQIRGELSKQFVCFFKPAPEEELRLPSREGSIEENFLQFLQG
        :.      ::..:.  . . :  ..... :.                            
CCDS73 VIAKASAIHNPIIYAITHPKYRVAIAQHLPCLGVLLGVSRRHSRPYPSYRSTHRSTLTSH
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pF1KB3 TGCPSESWVSRPLPSPKQEPPAVDFRIPGQIAEETSEFLEQQLTSDIIMSDSYLRPAASP
                                                                   
CCDS73 TSNLSWISIRRRQESLGSESEVGWTHMEAAAVWGAAQQANGRSLYGQGLEDLEAKAPPRP
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451 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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