Result of FASTA (ccds) for pF1KB3717
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3717, 478 aa
  1>>>pF1KB3717 478 - 478 aa - 478 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5533+/-0.00111; mu= 15.5394+/- 0.066
 mean_var=56.5939+/-11.468, 0's: 0 Z-trim(101.1): 29  B-trim: 0 in 0/47
 Lambda= 0.170486
 statistics sampled from 6390 (6400) to 6390 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.557), E-opt: 0.2 (0.197), width:  16
 Scan time:  2.550

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3577.1 SCARB2 gene_id:950|Hs108|chr4           ( 478) 3193 794.1       0
CCDS56335.1 SCARB2 gene_id:950|Hs108|chr4          ( 335) 1652 415.0  6e-116
CCDS45008.1 SCARB1 gene_id:949|Hs108|chr12         ( 506)  996 253.7 3.3e-67
CCDS9259.1 SCARB1 gene_id:949|Hs108|chr12          ( 509)  985 251.0 2.2e-66
CCDS34673.1 CD36 gene_id:948|Hs108|chr7            ( 472)  957 244.1 2.4e-64
CCDS78251.1 CD36 gene_id:948|Hs108|chr7            ( 396)  819 210.2 3.4e-54
CCDS78250.1 CD36 gene_id:948|Hs108|chr7            ( 412)  616 160.2 3.7e-39
CCDS78249.1 CD36 gene_id:948|Hs108|chr7            ( 433)  426 113.5 4.6e-25


>>CCDS3577.1 SCARB2 gene_id:950|Hs108|chr4                (478 aa)
 initn: 3193 init1: 3193 opt: 3193  Z-score: 4240.9  bits: 794.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3193; 100.0% identity (100.0% similar) in 478 aa overlap (1-478:1-478)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MGRCCFYTAGTLSLLLLVTSVTLLVARVFQKAVDQSIEKKIVLRNGTEAFDSWEKPPLPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MGRCCFYTAGTLSLLLLVTSVTLLVARVFQKAVDQSIEKKIVLRNGTEAFDSWEKPPLPV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 YTQFYFFNVTNPEEILRGETPRVEEVGPYTYRELRNKANIQFGDNGTTISAVSNKAYVFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 YTQFYFFNVTNPEEILRGETPRVEEVGPYTYRELRNKANIQFGDNGTTISAVSNKAYVFE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 RDQSVGDPKIDLIRTLNIPVLTVIEWSQVHFLREIIEAMLKAYQQKLFVTHTVDELLWGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 RDQSVGDPKIDLIRTLNIPVLTVIEWSQVHFLREIIEAMLKAYQQKLFVTHTVDELLWGY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 KDEILSLIHVFRPDISPYFGLFYEKNGTNDGDYVFLTGEDSYLNFTKIVEWNGKTSLDWW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KDEILSLIHVFRPDISPYFGLFYEKNGTNDGDYVFLTGEDSYLNFTKIVEWNGKTSLDWW
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 ITDKCNMINGTDGDSFHPLITKDEVLYVFPSDFCRSVYITFSDYESVQGLPAFRYKVPAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ITDKCNMINGTDGDSFHPLITKDEVLYVFPSDFCRSVYITFSDYESVQGLPAFRYKVPAE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 ILANTSDNAGFCIPEGNCLGSGVLNVSICKNGAPIIMSFPHFYQADERFVSAIEGMHPNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ILANTSDNAGFCIPEGNCLGSGVLNVSICKNGAPIIMSFPHFYQADERFVSAIEGMHPNQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 EDHETFVDINPLTGIILKAAKRFQINIYVKKLDDFVETGDIRTMVFPVMYLNESVHIDKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EDHETFVDINPLTGIILKAAKRFQINIYVKKLDDFVETGDIRTMVFPVMYLNESVHIDKE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470        
pF1KB3 TASRLKSMINTTLIITNIPYIIMALGVFFGLVFTWLACKGQGSMDEGTADERAPLIRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TASRLKSMINTTLIITNIPYIIMALGVFFGLVFTWLACKGQGSMDEGTADERAPLIRT
              430       440       450       460       470        

>>CCDS56335.1 SCARB2 gene_id:950|Hs108|chr4               (335 aa)
 initn: 1671 init1: 1641 opt: 1652  Z-score: 2195.1  bits: 415.0 E(32554): 6e-116
Smith-Waterman score: 1953; 70.1% identity (70.1% similar) in 478 aa overlap (1-478:1-335)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MGRCCFYTAGTLSLLLLVTSVTLLVARVFQKAVDQSIEKKIVLRNGTEAFDSWEKPPLPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MGRCCFYTAGTLSLLLLVTSVTLLVARVFQKAVDQSIEKKIVLRNGTEAFDSWEKPPLPV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 YTQFYFFNVTNPEEILRGETPRVEEVGPYTYRELRNKANIQFGDNGTTISAVSNKAYVFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::                            
CCDS56 YTQFYFFNVTNPEEILRGETPRVEEVGPYTYR----------------------------
               70        80        90                              

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 RDQSVGDPKIDLIRTLNIPVLTVIEWSQVHFLREIIEAMLKAYQQKLFVTHTVDELLWGY
                                                                   
CCDS56 ------------------------------------------------------------
                                                                   

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 KDEILSLIHVFRPDISPYFGLFYEKNGTNDGDYVFLTGEDSYLNFTKIVEWNGKTSLDWW
                                                              :::::
CCDS56 -------------------------------------------------------SLDWW
                                                                   

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 ITDKCNMINGTDGDSFHPLITKDEVLYVFPSDFCRSVYITFSDYESVQGLPAFRYKVPAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ITDKCNMINGTDGDSFHPLITKDEVLYVFPSDFCRSVYITFSDYESVQGLPAFRYKVPAE
       100       110       120       130       140       150       

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 ILANTSDNAGFCIPEGNCLGSGVLNVSICKNGAPIIMSFPHFYQADERFVSAIEGMHPNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ILANTSDNAGFCIPEGNCLGSGVLNVSICKNGAPIIMSFPHFYQADERFVSAIEGMHPNQ
       160       170       180       190       200       210       

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 EDHETFVDINPLTGIILKAAKRFQINIYVKKLDDFVETGDIRTMVFPVMYLNESVHIDKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EDHETFVDINPLTGIILKAAKRFQINIYVKKLDDFVETGDIRTMVFPVMYLNESVHIDKE
       220       230       240       250       260       270       

              430       440       450       460       470        
pF1KB3 TASRLKSMINTTLIITNIPYIIMALGVFFGLVFTWLACKGQGSMDEGTADERAPLIRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TASRLKSMINTTLIITNIPYIIMALGVFFGLVFTWLACKGQGSMDEGTADERAPLIRT
       280       290       300       310       320       330     

>>CCDS45008.1 SCARB1 gene_id:949|Hs108|chr12              (506 aa)
 initn: 623 init1: 321 opt: 996  Z-score: 1320.0  bits: 253.7 E(32554): 3.3e-67
Smith-Waterman score: 996; 34.0% identity (66.9% similar) in 465 aa overlap (10-465:15-471)

                    10        20        30        40        50     
pF1KB3      MGRCCFYTAGTLSLLLLVTSVTLLVARVFQKAVDQSIEKKIVLRNGTEAFDSWEK
                     :. .::  : .....:  .  . . :.. :.. .  .. .:. :..
CCDS45 MGCSAKARWAAGALGVAGLLCAVLGAVMIV--MVPSLIKQQVLKNVRIDPSSLSFNMWKE
               10        20        30          40        50        

          60        70        80        90       100       110     
pF1KB3 PPLPVYTQFYFFNVTNPEEILRGETPRVEEVGPYTYRELRNKANIQFGDNGTTISAVSNK
        :.: : . :::.: :: :::.:: :.:.: :::.:::.:.:.:: : .:. :.: .  .
CCDS45 IPIPFYLSVYFFDVMNPSEILKGEKPQVRERGPYVYREFRHKSNITF-NNNDTVSFLEYR
       60        70        80        90       100        110       

         120       130       140         150       160       170   
pF1KB3 AYVFERDQSVGDPKIDLIRTLNIPVL--TVIEWSQVHFLREIIEAMLKAYQQKLFVTHTV
       .. :. ..: :. . : :   :: ::  .:.  ..   :. :.   . .  .. :...::
CCDS45 TFQFQPSKSHGSES-DYIVMPNILVLGAAVMMENKPMTLKLIMTLAFTTLGERAFMNRTV
       120       130        140       150       160       170      

           180       190          200       210       220       230
pF1KB3 DELLWGYKDEILSLIHVFRPDISPY---FGLFYEKNGTNDGDYVFLTGEDSYLNFTKIVE
        :..::::: ...::. . : . :.   :::: : :....: .. .:: ..   .  . .
CCDS45 GEIMWGYKDPLVNLINKYFPGMFPFKDKFGLFAELNNSDSGLFTVFTGVQNISRIHLVDK
        180       190       200       210       220       230      

              240       250       260       270       280       290
pF1KB3 WNGKTSLDWWITDKCNMINGTDGDSFHPLITKDEVLYVFPSDFCRSVYITFSDYESVQGL
       ::: ...:.: .:.:::::::.:. . :..: .  :  .  . :::. . ...    .:.
CCDS45 WNGLSKVDFWHSDQCNMINGTSGQMWPPFMTPESSLEFYSPEACRSMKLMYKESGVFEGI
        240       250       260       270       280       290      

              300          310       320       330       340       
pF1KB3 PAFRYKVPAEILANTS---DNAGFCIPEGNCLGSGVLNVSICKNGAPIIMSFPHFYQADE
       :..:. .:  ..:: :    : ::: :   :: ::. ::: :. .::...: ::: .:: 
CCDS45 PTYRFVAPKTLFANGSIYPPNEGFC-P---CLESGIQNVSTCRFSAPLFLSHPHFLNADP
        300       310       320           330       340       350  

       350       360       370       380       390       400       
pF1KB3 RFVSAIEGMHPNQEDHETFVDINPLTGIILKAAKRFQINIYVKKLDDFVETGDIRTMVFP
        .. :. :.::::: :  :.::.:.::: .. . ..:...:.:..  . .:: :. .:.:
CCDS45 VLAEAVTGLHPNQEAHSLFLDIHPVTGIPMNCSVKLQLSLYMKSVAGIGQTGKIEPVVLP
            360       370       380       390       400       410  

       410       420        430       440       450       460      
pF1KB3 VMYLNESVHIDKETASRLKS-MINTTLIITNIPYIIMALGVFFGLVFTWLACKGQGSMDE
       .... ::  .. ::   . . ..    ..    :...:::  . :: .    ..::  : 
CCDS45 LLWFAESGAMEGETLHTFYTQLVLMPKVMHYAQYVLLALGCVLLLVPVICQIRSQGPEDT
            420       430       440       450       460       470  

        470                              
pF1KB3 GTADERAPLIRT                      
                                         
CCDS45 VSQPGLAAGPDRPPSPYTPLLPDSPSGQPPSPTA
            480       490       500      

>>CCDS9259.1 SCARB1 gene_id:949|Hs108|chr12               (509 aa)
 initn: 623 init1: 321 opt: 985  Z-score: 1305.4  bits: 251.0 E(32554): 2.2e-66
Smith-Waterman score: 985; 34.3% identity (67.5% similar) in 452 aa overlap (10-452:15-458)

                    10        20        30        40        50     
pF1KB3      MGRCCFYTAGTLSLLLLVTSVTLLVARVFQKAVDQSIEKKIVLRNGTEAFDSWEK
                     :. .::  : .....:  .  . . :.. :.. .  .. .:. :..
CCDS92 MGCSAKARWAAGALGVAGLLCAVLGAVMIV--MVPSLIKQQVLKNVRIDPSSLSFNMWKE
               10        20        30          40        50        

          60        70        80        90       100       110     
pF1KB3 PPLPVYTQFYFFNVTNPEEILRGETPRVEEVGPYTYRELRNKANIQFGDNGTTISAVSNK
        :.: : . :::.: :: :::.:: :.:.: :::.:::.:.:.:: :..: : .: .  .
CCDS92 IPIPFYLSVYFFDVMNPSEILKGEKPQVRERGPYVYREFRHKSNITFNNNDT-VSFLEYR
       60        70        80        90       100       110        

         120       130       140         150       160       170   
pF1KB3 AYVFERDQSVGDPKIDLIRTLNIPVL--TVIEWSQVHFLREIIEAMLKAYQQKLFVTHTV
       .. :. ..: :. . : :   :: ::  .:.  ..   :. :.   . .  .. :...::
CCDS92 TFQFQPSKSHGSES-DYIVMPNILVLGAAVMMENKPMTLKLIMTLAFTTLGERAFMNRTV
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pF1KB3 DELLWGYKDEILSLIHVFRPDISPY---FGLFYEKNGTNDGDYVFLTGEDSYLNFTKIVE
        :..::::: ...::. . : . :.   :::: : :....: .. .:: ..   .  . .
CCDS92 GEIMWGYKDPLVNLINKYFPGMFPFKDKFGLFAELNNSDSGLFTVFTGVQNISRIHLVDK
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pF1KB3 WNGKTSLDWWITDKCNMINGTDGDSFHPLITKDEVLYVFPSDFCRSVYITFSDYESVQGL
       ::: ...:.: .:.:::::::.:. . :..: .  :  .  . :::. . ...    .:.
CCDS92 WNGLSKVDFWHSDQCNMINGTSGQMWPPFMTPESSLEFYSPEACRSMKLMYKESGVFEGI
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pF1KB3 PAFRYKVPAEILANTS---DNAGFCIPEGNCLGSGVLNVSICKNGAPIIMSFPHFYQADE
       :..:. .:  ..:: :    : ::: :   :: ::. ::: :. .::...: ::: .:: 
CCDS92 PTYRFVAPKTLFANGSIYPPNEGFC-P---CLESGIQNVSTCRFSAPLFLSHPHFLNADP
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pF1KB3 RFVSAIEGMHPNQEDHETFVDINPLTGIILKAAKRFQINIYVKKLDDFVETGDIRTMVFP
        .. :. :.::::: :  :.::.:.::: .. . ..:...:.:..  . .:: :. .:.:
CCDS92 VLAEAVTGLHPNQEAHSLFLDIHPVTGIPMNCSVKLQLSLYMKSVAGIGQTGKIEPVVLP
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pF1KB3 VMYLNESVHIDKETASRLKS-MINTTLIITNIPYIIMALGVFFGLVFTWLACKGQGSMDE
       .... ::  .. ::   . . ..    ..    :...:::  . ::              
CCDS92 LLWFAESGAMEGETLHTFYTQLVLMPKVMHYAQYVLLALGCVLLLVPVICQIRSQEKCYL
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pF1KB3 GTADERAPLIRT                         
                                            
CCDS92 FWSSSKKGSKDKEAIQAYSESLMTSAPKGSVLQEAKL
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>>CCDS34673.1 CD36 gene_id:948|Hs108|chr7                 (472 aa)
 initn: 772 init1: 268 opt: 957  Z-score: 1268.7  bits: 244.1 E(32554): 2.4e-64
Smith-Waterman score: 957; 33.8% identity (68.6% similar) in 477 aa overlap (1-461:1-469)

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pF1KB3 MG--RCCFYTAGTL--SLLLLVTSVTLLVARVFQKAVDQSIEKKIVLRNGTEAFDSWEKP
       ::  : :   ::..  ..: .  .. . :. ..   ....:.:..::..:: :: .: : 
CCDS34 MGCDRNCGLIAGAVIGAVLAVFGGILMPVGDLL---IQKTIKKQVVLEEGTIAFKNWVKT
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pF1KB3 PLPVYTQFYFFNVTNPEEILRGETP-RVEEVGPYTYR-ELRNKANIQFGDNGTTISAVSN
          :: ::..:.: ::.:.. . .  .:.. :::::: ..  : :.    . .:.: .. 
CCDS34 GTEVYRQFWIFDVQNPQEVMMNSSNIQVKQRGPYTYRVRFLAKENVTQDAEDNTVSFLQP
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pF1KB3 KAYVFERDQSVGDPKIDLIRTLNIPVLTVIEWSQVHFLREIIEAMLKAYQQKLFVTHTVD
       .. .:: . :::  . : . .::. : .. .  : .:.. :......  ....: ..:. 
CCDS34 NGAIFEPSLSVGT-EADNFTVLNLAVAAASHIYQNQFVQMILNSLINKSKSSMFQVRTLR
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pF1KB3 ELLWGYKDEILSLIHVFRPDISPYFGLFYEKNGTNDGDYVFLTGEDSYLNFTKIVEWNGK
       ::::::.: .:::.    : ..   ::::  :.: :: :  ..:.:.  . . :  ..::
CCDS34 ELLWGYRDPFLSLVP--YP-VTTTVGLFYPYNNTADGVYKVFNGKDNISKVAIIDTYKGK
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pF1KB3 TSLDWWITDKCNMINGTDGDSFHPLITKDEVLYVFPSDFCRSVYITFSDYESVQGLPAFR
        .:..:  ..:.::::::. :: :.. :..::  : ::.:::.: .: .  ...:.:..:
CCDS34 RNLSYW-ESHCDMINGTDAASFPPFVEKSQVLQFFSSDICRSIYAVFESDVNLKGIPVYR
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pF1KB3 YKVPAEILAN---TSDNAGFC---IPEGNCLGSGVLNVSICKNGAPIIMSFPHFYQADER
       . .:.. .:.   . ::  ::   :   :: . :::..: ::.: :. .:.:::  :.  
CCDS34 FVLPSKAFASPVENPDNYCFCTEKIISKNCTSYGVLDISKCKEGRPVYISLPHFLYASPD
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pF1KB3 FVSAIEGMHPNQEDHETFVDINPLTGIILKAAKRFQINIYVKKLDDFVETGDI-RTMVFP
           :.:..::.:.:.:..::.:.::. :. :::.:.:. ::  . .    .. :... :
CCDS34 VSEPIDGLNPNEEEHRTYLDIEPITGFTLQFAKRLQVNLLVKPSEKIQVLKNLKRNYIVP
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pF1KB3 VMYLNESVHIDKETASRLKSMINTTLIITN-IPYIIMALGV--FFGLVFTWLACKGQGSM
       ...:::.  :  : :. ..:...  . . . : .:....::  : ...... ::...   
CCDS34 ILWLNETGTIGDEKANMFRSQVTGKINLLGLIEMILLSVGVVMFVAFMISYCACRSKTIK
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          470        
pF1KB3 DEGTADERAPLIRT

>>CCDS78251.1 CD36 gene_id:948|Hs108|chr7                 (396 aa)
 initn: 666 init1: 268 opt: 819  Z-score: 1086.5  bits: 210.2 E(32554): 3.4e-54
Smith-Waterman score: 819; 34.3% identity (69.3% similar) in 391 aa overlap (82-461:8-393)

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pF1KB3 SWEKPPLPVYTQFYFFNVTNPEEILRGETPRVEEVGPYTYR-ELRNKANIQFGDNGTTIS
                                     .:.. :::::: ..  : :.    . .:.:
CCDS78                        MMNSSNIQVKQRGPYTYRVRFLAKENVTQDAEDNTVS
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pF1KB3 AVSNKAYVFERDQSVGDPKIDLIRTLNIPVLTVIEWSQVHFLREIIEAMLKAYQQKLFVT
        .. .. .:: . :::  . : . .::. : .. .  : .:.. :......  ....: .
CCDS78 FLQPNGAIFEPSLSVGT-EADNFTVLNLAVAAASHIYQNQFVQMILNSLINKSKSSMFQV
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pF1KB3 HTVDELLWGYKDEILSLIHVFRPDISPYFGLFYEKNGTNDGDYVFLTGEDSYLNFTKIVE
       .:. ::::::.: .:::.    : ..   ::::  :.: :: :  ..:.:.  . . :  
CCDS78 RTLRELLWGYRDPFLSLVPY--P-VTTTVGLFYPYNNTADGVYKVFNGKDNISKVAIIDT
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pF1KB3 WNGKTSLDWWITDKCNMINGTDGDSFHPLITKDEVLYVFPSDFCRSVYITFSDYESVQGL
       ..:: .:..:  ..:.::::::. :: :.. :..::  : ::.:::.: .: .  ...:.
CCDS78 YKGKRNLSYW-ESHCDMINGTDAASFPPFVEKSQVLQFFSSDICRSIYAVFESDVNLKGI
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pF1KB3 PAFRYKVPAEILAN---TSDNAGFC---IPEGNCLGSGVLNVSICKNGAPIIMSFPHFYQ
       :..:. .:.. .:.   . ::  ::   :   :: . :::..: ::.: :. .:.:::  
CCDS78 PVYRFVLPSKAFASPVENPDNYCFCTEKIISKNCTSYGVLDISKCKEGRPVYISLPHFLY
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pF1KB3 ADERFVSAIEGMHPNQEDHETFVDINPLTGIILKAAKRFQINIYVKKLDDFVETGDI-RT
       :.      :.:..::.:.:.:..::.:.::. :. :::.:.:. ::  . .    .. :.
CCDS78 ASPDVSEPIDGLNPNEEEHRTYLDIEPITGFTLQFAKRLQVNLLVKPSEKIQVLKNLKRN
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pF1KB3 MVFPVMYLNESVHIDKETASRLKSMINTTLIITN-IPYIIMALGV--FFGLVFTWLACKG
       .. :...:::.  :  : :. ..:...  . . . : .:....::  : ...... ::..
CCDS78 YIVPILWLNETGTIGDEKANMFRSQVTGKINLLGLIEMILLSVGVVMFVAFMISYCACRS
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              470        
pF1KB3 QGSMDEGTADERAPLIRT
       .                 
CCDS78 KTIK              
                         

>>CCDS78250.1 CD36 gene_id:948|Hs108|chr7                 (412 aa)
 initn: 610 init1: 268 opt: 616  Z-score: 816.4  bits: 160.2 E(32554): 3.7e-39
Smith-Waterman score: 712; 30.0% identity (59.7% similar) in 477 aa overlap (1-461:1-409)

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pF1KB3 MG--RCCFYTAGTL--SLLLLVTSVTLLVARVFQKAVDQSIEKKIVLRNGTEAFDSWEKP
       ::  : :   ::..  ..: .  .. . :. ..   ....:.:..::..:: :: .: : 
CCDS78 MGCDRNCGLIAGAVIGAVLAVFGGILMPVGDLL---IQKTIKKQVVLEEGTIAFKNWVKT
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pF1KB3 PLPVYTQFYFFNVTNPEEILRGETP-RVEEVGPYTYR-ELRNKANIQFGDNGTTISAVSN
          :: ::..:.: ::.:.. . .  .:.. :::::: ..  : :.    . .:.: .. 
CCDS78 GTEVYRQFWIFDVQNPQEVMMNSSNIQVKQRGPYTYRVRFLAKENVTQDAEDNTVSFLQP
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pF1KB3 KAYVFERDQSVGDPKIDLIRTLNIPVLTVIEWSQVHFLREIIEAMLKAYQQKLFVTHTVD
       .. .:: . :::  . : . .::. :                     ::           
CCDS78 NGAIFEPSLSVGT-EADNFTVLNLAV---------------------AY-----------
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pF1KB3 ELLWGYKDEILSLIHVFRPDISPYFGLFYEKNGTNDGDYVFLTGEDSYLNFTKIVEWNGK
                                      :.: :: :  ..:.:.  . . :  ..::
CCDS78 -------------------------------NNTADGVYKVFNGKDNISKVAIIDTYKGK
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pF1KB3 TSLDWWITDKCNMINGTDGDSFHPLITKDEVLYVFPSDFCRSVYITFSDYESVQGLPAFR
        .:..:  ..:.::::::. :: :.. :..::  : ::.:::.: .: .  ...:.:..:
CCDS78 RNLSYW-ESHCDMINGTDAASFPPFVEKSQVLQFFSSDICRSIYAVFESDVNLKGIPVYR
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pF1KB3 YKVPAEILAN---TSDNAGFC---IPEGNCLGSGVLNVSICKNGAPIIMSFPHFYQADER
       . .:.. .:.   . ::  ::   :   :: . :::..: ::.: :. .:.:::  :.  
CCDS78 FVLPSKAFASPVENPDNYCFCTEKIISKNCTSYGVLDISKCKEGRPVYISLPHFLYASPD
            240       250       260       270       280       290  

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pF1KB3 FVSAIEGMHPNQEDHETFVDINPLTGIILKAAKRFQINIYVKKLDDFVETGDI-RTMVFP
           :.:..::.:.:.:..::.:.::. :. :::.:.:. ::  . .    .. :... :
CCDS78 VSEPIDGLNPNEEEHRTYLDIEPITGFTLQFAKRLQVNLLVKPSEKIQVLKNLKRNYIVP
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pF1KB3 VMYLNESVHIDKETASRLKSMINTTLIITN-IPYIIMALGV--FFGLVFTWLACKGQGSM
       ...:::.  :  : :. ..:...  . . . : .:....::  : ...... ::...   
CCDS78 ILWLNETGTIGDEKANMFRSQVTGKINLLGLIEMILLSVGVVMFVAFMISYCACRSKTIK
            360       370       380       390       400       410  

          470        
pF1KB3 DEGTADERAPLIRT

>>CCDS78249.1 CD36 gene_id:948|Hs108|chr7                 (433 aa)
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478 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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